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当前共找到 41493 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2026-07-02 |
Multi-omics insights into immune tolerance at the maternal-fetal interface in recurrent pregnancy loss: mechanisms, integration challenges, and translational perspectives
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1811970
PMID:42136650
|
综述 | 利用多组学视角解析复发性流产母胎界面免疫耐受机制，整合挑战及转化前景 | 系统整合基因组学、单细胞/空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学等多组学数据，结合计算框架（如WGCNA、MOFA和深度学习模型）分析复发性流产的免疫耐受机制，并提出免疫分层的潜在转化路径 | 现有研究受限于小队列规模（尤其是单细胞数据集）、跨平台异质性、缺乏纵向验证及多中心重复性 | 阐明复发性流产中母胎界面免疫耐受失调的多组学机制，并探索生物标志物发现和免疫分层策略 | 复发性流产（RPL）患者母胎界面细胞群体（蜕膜基质细胞、子宫自然杀伤细胞、巨噬细胞、调节性T细胞、Th17细胞及滋养层细胞系） | 机器学习 | 复发性流产 | 多组学分析（基因组学, 表观基因组学, 单细胞/空间转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 微生物组分析, 免疫组学） | 加权基因共表达网络分析, 多组学因子分析, 深度学习模型 | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 982 | 2026-07-02 |
Region-aware bridge modeling enables interpretable mesoscale representation of spatial transcriptomic tissue sections
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag176
PMID:42381926
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研究论文 | 开发区域感知桥接建模方法，从空间转录组数据中提取可解释的中尺度区域表征 | 提出区域感知桥接建模，将细胞状态指示因子和基因程序评分聚合为紧凑的中尺度总结，实现空间转录组切片间区域化比较 | 未提及明确局限性 | 开发一种方法将空间转录组组织切片的点级数据转化为可解释的中尺度区域表征 | 公共结直肠癌、乳腺癌、肺癌、前列腺癌和卵巢癌10x Genomics Visium空间转录组切片 | 数字病理学 | 结直肠癌, 乳腺癌, 肺癌, 前列腺癌, 卵巢癌 | 空间转录组学 | 岭回归模型 | 空间基因表达数据 | 5种癌症类型（结直肠癌、乳腺癌、肺癌、前列腺癌、卵巢癌）的公共Visium切片 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics高清晰度Visium切片 |
| 983 | 2026-07-02 |
Adenosine metabolism as an endogenous protective mechanism in response to upstream ischemic injury
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1807841
PMID:42382016
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 984 | 2026-07-02 |
Neoadjuvant therapy-associated malignant phenotype score predicts prognosis and highlights the roles of MIF signaling and DUXAP8 in ESCC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1683349
PMID:41613113
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据，建立新辅助治疗相关的恶性表型评分，预测食管鳞癌预后并揭示MIF信号通路和DUXAP8的作用 | 首次构建基于恶性上皮细胞转录重塑的新辅助治疗相关恶性表型评分，并整合单细胞和批量转录组数据，识别了MIF信号通路和长链非编码RNA DUXAP8作为潜在治疗靶点 | 未提及明确的局限性，但可能包括样本量有限、缺乏独立外部验证队列以及功能验证仅针对单一基因DUXAP8 | 开发基于恶性细胞内在分子特征的预后评分，并探索与新辅助治疗反应相关的分子机制，以改善食管鳞癌患者的预后分层和个体化治疗决策 | 食管鳞癌患者在术前行新辅助治疗前后的恶性上皮细胞 | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、LASSO-Cox回归、免疫组织化学、qRT-PCR | LASSO-Cox回归模型 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 单细胞RNA测序数据（ESCC患者治疗前后）、TCGA和GEO队列的批量RNA-seq数据，以及TCGA-ESCA和GSE53624队列用于验证 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 985 | 2026-07-02 |
TIMP1 as a context-dependent biomarker linking cancer progression and cardiovascular disorders: a multi-level and bioinformatics study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1699962
PMID:41613136
|
研究论文 | 通过多层级生物信息学分析，揭示TIMP1作为连接癌症进展与心血管疾病的上下文依赖性生物标志物的作用 | 首次系统性地跨疾病分析TIMP1在多种癌症与心血管疾病中的表达模式、调控机制及功能差异，发现其作为连接肿瘤生物学与心血管疾病的潜在中介分子 | 主要基于公开数据库的生物信息学分析，细胞系实验仅用于靶向验证，缺乏体内动物模型和临床试验验证 | 探究TIMP1在癌症与心血管疾病中的系统性表达模式及其作为跨疾病生物标志物的潜力 | 结直肠癌、胃癌、动脉粥样硬化、心力衰竭等疾病的组织样本及细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌, 胃癌, 动脉粥样硬化, 心力衰竭 | 微阵列分析, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学, Western blotting, Transwell实验 | NA | 转录组数据, 单细胞数据, 基因表达数据, 临床数据 | 公共数据库多队列数据，包括TCGA/GTEx及GEO数据集（如GSE63032, GSE100927, GSE5406），具体样本量未明确 | Illumina | 微阵列, 单细胞RNA-seq | Illumina微阵列, 单细胞测序平台（未具体说明） | 基于公开数据集的分析，平台细节未完全提供 |
| 986 | 2026-07-02 |
Integrating single-cell RNA sequencing with spatial transcriptomics reveal the fibrosis-related genes in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1659404
PMID:41613122
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学揭示肝细胞癌中纤维化相关基因 | 首次通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和bulk RNA-seq多组学数据，系统鉴定肝细胞癌肿瘤微环境中纤维化相关的预后基因，并通过细胞实验验证YIPF4基因促进肝癌细胞增殖和迁移的功能 | NA | 鉴定肝细胞癌肿瘤微环境中与纤维化相关的预后基因，为临床治疗决策提供依据 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织样本及单细胞、空间转录组数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、bulk RNA测序、随机生存森林算法、EDU掺入实验、Transwell迁移实验、CCK-8增殖实验 | 随机生存森林 | 基因表达数据、空间转录组数据 | GSE149614和GSE245908数据集中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 987 | 2026-07-02 |
Multimodal analysis of TAAD pathogenesis: SHAP-enhanced interpretable models and single-cell sequencing analysis reveal immune microenvironment alterations
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1630404
PMID:41613150
|
研究论文 | 通过整合多组学转录组数据和单细胞测序数据，结合SHAP可解释性机器学习模型，揭示了Stanford A型主动脉夹层（TAAD）的免疫微环境改变和发病机制 | 首次利用SHAP增强的可解释机器学习模型结合单细胞测序技术，系统鉴定出SIX4、SCNN1B和PCDH11X三个关键调控基因，并明确SIX4在血管平滑肌细胞表型转换和免疫信号调控中的核心作用 | 未明确说明，但可能包括样本量有限、功能验证仅在体外进行、缺乏体内实验验证等 | 阐明Stanford A型主动脉夹层的分子机制并识别可靠的生物标志物 | Stanford A型主动脉夹层患者样本及健康对照 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO, 随机森林, SVM-RFE | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 整合了4个转录组数据集和2个单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 988 | 2026-07-02 |
Decoding cellular stress states for toxicology using single-cell transcriptomics
2025, NAM journal
DOI:10.1016/j.namjnl.2025.100046
PMID:42369397
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学技术分析化学物质诱导的细胞应激状态，揭示毒性反应中的动态细胞转变 | 首次将单细胞转录组技术应用于环境毒理学领域，系统解析了多种应激反应通路在单细胞水平的异质性响应模式，并发现细胞在稳态、适应性反应和终末状态间动态转变的证据 | 仅使用HepaRG细胞系，未涉及原代细胞或体内模型；仅检测24小时单一时间点，无法捕捉长期或动态响应；化学物质浓度范围有限，可能遗漏低剂量效应 | 评估单细胞转录组学在毒理学中解码细胞应激状态的能力，揭示化学物质诱导的细胞适应性与终末状态转变机制 | HepaRG细胞系暴露于依托泊苷、布雷菲德菌素A、放线菌酮、鱼藤酮、tBHQ、曲格列酮和衣霉素 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达矩阵 | 约40,000个HepaRG细胞，暴露于7种化学物质，每种化学物质3个浓度梯度 | BioSpyder | 单细胞RNA-seq | TempO-LINC® | TempO-LINC®单细胞转录组平台 |
| 989 | 2026-07-01 |
Blood Transcriptome Analysis Reveals CTSB and ATP6V0D1 Expression in Circulating Monocytes as Potential Biomarkers of Sepsis
2026-Jul-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002693
PMID:40961380
|
研究论文 | 通过全血转录组分析发现循环单核细胞中CTSB和ATP6V0D1的表达可作为脓毒症的潜在生物标志物 | 首次在循环单核细胞中发现CTSB和ATP6V0D1作为脓毒症的潜在生物标志物，并通过外部验证队列证实其与28天死亡率显著相关 | 样本量较小（20例脓毒症患者和12例健康个体），可能限制结果的普适性和统计效力 | 识别外周血单核细胞中的转录组变化作为脓毒症的潜在生物标志物 | 脓毒症患者和健康个体 | 机器学习 | 脓毒症 | 批量RNA测序，单细胞RNA测序，免疫细胞荧光测定 | 加权基因共表达网络分析，蛋白质-蛋白质相互作用分析 | 转录组数据 | 20例脓毒症患者和12例健康个体（内部队列）；479例（外部验证队列） | NA | 批量RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 990 | 2026-07-01 |
scRNA-seq and scATAC-seq reveal dual transcriptional and translational regulation of fiber cells in Upland and Pima cotton
2026-Jun-02, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag094
PMID:41746838
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序揭示陆地棉和海岛棉纤维细胞的双重转录和翻译调控 | 首次结合scRNA-seq和scATAC-seq技术解析棉花纤维细胞发育中转录和翻译调控的双重机制，并鉴定出两个不同的纤维基因共表达网络模块 | 未在正文中明确说明局限性 | 探究棉花纤维细胞发育的分子机制，揭示影响纤维产量和品质的关键调控途径 | 陆地棉、海岛棉以及裸籽突变体的纤维细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 超过40,000个细胞（来自陆地棉、海岛棉和裸籽突变体的早期纤维细胞） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 和单细胞ATAC测序方案 |
| 991 | 2026-07-01 |
A single-cell atlas of the human airways from patients with allergic rhinitis comorbid with asthma
2026-06, Annals of allergy, asthma & immunology : official publication of the American College of Allergy, Asthma, & Immunology
DOI:10.1016/j.anai.2026.03.013
PMID:41887463
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序构建过敏性鼻炎合并哮喘患者气道上皮的单细胞图谱，揭示上下气道细胞组成和转录变化的相似性及免疫屏障损伤机制 | 首次对过敏性鼻炎合并哮喘患者不同微解剖区域（鼻腔和支气管）的刷取细胞进行单细胞RNA测序，发现上下气道在慢性炎症下共享大量差异表达基因，并揭示GZMA-PARD3通路破坏气道上皮屏障的新机制 | 未提及具体研究限制 | 探究过敏性鼻炎合并哮喘患者上下气道沿线的细胞群体分布和转录变化 | 过敏性鼻炎合并哮喘患者及健康志愿者的鼻腔和支气管刷取细胞 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 过敏性鼻炎合并哮喘患者和健康志愿者的鼻腔及支气管刷取细胞，具体样本量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 992 | 2026-07-01 |
Cellular profiling identifies an early profibrotic alveolar type 2 cell signature in lung fibrosis
2026-06-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1093/ajrccm/aamag044
PMID:41738207
|
research paper | 研究揭示了端粒功能障碍通过p53信号通路驱动肺泡2型细胞转分化和衰老，导致肺纤维化的机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出肺纤维化早期促纤维化肺泡2型细胞特征，并发现p53信号促进AT2细胞转分化 | 研究基于小鼠模型，其与人类IPF的直接相关性需进一步验证 | 探讨AT2细胞端粒功能障碍（TRF1缺失）驱动肺重构的分子机制及其在IPF中的意义 | SPC-creTRF1flox/flox小鼠及IPF患者肺泡2型细胞 | machine learning | lung cancer | single-cell RNA sequencing | NA | gene expression data | SPC-creTRF1flox/flox小鼠和IPF患者肺组织样本 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 993 | 2026-07-01 |
Liquiritigenin targets transferrin receptor to potentiate ferroptosis sensitivity in colorectal cancer cells
2026-May, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158057
PMID:41833103
|
研究论文 | 通过高通量筛选发现甘草中的活性成分甘草苷元（LIQ）能够通过靶向转铁蛋白受体（TFRC）增强结直肠癌细胞的铁死亡敏感性 | 首次揭示甘草苷元作为铁死亡增敏剂的作用，并阐明其通过抑制β-TrCP介导的泛素化降解来稳定TFRC蛋白，从而促进铁积累和脂质过氧化 | 未提及明显的局限性，但结果基于体外和体内模型，临床转化尚需进一步验证 | 系统鉴定能够增敏结直肠癌细胞铁死亡的自然化合物并阐明其分子机制 | 结直肠癌细胞（包括体外细胞模型、皮下异种移植瘤模型和人器官oid模型） | 机器学习 | 结直肠癌 | 高通量筛选、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 图像（如C11-BODIPY荧光成像）、文本（分析结果） | 包含高质量天然化合物库的筛选（未指定具体数量） | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 使用了公开的单细胞RNA测序数据（未指定平台） |
| 994 | 2026-07-01 |
Genetic and chemical correction of cystic fibrosis reduces airway susceptibility to SARS-CoV-2
2026-04-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00223.2025
PMID:41556834
|
研究论文 | 研究囊性纤维化患者的基因和化学校正如何降低气道对SARS-CoV-2的易感性 | 首次利用同基因诱导多能干细胞衍生气道模型，揭示CFTR调节剂ETI不仅在CF气道中，也能在非CF气道中降低SARS-CoV-2感染和炎症的广泛保护作用 | NA | 探究CFTR调节剂ETI如何减轻SARS-CoV-2感染和气道损伤及其潜在机制 | 诱导多能干细胞衍生的气道上皮模型、同基因CFTR校正细胞、原代气道上皮 | 数字病理学 | 囊性纤维化、COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多组iPSC衍生气道模型及原代上皮样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 995 | 2026-07-01 |
Liver sinusoidal endothelial cells and laminin dictate cholangiocytes' fate in chronic liver disease
2026-Mar-27, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2026.03.022
PMID:41905508
|
研究论文 | 本研究揭示肝窦内皮细胞和层粘连蛋白在慢性肝病中决定胆管细胞命运的机制 | 首次发现并定义了两种胆管反应细胞群体（层粘连蛋白阳性和阴性），揭示了毛细管化CD34+肝窦内皮细胞通过维持层粘连蛋白沉积来限制胆管细胞向肝细胞分化的新机制 | 胆管反应来源的肝细胞对整体实质再生的贡献有限，且研究主要基于小鼠模型，人类验证仅限于组织样本分析 | 探究慢性肝病中局部微环境（特别是细胞外基质和邻近细胞）如何影响胆管反应细胞的命运决定 | 慢性肝病小鼠模型和人类肝脏组织样本 | 数字病理学 | 慢性肝病 | NA | NA | 图像、转录组数据 | 小鼠模型（四氯化碳注射6周）及公开单细胞RNA测序数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, Resolve分子制图 | 使用Resolve分子制图进行空间转录组学分析，并分析公开的10x单细胞RNA测序数据 |
| 996 | 2026-07-01 |
SPP1high fibrogenic macrophages mediate protective fibrotic remodeling and promote vascular stability in hypertension-associated aortic dissection
2026-03-16, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04798-9
PMID:41840626
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序等技术，发现SPP1高表达的促纤维化巨噬细胞在高血压相关主动脉夹层中介导保护性纤维化重塑并促进血管稳定性 | 首次鉴定出SPP1高表达促纤维化巨噬细胞群体，并阐明TGF-β1-SPP1轴驱动其产生，从而支持主动脉结构稳定，为急性主动脉综合征提供新的治疗策略 | 未明确说明局限性，但可能涉及样本量较小（每组3例）、动物模型与人类的差异以及干预措施在临床转化的潜在挑战 | 探讨高血压相关主动脉夹层中巨噬细胞状态与血管完整性的关系，并确定其机制和潜在治疗价值 | 高血压相关主动脉夹层患者、马凡综合征相关主动脉夹层患者及健康供体的主动脉组织、外周血及撕裂邻近样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、ELISA、TGF-β1条件培养、过继转移实验 | NA | 基因表达数据、血液样本 | 每个测序组3例主动脉样本；每个疾病组30例外周血样本；10例获取配对术中撕裂邻近样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 997 | 2026-07-01 |
