单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
10021 2024-08-21
MAB21L1 modulates gene expression and DNA metabolic processes in the lens placode
2021-12-01, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1
研究论文 本研究通过电子显微镜和单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了Mab21l1基因敲除小鼠的晶状体外胚层早期单细胞水平表型 首次揭示了MAB21L1在晶状体基板形成过程中调节晶状体特异性基因表达和DNA/核苷酸代谢过程的作用 NA 探究MAB21L1在晶状体基板形成中的作用及其对基因表达和DNA代谢过程的调控 Mab21l1基因敲除小鼠的晶状体外胚层 NA 先天性小脑、眼部、颅面和生殖系统(COFG)综合征 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 131个基因下调,148个基因上调
10022 2024-08-21
Leukotriene B4 Is a Major Determinant of Leukocyte Recruitment During Otitis Media
2021, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨了白三烯B4(LTB4)在急性中耳炎(OM)中的作用,通过基因表达分析和LTB4受体抑制剂的使用,观察了LTB4在炎症细胞招募中的关键作用。 首次详细研究了LTB4在急性中耳炎中的作用,并证明了LTB4受体拮抗剂在治疗OM中的潜在价值。 研究主要集中在LTB4的作用上,未全面探讨其他趋化因子在中耳炎中的作用。 研究LTB4在急性中耳炎中的作用及其对炎症反应的影响。 中耳感染非类型化流感嗜血杆菌(NTHi)的LTB4相关基因表达和中耳炎症反应。 NA 中耳炎 基因阵列分析,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 中耳感染NTHi的样本
10023 2024-08-21
Transcriptomic and Single-Cell Analysis of the Murine Parotid Gland
2019-12, Journal of dental research IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序分析了小鼠腮腺在不同成熟阶段的转录组特征 首次全面揭示了腮腺在不同成熟阶段的全球基因表达谱,并发现了腮腺特异性的基因特征和细胞异质性 NA 阐明腮腺的分子特性 小鼠腮腺的转录组和单细胞转录组 数字病理学 NA RNA测序,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 不同成熟阶段的小鼠腮腺样本
10024 2024-08-20
Integrated metabolomics and proteomics analyses to reveal anticancer mechanism of hemp oil extract in colorectal cancer
2024-Oct-15, Journal of pharmaceutical and biomedical analysis IF:3.1Q2
研究论文 本研究通过代谢组学和蛋白质组学分析,探讨了大麻油提取物(HOE)在结直肠癌(CRC)治疗中的抗癌机制 首次详细揭示了大麻油提取物通过影响嘌呤代谢途径和下调c-MYC等细胞周期相关蛋白的表达,导致细胞周期在G1期停滞,从而抑制结直肠癌细胞增殖的机制 NA 阐明大麻油提取物在结直肠癌治疗中的具体抗癌机制 大麻油提取物对结直肠癌细胞的影响 数字病理学 结直肠癌 质谱法 NA 代谢组学数据和蛋白质组学数据 NA
10025 2024-08-20
IL-17A/F double producing T cells, unstable Tregs and quiescent TRMs in clinically healed lesions are potential cellular candidates for recurrence of psoriasis
2024-Sep, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
研究论文 本研究通过单细胞测序和多重免疫组化染色技术,分析了自体愈合性病变、现场复发性银屑病变和相邻正常皮肤中的T细胞亚群,以揭示银屑病复发的细胞机制 首次在临床愈合的银屑病变中识别出IL-17A/F双产T细胞、不稳定Tregs和静息TRMs作为复发的潜在细胞候选者 研究结果需要进一步的深入工作以加深理解 阐明银屑病复发的免疫学机制 银屑病愈合病变中的T细胞亚群 NA 银屑病 单细胞测序,多重免疫组化染色 NA 细胞 自体愈合性病变、现场复发性银屑病变和相邻正常皮肤样本
10026 2024-08-20
RBMS1 reflects a distinct microenvironment and promotes tumor progression in ocular melanoma
2024-Sep, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究通过多种机器学习算法分析了UM患者的DNA甲基化、转录组数据及临床信息,发现甲基化驱动的基因RBMS1与UM患者的临床预后不良相关,并揭示了RBMS1在肿瘤微环境中的作用及其对肿瘤进展的影响。 首次揭示RBMS1基因在眼部黑色素瘤中的作用,及其与肿瘤微环境和预后的关联。 研究主要基于UM患者的数据,未来研究需验证RBMS1在其他类型眼部黑色素瘤中的作用。 探讨RBMS1基因在眼部黑色素瘤中的作用及其对肿瘤微环境和预后的影响。 眼部黑色素瘤,包括葡萄膜黑色素瘤(UM)和结膜黑色素瘤(CM)。 数字病理学 眼部黑色素瘤 DNA甲基化分析、RNA测序、单细胞RNA测序 机器学习算法 DNA甲基化数据、转录组数据、临床信息 具体样本数量未在摘要中明确提及
10027 2024-08-20
Adenosine A2A receptor activation regulates the M1 macrophages activation to initiate innate and adaptive immunity in psoriasis
2024-Sep, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
研究论文 本研究探讨了腺苷A2A受体激活对M1巨噬细胞的调节作用及其在银屑病中的免疫机制 首次发现KRT16在M1巨噬细胞中的表达,并确定CXCL10/11主要来源于巨噬细胞和树突状细胞而非角质形成细胞 NA 探究M1巨噬细胞在银屑病发病机制中的作用 M1巨噬细胞在银屑病中的作用及腺苷A2A受体的调节机制 免疫学 银屑病 单细胞RNA测序 NA RNA NA
10028 2024-08-20
Integrated analysis reveals an aspartate metabolism-related gene signature for predicting the overall survival in patients with hepatocellular carcinoma
2024-Sep, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过多组学数据分析,建立了一个与天冬氨酸代谢相关的基因签名(AMGS),用于预测肝细胞癌患者的总体生存率 首次揭示了天冬氨酸代谢重编程在肝细胞癌中的作用,并建立了一个新的基因签名用于预测患者的生存率 NA 探索天冬氨酸代谢在肝细胞癌中的作用,并开发新的预测工具 肝细胞癌患者及其天冬氨酸代谢相关基因 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) Cox回归模型 多组学数据 来自公共数据库的肝细胞癌患者数据
10029 2024-08-20
TDP-43 was Involved in Radiation-induced Neuronal Damage and May Not Through the BDNF/TrkB Pathway
2024-03-01, Radiation research IF:2.5Q2
研究论文 本研究探讨了TDP-43在辐射诱导的海马损伤中的作用,并评估了BDNF/TrkB通路是否参与此过程。 首次揭示了TDP-43在辐射诱导的神经元损伤中的作用,并发现BDNF/TrkB信号通路可能不参与此过程。 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,需要进一步的人体研究来验证结果。 探究TDP-43在辐射诱导的认知功能障碍中的作用及其与BDNF/TrkB通路的关系。 辐射诱导认知功能障碍的大鼠模型及体外神经元细胞。 神经科学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 大鼠海马组织及体外神经元细胞
10030 2024-08-20
Single-Cell RNA Sequencing Reveals a Role for Reactive Oxygen Species and Peroxiredoxins in Fatty Acid-Induced Rat β-Cell Proliferation
2023-01-01, Diabetes IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序探讨了脂肪酸诱导的大鼠β细胞增殖的转录机制 首次揭示了活性氧物种和过氧化物酶在脂肪酸诱导的β细胞增殖中的关键作用 研究仅限于大鼠模型,且未探讨其他脂肪酸类型对β细胞增殖的影响 探究脂肪酸诱导β细胞增殖的分子机制 大鼠胰岛β细胞 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序 NA RNA 使用了大鼠胰岛样本,具体数量未详述
10031 2024-08-20
Cellular heterogeneity of circulating CD4+CD8+ double-positive T cells characterized by single-cell RNA sequencing
2021-12-08, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了食蟹猴外周血中循环CD4+CD8+双阳性T细胞的组成和特性 研究发现循环中的CD4+CD8+双阳性T细胞不仅包含大量幼稚细胞,还包含多种具有潜在功能的异质性细胞群 尽管研究揭示了循环CD4+CD8+双阳性T细胞的更多亚型,但这一群体本身非常小 研究循环CD4+CD8+双阳性T细胞的组成和特性 食蟹猴外周血中的循环CD4+CD8+双阳性T细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 食蟹猴的外周血样本
10032 2024-08-20
Roles of Macrophages in Atherogenesis
2021, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
综述 本文综述了巨噬细胞在动脉粥样硬化不同阶段中的作用,并描述了基于巨噬细胞的治疗方法 利用单细胞测序技术探讨了病变中巨噬细胞的异质性 NA 探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用及潜在治疗策略 巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用及其治疗潜力 NA 心血管疾病 单细胞测序 NA NA NA
10033 2024-08-20
Aging of the Hematopoietic Stem Cell Niche: New Tools to Answer an Old Question
2021, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了骨髓微环境老化对造血干细胞(HSC)功能的影响,并介绍了用于研究老化过程中骨髓微环境特定改变的新工具 文章介绍了跨学科方法开发的新技术工具,如特定的小鼠模型、共培养系统、新的三维成像工具、骨化小体和模拟骨髓系统,以及单细胞测序技术、空间转录组学和人工智能深度学习方法在数据分析和整合中的应用 NA 探讨骨髓微环境老化对造血干细胞功能的影响,并介绍用于研究老化过程中骨髓微环境特定改变的新工具 造血干细胞(HSC)及其微环境 NA NA 单细胞测序技术、空间转录组学、人工智能和深度学习 NA NA NA
10034 2024-08-20
Single-Cell Sequencing Reveals Differential Cell Types in Skin Tissues of Liaoning Cashmere Goats and Key Genes Related Potentially to the Fineness of Cashmere Fiber
2021, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和计算模型,在辽宁绒山羊的皮肤组织中鉴定了13种皮肤细胞类型,并分析了与绒毛形成相关的细胞簇中的枢纽基因 首次在单细胞水平上揭示了辽宁绒山羊皮肤组织中与绒毛细度相关的细胞类型和关键基因 NA 探究绒毛细度在细胞水平的调控机制 辽宁绒山羊的皮肤组织 NA NA 单细胞RNA测序 计算模型 基因表达数据 NA
10035 2024-08-20
The Potential Prognostic Role of Oligosaccharide-Binding Fold-Containing Protein 2A (OBFC2A) in Triple-Negative Breast Cancer
2021, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究旨在通过分析乳腺癌蛋白质组和转录组数据集,探讨三阴性乳腺癌(TNBC)的潜在预后标志物 发现OBFC2A蛋白在三阴性乳腺癌中具有独立的预后标志物作用,并与其免疫功能相关 NA 探讨三阴性乳腺癌的潜在预后标志物 三阴性乳腺癌患者的预后 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 蛋白质组和转录组数据 来自CPTAC的六种候选蛋白质,以及来自METABRIC的数据集
10036 2024-08-19
HAO2 protects from proximal tubular cells injured in rats with chronic kidney disease by promoting fatty acid metabolic processes
2024-Oct, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
研究论文 本研究使用单细胞转录组测序技术,对正常对照组和慢性肾脏病(CKD)大鼠的血液和肾脏组织细胞进行测序和分析,重点关注关键细胞群和功能富集,以探索CKD的发病机制 成功建立了CKD大鼠的单细胞转录组图谱,并发现HAO2通过促进脂肪酸代谢过程保护近端小管细胞免受损伤 NA 探索慢性肾脏病的发病机制 慢性肾脏病大鼠的血液和肾脏组织细胞 数字病理学 肾脏疾病 单细胞转录组测序技术 NA 细胞 正常对照组和慢性肾脏病大鼠的血液和肾脏组织细胞
10037 2024-08-19
Lysine lactylation-based insight to understanding the characterization of cervical cancer
2024-Oct, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
研究论文 本文通过综合蛋白质组学分析,研究了赖氨酸乳酸化(Kla)在宫颈癌中的特征和功能 首次全面分析了Kla在宫颈癌细胞中的分布和功能,并构建了基于Kla的宫颈癌预后模型 研究主要集中在HeLa细胞系,可能需要进一步在更多样化的细胞系和临床样本中验证 探索赖氨酸乳酸化在宫颈癌中的特征和功能,为治疗提供潜在途径 宫颈癌细胞中的赖氨酸乳酸化位点和相关蛋白 数字病理学 宫颈癌 蛋白质组学分析 NA 蛋白质组、转录组和单细胞转录组数据 3633个Kla位点,1637种蛋白质
10038 2024-08-19
Single-cell analysis identifies critical regulators of spermatogonial development and differentiation in cattle-yak bulls
2024-Sep, Journal of dairy science IF:3.7Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了牦牛和牛-牦牛杂交种在睾丸细胞组成和生精细胞发育轨迹上的差异 首次在单细胞水平上获得了不同生殖细胞和睾丸体细胞的转录组特征,并识别了牦牛和无生育能力牛-牦牛的生精细胞分化和减数分裂的关键调控因子 NA 探讨导致牛科物种杂交不育和物种形成的遗传机制 牦牛和牛-牦牛杂交种的生精细胞发育和分化 NA NA 单细胞RNA测序 NA 转录组 NA
10039 2024-08-19
Requirement of Pdgfrα+ cells for calvarial bone repair
2024-Aug-16, Stem cells translational medicine IF:5.4Q1
研究论文 本文研究了血小板衍生生长因子受体α(PDGFRα)阳性细胞在颅骨修复中的作用 首次详细探讨了PDGFRα阳性间充质细胞在颅骨愈合过程中的贡献 NA 探究PDGFRα阳性间充质细胞在颅骨修复中的作用 PDGFRα阳性间充质细胞 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 细胞 使用Pdgfrα-CreERTM;mT/mG报告动物模型进行研究
10040 2024-08-19
Nanos2 marks precursors of somatic lineages and is required for germline formation in the sea anemone Nematostella vectensis
2024-Aug-16, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本文研究了海葵Nematostella vectensis中Nanos2基因在体细胞系和生殖细胞形成中的作用 通过转基因报告基因和单细胞转录组学,识别了表达生殖细胞相关标记的细胞群,并发现Nanos2基因对生殖细胞形成至关重要 NA 旨在描述海葵中保守的干细胞标记基因 海葵Nematostella vectensis中的干细胞系统 NA NA 转基因报告基因和单细胞转录组学 NA 基因表达数据 NA
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