单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 40356 篇文献,本页显示第 981 - 1000 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
981 2026-06-05
ETS1 activates heparanase transcription to drive intra-islet heparan sulfate degradation and macrophage-induced insulitis in type 1 diabetes
2026-Jun-25, Journal of biomedical research IF:2.2Q3
研究论文 该研究揭示了ETS1转录因子激活乙酰肝素酶表达,驱动胰岛内硫酸乙酰肝素降解和巨噬细胞诱导的胰岛炎,从而促进1型糖尿病进展 首次发现ETS1-HPSE-HS信号轴在1型糖尿病巨噬细胞介导的胰岛损伤中的关键作用,为靶向ETS1治疗1型糖尿病提供新策略 未提及具体局限性,但研究主要基于小鼠模型,需进一步验证在人类T1D中的适用性 阐明T1D中巨噬细胞HPSE异常上调的转录机制及其在胰岛炎中的作用 T1D免疫细胞(巨噬细胞)及小鼠模型 分子生物学 1型糖尿病 单细胞RNA测序,CUT&Tag,荧光素酶报告基因检测 NA 基因表达数据,DNA结合数据 T1D免疫细胞样本和小鼠模型(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
982 2026-06-05
Antibiotic-Loaded Polymethyl Methacrylate Cement Drives Fibroblast-Mediated Angiogenesis via LOXL2 to Accelerate Diabetic Foot Ulcer Healing
2026-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 整合单细胞RNA测序与蛋白质组学分析,揭示载抗生素聚甲基丙烯酸甲酯骨水泥通过LOXL2驱动成纤维细胞介导的血管生成以加速糖尿病足溃疡愈合的机制 首次通过单细胞测序与蛋白质组学联合分析,鉴定LOXL2为载抗生素PMMA骨水泥促进糖尿病足溃疡血管生成的核心调控因子,阐明了成纤维细胞重塑及成纤维细胞-内皮细胞互作的新机制 未明确说明,需进一步验证LOXL2在临床样本中的广泛适用性及潜在副作用 阐明载抗生素PMMA骨水泥促进糖尿病足溃疡血管生成的细胞与分子机制 糖尿病足溃疡伤口组织 数字病理学 糖尿病足溃疡 单细胞RNA测序,无标记定量蛋白质组学 NA 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 20,245个单细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
983 2026-06-05
COX-2-Derived PGE2 Modulates IL-17 Production by γδ T Cells During Allergic Lung Inflammation
2026-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 探究COX-2衍生的PGE2在过敏性肺部炎症中通过EP2/EP4受体调节γδ T细胞产生IL-17的机制 首次揭示COX-2衍生的PGE2通过EP2/EP4受体增强γδ T细胞产生IL-17A,而非通过改变细胞数量,区别于传统对Th17细胞的研究 未明确EP2和EP4受体在体内炎症模型中的相对贡献,且研究主要基于小鼠模型,需进一步验证在人中的相关性 探究COX-2衍生的前列腺素在过敏性肺部炎症中对γδ T细胞的调节作用 COX-2基因敲除小鼠和野生型小鼠中的γδ T细胞 免疫学 过敏性肺部炎症 单细胞RNA测序、qPCR、体内外细胞实验 NA 基因表达数据 使用COX-2+/+和COX-2-/-小鼠,具体数量未说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
984 2026-06-05
CSF-1R inhibition and lenalidomide synergize to promote myeloma control after autologous stem cell transplantation
2026-Jun-04, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究发现CSF-1R抑制与来那度胺联用可协同控制自体干细胞移植后的骨髓瘤进展 首次揭示CSF-1R+巨噬细胞与ASCT后复发相关,并发现CSF-1R阻断与来那度胺的协同抗骨髓瘤作用 研究基于临床前模型,可能无法完全模拟人类ASCT后的免疫微环境 探究骨髓中免疫抑制性髓系细胞是否与ASCT预后相关,并开发新的联合治疗策略 多发性骨髓瘤患者骨髓样本及小鼠ASCT模型 机器学习 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 复发性多发性骨髓瘤患者及临床前小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
985 2026-06-05
ACY-1215 ameliorates experimental colitis by inhibiting dendritic cell maturation and Th1/Th17 responses
2026-Jun-04, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.] IF:4.8Q2
研究论文 ACY-1215通过抑制树突状细胞成熟和Th1/Th17反应改善实验性结肠炎 首次评估选择性HDAC6抑制剂ACY-1215在炎症性肠病中的治疗潜力,并通过单细胞RNA测序揭示其通过抑制树突细胞驱动的T细胞反应的免疫表观遗传机制 仅涉及小鼠模型和公共单细胞数据集,缺乏人体样本验证和长期疗效评估 评估ACY-1215在炎症性肠病中的治疗潜力并阐明其对树突状细胞介导T细胞反应的机制 DSS诱导的小鼠结肠炎模型,树突状细胞,Th1/Th17细胞 机器学习 炎症性肠病 RNA-seq,单细胞RNA-seq NA 转录组数据 小鼠结肠组织样本(数量未明确),公共单细胞RNA-seq数据集GSE134809 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA 公共单细胞RNA-seq数据集GSE134809
986 2026-06-05
MGCL-ST: multi-view graph contrastive learning for spatial transcriptomics imputation
2026-Jun-04, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 提出一种名为MGCL-ST的多视图图对比学习方法,用于空间转录组学数据的超分辨率插补 首次联合建模局部和全局空间图,并整合来自病理基础模型的组织学特征,实现高精度空间基因表达推断 未提及具体限制 开发高分辨率、连续的空间基因表达谱分析方法 空间转录组学数据与组织病理图像 机器学习 肿瘤 空间转录组学 图对比学习 空间基因表达数据与组织学图像 涉及三种不同平台的数据集 NA 空间转录组学 NA NA
987 2026-06-05
Unraveling the regulatory role of intercellular communication in intestinal immune cells mediated by H₂ in sepsis recovery through single-cell RNA sequencing
2026-Jun-04, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示氢气(H₂)在脓毒症恢复中调节肠道免疫细胞间通讯的调控作用 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了氢气在脓毒症恢复中系统性重编程肠道免疫微环境、恢复正常免疫细胞亚群和增强细胞间通讯的分子机制 NA 阐明氢气在脓毒症恢复中对肠道免疫细胞间通讯的调控作用 小鼠脓毒症模型中的肠道免疫细胞(B细胞、T细胞及上皮细胞) 机器学习 脓毒症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠样本,分为对照组、脓毒症组和氢气治疗脓毒症组 NA 单细胞RNA测序 NA NA
988 2026-06-05
A dorsal hippocampus-prodynorphinergic dorsolateral septum-to-lateral hypothalamus circuit mediates contextual gating of feeding
2026-Jun-03, Neuron IF:14.7Q1
research paper 研究揭示了背侧海马-背外侧隔核前强啡肽阳性神经元-下丘脑外侧区回路如何介导情境对进食的调控 首次鉴定出背外侧隔核中表达前强啡肽的生长抑素抑制性神经元亚群,并阐明了其接受背侧海马输入并通过抑制下丘脑外侧区GABA能神经元来调控情境依赖的进食行为 研究未提及具体局限性 探索背侧海马如何通过招募下丘脑进食模块来调节不同环境下的进食行为 小鼠的背侧海马、背外侧隔核和外侧下丘脑区域 machine learning NA 单细胞转录组学、跨突触追踪、光遗传学、电生理学、体内钙成像、病毒基因删除 NA NA NA NA 单细胞转录组学 NA NA
989 2026-06-05
High-resolution spatial multi-omics enables prognostic scoring in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Jun-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1
研究论文 通过空间多组学整合分析,开发用于肝内胆管癌预后评估的新型评分系统 首次将图像质谱流式、膨胀凝胶空间蛋白质组学、单细胞RNA测序等多种前沿技术整合,构建了高分辨率空间多模态评分系统,并通过跨尺度验证确保临床可转化性 训练队列样本量较小(155例),且跨尺度验证仅在两个独立队列中进行,未来需更大规模多中心验证 开发用于肝内胆管癌风险分层和治疗优化的空间多模态预后评分系统 肝内胆管癌患者的肿瘤组织样本 数字化病理学 肝内胆管癌 单细胞RNA测序、质谱流式、空间蛋白质组学、多重免疫荧光、批量蛋白质组学 NA 图像、文本、蛋白质组数据 155例训练队列和214例独立验证队列的肝内胆管癌患者样本 NA 空间多组学 NA NA
990 2026-06-05
CD163⁺ monocytes and soluble CD163 as prognostic indicators in severe fever with thrombocytopenia syndrome: An integrative analysis
2026-Jun-03, PLoS neglected tropical diseases IF:3.4Q1
研究论文 通过整合分析单细胞RNA测序和临床队列数据,发现CD163⁺单核细胞和可溶性CD163可作为发热伴血小板减少综合征预后指标 首次通过单细胞转录组学揭示CD163⁺单核细胞在SFTS中的扩增及其与预后的关联,并建立基于sCD163和血尿素氮的两标志物入院风险分层模型 三层次风险评分中的亚组分析因样本量小而受限,结果仅具探索性 探究发热伴血小板减少综合征的免疫病理机制并建立入院风险分层工具 发热伴血小板减少综合征患者和健康对照者 机器学习 传染病 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 流式细胞术, 酶联免疫吸附试验 Cox回归模型 基因表达数据, 临床数据 15例SFTS患者(4例死亡,11例存活)和4例健康对照用于scRNA-seq;150例SFTS患者(132例存活,18例死亡)用于临床验证 Illumina 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 流式细胞术 Illumina NovaSeq GSE175499数据集的单细胞RNA测序使用10x Genomics平台,批量RNA测序使用Illumina NovaSeq
991 2026-06-05
Claudin-1 targeting suppresses tumor growth, invasion, and metastasis in patient-derived cholangiocarcinoma models
2026-Jun-03, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 该文章通过患者来源的胆管癌模型,揭示了Claudin-1作为致癌驱动因子的功能,并通过靶向CLDN1的单克隆抗体抑制肿瘤生长、侵袭和转移 首次发现CLDN1是胆管癌的致癌驱动因子和治疗靶点,并开发了靶向非连接部CLDN1的单克隆抗体 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化效果需进一步验证,且中低CLDN1表达肿瘤的疗效仍有待优化 探索CLDN1在胆管癌中的功能及靶向治疗潜力 胆管癌患者的肿瘤组织、细胞系、类器官及小鼠模型 机器学习 胆管癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、CRISPR-Cas9、RNA干扰、共聚焦成像 NA RNA测序数据、图像数据 患者胆管癌组织样本(数量未具体说明)、多种小鼠模型(CDX和PDX)及患者来源类器官 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
992 2026-06-05
Single-cell profiling identifies an AIM2-dependent macrophage program amplifying T cell-mediated acute cardiac allograft rejection
2026-Jun-03, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 通过单细胞测序分析心脏移植物中的巨噬细胞亚群,发现依赖AIM2的巨噬细胞程序可增强T细胞介导的急性心脏同种异体移植排斥反应 首次在单细胞分辨率下揭示AIM2炎症小体通路在M1样巨噬细胞中驱动T细胞介导的急性心脏排斥反应的中心作用,并验证AIM2抑制可延长移植物存活 主要基于小鼠模型和有限的人类活检样本,需进一步在更大队列和临床中验证 阐明心脏同种异体移植排斥中巨噬细胞亚群的功能异质性及AIM2炎症小体的机制作用 小鼠心脏移植模型及人类心内膜心肌活检样本中的巨噬细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、微阵列转录组分析、RNA-seq NA 单细胞转录组数据、微阵列数据、RNA-seq数据 小鼠心脏移植模型及人类心内膜心肌活检样本(具体数量未提及) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium用于单细胞RNA-seq, Illumina用于微阵列和RNA-seq
993 2026-06-05
Kirenol, a diterpene active component from Siegesbeckia orientalis, alleviates atopic dermatitis by suppressing TYK2
2026-Jun-03, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 研究发现来自豨莶草的二萜活性成分奇壬醇通过抑制TYK2减轻特应性皮炎症状 首次报道奇壬醇对特应性皮炎的治疗作用,并揭示其通过直接结合TYK2蛋白、抑制STAT3磷酸化及下调IL-12/IL-23表达的分子机制 未明确说明研究局限性 探究奇壬醇治疗特应性皮炎的治疗效果及潜在分子机制 特应性皮炎患者皮肤组织样本及小鼠模型 计算生物学 特应性皮炎 单细胞RNA测序、分子对接、细胞热转变分析 NA 单细胞转录组数据 5例特应性皮炎患者和4例健康供体的皮肤组织 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
994 2026-06-05
Cross-species integration of single-cell data reveals conserved pathology-associated cell populations across animal models and human samples
2026-Jun-03, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 提出TACMAN框架,利用元路径异构图神经网络和编码器Transformer跨物种整合单细胞数据,揭示动物模型与人类样本中保守的病理相关细胞群 首次结合元路径异构图神经网络与仅编码器Transformer实现跨物种单细胞数据整合,能够在保留生物学信号的同时对齐保守细胞类型,并应用于远缘物种(线虫)与人类的病理比较 未明确说明局限性内容 开发跨物种单细胞RNA测序数据整合的计算方法,以在病理条件下比较保守细胞群 人类与哺乳动物模型(包括线虫生殖系肿瘤模型)的单细胞转录组数据 机器学习 肿瘤 单细胞RNA测序 图神经网络、Transformer 单细胞基因表达数据 涉及人类临床样本、哺乳动物模型和线虫生殖系肿瘤模型(具体数量文中未详述) NA 单细胞RNA测序 NA NA
995 2026-06-05
IRG1/itaconate rewires macrophage and lung tumor metabolism through G6PD inhibition
2026-Jun-03, Cell metabolism IF:27.7Q1
研究论文 探索IRG1/衣康酸通过抑制G6PD活性重编程巨噬细胞和肺癌肿瘤代谢的机制 首次揭示IRG1/衣康酸在肺癌微环境中通过靶向G6PD抑制磷酸戊糖途径,从而发挥抗肿瘤作用,并鉴定出4-辛基衣康酸作为一种潜在的治疗手段 该研究主要基于小鼠模型和体外实验,缺乏大规模人体临床试验验证 研究IRG1/衣康酸在肺癌发展中的抗肿瘤作用及其分子机制 肿瘤相关巨噬细胞和肺癌细胞 机器学习 肺癌 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, 多组学分析 NA 基因表达数据, 代谢组数据 人类和小鼠肺癌样本 10x Genomics 空间代谢组学, 单细胞RNA-seq, 多组学 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于分析免疫细胞表达谱
996 2026-06-05
Glucose restriction reprograms lipid metabolism and enhances immunotherapy through ZNRF3-Wnt-SCD signaling axis
2026-Jun-03, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过CRISPR筛选发现ZNRF3是葡萄糖限制下肿瘤细胞适应的关键调节因子,其通过Wnt-SCD信号轴重编程脂质代谢,增强抗肿瘤免疫并与免疫治疗协同 首次揭示ZNRF3-Wnt-SCD轴作为葡萄糖限制条件下的代谢检查点,阐明饮食干预与免疫治疗协同作用的分子机制 未说明研究的具体局限性 阐明肿瘤细胞在葡萄糖限制条件下的代谢适应机制及其对肿瘤微环境的影响 肿瘤细胞、T细胞 机器学习 癌症 CRISPR/Cas9筛选 NA 单细胞RNA测序数据 多个临床前模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
997 2026-06-05
Spatially resolved single-cell landscape of tumor immunotypes reveals the central role of interferon signaling and plasmacytoid dendritic cells in triple-negative breast cancer
2026-Jun-03, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过空间分辨单细胞转录组学分析三阴性乳腺癌的免疫类型,揭示干扰素信号和浆细胞样树突状细胞在抗肿瘤免疫中的核心作用 首次对三阴性乳腺癌的三种免疫类型(免疫沙漠、免疫排斥、免疫炎症)进行单细胞空间转录组分析,发现免疫排斥肿瘤中基质TILs高但预后差,并揭示了浆细胞样树突状细胞和干扰素信号作为有效抗肿瘤免疫标志物的新机制 样本为回顾性研究,空间转录组分析仅覆盖75个肿瘤,免疫分型依赖HE染色而非全面分子特征,pDC和IFN信号的因果作用需进一步验证 探究三阴性乳腺癌中不同免疫类型相关的细胞景观及其与临床结局的关联 212个三阴性乳腺癌肿瘤样本以及FinXX、CALGB-40603、I-SPY 2和真实世界临床基因组数据队列 数字病理学 三阴性乳腺癌 空间转录组学, 批量RNA测序 NA 图像, 转录组数据 212个三阴性乳腺癌肿瘤,其中75个进行空间转录组分析 NA 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
998 2026-06-05
Spatial transcriptomics reveals clonal relationships between intraductal carcinoma and adjacent invasive prostate cancer
2026-Jun-03, Histopathology IF:3.9Q1
研究论文 利用空间转录组学揭示导管内癌与邻近侵袭性前列腺癌之间的克隆关系 提出了“重复侵袭、前体进展”(RIPP)的替代假说,并通过空间转录组学分析首次揭示了高级别前列腺上皮内瘤变、导管内癌和邻近侵袭性前列腺癌之间的克隆关系 样本数量有限,仅分析了六例标本,结论需要更大规模研究验证 阐明高级别前列腺上皮内瘤变、导管内癌和邻近侵袭性前列腺癌之间的相互克隆关系 六例Gleason评分3+4=7的根治性前列腺切除术标本中的高级别前列腺上皮内瘤变、导管内癌和邻近侵袭性前列腺癌区域 数字病理学 前列腺癌 空间转录组学 NA 基因表达数据 6例根治性前列腺切除术标本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium Visium工作流程
999 2026-06-05
An integrated machine learning and mendelian randomization approach identifies SERPING1 as a prognostic biomarker associated with CD8 + T-cell infiltration in DLBCL
2026-Jun-03, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过整合机器学习和孟德尔随机化方法,鉴定SERPING1为与CD8+T细胞浸润相关的DLBCL预后生物标志物 首次利用多组学整合与机器学习算法,结合孟德尔随机化分析,从多角度确认SERPING1在DLBCL中的核心作用及其与CD8+T细胞浸润的关系 研究依赖于公共数据库,样本量有限,且SERPING1作为风险因子的机制尚未完全阐明 鉴定DLBCL中与CD8+T细胞相关的新预后标志物和治疗靶点 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者的肿瘤组织和基因表达数据 机器学习 弥漫性大B细胞淋巴瘤 RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA, 分子对接, 孟德尔随机化 LASSO, LDA, 随机森林, XGBoost, SHAP 基因表达数据, 单细胞转录组数据 来自GEO的6个数据集(GSE56315, GSE25638, GSE12453, GSE12195, GSE32018, GSE83632)以及TCGA-DLBC RNA测序数据 NA NA NA NA
1000 2026-06-05
Vascular SMC-like CAF-derived THBS1 drives tumor-associated neutrophil recruitment to orchestrate an immunosuppressive microenvironment in gastric cancer
2026-Jun-03, Cell death & disease IF:8.1Q1
research paper 本研究揭示血管平滑肌样CAF来源的THBS1通过招募肿瘤相关中性粒细胞,在胃癌中形成免疫抑制微环境并促进肿瘤进展 首次阐明血管平滑肌样CAF通过分泌THBS1驱动中性粒细胞趋化因子(CXCL1/5/6)产生,从而招募肿瘤相关中性粒细胞的机制,并证实THBS1可作为胃癌免疫治疗新靶点 研究主要基于细胞系和异种移植模型,临床样本验证规模有限;THBS1下游信号通路及与其他免疫细胞亚群的交互作用未深入探讨 探究胃癌中肿瘤相关中性粒细胞(TANs)招募及免疫抑制微环境形成的分子机制 血管平滑肌样成纤维细胞(VSMC-like CAF)、肿瘤相关中性粒细胞(TANs)、胃癌组织样本 machine learning 胃癌 单细胞RNA测序、多重免疫荧光、患者来源异种移植模型 NA 单细胞转录组数据、组织切片图像 胃癌组织样本(具体数量未明确) NA single-cell RNA-seq NA NA
回到顶部