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当前共找到 32055 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-11-02 |
StarCDP: Dynamic Programming Algorithms for Fast and Accurate Cell Lineage Tree Reconstruction from CRISPR-Based Lineage Tracing Data
2025-Oct-23, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1177/15578666251386082
PMID:41173524
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研究论文 | 提出Star-CDP动态规划算法，用于从CRISPR谱系追踪数据中快速准确地重建细胞谱系树 | 开发了基于动态规划的算法，能在约束搜索空间内寻找、计数、采样和构建共识树，相比现有方法具有更高可扩展性和准确性 | 研究显示标准数据处理流程可能影响迁移/再播种的相对性能评估 | 解决细胞谱系树重建中系统发育信号不一致的技术限制 | CRISPR诱导突变的细胞谱系数据 | 生物信息学 | 肺腺癌 | CRISPR谱系追踪，单细胞RNA测序 | 动态规划算法 | 基因突变数据 | 小鼠模型数据 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2025-11-02 |
Temporal Clonal Tracing Reveals Tumor-Intrinsic IFNγ-Dependencies Driving Niche Adaptation and Early Metastatic Colonization
2025-Oct-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.13.669778
PMID:40832237
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研究论文 | 通过单细胞条形码和转录组分析揭示肿瘤细胞在转移过程中对IFNγ信号通路的依赖性 | 开发了MetTag单细胞追踪技术，首次发现早期播散肿瘤细胞通过IFNγ信号通路实现转移定植的机制 | 研究主要关注腹膜转移，其他器官转移机制可能不同 | 探究肿瘤细胞在转移定植过程中的克隆动态和分子机制 | 播散肿瘤细胞和转移微环境 | 单细胞生物学 | 癌症转移 | 单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9筛选,RNA速度分析 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2025-11-02 |
Comprehensive noise reduction in single-cell data with the RECODE platform
2025-Oct-20, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101178
PMID:40967209
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研究论文 | 本研究升级了RECODE平台，通过新增iRECODE功能和技术扩展，为单细胞数据提供全面的噪声降低解决方案 | 开发了iRECODE功能可同时降低技术和批次噪声，并将RECODE适用范围扩展到单细胞Hi-C和空间转录组学等多种单细胞模态 | NA | 解决单细胞测序数据中的技术噪声和批次效应问题 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞Hi-C, 空间转录组学 | 基于高维统计的算法 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞Hi-C, 空间转录组学 | RECODE平台 | RECODE技术噪声降低平台，包含iRECODE批次噪声降低功能 |
| 84 | 2025-11-02 |
Identification of Regulatory RNA-Binding Genes in Spermatogonial Stem Cell Reprogramming to ES-like Cells Using Machine Learning-Integrated Transcriptomic and Network Analysis
2025-Oct-20, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14201632
PMID:41148847
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研究论文 | 本研究通过机器学习整合转录组和网络分析，识别精原干细胞重编程为ES样细胞过程中的关键RNA结合调控基因 | 首次整合机器学习、转录组学和网络分析系统揭示精原干细胞重编程的分子机制，识别出Ctdsp1、Rest和Stra8等关键RNA结合调控基因 | 研究仅使用小鼠模型，人类精原干细胞的重编程机制仍需验证 | 探索精原干细胞重编程为多能干细胞的分子机制及其在再生医学和生育力保护中的应用潜力 | Oct4-GFP C57BL/6转基因小鼠的精原干细胞及其重编程产生的ES样细胞 | 机器学习 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫细胞化学, 畸胎瘤实验 | 机器学习整合分析 | 转录组数据, 基因表达数据 | 使用GEO数据库多个数据集(GSE43850, GSE38776, GSE149512)的小鼠精原干细胞和胚胎干细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2025-11-02 |
PPAR-γ Inhibits Chronic Apical Periodontitis by Facilitating Macrophage Efferocytosis
2025-Oct-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262010157
PMID:41155449
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研究论文 | 本研究阐明PPAR-γ通过促进巨噬细胞胞葬作用抑制慢性根尖周炎的机制 | 首次揭示PPAR-γ在慢性根尖周炎病程中调控巨噬细胞胞葬功能的作用机制 | NA | 探究PPAR-γ在慢性根尖周炎发病过程中对巨噬细胞胞葬作用的调控功能 | 临床标本、大鼠根尖周病变模型、体外CAP炎症环境模型 | NA | 慢性根尖周炎 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据,组织染色图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2025-11-02 |
The Interplay Between lncRNAs-microRNAs Network Dysregulation and Cellular Hallmarks of Thyroid Cancer
2025-Oct-18, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17203373
PMID:41154428
|
综述 | 本文综述了长链非编码RNA与microRNA网络失调在甲状腺癌发生发展中的作用机制 | 系统总结了lncRNAs通过ceRNA机制、信号通路调控和表观遗传修饰参与甲状腺癌特征性表现的分子机制 | NA | 探讨lncRNAs-microRNAs网络失调与甲状腺癌细胞特征之间的相互作用关系 | 甲状腺癌（特别是乳头状甲状腺癌和间变性甲状腺癌） | NA | 甲状腺癌 | RNA干扰、反义寡核苷酸、CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 87 | 2025-11-02 |
OmniCellX: A Versatile and Comprehensive Browser-Based Tool for Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2025-Oct-17, Biology
DOI:10.3390/biology14101437
PMID:41154840
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研究论文 | 介绍了一个基于浏览器的单细胞RNA测序分析工具OmniCellX | 开发了首个基于浏览器、支持双模式操作（分析与可视化）且能处理百万级细胞数据的单细胞RNA测序分析工具 | 未提及具体性能基准测试或与其他工具的详细比较 | 简化单细胞RNA测序数据分析流程，解决可访问性、可扩展性和可用性挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 百万级细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | OmniCellX | 基于浏览器的单细胞RNA测序分析工具，支持Docker部署和双模式操作 |
| 88 | 2025-11-02 |
Integrative Single-Cell and Bulk Transcriptomic Analysis Identifies Macrophage-Related Gene Signatures Predictive of Hepatocellular Carcinoma in Cirrhosis
2025-Oct-15, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16101213
PMID:41153430
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据识别巨噬细胞相关基因特征，构建肝硬化和肝细胞癌的预测模型 | 首次整合单细胞和批量转录组数据系统分析肝硬化向肝癌进展过程中巨噬细胞相关转录组变化 | 研究样本量有限，需要在更大队列中验证模型的普适性 | 开发肝硬化患者肝癌风险的早期预测模型 | 肝硬化患者和肝细胞癌患者的肝组织样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Lasso回归, 随机森林, XGBoost | 基因表达数据 | 肝硬化患者和肝细胞癌患者的肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2025-11-02 |
Determining the Biological Features of Aggressive Meningioma Growth with Transcriptomic Profiling
2025-Oct-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17203324
PMID:41154381
|
研究论文 | 通过转录组分析揭示侵袭性脑膜瘤生长的生物学特征 | 首次结合RNA-seq和scRNA-seq数据解析脑膜瘤等级相关的基因表达变化及肿瘤微环境特征 | 样本量相对有限（共60例），且为单中心研究 | 识别与脑膜瘤恶性程度相关的基因并评估其功能相关性 | 脑膜瘤组织样本（脑膜上皮型19例、纤维型11例、非典型18例、间变型12例） | 生物信息学 | 脑膜瘤 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | 无监督聚类分析, 基因集富集分析 | 转录组数据, 单细胞数据 | 60例脑膜瘤样本（WHO I级30例，II级18例，III级12例） | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2025-11-02 |
Kdm7aa Orchestrates an Immunomodulatory Cardiomyocyte Program to Enable Zebrafish Heart Regeneration
2025-Oct-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262010044
PMID:41155336
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现组蛋白去甲基化酶Kdm7aa在斑马鱼心脏再生过程中协调免疫调节性心肌细胞程序 | 首次揭示Kdm7aa作为再生诱导的表观遗传调节因子，连接组蛋白去甲基化与趋化因子信号通路 | 研究主要基于斑马鱼模型，在哺乳动物中的直接应用仍需验证 | 阐明斑马鱼心脏再生的分子机制，探索增强哺乳动物心脏修复的潜在治疗策略 | 斑马鱼心室心肌细胞，新生和成年小鼠心脏，人类心脏组织 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，CRISPR/Cas9基因编辑，bulk RNA测序，药理学抑制 | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 斑马鱼心肌细胞，小鼠心脏组织，人类心脏组织 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2025-11-02 |
Transcriptomic Signatures in IgA Nephropathy: From Renal Tissue to Precision Risk Stratification
2025-Oct-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262010055
PMID:41155346
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综述 | 本文综述了转录组学在IgA肾病分子特征解析和精准风险分层中的应用进展 | 首次整合了bulk RNA测序、单细胞转录组学、空间转录组学和非侵入性转录组学数据，将分子特征直接与临床风险分层和精准治疗联系起来 | 存在标准化、队列规模和临床部署方面的挑战 | 总结转录组学在IgA肾病分子特征研究和患者风险分层中的应用 | IgA肾病患者的肾脏组织、尿液和血液样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA测序、单细胞转录组学、空间转录组学、基因表达谱分析、机器学习 | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 92 | 2025-11-02 |
Immunometabolic Dysregulation in B-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia Revealed by Single-Cell RNA Sequencing: Perspectives on Subtypes and Potential Therapeutic Targets
2025-Oct-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26209996
PMID:41155287
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示B细胞急性淋巴细胞白血病中的免疫代谢失调机制 | 首次在单细胞水平系统描绘B-ALL免疫代谢特征，建立基于代谢特征的机器学习分型模型，并识别关键转录因子和靶向药物 | 样本量有限（17例患者），需要更大规模验证 | 探索B-ALL免疫微环境中的代谢失调机制及潜在治疗靶点 | B细胞急性淋巴细胞白血病患者骨髓样本 | 数字病理 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 17例B-ALL患者和13例健康对照的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2025-11-02 |
RNA-Seq and Single-Cell RNA-Seq Analyses of Tilapia Head Kidney in Response to Streptococcus agalactiae and Aeromonas hydrophila
2025-Oct-11, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15202951
PMID:41153878
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研究论文 | 通过RNA-Seq和单细胞RNA-Seq分析罗非鱼头肾对无乳链球菌和嗜水气单胞菌感染的免疫应答机制 | 首次结合比较转录组学和单细胞RNA测序技术揭示罗非鱼对不同病原菌的免疫细胞响应差异，特别是发现单核/巨噬细胞根据细菌挑战类型呈现不同分化模式 | 研究聚焦于头肾组织，未涉及其他免疫器官；实验仅针对两种特定病原菌，结论普适性有待验证 | 探究罗非鱼对不同病原菌感染的免疫应答机制 | 罗非鱼头肾组织 | 转录组学 | 细菌感染 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq | NA | NA |
| 94 | 2025-11-02 |
Cold Exposure Induces Swine Brown Adipocytes to Display an Island-like Distribution with Atypical Characteristics
2025-Oct-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26209871
PMID:41155166
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现猪体内存在棕色脂肪细胞，并揭示其在冷暴露下呈现岛状分布的非典型特征 | 首次在猪体内鉴定出棕色脂肪细胞，发现其独特的岛状分布模式和不同于典型棕色脂肪细胞的分子特征 | UCP2/3蛋白含量未显著增加，论文提供了重复实验以提高该蛋白含量的方法 | 确认猪体内棕色脂肪细胞的存在及其在冷暴露下的特征 | 猪棕色脂肪细胞与小鼠棕色脂肪组织的比较分析 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 全转录组测序, ceRNA网络分析, 染色质可及性分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2025-11-02 |
Conditional Ablation of PKCλ/ι in CD4+ T Cells Ameliorates Hepatic Fibrosis in Schistosoma japonicum-Infected Mice via T Follicular Helper (Tfh) Cell Suppression Coupled with Increased Follicular Regulatory T (Tfr) and Regulatory B (Breg) Cell Activities
2025-Oct-09, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15101430
PMID:41154658
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除CD4+ T细胞中的PKCλ/ι基因，探讨其在日本血吸虫感染诱导的小鼠肝纤维化中的作用机制 | 首次揭示了PKCλ/ι通过调控Tfh细胞分化、促进Tfr功能及激活IL-10产生的Breg细胞来减轻肝纤维化的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究PKCλ/ι在血吸虫感染诱导的肝纤维化中的免疫调节作用 | CD4+ T细胞条件性PKCλ/ι敲除小鼠和野生型对照小鼠 | 免疫学 | 肝纤维化 | 流式细胞术, RT-qPCR, ELISA, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 条件性敲除小鼠和野生型对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2025-11-02 |
Preclinical Diagnosis of Type 1 Diabetes: Reality or Utopia
2025-Oct-07, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13102444
PMID:41153727
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综述 | 评估1型糖尿病经典与新兴生物标志物在早期诊断中的应用现状与潜力 | 系统整合传统标志物与新兴技术（如单细胞转录组、FTIR光谱等），提出多标志物联合诊断策略 | 多数新兴生物标志物证据基础不足，尚未在临床诊断中广泛应用 | 评估生物标志物在1型糖尿病早期诊断中的适用性，推动新型诊断方法开发 | 1型糖尿病生物标志物（包括HLA、自身抗体、细胞因子、cfDNA等） | 生物信息学 | 1型糖尿病 | 全基因组关联研究（GWAS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、FTIR光谱 | 多基因风险评分（PRS） | 基因组数据、转录组数据、光谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-11-02 |
Harpagide Confers Protection Against Acute Lung Injury Through Multi-Omics Dissection of Immune-Microenvironmental Crosstalk and Convergent Therapeutic Mechanisms
2025-Oct-04, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph18101494
PMID:41155609
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示钩果草苷通过调节免疫微环境对急性肺损伤的保护作用 | 首次采用单细胞转录组学、蛋白质组学与分子动力学模拟相结合的多组学策略，系统解析钩果草苷在急性肺损伤中的多通路调控机制 | 研究仅基于LPS诱导的小鼠模型，尚未在临床样本中验证 | 探究钩果草苷对急性肺损伤的保护作用及其分子机制 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 多组学分析 | 急性肺损伤 | 单细胞转录组学,蛋白质组学,表面等离子共振,细胞热位移分析,分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,分子相互作用数据 | 6只小鼠/组 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
| 98 | 2025-11-02 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals a Multi-Compartmental Cellular Cascade Underlying Elahere-Induced Ocular Toxicity in Rats
2025-Oct-04, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph18101492
PMID:41155607
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了Elahere在大鼠中诱导眼毒性的多区室细胞级联反应机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统解析ADC药物Elahere引起的眼毒性细胞特异性分子机制 | 研究仅使用大鼠模型，与人类病理生理可能存在差异 | 阐明Elahere诱导眼毒性的细胞类型特异性分子机制 | Sprague-Dawley大鼠角膜细胞 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 47,606个角膜细胞 | BD Biosciences | single-cell RNA-seq | BD Rhapsody | BD Rhapsody单细胞分析系统 |
| 99 | 2025-11-02 |
Exploring the Abnormal Characteristics of the Ovaries During the Estrus Period of Kazakh Horses Based on Single-Cell Transcriptome Technology
2025-Oct-02, Biology
DOI:10.3390/biology14101351
PMID:41154754
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术探索哈萨克马发情期卵巢的异常特征 | 首次构建了哈萨克马卵巢的单细胞转录组图谱，揭示了不同卵巢细胞类型及其亚型在发情期的分子特征 | 研究仅针对哈萨克马特定品种，结果可能不适用于其他马种 | 探究马匹发情期卵巢功能衰退的分子机制 | 哈萨克马的卵巢组织 | 单细胞转录组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 112,861个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2025-11-02 |
Mechanisms of Sepsis From a Metabolic Immunology Perspective: A Bidirectional Mendelian Randomization and Single-Cell Sequencing Study of CD39 + Cells
2025-Oct-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002633
PMID:40663487
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研究论文 | 通过双向孟德尔随机化和单细胞测序研究CD39+细胞在脓毒症中的代谢免疫机制 | 首次整合双向孟德尔随机化和单细胞转录组学揭示CD39+CD8+T细胞通过代谢中间体如硫酸雄酮驱动脓毒症进展 | 研究样本量相对有限，需要进一步实验验证机制 | 探究免疫表型与代谢物在脓毒症发病机制中的相互作用 | 脓毒症患者免疫细胞，特别是CD39+CD8+T细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | 双向两样本孟德尔随机化模型 | 基因组关联研究数据, 单细胞转录组数据 | 11,643例脓毒症病例，GSE167363数据集（脓毒症vs对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |