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当前共找到 39637 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2026-05-12 |
Unsupervised multiscale clustering of single-cell transcriptomes to identify hierarchical structures of cell subtypes
2025-01-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf111
PMID:41066207
|
研究论文 | 开发一种无监督多尺度聚类方法MSC，用于从单细胞转录组数据中识别细胞亚型的层次结构 | 提出多尺度聚类方法MSC，通过构建稀疏细胞-细胞关联网络，能够在多个分辨率下无监督识别新的细胞类型和亚型，并揭示有生物学意义的细胞层次结构 | 未在摘要中明确提及局限性 | 开发一种能够更精细解析单细胞RNA测序数据中细胞层次结构的无监督聚类方法 | 模拟银标准、金标准数据以及真实疾病单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | MSC（多尺度聚类） | 单细胞转录组数据 | NA（未明确样本数量） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 982 | 2026-05-12 |
Microglia phagocytosis of PNNs mediates PV-positive interneuron dysfunction and associated gamma oscillations in neuroinflammation-induced cognitive impairment in mice
2025-01-01, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2024.110205
PMID:39489286
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研究论文 | 研究揭示小胶质细胞吞噬周神经网介导PV阳性中间神经元功能障碍及γ振荡在神经炎症诱导的小鼠认知损伤中的作用 | 首次发现小胶质细胞通过ApoE介导的周神经网吞噬作用导致PV阳性中间神经元功能障碍和γ振荡异常，从而引发认知损伤，并通过抑制ApoE或过表达Hapln1改善损伤 | 研究仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证；长期神经炎症的影响未评估 | 探讨神经炎症引起认知损伤中周神经网与ApoE的关联机制 | C57BL/6J小鼠和CX3CR1-CreERT2小鼠 | 数字病理学 | 认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 983 | 2026-05-12 |
Spatial transcriptomics reveals Inhba/Smad2/E2f4 axis in Lrp2high thecal cell proliferation in androgen-induced PCOS mice
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1633254
PMID:40831751
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research paper | 利用空间转录组学揭示雄激素诱导的PCOS小鼠模型中Lrp2高表达膜细胞增殖的Inhba/Smad2/E2f4轴 | 首次通过空间转录组学在细胞分辨率下揭示PCOS小鼠卵巢中Lrp2高表达膜细胞亚群及其Inhba/Smad2/E2f4信号轴对细胞增殖的调控作用 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类PCOS卵巢组织中进行验证；功能验证仅限于体外细胞实验，缺乏体内数据支持 | 阐明PCOS中膜细胞异常增殖的分子机制 | DHEA诱导的PCOS小鼠模型中的卵巢膜细胞 | spatial transcriptomics | 多囊卵巢综合征 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | DHEA诱导的PCOS小鼠模型卵巢组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 984 | 2026-05-12 |
Identification of Dendritic Cell-Associated Genes in COPD Based on Bioinformatics
2025, International journal of chronic obstructive pulmonary disease
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/COPD.S543753
PMID:41185886
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研究论文 | 通过生物信息学预测和实验验证，识别慢性阻塞性肺疾病（COPD）肺组织中与树突状细胞相关的基因 | 首次利用单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析综合鉴定COPD中树突状细胞相关基因，并通过体内外实验验证了RASGRP3、C1QB、BLOC1S2和VSIG4的表达变化 | 未提供明确局限性信息 | 利用生物信息学预测和实验验证，识别COPD患者肺组织中与树突状细胞相关的关键基因 | COPD患者肺组织及香烟烟雾诱导的肺气肿小鼠模型 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA测序（RNA-seq）、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、实时定量PCR（RT-qPCR）、蛋白质印迹法（Western blot） | NA | 基因表达数据 | 多个公开数据集（GSE196638、GSE26296、GSE38974）及小鼠模型（香烟烟雾诱导肺气肿小鼠和骨髓来源树突状细胞） | NA | scRNA-seq、RNA-seq | NA | NA |
| 985 | 2026-05-12 |
ER Stress-Related Biomarkers in Chronic Obstructive Pulmonary Disease: A Comprehensive Transcriptome, Mendelian Randomization, and Machine-Learning Analysis
2025, International journal of chronic obstructive pulmonary disease
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/COPD.S548160
PMID:41328289
|
研究论文 | 通过转录组分析、孟德尔随机化和机器学习方法，识别慢性阻塞性肺疾病（COPD）中内质网应激相关基因DNAJB1作为风险基因及其诊断价值 | 首次整合单细胞测序、孟德尔随机化和机器学习方法，系统鉴定DNAJB1作为COPD风险基因，并建立包含9个关键基因的诊断生物标志物组合 | 研究基于公开数据集，需要进一步在独立队列中验证；孟德尔随机化揭示的因果关联需更深入的机制研究证实 | 探究内质网应激相关基因DNAJB1在COPD发病中的风险角色及临床诊断价值 | 慢性阻塞性肺疾病患者及对照样本的转录组数据和遗传变异数据 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、微阵列分析、孟德尔随机化 | 机器学习分类器 | 基因表达数据、遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、微阵列分析 | NA | NA |
| 986 | 2026-05-12 |
Two-Step Positive Selection Method for the Magnetic Isolation of Lymphatic Endothelial Cells
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4706-6_2
PMID:40859071
|
研究论文 | 描述了一种利用双抗体磁珠分选法从组织中分离淋巴内皮细胞（LEC）的方法 | 采用两步阳性选择策略，结合双抗体标记，高效富集稀有淋巴内皮细胞，解决了常规分离方法中LEC纯度低的问题 | 未提及与其他分离方法的直接比较，可能对组织来源和细胞状态有依赖性 | 开发一种可靠的稀有细胞分离方法，用于研究淋巴内皮细胞在生理和病理状态下的功能 | 淋巴内皮细胞（LEC） | 分子生物学 | NA | 磁珠分选 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 987 | 2026-05-12 |
Unsupervised multi-scale clustering of single-cell transcriptomes to identify hierarchical structures of cell subtypes
2024-Dec-23, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5671748/v1
PMID:39764102
|
研究论文 | 提出一种无监督多尺度聚类方法用于单细胞转录组数据，以识别细胞亚型的层次结构 | 开发了多尺度聚类（MSC）方法，能够在无监督模式下构建稀疏细胞-细胞相关网络，以多尺度分辨率识别细胞类型和亚型，相比现有方法性能显著提升 | 未明确说明局限性 | 改进单细胞RNA测序数据中细胞聚类方法，以更精细地解析细胞景观的复杂结构 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型和亚型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括模拟数据、银色标准数据、金色标准数据以及真实疾病相关scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 988 | 2026-05-12 |
STAN, a computational framework for inferring spatially informed transcription factor activity
2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.26.600782
PMID:38979296
|
研究论文 | 提出了一种计算框架STAN，用于推断空间信息指导的转录因子活性 | 首次利用空间转录组数据系统估计细胞身份相关的转录因子活性，并整合了形态学特征 | 未明确提及局限性 | 开发一种计算方法，从空间转录组数据推断转录因子的空间活性 | 空间转录组数据集中的点（spots） | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 线性混合效应模型 | 基因表达数据、空间坐标、形态学特征 | 三个数据集：淋巴结、乳腺癌、胶质母细胞瘤 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 989 | 2026-05-12 |
Selectively Imaging Cranial Sensory Ganglion Neurons Using AAV-PHP.S
2022 May-Jun, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0373-21.2022
PMID:35610024
|
研究论文 | 使用AAV-PHP.S选择性成像颅脑感觉神经节神经元 | 首次利用AAV-PHP.S载体实现对小鼠颅神经V、VII、IX、X感觉神经节神经元的高效转导和荧光标记，并结合功能成像揭示此前未记录的膝状神经节耳廓神经元的感官特性 | 研究主要基于小鼠模型，且转导效率约为66%，可能未覆盖全部神经元亚型 | 开发并验证AAV-PHP.S作为工具用于外周感觉神经元的解剖和功能映射 | 小鼠颅神经V、VII、IX、X感觉神经节的感觉神经元（包括躯体性和内脏性假单极神经元）以及卫星胶质细胞 | 神经科学 | NA | AAV介导的基因传递、荧光成像、光片显微镜、钙成像 | NA | 图像 | 小鼠模型，具体数量未明确说明 | NA | NA | AAV-PHP.S | AAV-PHP.S携带GFP或mScarlet荧光蛋白以及Cre依赖性报告基因 |
| 990 | 2026-05-12 |
Cigarette Smoke Exposure and Inflammatory Signaling Increase the Expression of the SARS-CoV-2 Receptor ACE2 in the Respiratory Tract
2020-06-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.05.012
PMID:32425701
|
研究论文 | 本研究揭示香烟暴露通过上调ACE2表达增加SARS-CoV-2感染风险，并发现ACE2是干扰素刺激基因 | 首次从单细胞水平阐明香烟暴露通过扩增分泌细胞群上调ACE2的机制，并证实ACE2作为干扰素刺激基因可能形成正反馈循环促进病毒传播 | 未明确说明 | 探究香烟暴露对SARS-CoV-2受体ACE2在呼吸道表达的影响及调控机制 | 啮齿动物和人类呼吸道组织样本 | 机器学习和数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 涉及啮齿动物和人类样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台 |
| 991 | 2026-05-11 |
The role of positional information in determining dermal fibroblast diversity
2024-04, Matrix biology : journal of the International Society for Matrix Biology
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.matbio.2024.02.009
PMID:38423396
|
综述 | 综述了位置信息在决定真皮成纤维细胞多样性中的作用 | 系统总结了位置信息如何影响成纤维细胞异质性和可塑性，并探讨其在皮肤稳态、伤口愈合、纤维化和癌症中的潜在应用 | 作为综述，缺乏原始实验数据支持，未提供具体机制验证 | 阐明位置信息对真皮成纤维细胞多样性的调控作用及其在皮肤疾病中的意义 | 真皮成纤维细胞及其在皮肤中的异质性和可塑性 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 992 | 2026-05-11 |
Deciphering the heterogeneity of neutrophil cells within circulation and the lung cancer microenvironment pre- and post-operation
2024-02-06, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09850-z
PMID:38319415
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析非小细胞肺癌患者循环血和肿瘤微环境中中性粒细胞亚群的异质性 | 开发了过表达率（OER）计算方法来评估中性粒细胞亚群的特异性，并识别了具有潜在临床价值的基因面板 | 缺乏对中性粒细胞亚群识别标准的明确结论 | 评估中性粒细胞亚群分布特征以帮助非小细胞肺癌的诊断和预后 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织、癌旁组织及术前术后血液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 993 | 2026-05-11 |
Leveraging single-cell ATAC-seq and RNA-seq to identify disease-critical fetal and adult brain cell types
2024-01-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-44742-0
PMID:38233398
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研究论文 | 通过整合单细胞ATAC-seq（scATAC-seq）和RNA-seq（scRNA-seq）数据，识别与大脑疾病相关的胎儿和成体脑细胞类型 | 首次大规模整合GWAS数据与超300万scATAC-seq和scRNA-seq图谱，从染色质可及性和基因表达两个维度识别脑疾病关键细胞类型 | 研究依赖GWAS汇总统计数据，可能遗漏罕见变异或细胞类型特异效应；仅覆盖83种细胞类型，仍存在未检测的细胞亚型 | 利用单细胞表观组学和转录组学数据，优先识别与脑部疾病相关的关键胎儿和成体脑细胞类型 | 28种脑部相关疾病/特征以及83种细胞类型的scATAC-seq和scRNA-seq图谱 | 计算生物学、基因组学 | 脑部疾病（如重度抑郁症、精神分裂症、ADHD）、代谢特征（如BMI） | scATAC-seq, scRNA-seq | NA | 单细胞染色质可及性数据、单细胞基因表达数据、GWAS汇总统计 | 28种疾病/特征的平均样本量约298,000人；单细胞数据包含320万个细胞 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 994 | 2026-05-11 |
The phosphatase DUSP22 inhibits UBR2-mediated K63-ubiquitination and activation of Lck downstream of TCR signalling
2024-01-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-44843-w
PMID:38225265
|
研究论文 | 揭示DUSP22磷酸酶通过抑制UBR2介导的Lck K63-泛素化来调控T细胞受体信号通路 | 首次发现E3泛素连接酶UBR2是T细胞活化中Lck的正向上游调控因子，并阐明DUSP22通过去磷酸化UBR2促使其降解的调控机制 | 未提及具体局限性 | 研究T细胞激活过程中Lck激酶的调控机制及其在炎症反应中的平衡作用 | T细胞受体信号通路中的关键蛋白DUSP22、UBR2和Lck | 机器学习 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 系统性红斑狼疮患者外周血T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 995 | 2026-05-11 |
BIDCell: Biologically-informed self-supervised learning for segmentation of subcellular spatial transcriptomics data
2024-01-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44560-w
PMID:38218939
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研究论文 | 提出BIDCell框架，利用自监督深度学习结合细胞形态和基因表达数据，实现亚细胞空间转录组数据的细胞分割 | 引入生物信息指导的损失函数，融合单细胞转录组和细胞形态信息，实现高精度细胞分割，避免碎片化或过大细胞导致的污染表达 | 未提及具体限制，但可能依赖高质量参考数据且对新型组织类型泛化能力未知 | 开发改进的细胞分割方法，提升亚细胞空间转录组数据中细胞识别的准确性和基因分配精度 | 亚细胞空间转录组数据中的细胞 | 数字病理学 | NA | 亚细胞成像转录组学、单细胞转录组学 | 自监督深度学习框架 | 空间基因表达数据、细胞形态图像 | 多种组织类型和技术平台的数据集 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 996 | 2026-05-11 |
Integrated epigenetic and transcriptional single-cell analysis of t(11;14) multiple myeloma and its BCL2 dependency
2024-01-04, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023020276
PMID:37729611
|
研究论文 | 整合单细胞ATAC-seq和RNA-seq分析t(11;14)多发性骨髓瘤及其BCL2依赖性 | 首次在原发性多发性骨髓瘤细胞中整合单细胞ATAC-seq和单细胞RNA-seq分析，深入解析t(11;14)多发性骨髓瘤的表观遗传调控组和转录组及其对venetoclax耐药性的影响 | 未明确说明 | 揭示t(11;14)多发性骨髓瘤对BCL2抑制剂的依赖性及其表观遗传调控机制 | t(11;14)多发性骨髓瘤患者 | 表观遗传学 | 多发性骨髓瘤 | ATAC-seq, RNA-seq | NA | 单细胞测序数据 | 原发性MM样本 | NA | NA | NA | NA |
| 997 | 2026-05-11 |
Analysis of Single-Cell RNA-seq Data
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2986-4_6
PMID:36929075
|
综述 | 描述了单细胞RNA测序数据分析的标准工作流程和相关工具，并提供使用建议 | NA | NA | 介绍单细胞RNA测序数据分析的标准工作流程和常用方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 998 | 2026-05-11 |
Single-cell RNA-sequencing analyses identify heterogeneity of CD8+ T cell subpopulations and novel therapy targets in melanoma
2021-Mar-26, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2020.12.003
PMID:33575475
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析黑色素瘤中CD8+ T细胞亚群的异质性，并识别潜在治疗靶点 | 首次在黑色素瘤中系统描述了7个CD8+ T细胞亚群的异质性，并发现耗竭性CD8+ T细胞亚群2中的三个过表达基因（、、）可作为新型治疗靶点 | 研究基于已发表数据，未涉及实验验证；样本量可能有限；靶点的临床前验证尚未进行 | 探索黑色素瘤中CD8+ T细胞亚群的异质性及其对预后和免疫治疗的影响 | 黑色素瘤样本中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 999 | 2026-05-11 |
Single-cell RNA-seq dissects the intratumoral heterogeneity of triple-negative breast cancer based on gene regulatory networks
2021-Mar-05, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2020.12.018
PMID:33575114
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据构建基因调控网络，解析三阴性乳腺癌的瘤内异质性 | 通过整合基因共表达和转录因子结合基序富集分析，为每个亚型构建基因调控网络，并基于中心性指标识别关键基因 | 未提及样本量大小及其他潜在局限性 | 利用单细胞RNA测序数据构建基因调控网络，以解析三阴性乳腺癌的瘤内异质性并识别关键基因 | 三阴性乳腺癌患者的恶性细胞亚型 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | PAM50分型模型 | 单细胞转录组数据 | 未提供具体样本量 | 双歧杆菌 | 单细胞RNA测序 | 双歧杆菌 | 双歧杆菌 |
| 1000 | 2026-05-11 |
Systemic transcriptome comparison between early- And late-onset pre-eclampsia shows distinct pathology and novel biomarkers
2021-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.12968
PMID:33332660
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研究论文 | 比较早发型和晚发型子痫前期的全身转录组，揭示其病理差异并发现新型生物标志物 | 首次整合胎盘和外周血转录组与母胎界面单细胞转录组，系统比较早发型和晚发型子痫前期的病理差异，并发现各自特异的新型生物标志物 | 需要更大样本量验证新标志物的临床适用性，且单细胞数据整合分析的深度有限 | 阐明早发型和晚发型子痫前期的病理差异并发现新型诊断生物标志物 | 子痫前期患者（早发型和晚发型）的胎盘和外周血样本 | 数字病理学 | 子痫前期 | 转录组测序、单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 包含早发型和晚发型子痫前期患者及对照组的胎盘和外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 整合了母胎界面的单细胞转录组数据 |