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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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10021 | 2024-08-04 |
Pharmacological Improvement of Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator Function Rescues Airway Epithelial Homeostasis and Host Defense in Children with Cystic Fibrosis
2024-06-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202310-1836OC
PMID:38259174
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研究论文 | 该研究探讨了药理改善囊性纤维化转膜导管调节因子(CFTR)功能对儿童囊性纤维化患者上呼吸道上皮稳态和宿主防御的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了ETI对儿童囊性纤维化患者鼻上皮和免疫细胞转录组的影响 | 仅在小样本的儿童群体中进行观察,结果可能无法推广到更广泛的人群 | 研究ETI对儿童囊性纤维化患者鼻上皮细胞和免疫细胞的机制 | 儿童囊性纤维化患者的鼻拭子样本 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 13名囊性纤维化儿童和12名健康儿童 |
10022 | 2024-08-05 |
N-MYC impairs innate immune signaling in high-grade serous ovarian carcinoma
2024-May-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj5428
PMID:38748789
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研究论文 | 该文章研究了N-MYC在高等级浆液性卵巢癌中的作用,特别是其对先天免疫信号的抑制 | 揭示了N-MYC通过抑制STING信号和RIG-I样受体信号来减弱肿瘤细胞的先天免疫反应,这是该领域的创新发现 | 研究主要集中在HGSC细胞系上,临床样本的多样性可能影响结果的普适性 | 探讨N-MYC如何影响高等级浆液性卵巢癌中的免疫信号传导 | 高等级浆液性卵巢癌细胞系与临床样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 涉及多个人类临床HGSC样本 |
10023 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals subtype-specific clonal evolution and microenvironmental changes in liver metastasis of pancreatic adenocarcinoma and their clinical implications
2024-May-03, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02003-0
PMID:38702773
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了胰腺腺癌肝转移的亚型特异性克隆演化和微环境变化及其临床意义 | 揭示了基底样亚型细胞在化疗反应和患者结局中的关键作用以及PDAC的克隆演变与癌症相关基因的剂量变化之间的关系 | 研究仍需进一步探讨不同细胞亚型与TME的具体相互作用 | 了解胰腺导管腺癌的肿瘤演变和其临床关联 | 治疗前的原发性胰腺导管腺癌样本及其配对肝转移样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | 治疗前的原发性PDAC样本和配对的肝转移样本 |
10024 | 2024-08-04 |
The mucosal concept in chronic rhinosinusitis: Focus on the epithelial barrier
2024-May, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.01.015
PMID:38295881
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综述 | 该文献主要探讨了慢性鼻窦炎中上皮屏障的关键作用 | 文章强调了新技术(如单细胞转录组学)揭示的上皮屏障的新功能,如炎症记忆和神经内分泌功能 | 未提供具体的实验数据或样本数量,以支持提出的观点 | 旨在深入理解慢性鼻窦炎中的上皮细胞在粘膜框架中的作用 | 针对慢性鼻窦炎中上皮细胞的相关研究 | NA | 慢性鼻窦炎 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
10025 | 2024-08-05 |
STAT3 protects hematopoietic stem cells by preventing activation of a deleterious autocrine type-I interferon response
2024-May, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02218-6
PMID:38467768
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研究论文 | 本研究探讨了STAT3在造血干细胞中的保护作用,防止有害自分泌式I型干扰素反应的激活 | 揭示了STAT3如何通过抑制有害的自分泌型I型干扰素反应来维持造血干细胞功能的全新机制 | 由于在骨髓嵌合小鼠中进行的研究,可能存在系统性炎症未完全消除的潜在影响 | 研究STAT3在造血干细胞功能中的作用及其潜在的治疗应用 | STAT3缺失的造血干细胞和祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 20%的造血腔室中的混合骨髓嵌合小鼠 |
10026 | 2024-08-04 |
Bento: a toolkit for subcellular analysis of spatial transcriptomics data
2024-04-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03217-7
PMID:38566187
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研究论文 | Bento是一个用于亚细胞空间转录组数据分析的Python工具包 | Bento利用单分子信息实现亚细胞尺度的空间分析,填补了现有方法在多细胞尺度的局限 | 目前尚未提到Bento在极端实验条件或特定细胞类型下的表现 | 开发一个用于亚细胞尺度空间分析的工具包 | 分子坐标和分割边界的数据 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 空间转录组数据 | 演示了MERFISH、seqFISH+、分子地图绘制和Xenium数据集 |
10027 | 2024-08-05 |
scCRT: a contrastive-based dimensionality reduction model for scRNA-seq trajectory inference
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae204
PMID:38701412
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研究论文 | 提出了一种用于轨迹推断的新型降维模型scCRT,以提高单细胞RNA测序的分析性能 | scCRT模型结合了细胞级和聚类级对比模块,以利用先前信息学习准确的细胞表示 | 模型依赖于先前的细胞状态信息,可能对数据的依赖性较强 | 旨在提高单细胞RNA测序中轨迹推断的准确性和效率 | 研究对象为单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比学习模型 | 数据集 | 共有135个数据集,包括54个真实数据集和81个合成数据集 |
10028 | 2024-08-04 |
Sirtuin 6 ameliorates bleomycin-induced pulmonary fibrosis via activation of lipid catabolism
2024-Mar, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31027
PMID:37099691
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研究论文 | 本文探讨了SIRT6在减轻博来霉素诱导的肺纤维化中的作用 | 首次揭示了SIRT6通过激活脂质分解代谢来改善肺纤维化 | 对SIRT6在肺纤维化机制中的具体作用尚需进一步研究 | 研究SIRT6在肺纤维化中的保护机制 | 人类肺组织中的SIRT6及其对小鼠的影响 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 高通量测序 | NA | 数据 | 小鼠模型及单细胞测序数据库 |
10029 | 2024-08-04 |
Cell-type deconvolution of bulk-blood RNA-seq reveals biological insights into neuropsychiatric disorders
2024-02-01, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2023.12.018
PMID:38306997
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研究论文 | 本研究通过对大规模血液RNA测序数据进行细胞类型解卷积,提供了精神疾病的生物学见解 | 本研究使用计算推断细胞类型比重和基因表达,发现了多个未通过常规分析得出的与精神疾病相关的基因 | 该研究的细胞类型特定信号可能仍会受到某些因素的影响,且未使用单细胞测序 | 探讨基因变异与精神疾病风险之间的因果机制 | 来自1730例患有双相情感障碍和精神分裂症个体的全血样本 | 数字病理学 | 精神疾病 | RNA测序 | NA | 血液样本 | 1730个全血样本 |
10030 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptome analysis reveals distinct cell populations in dorsal root ganglia and their potential roles in diabetic peripheral neuropathy
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0306424
PMID:39083491
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研究论文 | 单细胞转录组分析揭示了背根神经节中不同细胞群体及其在糖尿病周围神经病中的潜在作用 | 首次系统性地分析了背根神经节的细胞组成及其在糖尿病周围神经病中的作用 | 缺乏对背根神经节在糖尿病周围神经病发病机制的深入探索 | 深入了解背根神经节的细胞类型组成及其在糖尿病周围神经病中的角色 | 健康对照组及糖尿病周围神经病大鼠的背根神经节组织 | 数字病理学 | 糖尿病周围神经病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自健康对照组和糖尿病周围神经病大鼠的背根神经节组织 |
10031 | 2024-08-05 |
Systems biology-based analysis exploring shared biomarkers and pathogenesis of myocardial infarction combined with osteoarthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1398990
PMID:39086489
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研究论文 | 本研究通过系统生物学探讨了心肌梗死和骨关节炎共享的生物标志物和发病机制 | 首次揭示了DUSP1、FOS和THBS1作为心肌梗死和骨关节炎的三个新共享生物标志物及其相关信号通路 | 未提及研究的具体局限性 | 探讨心肌梗死与骨关节炎的共享生物标志物和发病机制 | 心肌梗死(MI)和骨关节炎(OA)患者的基因表达数据 | 数字病理学 | 心肌梗死与骨关节炎 | 基因表达分析,单细胞RNA测序,RT-qPCR | 无特定模型类型 | 基因表达数据 | 涉及心肌细胞和软骨细胞的样本,具体样本数量未说明 |
10032 | 2024-08-05 |
HIF2A mediates lineage transition to aggressive phenotype of cancer-associated fibroblasts in lung cancer brain metastasis
2024, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2356942
PMID:38778816
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研究论文 | 这篇文章探讨了HIF2A在肺癌脑转移中促进癌症相关成纤维细胞的谱系转变及其侵袭性表型的机制 | 本研究揭示了肺癌脑转移中HIF-2α诱导的CAF谱系转变及其功能改变的新机制 | 本研究的局限性在于数据主要来源于单细胞RNA测序,可能无法全面反映所有CAF的复杂性 | 本研究的目的是探讨肺癌脑转移中的肿瘤微环境变化及CAF的作用 | 研究对象为不同转移阶段的肺癌患者的CAF及其在脑转移中的表现 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 大规模RNA测序, 多重免疫组化 | NA | RNA数据 | 包括四对脑转移和原发肺癌样本的配对样本 |
10033 | 2024-08-05 |
Integrative single-cell analysis of longitudinal t(8;21) AML reveals heterogeneous immune cell infiltration and prognostic signatures
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1424933
PMID:39086485
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研究论文 | 本研究对t(8;21)急性髓性白血病患者的免疫微环境进行了综合单细胞分析 | 本研究通过scRNA-seq发现了与疾病进展和药物耐受性相关的独特T细胞特征 | 论文未提及具体的样本数量及其来源,限制了结果的普遍性 | 探究急性髓性白血病患者的免疫细胞浸润状况与预后的关系 | t(8;21)急性髓性白血病患者的免疫细胞特征 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞浸润数据 | 包括原发和纵向t(8;21)急性髓性白血病样本以及外部队列 |
10034 | 2024-08-04 |
Molecular and immune signatures, and pathological trajectories of fatal COVID-19 lungs defined by in situ spatial single-cell transcriptome analysis
2023-08, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29009
PMID:37563850
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研究论文 | 本研究通过原位测序分析了COVID-19死亡患者肺部的单细胞分子和细胞特征 | 首次建立了COVID-19肺部细胞和分子特征的空间单细胞图谱 | 仅针对死后肺组织进行研究,可能无法全面代表所有COVID-19患者的肺部病理 | 旨在定义COVID-19肺部的分子和免疫特征及病理轨迹 | 研究对象为COVID-19死亡患者的肺部组织样本 | 数字病理学 | 肺炎COVID-19 | 原位测序(ISS) | 稀疏非负矩阵分解(SNMF) | 转录组数据 | 研究中涉及221个基因,分析了1719459个细胞 |
10035 | 2024-08-04 |
The progenitor basis of cortical projection neuron diversity
2023-08, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2023.102726
PMID:37148649
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研究论文 | 本研究探讨了不同类型的神经祖细胞如何产生皮层投射神经元的多样性。 | 创新点在于通过细胞类型解析的追踪方法来理解神经祖细胞在投射神经元多样性中的作用。 | 目前关于中间祖细胞在投射神经元多样性中的角色仍然研究不足。 | 研究神经祖细胞如何产生皮层投射神经元的多样性和层级组织。 | 主要研究对象为辐射胶质细胞和中间祖细胞。 | 神经科学 | NA | 细胞类型解析遗传命运追踪,轴突追踪,空间转录组学 | NA | NA | NA |
10036 | 2024-08-05 |
Protective Renalase Deficiency in β-Cells Shapes Immune Metabolism and Function in Autoimmune Diabetes
2023-08-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0030
PMID:37216639
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研究论文 | 本文探讨了肾素缺乏如何影响自身免疫糖尿病中β细胞的免疫代谢和功能 | 首次揭示了肾素缺乏在移植的β细胞中调节局部免疫细胞代谢和功能的能力 | 研究仅在小鼠模型中进行,缺乏对人类适用性的验证 | 本研究旨在了解肾素缺乏对自身免疫糖尿病中β细胞的影响 | 主要研究对象为小鼠模型中的β细胞和浸润的免疫细胞 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 细胞 | NA |
10037 | 2024-08-05 |
Ezh2 Knockout in B Cells Impairs Plasmablast Differentiation and Ameliorates Lupus-like Disease in MRL/lpr Mice
2023-08, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42492
PMID:36897808
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研究论文 | 本研究评估了EZH2在B细胞中的表达对狼疮病理机制的影响 | 首次揭示EZH2缺失对浆细胞发育和狼疮样疾病的改善效果 | 研究主要集中在小鼠模型,临床相关性尚需进一步验证 | 评估EZH2在B细胞中的角色及其与狼疮发病机制的关系 | MRL/lpr小鼠模型中的B细胞和人类狼疮患者的B细胞 | 数字病理 | 狼疮 | 单细胞RNA测序 | 鼠模型 | 细胞类型数据 | 小鼠模型和人类狼疮患者的多样本 |
10038 | 2024-08-05 |
Stimulation of Immune Checkpoint Molecule B and T-Lymphocyte Attenuator Alleviates Experimental Crescentic Glomerulonephritis
2023-08-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000159
PMID:37367205
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研究论文 | 这篇文章探讨了免疫检查点分子BTLA在实验性新月型肾小管肾炎中的作用 | 这项研究首次揭示BTLA在新月型肾小管肾炎中的保护作用和抗体治疗的潜力 | 研究主要集中在小鼠模型上,可能在临床应用中存在差异 | 研究BTLA在新月型肾小管肾炎中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | BTLA缺陷小鼠和野生型小鼠的实验 | 免疫学 | 肾炎 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物样本(小鼠模型) | 使用BTLA缺陷小鼠和野生型小鼠进行实验,但具体样本量未提及 |
10039 | 2024-08-05 |
Distinct Inflammatory Milieu in Patients With Right Heart Failure
2023-08, Circulation. Heart failure
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研究论文 | 这项研究探讨了右心衰竭患者的循环炎症环境 | 识别了可预测患者预后的新生物标志物soluble CD163和CXCL12 | 样本数量较小,且需进一步研究这些分子如何影响心衰表现和疾病进展 | 了解右心衰竭与肝脏相互作用的机制 | 包括正常心脏功能的对照组和满足右心衰竭标准的心衰患者 | 数字病理学 | 心衰 | 多重蛋白检测和单细胞RNA测序 | NA | 血液样本和组织成像 | 三组患者的血液样本,具体数量未说明 |
10040 | 2024-08-05 |
Spatially patterned 3D model mimics key features of cancer metastasis to bone
2023-08, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本文报道了空间模式化的组织工程3D模型,模仿乳腺癌和前列腺癌骨转移的关键特征 | 提出了一种空间模式化的3D骨转移模型,可以模拟骨特异性侵袭和癌症对骨重塑的诱导性失调 | 缺乏对这些模型的广泛验证和应用研究 | 填补缺乏生理相关的体外模型的空白,探索骨转移的生物学 | 乳腺癌和前列腺癌的骨转移 | 数字病理学 | 乳腺癌和前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 3D模型 | NA | NA |