单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 40432 篇文献,本页显示第 81 - 100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-06-13
Tumor immune microenvironment in cervical cancer: Histological subtype-specific immune landscapes and therapeutic implications
2026-Jul, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
综述 综述了宫颈癌不同组织学亚型中肿瘤免疫微环境的异质性,重点关注免疫细胞组成、基质结构和代谢影响,并探讨了亚型特异性免疫治疗策略 首次系统总结宫颈癌不同组织学亚型(鳞癌、腺癌、腺鳞癌及罕见亚型)的免疫微环境异质性,结合单细胞及空间转录组学数据揭示亚型特异性免疫特征 未纳入原始实验数据,依赖已发表文献的二次分析,可能受限于当前研究样本量和数据质量 阐明宫颈癌组织学亚型特异性免疫微环境差异,为开发分层治疗策略提供理论基础 宫颈癌主要组织学亚型(鳞癌、腺癌、腺鳞癌、神经内分泌癌、透明细胞癌及胃型腺癌)的肿瘤免疫微环境 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据 NA 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序,10x Visium 用于空间转录组学分析
82 2026-06-13
Neutrophil extracellular traps-related biomarkers in idiopathic pulmonary arterial hypertension: A machine learning-based identification and experimental validation study
2026-Jul, Molecular immunology IF:3.2Q3
研究论文 采用机器学习与实验验证相结合的方法,识别特发性肺动脉高压中与中性粒细胞胞外陷阱相关的生物标志物 首次通过整合生物信息学与机器学习算法(WGCNA、三种互补算法)系统筛选出五个NETs相关生物标志物(CSF3R、MGAM、ITGAM、TLR8、SELP),并结合单细胞RNA测序和动物模型进行实验验证 未提及具体限制,但可能包括样本量较小、仅使用公共数据库、缺乏多中心验证等潜在局限 识别特发性肺动脉高压中与中性粒细胞胞外陷阱相关的分子生物标志物,揭示其致病机制 特发性肺动脉高压患者与对照组样本,以及单核细胞诱导的大鼠肺动脉高压模型 机器学习 肺动脉高压 转录组测序、单细胞RNA测序、蛋白表达检测 加权基因共表达网络分析、三种机器学习算法(具体类型未明确) 基因表达数据、单细胞转录组数据 40例特发性肺动脉高压患者与34例对照样本(训练集),独立验证集数据未明确说明 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA 数据集GSE117261和GSE48149来源的测序平台未明确说明
83 2026-06-13
Transcriptomic sequencing analysis of the tumor microenvironment atlas and potential mechanisms of metastasis in papillary thyroid carcinoma
2026-Jul, Molecular immunology IF:3.2Q3
研究论文 整合单细胞RNA测序与批量转录组数据,绘制甲状腺乳头状癌肿瘤微环境图谱,揭示转移相关细胞亚群和机制 首次整合肿瘤、瘤周甲状腺和淋巴结组织的单细胞RNA-seq数据,结合机器学习模型预测淋巴结转移状态和预后,并识别出多种与转移相关的细胞亚群(如Mac-APOC1巨噬细胞、RGS5+肌成纤维细胞)及其动态转变 NA 阐明甲状腺乳头状癌转移的微环境基础,构建预测淋巴结状态和预后的机器学习模型 甲状腺乳头状癌患者的肿瘤组织、瘤周甲状腺组织和淋巴结组织 机器学习 甲状腺癌 单细胞RNA测序、批量转录组测序 随机森林、Lasso-Cox回归 单细胞转录组数据、批量转录组数据 包括转移性和非转移性病例的肿瘤、瘤周甲状腺和淋巴结样本 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
84 2026-06-13
Synergistic Oncogenesis Cooperative Role of Epstein Barr Virus and Human Papillomavirus in Cancer Progression
2026-Jul, Reviews in medical virology IF:9.0Q1
综述 综述了EB病毒和高危型人乳头瘤病毒在癌症进展中的协同致癌作用,探讨了共感染的分子和免疫机制 区分了病毒共存在与生物学活性共感染,并总结了共感染在促进基因组不稳定性、慢性炎症和免疫逃逸中的协同机制 由于方法学异质性和病毒检测技术差异,因果协同作用尚缺乏充分验证 总结EBV-HPV共感染在致癌作用中的合作角色,并指出未来研究方向 EBV和HPV病毒及其在宫颈癌、口咽癌和鼻咽癌等上皮恶性肿瘤中的共感染 数字病理学 宫颈癌, 口咽癌, 鼻咽癌 PCR, 原位杂交, 免疫组织化学, 空间转录组学, 单细胞分析 NA 文本, 图像 NA NA 空间转录组学, 单细胞分析 NA NA
85 2026-06-13
Characterization of T-Cell Ubiquitination in Melanoma and Development of a Risk Signature Using Single-Cell and Bulk RNA-Seq
2026-Jul, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 利用单细胞和 bulk RNA-seq 数据,鉴定黑色素瘤中与泛素化相关的预后基因特征,并探索其与免疫微环境的关系 首次整合单细胞和 bulk RNA-seq 数据,建立基于泛素化相关基因的六基因预后特征,并揭示其在 T 细胞分化和免疫调控中的作用 标题和摘要未提及具体局限性 开发基于泛素化相关基因的预后特征,并探索其在皮肤黑色素瘤免疫调节中的作用 皮肤黑色素瘤的转录组数据,包括单细胞和 bulk RNA-seq 数据 机器学习 黑色素瘤 RNA-seq, 单细胞 RNA-seq Cox 回归 转录组数据 NA NA 单细胞 RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
86 2026-06-13
Mining single-cell transcriptomic data reveals distinct T-cell population in pediatric B-ALL and AML at diagnosis
2026-Jun-23, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 通过整合单细胞转录组数据分析,揭示儿童B-ALL和AML在诊断时T细胞群体的差异 首次在儿童白血病中系统比较B-ALL与AML的T细胞亚群异质性,并发现一种表达血红蛋白基因的稀有T细胞亚群与B-ALL预后改善相关 仅利用已有公开数据集,可能受不同实验批次和平台差异影响;样本量中AML患者数相对较少 表征儿童B-ALL和AML患者骨髓中T细胞亚群的转录组特征,为免疫治疗策略提供依据 儿童B-ALL(89例)和AML(26例)患者及健康捐赠者(9例)的骨髓T细胞 单细胞转录组学 儿童B细胞急性淋巴细胞白血病,急性髓系白血病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 总计124例样本(89例B-ALL、26例AML、9例健康供者),47610个T细胞 NA 单细胞RNA测序 NA 采用整合分析已有单细胞RNA测序数据集
87 2026-06-13
A comprehensive single-cell atlas of monoallelic expression across various tissues in zebrafish
2026-Jun-11, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序和全基因组测序,构建了斑马鱼多种组织中的单等位基因表达综合图谱 首次在斑马鱼中构建单细胞水平的单等位基因表达图谱,揭示了MAE在发育过程中的动态变化及其对组织特化的贡献 研究仅限于斑马鱼的两个发育阶段,可能未完全覆盖MAE的整个动态过程;此外,部分基因的MAE检测可能受限于细胞类型分辨率和测序深度 系统表征斑马鱼发育过程中单等位基因表达的动态特征及其功能意义 斑马鱼胚胎和成体组织的细胞 基因组学 不适用 单细胞RNA测序, 全基因组测序 最大似然估计 单细胞RNA测序数据, 全基因组测序数据 50,819个细胞,涵盖37种细胞类型 Illumina 单细胞RNA测序, 全基因组测序 Illumina NovaSeq 未提供具体平台配置细节
88 2026-06-13
A 3D morphogenetic blueprint for metastatic outgrowth in breast cancer
2026-Jun-11, Cell IF:45.5Q1
研究论文 结合单细胞RNA测序、空间转录组学、AI支持的三维成像及小鼠功能研究,揭示了乳腺癌转移扩增的三维形态发生蓝图 首次发现转移性小梁形态发生程序(MTM)利用发育性分支形态发生构建三维小梁晶格结构,并鉴定ETV1/4/5为MTM的主调控因子 未提供具体局限性描述 阐明乳腺癌转移性扩增的组织水平形态发生过程 人类乳腺癌组织样本和小鼠模型中的转移灶及原发肿瘤 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、三维成像、染色质免疫沉淀测序 NA 基因表达数据、成像数据、染色质免疫沉淀测序数据 人类乳腺癌样本与小鼠模型,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
89 2026-06-13
Long-acting IL-7 induces distinct transcriptomic features in peripheral T cells of patients with solid tumors
2026-Jun-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 研究长效IL-7(rhIL-7-hyFc)对实体瘤患者外周T细胞的转录组影响 首次通过单细胞转录组学揭示长效IL-7对实体瘤患者外周T细胞的转录特征变化,发现二次给药后增殖和转录变化减弱,并检测到IL-7信号通路远端元件下调 未详细说明样本量大小及长期随访数据 探究长效重组人IL-7(rhIL-7-hyFc)对晚期实体瘤患者外周T细胞的分子机制 晚期实体瘤患者的外周T细胞 数字病理学 实体瘤(癌症) 单细胞转录组学、流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞转录组测序
90 2026-06-13
A conserved re-epithelialization program underlies malignancy in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Jun-08, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 通过高分辨率空间转录组学,识别了一个保守的上皮程序MP10,该程序标记了胰腺导管腺癌中的侵袭性癌细胞,并揭示了其与伤口愈合相关的机制 首次发现并描述了一个保守的上皮程序MP10,该程序在胰腺癌从原位癌向侵袭性癌转变中起关键作用,并阐明其与伤口边缘角质细胞再上皮化程序的相似性 NA 探究胰腺导管腺癌从原位癌向侵袭性癌转变的分子机制 人类和小鼠的胰腺导管腺癌细胞以及正常胰腺组织 数字病理学 胰腺癌 空间转录组学 NA 图像(空间转录组数据) NA(包含人类和小鼠样本) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 高分辨率空间转录组学技术
91 2026-06-13
The architecture of salt tolerance: A multi-scale view of sodium transport in plants
2026-Jun-08, Plant communications IF:9.4Q1
综述 本文整合经典方法和单细胞RNA测序数据,提供了植物中钠稳态的多尺度视图,探讨了从离子感知到组织水平分布的钠调控机制 利用公开的单细胞RNA测序数据集生成主要钠转运蛋白SOS1及其钙依赖性调控因子的细胞类型特异性表达谱,揭示双子叶植物(拟南芥)和单子叶植物(水稻)在离子调控上的关键差异,并将亚细胞定位和内膜运输机制整合到组织层面 未明确提及自身局限性,但依赖于公开数据集可能受限于数据质量和覆盖范围,且综述性质缺乏实验验证 综合理解植物如何通过离子感知、膜运输、亚细胞隔离和组织水平分布等机制调控钠稳态,以支持耐盐作物的开发 拟南芥和水稻中涉及钠转运的离子转运蛋白(如SOS1、HKTs)及其表达模式 植物生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 公开可用的单细胞RNA测序数据集,具体样本数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
92 2026-06-13
USP1-mediated lipophagy-lipogenesis axis drives cholangiocarcinoma progression and immune evasion
2026-Jun-08, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过多组学分析揭示USP1介导的脂吞噬-脂肪生成轴驱动胆管癌进展和免疫逃逸的机制 首次发现USP1通过协调增强脂吞噬和脂肪生成,建立系统级代谢调控网络,促进长链不饱和脂肪酸积累,并通过FABP5优先被肿瘤相关巨噬细胞摄取,抑制细胞毒性T细胞活性,形成代谢-免疫串扰的正反馈环路 未在论文标题和摘要中明确提及局限性 阐明胆管癌中代谢重编程与免疫逃逸之间的分子联系,为开发靶向肿瘤微环境的疗法提供基础 胆管癌组织和细胞 数字病理学 胆管癌 非靶向代谢组学, 下一代测序, 数据库分析, 蛋白质组学, 代谢表型实验, 单细胞RNA测序, Olink蛋白质组学, 流式细胞术, 多重免疫组化 NA 组学数据, 图像, 文本 未在论文标题和摘要中明确提及样本量 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
93 2026-06-13
Multi-omics and experimental evidence in human chondrocytes identify caspase-8 as a non-apoptotic regulator of inflammatory, senescent, and fibrotic signaling in osteoarthritis
2026-Jun-06, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
研究论文 通过多组学与实验证据,在人软骨细胞中确定caspase-8作为骨关节炎中炎症、衰老和纤维化信号的非凋亡调控因子 首次系统揭示caspase-8在骨关节炎软骨细胞中的非凋亡调控功能,整合多组学分析与功能验证,发现其作为炎症-衰老-纤维化信号中枢枢纽的作用 研究主要基于体外实验和公开数据集,需要进一步动物模型和临床试验验证;siRNA敲低后无明显效应,暗示可能存在补偿机制 探究caspase-8在骨关节炎发病机制中的非凋亡调控作用及其治疗潜力 人类骨关节炎软骨细胞 机器学习和生物信息学 骨关节炎 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 定量蛋白质组学, 孟德尔随机化 NA 转录组数据, 蛋白质组数据, 空间转录组数据 多个公开数据集(GSE168505, GSE246425, GSE287861, GSE26475, GSE254844, GSE255460)及体外细胞实验 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
94 2026-06-13
Human microglial transitions at the Aβ-tau inflection point associate with divergent pathways to dementia and resilience
2026-Jun-04, Nature medicine IF:58.7Q1
research paper 结合空间转录组学和单细胞核RNA测序,研究了八旬老人和百岁老人大脑中Aβ和tau诱导的小胶质细胞状态转变与痴呆或认知韧性相关的机制 首次在人类大脑中识别出Aβ- tau拐点处的六个组织域,并发现小胶质细胞从早期炎症状态向晚期抗原呈递状态的转变与痴呆韧性机制相关联 样本量有限且仅聚焦于前额叶皮层,未能涵盖其他脑区或不同年龄段的广泛变化 探索阿尔茨海默病中Aβ和tau诱导的细胞反应机制,并揭示认知韧性相关的病理模式 八旬老人(有或无痴呆)和认知完好的百岁老人脑组织样本 spatial transcriptomics, single-cell RNA sequencing 阿尔茨海默病 空间转录组学, 单细胞核RNA测序 NA 基因表达数据 包括八旬老人(有或无痴呆)和百岁老人等多个样本组,具体数量文中未明确说明 10x Genomics 空间转录组学, 单细胞核RNA测序 10x Visium, 10x Chromium 空间转录组学采用10x Visium技术,单细胞核RNA测序采用10x Chromium平台
95 2026-06-13
Spatiotemporal regulation of arbuscular mycorrhizal symbiosis at cellular resolution
2026-Jun-02, The Plant cell
研究论文 通过单细胞分辨率的空间转录组学和阶段特异性TRAP-seq,揭示了水稻中丛枝菌根共生在细胞水平上的时空动态调控 首次结合单细胞空间转录组学与阶段特异性翻译核糖体亲和纯化RNA测序(TRAP-seq),在细胞水平上解析了丛枝菌根共生中真菌结构转录活性、植物细胞身份重编程以及乔木细胞隐藏功能异质性 研究主要关注转录和翻译层面的调控,未涉及蛋白质组或代谢组分析,且仅以水稻为模型,物种适用性需进一步验证 阐明丛枝菌根共生在细胞水平上的时空动态调控机制,特别是营养交换和真菌发育的协调 水稻(Oryza sativa)根被根内球囊霉(Rhizophagus irregularis)定殖的样本 机器学习和数字病理学(因涉及单细胞数据分析) NA 空间转录组学、单细胞RNA测序、TRAP-seq NA 基因表达数据(转录组和翻译组) 水稻根被真菌定殖的样本,但具体样本数量未明确 10x Genomics, Illumina 空间转录组学,单细胞RNA-seq,TRAP-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium用于单细胞转录组文库构建,Illumina NovaSeq用于测序;TRAP-seq使用阶段特异性启动子驱动的核糖体亲和纯化
96 2026-06-13
Unveiling the impact of electroacupuncture on retinal cells in myopic guinea pigs via single-cell sequencing
2026-Jun, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 利用单细胞测序揭示电针对近视豚鼠视网膜细胞的影响 首次通过单细胞RNA测序技术系统揭示电针对近视豚鼠视网膜中多种细胞类型(如Müller胶质细胞、视锥细胞和小胶质细胞)的功能调控机制 未说明研究的局限性 探究电针干预对近视豚鼠视网膜细胞功能特性的影响 近视豚鼠模型中的视网膜细胞 数字病理学 近视 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
97 2026-06-13
High MAP3K6 expression in spinal cord injury tissues enhances neuronal apoptosis: insights from multi-omics data integrating WGCNA, machine learning and experimental validation
2026-Jun, The International journal of neuroscience
研究论文 通过多组学分析结合WGCNA、机器学习和实验验证,发现MAP3K6高表达促进脊髓损伤后神经元凋亡 首次通过整合WGCNA、机器学习及单细胞RNA测序多组学方法,识别并实验验证MAP3K6作为脊髓损伤的关键调控因子和潜在诊断标志物 NA 鉴定脊髓损伤的可靠生物标志物,并揭示其分子机制 脊髓损伤组织中的差异表达基因及关键调控因子MAP3K6 机器学习 脊髓损伤 RNA-seq, 单细胞RNA测序 随机森林, WGCNA 基因表达数据 GSE226238数据集(脊髓损伤组与对照组)及独立验证集GSE151371 NA RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA NA
98 2026-06-13
Locus-Specific Human Endogenous Retrovirus ERVK18 Expression Indicates an Inflamed Microenvironment and Favorable Immunotherapy Outcome in Small Cell Lung Cancer
2026-Jun-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
research paper 本研究探讨了人类内源性逆转录病毒ERVK18在小细胞肺癌中的表达与免疫治疗预后的关系 首次发现位点特异性ERVK18转录本可作为小细胞肺癌免疫治疗的预后和预测性生物标志物 NA 探究ERVK18表达与SCLC免疫微环境及免疫治疗结局的关联 小细胞肺癌患者 machine learning lung cancer RNA-seq, single-cell RNA sequencing, IHC, RNA-fluorescence in situ hybridization NA gene expression data, image IMpower133队列271例,PKUPH队列40例,组织微阵列48例 10x Genomics bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics 10x Chromium, PhenoCycler-Fusion TELESCOPE分析ERVK表达,10x Chromium单细胞RNA测序,PhenoCycler-Fusion多重免疫组化
99 2026-06-13
A proliferative subpopulation of coelomocytes in sea cucumber is identified and characterized by single-cell RNA-seq after evisceration
2026-Jun, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序鉴定并表征海参排脏后体腔细胞中具有增殖能力的亚群 首次通过scRNA-seq全面分析海参体腔及水管系统中的体腔细胞亚群,并发现排脏后一个具有增殖能力的亚群(簇10)在体腔和水管系统中表现出不同的分化潜力与动态变化 研究主要基于单细胞转录组分析,缺乏对簇10亚群增殖和分化能力的体内功能验证;另外,排脏后体腔细胞恢复的具体分子机制尚未完全阐明 研究海参排脏后体腔细胞在体腔和水管系统中的恢复机制,特别是增殖亚群的鉴定和功能表征 仿刺参(Apostichopus japonicus)的体腔细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 海参体腔细胞样本(具体数量未提及) NA single-cell RNA-seq NA NA
100 2026-06-13
Integrative assessment of gamete and embryo quality in porcine in vitro production: A comprehensive review
2026-Jun, Reproductive biology IF:2.5Q3
综述 全面梳理猪体外胚胎生产中配子与胚胎质量评估的现有方法,整合其他哺乳动物模型见解,探讨物种特异性挑战与未来发展方向 提出将先进成像、代谢组学、单细胞转录组学等新兴技术整合到猪IVP质量评估中,并强调建立多参数数据驱动框架和物种特异性生物标志物 现有评估方法缺乏标准化、客观标准,新兴技术在实际应用中验证不足且缺乏实验室间标准化,成本效益和重现性仍需进一步验证 系统总结猪体外胚胎生产中配子和胚胎质量评估方法,为建立标准化、客观评估体系提供综合见解 猪的卵母细胞、精子和体外胚胎 机器学习 NA 单细胞转录组学、代谢组学、先进成像 机器学习、人工智能 影像、组学数据 NA NA 单细胞转录组学 NA NA
回到顶部