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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-04-04
Müller glia-mediated regeneration restores neuronal diversity and retinal circuit organization in the adult zebrafish
2026-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过结合诱导谱系追踪、单细胞RNA测序和形态学分析,探讨了成年斑马鱼视网膜中Müller胶质细胞介导的神经元再生如何恢复神经元多样性和视网膜环路组织 首次在成年斑马鱼中系统评估了Müller胶质细胞再生神经元在分子和结构特征上与原内源性神经元的匹配程度,揭示了损伤环境如何影响再生神经元的比例和多样性 研究主要基于斑马鱼模型,结果可能不完全适用于哺乳动物;再生神经元的长期功能和环路整合需进一步验证 探究成年斑马鱼视网膜中Müller胶质细胞介导的神经元再生是否能够恢复神经元多样性、身份和环路组织,为再生神经科学提供见解 成年斑马鱼视网膜中的Müller胶质细胞及其再生的神经元,包括光感受器和内视网膜神经元 再生神经科学 视网膜损伤 诱导谱系追踪,单细胞RNA测序,形态学分析,光损伤和NMDA损伤模型 NA 单细胞转录组数据,形态学图像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
82 2026-04-04
Lysine attenuates acute lung injury by restoring α-tubulin acetylation and ciliary activity
2026-Mar-16, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序分析和靶向血浆代谢组学,揭示了赖氨酸在急性肺损伤中通过恢复α-微管蛋白乙酰化和纤毛活性来促进肺泡上皮修复的作用机制 首次将赖氨酸代谢与α-微管蛋白乙酰化、纤毛信号传导及钙稳态联系起来,并发现赖氨酸补充能显著提高小鼠存活率(从0%提升至62.5%) 研究主要基于动物模型(小鼠和非人灵长类),在人类患者中的直接疗效仍需进一步临床验证 探究氨基酸代谢在急性肺损伤后肺泡上皮修复中的具体作用机制 急性肺损伤(ALI)模型中的肺上皮细胞,特别是SFTPC+肺泡上皮II型(AT2)细胞 数字病理学 肺损伤 单细胞RNA测序(scRNA-seq),靶向血浆代谢组学 NA 单细胞转录组数据,代谢组数据 人类ALI样本和小鼠及非人灵长类ALI模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
83 2026-04-04
MAPK14/SLC7A11/GPX4 axis dysregulation drives podocyte ferroptosis via mediating glycerophospholipid metabolism
2026-Mar-11, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过整合多组学方法,揭示了糖尿病肾病中足细胞铁死亡的关键驱动机制,并验证了黄芪甲苷IV的保护作用 首次通过单细胞RNA测序确定足细胞是糖尿病肾病的核心细胞枢纽,并发现MAPK14/SLC7A11/GPX4轴失调通过介导甘油磷脂代谢驱动足细胞铁死亡 未明确说明样本的具体数量及临床特征细节 阐明糖尿病肾病的细胞类型特异性发病机制,并探索新的治疗靶点和诊断生物标志物 人类糖尿病肾脏组织、足细胞 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序, 空间代谢组学, 转录组学, 代谢组学 NA RNA测序数据, 代谢组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间代谢组学, bulk RNA-seq NA NA
84 2026-04-04
ChatSpatial: Schema-Enforced Agentic Orchestration for Reproducible and Cross-Platform Spatial Transcriptomics
2026-Mar-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍ChatSpatial平台,该平台通过模式强制的智能编排,统一了空间转录组学分析工具,实现了跨Python和R生态系统的可重复工作流程 提出基于模式强制编排的LLM驱动平台,将60多种方法统一到单一对话工作流中,通过预验证工具模式而非生成自由代码来确保可重复性 未明确说明平台对计算资源的要求、对新分析工具的扩展性限制,以及在实际大规模数据集上的性能评估 解决空间转录组学数据分析中工具碎片化和跨平台兼容性问题,提高分析可重复性和效率 空间转录组学数据分析工作流程和工具集成 空间转录组学 卵巢癌,口腔鳞状细胞癌 空间转录组学分析 LLM(大语言模型) 空间转录组学数据 基于两项已发表研究的数据(具体样本数量未明确) NA 空间转录组学 NA NA
85 2026-04-04
Smarca4 maintains mitochondrial homeostasis and energy metabolism during cardiac development
2026-Mar-07, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 本研究揭示了Smarca4在心脏发育过程中作为关键染色质重塑因子,通过调控线粒体稳态和能量代谢来维持心脏和骨骼肌功能 首次将SWI/SNF染色质重塑ATP酶亚基Smarca4确定为线粒体稳态和细胞能量代谢的关键调控因子,并建立了其与脊椎动物肌肉发育中核调控与线粒体能量稳态之间的直接联系 研究主要基于斑马鱼模型,虽在人类心肌细胞和小鼠肌管中进行了验证,但体内复杂调控机制仍需进一步探索 探究表观遗传机制如何调控线粒体结构和功能,特别是在心脏发育过程中的作用 斑马鱼(smarca4a缺陷模型)、人类心肌细胞和小鼠肌管 表观遗传学 代谢性肌病 RNA-seq, ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 高分辨率共聚焦成像, Seahorse代谢分析, AAV介导的基因敲低 NA 基因组学数据、成像数据、代谢数据 NA NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq NA NA
86 2026-04-04
CNS-resident B cells develop locally into a pro-inflammatory age-associated phenotype during aging and after stroke
2026-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过流式细胞术、单细胞RNA测序和B细胞受体测序,揭示了衰老和缺血性中风后中枢神经系统内B细胞亚群的局部发育和促炎性表型转变 首次在小鼠和人类中鉴定出中枢神经系统内独特的B1b祖细胞池,并揭示其向年龄相关B细胞(ABC)亚群的分化轨迹及中风后的克隆扩增 研究主要基于小鼠模型和死后人类脑组织,缺乏活体人类动态观察数据 阐明衰老和缺血性中风后中枢神经系统内B细胞亚群的发育动态和免疫表型特征 老年雄性和雌性小鼠的未损伤及中风后脑组织、老年人类供体的死后脑实质组织 免疫学 缺血性中风 流式细胞术, 单细胞RNA测序, B细胞受体测序 NA 单细胞转录组数据, 序列数据 老年小鼠脑组织B细胞、老年人类死后脑组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
87 2026-04-04
Influence of body composition on the efficacy of nivolumab plus ipilimumab for metastatic clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar-03, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究探讨了身体成分(皮下脂肪和骨骼肌质量)对转移性透明细胞肾细胞癌患者接受一线纳武利尤单抗联合伊匹木单抗治疗疗效的影响 首次使用人工智能分割工具量化身体成分,并结合单细胞RNA测序探索其与肿瘤微环境的关系,超越了传统BMI指标的局限性 回顾性研究设计,样本量有限,OS关联结果不明确,需要前瞻性验证 评估身体成分与免疫检查点抑制剂治疗转移性透明细胞肾细胞癌疗效之间的关联 转移性透明细胞肾细胞癌患者 数字病理学 肾癌 人工智能图像分割,单细胞RNA测序 Cox回归模型,立方样条 CT图像,临床数据,单细胞RNA测序数据 309名患者用于回顾性分析,12名患者用于单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序 NA NA
88 2026-04-04
Transcriptional factor ZMYM3 promotes hepatocellular carcinoma metastasis by upregulating CTTN and inducing invadopodia formation
2026-Mar-03, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究探讨了转录因子ZMYM3通过上调CTTN表达并诱导侵袭伪足形成,从而促进肝细胞癌转移的分子机制 首次揭示了ZMYM3在肝细胞癌转移中的关键作用,并阐明其通过直接结合CTTN启动子促进侵袭伪足形成的新机制 研究主要基于体外实验和公共数据库分析,缺乏体内动物模型的直接验证 探究肝细胞癌侵袭和转移的分子机制,寻找潜在治疗靶点 肝细胞癌组织和细胞 癌症生物学 肝细胞癌 RNA测序、染色质免疫沉淀测序、免疫组织化学、单细胞测序 NA 基因表达数据、测序数据、病理图像 TCGA和GEO数据库中的肝细胞癌样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ChIP-seq NA NA
89 2026-04-04
SAGE: Spatially Aware Gene Selection and Dual-View Embedding Fusion for Domain Identification in Spatial Transcriptomics
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文提出了一种名为SAGE的统一可重复框架,用于空间转录组学中的空间域识别,该框架结合了主题驱动的基因选择和双视图嵌入融合 提出了一种结合基于主题模型的基因选择和双视图(局部表达图与主题驱动的非局部图)嵌入融合的统一框架,以解决现有方法在捕获结构判别性基因和长程功能关系方面的不足 未明确说明 提高空间转录组学数据中空间域识别的准确性和生物学可解释性 空间转录组学数据 空间转录组学 乳腺癌,黑色素瘤 空间转录组学 非负矩阵分解,对比图表示学习 空间基因表达数据 34个真实世界数据集 NA 空间转录组学 NA NA
90 2026-04-04
Spatially Resolved Multiomics Reveals Metabolic Remodeling and Autophagy Activation in Adamantinomatous Craniopharyngiomas
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究利用空间分辨多组学技术揭示了颅咽管瘤中的代谢重塑和自噬激活机制 首次结合单细胞空间转录组学和空间分辨代谢组学,揭示了颅咽管瘤中肿瘤上皮细胞亚群的空间分离、代谢轴形成及其与自噬激活的直接耦合 研究样本可能有限,且功能验证主要基于免疫组化,未来需更多体内实验验证 探究颅咽管瘤进展和复发的驱动因素 颅咽管瘤组织 数字病理学 颅咽管瘤 单细胞空间转录组学, 空间分辨代谢组学, 批量代谢组学, 免疫组化 NA 空间转录组数据, 代谢组数据, 图像数据 NA CosMx, AFADESI 单细胞空间转录组学, 空间分辨代谢组学 CosMx SMI, AFADESI-MSI CosMx 单分子成像空间转录组学, AFADESI 质谱成像空间代谢组学
91 2026-04-04
Spatial Transcriptomics of TMJ Reveals a Remodeling Fibroblast-Immune Microenvironment Driving Arthritis Pain
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究应用seqFISH空间转录组学技术解析了颞下颌关节关节炎疼痛的细胞微环境重塑机制 首次应用seqFISH空间转录组学技术系统绘制成年小鼠TMJ细胞类型解剖图谱,揭示了关节炎诱导的成纤维细胞-免疫细胞微环境重塑及其通过Igf1-Il33轴驱动疼痛的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类患者组织验证样本量有限,机制研究尚未完全转化为临床治疗策略 探究颞下颌关节关节炎疼痛的细胞微环境重塑机制 成年小鼠颞下颌关节组织及患者滑膜组织 空间转录组学 关节炎 seqFISH(顺序荧光原位杂交)空间转录组学 基因敲除小鼠模型(巨噬细胞特异性Igf1敲除、成纤维细胞特异性Il33敲除) 空间转录组数据、组织切片图像 未明确说明具体样本数量,包括成年小鼠TMJ组织和患者滑膜组织 NA 空间转录组学 seqFISH 顺序荧光原位杂交空间转录组技术
92 2026-04-04
Early Radial Extracorporeal Shockwave Stimulation on Proximal Tibial Circular Osteotomy Site Enhanced Heterotopic Skin Wound Healing via Small Extracellular Vesicles
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究探索了径向体外冲击波疗法在胫骨环形截骨部位如何通过小细胞外囊泡增强大鼠足背伤口愈合 首次将径向体外冲击波疗法应用于胫骨截骨部位,并通过小细胞外囊泡介导的机制促进伤口愈合,揭示了ATP/P2X7R/p38MAPK通路在sEV释放中的作用以及Thrombospondin 1蛋白的关键功能 研究仅在大鼠模型中进行,尚未在人类临床试验中验证,且具体机制细节需进一步探索 探索径向体外冲击波疗法在伤口愈合中的治疗潜力,特别是针对慢性伤口如糖尿病足溃疡 大鼠的胫骨环形截骨部位和足背皮肤伤口 再生医学 糖尿病足溃疡 单细胞测序、蛋白质组学分析 动物模型(大鼠) 生物分子数据、细胞行为数据 NA NA NA NA NA
93 2026-04-04
ROS Activated NETosis of Bone Marrow CD55+ Intermediate Mature Neutrophils Through HIF1α-PADI4 Pathway to Initiate Bone Aging
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了骨髓中CD55+中间成熟中性粒细胞通过ROS激活的NETosis,经由HIF1α-PADI4通路,在骨衰老启动中的关键作用 首次发现CD55+中间成熟中性粒细胞亚群在骨衰老中的核心角色,并揭示了ROS与HIF1α-PADI4通路协同调控NETosis的新机制 研究主要基于SAMP6小鼠模型,人类骨衰老中的直接相关性尚需进一步验证 探究骨髓中性粒细胞NETosis在骨衰老启动中的机制及潜在治疗靶点 3月龄雄性SAMP6小鼠的骨髓中性粒细胞及骨髓间充质干细胞 细胞生物学 骨质疏松症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 3月龄雄性SAMP6小鼠骨髓样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
94 2026-04-04
Reconstructing Coherent Functional Landscape From Multi-Modal Multi-Slice Spatial Transcriptomics by a Variational Spatial Gaussian Process
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文介绍了一种名为stVGP的变分空间高斯过程框架,用于从多模态、多切片空间转录组数据中对齐、整合和重建空间相干域 stVGP通过结合空间高斯过程与空间分层变换器,实现了跨切片对齐、批次效应校正和虚拟组织切片生成,支持连续3D重建和基因表达插值 NA 开发一个统一、可扩展的框架,用于从多模态多切片空间转录组数据中建模复杂组织的3D空间景观 空间转录组数据集,包括人类乳腺癌样本 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学 变分空间高斯过程框架(stVGP),结合空间分层变换器 空间转录组数据,组织学图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
95 2026-04-04
HMGB2-RAD21 Axis Promotes Fibro/Adipogenic Progenitor Proliferation and Regulates Fat Infiltration
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞测序分析猪胚胎肌肉,揭示了HMGB2-RAD21轴在调控纤维/脂肪祖细胞增殖和脂肪浸润中的关键作用 首次构建了猪胚胎纤维/脂肪祖细胞的发育图谱,并鉴定出HMGB2亚群作为决定FAP池大小的关键因素,揭示了HMGB2通过靶向RAD21调控FAP体内增殖的新机制 研究主要基于猪和小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证,且机制研究在体内外环境中的差异需更深入探讨 探究肌间脂肪浸润的分子和细胞机制,以改善肉类品质并缓解骨骼肌中的病理脂肪浸润 猪胚胎肌肉组织、小鼠模型以及纤维/脂肪祖细胞 单细胞测序 肌肉疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 猪胚胎肌肉样本和小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
96 2026-04-04
Confidence-Based Batch Ordering in Continual Learning: A Curriculum Learning Approach for Single-Cell RNA Sequencing Data
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本研究提出了一种基于置信度的批量排序策略,用于单细胞RNA测序数据的持续学习,通过按置信度升序排列训练批次来提升分类性能 引入置信度估计来优先处理训练样本,首次在持续学习中系统研究批量排序对学习效率和模型性能的影响 未探讨自适应置信度指标在动态数据集中的应用,且策略在其他领域的扩展性有待验证 优化持续学习算法在数据密集型任务中的工作流程,提高模型在单细胞RNA测序数据上的分类性能和泛化能力 单细胞RNA测序数据集 机器学习 NA 单细胞RNA测序 持续学习算法 基因表达数据 多个单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
97 2026-04-04
S3RL: Enhancing Spatial Single-Cell Transcriptomics With Separable Representation Learning
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文提出了一种名为S3RL的可分离表示学习框架,旨在增强空间转录组原始数据的保真度,以解决数据稀疏性和技术噪声问题 提出S3RL框架,通过有效去噪稀疏测量和放大生物学相关信号,恢复精细的空间表达模式和调控关系,在空间域识别和多切片对齐方面实现了高达170%的ARI提升 未在摘要中明确说明 提升空间转录组数据的分析能力,以解码复杂的组织微环境 人类、小鼠和植物等多种生物组织的空间转录组数据 空间转录组学 肿瘤免疫交互 空间转录组学 可分离表示学习框架 空间转录组数据 未在摘要中明确说明具体样本数量 NA 空间转录组学 NA NA
98 2026-04-04
scDGCL: A Dual-Level and Graph-Constrained Contrastive Learning Method for Single-Cell RNA Sequencing Data Clustering
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本文提出了一种名为scDGCL的双层图约束对比学习方法,用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 该方法通过同时考虑细胞和簇级别的相似性与差异性,并利用图的关系先验对齐表示,从而优化细胞表示并提升聚类性能 NA 提升单细胞RNA测序数据的聚类性能 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 对比学习 基因表达数据 12个真实数据集和8个模拟数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
99 2026-04-04
Immune Predictors of Radiotherapy Outcomes in Cervical Cancer
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究整合单细胞转录组学和机器学习,揭示了宫颈癌放疗后免疫微环境的动态重塑,并开发了预测放疗预后的多层感知机模型 首次结合单细胞转录组学和机器学习识别宫颈癌放疗的免疫预测因子,并发现C3/C3AR1轴介导的上皮-髓系细胞互作在放疗响应中的关键作用 研究样本量有限,且主要基于单细胞数据,需进一步临床验证 探索宫颈癌放疗疗效的免疫预测因子,以指导精准放疗策略 宫颈癌患者及小鼠模型的免疫微环境 数字病理学 宫颈癌 单细胞转录组学 多层感知机 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
100 2026-04-04
Mitochondrial Calcium Uniporter Drives Chemoresistance in Pancreatic Cancer via Glutathione-Mediated Stemness Maintenance
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序,发现线粒体钙单向转运体(MCU)在胰腺导管腺癌(PDAC)中通过谷胱甘肽介导的干细胞性维持驱动化疗耐药 首次揭示MCU通过触发内质网应激和PERK-eIF2α通路,激活ATF4和NRF2,促进谷胱甘肽合成以清除活性氧并维持干细胞性,从而介导PDAC化疗耐药 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证MCU抑制剂的疗效和安全性 探究胰腺导管腺癌(PDAC)化疗耐药的分子机制,并开发新的治疗策略 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤细胞,特别是化疗耐药相关的癌症干细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序,高通量筛选 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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