单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 33678 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2025-11-25 |
GPRC5A+ myCAFs promote ESCC progression via TGF-β-induced fibroblast activation and ANXA1-mediated M2 macrophage polarization
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115663
PMID:41082840
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现GPRC5A+肌成纤维细胞通过TGF-β通路激活成纤维细胞和ANXA1介导的M2巨噬细胞极化促进食管鳞癌进展 | 首次鉴定GPRC5A作为肌成纤维细胞亚群特异性标志物，并揭示其通过双重机制驱动肿瘤进展的新机制 | 样本量相对有限（15例肿瘤和11例正常组织），需进一步验证 | 探究食管鳞癌中癌相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤微环境调控中的作用机制 | 食管鳞癌组织和正常食管组织 | 单细胞生物学 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序，转录组去卷积分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 15例ESCC肿瘤组织和11例正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 982 | 2025-11-25 |
Paeoniflorin attenuates hepatic ischemia-reperfusion injury by modulating Tmem176b+ macrophages polarization
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115657
PMID:41092769
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示芍药苷通过调节Tmem176b+巨噬细胞极化减轻肝脏缺血再灌注损伤的机制 | 首次发现芍药苷特异性靶向Tmem176b+巨噬细胞亚群，通过调控THBS1-CD47免疫抑制轴和SPP1-CD44促炎信号通路发挥保护作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证；单细胞测序样本量相对有限 | 探究芍药苷在肝脏缺血再灌注损伤中对巨噬细胞极化的调节机制 | 肝脏缺血再灌注损伤小鼠模型中的巨噬细胞亚群 | 单细胞组学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，伪时间轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 45,673个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 983 | 2025-11-25 |
Integration of scRNA-seq and bulk RNA-seq reveals that macrophage ferroptosis inhibits MSC osteogenic differentiation in inflammatory microenvironments
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115744
PMID:41166988
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序技术，揭示巨噬细胞铁死亡在炎症微环境中抑制间充质干细胞成骨分化的机制 | 首次揭示巨噬细胞铁死亡通过调控M1/M2极化影响MSC PANoptosis和成骨分化的新机制 | 研究主要聚焦于巨噬细胞铁死亡的效应，其他细胞类型的贡献尚未充分探讨 | 探究炎症微环境中巨噬细胞铁死亡对骨再生和MSC成骨分化的影响机制 | 巨噬细胞、间充质干细胞(MSC)、骨感染临床样本 | 单细胞生物学 | 骨感染 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包含体内、体外实验和临床样本的多层次验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 984 | 2025-11-25 |
Single-Cell Profiling of Lichen Planus Reveals Type I IFN Response Triggering the Interface Dermatitis Reaction
2025-Dec, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.043
PMID:40499747
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了扁平苔藓中I型干扰素反应触发界面皮炎反应的免疫发病机制 | 首次在扁平苔藓中发现I型干扰素富集环境，并证实IFN-β通过敏化角质形成细胞增强CD8 T细胞介导的细胞死亡 | NA | 研究扁平苔瘆的免疫发病机制及驱动界面皮炎反应的潜在机制 | 扁平苔瘆患者皮损组织与健康对照皮肤 | 单细胞组学 | 皮肤炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 扁平苔瘆患者皮损组织与健康对照皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 985 | 2025-11-25 |
Analyzing the toxicological effects of PET-MPs on male infertility: Insights from network toxicology, mendelian randomization, and transcriptomics
2025-Dec, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2025.101076
PMID:40929757
|
研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学、孟德尔随机化和转录组学方法，探讨了PET微塑料导致男性不育的分子机制 | 首次发现CLK4是PET微塑料导致男性不育的功能靶点，并揭示了其通过调节Th1细胞浸润和干扰精子发生过程的双重作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外模拟，缺乏体内实验验证 | 探究PET微塑料对男性生殖功能损害的分子机制 | 男性不育相关基因和细胞类型 | 生物信息学 | 男性不育 | 网络毒理学, 孟德尔随机化, 转录组学, 分子对接, 分子动力学模拟, bulk RNA-seq, scRNA-seq | SMR分析 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 986 | 2025-11-25 |
Molecular insights into the role of tumor-specific endothelial cells in metastasis
2025-Dec, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104964
PMID:41015325
|
综述 | 本文综述了肿瘤特异性内皮细胞在肿瘤转移和免疫逃逸中的关键作用及其治疗潜力 | 系统阐述了肿瘤特异性内皮细胞区别于正常内皮细胞的独特特征及其在肿瘤进展中的多重功能 | NA | 探讨肿瘤特异性内皮细胞在癌症转移和治疗中的作用机制 | 肿瘤特异性内皮细胞 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 987 | 2025-11-25 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics-Based Research Reveals Association Between M2a Macrophages and Tumor Spread through Air Spaces in Lung Adenocarcinoma
2025-Dec, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.07.017
PMID:40946801
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示M2a巨噬细胞通过CCL17/CCR4轴促进β-catenin信号通路，从而增强肺腺癌气腔播散的发生发展 | 创新性地结合单细胞RNA测序与数字空间分析空间转录组学技术，针对STAS的空间特性探索肿瘤相关巨噬细胞的作用机制 | NA | 探索肺腺癌中气腔播散的发生和定植机制，特别是肿瘤相关巨噬细胞在其中的作用 | 肺腺癌组织中的肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 数字空间分析空间转录组学 |
| 988 | 2025-11-25 |
Comprehensive multi-omics analysis identifies transferrin receptor as a therapeutic target in esophageal cancer
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148121
PMID:41067362
|
研究论文 | 通过多组学方法鉴定转铁蛋白受体(TFRC)作为食管癌的潜在治疗靶点 | 首次通过整合单细胞RNA测序、转录组分析和基因组关联研究，系统揭示TFRC在食管癌免疫逃逸中的关键作用机制 | NA | 识别食管癌的新型生物标志物并探索其在疾病进展中的作用 | 食管癌样本 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,基因表达数量性状位点分析,全基因组关联研究,多重免疫荧光检测 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 989 | 2025-11-25 |
Single-cell RNA sequencing reveals oocyte-granulosa crosstalk and regulatory networks driving chicken primordial follicle assembly
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148357
PMID:41109371
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示鸡原始卵泡组装过程中卵母细胞与颗粒细胞的相互作用及调控网络 | 首次构建鸡生殖细胞和颗粒细胞的单细胞转录组图谱，揭示原始卵泡组装过程中的细胞异质性和双向调控机制 | 研究局限于鸡模型，调控机制在其它物种中的普适性需要进一步验证 | 解析鸡原始卵泡组装的分子调控机制 | 鸡卵巢生殖细胞和颗粒细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP, Pseudotime轨迹分析, CellChat | 单细胞转录组数据 | 鸡卵巢关键发育阶段的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 990 | 2025-11-25 |
Consensus Molecular Subtypes (CMS) Classification: a progress towards Subtype-Driven treatments in colorectal cancer
2025-Nov-24, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-04117-1
PMID:41276825
|
综述 | 本文综述了结直肠癌共识分子分型(CMS)的分类系统及其在预后预测和个性化治疗中的应用 | 系统整合了基于基因表达谱、免疫组化和深度学习图像分析的CMS分类方法，并探讨了单细胞测序解决肿瘤内异质性的新策略 | 肿瘤内异质性和技术障碍限制了临床应用的广泛采纳 | 评估CMS分类在结直肠癌预后预测和治疗指导中的价值 | 结直肠癌分子亚型及其临床特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 基因表达谱分析,免疫组化,单细胞RNA测序,深度学习 | 深度学习 | 基因表达数据,病理图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 991 | 2025-11-25 |
Adipose-derived mesenchymal stem cell therapy modulates mitochondrial function to attenuate acetaminophen-induced liver injury by DDIT4/PGC-1α axis
2025-Nov-24, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04815-3
PMID:41276869
|
研究论文 | 本研究探讨脂肪来源间充质干细胞通过DDIT4/PGC-1α轴调节线粒体功能缓解对乙酰氨基酚诱导肝损伤的机制 | 首次揭示AMSCs通过DDIT4介导的PGC-1α上调诱导线粒体生物发生和线粒体自噬，从而恢复线粒体功能 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化需要进一步验证 | 探究间充质干细胞治疗对乙酰氨基酚诱导肝损伤的线粒体功能调节机制 | 对乙酰氨基酚诱导肝损伤小鼠模型、肝细胞特异性DDIT4敲除小鼠、AILI患者肝组织样本 | 细胞治疗 | 药物性肝损伤 | RNA-Seq, snRNA-Seq, 空间转录组学分析 | NA | 基因表达数据, 组织学数据 | 小鼠模型和患者肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 992 | 2025-11-25 |
PBMCpedia: a harmonized PBMC scRNA-seq database with unified mapping and enhanced celltype annotation
2025-Nov-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1245
PMID:41277528
|
研究论文 | 本研究构建了一个统一处理与注释的PBMC单细胞RNA测序数据库PBMCpedia | 通过标准化流程统一处理24项公开研究的519个样本，提供跨疾病、细胞类型、性别和年龄组的元数据感知比较 | 仅包含公开可用数据，未涉及新样本采集 | 解决PBMC单细胞转录组研究中数据整合困难的问题 | 外周血单个核细胞(PBMC) | 单细胞转录组学 | 自身免疫疾病,传染病,神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,T细胞受体/B细胞受体谱数据,表面蛋白测量数据 | 519个样本(超过430万个细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 993 | 2025-11-25 |
Single-cell transcriptome profiling reveals immunological fitness of HIV long-term non-progressors
2025-Nov-24, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01597-25
PMID:41277843
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示HIV长期不进展者的免疫适应性特征 | 首次在单细胞水平系统比较HIV长期不进展者、典型进展者和健康捐赠者的免疫细胞转录组差异 | 样本量较小（仅12名参与者），仅分析外周血单个核细胞 | 研究HIV长期不进展者的免疫学特征与非进展机制 | HIV长期不进展者、典型进展者和健康捐赠者的外周血单个核细胞 | 单细胞生物学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA) | 单细胞转录组数据 | 12名个体（4名LTNP、4名TP、4名HD） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 994 | 2025-11-25 |
Cmss1 limits FMDV infection by enhancing antigen presentation and CD8+ T cell responses
2025-Nov-24, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01249-25
PMID:41277842
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了树突状细胞在口蹄疫病毒感染中的作用，并发现Cmss1通过增强抗原呈递和CD8+ T细胞反应限制病毒感染 | 首次开发了缺乏I型干扰素受体的小鼠感染模型，通过单细胞RNA测序绘制了FMDV感染小鼠脾脏DC的高分辨率图谱，并鉴定出Cmss1作为新的宿主因子 | 研究主要使用小鼠模型，结果在猪等自然宿主中的适用性需要进一步验证 | 探究树突状细胞在口蹄疫病毒感染中的作用机制，寻找抗病毒治疗新靶点 | 缺乏I型干扰素受体的C57BL/6小鼠、树突状细胞、FMDV病毒 | 免疫学 | 口蹄疫 | 单细胞RNA测序、基因编辑 | NA | 单细胞转录组数据 | 感染FMDV的小鼠脾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 995 | 2025-11-25 |
Single-cell and spatial transcriptome-based metabolism-immunity interaction network and therapeutic target discovery of matrine in cervical cancer
2025-Nov-24, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04801-9
PMID:41283998
|
研究论文 | 本研究通过整合TCGA数据库分析、单细胞测序和空间转录组技术，探索宫颈癌的代谢-免疫相互作用网络及苦参碱的治疗潜力 | 首次结合单细胞测序和空间转录组技术系统揭示宫颈癌代谢-免疫相互作用网络，并发现苦参碱通过调控钙信号通路和炎症相关基因发挥抗肿瘤作用 | 苦参碱的确切作用机制尚未完全明确，研究结果主要基于生物信息学分析和初步体外实验 | 探索宫颈癌的分子机制及苦参碱的治疗潜力，为宫颈癌治疗提供新的研究方向 | 宫颈癌组织样本及相关基因数据 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞测序,空间转录组,生物信息学分析,分子对接 | CIBERSORT算法,ESTIMATE算法 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 从TCGA数据库筛选758个差异基因，其中453个与宫颈癌靶点重叠，发现20个核心基因 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组 | NA | NA |
| 996 | 2025-11-25 |
Azvudine remodels the local immunosuppressive microenvironment and exhibits sustained anti-tumor effects in combination with anti-PD-1 therapies
