单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
10021 2024-09-01
Tumor-Infiltrating Regulatory T-cell Accumulation in the Tumor Microenvironment Is Mediated by IL33/ST2 Signaling
2020-11, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 研究探讨了肿瘤微环境中肿瘤浸润调节性T细胞(Treg)积累的分子机制,特别是IL33/ST2信号通路的作用 首次揭示了IL33/ST2轴在肿瘤微环境中调节性T细胞积累的关键作用,并提出了这一通路作为癌症免疫治疗潜在靶点的可能性 NA 阐明肿瘤微环境中调节性T细胞积累的分子机制 肿瘤浸润调节性T细胞及其在肿瘤微环境中的积累机制 免疫学 癌症 RNA测序(RNA-seq) NA RNA 来自同种肿瘤小鼠的肿瘤浸润Treg和脾脏Treg
10022 2024-09-01
Development and Arealization of the Cerebral Cortex
2019-09-25, Neuron IF:14.7Q1
综述 本文综述了大脑皮层区域多样性的早期发育过程,包括内在和外在机制,并提出了一个整合模型。 引入单细胞转录组学等新兴技术,提供了一个新的视角来理解区域特异性的分子多样性。 NA 探讨大脑皮层区域多样性的发育过程及其在神经发育障碍中的潜在应用。 大脑皮层的发育过程和区域多样性。 神经科学 神经发育障碍 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA
10023 2024-08-31
Personalized composite scaffolds for accelerated cell- and growth factor-free craniofacial bone regeneration
2024-Nov, Bioactive materials IF:18.0Q1
研究论文 本文介绍了一种用于加速颅面骨再生的个性化复合支架系统,该系统采用3D打印技术制造,包含多孔聚二醇柠檬酸-羟基磷灰石复合弹性体和聚二醇柠檬酸-石墨烯氧化物水凝胶复合物。 该支架系统通过材料中心的设计,无需细胞和生长因子即可促进骨再生,具有简化的制造过程和临床转化优势。 NA 开发一种新型的复合支架系统,用于加速颅面骨的再生。 颅面骨的再生 生物材料 骨骼疾病 3D打印 NA NA NA
10024 2024-08-31
Bi-functional CpG-STAT3 decoy oligonucleotide triggers multilineage differentiation of acute myeloid leukemia in mice
2024-Sep-10, Molecular therapy. Nucleic acids
研究论文 研究通过使用双功能CpG-STAT3诱饵寡核苷酸,触发小鼠急性髓系白血病细胞的多谱系分化 本研究揭示了通过STAT3抑制/TLR9激活驱动的inv(16) AML重编程的分子机制,并展示了双功能寡核苷酸通过同时抑制STAT3和/或DNMT来释放TLR9驱动的白血病细胞分化的免疫治疗潜力 NA 阐明STAT3抑制/TLR9激活驱动的inv(16) AML重编程的分子机制,并探索双功能寡核苷酸在白血病治疗中的应用 急性髓系白血病细胞 数字病理学 白血病 寡核苷酸技术 NA 转录组数据 小鼠来源的急性髓系白血病细胞
10025 2024-08-31
A single-cell atlas of the miracidium larva of Schistosoma mansoni reveals cell types, developmental pathways, and tissue architecture
2024-Aug-27, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序创建了Schistosoma mansoni的miracidium幼虫的全身体细胞图谱,揭示了其细胞类型、发育途径和组织结构 首次为miracidium幼虫创建了包含约365个细胞的单细胞图谱,并通过原位杂交和轨迹分析揭示了细胞类型特异性和干细胞的性别偏倚转录特征 NA 旨在深入理解miracidium幼虫在细胞和分子水平上的特性 Schistosoma mansoni的miracidium幼虫 数字病理学 寄生虫病 单细胞RNA测序 NA 细胞数据 约365个细胞
10026 2024-08-31
Establishment and verification of a TME prognosis scoring model based on the acute myeloid leukemia single-cell transcriptome
2024-08-27, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文通过单细胞转录组数据,构建并验证了一个基于急性髓系白血病(AML)肿瘤微环境(TME)的预后评分模型 首次基于AML的单细胞转录组数据,构建了一个包含10个关键基因的预后评分模型,用于区分AML患者的高风险和低风险组 需要进一步的研究来验证模型在更大样本量和其他数据集上的泛化能力 开发一种新的预后评分模型,以帮助预测AML患者的生存率和指导治疗策略 急性髓系白血病患者的肿瘤微环境 数字病理学 白血病 单细胞测序 预后评分模型 转录组数据 18,251个单细胞
10027 2024-08-31
Assessment of SWI/SNF chromatin remodeling complex related genes as potential biomarkers and therapeutic targets in pan-cancer
2024-Aug-27, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究全面分析了SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的表达差异、体细胞突变、潜在生物途径、基质或免疫细胞浸润及药物敏感性,并评估了其在肾透明细胞癌中的进化趋势、预后标志和免疫治疗反应。 首次全面分析SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的多方面作用,并构建了肾透明细胞癌的预后标志。 研究主要集中在SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因,未涉及其他可能的生物标志物和治疗靶点。 探讨SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因作为潜在生物标志物和治疗靶点在泛癌中的作用。 SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的表达、突变、生物途径、细胞浸润和药物敏感性。 数字病理学 泛癌 scRNA-seq, qRT-PCR, CCK-8 assay NA 基因表达数据 14种肿瘤类型的患者数据
