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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-11-03 |
Single-Cell Transcriptome Atlas and Dynamic Regulatory Mechanisms of Anther Development in Alfalfa (Medicago sativa L.)
2025-Nov, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70276
PMID:40729546
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研究论文 | 构建了紫花苜蓿花药首个单细胞转录组图谱,揭示了花药发育过程中的细胞类型特异性基因表达和动态调控机制 | 首次构建紫花苜蓿花药单细胞转录组图谱,发现绒毡层在四分体期的快速功能转换,鉴定出MsKIN14P、ERF3和ERF025等关键调控因子 | NA | 解析紫花苜蓿花药发育的单细胞转录景观和动态调控机制 | 紫花苜蓿花药中的各种特化细胞类型,特别是绒毡层和小孢子 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2025-11-03 |
SMAD7-mediated ferroptosis in macrophages drives osteoporosis progression: A multi-omics study
2025-Nov, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2025.08.021
PMID:40897147
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现SMAD7介导的巨噬细胞铁死亡是骨质疏松进展的关键机制 | 首次揭示SMAD7通过调控巨噬细胞铁死亡驱动骨质疏松的分子机制,并验证SMAD7抑制剂mongersen的治疗潜力 | 研究主要基于细胞系和生物信息学分析,需要更多体内实验验证 | 探索巨噬细胞在骨质疏松发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 骨质疏松患者样本、RAW264.7巨噬细胞系 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | RNA-seq, scRNA-seq, 生物信息学分析, 免疫组化, micro-CT | 人工神经网络, 机器学习算法 | 基因表达数据, 影像数据, 蛋白质相互作用数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 83 | 2025-11-03 |
Pancreatic hypersecretion of amyloid-forming human amylin dysregulates the neuro-immune axis and B cell development in a model of type-2 diabetes
2025-Nov, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.107153
PMID:41135632
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研究论文 | 本研究探讨了2型糖尿病中胰腺分泌的淀粉样人胰岛淀粉样多肽如何通过CXCL12/CXCR4信号轴导致外周和神经免疫系统失调 | 首次揭示淀粉样人胰岛淀粉样多肽通过下调脑血管ICAM-1和上调前体B细胞CXCR4表达,导致免疫细胞脑部迁移障碍和B细胞发育缺陷的机制 | 动物模型研究结果需在人类中进一步验证,急性和慢性暴露效应的差异机制尚未完全阐明 | 探究2型糖尿病中胰腺人胰岛淀粉样多肽积累对免疫系统的调控机制 | 转基因大鼠和小鼠模型,以及2型糖尿病患者的单细胞测序数据 | 免疫学 | 2型糖尿病 | 单细胞测序 | 转基因动物模型 | 基因表达数据,免疫细胞计数数据 | 转基因大鼠和小鼠模型,2型糖尿病患者单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2025-11-03 |
Single-cell transcriptional decoding of iron deficiency responses in maize root tips
2025-Nov-01, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03649-w
PMID:41175233
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了玉米根尖在铁充足和铁缺乏条件下的转录图谱,揭示了细胞类型特异性的铁缺乏响应机制 | 首次在单细胞分辨率下解析玉米根尖对铁缺乏的转录响应,发现皮层功能重编程和分布式调控网络协调铁缺乏响应 | 研究仅关注V3阶段初生根,未涵盖其他发育阶段或根型;功能验证实验有限 | 解析玉米根尖在铁缺乏条件下的细胞类型特异性转录响应机制 | 玉米根尖细胞 | 植物生物学,单细胞转录组学 | 营养缺乏症 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,系统发育分析,加权基因共表达网络分析,蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | WGCNA,PPI网络分析 | 单细胞转录组数据,批量转录组数据 | 15,306个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-11-03 |
Intrinsic changes in cell differentiation and identity drive impaired wound healing in aged female murine skin
2025-Nov-01, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-025-10340-w
PMID:41175301
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了老年雌性小鼠皮肤中细胞内在变化如何导致伤口愈合受损 | 首次在老年雌性小鼠模型中系统描绘了皮肤驻留细胞亚群在衰老过程中的转录组状态变化及其对伤口愈合的影响 | 研究仅限于雌性小鼠模型,且仅观察了伤后3天的时间点 | 阐明衰老过程中细胞内在变化如何影响皮肤伤口愈合的分子机制 | 年轻和老年雌性小鼠的完整皮肤及伤后3天的伤口组织 | 单细胞基因组学 | 皮肤伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年雌性小鼠的皮肤和伤口组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2025-11-03 |
Single-cell omics for nutrition research: an emerging opportunity for human-centric investigations
2025-Nov-01, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2025.2566387
PMID:41176166
|
综述 | 探讨单细胞组学技术在营养研究中的新兴应用及其推动人本营养研究的潜力 | 提出将单细胞组学技术与类器官和器官芯片等先进人类衍生系统相结合,实现生理相关背景下营养-细胞相互作用的机制研究 | 存在技术限制、模型选择困难和机构偏见等关键挑战 | 推进人本营养研究,揭示细胞特异性饮食反应和营养敏感通路 | 营养研究中的细胞类型特异性效应和个体间变异性 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞蛋白质组学、单细胞代谢组学 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 87 | 2025-11-03 |
Hspa8 modulation of immune responses mitigates ischemic brain injury
2025-Nov-01, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00359-x
PMID:41176589
|
研究论文 | 本研究探讨热休克蛋白A8在缺血性脑损伤后调节免疫细胞动态的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序等技术系统揭示Hspa8在调节中性粒细胞浸润和活性氧产生中的关键作用 | 研究主要基于实验模型,临床转化价值仍需进一步验证 | 阐明Hspa8在缺血性脑损伤免疫反应中的调控机制 | 缺血性脑损伤模型中的免疫细胞(T细胞、中性粒细胞、单核细胞) | 神经免疫学 | 缺血性脑损伤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 蛋白质相互作用网络分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质互作数据, 细胞表型数据 | 体外和体内缺血模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-11-03 |
Systematic characterization of full-length RNA isoforms in human colorectal cancer at single-cell resolution
2025-Oct-31, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf049
PMID:40702779
|
研究论文 | 通过单细胞长读长RNA测序系统表征人类结直肠癌中的全长RNA亚型 | 首次在单细胞分辨率下使用高深度长读长scRNA-seq技术系统解析结直肠癌全长转录组,揭示不同分子亚型间的选择性剪接调控模式 | 样本量相对有限(12例患者),功能验证实验仍需进一步扩展 | 系统表征结直肠癌中全长RNA亚型的多样性及其在肿瘤发生中的作用 | 结直肠癌患者的结肠上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 长读长单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2025-11-03 |
Tumor-derived RAC1A159V mutation promotes an immunosuppressive microenvironment that represses response to immune checkpoint inhibitor
2025-Oct-31, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea1212
PMID:41160695
|
研究论文 | 本研究揭示肿瘤来源的RAC1A159V突变通过激活mTORC1信号通路促进免疫抑制微环境,导致对免疫检查点抑制剂治疗产生抵抗 | 首次证明RAC1突变通过上调糖鞘脂生物合成激活mTORC1信号,进而改变肿瘤代谢和免疫细胞相互作用机制 | 研究主要基于基因编辑小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究RAC1突变如何影响肿瘤免疫微环境及免疫治疗反应 | 携带RAC1突变的肿瘤细胞和免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 基因编辑、流式细胞术、单细胞RNA测序 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2025-11-03 |
Circulating tumor cells as predictive biomarkers in the risk stratification of DCIS: Evidence of early dissemination
2025-Oct-31, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz0187
PMID:41160699
|
研究论文 | 本研究探讨循环肿瘤细胞作为DCIS风险分层预测生物标志物的潜力 | 首次在DCIS患者中系统研究CTC作为生物侵袭性指标,并通过单细胞RNA测序揭示早期播散证据 | 样本量较小(34例患者),需要更大规模研究验证 | 改善DCIS患者风险分层,减少过度治疗 | 导管原位癌(DCIS)患者和健康对照 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 微流控技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 34例DCIS患者及健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2025-11-03 |
Single-cell RNA-seq of small-intestinal neuroendocrine tumors reveals the cell of origin and gene expression of early tumor development
2025-Oct-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116500
PMID:41175375
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小肠神经内分泌肿瘤的细胞起源和早期肿瘤发育的基因表达轨迹 | 首次识别出位于隐窝+4位置及以下的CES1(+)、LCN15(-)肠嗜铬细胞亚群作为SI-NET的推定起源细胞,并发现PRODH2作为前体细胞的关键生物标志物 | 研究主要基于遗传性SI-NET患者样本,可能不适用于散发性病例 | 阐明小肠神经内分泌肿瘤的细胞起源和早期发育机制 | 遗传性小肠神经内分泌肿瘤患者的多发性同步肿瘤和前体病变 | 单细胞组学 | 小肠神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 遗传性SI-NET患者的多发性肿瘤和前体样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2025-11-03 |
Myeloid cells mediate interferon-driven resistance to immunotherapy in advanced renal cell carcinoma
2025-Oct-31, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.10.013
PMID:41175876
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肾细胞癌中干扰素信号通路对免疫检查点阻断治疗耐药性的影响 | 开发了推断细胞类型特异性干扰素诱导基因的混合效应模型,揭示了髓系细胞在干扰素驱动的免疫治疗耐药中的关键作用 | 研究主要基于观察性数据,需要进一步实验验证机制 | 探究干扰素信号在肾细胞癌免疫治疗耐药中的作用机制 | 肾细胞癌患者的肿瘤免疫微环境 | 单细胞基因组学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 混合效应模型 | 单细胞转录组数据 | 多个临床试验队列的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2025-11-03 |
Stress-NRF2 response axis polarizes tumor macrophages and undermines immunotherapy
2025-Oct-31, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013063
PMID:41176316
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研究论文 | 本研究揭示了NRF2转录因子在肿瘤相关巨噬细胞极化中的关键作用及其对免疫治疗的负面影响 | 首次发现NRF2介导的应激反应轴能够极化肿瘤巨噬细胞,形成免疫抑制性“应激-TAMs”,并证明靶向NRF2可增强免疫治疗效果 | 研究主要基于小鼠模型,在人类癌症中的临床转化仍需进一步验证 | 探索肿瘤相关巨噬细胞中NRF2激活状态如何影响免疫治疗反应 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)、MC38结肠肿瘤模型、MMTV-PyMT乳腺肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌、乳腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、三维细胞培养、体内肿瘤模型 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠肿瘤模型及人类癌症样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 94 | 2025-11-03 |
Niche Environment Remodeling Promotes Long-Term Endometrium Stromal Stem Cell Engraftment and Tissue Regeneration in Thin Endometrium
2025-Oct-31, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.10.053
PMID:41176621
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研究论文 | 通过改造干细胞微环境促进子宫内膜基质干细胞长期定植和薄型子宫内膜组织再生 | 首次提出通过免疫抑制和血管重建双重策略改造干细胞微环境,显著提高干细胞移植存活率 | 研究主要基于大鼠模型,人类临床应用效果需进一步验证 | 开发治疗薄型子宫内膜的新型干细胞疗法 | 大鼠薄型子宫内膜模型和人类子宫内膜基质干细胞 | 再生医学 | 子宫内膜疾病 | 单细胞RNA测序,mRNA工程,异种移植模型 | 动物模型 | 基因表达数据,病理学数据 | 大鼠模型和人类干细胞异种移植实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2025-11-03 |
Integrating single-cell RNA-seq datasets with substantial batch effects
2025-Oct-30, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12126-3
PMID:41168710
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研究论文 | 提出一种基于条件变分自编码器的新方法sysVI,用于整合具有显著批次效应的单细胞RNA测序数据集 | 采用VampPrior和循环一致性约束,解决了现有方法在整合跨系统数据时无法同时保持批次校正和保留生物信号的难题 | 未提及方法在超大规模数据集上的性能表现和计算效率 | 开发能够有效整合跨系统单细胞RNA测序数据的计算方法 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器(cVAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2025-11-03 |
Clonally expanded effector CD4+ cytotoxic T lymphocytes are associated with severe neurological adverse events after immune checkpoint inhibitor therapy
2025-Oct-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012350
PMID:41167637
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研究论文 | 本研究通过单细胞基因组学分析揭示了免疫检查点抑制剂治疗后严重神经系统不良事件与克隆扩增的CD4+细胞毒性T淋巴细胞之间的关联 | 首次在单细胞水平上识别出与n-irAEs特异性相关的CD4+ CTL克隆扩增及其效应基因表达谱 | 样本量较小(仅17例患者),且仅分析了外周血细胞而未直接研究中枢神经系统 | 探究免疫检查点抑制剂诱导的神经系统不良事件的免疫学机制和风险因素 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者,包括8例急性神经毒性患者 | 单细胞基因组学 | 癌症治疗相关神经系统不良事件 | 单细胞RNA测序,T细胞受体谱分析 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | 17例癌症患者(8例n-irAEs患者),共186,435个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-11-03 |
Low-density lipoprotein receptor interacts with clusterin to regulate A1/A2 astrocyte polarization and ameliorate hemorrhagic brain injury
2025-Oct-30, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115539
PMID:41175961
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研究论文 | 本研究探讨低密度脂蛋白受体与clusterin相互作用调控星形胶质细胞A1/A2极化并改善出血性脑损伤的机制 | 首次揭示LDLR通过相互作用蛋白CLU调控星形胶质细胞极化状态,为出血性脑损伤提供新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索LDLR对星形胶质细胞极化的影响及其分子机制 | C57BL/6J小鼠星形胶质细胞 | 神经科学 | 脑出血 | 单细胞测序, 质谱分析, 免疫共沉淀 | NA | 单细胞测序数据, 蛋白质组数据 | 小鼠脑出血模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2025-11-03 |
SerpinB2 promotes the proliferation of glioma cells by regulating the cell cycle through the Wnt/β-catenin signaling pathway
2025-Oct-30, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111148
PMID:41176096
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研究论文 | 本研究揭示SerpinB2通过Wnt/β-catenin信号通路调控细胞周期促进胶质瘤细胞增殖的分子机制 | 结合转录组测序与单细胞转录组分析,首次阐明SerpinB2通过Wnt/β-catenin通路调控细胞周期促进胶质瘤增殖的作用机制 | NA | 阐明SerpinB2在胶质瘤细胞增殖中的分子调控机制 | 胶质瘤细胞、胶质瘤组织、荷瘤小鼠模型 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 转录组测序,单细胞转录组分析,CCK-8检测,伤口愈合实验,流式细胞术,q-PCR,Western blotting | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
| 99 | 2025-11-03 |
A spatial transcriptomics dataset of the endometrium from repeated implantation failure patients
2025-Oct-29, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05995-6
PMID:41162434
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术分析了正常个体和反复种植失败患者子宫内膜组织的空间基因表达特征 | 首次构建了正常和反复种植失败条件下子宫内膜组织的空间转录组图谱 | 样本量较小(仅8个组织样本),仅研究了黄体中期阶段 | 探究反复种植失败患者子宫内膜组织的空间转录组特征 | 4名正常个体和4名反复种植失败患者的子宫内膜组织 | 空间转录组学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | 8个子宫内膜组织样本(4个正常对照,4个RIF患者) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 100 | 2025-11-03 |
Implication of an exosome-based gene signature for estimating clinical outcomes of triple-negative breast cancer and assisting in individualized therapy
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-16751-6
PMID:41162433
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研究论文 | 本研究开发了一种基于外泌体基因特征的三阴性乳腺癌预后评估模型 | 首次构建基于外泌体相关基因的TNBC预后特征模型,并发现FAM129B作为潜在治疗靶点 | 研究样本量未明确说明,需要进一步临床验证 | 开发三阴性乳腺癌预后评估工具并指导个体化治疗 | 三阴性乳腺癌患者和TNBC细胞系(MDA-MB-231, MDA-MB-468) | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌 | LASSO分析, 转录组学, 基因突变分析, siRNA转染, EdU检测, 伤口愈合实验 | LASSO回归模型 | 转录组数据, 基因突变数据, 实验数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |