单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 31780 篇文献,本页显示第 981 - 1000 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
981 2025-10-05
The tumor-associated fibroblasts regulate urothelial carcinoma progression
2025-Sep-19, Journal of molecular cell biology IF:5.3Q2
研究论文 通过单细胞测序和空间转录组技术构建上尿路尿路上皮癌微环境图谱,揭示肿瘤相关成纤维细胞在癌症进展中的作用 首次构建UTUC的全面微环境图谱,发现myCAFs亚群与不同恶性程度上皮细胞的相互作用机制 CAFs在UTUC发展中的具体调控机制仍需进一步验证 研究肿瘤相关成纤维细胞对上尿路尿路上皮癌进展的调控作用 上尿路尿路上皮癌组织和细胞 数字病理学 尿路上皮癌 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组测序,免疫荧光芯片 风险模型,层次聚类 基因表达数据,空间转录组数据,免疫荧光数据 UTUC患者队列 NA 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 NA Stereo-seq空间增强分辨率组学测序技术
982 2025-10-05
Bone marrow B lymphopoiesis accelerates early cerebral amyloid pathology
2025-Sep-18, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本研究揭示了骨髓B淋巴细胞生成通过IL-6信号通路加速早期脑淀粉样蛋白病理的机制 首次发现Aβ在AD患者颅骨骨髓中积累,并证实骨髓来源的年龄相关B细胞通过增强小胶质细胞反应性加剧AD神经病理 研究主要基于小鼠AD模型,人类样本验证有限 探究骨髓造血系统改变在阿尔茨海默病神经炎症和脑Aβ病理中的作用 AD患者骨髓样本、5×FAD和APP/PS1小鼠模型、IL-6敲除小鼠 神经科学 阿尔茨海默病 流式细胞术、细胞追踪分析、单细胞测序、体外小胶质细胞培养 NA 细胞计数数据、基因表达数据、行为学数据 两种经典AD小鼠模型(5×FAD和APP/PS1)及IL-6敲除小鼠 NA 单细胞测序 NA NA
983 2025-10-05
Neural basis for parental behavioral transitions in mice
2025-Sep-18, Current opinion in neurobiology IF:4.8Q1
综述 本文综述了小鼠亲代行为转变的神经基础,重点关注激素与特定脑区细胞类型的相互作用机制 整合单细胞转录组学和细胞类型特异性遗传操作的最新进展,阐明激素驱动大脑关键区域结构可塑性的机制 主要基于小鼠模型研究,对人类直接适用性有限;对性二态性激素系统参与的讨论较为简要 探究哺乳动物亲代行为转变的神经内分泌机制 小鼠的亲代行为及其神经基础 神经科学 NA 单细胞转录组学,细胞类型特异性遗传操作 NA NA NA NA NA NA NA
984 2025-10-05
SPP1+ macrophages polarized by lactate confer the progression of hypoxic adaptive tumor cells in brain
2025-Sep-18, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究揭示了脑肿瘤中缺氧适应性肿瘤细胞通过乳酸诱导SPP1+巨噬细胞极化促进肿瘤进展的机制 首次发现乳酸介导的组蛋白乳酸化诱导SPP1+巨噬细胞极化,并阐明SPP1直接激活MAPK信号通路促进肿瘤生长的机制 研究主要基于小鼠模型,临床转化需要进一步验证 探究脑肿瘤微环境中缺氧适应性肿瘤细胞与巨噬细胞的相互作用机制 脑肿瘤微环境中的肿瘤细胞和巨噬细胞 肿瘤免疫学 脑肿瘤 单细胞RNA测序,空间转录组,CRISPR/Cas9基因编辑,流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 转基因小鼠模型 NA 单细胞RNA测序,空间转录组 NA NA
985 2025-10-05
Conformal Inference for Reliable Single Cell RNA-seq Annotation
2025-Sep-18, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出基于共形预测框架的单细胞RNA测序注释方法,提供可靠的细胞类型注释和不确定性量化 首次将共形预测框架应用于单细胞RNA测序注释,无需数据分布假设即可提供统计保证 NA 解决单细胞RNA测序注释中的不确定性量化和异常细胞类型检测问题 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 共形预测 基因表达数据 十个批次实验,来自多种组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
986 2025-10-05
RNA velocity and beyond: Current advances in modeling single-cell transcriptional dynamics
2025-Sep-18, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology IF:6.2Q1
综述 本文综述了RNA Velocity及其扩展方法在单细胞转录动力学建模中的最新进展 系统梳理了RNA Velocity从基础原理到第二代计算工具的发展历程,并重点介绍了在过敏和免疫学研究中的创新应用 讨论了RNA Velocity分析当前面临的挑战和剩余限制 探索单细胞转录动力学的建模方法及其在生物学研究中的应用 单细胞RNA测序数据及其在细胞分化、重编程和疾病进展等动态过程中的应用 生物信息学 过敏性和免疫介导疾病 单细胞RNA测序 Velocyto, scVelo, dynamo, CellRank, 深度学习 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学 NA NA
987 2025-05-02
Spatial transcriptomics: Advances and challenges in peripheral nerve sheath tumor
2025-Sep-17, Neuro-oncology IF:16.4Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
988 2025-10-05
TissueMosaic: Self-supervised learning of tissue representations enables differential spatial transcriptomics across samples
2025-Sep-17, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 提出了一种自监督卷积神经网络TissueMosaic,用于从空间转录组数据中学习组织架构表示并比较不同样本间的差异 开发了首个基于组织架构基序的自监督学习方法,能够将组织结构与基因表达联系起来,提高空间差异表达分析的信噪比 未提及具体的技术限制或数据集局限性 开发计算方法以连接细胞状态与其微环境,并比较不同样本和条件下的空间转录组关系 多样本空间转录组数据集中的组织架构基序 空间转录组学 NA 空间转录组学 自监督卷积神经网络(CNN) 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
989 2025-10-05
Spatial transcriptomic analysis reveals lack of response to PD-1 blockade in recurrent glioblastoma
2025-Sep-17, Acta neuropathologica IF:9.3Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学分析发现复发性胶质母细胞瘤对PD-1阻断治疗缺乏响应 首次使用空间转录组学技术分析PD-1阻断后胶质母细胞瘤中肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞的转录组变化 样本量相对较小(26例患者),仅检测了空间转录组水平的变化 研究PD-1阻断治疗在复发性胶质母细胞瘤中对肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞的影响 26例匹配的原发性和复发性IDH野生型胶质母细胞瘤患者 数字病理学 胶质母细胞瘤 空间转录组学,Digital Spatial Profiling NA 空间转录组数据 26例患者(16例接受纳武利尤单抗治疗) NanoString 空间转录组学 GeoMx Digital Spatial Profiling平台,使用FFPE肿瘤样本,针对SOX2⁺肿瘤细胞和IBA1⁺肿瘤相关巨噬细胞区域进行分析
990 2025-10-05
Learning antibody sequence constraints from allelic inclusion
2025-Sep-17, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 开发机器学习框架利用等位基因包含数据识别抗体序列约束 首次利用等位基因包含这一罕见事件作为数据源训练机器学习模型预测抗体序列约束 NA 识别违反表达要求和脱靶反应性限制的抗体序列 人类B细胞抗体轻链和重链序列 机器学习 NA 单细胞测序 机器学习模型 序列数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
991 2025-10-05
Epithelial cell-derived lumican modulates extracellular matrix dynamics in early-life airways disease
2025-Sep-17, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本研究揭示了上皮细胞来源的lumican在早期生命气道疾病中调节细胞外基质动态变化的新机制 首次发现lumican在儿童喘息和哮喘气道重塑中的关键作用,并阐明其通过改变成纤维细胞功能影响胶原蛋白组织 研究样本量有限,机制研究主要在动物模型中进行,需要进一步验证 探究早期生命气道疾病中细胞外基质改变机制 学龄前喘息儿童(1-5岁)、学龄期哮喘儿童(6-16岁)和HDM暴露新生小鼠 数字病理学 哮喘 空间转录组学,共聚焦显微镜,二次谐波产生显微镜 NA 转录组数据,图像数据 儿童气道活检样本和HDM暴露新生小鼠肺组织 NA 空间转录组学 NA NA
992 2025-10-05
Automating classification of treatment responses to combined targeted therapy and immunotherapy in HCC
2025-Sep-17, Journal of molecular cell biology IF:5.3Q2
研究论文 开发多模态CNN-Transformer模型预测肝细胞癌患者对TKI联合免疫治疗的疗效反应 首次构建融合影像和临床特征的多模态深度学习模型,并采用两阶段3D U-Net自动分割系统减少人工干预偏差 样本量有限(训练队列181例,验证队列30例),且主要针对无法手术的晚期HCC患者 预测肝细胞癌患者对TKI联合免疫治疗的治疗反应 晚期肝细胞癌患者 计算机视觉 肝细胞癌 单细胞测序,磁共振成像 CNN-Transformer,3D U-Net 影像,临床数据 训练队列181例,验证队列30例 NA 单细胞RNA-seq NA NA
993 2025-10-05
Harnessing scRNA-seq and bulk RNA-seq to identify CD39+T cell genes for rheumatoid arthritis diagnosis and therapy
2025-Sep-17, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,鉴定CD39+T细胞相关基因作为类风湿关节炎诊断和治疗的生物标志物 首次聚焦CD39+T细胞在类风湿关节炎中的作用,发现PELI1等关键基因的诊断价值并构建lncRNA-miRNA-PELI1调控网络 未明确说明样本规模和研究人群特征,需要进一步实验验证PELI1的生物学功能 识别类风湿关节炎的诊断和治疗生物标志物 类风湿关节炎患者的CD39+T细胞 生物信息学 类风湿关节炎 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习算法 机器学习算法 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
994 2025-10-05
Effects of Oligolysine-Polyethylene Glycol Coating on the Biodistribution of Wireframe DNA Origami Nanosheets in Zebrafish Embryos
2025-Sep-16, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过斑马鱼胚胎模型分析寡聚赖氨酸-聚乙二醇涂层对线框DNA折纸纳米片生物分布的影响 首次结合长期高分辨率活体成像和单细胞RNA测序,在斑马鱼胚胎中研究DNA折纸纳米结构的生物分布和清除机制 研究仅限于斑马鱼胚胎模型,结果向其他生物系统的推广性有待验证 探究K-PEG涂层对DNA折纸纳米结构在生物体内分布和清除的影响 斑马鱼胚胎 纳米生物技术 NA 单细胞RNA测序,活体成像 NA 图像,基因表达数据 斑马鱼胚胎 NA 单细胞RNA测序 NA NA
995 2025-10-05
Transcriptional states of lung cancer microenvironment reveal macrophage subtype dynamics linked to disease progression
2025-Sep-16, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和临床数据分析,揭示了肺癌微环境中肿瘤相关巨噬细胞亚型的动态变化与疾病进展的关系 建立了7种巨噬细胞亚型的精细分类系统,发现脂质相关TAMs随疾病进展而扩增并具有免疫抑制特性,提出了脂质相关与组织驻留TAMs比率作为预后指标 空间转录组分析依赖于反卷积技术推断细胞类型组成,对精细TAM亚群分析的准确性存在依赖 解析肺癌微环境中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 肺腺癌和肺鳞状细胞癌患者样本 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 分层分类, 基于细胞的基因评分 基因表达数据, 空间转录组数据, 临床数据 大型癌症队列数据集 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
996 2025-10-05
Endothelial plasticity in atrial fibrosis by integrating single-cell sequencing and genetic lineage tracing
2025-Sep-15, European heart journal IF:37.6Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞测序和遗传谱系追踪技术,揭示了内皮细胞通过TGF-β1调控心房纤维化的新机制 首次发现间充质活化内皮细胞(EndoMA)通过分泌TGF-β1促进成纤维细胞功能,而非通过完全的内皮-成纤维细胞转分化 未观察到完全的内皮-成纤维细胞转分化过程,机制研究仍需深入 阐明内皮细胞在心房纤维化中的具体作用机制 人心房组织、Cdh5-CreERT2;RFP基因工程小鼠、人原代心房内皮细胞和成纤维细胞 单细胞生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪, 免疫荧光, 高内涵筛选 NA 单细胞转录组数据, 图像数据 窦性心律和房颤患者的心房组织,基因工程小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
997 2025-10-05
Infusion of peripheral blood mononuclear cell alleviates amyloid accumulation and cognitive deficits in Alzheimer's disease
2025-Sep-12, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
研究论文 本研究探讨外周血单个核细胞对阿尔茨海默病淀粉样蛋白积累和认知缺陷的改善作用 首次发现外周血单个核细胞移植可减少AD小鼠Aβ斑块和p-Tau沉积并改善认知功能,鉴定JUN基因为AD诊断关键标志物 样本量有限,未深入探讨PBMCs作用机制,临床转化需进一步验证 探究外周血单个核细胞在阿尔茨海默病中的作用及潜在治疗价值 健康对照和AD患者的外周血单个核细胞,野生型小鼠和AD模型小鼠 神经退行性疾病研究 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序,qRT-PCR,ROC曲线分析,GO和KEGG通路分析 NA 基因表达数据,认知行为数据,病理染色数据 健康对照和AD患者PBMCs样本,9月龄和6月龄AD小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
998 2025-10-05
OPIOID-EXPRESSING B CELLS SILENCE TUMOR-INFILTRATING NOCICEPTOR NEURONS
2025-Sep-03, Research square
研究论文 本研究揭示了阿片类药物通过调节B细胞产生的痛敏肽/孤啡肽(N/OFQ)来影响肿瘤浸润伤害感受神经元活性的新机制 首次发现B细胞是N/OFQ的主要来源,并阐明了N/OFQ-OPRL1和CGRP-RAMP1信号通路在调节肿瘤疼痛和抗肿瘤免疫中的相互作用 研究主要基于头颈鳞癌和黑色素瘤模型,在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 探索癌症疼痛与抗肿瘤免疫之间的分子机制 头颈鳞状细胞癌患者、黑色素瘤患者、口腔鳞癌小鼠模型 肿瘤免疫学 头颈癌, 黑色素瘤 单细胞RNA测序, 动物模型, 细胞共培养 小鼠肿瘤模型 基因表达数据, 临床数据, 行为学数据 头颈癌患者回顾性分析, 多种小鼠肿瘤模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
999 2025-10-05
Integrative genomics elucidates the evolutionary, temporal, and developmental origins of a hydrocephalus risk gene
2025-Sep-02, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究通过整合基因组学方法揭示了脑积水风险基因MAEL的进化起源、时间表达模式和发育谱系特征 首次系统描绘MAEL基因在人类大脑发育过程中的进化起源、时空表达模式,并在人类脑积水组织中直接验证其表达降低 MAEL基因在常用模式生物中序列同源性低,限制了体外和体内机制研究的适用性 阐明MAEL基因在脑积水和发育中人类大脑中的进化、时间、发育和谱系表达特征 人类大脑组织,包括发育中大脑和脑积水患者手术获取的皮质组织 基因组学 脑积水 单细胞RNA测序,整合基因组学分析 NA 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 49个大脑区域的单细胞RNA测序数据,加上手术获取的脑积水原代皮质组织 Allen Institute 单细胞RNA测序 NA 发育中人类大脑图谱的单细胞RNA测序数据
1000 2025-10-05
Exploring mechanisms of britannin against colorectal cancer based on experimentally validated network pharmacology
2025-Sep, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究通过实验验证的网络药理学方法探讨了旋覆花素对结直肠癌的作用机制 首次结合网络药理学和单细胞RNA测序技术系统研究旋覆花素的抗结直肠癌机制,并发现其对巨噬细胞极化的调控作用 研究机制尚未完全阐明,需要进一步验证具体分子靶点 探索旋覆花素治疗结直肠癌的作用机制 结直肠癌细胞和肿瘤微环境 网络药理学 结直肠癌 网络药理学,单细胞RNA测序,CIBERSORT分析,体外实验,体内实验 NA 基因表达数据,实验数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部