2025-Nov-24, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-025-1164-0
PMID:41284146
|
研究论文 | 本研究探讨阿兹夫定单用或联合抗PD-1疗法对肿瘤微环境的免疫调节作用及抗肿瘤效果 | 首次揭示阿兹夫定通过诱导免疫原性细胞死亡和重塑免疫抑制微环境增强抗PD-1疗法的协同抗肿瘤作用 | 研究基于小鼠同系肿瘤模型，需进一步临床验证在不同肿瘤类型中的转化潜力 | 评估阿兹夫定在肿瘤免疫治疗中的免疫调节机制和联合治疗潜力 | 免疫健全小鼠建立的同系肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫学检测 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 免疫健全小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 997 | 2025-11-25 |
Prognostic and Immunological Significance of TIPARP in Pancreatic Cancer
2025-Nov-24, Digestive diseases and sciences
IF:2.5Q2
DOI:10.1007/s10620-025-09546-2
PMID:41284141
|
研究论文 | 本研究探讨了TIPARP在胰腺癌中的预后价值和免疫学意义 | 首次系统揭示TIPARP在胰腺癌中的独立预后价值、免疫调节功能及其通过PI3K-Akt信号通路促进肿瘤进展的机制 | 研究主要基于公共数据库分析，实验验证主要在体外进行，缺乏体内动物模型验证 | 阐明TIPARP在胰腺癌中的临床意义和生物学功能 | 胰腺导管腺癌(PAAD)患者组织和细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫浸润分析,孟德尔随机化分析,体外功能实验,通路富集分析 | 列线图(nomogram) | 基因表达数据,临床数据,单细胞转录组数据 | TCGA-PAAD数据库178例,GTEx数据库171例正常组织 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 998 | 2025-11-25 |
LRP12 promotes gastric cancer progression through AKT/mTOR signaling and M2 macrophage-mediated immunosuppression
2025-Nov-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28503-7
PMID:41276539
|
研究论文 | 本研究揭示了LRP12通过激活AKT/mTOR信号通路和诱导M2巨噬细胞介导的免疫抑制促进胃癌进展的机制 | 首次发现LRP12作为炎症相关基因在胃癌中的预后价值，并阐明其通过AKT/mTOR信号和M2巨噬细胞极化双重机制促进肿瘤进展 | 研究主要基于实验模型验证，临床转化价值仍需进一步人群研究确认 | 鉴定胃癌炎症相关生物标志物并探索其调控肿瘤免疫微环境的机制 | 胃癌细胞系、公共数据集、内部患者队列、异种移植模型 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 单细胞转录组学、多重免疫荧光/免疫组化、Western blotting、细胞增殖和侵袭实验 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质印迹数据、免疫组化图像 | 公共数据集与内部队列整合分析，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 999 | 2025-11-25 |
Metabolic reprogramming and mitochondrial dysfunction underlie β gonia arrest and niche cell dysfunction in sterile triploid oysters
2025-Nov-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09202-5
PMID:41276684
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了三倍体牡蛎不育的分子机制，重点关注β精原细胞停滞和生态位细胞功能障碍 | 首次构建了不育三倍体牡蛎性腺的空间分辨分子图谱，揭示了SOHLH2沉默驱动的线粒体功能障碍和NOTCH-Hes1a-CCNA2信号介导的生态位细胞G期阻滞 | 由于牡蛎性腺缺乏明确结构边界，细胞类型鉴定具有挑战性 | 阐明三倍体牡蛎不育的分子基础 | 雌性三倍体太平洋牡蛎的性腺组织 | 空间转录组学 | 不育症 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 1000 | 2025-11-25 |
Integrated multi-omics analysis identifies key biomarkers associated with post-translational modifications and RNA methylation in clear cell renal cell carcinoma
2025-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04074-x
PMID:41276708
|
研究论文 | 通过整合多组学数据分析，识别与透明细胞肾细胞癌中翻译后修饰和RNA甲基化相关的关键生物标志物 | 首次系统整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，结合20种PTM类型和4种RNA甲基化模式，识别ccRCC中的关键生物标志物和分子亚型 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 阐明ccRCC肿瘤发生机制和肿瘤微环境动态，为诊断和治疗提供新见解 | 透明细胞肾细胞癌 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | LASSO,SVM,随机森林,SHAP | 基因表达数据 | 5个GEO数据集(GSE16449,GSE46699,GSE53000,GSE53757,GSE66272) | NA | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |