单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
81	2025-07-24	KMT2D Regulates Tooth Enamel Development 2025-Jul, Journal of dental research IF:5.7Q1 DOI:10.1177/00220345251320922 PMID:40103013	研究论文	本研究探讨了KMT2D基因在牙釉质发育中的具体作用及其机制	首次通过条件性敲除小鼠模型揭示了KMT2D在成釉细胞分化中的关键调控作用，并鉴定了其直接靶向的8个基因	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证不足	阐明KMT2D在牙釉质形成过程中的分子机制	KMT2D条件性敲除小鼠模型及其牙胚组织	发育生物学	牙釉质发育不全	条件性基因敲除、micro-CT、扫描电镜、RNA测序、CUT&RUN测序、单细胞RNA测序	条件性敲除小鼠模型	基因表达数据、影像数据、组织学数据	KMT2D条件性敲除小鼠及其对照组
82	2025-07-24	Single-Cell Transcriptome Reveals Aquaporin-Mediated Carbon Nanosol-Induced Growth Promotion of Plants 2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202504459 PMID:40305768	研究论文	研究通过单细胞转录组揭示了水通道蛋白介导的碳纳米溶胶促进植物生长的机制	首次在单细胞水平上解析了碳纳米溶胶促进植物生长的分子机制，并发现水通道蛋白在此过程中的关键作用	研究仅针对烟草根部细胞，未涉及其他植物组织或其他植物物种	探究碳纳米溶胶促进植物生长的分子机制	烟草根部细胞	植物分子生物学	NA	单细胞转录组测序、荧光标记追踪、伪时间轨迹分析	NA	单细胞转录组数据、荧光成像数据	7,897个细胞，代表13种不同的细胞类型
83	2025-07-24	PP1A Modulates the Efficacy of Lenvatinib Plus ICIs Therapy by Inhibiting Ferroptosis in Hepatocellular Carcinoma 2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202501730 PMID:40344394	研究论文	本文研究了PP1A通过抑制铁死亡调节Lenvatinib联合ICIs治疗肝细胞癌的效果	揭示了PP1A通过去磷酸化Keap1抑制铁死亡，进而影响Keap1-Nrf2相互作用和PD-L1转录的新机制	研究主要基于体外和动物实验，临床转化效果尚需进一步验证	探索PP1A在肝细胞癌治疗抵抗中的作用机制及其作为治疗靶点的潜力	肝细胞癌细胞系和动物模型	肿瘤生物学	肝细胞癌	转录组分析、铁死亡代谢物分析、单细胞测序	NA	分子生物学数据、测序数据	未明确说明样本数量，使用细胞系和动物模型
84	2025-07-24	Immune-Vascular Synergy: A Photodynamic Hydrogel Activating ALDH2 to Combat Inflammation and Enhance Angiogenesis in Diabetic Wound Healing 2025-Jul, Small methods IF:10.7Q1 DOI:10.1002/smtd.202500391 PMID:40364604	research paper	该研究开发了一种光动力水凝胶，通过激活ALDH2来对抗炎症并促进糖尿病伤口愈合中的血管生成	提出了一种双功能策略的光动力水凝胶，独特地整合了ALDH2激活与免疫-血管调节，以解决糖尿病伤口愈合中的多重挑战	未提及具体的临床前或临床试验阶段，可能缺乏人体试验数据	开发一种新型治疗方法以改善糖尿病伤口愈合	糖尿病伤口组织	生物医学工程	糖尿病	光动力疗法、单细胞测序	NA	临床标本、实验数据	未明确提及具体样本数量
85	2025-07-24	Microbiome Single Cell Atlases Generated with a Commercial Instrument 2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202409338 PMID:40462354	研究论文	本文介绍了一种名为EASi-seq的新方法，用于高效测序单个微生物基因组，并生成详细的人类和环境微生物组图谱	EASi-seq方法通过改造商业化的Mission Bio Tapestri仪器的单细胞工作流程，实现了对单个微生物基因组的高效测序，并开发了配套的生物信息学流程	NA	开发一种适用于微生物的单细胞测序方法，以解决目前微生物单细胞分析工具的局限性	微生物基因组	基因组学	NA	单细胞测序	NA	基因组数据	每轮运行可测序数万个微生物
86	2025-07-24	MatriCom, a single-cell RNA-sequencing data mining tool to infer cell-extracellular matrix interactions 2025-Jul-01, Journal of cell science IF:3.3Q3 DOI:10.1242/jcs.263927 PMID:40501363	研究论文	介绍了一个名为MatriCom的网络应用和R包，用于从单细胞RNA测序数据推断细胞外基质（ECM）成分之间以及不同细胞群体与ECM之间的通讯	开发了MatriCom工具，利用独特的MatriComDB数据库，包含超过25,000个经过整理的相互作用，用于从表达数据中推断相互作用，并构建了首个人类肾脏基质通讯网络	未明确提及具体限制，但可能依赖于数据库的覆盖范围和准确性	研究细胞外基质（ECM）成分之间以及细胞与ECM之间的通讯机制	单细胞RNA测序数据集中的细胞外基质成分和细胞群体	生物信息学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	RNA测序数据	46个健康成体组织的scRNA-Seq数据集
87	2025-07-24	Identification of an immunomodulatory lncRNA signature associated with immune cell reprogramming in high-grade glioma 2025-Jul, Cancer gene therapy IF:4.8Q1 DOI:10.1038/s41417-025-00919-3 PMID:40527978	研究论文	该研究通过分析高级别胶质瘤中的长链非编码RNA（lncRNA）特征，揭示了其在免疫微环境重塑中的作用	首次在两种不同免疫表型的鼠模型中系统鉴定与免疫抑制/促炎性肿瘤微环境相关的lncRNA特征，并通过单细胞测序和空间转录组学揭示其细胞特异性表达模式与空间分布规律	研究主要基于鼠模型，人类患者样本验证有限；lncRNA功能机制尚未完全阐明	探索lncRNA在高级别胶质瘤免疫微环境调控中的作用机制	高级别胶质瘤（HGGs）及其肿瘤浸润免疫细胞（髓系细胞、T细胞、NK细胞等）	肿瘤免疫学	脑癌（高级别胶质瘤）	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学	RCAS-PDGFb免疫抑制模型、RCAS-BRAF V600E促炎模型	转录组数据、空间表达数据	两种鼠模型及GBM患者样本（具体数量未明确说明）
88	2025-07-24	Single-cell and spatial transcriptomics of stricturing Crohn's disease highlights a fibrosis-associated network 2025-Jul, Nature genetics IF:31.7Q1 DOI:10.1038/s41588-025-02225-y PMID:40562913	研究论文	本文通过单细胞和空间转录组学技术研究了克罗恩病（CD）狭窄病变中的纤维化相关网络	结合单细胞和空间转录组学技术，揭示了克罗恩病狭窄病变中的关键转录组和细胞网络，以及多细胞遗传风险因子的空间组织	样本量相对较小（61个样本，来自21名CD患者和10名非IBD患者），可能影响结果的普遍性	研究克罗恩病狭窄病变的纤维化机制及其相关细胞和基因网络	克罗恩病患者的肠道狭窄病变组织	数字病理学	克罗恩病	单细胞转录组学，空间转录组学	NA	转录组数据	61个样本（来自21名CD患者和10名非IBD患者）
89	2025-07-24	Mobilizing antigen-presenting mast cells in anti-PD-1-refractory triple-negative breast cancer: a phase 2 trial 2025-Jul, Nature medicine IF:58.7Q1 DOI:10.1038/s41591-025-03776-7 PMID:40563015	研究论文	本研究通过整合44名未接受过治疗的三阴性乳腺癌（TNBC）患者的单细胞转录组数据，揭示了患者内肥大细胞异质性与PD-1阻断临床获益之间的关联，并在484名TNBC患者中进行了独立验证	发现乳腺癌组织中抗原呈递肥大细胞（apMCs）的高水平与抗PD-1疗效增强相关，并确定了一种广泛使用的过敏药物色甘酸可动员apMC介导的T细胞免疫，使肿瘤对PD-1阻断敏感	研究样本量相对较小，且仅针对女性抗PD-1难治性转移性TNBC患者	探索克服抗PD-1耐药的新机制并评估其在人体中的疗效和安全性	三阴性乳腺癌（TNBC）患者	精准免疫肿瘤学	三阴性乳腺癌	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	44名未治疗TNBC患者（单细胞转录组），484名TNBC患者（验证）
90	2025-07-24	Guard cells on the adaxial and abaxial leaf surfaces use different compositions of potassium ion channels to drive light-induced stomatal opening 2025-Jul, Nature plants IF:15.8Q1 DOI:10.1038/s41477-025-02026-5 PMID:40634560	研究论文	本研究探讨了草本植物叶片上下表面气孔对光响应差异的分子机制	揭示了上下表面保卫细胞利用不同钾离子通道驱动光诱导气孔开放的分子机制	研究仅针对拟南芥和烟草两种模式植物，结论在其他植物中的普适性有待验证	探究植物叶片上下表面气孔对光响应差异的分子基础	拟南芥和烟草的叶片保卫细胞	植物生理学	NA	单细胞RNA测序、转录组测序、OnGuard计算机模拟	NA	基因表达数据	两种模式植物(拟南芥和烟草)的叶片保卫细胞
91	2025-07-24	Atlas of amnion development during the first trimester of human pregnancy 2025-Jul, Nature cell biology IF:17.3Q1 DOI:10.1038/s41556-025-01696-9 PMID:40659869	研究论文	通过单细胞转录组学技术，研究人类妊娠早期羊膜的细胞类型及其动态重塑过程	首次系统鉴定了人类妊娠早期羊膜的主要细胞类型和亚型，揭示了上皮-间质和上皮-免疫细胞间的动态转变及关键细胞间通讯通路	研究仅聚焦于妊娠早期羊膜发育，未涵盖整个妊娠周期	阐明羊膜在早期妊娠中的细胞组成、动态重塑及发育机制	人类妊娠早期羊膜组织	发育生物学	NA	单细胞转录组学	NA	单细胞RNA测序数据	未明确提及具体样本数量（人类早期妊娠羊膜组织）
92	2025-07-24	Mapping Genetic Associations With Functional Brain Area Alterations in Schizophrenia and Implications for Cortical Development 2025-Jul, Brain and behavior IF:2.6Q3 DOI:10.1002/brb3.70688 PMID:40685676	研究论文	本研究通过GWAS和功能映射分析，探讨精神分裂症患者特定脑功能区域灰质体积减少与遗传因素的关系	首次将精神分裂症的灰质体积改变与特定Brodmann区域及遗传变异联系起来，并探索这些基因在皮质发育中的潜在作用	样本量相对有限(194例患者和330例对照)，且主要基于台湾人群，可能限制结果的普适性	识别精神分裂症患者灰质体积改变的特定脑功能区域，并探索相关的遗传因素	精神分裂症患者和健康对照的脑结构和遗传数据	神经科学	精神分裂症	GWAS、单细胞RNA测序、原位杂交、T1加权MRI	NA	影像数据、遗传数据	194名精神分裂症患者和330名健康对照
93	2025-07-24	Dissecting Sex-Specific Pathology in K18-hACE2 Transgenic Mice Infected With Different SARS-CoV-2 Variants 2025-Jul, Journal of medical virology IF:6.8Q1 DOI:10.1002/jmv.70506 PMID:40686017	研究论文	本研究通过K18-hACE2转基因小鼠模型，探究了不同SARS-CoV-2变体感染后性别特异性病理差异	揭示了不同SARS-CoV-2变体感染后性别特异性病理差异的复杂动态，强调了性别作为COVID-19病理学混杂因素的重要性	研究仅使用了K18-hACE2转基因小鼠模型，可能无法完全反映人类感染情况	理解不同SARS-CoV-2变体感染后性别特异性病理差异	K18-hACE2转基因小鼠的肺和鼻腔组织	病理学	COVID-19	空间转录组学	K18-hACE2转基因小鼠模型	组织病理学数据和转录组数据	年龄匹配的雌性和雄性K18-hACE2转基因小鼠
94	2025-07-24	Featured Immune Characteristics of Periodontitis and Primary Sjögren's Syndrome Revealed by Single-Cell Transcriptome Analyses 2025-Jul, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70713 PMID:40696268	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示牙周炎和原发性干燥综合征的免疫特征	首次在单细胞水平上全面比较了牙周炎和原发性干燥综合征的免疫细胞景观，并揭示了两种疾病之间的共同分子机制	研究依赖于公开数据库的数据，可能受到样本来源和数量的限制	探究牙周炎和原发性干燥综合征在免疫细胞层面的关联和共同分子机制	健康对照组、牙周炎患者和原发性干燥综合征患者的外周血单个核细胞	生物信息学	牙周炎, 原发性干燥综合征	单细胞转录组测序, NicheNetr分析	Seurat, NicheNetr	单细胞RNA测序数据	来自NCBI和NGDC数据库的健康对照组、牙周炎和原发性干燥综合征患者的PBMC数据
95	2025-07-24	Extracellular Origins of Cognition: Lessons from Primate Neocortical ECM 2025-Jul, Proteomics IF:3.4Q2 DOI:10.1002/pmic.13979 PMID:40696865	comments	本文评论了Vilicich等人的研究，该研究通过多模态方法构建了人类和非人灵长类动物发育中新皮质的ECM图谱	研究整合了单细胞转录组学、蛋白质组学和免疫组织荧光技术，揭示了ECM在皮质层和发育阶段的特异性分布	评论文章未直接进行实验研究，主要基于对他人研究的分析和讨论	探讨ECM在神经发育中的作用及其与神经发育障碍的潜在关联	人类和非人灵长类动物的发育中新皮质	神经科学	神经发育障碍	单细胞转录组学、蛋白质组学、免疫组织荧光	NA	分子数据、图像数据	NA
96	2025-07-24	Single-cell RNA sequencing reveals Shen-Bai-Jie-Du decoction retards colorectal tumorigenesis by regulating the TMEM131-TNF signaling pathway-mediated differentiation of immunosuppressive dendritic cells 2025-Jul, Acta pharmaceutica Sinica. B DOI:10.1016/j.apsb.2025.05.013 PMID:40698132	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了参白解毒汤通过调节TMEM131-TNF信号通路介导的免疫抑制性树突状细胞分化延缓结直肠肿瘤发生的机制	首次发现参白解毒汤和黄连素能够逆转CCL22树突状细胞的积累及其免疫抑制作用，并揭示了TMEM131通过TNF信号通路调控这些细胞的生成	研究主要基于小鼠模型和临床患者样本，人类样本数量可能有限	探究参白解毒汤延缓结直肠肿瘤发生的分子机制	结直肠肿瘤微环境中的免疫细胞（特别是树突状细胞）	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重免疫组化、流式细胞术、批量RNA测序	NA	RNA测序数据、免疫组化图像、流式细胞数据	小鼠模型和临床患者样本（具体数量未明确说明）
97	2025-07-24	Leveraging hypoxia-related genes signature for predicting the prognosis of bladder cancer 2025-Jun-30, Translational andrology and urology IF:1.9Q3 DOI:10.21037/tau-2025-118 PMID:40687655	研究论文	本研究探讨了缺氧相关基因（HRGs）在膀胱癌（BC）中的功能作用，并构建了一个预后风险模型	开发了一个基于HRGs的新型预后风险模型，并分析了其与免疫微环境、突变模式、药物敏感性及基因发育轨迹的关系	研究对缺氧在膀胱癌中的机制探讨仍有限，且模型需进一步验证	探索HRGs在膀胱癌中的功能作用，并构建预后风险模型以优化患者治疗效果	膀胱癌患者及其缺氧相关基因	生物信息学	膀胱癌	ssGSEA、qRT-PCR、单细胞测序	预后风险模型	基因表达数据、单细胞测序数据	NA
98	2025-07-24	A pre-menopausal single-cell atlas for ovarian drug discovery 2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.06.20.660779 PMID:40666883	研究论文	本文介绍了一个针对绝经前女性的单细胞图谱（PreMeno Atlas），旨在促进卵巢生物学研究和避孕靶点发现	首次整合了绝经前女性的单细胞数据集，包括14个组织的511,365个细胞，特别关注卵巢细胞基因特征和潜在药物靶点	研究主要基于绝经前女性数据，可能不适用于其他年龄段人群	促进对绝经前阶段卵巢生物学的理解，并支持针对年轻人群（如生育管理）的卵巢基因靶点识别	绝经前女性的卵巢细胞和其他13种组织细胞	单细胞生物学	生育管理	单细胞测序，空间转录组学	NA	单细胞转录组数据	511,365个细胞（来自14个组织）
99	2025-07-24	GPC2-targeted CAR T cells engineered with NFAT-inducible membrane-tethered IL-15/IL-21 exhibit enhanced activity against neuroblastoma 2025-Jun-26, Cancer immunology research IF:8.1Q1 DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0975 PMID:40569285	研究论文	本研究评估了针对神经母细胞瘤（NB）的GPC2靶向CAR T细胞在表达IL-15和IL-21时的疗效，特别是在高肿瘤负荷情况下	开发了NFAT诱导型膜结合IL-15/IL-21表达的GPC2-CAR T细胞，显著增强了对高负荷神经母细胞瘤的杀伤效果并降低了毒性	需要进一步研究验证这些发现	优化CAR T细胞疗法以更有效地治疗高负荷神经母细胞瘤	神经母细胞瘤和高负荷肿瘤模型	免疫治疗	神经母细胞瘤	CAR T细胞工程、单细胞RNA测序	CAR T细胞	体外和体内实验数据	高负荷神经母细胞瘤异种移植模型
100	2025-07-24	MHCIIhiLYVE1loCCR2hi Interstitial Macrophages Promote Medial Fibrosis in Pulmonary Arterioles and Contribute to Pulmonary Hypertension 2025-Jun-20, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326173 PMID:40357547	research paper	该研究探讨了间质巨噬细胞（iMΦ）在肺动脉高压（PH）中促进肺动脉中膜纤维化的作用及其机制	首次发现MHCIIhiLYVE1loCCR2hi iMΦs通过WNT11/PCP通路促进肺动脉平滑肌细胞向成纤维细胞样表型转化，从而加剧肺动脉中膜纤维化	研究主要基于动物模型和体外实验，临床样本验证相对有限	阐明间质巨噬细胞在肺动脉高压发病机制中的作用	肺动脉高压患者和实验性PH动物的肺组织样本	病理生理学	肺动脉高压	单细胞RNA测序、谱系追踪、组织学分析、共培养实验、转基因动物实验	动物模型（Sugen-5416+缺氧+常氧刺激模型）	基因表达数据、组织学图像数据	患者样本和实验动物样本（具体数量未明确说明）