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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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10001 | 2025-10-07 |
Multi-omics analysis identifies diagnostic circulating biomarkers and potential therapeutic targets, revealing IQGAP1 as an oncogene in gastric cancer
2025-Apr-14, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00895-9
PMID:40229327
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研究论文 | 通过多组学整合分析识别胃癌循环生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次通过多组学整合方法识别出IQGAP1等8个胃癌生物标志物,并揭示IQGAP1在胃癌中的致癌作用 | NA | 识别胃癌诊断性循环生物标志物和潜在治疗靶点 | 胃癌患者 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 基因定量性状位点分析, 蛋白定量性状位点分析, 共定位分析, 孟德尔随机化 | NA | 血浆样本, 肿瘤组织样本, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10002 | 2025-10-07 |
IL1RAP is an immunotherapeutic target for normal karyotype triple-mutated acute myeloid leukemia
2025-Apr-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00769-z
PMID:40229904
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研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定IL1RAP作为正常核型三重突变急性髓系白血病的免疫治疗靶点 | 首次通过多组学方法系统识别IL1RAP作为NKt-AML特异性表面抗原,并证明其可作为抗体-药物偶联物的潜在靶点 | 样本量有限(仅12例NKt-AML样本进行表面蛋白质组分析),需进一步验证 | 寻找NKt-AML特异性表面抗原以开发新型免疫疗法 | 原发性急性髓系白血病样本 | 生物医学 | 急性髓系白血病 | 表面蛋白质组富集、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 100例原发性AML样本(表面蛋白质组),691例原发性AML样本(转录组),23例原发性AML样本(单细胞RNA测序) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10003 | 2025-10-07 |
Extracellular vesicle-derived miRNA-mediated cell-cell communication inference for single-cell transcriptomic data with miRTalk
2025-Apr-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03566-x
PMID:40229908
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研究论文 | 开发了一种名为miRTalk的新方法,用于从单细胞转录组数据推断细胞外囊泡来源的miRNA介导的细胞间通讯 | 首次提出通过细胞外囊泡来源的miRNA-靶标相互作用推断细胞间通讯的创新方法 | NA | 开发从单细胞RNA测序数据推断细胞间通讯的计算方法 | 细胞外囊泡来源的miRNA及其靶标相互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | miRTalk(专门开发的推断算法) | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10004 | 2025-10-07 |
Comprehensive bioinformatics and immunohistochemical analyses identify phosphoinositide metabolism and PNPLA7 as potential biomarkers in urological cancers
2025-Apr-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97118-9
PMID:40221501
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研究论文 | 通过生物信息学和免疫组化分析发现磷酸肌醇代谢和PNPLA7基因可作为泌尿系统癌症的潜在生物标志物 | 首次系统研究磷酸肌醇代谢在泌尿系统癌症中的作用,并发现PNPLA7作为新型生物标志物 | 基于公共数据库的分析,需要进一步实验验证 | 探讨磷酸肌醇代谢在泌尿系统癌症中的预后价值和治疗指导意义 | 透明细胞肾癌、膀胱癌和前列腺腺癌 | 生物信息学 | 泌尿系统癌症 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序,免疫组化 | NA | 基因表达数据,临床样本 | 公共数据库中的泌尿系统癌症数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10005 | 2025-10-07 |
Exploring the tumor microenvironment of breast cancer to develop a prognostic model and predict immunotherapy responses
2025-Apr-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97784-9
PMID:40221624
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研究论文 | 本研究通过分析乳腺癌肿瘤微环境开发预后模型并预测免疫治疗反应 | 识别了12个独立预后基因并构建预后模型,首次揭示内皮细胞比例与患者预后的显著关联 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏前瞻性临床验证 | 开发乳腺癌预后模型并预测免疫治疗反应 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序 | Cox回归,LASSO回归,共识聚类,WGCNA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 公共数据库中的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
10006 | 2025-10-07 |
Overcoming immunotherapy resistance in hepatocellular carcinoma by targeting myeloid IL-8/CXCR2 signaling
2025-Apr-02, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.02.002
PMID:39916327
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研究论文 | 本研究通过靶向髓系IL-8/CXCR2信号通路克服肝细胞癌的免疫治疗耐药性 | 首次在单细胞水平揭示IL-8/CXCR2通路通过髓系抑制细胞介导免疫检查点抑制剂耐药机制,并验证CXCR2拮抗剂的联合治疗策略 | 研究样本量有限,主要基于临床前模型验证机制 | 阐明肝细胞癌免疫检查点抑制剂耐药机制并开发联合治疗策略 | 晚期肝细胞癌患者和小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 原位小鼠模型 | 基因表达数据 | 晚期肝细胞癌患者队列(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10007 | 2025-10-07 |
The origin of patient-derived cancer organoids from pathologically undiagnosed specimen in patients with pancreatobiliary cancers
2025-Apr, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-01026-5
PMID:39688793
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研究论文 | 本研究探讨了从病理学未确诊的胰胆管癌患者样本中建立患者来源癌症类器官的诊断潜力 | 首次证实从病理阴性样本建立的PDCOs能够代表患者癌组织的多组学特征,并展示其作为诊断工具的潜力 | 样本量较小(仅4例患者),需要更大规模试验验证 | 评估患者来源癌症类器官在胰胆管癌诊断和研究中的应用价值 | 胰胆管癌患者(3例胰腺癌,1例胆囊癌)的组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌, 胆囊癌 | 肿瘤panel测序, 单细胞RNA测序, H&E染色, 免疫组织化学染色 | 患者来源癌症类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | 4例患者的9个样本(包括病理阴性样本) | NA | 单细胞RNA测序, 肿瘤panel测序 | NA | NA |
10008 | 2025-10-07 |
An accelerated human in-vitro aging model mimics in-vivo aging and facilitates dynamic testing of anti-aging compounds
2025-Mar-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6173768/v1
PMID:40195985
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研究论文 | 开发了一种加速的人类体外衰老模型,可模拟体内衰老并用于抗衰老化合物的动态测试 | 建立了长期有丝分裂后人类成纤维细胞培养系统,能真实重现并加速体内衰老特征,首次实现了神经元衰老的伪纵向建模 | 研究主要基于成纤维细胞模型,可能无法完全代表其他细胞类型的衰老过程 | 开发人类特异性衰老研究平台并评估抗衰老化合物的疗效 | 人类成纤维细胞及其神经元转化细胞 | 细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组学,表观遗传时钟分析,纵向配对转录组-表观遗传分析 | 体外衰老模型 | 转录组数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10009 | 2025-10-07 |
Identification of the immune infiltration and biomarkers in ulcerative colitis based on liquid-liquid phase separation-related genes
2025-02-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-89252-1
PMID:39915583
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研究论文 | 基于液-液相分离相关基因鉴定溃疡性结肠炎的免疫浸润特征和生物标志物 | 首次将液-液相分离机制与溃疡性结肠炎免疫浸润联系起来,筛选出7个核心诊断基因并发现两个具有不同免疫特征的分子亚型 | NA | 探索液-液相分离相关基因在溃疡性结肠炎免疫浸润中的作用并寻找诊断生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者样本和细胞模型 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 机器学习算法、微阵列、单细胞RNA测序、qRT-PCR | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10010 | 2025-10-07 |
TNBC response to paclitaxel phenocopies interferon response which reveals cell cycle-associated resistance mechanisms
2025-02-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82218-9
PMID:39905117
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研究论文 | 本研究通过实验与计算相结合的方法揭示了三阴性乳腺癌对紫杉醇的反应机制及耐药性 | 发现紫杉醇反应模拟干扰素反应,并鉴定ELF3上调作为紫杉醇耐药的新生物标志物 | 研究主要基于细胞系实验,需要进一步临床验证 | 探索紫杉醇对三阴性乳腺癌细胞的分子响应机制及耐药性 | 三阴性乳腺癌细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 活细胞成像 | 转录因子富集分析 | 基因表达数据, 成像数据 | 细胞系研究,具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10011 | 2025-10-07 |
Interferon-γ Signaling in Eosinophilic Esophagitis Affects Epithelial Barrier Function and Programmed Cell Death
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101466
PMID:39884574
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探究干扰素-γ信号在嗜酸性食管炎中对上皮屏障功能和程序性细胞死亡的影响 | 首次在单细胞水平揭示嗜酸性食管炎中上皮细胞是干扰素反应特征基因表达最高的细胞类型,并发现IFN-γ对上皮屏障功能和细胞凋亡的显著影响 | 研究样本量有限,器官模型可能无法完全模拟体内复杂环境 | 探究嗜酸性食管炎中干扰素信号对食管上皮细胞功能的影响机制 | 嗜酸性食管炎患者的上皮细胞和器官模型 | 单细胞基因组学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 器官培养 | 器官模型 | 基因表达数据 | 嗜酸性食管炎患者活检组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
10012 | 2025-10-07 |
Cellular Crosstalk Promotes Hepatic Progenitor Cell Proliferation and Stellate Cell Activation in 3D Co-culture
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101472
PMID:39892785
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研究论文 | 开发3D共培养系统研究肝祖细胞与星状细胞间的相互作用及其在肝损伤中的作用 | 建立首个能实时观察肝祖细胞增殖与星状细胞激活的3D共培养模型,并发现两种细胞需直接接触才能相互影响 | 研究主要基于小鼠细胞,人类样本验证有限;3D培养系统可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究肝损伤过程中肝祖细胞与星状细胞间的功能相互作用机制 | 小鼠肝星状细胞和肝祖细胞(未分化肝内胆管细胞类器官) | 细胞生物学 | 肝纤维化 | 3D共培养、荧光标记、细胞分选、基因表达分析、空间转录组学 | 3D器官共培养系统 | 基因表达数据、形态学观察数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
10013 | 2025-10-07 |
Exploring the impact of cuproptosis on prostate cancer prognosis via RNA methylation regulation based on single cell and bulk RNA sequencing data
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1573611
PMID:40235543
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研究论文 | 本研究通过单细胞和bulk RNA测序数据探索铜死亡和RNA甲基化调控对前列腺癌预后的影响 | 首次将铜死亡与RNA甲基化调控因子结合构建前列腺癌预后模型,并通过单细胞测序揭示免疫特征 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证机制 | 探索铜死亡和RNA甲基化调控在前列腺癌预后中的作用机制 | 前列腺癌患者 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,qPCR,免疫组化 | LASSO Cox回归模型 | 基因组数据,临床数据,单细胞测序数据 | TCGA前列腺癌数据集及外部验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
10014 | 2025-10-07 |
Unveiling purine metabolism dysregulation orchestrated immunosuppression in advanced pancreatic cancer and concentrating on the central role of NT5E
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1569088
PMID:40236698
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示胰腺癌中嘌呤代谢失调如何促进免疫抑制微环境形成,并确定NT5E在此过程中的核心作用 | 首次在胰腺癌微环境中系统分析嘌呤代谢异质性,发现NT5E是逆转免疫抑制的关键靶点 | 研究样本量有限,需要进一步临床验证 | 探究胰腺癌嘌呤代谢重编程与免疫抑制微环境的关系 | 胰腺癌患者肿瘤微环境中的各类细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 细胞共培养 | AUCell, Ucell, Cellchat | 转录组数据, 空间数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
10015 | 2025-10-07 |
PM2.5 exposure reprograms cell cycle dynamics in uterine immune cells at single-cell resolution
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1561290
PMID:40236703
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究PM2.5暴露对小鼠子宫免疫细胞周期动态的重编程作用 | 首次在单细胞分辨率下揭示PM2.5暴露对子宫免疫细胞周期动态的细胞类型特异性影响 | 研究仅基于小鼠模型,样本量为9,000个细胞,需要进一步验证 | 探究PM2.5暴露对生殖系统免疫细胞周期调控的细胞机制 | 小鼠子宫免疫细胞 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 9,000个平衡细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10016 | 2025-10-07 |
Current insights into human pathogenic phenuiviruses and the host immune system
2024-12, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2024.2384563
PMID:39072499
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综述 | 本综述全面概述了人类致病性白纤病毒与宿主免疫系统的相互作用机制 | 系统整合了白纤病毒毒力因子与宿主免疫互作的最新研究进展,特别关注RVFV和SFTSV的免疫逃避机制 | 作为综述文章,不包含原始实验数据,主要基于现有文献分析 | 阐明人类致病性白纤病毒的宿主识别机制、免疫逃避策略和潜在治疗方法 | 人类致病性白纤病毒(特别是裂谷热病毒和发热伴血小板减少综合征病毒)及其与宿主免疫系统的相互作用 | NA | 病毒感染性疾病 | 宏基因组学、代谢组学、单细胞转录组学、蛋白质组学、基因编辑、单克隆抗体技术 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
10017 | 2025-10-07 |
Hidden liver-joint axis: HBV infection causes rheumatoid arthritis via TRAFD1 with imbalance of HBV X protein and trans-ferulic acid
2024-12, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2024.2422540
PMID:39484999
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研究论文 | 本研究揭示了乙肝病毒通过TRAFD1介导的肝-关节轴机制导致类风湿关节炎的发病机制 | 首次发现HBV编码的HBx蛋白通过上调TRAFD1促进成纤维样滑膜细胞向肌成纤维细胞转化,并鉴定反式阿魏酸可抑制此过程 | 动物模型为CIA模型而非直接HBV感染模型,临床样本量未明确说明 | 探究乙肝病毒感染与类风湿关节炎之间的因果关系及分子机制 | 乙肝病毒感染者、类风湿关节炎患者、转基因小鼠模型、成纤维样滑膜细胞 | 分子生物学 | 类风湿关节炎 | 孟德尔随机化分析、单细胞转录组测序、代谢组学、WGCNA | CIA小鼠模型 | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、代谢组学 | NA | NA |
10018 | 2025-10-07 |
A targetable type III immune response with increase of IL-17A expressing CD4+ T cells is associated with immunotherapy-induced toxicity in melanoma
2024-09, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00810-4
PMID:39210005
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研究论文 | 本研究探讨了免疫检查点抑制剂治疗黑色素瘤时引发不良反应的免疫机制,发现III型免疫反应和IL-17A表达CD4+T细胞与免疫治疗毒性相关 | 首次揭示了III型免疫反应特征和IL-17A表达CD4+T细胞在免疫治疗毒性中的作用,并提供了抗IL-17A治疗不良反应的概念验证证据 | 样本量有限,抗IL-17A治疗仅在两名患者中验证,需要更大规模的临床试验确认疗效 | 研究免疫检查点抑制剂治疗黑色素瘤时引发不良反应的免疫机制 | 黑色素瘤患者接受免疫检查点抑制剂治疗期间出现不良反应的患者 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 蛋白质组学分析、多重细胞因子检测、流式细胞术、多重免疫组织化学、空间转录组学 | NA | 血清蛋白质组数据、细胞因子数据、流式细胞数据、组织病理数据、空间转录组数据 | 未明确具体样本数量,包括血清样本、外周血样本、皮肤皮疹和结肠炎组织样本 | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学, 流式细胞术, 多重免疫组织化学 | NA | NA |
10019 | 2025-10-07 |
The proteogenomic landscape of multiple myeloma reveals insights into disease biology and therapeutic opportunities
2024-08, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00784-3
PMID:38942927
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研究论文 | 通过蛋白质基因组学分析多发性骨髓瘤的疾病生物学特征和潜在治疗靶点 | 首次系统评估多发性骨髓瘤蛋白质组,整合磷酸化蛋白质组学、RNA测序和纳米孔DNA测序进行多组学分析 | 样本量相对有限(138例),需要进一步验证研究 | 探索多发性骨髓瘤的蛋白质基因组学特征以改善风险分层和发现新疗法 | 138例原发性患者来源的浆细胞恶性肿瘤,包括初治多发性骨髓瘤、浆细胞白血病和意义未明的单克隆丙种球蛋白病以及健康对照 | 癌症研究 | 多发性骨髓瘤 | 串联质量标签定量蛋白质组学、RNA测序、纳米孔DNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、基因组数据 | 138例患者样本和健康对照 | Oxford Nanopore | 蛋白质组学、RNA测序、DNA测序、单细胞RNA测序 | 纳米孔测序 | 基于串联质量标签的定量全局(磷酸化)蛋白质组学 |
10020 | 2025-10-07 |
An atlas of transcribed enhancers across helper T cell diversity for decoding human diseases
2024-07-05, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.add8394
PMID:38963856
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类CD4 T细胞中增强子RNA和其他编码/非编码RNA的转录起始位点图谱 | 首次在人类CD4 T细胞中定义了双向转录增强子的细胞类型特异性图谱,并揭示疾病遗传性在这些增强子中的富集 | NA | 解码转录增强子与人类疾病的关联 | 人类CD4 T细胞 | 生物信息学 | 免疫介导疾病 | 5'单细胞RNA测序,单细胞染色质分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,染色质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |