单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 39915 篇文献,本页显示第 981 - 1000 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
981 2026-05-21
TNFAIP3 in M2 Macrophage Attenuates Subretinal Fibrosis in Laser-Induced Murine Model
2026-May-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
982 2026-05-21
Single-cell RNA sequencing reveals extensive fibrotic remodeling and pathogenic chondrocyte subpopulations in developmental dysplasia of the hip
2026-Apr-30, Translational pediatrics IF:1.5Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示发育性髋关节发育不良中髋臼软骨的纤维化重塑和致病性软骨细胞亚群 首次在发育性髋关节发育不良的髋臼软骨中通过单细胞RNA测序识别出四个此前未知的软骨细胞亚群,并揭示其向纤维软骨样表型的显著转变及相关的分子机制 样本量较小(3例患者和2例对照),且研究仅聚焦于转录组层面,缺乏功能验证实验 探究发育性髋关节发育不良中髋臼软骨的细胞异质性和纤维化重塑机制 发育性髋关节发育不良患儿的髋臼软骨细胞 数字病理学 骨科疾病 单细胞RNA测序,PCR,免疫组化,组织学染色 NA 基因表达数据 3例发育性髋关节发育不良患儿和2例年龄匹配对照的髋臼软骨,共10550个软骨细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
983 2026-05-21
Shaping the microvascular network: insights into skeletal muscle angiogenesis
2026-Apr-29, Open biology IF:4.5Q1
综述 本文综述了骨骼肌血管生成的细胞事件和分子机制,包括与细胞外基质的相互作用以及多种驻留和浸润细胞类型的关键作用 重点介绍了新兴高分辨率技术(如单细胞RNA测序)在揭示骨骼肌血管生成中细胞类型特异性作用及细胞间相互作用方面的应用潜力 骨骼肌血管生成的确切机制仍然只有部分被理解 探讨骨骼肌血管生成的调控机制及其在生理和病理条件下的变化 骨骼肌血管生成过程中的细胞事件和分子机制 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
984 2026-05-21
Multi-Omics reveals SPP1 + malignant and CXCR4+ TAM crosstalk predicts immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2026-Apr-28, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过多组学分析揭示SPP1+恶性细胞与CXCR4+肿瘤相关巨噬细胞之间的相互作用预测肺腺癌免疫治疗反应 首次发现SPP1+恶性细胞和CXCR4+肿瘤相关巨噬细胞之间的相互作用是驱动CD8T细胞耗竭并导致免疫治疗反应不良的新机制,并提供了潜在的生物标志物 NA 识别肺腺癌免疫治疗反应的预测性生物标志物 肺腺癌的肿瘤微环境中的细胞异质性和动态变化 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'试剂盒,Illumina NovaSeq测序平台用于空间转录组分析
985 2026-05-21
SIV infection disrupts the spatial cellular and communication networks of pulmonary granulomas during SIV/Mtb co-infection
2026-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过空间转录组学比较SIV/Mtb共感染猕猴肺部肉芽肿的细胞和通讯网络,发现SIV感染破坏了肉芽肿的空间免疫功能,且抗逆转录病毒治疗未能完全恢复 首次在SIV/Mtb共感染模型中揭示了肉芽肿内空间转录组学特征的变化,并评估了抗逆转录病毒治疗对空间免疫网络的影响 未详细说明ART治疗的持续时间对结果的影响,且样本量有限 探究HIV/Mtb共感染中肺部肉芽肿的免疫相互作用及ART对空间转录组学的影响 与SIV/Mtb共感染的猕猴 空间转录组学 结核病,艾滋病 空间转录组学 NA 转录组数据 猕猴样本(具体数量未说明) NA 空间转录组学 NA NA
986 2026-05-21
Single-cell profiling of ANKRD26 thrombocytopenia reveals progenitor expansion and polyploid apoptosis via JUNB-p21
2026-Apr-23, Blood IF:21.0Q1
研究论文 通过单细胞转录组学和体外功能分析,揭示ANKRD26相关性血小板减少症中祖细胞扩增和通过JUNB-p21通路诱导多倍体巨核细胞凋亡的机制 首次在多个患者中整合单细胞转录组和体外功能分析,发现ANKRD26通过JUNB介导的CDKN1A转录激活独立于经典p53-PIDDosome轴诱导多倍体巨核细胞凋亡,并定位ANKRD26到中心体参与有丝分裂调控 样本量有限(仅4名患者),未提及可能的批次效应或技术复制的详细评估 阐明ANKRD26基因5'UTR变异导致的血小板减少症的细胞和分子机制 4名THC2患者的骨髓CD34+造血干细胞和祖细胞以及原代巨核细胞 数字病理学 血小板减少症 单细胞转录组学,共聚焦成像 NA 序列数据 4名患者,包含47,281个THC2 HSPC细胞与51,907个对照细胞,以及7,309个THC2 pMK细胞与5,077个对照细胞 10x Genomics,Illumina 单细胞RNA测序 10x Chromium,Illumina NovaSeq 10x Chromium 单细胞3'测序,Illumina NovaSeq测序平台
987 2026-05-21
Reference-free discovery with barcoded single-cell sequencing
2026-Apr-22, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 介绍sc-SPLASH方法用于无参考的条形码单细胞测序数据发现 首次提出统计优先、无参考的发现方法,独立BKC子模块优化条形码数据预处理,速度比UMI-tools快约50倍 文章中未提及具体局限性 开发一种无参考的统计优先方法,用于发现条形码单细胞测序和空间转录组学中的转录组变异 海绵(Spongilla,缺少参考序列)和海鞘(Ciona)的免疫样细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学 NA 序列数据 海绵和海鞘的免疫样细胞样本 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
988 2026-05-21
scVIP: personalized modeling of single-cell transcriptomes for developmental and disease phenotypes
2026-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出scVIP生成框架,将单细胞转录组与个体表型关联,实现发育与疾病表型的个性化建模 首次将生成模型与细胞类型感知的多实例学习结合,从单细胞数据中学习个体层面的嵌入表示,并能整合不同表型定义的数据集 仅基于摘要,未提及局限性;可能需大量训练数据、可解释性有限或对罕见细胞类型敏感性不足 开发能够将单细胞转录组与个体表型(如发育年龄、疾病进展和神经病理)关联的个性化建模方法 单细胞转录数据及对应的个体表型标记 机器学习 神经退行性疾病 单细胞RNA测序 生成模型(如变分自编码器)与多实例学习 基因表达数据 未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
989 2026-05-21
The transcription factor E4F1 is crucial for spermatogonial differentiation and meiosis progression in mice
2026-Apr-14, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 揭示了转录因子E4F1在小鼠精原细胞分化和减数分裂进程中的关键作用 首次发现E4F1通过调控精原细胞分化和减数分裂相关基因表达,影响小鼠精子发生过程 需要进一步验证以完全阐明E4F1依赖的转录调控机制 探究E4F1在精原细胞分化和减数分裂进程中的功能及分子机制 小鼠精原细胞和精母细胞 分子生物学 NA Cre-loxP基因敲除、单细胞转录组分析、CUT&Tag分析 NA 基因表达数据 E4f1条件性敲除小鼠和HIS-Tag敲入小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
990 2026-05-21
scDEBGCL: a deep embedding approach based on bipartite graph contrastive learning for single-cell RNA-seq data
2026-Apr-14, BMC biology IF:4.4Q1
研究论文 提出一种基于二分图对比学习的深度嵌入方法scDEBGCL,用于单细胞RNA测序数据的低维表示学习与下游分析 利用奇异值分解增强二分图并结合对比学习、图重建和数据重建联合学习细胞低维嵌入,有效保留全局细胞-基因相互作用并捕获判别性细胞表示 实验结果仅展示scDEBGCL作为有用框架,未提及具体局限性 解决单细胞RNA-seq数据高维稀疏性对下游分析(如细胞聚类、轨迹推断)的影响,学习有效的嵌入表示 单细胞RNA-seq数据中的细胞和基因 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 图对比学习 基因表达矩阵 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
991 2026-05-21
High-throughput strategy for targeting MDM2 in uveal melanoma to reverse radiation therapy resistance
2026-Apr-11, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 结合机器学习和高通量筛选平台发现靶向MDM2的小分子抑制剂,以克服葡萄膜黑色素瘤的放射治疗耐药性 首次将机器学习模型与高通量筛选平台整合,识别靶向MDM2的新型小分子抑制剂SAR405838,并验证其通过p53激活增强放射敏感性 未提及临床验证和体内实验的长期效果评估 开发克服葡萄膜黑色素瘤放射治疗耐药性的新治疗策略 葡萄膜黑色素瘤细胞及其放射治疗耐药机制 机器学习 葡萄膜黑色素瘤 转录组测序, 单细胞RNA测序 机器学习模型 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
992 2026-05-21
MDA5-MAVS and interferon-lambda signaling in the intestinal epithelium limit murine astrovirus infection
2026-Apr, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示MDA5-MAVS和干扰素-λ信号在肠道上皮细胞中限制小鼠星状病毒感染的作用机制 首次在体内通过单细胞RNA测序明确小鼠星状病毒感染的细胞嗜性,并证明肠上皮细胞是干扰素-λ的主要来源,MDA5-MAVS通路调控干扰素-λ诱导,且IFN-λ信号主要在分泌细胞(包括杯状细胞)中发挥抗病毒作用 未发现特定肠上皮细胞类型对MAVS在控制病毒感染中的需求差异,提示可能需要多种肠上皮细胞的协同作用 阐明小鼠星状病毒感染时干扰素-λ诱导的病毒感知通路及其在病毒控制和细胞嗜性调节中的具体作用 小鼠星状病毒感染的小鼠肠道上皮细胞(包括杯状细胞和多种肠上皮细胞类型) 机器学习和单细胞组学 肠道病毒感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未提供具体样本量信息 NA 单细胞RNA测序 NA NA
993 2026-05-21
Application and Challenges of Chimeric Antigen Receptor T Cell Therapy in Systemic Rheumatic Diseases and Autoimmune Disorders
2026-Apr, MedComm IF:10.7Q1
综述 综述嵌合抗原受体T细胞疗法在系统性风湿病和自身免疫性疾病中的应用与挑战 系统总结了CAR-T在自身免疫性疾病中的作用机制,分析了核心临床挑战,并突出了新兴策略(如通用型/体内生成CAR-T细胞、多靶点/逻辑门设计、器官归巢工程以及与耐受增强剂的合理组合),强调多组学整合用于患者分层和复发预测 面临制造复杂、组织穿透有限、抗原逃逸、免疫后遗症以及缺乏预测性生物标志物等未满足需求 系统阐述CAR-T在自身免疫性疾病中的机制、挑战和精准导向创新策略,推动功能免疫重置 系统性风湿病和自身免疫性疾病患者 自然语言处理 自身免疫性疾病 CAR-T细胞疗法 NA NA NA NA NA NA NA
994 2026-05-21
Metabolic Alterations in Macrophage Subtypes Propel Immune and Stromal Remodeling in Neurofibroma's Malignant Progression
2026-Apr, MedComm IF:10.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,揭示巨噬细胞亚型代谢变化驱动神经纤维瘤恶变过程中的免疫和基质重塑 首次鉴定出SPP1KYNU巨噬细胞亚群在MPNST恶变中协调基质重塑和免疫抑制的核心作用,并发现色氨酸代谢作为潜在治疗靶点 未提及样本量较小等具体局限性 阐明神经纤维瘤恶性转化为MPNST的潜在机制,寻找新的治疗靶点和诊断标志物 人类良性丛状神经纤维瘤和恶性外周神经鞘瘤样本中的肿瘤微环境细胞 数字病理学 神经纤维瘤病1型、恶性外周神经鞘瘤 单细胞RNA测序 NA 文本(基因表达数据) 9个丛状神经纤维瘤和5个恶性外周神经鞘瘤样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
995 2026-05-21
High-Purity Functional Corneal Endothelial Cells From Human Induced Pluripotent Stem Cells via a Novel Wash-Out Method
2026-Apr, MedComm IF:10.7Q1
研究论文 通过新颖的冲洗方法从人诱导多能干细胞中生成高纯度功能性角膜内皮细胞 首次开发了一种高效、非细胞毒性的冲洗方法,用于去除未分化的诱导多能干细胞并获得高纯度的角膜内皮样细胞 内容未提及该方法在长期移植后的稳定性以及其他动物模型或临床试验的验证 建立从诱导多能干细胞高效生成高纯度功能性角膜内皮样细胞的稳健方法,以克服角膜内皮移植治疗中供体短缺的问题 角膜内皮细胞和诱导多能干细胞 机器学习 角膜内皮功能不全 诱导多能干细胞分化、冲洗方法、单细胞测序、体内移植 NA 单细胞测序数据 诱导多能干细胞衍生的角膜内皮样细胞和人类原代角膜内皮细胞,以及角膜内皮功能障碍家兔模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
996 2026-05-21
Infection of 5xFAD mice with a mouse-adapted SARS-CoV-2 does not alter Alzheimer's disease neuropathology yet induces widespread changes in gene expression across diverse cell types
2026-04, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 研究小鼠适应性SARS-CoV-2感染对5xFAD小鼠阿尔茨海默病神经病理学及基因表达的影响 首次使用小鼠适应性SARS-CoV-2感染老年5xFAD小鼠模型,结合空间转录组学分析未直接感染脑部病毒情况下对多种细胞类型基因表达的广泛影响 未在脑内检测到病毒RNA,感染可能未直接作用于中枢神经系统,且研究仅限于小鼠模型,可能无法完全反映人类SARS-CoV-2感染对阿尔茨海默病的影响 探究SARS-CoV-2感染是否加重阿尔茨海默病神经病理学及疾病进展 老年5xFAD和野生型小鼠 机器学习 阿尔茨海默病 空间转录组学 NA 基因表达数据 老年5xFAD和野生型小鼠 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台
997 2026-05-19
Dysregulated landscape of RNA-binding proteins in unexplained recurrent spontaneous abortion revealed by bulk and single-cell transcriptome
2026-Apr-01, Scientific reports IF:3.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
998 2026-05-21
Spike-in probe-enhanced single-cell RNA-seq reveals post-infusion transcriptomic remodeling of "prime-and-kill" synNotch-CAR-T cells
2026-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种带有外源探针的增强型单细胞RNA测序工作流程,用于追踪和分析“prime-and-kill” synNotch-CAR-T细胞输注后的转录组重塑 首次采用定制外源探针增强单细胞RNA测序技术检测synNotch-CAR转录本,结合机器学习辅助分类器实现工程化细胞的高特异性和高灵敏度检测 外源探针检测敏感性在不同细胞类型间存在差异(E-SYNC细胞78.2% vs B-SYNC细胞60.0%),可能影响低丰度细胞的全面捕获 开发能够同时检测工程化细胞并进行转录组分析的单细胞RNA测序工作流程,以解析synNotch-CAR-T细胞输注后的动态行为 针对胶质母细胞瘤的synNotch-CAR-T细胞(E-SYNC和B-SYNC系统) 机器学习、数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、外源探针设计、机器学习辅助分类器 NA 单细胞转录组数据 胶质母细胞瘤异种移植模型中的脾脏、肺和脑组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
999 2026-05-21
NetTracer3D Enables User-Friendly Analysis of Diverse Microscopic and Medical 3D Datasets
2026-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 NetTracer3D 是一个用于分析多样化显微与医学3D数据集的用户友好型工具 NetTracer3D 提供了三种广泛适用的网络分析模式(连接网络、分支邻接与分支点网络、邻近网络),并支持标准化数据格式和交互式探索,简化了3D图像分析流程 文章未明确提及局限性 开发一个集成工具,简化三维图像分析,促进不同数据集之间的整合、共享和分析 人类和小鼠肾脏、小鼠支气管、人类脑血管造影、淋巴结以及3D光片癌症图像 计算机视觉 癌症 CODEX, 无标记拉曼光谱, 光片显微镜 网络分析模型(连接网络、分支邻接与分支点网络、邻近网络) 图像 多种样本,包括人类和小鼠肾脏、小鼠支气管、人类脑血管造影、淋巴结及3D光片癌症图像 NA 空间转录组学, CODEX NA NA
1000 2026-05-21
Cross-Species Multi-Omics Profiling Identifies Conserved Activated Valvular Interstitial Cell Population Driving Myxomatous Mitral Valve Degeneration
2026-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 跨物种多组学分析揭示了在粘液样二尖瓣退行性变中保守的活化瓣膜间质细胞群 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,跨物种(小鼠和人类)鉴定出一个保守的活化瓣膜间质细胞群,该细胞群富集促纤维化细胞外基质重塑程序,并优先定位于机械脆弱区域 研究生效细胞群的因果关系验证尚不充分,且人类样本数量有限 解析粘液样二尖瓣退行性变中瓣膜间质细胞的分子异质性及其在疾病发病机制中的状态特异性贡献 纤维蛋白-1缺陷小鼠模型和人类二尖瓣组织标本(包括正常、散发性二尖瓣脱垂和马凡综合征相关二尖瓣脱垂) 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间表达数据 包含小鼠和人类样本,具体样本数未在摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
回到顶部