单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 40024 篇文献，本页显示第 10021 - 10040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10021 | 2025-12-07 |
Targeting the cell adhesion related ligands MAC1 with Indirubin to inhibit AGE-RAGE signaling and mitigate colitis in an mouse model
2025-Dec, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157504
PMID:41273872
|
研究论文 | 本研究阐明了靛玉红通过靶向MAC1抑制AGE-RAGE信号通路，从而缓解溃疡性结肠炎进展的机制 | 首次揭示了靛玉红通过靶向MAC1转录因子并抑制AGE-RAGE信号通路，以巨噬细胞依赖的方式缓解结肠炎的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，其临床转化效果和人体适用性仍需进一步验证 | 阐明靛玉红在溃疡性结肠炎中的抗炎特性及其分子机制 | 溃疡性结肠炎的小鼠模型和细胞模型 | 生物医学研究 | 溃疡性结肠炎 | 蛋白质组测序, 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 分子对接, 双荧光素酶报告基因检测 | NA | 测序数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组测序 | NA | NA |
| 10022 | 2025-12-07 |
Unraveling Traditional Chinese Medicine with single-cell RNA sequencing: Current applications and future frontiers
2025-Dec, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157556
PMID:41275745
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在中医药研究中的当前应用与未来前沿，强调了该技术在解析中医药多组分、多靶点机制及异质性证候方面的潜力 | 系统性地将scRNA-seq技术应用于中医药研究，作为连接中医药整体辨证与分子医学的关键桥梁，突出了中医药在网络驱动调控和整体平衡方面的独特关注点 | NA | 总结scRNA-seq在中医药研究中的前沿应用，并探讨其未来发展方向，以加速中医药及其与精准医学的融合 | 中医药相关研究，主要涉及肿瘤、炎症与自身免疫性疾病、心脑血管疾病、中医药安全性评价及中医证候研究 | 数字病理学 | 肿瘤, 炎症与自身免疫性疾病, 心脑血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10023 | 2025-12-07 |
Chaihu shugan powder ameliorated chronic pancreatitis by reprogramming SMS2-mediated sphingolipid metabolism in M1 macrophages
2025-Dec, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157565
PMID:41308384
|
研究论文 | 本研究探讨了柴胡疏肝散通过调控SMS2介导的鞘脂代谢改善慢性胰腺炎的机制 | 首次揭示柴胡疏肝散中的橙皮素通过靶向SMS2抑制M1巨噬细胞极化，从而改善慢性胰腺炎 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，临床转化需进一步验证 | 阐明柴胡疏肝散治疗慢性胰腺炎的作用机制及关键活性成分 | 慢性胰腺炎小鼠模型、骨髓来源巨噬细胞、原代胰腺星状细胞 | NA | 慢性胰腺炎 | 靶向鞘脂分析、单细胞RNA测序、流式细胞术、分子对接 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10024 | 2025-12-07 |
Endothelial cells as early therapeutic targets in chronic obstructive pulmonary disease: Insights into Tongxinluo's multiple protective mechanisms against cigarette smoke-induced lung injury
2025-Dec, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157600
PMID:41313847
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了内皮细胞作为慢性阻塞性肺疾病早期治疗靶点的潜力，并探讨了中药通心络胶囊通过Apelin/APJ/p38MAPK通路减轻香烟烟雾诱导的肺损伤的多重保护机制 | 首次将内皮细胞作为COPD早期治疗靶点进行研究，结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了通心络胶囊通过Apelin/APJ/p38MAPK通路促进内皮细胞增殖和内皮介导的上皮再生的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证，且通心络胶囊的具体活性成分和作用靶点需进一步明确 | 评估内皮细胞作为COPD早期治疗靶点的潜力，并探究中药通心络胶囊的干预效果 | 香烟烟雾暴露的小鼠模型，以及体外培养的内皮细胞和上皮细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间分布数据 | 香烟烟雾暴露2、4、6、12和24周的小鼠，其中12周时进行单细胞RNA测序和空间测序 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 10025 | 2025-12-07 |
A scheduler for rhythmic gene expression
2025-Dec, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00155-9
PMID:41073798
|
研究论文 | 本文以秀丽隐杆线虫蜕皮时钟为模型，研究遗传振荡器如何调度数千个基因的有序表达 | 开发了一个线性模型，基于超过200个转录因子的结合来预测染色质动态，并识别出九个关键调控因子，这些因子通过加性作用决定每个调控元件的峰值相位和振幅，同时还能通过破坏性干扰产生组成性、非节律性活动 | NA | 探究遗传振荡器如何调度基因的有序表达，以理解发育和其他动态生物过程中的复杂基因表达模式 | 秀丽隐杆线虫的蜕皮时钟及相关基因表达 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 时间分辨ATAC-seq | 线性模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 10026 | 2025-12-07 |
Single-Cell Transcriptomics Unravels Growth Factor Erv1-Like Mediated Ferroptosis as a Key Driver of Intestinal Epithelial Dysfunction in Ulcerative Colitis
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502014
PMID:41098076
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了生长因子Erv1样蛋白（GFER）通过调节铁死亡在溃疡性结肠炎肠道上皮功能障碍中的关键作用 | 首次证明GFER在UC中调节铁死亡的关键作用，并发现其通过与PCBP1相互作用维持铁稳态，以及通过激活PGC-1α/PPARγ通路减少脂质过氧化 | NA | 阐明溃疡性结肠炎中肠道上皮功能障碍的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 溃疡性结肠炎患者的肠道上皮细胞、DSS诱导的结肠炎小鼠模型、LPS诱导的体外肠道上皮细胞炎症模型 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10027 | 2025-12-07 |
Targeted NAT10 Degradation by PROTAC NP1192 Suppresses Hypoxia-Adaptive Glycolysis and Reinvigorates CD8+ Effector T‑Cell Function for Synergistic Cancer Immunotherapy
2025-Nov-26, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.5c00812
PMID:41341045
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为NP1192的PROTAC降解剂，靶向降解NAT10蛋白，通过抑制缺氧适应性糖酵解和增强CD8+效应T细胞功能，从而协同增强癌症免疫治疗效果 | 首次开发了靶向NAT10的PROTAC降解剂NP1192，证明了其通过双重代谢-免疫调节策略（抑制缺氧糖酵解和增强T细胞功能）来克服免疫检查点阻断疗法耐药性的新机制 | 研究主要在宫颈癌细胞系、肿瘤类器官和异种移植模型中进行，尚未在更广泛的癌症类型或人体临床试验中得到验证 | 开发一种新的治疗策略，以克服肿瘤对免疫检查点阻断疗法的耐药性，并增强癌症免疫治疗的效果 | NAT10蛋白、缺氧肿瘤微环境、CD8+ T细胞、宫颈癌细胞、肿瘤类器官、小鼠异种移植模型 | 癌症免疫治疗 | 宫颈癌 | PROTAC技术、单细胞RNA测序、共培养实验、异种移植模型 | NA | 基因表达数据、蛋白质降解数据、代谢物测量数据、细胞功能数据 | 三种肿瘤类器官、小鼠异种移植模型、宫颈癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10028 | 2025-12-07 |
Fibroblast-Specific Loss of TGF-β Signaling Mediates Lipomatous Metaplasia in the Infarcted Heart
2025-Nov-18, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了心肌梗死后成纤维细胞特异性TGF-β信号缺失如何通过Smad非依赖性途径介导成纤维细胞向脂肪细胞转化，导致心脏瘢痕中的脂肪化生 | 首次发现成纤维细胞特异性TGF-β信号缺失通过Smad非依赖性级联反应促进成纤维细胞向脂肪细胞转化，为心肌梗死后脂肪浸润提供了新的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅来自单细胞RNA测序分析，需要进一步验证 | 探究心肌梗死后脂肪化生的细胞机制，特别是成纤维细胞向脂肪细胞转化的分子途径 | 小鼠心肌梗死模型和人类心肌梗死患者的单细胞RNA测序数据 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，谱系追踪，转录组分析 | NA | 基因表达数据，组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10029 | 2025-12-07 |
Bisphenol S disrupts human sertoli cell function through NR1H3 degradation: Mechanistic insights from integrated bulk and single-cell transcriptomics
2025-Nov-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119418
PMID:41241997
|
研究论文 | 本研究揭示了双酚S通过靶向降解NR1H3蛋白损害人类支持细胞功能，从而可能导致男性不育的分子机制 | 首次结合批量与单细胞转录组学，并通过计算模拟与实验验证，确定了NR1H3是双酚S在人类支持细胞中的直接作用靶点 | 研究主要基于体外永生化细胞模型，体内生理环境下的效应仍需进一步验证 | 探究环境污染物双酚S损害人类支持细胞功能并导致男性不育的分子机制 | 永生化人类支持细胞及非梗阻性无精子症睾丸组织 | 生物信息学 | 男性不育症 | RNA测序，单细胞转录组测序，分子对接，分子动力学模拟，MM/GBSA结合自由能计算 | NA | 转录组数据，蛋白质数据 | NA | NA | 批量RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10030 | 2025-12-07 |
Therapeutic Potential of CLDN Family Proteins in Ovarian Cancer: Emerging Biomarkers and Targets
2025-Nov-11, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL45244
PMID:41351424
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析、单细胞RNA测序和功能实验，系统评估了CLDN家族成员（特别是CLDN6、CLDN9和CLDN10）在卵巢癌中的表达、预后价值及治疗潜力 | 首次综合多组学数据（包括单细胞RNA测序）和功能实验，明确CLDN6、CLDN9和CLDN10作为卵巢癌的新型诊断和预后生物标志物组合，并揭示CLDN6通过Wnt/β-catenin通路调控肿瘤恶性表型的关键作用 | CLDN10在肿瘤细胞中高表达但其风险比小于1的机制尚不明确，且研究主要基于公共数据库和体外/体内实验，需要更多临床样本和前瞻性研究进一步验证 | 识别卵巢癌的新型诊断和预后生物标志物及潜在治疗靶点 | CLDN家族基因（特别是CLDN6、CLDN9和CLDN10）在卵巢癌中的表达、功能及临床意义 | 生物信息学与癌症研究 | 卵巢癌 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序、免疫组化、Western blot、siRNA敲低、细胞功能实验（如Transwell侵袭、伤口愈合、线粒体去极化、ROS积累、细胞周期和凋亡检测）、裸鼠体内实验 | 逻辑回归模型、随机效应模型、ROC曲线分析 | 基因表达谱、临床数据、单细胞RNA测序数据、组织微阵列图像、蛋白质印迹数据 | TCGA-OV队列、两个GEO数据集（GSE18520、GSE26712）、独立组织微阵列、卵巢癌细胞系、裸鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10031 | 2025-12-07 |
Circuit-specific gene editing for precision modulation of neuronal activity with CRISPR-rabies virus
2025-Nov-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.03.686433
PMID:41278687
|
研究论文 | 开发了一种结合CRISPR基因编辑和狂犬病毒跨突触传播的CRISPR-狂犬病毒（CRV）系统，用于在解剖学定义的神经回路中进行精确基因编辑 | 利用狂犬病毒的跨突触传播特性，首次实现了在特定神经回路而非仅细胞类型层面的基因编辑，结合细胞类型特异性Cas9表达，能精确调控回路功能 | 未明确提及具体样本量或实验规模，可能受限于病毒递送效率和编辑特异性 | 研究神经回路中基因功能的精确调控，为脑部疾病开发新型基因疗法 | 神经元，特别是海马CA3区的PV中间神经元和锥体神经元 | 神经科学 | 脑部疾病 | CRISPR基因编辑，狂犬病毒递送系统，3'-捕获单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据，单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 3'-捕获单细胞RNA-seq |
| 10032 | 2025-12-07 |
HTRA1-AS1, an ARMS2-region long non-coding RNA, is downregulated in retinas of age-related macular degeneration patients
2025-Nov-06, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.10.29.25338834
PMID:41282784
|
研究论文 | 本研究在年龄相关性黄斑变性（AMD）的主要遗传风险位点10q26区域内，鉴定并验证了一个长链非编码RNA HTRA1-AS1，发现其在AMD患者视网膜中表达下调，并在氧化应激条件下表达显著上调 | 首次在AMD关键遗传风险区域ARMS2-HTRA1内鉴定出长链非编码RNA HTRA1-AS1，并揭示了其在AMD患者视网膜中的表达异常及在氧化应激反应中的动态变化 | 研究样本量相对有限（43例AMD vs 44例对照），且功能机制研究尚不深入，主要基于表达相关性分析 | 探索10q26基因座在年龄相关性黄斑变性发病机制中的非编码RNA调控作用 | 人类死后视网膜组织、人诱导多能干细胞（iPSC）分化的视网膜色素上皮（RPE）细胞 | 基因组学 | 年龄相关性黄斑变性 | RNA-seq、RT-PCR、Sanger测序、单细胞RNA-seq数据分析 | NA | RNA序列数据、基因表达数据 | 87例人类视网膜捐赠者（43例AMD患者，44例对照） | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10033 | 2025-12-07 |
Single Cell Analysis of pBMCs of Psoriasis patients reveals distinct CD4+ T cell phenotypes associated with response to IL-23 blockade
2025-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.04.686122
PMID:41279198
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析银屑病患者外周血单个核细胞，揭示了与IL-23阻断治疗反应相关的CD4+ T细胞表型 | 首次利用单细胞RNA测序技术，在银屑病患者外周血中识别出与IL-23抑制剂治疗反应相关的特定CD4+ T细胞群体，特别是Th1样细胞，并发现其转录组特征与皮损区T细胞相似 | 样本量相对较小（27名患者），且仅基于外周血分析，未直接评估皮损组织；研究结果需在更大队列中验证 | 旨在识别与IL-23阻断治疗反应相关的免疫细胞特征，以预测银屑病患者的临床疗效 | 银屑病或银屑病关节炎患者的外周血单个核细胞（pBMCs） | 单细胞组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 27名银屑病或银屑病关节炎患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10034 | 2025-12-07 |
ST-GCP: a graph convolutional network model with contrastive consistency and permutation for spatial transcriptomics
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf643
PMID:41348600
|
研究论文 | 本文提出了一种名为ST-GCP的自监督图表示学习框架，用于空间转录组数据，通过结合结构-特征扰动机制来提升聚类效果 | ST-GCP引入了特征级随机置换和空间邻接网络中的随机边丢弃，创建两个互补的增强图视图，并利用对比一致性目标对齐视图特定表示，从而在低维空间中耦合图拓扑与转录组谱 | NA | 开发一种自监督图表示学习框架，以更好地利用空间转录组数据中的空间信息，提升聚类和模式发现能力 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 图卷积网络 | 基因表达矩阵和空间邻接网络 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10035 | 2025-12-07 |
Emerging Roles of Megakaryocytes in Immune Regulation and Potential Therapeutic Prospects
2025-Oct-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14211677
PMID:41227322
|
综述 | 本文综述了巨核细胞在传统血小板生成功能之外，在免疫调节、造血干细胞微环境调控以及应对病理生理刺激中的新兴作用 | 揭示了巨核细胞群体的显著异质性及其在止血、免疫和再生过程中的整合作用，并探讨了其作为治疗靶点在再生医学和免疫疗法中的潜力 | NA | 探讨巨核细胞在免疫调节中的新兴功能及其治疗应用前景 | 巨核细胞 | NA | NA | 成像技术，单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10036 | 2025-12-07 |
Matrix stiffness induces endothelial network senescence
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.05.680536
PMID:41278992
|
研究论文 | 本研究开发了一种三维人类模型，揭示了细胞外基质硬化通过机械应力诱导内皮细胞衰老的机制 | 开发了能够将机械应力与炎症或生化输入解耦的三维人类模型，首次证明在没有炎症信号的情况下，基质硬化可通过Notch-JNK-FOS信号轴诱导内皮细胞衰老表型 | 模型可能无法完全模拟体内复杂的微环境，临床样本仅限于合成乳房植入物患者的纤维化包膜组织 | 研究细胞外基质硬化如何通过机械应力驱动内皮细胞衰老，以理解组织功能衰退的机制 | 内皮细胞、三维人类内皮网络模型、患者纤维化包膜组织 | 细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 三维人类模型 | 基因表达数据、组织样本 | 患者纤维化包膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10037 | 2025-12-07 |
Linear Dimensionality Reduction Methods for Analyzing Structured Biomedical Data: Existing Research and Future Opportunities
2025-Sep, Wiley interdisciplinary reviews. Computational statistics
DOI:10.1002/wics.70045
PMID:41341259
|
综述 | 本文综述了用于分析结构化生物医学数据的线性降维方法，包括监督和无监督分析，并基于低秩加噪声模型进行理论和数值比较 | 提出了一个基于低秩加噪声模型的统一框架，对现有结构化降维方法进行理论和数值比较，并指出未来研究方向 | 主要关注线性方法，可能未全面覆盖非线性降维技术，且为综述性文章，缺乏新的实证应用 | 综述现有线性降维方法，以帮助研究人员选择适合结构化生物医学数据分析的方法，并推动该领域未来发展 | 结构化生物医学数据，如单细胞RNA-seq数据、微生物组数据和空间转录组数据 | 机器学习 | NA | NA | 线性降维方法 | 结构化生物医学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10038 | 2025-12-07 |
Modeling gut inflammation using intestinal organoids: Advances, challenges, and future perspectives
2025-Sep, Best practice & research. Clinical gastroenterology
DOI:10.1016/j.bpg.2025.102048
PMID:41350087
|
综述 | 本文综述了利用肠道类器官模拟肠道炎症的进展、挑战与未来展望 | 整合了基因编辑、单细胞与空间转录组学以及类器官芯片等微工程平台，以推进类器官在炎症建模中的应用 | 在实现长期免疫共培养、培养基兼容性以及标准化检测方面仍面临挑战 | 利用肠道类器官模拟肠道炎症，以指导转化研究 | 肠道类器官 | NA | 炎症性肠病 | 基因编辑技术、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10039 | 2025-12-07 |
Single-cell sequencing in molecular diagnostics: Transformative yet untapped potential
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1621081
PMID:41340965
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在分子诊断领域的潜力、当前应用、整合挑战及其在肿瘤学、遗传学与罕见病、传染病和自身免疫性疾病等多个临床领域的发展前景 | 系统性地阐述了单细胞测序技术从研究工具向临床诊断转化的未开发潜力，并强调了其在解析细胞异质性、发现新生物标志物和理解复杂疾病通路方面的独特价值 | 文章指出单细胞测序技术在临床应用中面临数据分析、标准化和常规化整合的挑战，其全面临床转化仍需克服技术瓶颈 | 探讨单细胞测序技术在改善临床分子诊断方面的潜力，并分析其在多个疾病领域的应用前景与挑战 | 单细胞测序技术及其在临床诊断中的应用 | 数字病理学 | 肿瘤学，遗传与罕见病，传染病，自身免疫性疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞遗传与转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10040 | 2025-12-07 |
Identification of Mitochondrial Unfolded Protein Response-Related Genes and Diagnostic Biomarkers in Atherosclerosis by Integrative Multidimensional Analysis and Experimental Validation
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S562903
PMID:41341216
|
研究论文 | 本研究通过整合多维分析结合实验验证，识别了与动脉粥样硬化相关的线粒体未折叠蛋白反应基因及其诊断生物标志物 | 首次整合多维数据集、机器学习算法、单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，系统性探索UPRmt与动脉粥样硬化的关联，并识别出七个关键枢纽基因 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，样本量相对有限（101例AS和67例对照），且实验验证部分仅针对部分基因 | 阐明线粒体未折叠蛋白反应与动脉粥样硬化的关系，并寻找相关的诊断生物标志物和治疗靶点 | 动脉粥样硬化患者样本（来自GEO数据库）及相关基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 微阵列、单细胞RNA-seq、RT-qPCR、Western blot、免疫荧光、分子模拟 | 12种机器学习算法（具体算法未指明）、CellChat算法 | 基因表达数据（微阵列和单细胞RNA-seq数据） | 168个样本（101个动脉粥样硬化样本和67个对照样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |