单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9981 - 10000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9981 | 2025-10-07 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing data: unveiling RNA methylation and autophagy-related signatures in chronic obstructive pulmonary disease patients
2025-02-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-87437-2
PMID:39893187
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了慢性阻塞性肺疾病中RNA甲基化和自噬相关特征 | 首次系统整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据研究COPD中RNA甲基化与自噬的关联，发现FTO和IGF2BP2作为关键RNA甲基化调控因子在巨噬细胞中表达下调 | 研究主要基于公共数据库数据，部分发现需要通过动物模型验证，样本来源和数量有限 | 研究RNA甲基化调控因子及其与自噬在COPD发病机制中的作用 | COPD患者和非COPD患者的肺组织样本，COPD小鼠模型 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 流式细胞术 | 逻辑回归, WGCNA, 基因集富集分析 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的COPD和非COPD患者样本，具体数量未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9982 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis reveals the tumor suppressor role of macrophage signature gene FCER1G in hepatocellular carcinoma
2025-02-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88071-8
PMID:39893200
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和基因组分析揭示巨噬细胞特征基因FCER1G在肝细胞癌中的肿瘤抑制作用 | 首次系统性地识别巨噬细胞相关特征基因并构建基于LASSO回归的预后预测模型，发现FCER1G在HCC中的肿瘤 suppressor 功能 | 样本量较小（仅7个HCC样本），未发现MSI和TMB评分的显著差异 | 探索肝细胞癌中巨噬细胞特征基因及其对患者预后的影响 | 肝细胞癌患者样本和巨噬细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，基因组分析，主成分分析，t-SNE降维，LASSO回归 | LASSO回归模型 | 单细胞测序数据，基因组数据 | 7个HCC样本（来自GEO数据库），TCGA-LIHC队列验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9983 | 2025-10-07 |
MSC-EVs and UCB-EVs promote skin wound healing and spatial transcriptome analysis
2025-02-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-87592-6
PMID:39893214
|
研究论文 | 本研究探讨间充质干细胞来源细胞外囊泡和脐带血来源细胞外囊泡通过调节关键信号通路促进皮肤伤口愈合和减少瘢痕形成的机制 | 首次结合空间转录组学技术系统分析两种来源细胞外囊泡对皮肤伤口愈合过程中细胞异质性和信号通路的调控作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体临床试验验证 | 探究细胞外囊泡促进皮肤伤口愈合和减少瘢痕形成的分子机制 | 人真皮成纤维细胞和小鼠皮肤伤口模型 | 空间转录组学 | 皮肤创伤 | 超速离心法、透射电镜、纳米颗粒追踪分析、Western blot、细胞划痕实验、细胞迁移实验、细胞增殖实验、空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、组织学图像、细胞实验数据 | 小鼠皮肤组织样本（分组对照） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9984 | 2025-10-07 |
Vascular smooth muscle cell-derived SO2 sulphenylated interferon regulatory factor 1 to inhibit VSMC senescence
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1516885
PMID:40223932
|
研究论文 | 本研究揭示了内源性二氧化硫通过亚磺酰化干扰素调节因子1抑制血管平滑肌细胞衰老的分子机制 | 首次发现SO2通过IRF1蛋白C83位点的亚磺酰化修饰抑制VSMC衰老的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，人类临床相关性需要进一步验证 | 探索内源性SO2在血管平滑肌细胞衰老中的作用及其分子通路 | 老年小鼠、VSMC特异性AAT1敲除小鼠、D-半乳糖处理的主动脉环和大鼠VSMC系A7r5 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | Western blot、单细胞RNA测序、实时定量PCR、SA-β-gal染色、生物素转换实验、定点突变 | NA | 蛋白质表达数据、基因表达数据、细胞染色数据 | 老年小鼠(24月龄)、基因修饰小鼠模型、细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9985 | 2025-10-07 |
Bioinformatic Analysis of Apoptosis-Related Genes in Preeclampsia Using Public Transcriptomic and Single-Cell RNA Sequencing Datasets
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S507660
PMID:40224388
|
研究论文 | 通过公共转录组和单细胞RNA测序数据分析先兆子痫中凋亡相关基因及其细胞机制 | 首次结合转录组学和单细胞RNA测序技术系统分析先兆子痫中凋亡相关基因，并构建诊断列线图 | 所有数据均来自公共数据库，需进一步实验验证 | 探索先兆子痫中凋亡相关基因作为生物标志物的潜力及其细胞机制 | 先兆子痫患者胎盘组织 | 生物信息学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, RT-qPCR | CytoHubba算法, 诊断列线图 | 基因表达数据 | 公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 9986 | 2025-10-07 |
Causal Associations of Inflammatory Cytokines With Osteosarcopenia: Insights From Mendelian Randomization and Single Cell Analysis
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/6005225
PMID:40224485
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析炎症细胞因子与骨少肌症的因果关系 | 首次整合孟德尔随机化和单细胞RNA测序方法研究细胞因子在骨少肌症中的因果作用 | 研究结果为初步发现，需要进一步研究验证 | 阐明循环细胞因子在骨少肌症发病机制中的因果作用 | 骨少肌症（骨质疏松和肌肉减少症共存）患者 | 生物医学研究 | 老年疾病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 | 两样本孟德尔随机化 | 基因组关联研究数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个队列的公开GWAS数据，分析91种循环细胞因子 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9987 | 2025-10-07 |
Mendelian Randomization Combined with Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals the Role of the Key Gene PCLAF in the Pathogenesis of Atopic Dermatitis
2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S506139
PMID:40225314
|
研究论文 | 结合孟德尔随机化和单细胞转录组分析揭示PCLAF基因在特应性皮炎发病机制中的关键作用 | 首次将孟德尔随机化与单细胞转录组分析相结合，系统性地识别特应性皮炎的关键致病基因和代谢通路 | 研究结果需要进一步实验验证，样本来源和数量可能存在限制 | 探索特应性皮炎的遗传和代谢分子机制 | 特应性皮炎相关的基因和细胞类型 | 生物信息学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 孟德尔随机化, 基因集富集分析 | edgeR, Seurat | 基因表达数据, eQTL数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9988 | 2025-10-07 |
Targeting formyl peptide receptor 2 to suppress neuroinflammation in neuromyelitis optica spectrum disorder
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.107303
PMID:40225578
|
研究论文 | 本研究探讨了甲酰肽受体2（FPR2）在视神经脊髓炎谱系障碍（NMOSD）神经炎症中的作用及其治疗潜力 | 首次揭示FPR2/mFpr2通过调控小胶质细胞活性参与NMOSD神经炎症的新机制 | 研究主要基于动物模型，人类样本验证有限 | 研究FPR2在NMOSD神经炎症中的作用及FPR2拮抗剂的治疗潜力 | NMOSD患者外周血样本和NMOSD小鼠模型 | 神经免疫学 | 视神经脊髓炎谱系障碍 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，MRI，免疫染色 | NA | 基因表达数据，影像数据，细胞计数数据 | NMOSD患者和健康对照的外周血样本，NMOSD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9989 | 2025-10-07 |
FOS-driven inflammatory CAFs promote colorectal cancer liver metastasis via the SFRP1-FGFR2-HIF1 axis
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.111625
PMID:40225580
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了FOS驱动的炎症性癌症相关成纤维细胞通过SFRP1-FGFR2-HIF1轴促进结直肠癌肝转移的机制 | 首次鉴定出与不良预后相关的炎症性CAF亚型(CFD iCAFs)，并阐明其通过FOS介导的SFRP1过表达促进肿瘤干细胞性和上皮间质转化的新机制 | 未明确说明样本数量，机制研究主要依赖细胞系和小鼠模型，需要进一步临床验证 | 探究癌症相关成纤维细胞在结直肠癌肝转移中的作用机制 | 结直肠癌患者样本（非转移性原发肿瘤和转移性原发肿瘤）、SW480和CT26细胞系、BALB/c小鼠 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 动物模型 | 皮下异种移植模型, 原位肿瘤转移模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9990 | 2025-10-07 |
Deciphering single-cell landscape unravels cell-type-specific functional roles of RNA m6A modification in atherosclerosis
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.104179
PMID:40225569
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了m6A修饰在动脉粥样硬化中细胞类型特异性功能调控机制 | 首次在单细胞水平构建了动脉粥样硬化中m6A修饰的调控图谱，揭示了细胞类型特异性的调控功能 | NA | 阐明m6A修饰在动脉粥样硬化中的细胞类型特异性调控功能 | 动脉粥样硬化患者样本中的多种细胞类型（内皮细胞、平滑肌细胞、巨噬细胞等） | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9991 | 2025-10-07 |
Integrated Phenotypic and Transcriptomic Analyses of Osteoporosis in Type 2 Diabetic Mice
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.109537
PMID:40225857
|
研究论文 | 本研究通过整合表型和转录组分析，揭示了2型糖尿病早期骨质疏松的表型特征及骨髓间充质干细胞的功能异常 | 首次在2型糖尿病早期阶段系统揭示骨质疏松表型，并通过单细胞RNA测序发现骨髓间充质干细胞在糖尿病性骨质疏松中的关键作用 | 研究仅使用小鼠模型，结果需要进一步在人类样本中验证 | 探究2型糖尿病对骨骼的影响，特别是在疾病早期阶段 | 高脂饮食诱导的2型糖尿病小鼠模型 | 数字病理学 | 骨质疏松 | RNA测序,单细胞RNA测序,微计算机断层扫描,免疫荧光染色,酶联免疫吸附测定 | NA | 基因表达数据,影像数据,组织学数据 | 4周和16周高脂饮食喂养的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 9992 | 2025-10-07 |
Integrating Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Data to Explore Sphingolipid Metabolism Molecular Signatures in Ovarian Cancer Prognosis: an Original Study
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.107391
PMID:40225866
|
研究论文 | 本研究整合单细胞和bulk RNA测序数据，基于鞘脂代谢相关基因开发卵巢癌预后分子分型和预测标志物 | 首次整合单细胞和bulk RNA测序数据系统分析鞘脂代谢在卵巢癌中的作用，构建了基于三个SRGs的预后模型并实验验证关键基因功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多独立队列验证模型的临床适用性 | 探索鞘脂代谢分子特征在卵巢癌预后中的作用并构建预测模型 | 卵巢癌患者样本和细胞系(HEYA8和SKOV3) | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,WGCNA,细胞功能实验 | COX回归,LASSO回归,预后风险模型 | RNA测序数据,临床数据 | TCGA和GEO数据库中的卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 9993 | 2025-10-07 |
Cell-type specific epigenetic and transcriptional mechanisms in substance use disorder
2025, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2025.1552032
PMID:40226298
|
综述 | 本文综述了物质使用障碍中细胞类型特异性的表观遗传和转录调控机制 | 强调细胞类型特异性机制在物质使用障碍中的作用，并展望多组学技术整合用于个性化治疗策略 | NA | 探讨物质使用障碍的分子和细胞机制 | 神经元和非神经元细胞 | 表观遗传学 | 物质使用障碍 | 单细胞转录组学, 表观遗传学 | NA | 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学技术 | NA | NA |
| 9994 | 2025-10-07 |
Construction and Validation of a T Cell Exhaustion-Related Prognostic Signature in Cholangiocarcinoma
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/8823837
PMID:40226355
|
研究论文 | 本研究构建并验证了基于T细胞耗竭相关基因的胆管癌预后预测模型 | 首次在胆管癌中系统识别T细胞耗竭相关基因模块并建立四基因预后特征 | 研究基于公共数据集，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 开发胆管癌预后预测的生物标志物 | 胆管癌患者样本和细胞 | 生物信息学 | 胆管癌 | WGCNA, LASSO Cox回归, ssGSEA, scRNA-seq, qRT-PCR, western blot | 预后特征模型 | 基因表达数据 | E-MTAB-6389数据集中的胆管癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9995 | 2025-10-07 |
A novel tumor-associated macrophage risk signature predicts prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2025, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/SQUF6988
PMID:40226479
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，建立了一个基于肿瘤相关巨噬细胞的10基因风险特征，用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次系统鉴定肺腺癌中肿瘤相关巨噬细胞亚群并构建具有预后预测价值的10基因特征，该特征还能预测免疫检查点抑制剂治疗反应 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性临床试验进一步验证 | 建立肺腺癌预后预测模型并评估免疫治疗反应 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, Cox回归分析, LASSO回归 | 风险特征模型, 诺模图 | 基因表达数据, 临床数据 | 多个独立队列验证（包括IMvigor210和GSE78220数据集） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9996 | 2025-10-07 |
Unveiling the power of Treg.Sig: a novel machine-learning derived signature for predicting ICI response in melanoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1508638
PMID:40226609
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的Treg.Sig特征，用于预测黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂治疗的响应 | 首次通过机器学习方法构建了Treg相关特征Treg.Sig，并在黑色素瘤中验证了其预测ICI疗效的能力，优于51个已有特征 | 研究主要基于转录组数据，需要进一步临床验证 | 开发预测黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂治疗响应的生物标志物 | 黑色素瘤患者和黑色素瘤小鼠模型 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 机器学习 | 转录组数据 | 训练数据集和外部测试数据集（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 9997 | 2025-10-07 |
Identification of a novel prognostic marker ADGRG6 in pancreatic adenocarcinoma: multi-omics analysis and experimental validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1530789
PMID:40226617
|
研究论文 | 通过多组学分析和实验验证发现ADGRG6是胰腺腺癌的新型预后标志物和治疗靶点 | 首次发现ADGRG6在胰腺腺癌中的预后价值及其通过突变p53调控肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于公共数据库和实验模型，需要进一步临床验证 | 探索胰腺腺癌的新型预后标志物和治疗靶点 | 胰腺腺癌患者数据和细胞/动物模型 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 多组学分析,单细胞测序,免疫浸润分析,细胞实验,动物实验 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质数据 | TCGA和GEO数据库中的多个胰腺腺癌队列 | NA | 单细胞测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 9998 | 2025-10-07 |
De novo detection of somatic variants in high-quality long-read single-cell RNA sequencing data
2024-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.06.583775
PMID:38496441
|
研究论文 | 开发了名为LongSom的计算工作流程，利用高质量长读长单细胞RNA测序数据检测体细胞变异 | 无需正常样本即可检测体细胞变异，能够同时检测SNV、mtSNV、CNA和基因融合，并基于细胞突变谱重新注释细胞类型 | NA | 开发检测体细胞变异的方法以重建肿瘤克隆异质性 | 人类卵巢癌样本 | 计算生物学 | 卵巢癌 | 长读长单细胞RNA测序 | 计算工作流程 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9999 | 2025-10-07 |
ApoE ε4-dependent alteration of CXCR3 + CD127 + CD4 + T cells is associated with elevated plasma neurofilament light chain in Alzheimer's disease
2024-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.28.596276
PMID:38853824
|
研究论文 | 本研究通过单细胞质谱流式技术揭示了阿尔茨海默病患者外周血中CXCR3+CD127+Th1细胞与神经丝轻链蛋白的负相关性，并发现这种关联受ApoE ε4基因型调控 | 首次发现外周免疫细胞CXCR3+CD127+Th1细胞与AD神经退行标志物NfL的ApoE ε4依赖性关联，并证实脑脊液中该细胞群的促炎能力增强 | 样本量有限，机制研究不够深入，需要进一步验证因果关系 | 探究阿尔茨海默病患者外周适应性免疫细胞组成与神经炎症的关联 | 阿尔茨海默病患者和健康对照者的外周血单核细胞和脑脊液样本 | 免疫学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞质谱流式技术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 血浆蛋白浓度数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10000 | 2025-10-07 |
Genome-wide Cas9-mediated screening of essential non-coding regulatory elements via libraries of paired single-guide RNAs
2024-07, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-024-01204-8
PMID:38778183
|
研究论文 | 开发了一种通过配对sgRNA文库进行Cas9介导的全基因组非编码调控元件功能筛选的方法 | 首次使用配对sgRNA文库系统性地删除全基因组非编码调控元件来研究其功能 | 研究仅限于K562、293T细胞系和人胚胎干细胞，尚未在更多细胞类型中验证 | 系统研究非编码调控元件的功能及其在生物学过程中的作用 | 人类基因组中的非编码调控元件 | 基因组学 | NA | CRISPR-Cas9筛选，单细胞测序 | NA | 基因组数据，测序数据 | K562细胞系、293T细胞系和人胚胎干细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |