单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 40084 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-06-05 |
Transcription factor 21 deletion from podocyte precursors as a model for congenital nephrotic syndrome
2026-Jun-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00490.2025
PMID:42090190
|
研究论文 | 通过从足细胞前体删除转录因子21建立先天性肾病综合征小鼠模型，并利用单细胞RNA测序分析肾脏损伤机制 | 首次通过从早期足细胞前体删除转录因子21建立先天性肾病综合征小鼠模型，并生成了全面的肾脏单细胞转录组数据集 | 未明确说明限制 | 研究先天性肾病综合征中肾小球和肾小管间质变化机制 | 转录因子21基因敲除小鼠 | 机器学习 | 儿童肾病综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 转录因子21基因敲除小鼠及其对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 82 | 2026-06-05 |
Supervised deep learning with gene functional annotation for cell classification
2026-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014327
PMID:42224351
|
研究论文 | 开发了SDAN方法，通过图神经网络整合基因功能注释与表达谱，优化细胞分类和个体预测 | 首次将基因功能注释信息（如蛋白质-蛋白质相互作用）通过图神经网络与基因表达谱整合，实现了功能相关基因集的识别与细胞分类的同步优化 | 未提及具体限制，但可能依赖高质量基因注释数据库，对未知功能基因的适用性待验证 | 开发一种融合基因功能注释的监督深度学习方法，提升单细胞RNA测序数据的细胞分类和个体水平预测能力 | COVID-19重症、痴呆症和癌症免疫治疗反应相关的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | COVID-19, 痴呆症, 癌症 | scRNA-seq | 图神经网络 | 基因表达谱 | 三个真实应用案例，包括COVID-19、痴呆症和癌症免疫治疗数据集，具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2026-06-05 |
Dual epitope anti-LILRB4 synthetic T-cell receptor and antigen receptor (STAR)-T-cell therapy for relapsed/refractory acute myeloid leukemia
2026-Jun-01, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02765-7
PMID:42225613
|
研究论文 | 开发双表位抗LILRB4的合成T细胞受体和抗原受体（STAR）-T细胞疗法用于复发/难治性急性髓系白血病 | 首次在人体临床试验中评估双表位抗LILRB4的STAR-T细胞疗法，表现出比单表位STAR-T或CAR-T更强的肿瘤抑制效果，且未观察到严重神经毒性或高级别细胞因子释放综合征 | 样本量较小（9例患者），仅6例完成安全性和疗效评估，3例死于感染，非应答者中单核细胞介导的自体T细胞功能抑制可能是治疗失败的主要机制 | 评估针对LILRB4的STAR-T细胞疗法在复发/难治性急性髓系白血病中的安全性和疗效 | LILRB4阳性复发/难治性急性髓系白血病患者 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 噬菌体展示文库筛选, 单细胞RNA测序 | STAR-T细胞 | 单细胞RNA测序数据 | 9例患者（6例完成评估） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 用于单细胞RNA测序，但未指定具体平台 |
| 84 | 2026-06-05 |
Engineered Pericyte-Targeted Extracellular Vesicles Protect Against Hypoperfusion-Induced Cognitive Impairment and Vascular Demyelination
2026-Jun, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70319
PMID:42226579
|
研究论文 | 开发了一种生物正交方法，工程化改造携带环状NGR肽的细胞外囊泡，实现选择性靶向周细胞，并在慢性脑低灌注小鼠模型中验证了其保护作用 | 首次利用生物正交方法将环状NGR肽功能化修饰到细胞外囊泡上，实现选择性靶向CD13表达的脑周细胞，为血管性认知障碍提供新的周细胞靶向治疗策略 | 未提及 | 开发靶向周细胞的细胞外囊泡治疗策略，用于保护低灌注诱导的认知障碍和血管脱髓鞘 | 周细胞靶向的工程化细胞外囊泡（cNGR-EVs） | 数字病理学 | 血管性认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 85 | 2026-06-05 |
Multi-omics insights for deciphering prognosis-related T cell subsets in hepatocellular carcinoma
2026-Jun, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70708
PMID:42226614
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示肝细胞癌中与预后相关的T细胞亚群及分子互作机制 | 首次结合质量细胞术、批量RNA测序和单细胞RNA测序数据系统刻画肝细胞癌预后相关T细胞图谱，发现CD4+CD8+双阳性T细胞作为不良预后标志物，并揭示内皮来源HBEGF-DPT轴作为潜在治疗靶点 | 研究主要依赖公共数据集和体外实验验证，缺乏大规模前瞻性临床队列验证及体内功能研究 | 阐明肝细胞癌肿瘤微环境中T细胞亚群及其与预后的关联，并探索潜在治疗靶点 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织、小鼠同源性模型及细胞系（Hep3B等） | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 质量细胞术、批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、流式细胞术、基因敲低实验 | NA | 测序数据、图像数据、流式细胞术数据 | 多个肝细胞癌队列及同源性小鼠模型，具体样本量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 86 | 2026-06-05 |
Endothelial origin of hematopoietic stem cells: Insights from new technologies and unresolved questions
2026-06, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2026.103676
PMID:42102418
|
综述 | 利用新技术综述造血干细胞源自血源性内皮细胞的证据及未解决问题 | 通过整合单细胞转录组学、低输入表观基因组学和单细胞功能分析等高精度技术的最新研究，系统总结了HSC生成性HEC的富集标记、功能特性和发育轨迹，并阐述了从主动脉动脉内皮细胞到前造血干细胞的多个精细细胞阶段的连续特性 | 未提及具体局限性 | 总结和解决关于造血干细胞起源中血源性内皮细胞的性质、起源和命运的争议 | 造血干细胞生成性血源性内皮细胞及其前体细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、低输入表观基因组学、单细胞功能分析 | NA | 基因表达数据、表观基因组数据、单细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 87 | 2026-06-05 |
Establishment of a dendritic cell differentiation system faithfully recapitulating multiple DC subsets in autoimmune disease
2026-Jun-01, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2026.103658
PMID:42235377
|
研究论文 | 建立一种在自身免疫性疾病中忠实再现多种树突状细胞亚群的分化系统 | 首次构建了在富含干扰素的自身免疫样微环境中重建所有主要人类树突状细胞亚群的体外平台，并揭示了干扰素信号如何塑造树突状细胞谱系特化与功能极化 | 未在论文标题和摘要中明确提及局限性 | 建立生理相关的体外平台以重现自身免疫性疾病中多种树突状细胞亚群，并定义干扰素信号如何影响树突状细胞谱系特化和功能分化 | 人类树突状细胞及其亚群 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序、多色流式细胞术 | NA | 转录组数据、流式细胞术数据 | 脐带血来源的CD34⁺造血祖细胞（时间点包括分化过程中的3个时点） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2026-06-05 |
Distinct cellular and subcellular distributions of the alpha and beta isoforms of Heat Shock Protein 90 in the mouse cerebral cortex
2026-May-30, Gene expression patterns : GEP
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.gep.2026.119412
PMID:42218969
|
研究论文 | 该研究揭示了热休克蛋白90的α和β亚型在小鼠大脑皮层中具有不同的细胞和亚细胞分布模式 | 首次系统展示了HSP90α和HSP90β在小鼠大脑皮层不同细胞类型和亚细胞结构中的差异化分布，挑战了二者功能冗余的传统观点 | 未具体说明研究的局限性 | 探究HSP90α和HSP90β在小鼠大脑皮层中的分布差异及其潜在功能独特性 | 小鼠大脑皮层 | 神经科学 | NA | 免疫荧光染色、荧光原位杂交、单细胞RNA测序 | NA | 图像数据、基因表达数据 | 成年小鼠大脑皮层样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2026-06-05 |
CBLC-mediated ubiquitination stabilizes METTL1, enhances N7-methylguanosine modification of ESRRA, and promotes the progression of endometrial cancer
2026-May-30, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152809
PMID:42217705
|
研究论文 | 揭示CBLC通过泛素化稳定METTL1并促进ESRRA的m7G修饰，从而推动子宫内膜癌进展的机制 | 首次发现CBLC通过泛素化稳定METTL1并增强ESRRA mRNA的m7G修饰，从而促进子宫内膜癌进展的分子机制 | NA | 探究E3泛素连接酶CBLC在子宫内膜癌发生发展中的作用及其分子机制 | 子宫内膜癌细胞及其相关分子机制 | NA | 子宫内膜癌 | 单细胞测序、批量转录组分析、泛素化分析、m7G修饰检测 | NA | 单细胞测序数据、批量转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2026-06-05 |
Oral epithelial barrier: Gatekeeper of mucosal immunity and driver of disease
2026-May-30, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2026.128568
PMID:42235250
|
综述 | 探讨口腔上皮屏障作为黏膜免疫守门人和疾病驱动因子的角色，综述其在健康和疾病中的免疫调控机制 | 提出了上皮炎性记忆的新概念，即上皮干细胞和前体细胞保留过去炎症刺激的持久印记，为理解牙周炎等慢性疾病提供了新视角 | NA | 综述口腔上皮屏障在黏膜免疫和口腔炎症疾病中的核心作用及靶向治疗潜力 | 口腔黏膜上皮及其免疫调控机制 | NA | 口腔炎症性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2026-06-05 |
Ndufa4l2 drives the pathological activation of Müller cells in ischemic retinopathy via the PI3K/AKT signaling pathway
2026-May-30, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156567
PMID:42235340
|
research paper | 该研究揭示了Ndufa4l2通过PI3K/AKT信号通路驱动缺血性视网膜病变中Müller细胞病理活化的机制 | 首次鉴定Ndufa4l2为缺血性视网膜病变中Müller细胞病理活化的关键内在驱动因子，并阐明其通过PI3K/AKT信号通路发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人体组织或临床样本中进一步验证 | 探究Ndufa4l2在Müller细胞病理活化中的作用及分子机制 | 缺血性视网膜病变中的Müller细胞 | machine learning | 缺血性视网膜病变 | scRNA-seq, CRISPR/Cas9 | NA | 单细胞转录组数据 | 氧诱导视网膜病变小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2026-06-05 |
Empowering fungal infection research with single-cell RNA sequencing
2026-May-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10304-x
PMID:42215623
|
review | 综述单细胞RNA测序在真菌感染研究中的应用，总结宿主-真菌病原体相互作用的关键发现和动态 | 系统梳理scRNA-seq在真菌感染领域的最新进展，强调其在解析宿主-真菌互作细胞异质性方面的独特优势 | 当前scRNA-seq在真菌感染研究中应用有限，存在技术挑战和研究空白 | 推动单细胞技术在真菌感染研究中的更广泛应用，促进诊断和治疗发展 | 宿主细胞与真菌病原体 | 机器学习 | 真菌感染疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 93 | 2026-06-05 |
A first-in-class bifunctional antibody targeting CD20 and CD37 remodels the immune microenvironment in relapsed or refractory B-cell malignancies
2026-May-29, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-026-01796-5
PMID:42216090
|
研究论文 | 介绍一种首创双功能抗体PSB202，同时靶向CD20和CD37，用于治疗复发或难治性B细胞恶性肿瘤，并在I期试验中评估其安全性、疗效及对免疫微环境的影响 | 首次开发同时靶向CD20和CD37的双功能抗体，不依赖T细胞激活即可清除恶性B细胞，可能减轻与CD3相关的毒性 | 样本量较小（15例患者），且为开放标签I期试验，未达到最大耐受剂量，需要更大规模研究验证 | 评估双功能抗体PSB202在复发或难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤中的安全性、耐受性、药代动力学及初步疗效 | 复发或难治性CD20阳性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者 | 数字病理学 | B细胞非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15例重度预处理患者，中位年龄67.7岁，范围54-78岁 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 94 | 2026-06-05 |
THE molecular mechanisms underlying synovial fibroblast differentiation in knee osteoarthritis revealed by single-cell transcriptome sequencing
2026-May-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000047870
PMID:42216392
|
研究论文 | 利用单细胞转录组测序揭示膝骨关节炎中滑膜成纤维细胞分化的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序识别了膝骨关节炎滑膜成纤维细胞的7条分化轨迹和关键标志基因，提供了滑膜成纤维细胞分化的精细分子框架 | 样本量较小，仅包含3例膝骨关节炎样本，且未纳入正常对照或治疗验证 | 深入分析膝骨关节炎滑膜成纤维细胞分化的单细胞转录组数据，识别关键靶基因和分子机制，为临床靶向治疗提供分子水平理论支持 | 膝骨关节炎患者滑膜组织中的滑膜成纤维细胞 | 机器学习 | 膝骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3个膝骨关节炎样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集GSE176308来自基因表达综合数据库 |
| 95 | 2026-06-05 |
Association of DNA damage repair related genes with prostate cancer: A multi-omics Mendelian Randomization analysis
2026-May-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000049185
PMID:42216412
|
research paper | 采用多组学孟德尔随机化方法探究DNA损伤修复相关基因与前列腺癌的因果关系 | 首次通过多组学孟德尔随机化分析整合DNA损伤修复相关基因的甲基化、表达和蛋白质丰度与前列腺癌风险的遗传因果关联 | 研究基于欧洲人群队列，结论推广至其他种族人群可能存在局限性 | 阐明DNA损伤修复相关基因与前列腺癌风险之间的因果关系 | DNA损伤修复相关基因RPA2和POLI | machine learning | prostate cancer | NGS, single-cell sequencing | NA | multi-omics data | 多个欧洲队列的定量性状位点数据及全基因组关联研究数据 | Illumina | single-cell RNA-seq | Illumina NovaSeq | single-cell sequencing analysis |
| 96 | 2026-06-05 |
Pan-cancer spatial atlas of tertiary lymphoid structures
2026-05-28, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adz2742
PMID:42207882
|
研究论文 | 通过分析12种癌症类型的空间转录组数据，构建泛癌三级淋巴结构图谱，并表征其空间结构和成熟状态 | 首次构建泛癌三级淋巴结构空间图谱，结合超高通量单细胞空间分析揭示成熟过程中的细胞生态位重塑，并开发AI框架从H&E染色图像预测TLS成熟状态 | 未明确提及具体局限性，但可能依赖于公共数据集的可推广性及AI模型的泛化能力 | 系统解析三级淋巴结构的空间组织、成熟状态及其在不同癌症类型中的临床相关性 | 12种癌症类型的空间转录组样本及独立治疗队列的病理图像 | 数字病理学, 计算机视觉 | 癌症（泛癌），肺癌，前列腺癌等 | 空间转录组学, 单细胞空间分析, 组织病理图像AI分析 | 人工智能框架（具体类型未明确，可能为深度学习模型） | 图像，空间转录组数据 | 12种癌症类型的空间转录组样本，TCGA及多个独立治疗队列 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞多组学 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium用于空间转录组分析，10x Chromium用于超高通量单细胞空间分析 |
| 97 | 2026-06-05 |
Acute wood smoke exposure is associated with cell-specific hippocampal transcriptomic responses in an accelerated ovarian failure mouse model
2026-May-28, Neurotoxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.neuro.2026.103476
PMID:42214760
|
研究论文 | 使用加速卵巢衰竭小鼠模型，研究急性木材烟雾暴露对海马细胞特异性转录组反应的影响 | 首次结合空间转录组学和加速卵巢衰竭模型，揭示围绝经期激素状态如何放大木材烟雾暴露引起的海马细胞特异性转录组变化 | 未提及具体局限性 | 探究围绝经期样激素状态是否加剧急性木材烟雾暴露对海马的反应 | 雌性C57BL/6小鼠，使用4-乙烯基环己烯二环氧化物诱导的加速卵巢衰竭模型 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 每组4个海马切片 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台，用于分析海马组织切片 |
| 98 | 2026-06-05 |
Atlas-Level Single-Cell and Spatial Transcriptomics Data Integration via PRIME
2026-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.20.726698
PMID:42239079
|
研究论文 | 提出PRIME集成框架，用于大规模单细胞RNA测序和空间转录组数据的图谱级整合 | 结合随机投影共识锚定、图拉普拉斯校正和空间邻域正则化，能在数百万细胞规模下同时处理批次校正和空间一致性 | 未提及在极端不平衡细胞类型组成或超大规模数据集（如千万级细胞）上的性能表现 | 开发一种可扩展的图谱级数据集成方法，用于单细胞RNA-seq和空间转录组数据的联合分析 | 人类造血系统、背外侧前额叶皮层切片及药物扰动图谱等多源数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 图拉普拉斯模型，随机投影 | 单细胞基因表达数据，空间转录组数据 | 约33,000个细胞（人类造血基准数据）、超过100万个细胞（药物扰动图谱） | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 99 | 2026-06-05 |
Current evidence on the cell of origin of meningiomas disputes the arachnoid cap cell dogma
2026-05-21, Acta neurochirurgica
IF:1.9Q2
DOI:10.1007/s00701-026-06908-1
PMID:42165909
|
综述 | 重新审视脑膜瘤起源的传统观点，质疑蛛网膜帽细胞假说，并提出基于单细胞转录组学等多组学证据的更复杂异质性起源 | 综合单细胞转录组学、空间测序、发育生物学和转基因动物模型的新证据，挑战统治百年的蛛网膜帽细胞假说，提出脑膜瘤起源的异质性和区域性 | 仅为一篇小型综述，缺乏原始实验数据验证，也可能受限于历史研究样本和传统技术的偏见 | 批判性评估脑膜瘤细胞起源的传统观点，推动基于多组学和发育生物学的更准确分类和治疗策略 | 脑膜瘤的细胞起源，包括蛛网膜帽细胞、成纤维细胞样或区域特异的脑膜祖细胞 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞转录组学、空间测序、多组学、发育生物学、转基因动物模型 | NA | 分子和蛋白质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 100 | 2026-06-05 |
Multiomic study of cutaneous T-cell lymphoma reveals single-cell clonal evolution in progression and therapy resistance
2026-May-21, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025029012
PMID:41662591
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示皮肤T细胞淋巴瘤在疾病进展和治疗耐药中的单细胞克隆演化 | 首次以单细胞分辨率结合外显子组、全基因组、表观基因组、T细胞受体和RNA测序等多组学数据，全面解析CTCL的克隆演化机制，发现Rho GTPase通路失调在CTCL进展中的新作用 | 未提及具体局限性 | 明确CTCL在单细胞水平上的进展机制，识别临床有用的生物标志物和治疗靶点 | 来自34名CTCL患者的99份临床标注的系列皮肤、外周血和淋巴结样本 | 机器学习 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 外显子组测序、全基因组测序、表观基因组测序、批量RNA测序、单细胞T细胞受体测序、单细胞RNA测序、CUT&RUN | NA | 基因组数据、转录组数据、表观基因组数据 | 34名患者的99份样本 | Illumina | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | 使用Illumina NovaSeq进行高通量测序 |