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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-04-19
Beyond macrophages: FIPV tropism includes T and B lymphocytes
2026-Feb, Veterinary microbiology IF:2.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了猫传染性腹膜炎病毒(FIPV)不仅感染单核/巨噬细胞,还能感染T和B淋巴细胞,并能在这些细胞内进行病毒基因组复制 首次在自然感染FIP的猫体内,通过单细胞RNA测序等技术,证实FIPV可感染T和B淋巴细胞并进行病毒基因组复制,修正了现有关于FIPV仅选择性感染单核/巨噬细胞的致病模型 研究样本来源于自然感染的猫,可能存在个体差异;研究主要关注淋巴结组织,其他组织中的病毒感染情况可能不同 探究猫传染性腹膜炎病毒(FIPV)的细胞嗜性范围及免疫细胞入侵机制 自然发生渗出性猫传染性腹膜炎(FIP)的猫的肠系膜淋巴结穿刺液和福尔马林固定石蜡包埋的淋巴结组织 单细胞组学 猫传染性腹膜炎 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 原位杂交 NA RNA序列数据, 图像数据 来自自然感染FIP猫的肠系膜淋巴结穿刺液和淋巴结组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
82 2026-04-19
Gene editing and multi-omics approaches to study early embryogenesis in cattle
2026-Jan-09, Reproduction, fertility, and development
综述 本文综述了利用多组学分析和基因编辑技术研究牛早期胚胎发育的进展 整合单细胞多组学技术与CRISPR等靶向功能工具,以高分辨率解析牛早期胚胎发育的复杂动态 NA 提高对牛早期胚胎发育机制的理解,以改善牛生育力 牛早期胚胎 多组学分析 NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 代谢组学, 蛋白质组学, CRISPR-Cas9, RNA编辑, 碱基编辑, Trim-Away NA 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 NA NA
83 2026-04-19
Elucidating a Myofibroblast-dominated Fibrotic Niche in Crohn's Disease-associated Fibrostenosis Through High-resolution Spatial Transcriptomics
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过高分辨率空间转录组学揭示了克罗恩病相关纤维狭窄中肌成纤维细胞主导的纤维化微环境 首次在病例水平应用高分辨率空间转录组学,明确了纤维化微环境的空间组织,并鉴定了肌成纤维细胞的起源及周细胞向肌成纤维细胞样表型的重编程 研究样本量有限(仅2例用于空间转录组学分析),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性验证 阐明克罗恩病相关纤维狭窄的细胞身份和分子机制,以识别抗纤维化治疗靶点 克罗恩病患者的回肠组织,包括正常、非狭窄性和狭窄性病例 数字病理学 克罗恩病 高分辨率空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫荧光,原代周细胞培养,定量PCR NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,组织学图像 空间转录组分析:2例回肠标本(1例非纤维化,1例纤维狭窄);单细胞RNA测序验证:158个样本;组织学分析:104例(25例正常,35例非狭窄性CD,44例狭窄性CD);超声回顾:117例CD患者 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
84 2026-04-19
DOCK10 Regulates Insulin Hypersecretion in Insulinoma and Serves as a Diagnostic and Therapeutic Target
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示了DOCK10在胰岛素瘤中调控胰岛素过度分泌的分子机制,并探索其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 首次发现DOCK10在胰岛素瘤的胰岛素分泌成分中选择性过表达,并揭示了DOCK10-Cdc42轴在调控胰岛素分泌中的新作用 研究主要基于体外细胞模型、小鼠异种移植模型和患者来源的类器官,需要进一步在人体临床试验中验证DOCK10作为诊断和治疗靶点的有效性 识别胰岛素瘤中胰岛素过度分泌的分子机制,并开发改进的诊断工具和治疗策略 人类胰岛素瘤手术标本、匹配的类器官、MIN6小鼠胰岛素瘤细胞、异种移植小鼠模型 分子生物学与肿瘤学 胰岛素瘤 bulk RNA测序、单细胞RNA测序、定量聚合酶链反应、免疫组织化学 NA RNA测序数据、基因表达数据、组织图像 人类胰岛素瘤手术标本及其匹配类器官的生物样本库 NA 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 NA NA
85 2026-04-19
Novel Acinar Metaplastic States Uncovered in Exocrine Pancreas Disease
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了外分泌胰腺疾病中腺泡细胞向导管化生(ADM)的保守程序,并识别了新的化生状态 发现了先前未被识别的不同化生状态,包括一个“门户”ADM群体,并揭示了胰腺癌亚型在早期PanIN病变中就已指定 研究主要基于小鼠模型,人类组织验证有限,且样本数量相对较少 全面定义临床相关外分泌胰腺疾病中的化生反应,以了解癌症风险增加机制 小鼠模型中的胰腺腺泡细胞及其微环境,以及人类胰腺组织 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 超过300,000个单细胞 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 CosMx CosMx空间转录组学
86 2026-04-19
A mouse organoid platform for modeling cerebral cortex development and cis-regulatory evolution in vitro
2025-Dec-15, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本文开发了一种从小鼠外胚层干细胞生成大脑皮层类器官的可重复协议,用于模拟皮层发育和顺式调控进化 首次利用小鼠类器官平台结合单细胞RNA测序,全面绘制了发育中皮层细胞类型的顺式调控变异图谱,揭示了动态等位基因失衡 研究基于体外类器官模型,可能无法完全复制体内环境的复杂性 研究大脑皮层发育的基因调控网络和顺式调控进化机制 小鼠大脑皮层类器官,源自实验室小鼠和四种野生近交系杂交的F1代外胚层干细胞 发育生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 类器官模型 单细胞转录组数据 使用来自实验室小鼠(C57BL/6J)与四种野生近交系杂交的F1代外胚层干细胞生成的皮层类器官 NA 单细胞RNA测序 NA NA
87 2026-04-19
Expression of ACTR3 in cervical cancer and impact on immune cell infiltration and prognosis: A comprehensive analysis based on bulk RNA-Seq and single-cell RNA-Seq
2025-Dec-05, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过整合bulk RNA-Seq和单细胞RNA-Seq数据,分析了ACTR3在宫颈癌中的表达及其对免疫细胞浸润和患者预后的影响 首次将PI3K/Akt/mTOR通路基因ACTR3与宫颈癌的肿瘤免疫微环境及预后联系起来,并利用单细胞RNA测序技术解析了表达ACTR3的免疫细胞亚群 研究主要基于生物信息学分析和回顾性数据,需要进一步的实验验证来确认ACTR3的功能机制 探究ACTR3过表达是否影响宫颈癌患者的生存,并阐明其对肿瘤免疫微环境的作用 宫颈鳞状细胞癌和宫颈内膜腺癌(CESC) 生物信息学 宫颈癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组化 LASSO Cox回归, 诺模图 基因表达数据, 临床数据 未明确指定具体样本数量,但使用了公共数据库的RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
88 2026-04-19
A parabrachial hub for need-state control of enduring pain
2025-11, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学、神经操控、活动记录和计算建模,揭示了表达神经肽Y受体Y1的臂旁核神经元在长期持续性疼痛中的关键作用,并发现饥饿、口渴或捕食者信号能通过释放NPY抑制这些神经元,从而缓解疼痛 首次识别出臂旁核中表达Y1受体的神经元作为内源性镇痛枢纽,并证明其活动能预测功能应对行为,且多种生理需求状态(如饥饿、口渴)能通过NPY释放抑制这些神经元以缓解持续性疼痛 NA 探究慢性疼痛条件下持续性疼痛的中枢机制,特别是组织愈合后疼痛信号的调控 表达神经肽Y受体Y1的臂旁核神经元及其在疼痛和生理需求状态下的活动 神经科学 慢性疼痛 空间转录组学、神经操控、活动记录、计算建模 NA 转录组数据、神经活动数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
89 2026-04-19
ST2HE: A Cross-Platform Framework for Virtual Histology and Annotation of High-Resolution Spatial Transcriptomics Data
2025-Oct-13, ArXiv
PMID:41281202
研究论文 本文提出了一个跨平台生成框架ST2HE,用于从高分辨率空间转录组数据合成虚拟H&E图像,以支持组织学注释 ST2HE采用一步扩散模型整合细胞核形态和空间转录坐标,实现了跨组织类型和平台的高保真虚拟组织学图像生成,并支持条件性和组织无关的变体 未明确提及具体的数据集规模限制或模型泛化能力的详细评估 开发一个标准化框架,用于高分辨率空间转录组数据的虚拟组织学注释和表型分类 乳腺癌、非小细胞肺癌和卡波西肉瘤的组织样本 计算病理学 乳腺癌, 非小细胞肺癌, 卡波西肉瘤 空间转录组学 扩散模型 空间转录组数据 NA NA 高分辨率空间转录组学 NA NA
90 2026-04-19
Healing of lytic lesions and restoration of bone health in multiple myeloma through sclerostin inhibition
2025-Aug-22, Experimental hematology & oncology IF:9.4Q1
研究论文 本研究探讨了通过抑制硬化素(Scl-ab)来促进多发性骨髓瘤(MM)患者溶骨性病变愈合和恢复骨骼健康的潜力 首次在临床前模型和患者样本中系统评估了Scl-ab对MM骨骼疾病的修复作用,并证实其与抗癌药物联用时的协同抗肿瘤效果 研究包含回顾性临床分析,需要前瞻性临床试验进一步验证;动物模型结果向人类转化的有效性需更多验证 探究硬化素抑制剂(Scl-ab)能否促进MM骨骼修复、增强抗癌疗效并改善患者骨骼健康 多发性骨髓瘤小鼠模型、患者来源样本(包括缓解期患者) NA 多发性骨髓瘤 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA RNA测序数据、临床回顾性数据 临床前动物模型及患者样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
91 2026-04-19
Peripheral blood neutrophils contribute to Claudin18.2-specific CAR-T cell treatment resistance in advanced gastric cancer
2025-Jun, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本研究探讨了外周血中性粒细胞在晚期胃癌患者接受Claudin18.2特异性CAR-T细胞治疗中导致耐药的作用 首次将中性粒细胞与淋巴细胞比值(NLR)与CLDN18.2特异性CAR-T细胞治疗的预后联系起来,并通过单细胞RNA测序鉴定出与疾病进展相关的循环中性粒细胞亚群(NE-3)及其促肿瘤机制 需要进一步验证,并探索减轻中性粒细胞诱导的免疫抑制的策略 研究CLDN18.2特异性CAR-T细胞治疗在晚期胃癌中疗效差异的机制,特别是中性粒细胞介导的耐药作用 接受CLDN18.2特异性CAR-T细胞治疗的晚期胃癌患者及其外周血样本 肿瘤免疫学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 临床数据,单细胞RNA测序数据 未明确指定患者数量,但涉及接受CAR-T治疗的胃癌患者队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
92 2026-04-19
Choroid Plexus as a Mediator of CNS Inflammation in Multiple Sclerosis
2024-Dec, Multiple sclerosis (Houndmills, Basingstoke, England)
综述 本文探讨了脉络丛在多发性硬化症(MS)中作为中枢神经系统炎症介质的作用 重新评估脉络丛在MS神经炎症中的关键角色,结合空间转录组学等无偏方法探索疾病新驱动因素 作为观点综述,主要基于现有文献分析,缺乏原始实验数据验证 阐明脉络丛如何通过脑脊液调节MS相关的神经炎症 多发性硬化症患者的脑组织和脑脊液标本 数字病理学 多发性硬化症 空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学、脂质组学 NA 脑组织标本、脑脊液标本 NA NA 空间转录组学 NA NA
93 2026-04-19
A prenatal skin atlas reveals immune regulation of human skin morphogenesis
2024-11, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究构建了一个全面的人类产前皮肤多组学参考图谱,揭示了先天免疫细胞(如巨噬细胞)通过与皮肤非免疫细胞的相互作用,在皮肤形态发生(如毛囊形成、无瘢痕伤口愈合和血管生成)中发挥关键作用 首次系统性地整合单细胞和空间转录组学数据,构建了人类产前皮肤(7-17周)的多组学图谱,明确了巨噬细胞等免疫细胞在皮肤形态发生中的非免疫功能,并通过干细胞来源的皮肤类器官模型验证了巨噬细胞对内皮细胞发育的调控作用 皮肤类器官模型缺乏免疫细胞,且内皮细胞的异质性和数量显著减少,限制了其在完整模拟体内皮肤微环境方面的应用 探究先天免疫细胞(特别是巨噬细胞)在人类皮肤形态发生中的功能,超越其传统的免疫作用 人类产前皮肤(7-17孕周)、人胚胎干细胞和诱导多能干细胞来源的皮肤类器官、成人皮肤 单细胞组学与空间转录组学 皮肤发育与遗传性毛发/皮肤疾病 单细胞转录组测序、空间转录组学、多组学整合分析 皮肤类器官模型 单细胞RNA-seq数据、空间转录组数据 人类产前皮肤样本(7-17孕周),具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
94 2026-04-19
Single-Cell View of Tumor Microenvironment Gradients in Pleural Mesothelioma
2024-Nov-01, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术构建了胸膜间皮瘤肿瘤微环境的全面细胞图谱,并识别了与不良预后相关的癌症内在程序、新的胎儿样内皮细胞群以及NKG2A:HLA-E相互作用作为潜在治疗靶点 首次构建了胸膜间皮瘤的单细胞RNA测序图谱,发现了与疾病结局相关的癌症内在程序、新的胎儿样内皮细胞群,并验证了NKG2A:HLA-E相互作用作为新的治疗轴 NA 改善对胸膜间皮瘤肿瘤微环境的理解,以提升免疫治疗反应 胸膜间皮瘤的肿瘤微环境细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
95 2026-04-19
Titration of RAS alters senescent state and influences tumour initiation
2024-09, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过体外和体内模型探索了致癌RAS剂量对细胞衰老和肿瘤起始的影响,揭示了剂量依赖性表型连续体 首次在单细胞分辨率下定义了致癌RAS剂量驱动的衰老谱系,并关联了不同剂量水平与肿瘤起始表型 研究主要基于小鼠肝细胞模型,人类肝癌中的直接验证尚需进一步研究 探究致癌RAS剂量如何调控细胞衰老状态并影响肿瘤起始过程 小鼠肝细胞及肝癌模型 单细胞组学 肝癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
96 2026-04-19
Improved characterization of single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 评估Element Biosciences的亲和性测序技术在单细胞RNA-seq中准确测序通过同聚物引物区域的能力及其对多聚腺苷酸化位点分析的影响 首次系统评估Element Aviti平台的亲和性测序化学在单细胞RNA-seq中直接测序通过poly(dT)引物同聚物区域的能力,并开发了改进的接头修剪和比对流程 与单端比对相比,配对端比对并未持续提高读段映射率;未排除其他新兴平台可能具有类似性能 改进单细胞RNA-seq文库的表征方法,特别是多聚腺苷酸化位点的精确量化 单细胞RNA-seq文库 单细胞测序 NA 单细胞RNA-seq, DNA测序 NA 测序数据 NA Element Biosciences, Illumina 单细胞RNA-seq Element Aviti Element Aviti平台采用亲和性测序化学
97 2026-04-19
Hypoxia inducible factor 2α promotes tolerogenic macrophage development during cardiac transplantation through transcriptional regulation of colony stimulating factor 1 receptor
2024-Jun-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析心脏移植排斥与耐受模型,发现HIF-2α通过转录调控CSF1R促进耐受性巨噬细胞发育,从而诱导移植耐受 首次在单细胞水平上无偏倚地鉴定出HIF-2α是耐受性单细胞亚群的关键转录因子,并揭示其通过直接调控CSF1R表达促进移植耐受的新机制 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体移植受者中验证;HIF稳定剂roxadustat的靶向递送系统仍需进一步优化 探索心脏移植中诱导免疫耐受的细胞与分子机制 小鼠心脏同种异体移植模型中的髓系细胞(单核细胞与巨噬细胞) 单细胞组学与免疫学 器官移植免疫 单细胞RNA测序,流式细胞术,条件性基因功能缺失/获得小鼠模型 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 未明确说明具体样本数量,但涉及急性排斥与耐受状态的心脏移植物 NA 单细胞RNA-seq NA NA
98 2026-04-19
Proteomic and Single-Cell Transcriptomic Dissection of Human Plasmacytoid Dendritic Cell Response to Influenza Virus
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过蛋白质组学和单细胞转录组学技术,全面解析了人类浆细胞样树突状细胞对流感病毒的反应 首次报告了pDC在生理刺激下的全面无偏分泌组分析,并结合单细胞RNA-seq揭示了pDC的异质性和激活后的功能特化 研究仅针对流感H1N1病毒,未涵盖其他病毒或刺激条件,且样本来源和数量可能有限 研究人类浆细胞样树突状细胞在基线和流感病毒刺激下的分子特征和功能异质性 人类浆细胞样树突状细胞 免疫学 流感 LC-MS/MS, 单细胞RNA-seq NA 蛋白质组数据, 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
99 2026-04-18
Machine learning identifies key cells and therapeutic targets during ferroptosis after spinal cord injury
2026-Jun-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
研究论文 本研究利用机器学习方法,结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,识别了脊髓损伤后铁死亡过程中的关键细胞类型和基因,并验证了潜在药物环己酰亚胺的治疗效果 首次结合机器学习算法(随机森林和LASSO)与单细胞RNA测序分析,系统揭示了脊髓损伤后铁死亡的关键调控基因Atf3和Piezo1及其在巨噬细胞/小胶质细胞中的特异性表达,并通过分子对接和动物模型验证了环己酰亚胺的治疗潜力 研究主要基于公共数据库的测序数据,动物模型仅使用小鼠T8脊髓损伤模型,尚未在更大型动物或临床样本中验证;环己酰亚胺的治疗机制和长期安全性需进一步探索 探究脊髓损伤后铁死亡的细胞与分子机制,并寻找潜在治疗靶点 脊髓损伤后的铁死亡过程、巨噬细胞/小胶质细胞等免疫细胞、关键基因Atf3和Piezo1 机器学习 脊髓损伤 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 分子对接, 动物模型 随机森林, LASSO RNA测序数据 来自公共数据库GSE47681、GSE5296(批量RNA-seq)和GSE162610(单细胞RNA-seq)的数据,以及T8脊髓损伤小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
100 2026-04-18
RBAD: The first database dedicated alterations of blood RNA in individuals with Alzheimer's disease and their clinical relevance
2026-Jun-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
研究论文 本研究开发了首个专注于阿尔茨海默病血液RNA变化的数据库RBAD,基于1468个血液样本的转录组数据,揭示了与疾病相关的血液RNA特征及其临床相关性 首次建立了专门针对阿尔茨海默病血液RNA变化的数据库,整合了人类和小鼠的多组学数据,并进行了超过1100万次比较分析 研究主要基于现有数据集的整合分析,需要进一步实验验证血液RNA变化的生物学机制 研究阿尔茨海默病血液RNA变化及其临床意义 阿尔茨海默病患者和模型小鼠的血液样本 生物信息学 阿尔茨海默病 bulk RNA-seq, microRNA-seq, single-cell RNA-seq NA RNA测序数据 1468个血液样本(来自人类和小鼠研究) NA bulk RNA-seq, microRNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
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