单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 40024 篇文献,本页显示第 981 - 1000 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
981 2025-11-03
Macrophages in the infarcted heart acquire a fibrogenic phenotype, expressing matricellular proteins, but do not undergo fibroblast conversion
2024-11, Journal of molecular and cellular cardiology IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过谱系追踪和单细胞转录组学方法,揭示心肌梗死中巨噬细胞不会转化为成纤维细胞,但会表达促纤维化的基质细胞蛋白 首次结合谱系追踪和单细胞RNA测序技术,明确证明心肌梗死中的巨噬细胞不会转分化为成纤维细胞,同时发现其表达多种促纤维化基质蛋白的新功能 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 探究心肌梗死中巨噬细胞是否会发生成纤维细胞转化及其在细胞外基质表达中的作用 心肌梗死小鼠模型中的巨噬细胞和成纤维细胞 单细胞生物学 心血管疾病 谱系追踪,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 对照组和心肌梗死组小鼠的CSF1R+髓系细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
982 2026-05-24
Cellular transitions during cranial suture establishment in zebrafish
2024-08-13, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用斑马鱼单细胞转录组学、谱系追踪和突变分析,揭示颅缝形成过程中调控骨形成的关键细胞转变 首次鉴定出颅缝中部间充质细胞亚群通过表达BMP拮抗剂(如grem1a)限制骨形成,从而确保颅缝正常形态的机制 未提及 探究颅缝在颅骨扩张过程中如何控制成骨活性以促进骨生长并防止异常骨融合 斑马鱼胚胎颅缝组织 单细胞转录组学 颅缝相关疾病 单细胞转录组测序、谱系追踪、突变分析 NA 单细胞转录组数据 斑马鱼胚胎样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
983 2026-05-24
Single-cell long-read targeted sequencing reveals transcriptional variation in ovarian cancer
2024-08-12, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 开发单细胞靶向长读长测序方法scTaILoR-seq,揭示卵巢癌转录变异 提出scTaILoR-seq技术,通过杂交捕获靶向一千多个基因,将每个细胞的中位数靶向转录本数提高29倍,结合长读长变异检测揭示表达SNV与可变转录结构的关联,并测量等位基因失衡 长读长测序通量较低且可能意外测序伪影,该方法可能仍受限于靶向基因的选择和捕获效率 开发并验证一种单细胞长读长靶向测序方法,用于研究RNA异构体及转录变异 卵巢癌细胞系和原发肿瘤样本 单细胞测序 卵巢癌 长读长测序、靶向杂交捕获 NA RNA序列 10,796个单细胞转录组(来自卵巢癌细胞系和原发肿瘤) NA 单细胞RNA测序 NA NA
984 2026-05-24
Patient-derived organoid biobank identifies epigenetic dysregulation of intestinal epithelial MHC-I as a novel mechanism in severe Crohn's Disease
2024-08-08, Gut IF:23.0Q1
研究论文 通过患者来源的类器官生物库,发现肠上皮MHC-I的表观遗传失调是严重克罗恩病的新机制 首次发现肠上皮MHC-I的表观遗传失调(DNA甲基化缺失)是克罗恩病发病的新型机制,并通过类器官-淋巴细胞共培养和基因敲除小鼠模型验证了功能影响 未明确提及 研究肠上皮DNA甲基化在克罗恩病发病机制中的作用 来自168名患者(72名CD、23名UC、73名健康对照)的312个肠上皮类器官 机器学习 克罗恩病 DNA甲基化测序, 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因编辑 机器学习模型 DNA甲基化数据, RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 168名患者的312个肠上皮类器官 NA 单细胞RNA-seq NA NA
985 2026-05-24
Human enteric nervous system progenitor transplantation improves functional responses in Hirschsprung disease patient-derived tissue
2024-08-08, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究展示了人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞移植能够改善先天性巨结肠患者组织中的功能反应 首次证实人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞能够再定植并增加先天性巨结肠患者结肠组织的功能反应 NA 评估人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞移植对先天性巨结肠患者结肠组织的整合和功能影响 先天性巨结肠患者结肠组织样本,以及人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞 数字病理学 先天性巨结肠 单细胞RNA测序,蛋白质表达分析,钙成像,器官浴收缩性测试 NA 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,钙成像数据 先天性巨结肠患者结肠组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序用于分析细胞转录组特征
986 2026-05-24
Comprehensive single-cell analysis deciphered microenvironmental dynamics and immune regulator olfactomedin 4 in pathogenesis of gallbladder cancer
2024-08-08, Gut IF:23.0Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析,揭示胆囊癌发病过程中微环境动态变化及免疫调控因子OLFM4的作用 首次构建胆囊疾病多病理状态单细胞图谱,发现OLFM4通过MAPK-AP1轴上调PD-L1促进免疫逃逸,提出其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 部分发现需进一步在更大样本及临床队列中验证,体外和体内机制研究需补充更多分子细节 阐明胆囊癌及良性胆囊疾病的细胞生态系统和分子特征,为癌症预防和治疗提供新靶点 胆囊癌、胆囊炎、胆囊息肉、胆囊腺瘤及癌旁正常组织的细胞 机器学习 胆囊癌 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 230,737个细胞,来自15例胆囊癌、4例胆囊炎、3例胆囊息肉、5例胆囊腺瘤和16例癌旁正常组织 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
987 2026-05-24
Transcriptomic changes associated with oral immunotherapy for food allergy
2024-03, Pediatric allergy and immunology : official publication of the European Society of Pediatric Allergy and Immunology IF:4.3Q1
综述 总结口服免疫治疗对食物过敏转录组变化的研究进展 利用单细胞测序等新技术深入描述口服免疫治疗后的基因表达变化及其与脱敏和缓解等临床结局相关的分子特征,并鉴定了与疾病活动相关且受治疗影响的T辅助2A细胞类型 目前研究仍存在显著空白,需要更多关注长期和明确临床结局的免疫特征的研究,以全面理解过敏缓解的路径 研究口服免疫治疗对食物过敏转录组变化的影响及其与临床结局的关系 食物过敏患者接受口服免疫治疗后的转录组变化及免疫机制 机器学习 食物过敏 单细胞测序,转录组测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
988 2026-05-24
Single-cell analyses of metastatic bone marrow in human neuroblastoma reveals microenvironmental remodeling and metastatic signature
2024-02-15, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析人神经母细胞瘤转移性骨髓,揭示微环境重塑和转移特征 首次通过单细胞水平比较分析有和无转移患者的骨髓微环境,揭示免疫细胞群体重塑、基因表达重编程及预后标志物 未提及具体限制 阐明神经母细胞瘤骨髓转移的细胞和分子机制,为开发新疗法提供依据 神经母细胞瘤患者的转移性骨髓样本 机器学习 神经母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个患者样本,包括有和无转移的神经母细胞瘤患者 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
989 2026-05-24
Immunological characterization and comparison of children with COVID-19 from their adult counterparts at single-cell resolution
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序比较儿童与成人COVID-19患者的免疫特征 首次在单细胞分辨率下系统比较儿童和成人COVID-19患者的免疫细胞差异,揭示儿童更强的NK细胞毒性和较少的炎症反应 初步研究,样本量较小(15名儿童和18名成人) 阐明儿童COVID-19患者免于重症的免疫保护机制 COVID-19儿童和成人患者的外周血免疫细胞 单细胞组学 COVID-19 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 15名儿童(8名患者)和18名成人(13名患者) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
990 2026-05-24
Altered immune cell in human severe acute pancreatitis revealed by single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示重症急性胰腺炎患者中免疫细胞的变化 首次构建了重症急性胰腺炎患者外周血单核细胞的单细胞转录组图谱,并发现了一种高表达PPBP和PF4的新型单核细胞亚群 样本量较小,仅7名未经治疗的重症急性胰腺炎患者,且健康对照数据来自公共数据库 了解重症急性胰腺炎中特定免疫细胞亚型的变化及其作用机制,并识别预测急性胰腺炎严重程度的潜在生物标志物 重症急性胰腺炎患者的外周血单核细胞 单细胞转录组学 重症急性胰腺炎 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 7名未治疗的重症急性胰腺炎患者,6名健康对照(来自GEO数据库) NA 单细胞RNA-seq NA NA
991 2026-05-24
Endothelial cells are a key target of IFN-g during response to combined PD-1/CTLA-4 ICB treatment in a mouse model of bladder cancer
2023-Oct-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序技术,在膀胱癌小鼠模型中探究联合PD-1/CTLA-4免疫检查点阻断治疗后不同细胞类型的应答机制,发现内皮细胞是IFN-γ信号的关键靶点 首次通过单细胞分辨率揭示内皮细胞中IFN-γ信号在联合ICB治疗中的关键作用,并利用基因敲除实验验证其功能 仅在小鼠模型中进行验证,缺乏人类样本数据,且未深入探究内皮细胞IFN-γ信号下游的具体分子机制 探索联合PD-1/CTLA-4 ICB治疗在不同细胞类型中的应答机制 膀胱癌小鼠模型中的肿瘤细胞、内皮细胞及CD4 T细胞 单细胞转录组学 膀胱癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞基因表达数据 三种条件下的肿瘤组织样本:未治疗、治疗后、CD4 T细胞清除后治疗 NA 单细胞RNA测序 NA NA
992 2026-05-24
Cloning a profibrotic stem cell variant in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-04-26, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 通过单细胞克隆技术从特发性肺纤维化患者远端肺中鉴定出一种促纤维化干细胞变体,该变体能够转化正常肺成纤维细胞并激活肌成纤维细胞,其基因表达网络与器官纤维化相关 首次通过单细胞克隆技术鉴定出特发性肺纤维化中一种促纤维化干细胞变体,该变体在正常和胎儿肺中低量存在,但具有转化正常成纤维细胞为致病性肌成纤维细胞的能力,并筛选出表皮生长因子和雷帕霉素靶蛋白信号通路抑制剂作为潜在治疗靶点 未明确说明研究的局限性,但可能包括样本量有限、体外实验与体内微环境的差异、以及干细胞变体在疾病中的确切致病机制仍需进一步验证 揭示特发性肺纤维化中肺基底干细胞异质性的致病机制,鉴定促纤维化干细胞变体及其治疗靶点 16例特发性肺纤维化患者和10例对照者的远端肺基底干细胞 机器学习和数字病理学 特发性肺纤维化,慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序,单细胞克隆技术 NA 基因表达数据 16例特发性肺纤维化患者和10例对照者的远端肺样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'试剂盒
993 2026-05-24
Reconstruction of Single-Cell Trajectories Using Stochastic Tree Search
2023-01-26, Genes IF:2.8Q2
研究论文 提出一种用于单细胞轨迹重建的随机树搜索算法 引入惩罚似然框架和随机树搜索算法,旨在解决大且非凸树空间中的全局最优问题,相比现有方法提高了细胞排序和伪时间估计的准确性和鲁棒性 未明确提及局限性 开发更准确且鲁棒的单细胞轨迹推断方法 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 随机树搜索 基因表达数据 模拟数据和真实数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
994 2026-05-24
Transcriptome-wide association analysis identifies DACH1 as a kidney disease risk gene that contributes to fibrosis
2021-05-17, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 通过转录组全关联分析鉴定DACH1为肾脏疾病风险基因,该基因促进纤维化 整合GWAS、TWAS、单细胞表观基因组、表达分析、基因编辑及小鼠模型功能验证,首次鉴定DACH1为肾脏疾病风险基因并阐明其在纤维化中的机制 主要基于小鼠模型和体外实验,人类验证有限;未能完全阐明DACH1在所有肾细胞类型中的具体作用 鉴定肾脏功能相关GWAS位点中调控基因表达的因果基因及其在疾病中的机制 人类和小鼠肾脏组织样本、肾小管细胞、巨噬细胞 自然语言处理 肾脏疾病 GWAS, TWAS, 孟德尔随机化, MetaXcan, CRISPR-Cas9, 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 染色质免疫沉淀 NA 基因表达数据, 单细胞表观基因组数据, 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及人类GWAS数据、小鼠模型(叶酸和糖尿病肾损伤模型) NA 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
995 2026-05-24
A single-cell atlas of the healthy breast tissues reveals clinically relevant clusters of breast epithelial cells
2021-03-16, Cell reports. Medicine
研究论文 通过对健康女性乳腺活检组织进行单细胞RNA测序,创建了健康乳腺组织细胞图谱,并发现了23个乳腺上皮细胞簇,揭示了这些细胞簇与乳腺癌亚型的临床相关性 首次利用健康女性乳腺活检样本(而非传统上组织学异常的乳房缩小术样本)进行单细胞RNA测序,并鉴定了23个乳腺上皮细胞簇;揭示了成熟管腔细胞簇和管腔祖细胞簇基因特征在乳腺癌中的不同富集模式及其预后意义 未明确提及,但可推测可能包括样本量有限、单细胞测序技术本身的局限性、以及细胞簇标记基因的验证不足等 利用单细胞RNA测序技术构建健康乳腺组织的细胞图谱,探究乳腺上皮细胞簇与乳腺癌亚型及预后的关联 健康女性的乳腺活检组织样本以及约3000例乳腺癌转录组数据 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 健康乳腺活检样本(未明确数量)及约3000例乳腺癌样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
996 2026-05-24
Beta-Poisson model for single-cell RNA-seq data analyses
2016-07-15, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出一种用于单细胞RNA-seq数据的Beta-Poisson混合模型,能够捕捉基因表达的双峰分布特性,并集成到广义线性模型中用于差异表达分析 首次引入Beta-Poisson模型来处理单细胞RNA-seq数据中常见的双峰表达分布,优于传统的gamma-Poisson模型和现有单细胞专用方法 未明确提及局限性,但模型对∼90%的转录本拟合良好,仍有10%的转录本可能不适合该模型 开发一种新的统计模型来更好地分析单细胞RNA-seq数据的基因表达分布和差异表达 来自多个真实单细胞RNA-seq数据集的基因表达数据 机器学习 NA 单细胞RNA-seq Beta-Poisson混合模型 基因表达数据 多个真实单细胞RNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
997 2026-05-23
SIRT1-NCOR2 Corepressor Modulates Trophoblast-Macrophage Interactions in Preeclampsia
2026-Jun, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
研究论文 研究SIRT1-NCOR2共抑制复合物在子痫前期中调节滋养层-巨噬细胞相互作用的机制 首次揭示SIRT1通过招募NCOR2调控RARRES2表达,影响滋养层与巨噬细胞相互作用,并验证孕酮补充可逆转子痫前期样症状 未标注具体局限性,但可能涉及小鼠模型的物种差异及临床样本量限制 探究子痫前期中低SIRT1水平如何上调RARRES2表达,影响巨噬细胞极化和疾病发病机制 系统性Sirt1杂合敲除小鼠、滋养层特异性Sirt1敲除(cKO)小鼠、子痫前期患者血浆 数字病理学 妊娠期高血压疾病(子痫前期) 单细胞测序、共培养实验、荧光素酶报告基因、染色质免疫沉淀、质谱分析、免疫沉淀 NA 测序数据、细胞实验数据、动物模型数据、临床样本数据 包含小鼠模型(具体数量未提及)及子痫前期患者血浆样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
998 2026-05-23
Endothelial prolyl hydroxylase 3 mitigates maladaptive inflammation to promote post-ischemic kidney repair
2026-Jun, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 研究内皮细胞脯氨酰羟化酶3在急性肾损伤后修复中的作用机制 首次揭示内皮PHD3作为关键氧感受器,通过抑制干扰素-γ驱动的内皮激活来保护肾脏免受适应不良性炎症,促进组织修复并限制AKI向CKD的转变 主要基于小鼠模型和人类样本的单细胞分析,具体机制在人体内的验证尚需进一步研究 探究内皮氧感受(特别是PHD3)在急性肾损伤后肾脏修复中的作用 小鼠(条件性基因敲除品系)和人类肾脏样本 机器学习 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、体外实验数据 两种独立人类数据集及小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
999 2026-05-23
The splenic norepinephrine-β2-adrenergic receptor axis aggravates sepsis-associated acute kidney injury via neutrophil-mediated immunosuppression
2026-Jun, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 该文章揭示了脾脏去甲肾上腺素-β2肾上腺素能受体轴通过中性粒细胞介导的免疫抑制加重脓毒症相关急性肾损伤的机制 首次阐明脾脏NE/β2-AR信号在SA-AKI中通过调节中性粒细胞前列腺素E2合成及T辅助细胞1抑制的免疫抑制机制 未提及具体限制 阐明脾脏神经免疫调控在脓毒症相关急性肾损伤中的作用机制 脾脏去甲肾上腺素-β2肾上腺素能受体轴及中性粒细胞 数字病理学 脓毒症相关急性肾损伤 单细胞测序, 条件基因敲除 NA RNA测序数据 小鼠模型(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
1000 2026-05-23
Autocrine SFRP2 (secreted frizzled related protein 2) enhances lung myofibroblast fibrogenic activity by suppressing PINK1-mediated mitophagy initiation
2026-Jun, Autophagy IF:14.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现SFRP2在IPF肺肌成纤维细胞中高表达,并揭示其通过抑制PINK1介导的线粒体自噬启动来增强肺肌成纤维细胞的纤维化活性 首次定义了一个新型的自分泌SFRP2-线粒体自噬调控轴,该轴持续激活肌成纤维细胞,并作为肺纤维化的潜在治疗靶点 目前文章未明确提及局限性,但可能包括模型仅限于小鼠、未在人体样本中验证治疗干预等 探究特发性肺纤维化中肌成纤维细胞持续激活的调控机制 IPF患者肺组织、小鼠肺纤维化模型、原代小鼠肺成纤维细胞 数字病理学 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序、腺相关病毒载体、中和抗体、自噬诱导剂 NA 单细胞转录组数据 涉及IPF患者肺组织样本和小鼠模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'(推测)
回到顶部