单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 40345 篇文献,本页显示第 981 - 1000 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
981 2026-06-05
Single-cell profiling identifies an AIM2-dependent macrophage program amplifying T cell-mediated acute cardiac allograft rejection
2026-Jun-03, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 通过单细胞测序分析心脏移植物中的巨噬细胞亚群,发现依赖AIM2的巨噬细胞程序可增强T细胞介导的急性心脏同种异体移植排斥反应 首次在单细胞分辨率下揭示AIM2炎症小体通路在M1样巨噬细胞中驱动T细胞介导的急性心脏排斥反应的中心作用,并验证AIM2抑制可延长移植物存活 主要基于小鼠模型和有限的人类活检样本,需进一步在更大队列和临床中验证 阐明心脏同种异体移植排斥中巨噬细胞亚群的功能异质性及AIM2炎症小体的机制作用 小鼠心脏移植模型及人类心内膜心肌活检样本中的巨噬细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、微阵列转录组分析、RNA-seq NA 单细胞转录组数据、微阵列数据、RNA-seq数据 小鼠心脏移植模型及人类心内膜心肌活检样本(具体数量未提及) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium用于单细胞RNA-seq, Illumina用于微阵列和RNA-seq
982 2026-06-05
Kirenol, a diterpene active component from Siegesbeckia orientalis, alleviates atopic dermatitis by suppressing TYK2
2026-Jun-03, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 研究发现来自豨莶草的二萜活性成分奇壬醇通过抑制TYK2减轻特应性皮炎症状 首次报道奇壬醇对特应性皮炎的治疗作用,并揭示其通过直接结合TYK2蛋白、抑制STAT3磷酸化及下调IL-12/IL-23表达的分子机制 未明确说明研究局限性 探究奇壬醇治疗特应性皮炎的治疗效果及潜在分子机制 特应性皮炎患者皮肤组织样本及小鼠模型 计算生物学 特应性皮炎 单细胞RNA测序、分子对接、细胞热转变分析 NA 单细胞转录组数据 5例特应性皮炎患者和4例健康供体的皮肤组织 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
983 2026-06-05
Cross-species integration of single-cell data reveals conserved pathology-associated cell populations across animal models and human samples
2026-Jun-03, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 提出TACMAN框架,利用元路径异构图神经网络和编码器Transformer跨物种整合单细胞数据,揭示动物模型与人类样本中保守的病理相关细胞群 首次结合元路径异构图神经网络与仅编码器Transformer实现跨物种单细胞数据整合,能够在保留生物学信号的同时对齐保守细胞类型,并应用于远缘物种(线虫)与人类的病理比较 未明确说明局限性内容 开发跨物种单细胞RNA测序数据整合的计算方法,以在病理条件下比较保守细胞群 人类与哺乳动物模型(包括线虫生殖系肿瘤模型)的单细胞转录组数据 机器学习 肿瘤 单细胞RNA测序 图神经网络、Transformer 单细胞基因表达数据 涉及人类临床样本、哺乳动物模型和线虫生殖系肿瘤模型(具体数量文中未详述) NA 单细胞RNA测序 NA NA
984 2026-06-05
IRG1/itaconate rewires macrophage and lung tumor metabolism through G6PD inhibition
2026-Jun-03, Cell metabolism IF:27.7Q1
研究论文 探索IRG1/衣康酸通过抑制G6PD活性重编程巨噬细胞和肺癌肿瘤代谢的机制 首次揭示IRG1/衣康酸在肺癌微环境中通过靶向G6PD抑制磷酸戊糖途径,从而发挥抗肿瘤作用,并鉴定出4-辛基衣康酸作为一种潜在的治疗手段 该研究主要基于小鼠模型和体外实验,缺乏大规模人体临床试验验证 研究IRG1/衣康酸在肺癌发展中的抗肿瘤作用及其分子机制 肿瘤相关巨噬细胞和肺癌细胞 机器学习 肺癌 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, 多组学分析 NA 基因表达数据, 代谢组数据 人类和小鼠肺癌样本 10x Genomics 空间代谢组学, 单细胞RNA-seq, 多组学 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于分析免疫细胞表达谱
985 2026-06-05
Glucose restriction reprograms lipid metabolism and enhances immunotherapy through ZNRF3-Wnt-SCD signaling axis
2026-Jun-03, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过CRISPR筛选发现ZNRF3是葡萄糖限制下肿瘤细胞适应的关键调节因子,其通过Wnt-SCD信号轴重编程脂质代谢,增强抗肿瘤免疫并与免疫治疗协同 首次揭示ZNRF3-Wnt-SCD轴作为葡萄糖限制条件下的代谢检查点,阐明饮食干预与免疫治疗协同作用的分子机制 未说明研究的具体局限性 阐明肿瘤细胞在葡萄糖限制条件下的代谢适应机制及其对肿瘤微环境的影响 肿瘤细胞、T细胞 机器学习 癌症 CRISPR/Cas9筛选 NA 单细胞RNA测序数据 多个临床前模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
986 2026-06-05
Spatially resolved single-cell landscape of tumor immunotypes reveals the central role of interferon signaling and plasmacytoid dendritic cells in triple-negative breast cancer
2026-Jun-03, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过空间分辨单细胞转录组学分析三阴性乳腺癌的免疫类型,揭示干扰素信号和浆细胞样树突状细胞在抗肿瘤免疫中的核心作用 首次对三阴性乳腺癌的三种免疫类型(免疫沙漠、免疫排斥、免疫炎症)进行单细胞空间转录组分析,发现免疫排斥肿瘤中基质TILs高但预后差,并揭示了浆细胞样树突状细胞和干扰素信号作为有效抗肿瘤免疫标志物的新机制 样本为回顾性研究,空间转录组分析仅覆盖75个肿瘤,免疫分型依赖HE染色而非全面分子特征,pDC和IFN信号的因果作用需进一步验证 探究三阴性乳腺癌中不同免疫类型相关的细胞景观及其与临床结局的关联 212个三阴性乳腺癌肿瘤样本以及FinXX、CALGB-40603、I-SPY 2和真实世界临床基因组数据队列 数字病理学 三阴性乳腺癌 空间转录组学, 批量RNA测序 NA 图像, 转录组数据 212个三阴性乳腺癌肿瘤,其中75个进行空间转录组分析 NA 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
987 2026-06-05
Spatial transcriptomics reveals clonal relationships between intraductal carcinoma and adjacent invasive prostate cancer
2026-Jun-03, Histopathology IF:3.9Q1
研究论文 利用空间转录组学揭示导管内癌与邻近侵袭性前列腺癌之间的克隆关系 提出了“重复侵袭、前体进展”(RIPP)的替代假说,并通过空间转录组学分析首次揭示了高级别前列腺上皮内瘤变、导管内癌和邻近侵袭性前列腺癌之间的克隆关系 样本数量有限,仅分析了六例标本,结论需要更大规模研究验证 阐明高级别前列腺上皮内瘤变、导管内癌和邻近侵袭性前列腺癌之间的相互克隆关系 六例Gleason评分3+4=7的根治性前列腺切除术标本中的高级别前列腺上皮内瘤变、导管内癌和邻近侵袭性前列腺癌区域 数字病理学 前列腺癌 空间转录组学 NA 基因表达数据 6例根治性前列腺切除术标本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium Visium工作流程
988 2026-06-05
An integrated machine learning and mendelian randomization approach identifies SERPING1 as a prognostic biomarker associated with CD8 + T-cell infiltration in DLBCL
2026-Jun-03, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过整合机器学习和孟德尔随机化方法,鉴定SERPING1为与CD8+T细胞浸润相关的DLBCL预后生物标志物 首次利用多组学整合与机器学习算法,结合孟德尔随机化分析,从多角度确认SERPING1在DLBCL中的核心作用及其与CD8+T细胞浸润的关系 研究依赖于公共数据库,样本量有限,且SERPING1作为风险因子的机制尚未完全阐明 鉴定DLBCL中与CD8+T细胞相关的新预后标志物和治疗靶点 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者的肿瘤组织和基因表达数据 机器学习 弥漫性大B细胞淋巴瘤 RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA, 分子对接, 孟德尔随机化 LASSO, LDA, 随机森林, XGBoost, SHAP 基因表达数据, 单细胞转录组数据 来自GEO的6个数据集(GSE56315, GSE25638, GSE12453, GSE12195, GSE32018, GSE83632)以及TCGA-DLBC RNA测序数据 NA NA NA NA
989 2026-06-05
Vascular SMC-like CAF-derived THBS1 drives tumor-associated neutrophil recruitment to orchestrate an immunosuppressive microenvironment in gastric cancer
2026-Jun-03, Cell death & disease IF:8.1Q1
research paper 本研究揭示血管平滑肌样CAF来源的THBS1通过招募肿瘤相关中性粒细胞,在胃癌中形成免疫抑制微环境并促进肿瘤进展 首次阐明血管平滑肌样CAF通过分泌THBS1驱动中性粒细胞趋化因子(CXCL1/5/6)产生,从而招募肿瘤相关中性粒细胞的机制,并证实THBS1可作为胃癌免疫治疗新靶点 研究主要基于细胞系和异种移植模型,临床样本验证规模有限;THBS1下游信号通路及与其他免疫细胞亚群的交互作用未深入探讨 探究胃癌中肿瘤相关中性粒细胞(TANs)招募及免疫抑制微环境形成的分子机制 血管平滑肌样成纤维细胞(VSMC-like CAF)、肿瘤相关中性粒细胞(TANs)、胃癌组织样本 machine learning 胃癌 单细胞RNA测序、多重免疫荧光、患者来源异种移植模型 NA 单细胞转录组数据、组织切片图像 胃癌组织样本(具体数量未明确) NA single-cell RNA-seq NA NA
990 2026-06-05
Heterogeneity and dynamics of DENV-specific CD8 + T cells in dengue infection
2026-Jun-03, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析DENV特异性CD8+ T细胞在登革感染中的异质性和动态变化,揭示不同疾病严重程度相关的细胞亚群 首次利用HLA四聚体结合单细胞RNA测序,系统描绘了DENV特异性CD8+ T细胞在登革感染中的表型异质性,并发现与疾病严重程度相关的特定细胞亚群和转录组特征 NA 探究DENV特异性CD8+ T细胞的表型异质性如何与登革疾病严重程度相关 DENV特异性CD8+ T细胞,通过HLA四聚体从登革患者外周血中识别 单细胞组学 登革热 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 基于板的单细胞RNA测序(plate-based single-cell RNA sequencing)
991 2026-06-05
privateST: a feasible framework for privacy-preserving spatial transcriptomics prediction from histopathology images
2026-Jun-03, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 提出一种基于同态加密的隐私保护框架,用于从组织病理学图像预测空间转录组学 首次将同态加密应用于空间转录组学预测,通过下采样、辅助基因集预测和架构调整实现隐私保护下的高精度预测任务 输入图像经下采样后分辨率降低,可能影响空间信息的精细捕捉;仅验证100个目标基因的场景 实现跨机构数据共享时保护隐私的空间转录组学预测 空间转录组学预测模型及组织病理学图像 数字病理学、隐私保护机器学习 一般性肿瘤研究(未指定具体疾病) 空间转录组学预测 改进的ResNet-18架构 组织病理学图像 未明确说明样本数量(间接涉及100个目标基因和150个辅助基因) NA 空间转录组学 NA NA
992 2026-06-05
Single-cell multi-omic atlas and morphogen screening informs midbrain and hindbrain organoid engineering
2026-Jun-03, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 该研究通过单细胞多组学图谱和形态发生素筛选,为中脑和后脑类器官工程提供指导 结合单细胞转录组和可及染色质测序,构建多组学图谱,并通过多重筛选揭示形态发生素对类器官模型的扩展作用 未明确提及其局限性 绘制中脑和后脑类器官的细胞组成和调控机制,并筛选形态发生素以改进模型 中脑和后脑类器官模型中的细胞类型及调节机制 数字病理学 神经发育障碍 单细胞RNA测序和可及染色质测序 NA 转录组和染色质数据 涉及中脑和后脑类器官模型中的细胞样本 NA 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 NA NA
993 2026-06-05
Dopamine inhibits retinal pathological neovascularization in the oxygen-induced retinopathy mouse model
2026-Jun-03, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 通过氧气诱导视网膜病变小鼠模型,研究多巴胺抑制视网膜病理性新生血管的机制 首次整合单细胞RNA测序与Müller细胞特异性Drd2基因敲除小鼠模型,揭示多巴胺通过Müller细胞中Drd2信号调控HIF-α和VEGF-A合成,从而抑制病理性血管生成的机制 NA 探究多巴胺及其受体在视网膜病理性新生血管中的作用机制 氧气诱导视网膜病变小鼠模型及Müller细胞特异性Drd2基因敲除小鼠 数字病理学 早产儿视网膜病变 单细胞RNA测序 NA 测序数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序平台
994 2026-06-05
CIITA/PRMT5 promote CD4+Gzma+ T cell activation via H3R2me2-mediated endothelial expression of MHC class II in smoking-induced atherosclerosis
2026-Jun-03, BMC medicine IF:7.0Q1
研究论文 该研究揭示了吸烟通过CIITA/PRMT5介导的H3R2me2修饰促进内皮细胞MHC II表达,进而激活CD4+Gzma+ T细胞从而加剧动脉粥样硬化进展的免疫机制 首次发现CIITA与PRMT5相互作用通过H3R2对称二甲基化修饰调控MHC II表达,并阐明CD4+Gzma+ T细胞亚群在吸烟相关动脉粥样硬化中的关键致病作用 研究主要在ApoEKO小鼠模型和体外细胞实验中验证,缺乏临床样本的进一步验证 探究吸烟促进动脉粥样硬化进展中CD4+Gzma+ T细胞活化的免疫分子机制 ApoEKO小鼠、小鼠动脉内皮细胞、人冠状动脉内皮细胞 免疫学与心血管疾病 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序、质谱分析 NA 单细胞转录组数据 未明确说明样本量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
995 2026-06-05
Linking childhood interstitial lung disease to IARS-related disorder: clinical and preliminary functional studies in four new cases
2026-Jun-03, Human genomics IF:3.8Q2
研究论文 通过四例新病例的临床和初步功能研究,将儿童间质性肺病与IARS相关疾病联系起来 首次将IARS基因双等位突变确立为儿童间质性肺病/肺泡蛋白沉积症的新致病基因,并揭示了单核细胞/巨噬细胞谱系的内在缺陷可能参与表面活性物质清除障碍的免疫相关致病机制 病例数量有限,仅四例;功能研究尚属初步阶段,未深入验证具体分子机制 探究IARS基因双等位突变与儿童间质性肺病及肺泡蛋白沉积症的关联及其潜在致病机制 四名表现为进行性儿童间质性肺病/肺泡蛋白沉积症并伴肺外表现(生长迟缓、智力障碍、肌张力低下和肝病)的儿科患者 数字病理学 儿童间质性肺病,肺泡蛋白沉积症 全外显子测序,AlphaFold蛋白结构预测,PAS和ORO染色,Western blot,透射电镜,单细胞RNA测序 AlphaFold 基因组数据,蛋白质结构数据,染色图像,电镜图像,单细胞转录组数据 四名儿科患者 Illumina 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq NA
996 2026-06-05
Loss of miR-29a/b1 Cluster Reprograms the Tumor Microenvironment and Contributes to Immunosuppression in Lung Cancer
2026-Jun-02, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 该研究探讨了miR-29a/b1簇缺失如何重编程肿瘤微环境并促进肺癌免疫抑制 首次揭示miR-29家族通过调控ATX及其他靶基因影响肿瘤微环境和抗肿瘤免疫通路,与免疫检查点抑制剂反应相关 NA 探究miR-29在肺癌免疫检查点抑制剂耐药中的作用机制 Kras/p53驱动的肺癌小鼠模型及肺腺癌患者肿瘤样本 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序, RNA-seq NA 基因表达数据 小鼠模型及公共数据库中的肺腺癌患者样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
997 2026-06-05
Activated PIK3CD drives marginal zone B cell development from early transitional progenitors by enhancing ADAM10 expression
2026-Jun-02, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.] IF:4.8Q2
研究论文 通过小鼠模型和单细胞测序技术,揭示激活的PI3Kδ通过增强ADAM10表达促进边缘区B细胞从早期过渡前体细胞发育的机制 首次发现过度活跃的P110δ在B细胞发育的T1阶段即通过上调表面ADAM10水平促进脾脏边缘区B细胞前体扩增,并利用单细胞RNA测序揭示T1阶段的差异性细胞分化 从较浅的视角揭示了APDS中边缘区B细胞发育失衡的机制,仅为未来靶向自身免疫性B细胞策略的初步研究平台 探究激活的PI3Kδ信号在脾脏边缘区B细胞发育中的具体作用机制 激活的PI3Kδ综合征小鼠模型中的脾脏边缘区B细胞及其前体 机器学习 原发性免疫缺陷病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
998 2026-06-05
Network Methods for Diagonal Integration of Unpaired Single-Cell Multi-Omics Data: A Review
2026-Jun-02, Bioinformatics (Oxford, England)
综述 综述了用于非配对单细胞多组学数据对角集成的网络方法,涵盖从转录组学骨架构建到跨模态整合的完整计算流程 首次聚焦于非配对单细胞蛋白质组学数据的对角集成挑战,系统总结了生成式蛋白质组翻译、归纳先验嵌入和基于扰动的因果基准测试三大未来发展方向 未提供新的软件或算法实现,基准资源表仅作为补充材料提供 综述用于非配对单细胞多组学数据(特别是scMS与单细胞转录组)对角集成的网络方法 非配对的单细胞转录组与蛋白质组数据 机器学习 NA 单细胞质谱法 图神经网络, 生成模型, 概率图模型 基因表达数据, 蛋白质表达数据 NA NA 单细胞多组学 NA NA
999 2026-06-05
ADAM12-programmed ECM-CAF remodeling activates PI3K-AKT and enforces an immune-excluded microenvironment to drive bladder cancer progression and therapy resistance
2026-Jun, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 通过多组学分析探究ADAM12介导的ECM-CAF重塑在膀胱癌进展和治疗抵抗中的作用机制 首次整合单细胞转录组、成纤维细胞GWAS数据及多平台数据,系统揭示ADAM12作为基质驱动因子连接基质重塑、PI3K-AKT信号通路与膀胱癌免疫抑制的分子机制 未提及具体局限性 阐明膀胱癌中肿瘤相关成纤维细胞介导的基质重塑的致病机制及潜在治疗靶点 膀胱癌组织、细胞系和小鼠模型 计算机视觉 膀胱癌 单细胞转录组测序、多重免疫荧光、RNA-seq NA 单细胞转录组数据、GWAS数据、TCGA和GEO数据集 未提及具体样本量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1000 2026-06-05
Serum procalcitonin: A novel tumor biomarker for diagnosis and disease monitoring in fibrolamellar hepatocellular carcinoma
2026-Jun, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究探讨血清降钙素原作为纤维板层肝细胞癌的一种新型肿瘤生物标志物,用于诊断和疾病监测 首次证实降钙素原在纤维板层癌患者血清中显著升高,且具有高度敏感性和特异性,可作为该罕见肝癌的诊断和治疗监测生物标志物 样本量较小,需在更大规模和更多样化的队列中进行前瞻性研究以完善诊断阈值并确认特异性 评估血清降钙素原作为纤维板层癌诊断和监测生物标志物的潜力 纤维板层癌患者、肝细胞癌患者、胆管癌患者、肝硬化患者 机器学习 肝癌 RNA测序、空间转录组学、免疫组织化学 NA 图像 18例纤维板层癌患者34份样本,64例肝细胞癌患者,24例胆管癌患者,20例肝硬化患者;27例纤维板层癌肿瘤、331例肝细胞癌肿瘤、39例胆管癌肿瘤、71例肝母细胞瘤、34例肝细胞腺瘤、55例非肿瘤肝脏样本用于RNA测序;3例纤维板层癌肿瘤用于空间转录组学;13例纤维板层癌肿瘤和34例其他原发或继发性肝癌用于免疫组织化学 NA 空间转录组学 NA NA
回到顶部