Myeloid-derived immunosuppression of chimeric antigen receptor T cells in the neuronal microenvironment of glioblastoma
2026-03-13, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04783-2
PMID:41827001
|
研究论文 | 利用人新皮层脑片模型研究胶质母细胞瘤神经微环境中嵌合抗原受体T细胞的髓源性免疫抑制 | 创新性地使用保留复杂GB微环境的人新皮层脑片模型，结合PIC-seq、空间转录组学和基因调控网络重建来解析NKG2D CAR-T细胞与肿瘤生态系统的相互作用 | 研究未提及具体局限性 | 解析胶质母细胞瘤中CAR-T细胞快速功能失调相关的微环境和转录组变化，识别潜在的调控因子以设计更持久的细胞疗法 | 胶质母细胞瘤微环境中的NKG2D CAR-T细胞和髓系细胞群 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq | NA | 转录组数据、图像 | 采用脑片模型及单细胞数据，具体样本量未报告 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | PIC-seq结合空间转录组学分析 |
| 998 | 2026-07-01 |
Downregulated lysyl oxidase in plasma extracellular vesicles: a biomarker linked to brain metastasis risk in lung adenocarcinoma
2026-03-12, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04785-0
PMID:41814259
|
研究论文 | 一项通过多组学框架发现血浆细胞外囊泡中赖氨酰氧化酶下调可作为肺腺癌脑转移风险生物标志物的研究 | 首次通过多组学策略包括蛋白质组学、单细胞转录组学、体外实验和独立队列验证，确立血浆细胞外囊泡来源的LOX作为肺腺癌脑转移的非侵入性生物标志物，并提出了PI3K/AKT-LOX-ECM调控轴驱动脑转移的模型 | 样本量相对较小且为回顾性研究，需要更大规模前瞻性队列进行验证，LOX作为生物标志物的特异性尚需进一步探索 | 鉴定与肺腺癌脑转移相关的血浆细胞外囊泡来源蛋白质生物标志物 | IV期肺腺癌患者血浆细胞外囊泡、脑转移相关成纤维细胞 | 机器学习 | 肺腺癌 | 蛋白质组学,单细胞转录组学 | LASSO,随机森林,支持向量机 | 蛋白质组学数据,单细胞转录组数据 | 59例IV期肺腺癌患者（30例脑转移vs 29例非脑转移）用于发现，13例用于组织蛋白质组学验证，158例用于血浆独立队列ELISA验证 | NA | NA | NA | NA |
| 999 | 2026-07-01 |
Identification of cryosensitive niches and a targetable FOS/AP‑1 program in the human ovarian cortex by single‑cell and spatial transcriptomics
2026-03-03, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04757-4
PMID:41776587
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学鉴定人类卵巢皮质中的冷冻敏感生态位和可靶向的FOS/AP-1程序 | 首次在单细胞和空间水平上系统鉴定了卵巢冻存过程中易损的细胞类型（间质细胞和血管周细胞），并发现冷冻激活的FOS/AP-1通路可作为潜在治疗靶点 | 样本量有限（仅3例患者的卵巢组织），且未进行体内功能验证 | 阐明卵巢冻存损伤的细胞分子机制，寻找可干预的靶点 | 人类卵巢皮质组织，包括间质细胞、血管周细胞、颗粒细胞和卵母细胞 | 单细胞转录组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、Smart-seq2 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 27,185个新鲜细胞和25,480个冻融细胞；110个卵母细胞（66个新鲜，44个冻融） | 10x Genomics, 华大基因 | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 10x Chromium, BGI Stereo-seq | 10x Genomics单细胞RNA-seq用于解离的卵巢细胞悬液；BGI Stereo-seq用于空间转录组学 |
| 1000 | 2026-07-01 |
JADE: Joint Alignment and Deep Embedding for Multi-Slice Spatial Transcriptomics
2026-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.21.689823
PMID:41394739
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研究论文 | 提出JADE框架，用于多切片空间转录组数据的联合对齐与深度嵌入分析 | 首次在共享隐空间中联合优化对齐与表示学习，利用注意力机制动态评估嵌入维度重要性 | 未明确提及局限性 | 实现多切片空间转录组数据的鲁棒整合，同时解决空间对应与共享转录特征提取问题 | 多切片空间转录组数据（10x Visium人脑DLPFC切片和Stereo-seq蝾螈脑切片） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 注意力机制 | 空间转录组数据 | 10x Visium人脑DLPFC切片和Stereo-seq蝾螈脑切片数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, Stereo-seq | NA |