单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10021 - 10040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10021 | 2025-10-07 |
Current Applications of Single-Cell RNA Sequencing in Glioblastoma: A Scoping Review
2025-Mar-14, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci15030309
PMID:40149830
|
综述 | 本文通过范围综述方法探讨了单细胞RNA测序技术在胶质母细胞瘤中的临床应用 | 系统梳理了2009-2024年间scRNA-seq在GBM研究中的应用现状，重点关注该技术在解析肿瘤复杂性和治疗耐药性方面的潜力 | 仅纳入英文和西班牙语文献，可能存在语言偏倚；研究时间跨度较长，技术发展可能影响结果可比性 | 评估单细胞RNA测序技术在胶质母细胞瘤诊断、预后、治疗和癌症生物学理解中的应用价值 | 胶质母细胞瘤患者样本和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 24项研究（来自453篇文献筛选） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10022 | 2025-10-07 |
Multi-Omics Analysis of the Anoikis Gene CASP8 in Prostate Cancer and Biochemical Recurrence (BCR)
2025-Mar-07, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13030661
PMID:40149637
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研究论文 | 通过多组学分析探讨anoikis基因CASP8在前列腺癌和生化复发中的作用机制 | 首次通过单细胞和空间转录组分析探索anoikis基因在前列腺癌中的表达模式，定义了新型T细胞类型，并构建了4基因预后模型 | NA | 研究CASP8基因在前列腺癌发生发展和生化复发中的作用机制 | 前列腺癌细胞和生化复发患者 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序,多组学分析,孟德尔随机化分析 | 预后预测模型 | 基因表达数据,临床数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 10023 | 2025-10-07 |
Glucagon-like peptide-1 receptor signaling activation in alveolar type II cells enhances lung development in neonatal rats exposed to hyperoxia
2025-Mar-06, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103586
PMID:40080965
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研究论文 | 本研究探讨了GLP-1R信号在肺泡II型细胞中激活对高氧暴露新生大鼠肺发育的促进作用及其分子机制 | 首次揭示GLP-1R通过调控线粒体分裂和糖代谢影响肺发育的新机制，并发现高氧通过抑制m6A甲基化影响GLP-1R激活 | 研究主要基于新生大鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究GLP-1R在肺发育调控中的作用及其在支气管肺发育不良模型中的潜在机制 | 新生Sprague-Dawley大鼠、原代肺泡II型细胞、RLE-6TN细胞系 | 发育生物学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 免疫荧光染色, 代谢分析, RT-qPCR, MeRIP-qPCR | 动物模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 代谢数据, 图像数据 | 新生大鼠肺组织在不同时间点(3,7,10,14天)的样本，原代ATII细胞和RLE-6TN细胞系 | Agilent, 其他 | 单细胞RNA-seq, 代谢分析, 超分辨率显微镜 | Seahorse XF96, HiS-SIM | Seahorse XF96代谢细胞外通量分析仪用于实时分析细胞外酸化率和耗氧率，HiS-SIM超分辨率显微镜用于线粒体观察 |
| 10024 | 2025-10-07 |
Editorial for Brain Sciences Special Issue "Advances in Restorative Neurotherapeutic Technologies"
2025-Mar-05, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci15030273
PMID:40149794
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评论 | 本编辑文章介绍了《脑科学》特刊“神经修复治疗技术的进展”，概述了推动神经科学发展的技术革新 | 强调了从组织学技术到单细胞RNA测序等创新技术在神经修复治疗领域的应用进展 | NA | 探讨神经修复治疗技术的最新进展 | 神经科学领域的技术发展 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10025 | 2025-10-07 |
Integrated Spheroid-to-Population Framework for Evaluating PFHpA-Associated Metabolic Dysfunction and Steatotic Liver Disease
2025-Mar-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5960979/v1
PMID:40092438
|
研究论文 | 本研究通过整合人群队列和3D肝脏球体模型，评估PFHpA暴露与代谢功能障碍相关脂肪肝病的关系 | 开发了从球体到人群的整合框架，首次将短链PFAS化合物PFHpA与MASLD风险联系起来，并应用LUCID模型分析多组学特征 | 研究主要基于肥胖青少年队列，结果可能不适用于其他人群 | 阐明PFHpA在MASLD发病机制中的作用，识别可改变的风险因素 | 肥胖青少年队列（Teen-LABS）和3D人类肝脏球体模型 | 生物医学研究 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 单细胞转录组学，多组学分析，LUCID模型 | LUCID（潜在未知聚类与整合数据模型） | 临床数据，转录组数据，蛋白质组数据，代谢组数据 | 全国多中心肥胖青少年队列（接受减肥手术） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10026 | 2025-10-07 |
CellGAT: A GAT-Based Method for Constructing a Cell Communication Network Integrating Multiomics Information
2025-Feb-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15030342
PMID:40149878
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研究论文 | 提出一种基于图注意力网络的细胞通讯网络构建方法CellGAT，整合多组学信息预测细胞间通讯 | 首次将蛋白质-蛋白质相互作用信息整合到细胞通讯网络构建中，使用图注意力网络和节点嵌入算法 | NA | 开发更准确的细胞间通讯预测方法 | 多细胞生物中的细胞通讯网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，图注意力网络，节点嵌入算法 | GAT（图注意力网络） | 基因表达数据，蛋白质相互作用数据，蛋白质复合物数据，通路信息 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10027 | 2025-10-07 |
VPS25 Promotes an Immunosuppressive Microenvironment in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Feb-22, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15030323
PMID:40149859
|
研究论文 | 本研究探讨VPS25在头颈部鳞状细胞癌中促进免疫抑制微环境的作用机制 | 首次揭示VPS25通过上调PVR表达激活PVR-TIGIT免疫抑制信号轴，促进肿瘤免疫逃逸 | 研究主要基于TCGA数据集和细胞系实验，需要更多临床样本验证 | 探究ESCRT机制成分VPS25在HNSCC肿瘤进展和免疫调节中的作用 | 头颈部鳞状细胞癌组织和CAL27细胞系 | 肿瘤免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序，单细胞RNA测序，免疫组织化学，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，组织图像，单细胞转录组数据 | TCGA数据集和HNSCC组织芯片 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 10028 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA sequencing reveals mitochondrial dysfunction in microtia chondrocytes
2025-01-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85169-x
PMID:39762337
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究小耳畸形软骨细胞中的线粒体功能障碍 | 首次在单细胞水平揭示小耳畸形软骨细胞中线粒体功能障碍及其相关关键基因 | 样本量有限，仅针对单侧非综合征型小耳畸形患者 | 探究小耳畸形软骨细胞中的线粒体功能障碍机制 | 小耳畸形患者和健康对照者的软骨细胞 | 单细胞测序 | 小耳畸形 | 单细胞RNA测序，ROS检测，膜电位测定，透射电子显微镜 | 轨迹分析，基因共表达网络分析 | 单细胞RNA测序数据 | 小耳畸形患者和健康对照者的软骨样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 10029 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics unveils estrogen-modulated immune responses and structural alterations in the ectocervical mucosa of depot medroxyprogesterone acetate users
2025-01-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83775-9
PMID:39762272
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学揭示DMPA使用者宫颈黏膜中雌激素调节的免疫反应和结构改变 | 首次应用高分辨率空间转录组学技术揭示DMPA对宫颈黏膜的空间分子标记变化 | 样本来源仅限于肯尼亚性工作者群体，可能限制结果的普适性 | 探究DMPA对宫颈黏膜屏障的分子影响机制 | 使用DMPA或非激素避孕药的肯尼亚性工作者的宫颈黏膜组织 | 空间转录组学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组学，基因集富集分析，免疫染色 | 无监督聚类 | 空间转录组数据，基因表达数据，激素水平数据 | 肯尼亚性工作者群体样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10030 | 2025-10-07 |
Integrated analysis and single-cell sequencing of mitochondrial metabolism related gene molecular subtype and diagnostic model in ulcerative colitis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0320010
PMID:40153427
|
研究论文 | 通过整合分析和单细胞测序技术研究溃疡性结肠炎中线粒体代谢相关基因的分子亚型及诊断模型 | 首次系统鉴定UC中线粒体代谢相关基因的分子亚型，并构建基于机器学习的诊断模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索溃疡性结肠炎的发病机制和潜在生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者样本和线粒体代谢相关基因 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序, qRT-PCR, western blot | 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10031 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomes and chromatin accessibility of endothelial cells unravel transcription factors associated with dysregulated angiogenesis in systemic sclerosis
2024-Sep-30, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-225415
PMID:38754983
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了系统性硬化症中内皮细胞的转录组和染色质可及性变化，发现ETS转录因子家族在血管异常调控中的关键作用 | 首次在系统性硬化症中整合单细胞转录组和染色质可及性分析，识别出ELK4、ERF和ETS1作为调控血管异常的新靶点 | 样本量相对有限，主要聚焦皮肤组织，需要进一步验证这些发现在其他血管床的普适性 | 阐明系统性硬化症中内皮细胞功能障碍的分子机制 | 系统性硬化症患者和对照的内皮细胞 | 单细胞组学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序, 单核转座酶可及染色质测序, 免疫荧光染色, 蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 蛋白质组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 10032 | 2025-10-07 |
Multimodal contrastive learning for spatial gene expression prediction using histology images
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae551
PMID:39471412
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研究论文 | 提出一种基于多模态对比学习的空间基因表达预测方法mclSTExp，使用组织学图像预测空间转录组数据 | 将每个斑点视为'单词'，通过Transformer自注意力机制整合内在特征与空间上下文，并利用对比学习融合图像特征 | 仅在乳腺癌和皮肤鳞状细胞癌数据集上进行了评估，未验证在其他癌症类型上的泛化能力 | 开发成本效益高的空间基因表达预测方法 | 乳腺癌和皮肤鳞状细胞癌组织样本 | 计算机视觉 | 乳腺癌,皮肤鳞状细胞癌 | 多模态对比学习,Transformer,自注意力机制 | Transformer,Densenet-121 | 图像,空间基因表达数据 | 两个乳腺癌数据集和一个皮肤鳞状细胞癌数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10033 | 2025-10-07 |
Cell-type-specific aging clocks to quantify aging and rejuvenation in neurogenic regions of the brain
2023-01, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-022-00335-4
PMID:37118510
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研究论文 | 开发基于单细胞转录组学的细胞类型特异性衰老时钟，用于量化大脑神经发生区域的衰老和年轻化过程 | 首次从单细胞转录组数据开发高分辨率衰老时钟，能够量化转录组年轻化 | 研究仅基于小鼠模型，样本量相对有限 | 开发细胞类型特异性衰老时钟来表征大脑神经发生区域的衰老和年轻化 | 小鼠大脑室下区神经发生区域 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 回归模型 | 单细胞转录组数据 | 28只小鼠，覆盖从年轻到老年的不同年龄段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10034 | 2025-10-07 |
Seeing is believing: new methods for in situ single-cell transcriptomics
2014-Mar-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/gb4169
PMID:25000927
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综述 | 本文综述了用于复杂组织内单细胞原位转录组学研究的新方法 | 开发了通过原位测序或从单光活化细胞捕获mRNA的新方法 | NA | 开发单细胞原位转录组学研究方法 | 复杂组织中的单细胞 | 单细胞生物学 | NA | RNA-seq, 原位测序 | NA | mRNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10035 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomics and Proteomics Profiling After Ischemic Stroke Reperfusion: Insights Into Vascular Alterations
2025-Apr, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.124.048085
PMID:40052263
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和蛋白质组学分析缺血性卒中再灌注后的脑血管变化 | 首次结合空间转录组学和蛋白质组学技术，在空间维度上揭示缺血性卒中再灌注后微血管表达谱的变化 | 研究仅使用雄性小鼠模型，样本量较小(n=5)，且仅观察了早期(24小时)变化 | 研究缺血性卒中再灌注后脑血管变化的分子机制 | 13-14周龄C57BL/6JRj雄性小鼠的脑实质内皮细胞和周细胞 | 空间转录组学 | 缺血性卒中 | 空间转录组学, 蛋白质组学, 免疫组织化学, Nissl染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 组织图像 | 5只雄性小鼠 | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 10036 | 2025-10-07 |
Programmed Cell Death 10 (PDCD10) Is a Candidate Tumor-associated Gene in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2025-Apr, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.17527
PMID:40155014
|
研究论文 | 本研究通过分析染色体扩增区域鉴定PDCD10作为食管鳞状细胞癌的新型候选肿瘤相关基因 | 首次发现PDCD10在ESCC中显著扩增和过表达，并确认其与不良预后的关联，同时筛选出阿泽拉酸和瑞巴派特作为潜在靶向治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析和细胞系实验，缺乏体内实验验证 | 鉴定食管鳞状细胞癌中新的肿瘤相关基因 | 食管鳞状细胞癌组织和细胞系 | 癌症基因组学 | 食管癌 | DNA拷贝数变异分析，RNA测序，单细胞RNA测序，免疫组织化学 | Cox回归分析，Kaplan-Meier生存分析 | 基因组数据，转录组数据，临床病理数据 | TCGA和CCLE数据库中的ESCC样本，GEO数据库中的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | 使用Scanpy分析单细胞RNA测序数据 |
| 10037 | 2025-10-07 |
Ginsenoside Rb1 and berberine synergistically protect against type 2 diabetes mellitus via GDF15/HAMP pathway throughout the liver lobules: Insights from spatial transcriptomics analysis
2025-Mar-25, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107711
PMID:40147680
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示人参皂苷Rb1和黄连素通过GDF15/HAMP通路协同防治2型糖尿病的作用机制 | 首次发现Rb1和BBR联合治疗能全面调控整个肝小叶代谢，而二甲双胍仅改善门静脉周围区域功能 | 研究基于db/db小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探究人参皂苷Rb1和黄连素联合治疗对2型糖尿病的协同保护作用及分子机制 | 瘦素受体缺陷(db/db)糖尿病小鼠模型 | 空间转录组学 | 2型糖尿病 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | db/db小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10038 | 2025-10-07 |
Interferon Regulatory Factor 1 Promotes Diabetic Vasculopathy by Mediating Endothelial Cell Pyroptosis
2025-Mar-12, Annals of vascular surgery
IF:1.4Q3
DOI:10.1016/j.avsg.2025.02.018
PMID:40086624
|
研究论文 | 本研究揭示了干扰素调节因子1通过介导内皮细胞焦亡促进糖尿病血管病变的机制 | 首次发现IRF-1是内皮细胞焦亡的关键调控因子，并通过单细胞RNA测序技术鉴定了糖尿病血管病变中的EP1细胞亚群 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探索糖尿病血管病变的分子机制，特别关注内皮细胞焦亡的作用 | 糖尿病模型小鼠BKS-db/db和GSE169332数据集中的单细胞RNA测序数据 | 生物医学研究 | 糖尿病血管病变 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，免疫组织化学，HE染色，Masson染色 | NA | 单细胞RNA测序数据，组织图像数据 | GSE169332数据集（包含非糖尿病动脉粥样硬化和糖尿病动脉粥样硬化两组），BKS-db/db糖尿病模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10039 | 2025-10-07 |
Cardiac Fibrosis in the Multi-Omics Era: Implications for Heart Failure
2025-Mar-28, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325402
PMID:40146800
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综述 | 本文全面分析了多组学技术如何增进对心脏纤维化的理解及其对心力衰竭治疗的意义 | 整合基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据，揭示心脏纤维化的新致病机制和潜在治疗靶点 | NA | 探讨多组学时代对心脏纤维化研究的进展及其对心力衰竭治疗的影响 | 心脏纤维化的分子机制和病理过程 | 多组学整合分析 | 心血管疾病 | 基因组学, 表观基因组学, 转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 单细胞转录组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 多组学整合分析 | NA | NA |
| 10040 | 2025-10-07 |
Kölliker's Organ Functions as a Developmental Hub in Mouse Cochlea Regulating Spiral Limbus and Tectorial Membrane Development
2025-Mar-26, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0721-24.2025
PMID:39909560
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研究论文 | 本研究揭示了Kölliker器官作为小鼠耳蜗发育中枢，调控螺旋缘和覆膜发育的重要功能 | 首次发现Kölliker器官通过上皮-间质信号通路调控螺旋缘基质沉积，并确认基因为新的耳聋基因 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究Kölliker器官在耳蜗发育中的功能机制 | 小鼠耳蜗发育过程中的Kölliker器官、螺旋缘和覆膜 | 发育生物学 | 听力障碍 | 单细胞RNA测序, 条件性基因敲除 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 生理功能数据 | 未明确样本数量的小鼠耳蜗组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |