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当前共找到 38358 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-04-14 |
Circadian-driven transcriptional programs govern metastatic progression
2026-Apr-10, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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综述 | 本文综述了昼夜节律如何通过调控肿瘤微环境（TME）成分来影响转移进程 | 整合了单细胞RNA-seq和活体成像数据，揭示了昼夜节律扰动（如时差反应或CRY1敲除）如何改变TME中的细胞因子网络、缺氧反应和代谢共生，从而识别了时间治疗靶点 | 关于TME分子机制的细节尚未完全阐明 | 探讨昼夜节律在肿瘤转移进程中的作用机制 | 肿瘤微环境（TME）成分，包括细胞外基质、基质细胞（如癌症相关成纤维细胞、巨噬细胞）和免疫细胞 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞RNA-seq, 活体成像 | NA | 转录组数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2026-04-14 |
A simple cell-cycle control system in Marchantia polymorpha provides a framework for understanding plant cell proliferation
2026-Apr-09, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag103
PMID:41967031
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研究论文 | 本研究通过系统发育分析和单细胞RNA测序，揭示了地钱（Marchantia polymorpha）中简单且非冗余的细胞周期控制系统，为理解植物细胞增殖及其进化提供了框架 | 首次在非种子植物（地钱）中揭示了简化的细胞周期基因系统，证明了种子植物中的复杂性是衍生特征，并通过活体成像和功能研究明确了核心周期蛋白在细胞周期各阶段的具体作用 | 研究主要聚焦于地钱的营养配子体阶段，对孢子体或其他植物类群的细胞周期控制系统的普适性验证尚不充分 | 探究早期陆生植物祖先的细胞周期控制系统，理解植物细胞增殖的进化机制 | 地钱（Marchantia polymorpha）的细胞周期基因及其调控机制 | 植物生物学 | NA | 系统发育分析，单细胞RNA-seq，活体成像 | NA | 基因序列数据，单细胞转录组数据，荧光成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 83 | 2026-04-14 |
Identification of immune cell type-specific susceptibility genes in multiple cancers using transcriptome-wide association studies
2026-Apr-09, Journal of the National Cancer Institute
DOI:10.1093/jnci/djag108
PMID:41967136
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和GWAS汇总统计，通过细胞类型特异性转录组范围关联研究（TWAS）方法，识别了多种癌症中免疫细胞类型特异性的易感基因 | 开发了一个整合跨细胞类型共享基因表达效应的建模框架，提高了预测准确性，并首次在多种癌症中系统性地进行了细胞类型特异性TWAS分析 | 研究依赖于公开的GWAS汇总统计数据，可能受到样本异质性和人群特异性的影响；单细胞数据主要来自OneK1K队列，细胞类型覆盖可能不完全 | 通过细胞类型特异性TWAS增强癌症易感基因的识别能力，并解析癌症病因中的免疫景观 | 七种癌症（乳腺癌、前列腺癌、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、弥漫性大B细胞淋巴瘤）的易感基因 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组范围关联研究（TWAS）、全基因组关联研究（GWAS） | 细胞类型特异性预测模型 | 基因表达数据、GWAS汇总统计数据 | OneK1K队列（127万个细胞，14种免疫细胞类型）；七种癌症GWAS数据（总计超过29万病例）；肺癌验证数据（113个个体） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2026-04-14 |
Investigating the potential risk of nicotine exposure on glioblastoma: Integrating Mendelian randomization and network toxicology analysis
2026-Apr-09, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究整合孟德尔随机化和网络毒理学分析，探讨尼古丁暴露对胶质母细胞瘤的潜在风险 | 首次结合孟德尔随机化与网络毒理学方法，系统评估血清可替宁（尼古丁代谢物）与胶质母细胞瘤的因果关系，并识别核心靶点基因 | 研究依赖于公开数据库数据，可能存在样本选择偏倚；未进行实验验证核心靶点的功能机制 | 探究尼古丁暴露与胶质母细胞瘤风险之间的关联 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者数据及尼古丁相关靶点基因 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 孟德尔随机化、网络毒理学分析、机器学习、分子对接、结构动力学分析 | 机器学习（未指定具体模型） | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA | CNGB | 单细胞测序 | NA | CNGB单细胞测序数据库 |
| 85 | 2026-04-14 |
Robust integration and annotation of single-cell and spatial omics data using interpretable gene programs
2026-Apr-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101105
PMID:41421360
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研究论文 | 本文介绍了一个名为SSpMosaic的计算框架，该框架利用可解释的基因程序作为通用锚点，实现了单细胞和空间组学数据的稳健整合与注释 | 提出了以元程序（跨数据集对齐的高阶基因程序表示）作为生物学状态表示的通用锚点，实现了跨批次、模态和物种的一致且准确的整合，并支持无需参考数据的空间特征描述 | NA | 开发一个计算框架，以解决单细胞和空间组学数据整合与注释中的挑战，并实现跨尺度的空间转录组学解卷积 | 单细胞和空间组学数据，包括单核转录组学、染色质可及性和空间转录组学数据 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq | 基于元程序的迁移学习框架 | 转录组数据, 染色质可及性数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics, NanoString | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq | 10x Visium, CosMx, Visium HD | 10x Visium（spot级）, CosMx/Visium HD（亚细胞级） |
| 86 | 2026-04-14 |
Microbial single-cell omics in situ
2026-Apr-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101128
PMID:41576946
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研究论文 | 本文介绍了一种利用激光诱导前向转移技术，在复杂样本中获取高质量微生物单细胞基因组或转录组的方法 | 采用激光诱导前向转移技术，实现了对复杂样本中微生物单细胞的高质量基因组或转录组分析，并能直接分析邻近细菌或宿主细胞的相互作用 | NA | 开发一种可扩展且精确的单细胞方法，以深入理解微生物种群及其与宿主的单细胞相互作用 | 小鼠肠道、人类唾液和肿瘤切片等复杂样本中的微生物单细胞 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 激光诱导前向转移技术 | NA | 基因组、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2026-04-14 |
Deoxynivalenol drives liver injury progression by dysregulating core molecular networks: integrated multi-omics, network toxicology and molecular docking analysis
2026-Apr-08, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2026.110249
PMID:41967175
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研究论文 | 本研究通过整合多组学、网络毒理学和分子对接分析，揭示了脱氧雪腐镰刀菌烯醇（DON）通过失调核心分子网络驱动肝损伤进展的机制 | 首次整合公共转录组数据集、单细胞RNA-seq数据和毒理基因组学数据，结合分子对接和细胞热位移分析，系统解码DON诱导肝损伤的致病网络，并识别出五个核心枢纽基因 | 研究主要基于公共数据集和体外/体内模型验证，人类直接临床证据有限，且DON暴露的长期效应和个体差异需进一步探索 | 解码脱氧雪腐镰刀菌烯醇（DON）在慢性肝病进展至肝硬化和肝细胞癌中的致病网络 | 脱氧雪腐镰刀菌烯醇（DON）诱导的肝损伤，涉及人类肝细胞（THLE-2）和小鼠模型 | 生物信息学与毒理学 | 肝病 | 转录组学、单细胞RNA-seq、毒理基因组学、分子对接、细胞热位移分析（CETSA） | 机器学习建模 | 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | 整合多个公共数据集（GSE139602、GSE25097、GSE136103、GSE149614），并进行体外和体内验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 88 | 2026-04-14 |
A Potential Target for Suppressing Pancreatic Cancer: PDGFRB Regulated by DNA Methylation
2026-Apr-08, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化分析、蛋白质数量性状位点和单细胞RNA测序数据，揭示了PDGFRB基因表达通过DNA甲基化位点cg11042320调控胰腺癌风险的因果路径 | 首次采用整合pQTLs、mQTLs和单细胞数据的孟德尔随机化框架，识别出PDGFRB作为胰腺癌保护因子及其上游甲基化调控机制，并量化了甲基化介导效应（97.62%） | 研究依赖于公共数据库的汇总数据，缺乏实验验证；样本主要基于欧洲人群，需多族群验证；未涉及具体治疗干预效果评估 | 探究DNA甲基化和蛋白质数量性状位点在胰腺癌发展中的因果作用，寻找潜在治疗靶点 | 胰腺癌风险相关的基因表达与表观遗传调控机制 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、中介分析 | 逆方差加权法、敏感性分析模型 | 基因组关联研究数据、表观基因组数据、单细胞转录组数据 | GWAS数据476,245例、GoDMC数据27,750例、pQTL研究35,559例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-04-14 |
SA2E: spatial-aware auto-encoder for cell type deconvolution of spatial transcriptomics data
2026-Apr-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag133
PMID:41863296
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研究论文 | 本文提出了一种空间感知的自编码器框架（SA2E），用于空间转录组学数据的细胞类型去卷积，无需预定义的细胞类型生物标志物 | SA2E通过空间正则化自编码器学习潜在点表示，并利用模拟数据进行监督预训练，从而在无需预定义标记基因的情况下实现细胞类型去卷积 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种无需预定义细胞类型生物标志物的空间转录组学数据细胞类型去卷积方法 | 空间转录组学数据和单细胞RNA-seq数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | 自编码器 | 基因表达数据和空间位置数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2026-04-14 |
Hypergraph representations of single-cell RNA sequencing data for improved cell clustering
2026-Apr-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag148
PMID:41896196
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研究论文 | 本文提出了一种将单细胞RNA测序数据表示为超图的新方法，并开发了两种新颖的聚类算法，以改进细胞类型聚类 | 首次将scRNA-seq数据表示为超图以捕获高阶信息，并提出了两种新的超图随机游走聚类算法（DIPHW和CoMem-DIPHW），后者整合了单细胞表达超图与基因共表达、细胞共表达网络 | 未明确说明算法在超大规模数据集上的计算效率，也未讨论对批次效应等常见scRNA-seq数据问题的处理能力 | 改进单细胞RNA测序数据的细胞类型聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 超图随机游走算法（DIPHW, CoMem-DIPHW） | 基因表达矩阵 | 多个真实世界数据集（人胰腺、小鼠胰腺、人脑、小鼠脑组织）和模拟数据，包括人肺腺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2026-04-14 |
GRNFormer: accurate gene regulatory network inference using graph transformer
2026-Apr-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag144
PMID:41883144
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研究论文 | 本文提出了一种名为GRNFormer的通用图变换器框架，用于从跨物种、细胞类型和平台的转录组学数据中准确推断基因调控网络 | GRNFormer整合了基于变换器的基因表达编码器与变分图自编码器，并采用TF-Walker子图采样策略，有效捕获基因调控相互作用，无需细胞类型注释或先验调控信息 | NA | 解决从单细胞转录组学数据中推断基因调控网络的挑战，包括数据稀疏性、高维度和缺乏可扩展、可泛化的推理模型 | 基因调控网络，涉及人类胚胎干细胞中的多能性回路和外围血单核细胞中的免疫细胞模块 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | 图变换器，变分图自编码器 | 转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2026-04-14 |
Glial dynamics in brain aging: Cellular heterogeneity and regional vulnerability
2026-Apr-07, Progress in neurobiology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.pneurobio.2026.102915
PMID:41956196
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综述 | 本文综述了大脑衰老过程中胶质细胞的动态变化，包括其细胞异质性、区域脆弱性、分子机制及治疗策略 | 整合单细胞转录组学、空间基因组学和功能成像技术，系统揭示了胶质细胞在衰老中的异质性变化及其对认知功能障碍的主动驱动作用 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且胶质细胞区域脆弱性的具体机制仍需进一步研究 | 探讨大脑衰老过程中胶质细胞的动态变化及其在认知衰退和神经退行性疾病中的作用 | 胶质细胞（包括小胶质细胞、星形胶质细胞和少突胶质细胞） | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学, 空间基因组学, 功能成像 | NA | 转录组数据, 空间数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 93 | 2026-04-14 |
AR and ITGAL: Key Mediators of Andrographis paniculata's Anti-Psoriatic Effects Revealed by Multi-Omics Analysis
2026-Apr-07, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了穿心莲抗银屑病作用的关键介质AR和ITGAL | 结合计算预测与体外实验验证，首次系统识别了穿心莲活性成分脱氢穿心莲内酯的抗银屑病作用靶点AR和ITGAL | 研究主要基于计算分析和体外细胞模型，缺乏体内动物实验或临床数据验证 | 探究穿心莲抗银屑病的分子作用机制 | 穿心莲的活性成分及其在银屑病中的潜在靶点 | 多组学分析 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 体外细胞模型 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2026-04-14 |
Integrative Machine Learning and Structural Modeling Identify Multitarget Therapeutic Candidates for Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2026-Apr-07, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.6c00155
PMID:41970850
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研究论文 | 本研究开发了一个整合计算框架，结合机器学习、单细胞转录组学、遗传因果推断和结构建模，以优先考虑针对特发性肺纤维化的多靶点治疗候选药物 | 整合了机器学习、单细胞转录组学、遗传因果推断和结构建模，系统性地识别多靶点治疗候选药物，并提供了结构层面的支持 | 未在实验模型中验证预测的化合物活性，且依赖于现有分子活性数据集的完整性 | 开发一个整合计算框架，优先考虑针对特发性肺纤维化的多靶点治疗候选药物 | 特发性肺纤维化相关的13种受体酪氨酸激酶及其潜在活性化合物 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析, 分子对接, 分子动力学模拟 | 机器学习模型 | 分子活性数据, 单细胞转录组数据, 遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2026-04-14 |
Glandular Cells of Forest Musk Deer Autonomously Synthesize Sex Steroid Hormones
2026-Apr-06, Biology
DOI:10.3390/biology15070583
PMID:41972586
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研究论文 | 本研究利用体外培养的麝香腺细胞模型，探究麝香腺细胞是否具备自主合成性类固醇激素的能力 | 首次揭示麝香腺细胞能够自主合成性类固醇激素，并发现胆固醇可能调控其生物合成 | 研究主要基于体外细胞模型，体内生理环境下的合成机制和调控网络仍需进一步验证 | 探究麝香腺细胞是否具备自主合成性类固醇激素的能力 | 雄性林麝的麝香腺细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 逆转录定量实时聚合酶链反应, 液相色谱-质谱联用 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 代谢物数据 | 未明确指定样本数量，但基于单细胞RNA测序和体外细胞培养实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2026-04-14 |
An AI-Enabled Single-Cell Transcriptomic Analysis Pipeline for Gene Signature Discovery in Natural Killer Cells Linked to Remission Outcomes in Chronic Myeloid Leukemia
2026-Apr-06, Biology
DOI:10.3390/biology15070588
PMID:41972591
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研究论文 | 本文开发了一种基于基因调控网络-人工智能-功能分析（GAFA）的集成生物信息学流程，用于慢性髓系白血病（CML）中自然杀伤（NK）细胞的单细胞转录组分析，以发现与缓解结果相关的基因特征 | 开发了一种集成的单细胞转录组分析流程，首次同时结合基因调控网络架构、人工智能辅助基因面板发现和功能相关性分析，为CML中NK细胞状态与治疗结果关联提供了机制性框架 | 研究样本量较小（仅6名CML患者，15个样本），且结果需要在更大的患者队列中进行验证 | 开发一种集成分析流程，用于发现与慢性髓系白血病治疗结果相关的NK细胞基因特征 | 慢性髓系白血病患者的自然杀伤细胞 | 生物信息学 | 慢性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 单细胞转录组数据 | 6名CML患者（2名早期复发，2名晚期复发，2名持久治疗无缓解），共15个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 97 | 2026-04-14 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal That TXNIP and BIRC3 Contribute to Human Prostate Tumor Progression
2026-Apr-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15070647
PMID:41972735
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了TXNIP和BIRC3基因在人类前列腺肿瘤进展中的作用 | 结合单细胞和空间转录组学技术，首次在空间水平上识别了TXNIP和BIRC3基因在前列腺癌中的表达模式及其与肿瘤血管系统的共定位，为理解肿瘤微环境提供了高分辨率分子图谱 | 样本量相对较小（15个单细胞样本和3个空间转录组样本），且仅基于FFPE组织，可能限制了结果的普遍性 | 探究前列腺癌肿瘤微环境中基因表达的细胞和空间动态，以改进治疗策略 | 人类前列腺组织样本，包括正常和肿瘤组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 15个前列腺样本（8个正常, 7个肿瘤）用于单细胞RNA测序；3个FFPE前列腺组织切片用于空间转录组学 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium FFPE平台（55 µm捕获点） |
| 98 | 2026-04-14 |
Cre-dependent gene expression enables thymic development of autoreactive tumor-associated antigen targeting CAR-T cells
2026-Apr-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.12.047
PMID:41445186
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研究论文 | 本研究开发了一种在体内持续生成CAR-T细胞的平台，通过基因工程改造造血干细胞，使其在胸腺中表达肿瘤特异性CAR，以克服现有CAR-T疗法持久性不足和肿瘤复发的问题 | 首次利用胸腺微环境支持造血干细胞分化为T细胞的特性，开发了可诱导表达的CAR基因系统，以绕过胸腺阴性选择，实现自体反应性肿瘤相关抗原靶向CAR-T细胞的胸腺内发育 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证；胸腺内CAR-T细胞发育的长期安全性和有效性仍需进一步评估 | 开发一种能够持续在体内生成CAR-T细胞的新策略，以解决现有CAR-T疗法持久性不足和肿瘤复发的问题 | 造血干细胞和祖细胞、胸腺微环境、CD19 CAR-T细胞 | 免疫治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序、连续移植研究、基因工程 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2026-01-04 |
Spatial transcriptomics in epilepsy research: Early successes, opportunities, and challenges
2026-Apr, Epilepsia
IF:6.6Q1
DOI:10.1002/epi.70079
PMID:41483454
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2026-04-14 |
Designing 5' UTR sequences improves the capacity of mRNA therapeutics in preclinical models of aging and obesity
2026-Apr-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.12.060
PMID:41485049
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研究论文 | 本研究通过设计5' UTR序列，提高了mRNA疗法在衰老和肥胖小鼠模型中的治疗效果 | 发现RPL18、RPL35和RPS9的5' UTR能增强合成mRNA的蛋白质输出，尤其在活性氧水平高的细胞中效果显著，并首次在衰老和肥胖模型中验证了其提升免疫反应的能力 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用效果尚需进一步验证，且机制探索中部分突变UTR的独立作用未完全阐明 | 探索5' UTR序列设计以提升mRNA疗法的治疗潜力，特别是在衰老和肥胖相关疾病中的应用 | 合成mRNA的5' UTR序列，以及其在人类和小鼠细胞、衰老小鼠和高脂饮食诱导的肥胖小鼠模型中的效果 | 生物信息学与基因治疗 | 衰老与肥胖 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 核糖体分析, 交联免疫沉淀测序 | NA | 序列数据, 转录组数据, 蛋白质表达数据 | 小鼠模型（包括衰老小鼠和高脂饮食诱导的肥胖小鼠），以及人类和小鼠细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, RNA-seq | NA | NA |