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当前共找到 39398 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2026-05-04 |
Identification of key driver genes in idiopathic pulmonary arterial hypertension by single-cell RNA sequencing and experimental validation
2026-Apr-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153869
PMID:42068750
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和实验验证，鉴定特发性肺动脉高压的关键驱动基因 | 首次整合单细胞RNA测序分析与体内外实验验证，系统筛选出四个关键枢纽基因（COL1A1、MYL9、COL1A2和TPM2），并证实其沉默可抑制HMGB1诱导的肺动脉平滑肌细胞增殖和迁移 | 未提及研究局限 | 揭示特发性肺动脉高压的分子机制并鉴定潜在治疗靶点 | 肺动脉平滑肌细胞 | 生物信息学 | 特发性肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、qPCR、Western blotting、siRNA敲低 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 982 | 2026-05-04 |
The BTN3A3-TOMM22 axis preserves mitochondrial homeostasis to facilitate HCC stemness and drug resistance
2026-Apr-30, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218557
PMID:42069175
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研究论文 | 本研究揭示了BTN3A3-TOMM22轴通过维持线粒体稳态促进肝癌干性和耐药性的新机制 | 首次阐明BTN3A3在肝细胞癌中通过非免疫性方式调控线粒体重编程，防止TOMM22泛素化降解以维持线粒体稳态，从而驱动干性和耐药性 | 尚未明确BTN3A3在线粒体转位及与TOMM22相互作用的精细分子机制 | 探究BTN3A3在肝细胞癌干性和耐药性中的作用及其线粒体相关分子机制 | 肝细胞癌细胞、原位异种移植小鼠模型、患者来源类器官 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞转录组测序、批量转录组测序、质谱分析、免疫共沉淀 | NA | 转录组数据 | 批量与单细胞转录组数据来源样本数未明确，体内模型和类器官实验样本量未详述 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 983 | 2026-05-04 |
GRK5 in dorsolateral septal somatostatin neurons mediates chronic stress-induced depression via the AKT-mTORC1 pathway
2026-Apr-28, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2026.110997
PMID:42061809
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现，慢性束缚压力导致小鼠背外侧隔核中生长抑素阳性神经元的GRK5下调，并通过AKT-mTORC1通路介导抑郁样行为 | 首次发现背外侧隔核SST神经元中GRK5的特异性下调是慢性应激诱发抑郁的关键机制，并验证GRK5作为新型抗抑郁靶点的潜力 | 研究仅在动物模型上进行，未在人类样本中验证；未阐明GRK5下调的上游调控机制 | 探究背外侧隔核SST神经元中GRK5在慢性应激诱发抑郁中的作用及其分子机制 | 小鼠的背外侧隔核SST阳性GABA能神经元 | 机器学习 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 984 | 2026-05-04 |
Multi-organ single-cell analysis of preferential expression of CAKUT genes
2026-Apr-27, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-026-05003-y
PMID:42045859
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研究论文 | 通过多器官单细胞分析揭示CAKUT相关基因的优先表达模式 | 首次利用单细胞RNA测序数据系统分析CAKUT相关基因在人类胎儿和成人肾、输尿管及膀胱中的细胞类型特异性表达，并发现共享的基质-间充质基因表达特征 | 基于公共数据集，缺乏独立验证实验；样本仅涉及人胎儿和成人组织，未涵盖所有发育阶段 | 探究先天性肾脏和尿路畸形（CAKUT）相关基因是否在发育过程中共享细胞表达程序 | 人胎儿和成人肾、输尿管及膀胱组织中的单细胞 | 单细胞生物学 | 先天性肾脏和尿路畸形（CAKUT） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 公开数据集中的多个胎儿和成人样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 985 | 2026-05-04 |
Integrative multi-omics analysis identifies stromal-immune crosstalk as a determinant of immunotherapy efficacy and establishes a prognostic signature in gastric cancer
2026-Apr-23, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 通过多组学整合分析揭示胃癌中基质-免疫互作对免疫检查点抑制剂疗效的影响，并建立预后特征 | 首次将基质-免疫细胞间通信（MHC-I和胶原/层粘连蛋白信号）与帕博利珠单抗耐药机制直接关联，并开发了包含VWF/VCAN等基因的预后评分系统（LSR） | 文中未明确提及研究的局限性 | 探究转移性胃癌中帕博利珠单抗疗效的分子驱动因素，并建立预后签名 | 转移性胃癌患者（包括帕博利珠单抗治疗组及多个独立队列） | 数字病理学 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, 多组学分析 | Lasso-Cox回归模型（用于构建预后签名） | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫组化图像 | 包含TIGER数据库中帕博利珠单抗治疗的胃癌队列，以及4个独立验证队列（来自GEO和TCGA数据库） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据来自GEO数据库，空间转录组学用于GC组织分析 |
| 986 | 2026-05-04 |
Endothelial Adgrl2 Expression and Alternative Splicing Controls the Cerebrovasculature
2026-04-22, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0019-26.2026
PMID:41876233
|
研究论文 | 研究内皮细胞Adgrl2表达和可变剪接对脑血管系统发育和功能的影响 | 发现Adgrl2基因在神经元和内皮细胞中通过细胞类型特异性可变剪接产生不同异构体，分别调控神经回路组装和脑血管稳态 | 主要基于小鼠模型，人类脑血管中Adgrl2的类似功能尚需验证 | 探究Adgrl2在内皮细胞中的功能及其可变剪接对脑血管完整性及血脑屏障稳态的调控机制 | 小鼠（雌雄兼用）的脑血管内皮细胞和神经元 | 神经生物学 | 脑积水 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 987 | 2026-05-04 |
Anemoside B4 alleviates pulmonary fibrosis by targeting the Keap1/Nrf2 axis to suppress NLRP3 inflammasome-mediated pyroptosis and epithelial-mesenchymal transition
2026-Apr-20, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158223
PMID:42068876
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研究论文 | 探讨Anemoside B4通过调节Keap1/Nrf2轴抑制NLRP3炎症小体介导的细胞焦亡和上皮-间充质转化从而缓解肺纤维化 | 首次发现Anemoside B4作为预防性而非治疗性药物，通过靶向Keap1激活Nrf2抗氧化反应、抑制NLRP3依赖的细胞焦亡及分泌组驱动的上皮-间充质转化，为肺纤维化的早期干预提供潜在候选药物 | 未提及具体局限性 | 明确Anemoside B4对肺纤维化的保护作用及分子机制 | 博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型（野生型和Nlrp3-/-小鼠） | 数字病理学 | 肺纤维化 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 分子对接, Co-IP, CETSA | NA | 基因表达数据 | 博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型，包括野生型和Nlrp3-/-小鼠 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 988 | 2026-05-04 |
Single-Cell RNA Sequencing of Lung Tissue in a Rat Model of Acute Respiratory Distress Syndrome
2026-04-07, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70491
PMID:42044167
|
研究论文 | 介绍了一种在脂多糖诱导的大鼠急性呼吸窘迫综合征模型中进行肺组织单细胞RNA测序的标准化方案，揭示了21种细胞群体和6种巨噬细胞/单核细胞亚群的转录特征 | 建立了可重复的单细胞RNA测序工作流程，包括优化的组织解离、严格质量控制、双细胞去除和批次效应校正，首次在ARDS大鼠模型中识别了六种巨噬细胞/单核细胞亚群的独特转录特征 | 该研究基于动物模型，其发现可能不完全适用于人类ARDS；同时技术变异可能影响结果的稳定性和可重复性 | 开发并标准化用于ARDS肺组织单细胞RNA测序的分析流程，以深入解析细胞异质性和炎症机制 | 脂多糖诱导的大鼠急性呼吸窘迫综合征模型中的肺组织细胞 | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 大鼠肺组织样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 989 | 2026-05-04 |
A Protocol for Harvesting Single-cell Suspension from Mouse Corneas
2026-04-03, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69844
PMID:42008475
|
研究论文 | 建立从小鼠角膜组织中制备高质量单细胞悬液的稳健方案 | 针对角膜组织致密复杂结构，优化了胶原酶A和胰蛋白酶顺序消化方法，获得高细胞数、高活力（≥94.6%）和高单细胞比例（96.3%）的悬液，满足scRNA-seq等下游应用要求 | NA | 建立从小鼠全角膜制备高质量单细胞悬液的标准化方案 | 小鼠全角膜组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠角膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 990 | 2026-05-04 |
Mapping Infant Immunity with Minimal Input: Integrative Single-cell and Multiomic Profiling
2026-04-03, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70279
PMID:42008512
|
研究论文 | 提出一套优化方案，利用微量新生儿血液进行整合单细胞和多组学免疫分析，揭示早期生命免疫系统的独特轨迹 | 针对新生儿血容量极低的限制，开发了从微量样本中实现高维免疫谱分析的综合方案，整合流式细胞术、蛋白质组学和单细胞RNA测序技术，为早期生命免疫研究提供了新方法 | 主要受限于新生儿血容量低，尤其是极低出生体重或极度早产儿，可安全采集的样本量极为有限 | 探索新生儿早期生命免疫系统的动态变化和独特适应性，通过微量血液样本实现高维度免疫谱分析 | 新生儿的循环免疫细胞，包括极低出生体重和极度早产儿 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习, 数字病理 | NA | 流式细胞术, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 991 | 2026-05-04 |
The Spatially Resolved Kidney Transcriptome Signatures in Rat Models of Trauma-Induced Acute Kidney Injury
2026-Apr-01, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0000001045
PMID:41396698
|
研究论文 | 利用整体和空间转录组学在大鼠模型中定义了出血性休克、横纹肌溶解及其组合对肾脏的早期反应 | 首次在创伤诱导的急性肾损伤大鼠模型中应用商用小鼠空间转录组探针，实现了成本效益高且区域特异性的基因表达谱分析，并揭示了横纹肌溶解作为转录变化主要驱动因素及协同致死反应的分子机制 | 未提及 | 定义出血性休克和横纹肌溶解单独及组合对大鼠肾脏的早期转录反应机制 | 创伤诱导急性肾损伤的大鼠模型 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 空间转录组学、整体转录组学 | NA | 文本、图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学、整体RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq, MGI DNBSEQ | 商用小鼠空间转录组探针应用于大鼠肾组织、整体RNA测序 |
| 992 | 2026-05-04 |
Artificial soil (ArtSoil): Recreating soil conditions in synthetic plant growth media
2026-Apr, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70833
PMID:41911577
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research paper | 开发了一种名为人工土壤（ArtSoil）的合成植物生长培养基，能够模拟土壤条件，支持植物生长并维持土壤微生物组，避免了传统培养基中蔗糖的副作用 | 首次提出一种无需添加糖分的合成培养基，通过添加水性土壤提取物保持土壤微生物组和土壤因素，使植物在类似土壤的条件下生长，更接近自然状态 | 文章未明确说明ArtSoil在不同土壤类型或长期培养中的稳定性，以及其在实际农业应用中的可行性 | 开发一种更接近土壤条件的合成植物生长培养基，以便在实验室中准确研究植物生理和多组学特征 | 拟南芥（Arabidopsis thaliana） | machine learning | NA | NA | NA | single-cell transcriptomics data | 拟南芥样本在不同生长条件下进行比较，未提供具体数量 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 993 | 2026-05-04 |
Molecular Characterization of the Effect of Glucagon-Like Peptide-1 Receptor Agonist Semaglutide in the Nephrotoxic Serum Nephritis Mouse Model
2026-Apr-01, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0000001067
PMID:41945470
|
研究论文 | 探究胰高血糖素样肽-1受体激动剂Semaglutide在肾毒性血清肾炎小鼠模型中的作用机制 | 首次在非肥胖非糖尿病慢性肾病模型中揭示Semaglutide通过抗炎、抗纤维化及改善肾血流动力学独立于代谢效应的肾脏保护作用 | 仅在小鼠模型中进行研究，尚未在人类中验证；未涉及长期治疗效果评估 | 阐明Semaglutide在非肥胖非糖尿病慢性肾病模型中的肾脏保护机制 | 肾毒性血清肾炎小鼠模型 | 机器学习 | 慢性肾病 | 空间转录组测序、单细胞核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠（具体数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞核RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium空间转录组学平台用于肾脏组织切片分析；10x Chromium单细胞核RNA测序用于肾细胞亚群分析 |
| 994 | 2026-05-04 |
Cell type annotation for scATAC-seq via DNA large language model and graph domain adaptation
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014226
PMID:42060707
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研究论文 | 提出scLLMDA框架，利用DNA大语言模型和图域自适应实现scATAC-seq细胞类型注释 | 首次结合DNA特异性语言模型和图神经网络进行域自适应，捕获峰值序列上下文嵌入与细胞邻域结构，解决了跨模态注释的模态不匹配和信号失真问题 | 文章未明确提到局限性，但可能依赖参考数据的质量与相似性，且大规模数据集的计算效率有待验证 | 开发更准确和鲁棒的scATAC-seq细胞类型注释方法 | 单细胞ATAC-seq数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | ATAC-seq | DNA大语言模型、图神经网络 | 序列数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 995 | 2026-05-04 |
Cell confinement initiates a delayed but heritable loss of chromosomes
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117053
PMID:41811846
|
研究论文 | 本研究通过染色体报告系统量化活细胞中在物理压缩后发生的染色体丢失现象，发现细胞压缩会触发延迟但可遗传的染色体丢失 | 首次使用染色体报告系统（ChReporters）在活细胞中定量测量物理压缩导致的染色体丢失，并揭示压缩后延迟出现的染色体错误分离机制 | 研究主要基于体外细胞实验，体内肿瘤微环境中更复杂的力学因素和多细胞相互作用未被充分模拟 | 探究细胞物理压缩如何引发可遗传的染色体丢失及其分子机制 | 活体哺乳动物细胞 | 计算机视觉 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 未明确说明样本数量，涉及多种细胞系和药物处理条件 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 996 | 2026-05-04 |
scComm: a contrastive learning framework for deciphering cell-cell communications at single-cell resolution
2026-Mar-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04043-9
PMID:41877186
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研究论文 | 提出scComm框架，利用监督对比学习在单细胞分辨率下推断细胞间通讯，并在结直肠癌和肝癌研究中揭示新见解 | 首次将监督对比学习应用于单细胞分辨率的细胞间通讯推断，克服传统聚类方法忽视细胞内异质性的局限，并在多种癌症分析中展示优越性能 | 未提及计算资源需求或对大规模数据集的扩展性，也未讨论模型对噪声数据的鲁棒性 | 开发能高分辨率解析细胞间通讯的计算方法，以发现传统方法遗漏的生物学见解 | 单细胞RNA测序数据模拟样本，以及结直肠癌和肝癌患者的真实scRNA-seq数据 | 机器学习 | 结直肠癌, 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 对比学习网络 | 单细胞基因表达数据（模拟和真实数据） | 模拟数据集（具体数量未说明），以及结直肠癌和肝癌患者的scRNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 997 | 2026-05-04 |
High-Fidelity Long-term Whole-embryo Lineage and Fate Reconstruction by Iterative Tracking with Error Correction
2026-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711203
PMID:41889864
|
研究论文 | 提出一种名为ITEC的全自动方法，通过迭代追踪与纠错，高保真度重建胚胎中每个细胞的完整谱系和命运图谱 | 开发了首个全自动无监督的胚胎细胞谱系重建方法ITEC，结合误差校正实现超过99.7%的准确性，并揭示了体节边界形成等关键形态发生过程的时空动态和细胞运动与空间转录组学的关联 | 未明确说明局限性，但基于摘要可能涉及计算资源需求或对极大型数据集的拓展性挑战 | 重建活体胚胎的完整细胞谱系和命运图谱，探索发育生物学中细胞尺度动态过程 | 斑马鱼、小鼠等跨物种胚胎中的细胞谱系 | 计算机视觉 | NA | 迭代追踪与误差校正 | ITEC | 图像 | 四组跨物种数据集（斑马鱼、小鼠等），其中一个斑马鱼胚胎包含1850万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 998 | 2026-05-04 |
UniST: A Unified Computational Framework for 3D Spatial Transcriptomics Reconstruction
2026-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711362
PMID:41889901
|
研究论文 | 提出UniST统一生成式人工智能框架，用于从稀疏序列切片中计算重建致密连续的3D空间转录组学景观 | 将核点卷积与交叉注意力层结合用于点云上采样、基于光流的连续切片插值以及利用隐式神经表示的图自编码器进行基因表达插补，三种互补模块集成实现3D重建 | 仅依赖2D切片数据进行计算重建，无法完全替代实验获取的3D数据；稀疏切片和组织损失仍可能影响重建精度 | 解决3D空间转录组学数据稀疏、异质及组织缺失导致的分析挑战，实现连贯的3D组织结构重建 | 小鼠胚胎和人类癌症组织（包括肿瘤-免疫边界和三级淋巴结构） | 机器学习 | 癌症 | 空间转录组学（ST） | 核点卷积神经网络、图自编码器、隐式神经表示 | 空间转录组学切片图像及基因表达数据 | 多个空间转录组平台和多种组织样本人（具体数量未提及） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 999 | 2026-05-04 |
Single-cell and spatial profiling reveal cDC2A-CXCL13+CD8+ T-epithelial cell crosstalk and cytotoxicity through TNFRSF9 in cutaneous and mucosal lichen planus
2026-Mar-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70506-z
PMID:41832141
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序、空间转录组学和蛋白质组学分析揭示皮肤和黏膜扁平苔藓中cDC2A-CXCL13+CD8+ T细胞与上皮细胞通过TNFRSF9的相互作用和细胞毒性机制 | 首次整合单细胞转录组、空间转录组和蛋白质组学数据，系统揭示了cDC2A细胞在驱动CXCL13+CD8+ T细胞介导的上皮细胞毒性中的关键作用，并发现TNFRSF9通路是潜在治疗靶点 | 样本量有限（28例患者和18例对照），且仅分析了皮肤和黏膜两种亚型，未覆盖其他变体；功能性验证实验未在文中提及 | 解析皮肤和黏膜扁平苔藓的免疫微环境，阐明T细胞与上皮细胞相互作用的分子机制 | 皮肤和黏膜扁平苔藓患者的组织样本 | 数字病理学 | 扁平苔藓 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、蛋白质表达数据 | 28例患者和18例健康对照的组织样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1000 | 2026-05-04 |
Predicting targeted- and immunotherapeutic response outcomes in melanoma with single-cell Raman spectroscopy and AI
2026-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.654612
PMID:41889902
|
研究论文 | 结合单细胞拉曼光谱与机器学习预测黑色素瘤靶向治疗和免疫治疗反应结局 | 首次将单细胞拉曼光谱与机器学习结合，用于非破坏性预测黑色素瘤治疗抵抗性 | 未提及具体限制 | 开发一种非破坏性、单细胞水平的方法，用于快速细胞分型并预测治疗反应 | 小鼠和人类黑色素瘤细胞系及九例黑色素瘤患者衍生样本 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 拉曼光谱、单细胞拉曼光谱 | 随机森林 | 拉曼光谱数据 | 九例黑色素瘤患者样本及多种细胞系 | NA | 单细胞拉曼光谱 | NA | NA |