10028 2024-08-29
Correction: Varied cellular abnormalities in thin vs. normal endometrium in recurrent implantation failure by single-cell transcriptomics
2024-Aug-27, Reproductive biology and endocrinology : RB&E IF:4.2Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
10029 2024-08-31
METI: deep profiling of tumor ecosystems by integrating cell morphology and spatial transcriptomics
2024-Aug-25, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了Morphology-Enhanced Spatial Transcriptome Analysis Integrator (METI)框架,该框架通过整合细胞形态学和空间转录组学来深入分析肿瘤生态系统 METI框架结合了空间转录组学、细胞形态学和精选基因签名,增强了我们对组织内分子景观和细胞相互作用的理解 NA 开发和评估一种新的分析工具METI,用于改善肿瘤微环境研究中的细胞类型和状态的分层以及细胞共定位分析 胃癌、肺癌、膀胱癌及癌前组织 数字病理学 胃癌, 肺癌, 膀胱癌 空间转录组学 NA 图像, 基因数据 多种肿瘤组织样本,包括胃癌、肺癌、膀胱癌及癌前组织
10030 2024-08-31
The interferon/STAT1 signaling axis is a common feature of tumor-initiating cells in breast cancer
2024-Aug-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文研究了干扰素/STAT1信号轴在乳腺癌肿瘤起始细胞中的作用 开发了一种新的STAT响应性谱系追踪系统,并结合原有的报告基因,揭示了STAT信号在肿瘤起始细胞中的作用 研究仅限于某些基底样三阴性乳腺癌异种移植模型 探讨干扰素/STAT1信号轴在乳腺癌肿瘤起始细胞中的作用及其潜在的治疗意义 乳腺癌肿瘤起始细胞及其相关的信号通路 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 包括异种移植模型和临床样本
10031 2024-08-31
Multimodal analysis unveils tumor microenvironment heterogeneity linked to immune activity and evasion
2024-Aug-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文通过系统生物学方法,从肺癌转录组数据中提取肿瘤微环境(TME)异质性的特征,并探讨其在不同癌症中的保守性及其与抗肿瘤免疫的关系。 首次提出名为iHet的特征,该特征能够预测癌症免疫治疗的效果,并通过单细胞和空间转录组数据分析其细胞起源。 NA 研究肿瘤微环境的异质性及其在免疫治疗中的作用。 肺癌及其他癌症的肿瘤微环境异质性。 数字病理学 肺癌 转录组学 NA 转录组数据 NA
10032 2024-08-31
Activation of limbal epithelial proliferation is partly controlled by the ACE2-LCN2 pathway
2024-Aug-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文探讨了角膜损伤后角膜上皮干细胞及其直接后代早期过渡放大(eTA)细胞的激活机制,特别是ACE2-LCN2通路在其中的作用 首次揭示了ACE2在角膜上皮细胞增殖中的作用及其通过TGFA/EGFR/LCN2通路的调控机制 NA 研究角膜损伤后角膜上皮干细胞和eTA细胞激活的调控机制 角膜上皮干细胞和eTA细胞的增殖机制 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA NA
10033 2024-08-31
Personalized neoantigen vaccines as early intervention in untreated patients with lymphoplasmacytic lymphoma: a non-randomized phase 1 trial
2024-Aug-11, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究探讨了在未治疗的淋巴浆细胞性淋巴瘤患者中使用个性化新抗原疫苗作为早期干预的效果 首次在人类中使用新抗原DNA疫苗治疗淋巴浆细胞性淋巴瘤,并观察到稳定的疾病进展和激活的骨髓T细胞克隆 研究为非随机第一阶段试验,样本量较小,且未涉及标准疗法的比较 评估个性化新抗原疫苗在淋巴浆细胞性淋巴瘤患者中的安全性和有效性 九名无症状的淋巴浆细胞性淋巴瘤患者 NA 淋巴瘤 单细胞转录组学 NA 转录组数据 九名患者
10034 2024-08-31
bHLH transcription factors cooperate with chromatin remodelers to regulate cell fate decisions during Arabidopsis stomatal development
2024-Aug, PLoS biology IF:7.8Q1
研究论文 本文研究了bHLH转录因子与染色质重塑因子在拟南芥气孔发育中的细胞命运决策中的协同作用 本文通过scRNA-seq和ChIP-seq数据分析,揭示了气孔发育中转录调控的不同阶段,并提出了bHLH转录因子和染色质重塑因子共同调控转录和染色质重塑的模型 NA 探讨转录因子、顺式调控元件和表观基因组在细胞命运承诺中的协同调控机制 拟南芥叶表皮中的气孔发育 分子生物学 NA scRNA-seq, ChIP-seq, MNase-seq bHLH转录因子, SWI/SNF染色质重塑复合体, 组蛋白乙酰转移酶HAC1 基因组数据 NA
10035 2024-08-31
Soma-germline communication drives sex maintenance in the Drosophila testis
2024-Aug, National science review IF:16.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了果蝇睾丸中体细胞与生殖细胞间通讯在性别维持中的作用机制 首次通过单细胞RNA测序和CUT&Tag技术,详细解析了体细胞中Chinmo蛋白在性别决定和胰岛素信号通路中的直接调控作用 研究主要集中在果蝇睾丸模型中,可能需要进一步在其他物种中验证相关机制 探讨体细胞信号如何调控生殖细胞以实现正常的配子发生 果蝇睾丸中的体细胞和生殖细胞 发育生物学 NA 单细胞RNA测序, CUT&Tag NA RNA 多个果蝇睾丸样本
10036 2024-08-31
Multiomics unveils extracellular vesicle-driven mechanisms of endothelial communication in human carotid atherosclerosis
2024-Jul-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文研究了外周血管疾病中的细胞间通信机制,特别是通过外泌体在颈动脉粥样硬化中的作用 首次综合分析了外泌体在颈动脉粥样硬化中的多组学特征,揭示了其在疾病进展中的复杂通信网络和功能影响 研究样本量相对较小,且仅限于颈动脉粥样硬化的特定阶段 探讨外泌体在颈动脉粥样硬化中的细胞间通信机制及其对疾病进展的影响 颈动脉粥样硬化患者的外泌体及其在疾病中的作用 数字病理学 心血管疾病 全转录组miRNA测序和基于质谱的蛋白质组学 NA RNA测序数据和蛋白质组学数据 症状性患者16例,无症状患者13例
10037 2024-08-31
Negative selection allows human primary fibroblasts to tolerate high somatic mutation loads induced by N-ethyl-N-nitrosourea
2024-Jul-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文研究了人类原代成纤维细胞在N-乙基-N-亚硝基脲(ENU)诱导的高体细胞突变负荷下的耐受性 首次揭示了单个细胞能够承受约60,000个单核苷酸变异(SNVs)而仅轻微影响生长速率,并证明了这种高突变水平仅通过基因编码区域和维持基本细胞功能及生长的遗传途径中的负选择来耐受 研究仅限于人类原代成纤维细胞,未涉及其他组织类型 探讨细胞在衰老过程中积累的突变负荷对功能的影响 人类原代成纤维细胞 基因组学 NA 单细胞全基因组测序 NA 基因组数据 多个低剂量ENU处理的细胞样本
10038 2024-08-31
Human pluripotent stem cell-derived kidney organoids reveal tubular epithelial pathobiology of heterozygous HNF1B-associated dysplastic kidney malformations
2024-Jun-11, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 研究使用CRISPR-Cas9基因编辑的人胚胎干细胞和诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官,揭示了HNF1B杂合突变相关的肾发育不良的病理生物学机制 首次揭示了HNF1B在人类肾小管分化和形态发生中的形态学、分子和生理学作用,以及其在突变HNF1B导致的肾脏疾病发展中的起源 NA 理解HNF1B杂合突变导致的肾发育不良的病理生物学机制 HNF1B杂合突变的人胚胎干细胞和诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官 数字病理学 肾发育不良 CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 NA 细胞 来自HNF1B相关肾发育不良家族的细胞
10039 2024-08-31
Characterizing enteric neurons in dopamine transporter (DAT)-Cre reporter mice reveals dopaminergic subtypes with dual-transmitter content
2024-May, The European journal of neuroscience
研究论文 本研究利用报告鼠系对肠道中的多巴胺能神经元进行了全面表征,揭示了具有双重递质含量的多巴胺能亚型。 本研究首次在肠道神经系统中发现了一种新型多巴胺能神经元群体,这些神经元同时表达胆碱乙酰转移酶和多巴胺转运体。 需要进一步研究以定义这些多巴胺能肠道神经元的功能特征及其在疾病中的作用。 旨在全面表征肠道中的多巴胺能神经元,并揭示其亚型和功能。 肠道神经系统中的多巴胺能神经元及其亚型。 神经科学 NA 免疫荧光、单细胞转录组学、原位杂交 NA 图像 使用多巴胺转运体报告鼠系进行研究
10040 2024-08-31
Involvement of microglia-expressed MS4A6A in the onset of glioblastoma
2024-May, The European journal of neuroscience
研究论文 本文探讨了微胶质细胞表达的MS4A6A在胶质母细胞瘤发病中的作用 首次揭示了MS4A6A在胶质母细胞瘤中的表达及其对肿瘤细胞增殖和迁移的影响 尚未阐明MS4A6A参与胶质母细胞瘤调控的具体机制 研究MS4A6A在胶质母细胞瘤中的作用及其作为潜在生物标志物的可能性 胶质母细胞瘤患者样本及微胶质细胞中的MS4A6A表达 数字病理学 脑肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA 胶质母细胞瘤患者样本
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