单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
81	2025-06-04	Human endothelial cells promote a human neural stem cell type B phenotype via Notch signaling 2025-May-30, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-60194-6 PMID:40447618	research paper	研究发现人类内皮细胞通过Notch信号通路促进人类神经干细胞B型表型	首次揭示了人类内皮细胞通过Notch信号通路促进神经干细胞B型表型的机制，并鉴定了S100A6和LeX作为人类B型细胞的标记物	研究主要基于体外实验，需要进一步在体内验证这些发现	探究人类内皮细胞与神经干细胞之间的相互作用机制	人类内皮细胞(hECs)和神经干细胞(hNSPCs)	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序(scRNAseq)	NA	基因表达数据	人类神经干细胞和内皮细胞样本
82	2025-06-04	Immunogenicity and cellular response of a herpes zoster virus gEgI fusion protein adjuvanted with CpG-emulsion in mice 2025-May-30, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1 DOI:10.1186/s12951-025-03423-w PMID:40448056	研究论文	研究评估了一种新型疱疹病毒gEgI融合蛋白疫苗在小鼠中的免疫原性和细胞反应	开发了gEgI融合蛋白疫苗，并使用新型复合佐剂XUA09C，显示出比现有疫苗Shingrix更强的T细胞反应和免疫激活	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证效果	开发更安全、更易获取的带状疱疹疫苗	成年小鼠、VZV预免疫小鼠和老年小鼠	疫苗开发	带状疱疹	单细胞RNA测序	NA	免疫反应数据	多组小鼠（具体数量未提及）
83	2025-06-04	Multiplex imaging reveals novel patterns of MRTFA/B activation in the breast cancer microenvironment 2025-May-30, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06559-3 PMID:40448123	research paper	该研究通过多重成像技术揭示了MRTFA/B在乳腺癌微环境中的新激活模式	首次在人类肿瘤中发现MRTFA/B在癌细胞中同时激活，并在不同组织学亚型和肿瘤微环境细胞中表现出不同的表达模式，特别是在非裔美国患者的转移性肿瘤中MRTFA表达升高	研究主要基于组织微阵列和公共数据库分析，可能受到样本来源和数据质量的限制	评估MRTFA/B转录因子对乳腺癌及其肿瘤微环境细胞的致瘤和转移影响	乳腺癌组织微阵列中的肿瘤细胞和肿瘤微环境细胞（内皮细胞和抗原呈递细胞）	digital pathology	breast cancer	multiplexed immunofluorescence, bioinformatics analysis, single-cell RNA sequencing	NA	image, RNA-seq data	两个乳腺癌组织微阵列（CHTN_BrCaProg3和TMA BCWG UIC-001-TMA），包含来自芝加哥西区和南区患者的原发肿瘤和淋巴结转移样本
84	2025-06-04	Ocular immune privilege in action: The living eye imposes unique regulatory and anergic gene signatures on uveitogenic T cells 2025-May-30, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115780 PMID:40450686	research paper	该研究探讨了眼部免疫特权如何通过独特的调节和无能基因签名影响葡萄膜炎原性T细胞	使用单细胞转录组学和功能验证揭示了Tregs和无能细胞的独特表型，以及它们从共同增殖前体平行而非顺序分化的轨迹	研究主要基于体内免疫特权模型，可能不完全反映人类眼部免疫反应的全部复杂性	揭示眼部免疫特权的分子机制，为自身免疫效应细胞的沉默或癌症、疫苗接种或慢性感染中T细胞无反应性的逆转提供策略	视网膜特异性T细胞，特别是Foxp3调节性T细胞（Tregs）和无能T细胞	免疫学	自身免疫性葡萄膜炎	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	NA
85	2025-06-04	CCR5-mediated dynamic maintenance of resident memory T cells in the respiratory tract 2025-May-30, Science China. Life sciences DOI:10.1007/s11427-024-2920-y PMID:40459692	研究论文	本研究探讨了CCR5介导的呼吸道组织中驻留记忆T细胞的动态维持机制	通过条形码谱系追踪和单细胞转录组分析，发现了一种独特的CD69CD103病毒特异性CD8 T细胞群体，并揭示了CCR5-CCL5轴在促进肺到引流淋巴结迁移中的作用	研究主要关注流感感染模型，可能不适用于其他病原体或组织	阐明呼吸道组织中驻留记忆T细胞的维持机制	CD8 T细胞在呼吸道和引流淋巴结中的动态分布和功能	免疫学	流感	条形码谱系追踪, 单细胞转录组分析	NA	基因表达数据, 细胞表型数据	未明确说明具体样本数量，但涉及小鼠模型中的T细胞分析
86	2025-06-04	Single-cell analyses identify monocyte gene expression profiles that influence HIV-1 reservoir size in acutely treated cohorts 2025-May-29, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-59833-9 PMID:40442100	研究论文	通过单细胞RNA测序分析，研究宿主基因表达对HIV-1病毒库大小的影响	首次发现CD14+单核细胞活性和IL1B表达与HIV-1病毒库大小的负相关关系，并揭示了IL1B通过激活NF-κB影响病毒库的机制	样本量较小（14名男性），且研究对象仅限于急性感染期开始ART治疗的男性	研究宿主基因表达对HIV-1病毒库大小的影响	急性感染期开始ART治疗的男性HIV-1感染者	生物医学	HIV/AIDS	单细胞RNA测序（scRNA-seq），完整前病毒DNA检测（IPDA®）	NA	RNA测序数据	14名男性（初始队列）和38名男性（验证队列）
87	2025-06-04	A visual-omics foundation model to bridge histopathology with spatial transcriptomics 2025-May-29, Nature methods IF:36.1Q1 DOI:10.1038/s41592-025-02707-1 PMID:40442373	research paper	开发了一个名为OmiCLIP的视觉-组学基础模型，用于整合组织病理学和转录组学数据	OmiCLIP是首个将H&E图像和转录组学数据整合的基础模型，通过将转录组数据转化为'句子'形式，实现了两者的有效连接	模型性能依赖于训练数据的质量和数量，且目前仅适用于Visium数据	开发一个能够整合组织病理学和转录组学数据的计算模型	组织病理学图像和空间转录组学数据	digital pathology	NA	single-cell RNA sequencing, spatial transcriptomics	OmiCLIP	image, transcriptomic data	220万对组织图像和转录组数据，涵盖32个器官
88	2025-06-04	Antibody-Fab and -Fc features promote Mycobacterium tuberculosis restriction 2025-May-29, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2025.05.004 PMID:40449485	research paper	该研究探讨了抗体Fab和Fc特征在限制结核分枝杆菌中的作用机制	通过构建单克隆抗体库并筛选具有限制结核分枝杆菌活性的抗体，揭示了Fc效应功能在限制结核分枝杆菌中的作用，并发现抗体介导的限制与组织水平免疫反应的重组有关	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	探究抗体在结核分枝杆菌控制中的作用机制	结核分枝杆菌及其与抗体的相互作用	免疫学	结核病	单克隆抗体技术、单细胞转录组学	NA	NA	NA
89	2025-06-04	Cardiac Fibroblasts regulate myocardium and coronary vasculature development via the collagen signaling pathway 2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.09.11.612512 PMID:39314489	研究论文	本研究探讨了心脏成纤维细胞（FB）通过胶原信号通路调控心肌和冠状血管发育的功能	首次揭示了成纤维细胞通过胶原信号通路调控心肌和血管内皮细胞发育的分子机制	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	探究心脏成纤维细胞在心肌和血管发育中的作用机制	心脏成纤维细胞、心肌细胞和血管内皮细胞	发育生物学	心血管疾病	scRNA-seq, RNA染色, Pdgfra-CreER控制的DTA系统	NA	单细胞mRNA测序数据	不同发育阶段的小鼠心脏组织
90	2025-06-04	In vivo CRISPRi screen reveals lncRNA portfolio crucial for cutaneous squamous cell carcinoma tumor growth 2025-May-27, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2025.04.038 PMID:40441291	研究论文	本研究通过CRISPRi筛选揭示了在皮肤鳞状细胞癌（cSCC）肿瘤生长中起关键作用的长链非编码RNA（lncRNA）组合	首次通过伪批量分析单细胞测序数据确定了在角质形成细胞亚群中特异性表达的lncRNA组合，并通过CRISPR干扰筛选和异种移植模型验证了这些lncRNA对cSCC生长的影响	研究主要基于体外和异种移植模型，未涉及人体临床试验	揭示lncRNA在皮肤鳞状细胞癌肿瘤生长中的作用	皮肤鳞状细胞癌（cSCC）	癌症研究	皮肤癌	单细胞测序、CRISPR干扰筛选	异种移植模型	测序数据	来自正常和cSCC人类皮肤组织的单细胞测序数据
91	2025-06-04	ICOS+CD4+ T cells define a high susceptibility to anti-PD-1 therapy-induced lung pathogenesis 2025-May-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.186483 PMID:40198121	研究论文	研究探讨了抗PD-1治疗引起的肺毒性机制，特别是在老年小鼠模型中ICOS+CD4+ T细胞的作用	揭示了ICOS+CD4+ T细胞在抗PD-1治疗诱导的肺毒性中的关键作用，并提出了通过阻断ICOS-ICOSL相互作用来减轻肺损伤的策略	研究主要基于小鼠模型，人类数据有限，需要进一步验证	探究抗PD-(L)1治疗引起的免疫相关不良事件（irAEs）的细胞机制	老年小鼠模型和癌症患者的CD4+ T细胞	免疫学	肺癌	单细胞转录组学	小鼠模型	基因表达数据	老年小鼠和癌症患者的样本
92	2025-06-04	Transcriptional signatures of endothelial cells shape immune responses in cardiopulmonary health and disease 2025-May-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.191059 PMID:40401523	review	本文综述了心肺血管系统中内皮细胞在健康和疾病状态下的免疫调节作用	利用单细胞RNA测序技术揭示了心肺血管系统中内皮细胞的多样性及其免疫调节特性	NA	探讨内皮细胞在心肺健康和疾病中的免疫调节功能	心肺血管系统中的内皮细胞	生物医学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
93	2025-06-04	INBRX-106: a hexavalent OX40 agonist that drives superior antitumor responses via optimized receptor clustering 2025-May-21, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-011524 PMID:40404202	research paper	本文介绍了一种新型六价OX40激动剂INBRX-106，通过优化受体聚集增强抗肿瘤T细胞反应	开发了六价OX40激动剂INBRX-106，相比传统二价激动剂能更有效地诱导受体聚集和多聚体结合，从而增强信号传导和T细胞激活	虽然在小鼠模型和临床I/II期试验中显示出良好效果，但还需要更大规模的临床试验验证其安全性和有效性	开发更有效的OX40靶向免疫疗法，克服传统二价激动剂的局限性	OX40受体和T细胞	免疫疗法	癌症	NF-kß报告基因检测、共聚焦显微镜、流式细胞术、单细胞RNA测序	NA	实验数据、临床样本数据	小鼠肿瘤模型、体外人类样本、临床I/II期试验(NCT04198766)的患者样本
94	2025-06-04	Correction to: "GnRH-Gonadotropes Interactions Revealed by Pituitary Single-cell Transcriptomics in Zebrafish" 2025-May-19, Endocrinology IF:3.8Q2 DOI:10.1210/endocr/bqaf098 PMID:40457745	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
95	2025-06-04	PERK+ Macrophages Drive Immunotherapy Resistance in Lymph Node Metastases of Oral Squamous Cell Carcinoma 2025-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3135 PMID:40036693	研究论文	本研究评估了口腔鳞状细胞癌（OSCC）患者淋巴结转移的病理反应率，并探索了改善治疗效果的潜在靶点	首次系统评估了OSCC患者淋巴结转移的病理反应率，并发现PERK+巨噬细胞在免疫治疗抵抗中的作用	研究样本来自单一临床试验，需要更大规模的研究验证结果	评估OSCC患者淋巴结转移对免疫治疗的病理反应并探索改善治疗效果的靶点	口腔鳞状细胞癌患者及其淋巴结转移灶	肿瘤免疫学	口腔鳞状细胞癌	单细胞转录组学、空间转录组学、多重免疫组化	NA	临床数据、转录组数据、免疫组化数据	参与II期临床试验的OSCC患者（NCT04649476）
96	2025-06-04	Mapping Inherited Genetic Variation with Opposite Effects on Autoimmune Disease and Four Cancer Types Identifies Candidate Drug Targets Associated with the Anti-Tumor Immune Response 2025-May-14, Genes IF:2.8Q2 DOI:10.3390/genes16050575 PMID:40428397	research paper	该研究通过基因组关联研究（GWAS）和功能基因组学分析，系统地寻找与自身免疫性疾病和癌症风险相反的遗传变异，以识别潜在的癌症免疫治疗靶点	首次系统地识别出312个独特的遗传变异，这些变异在自身免疫性疾病和四种癌症类型中表现出相反的风险效应，并确定了5个可能的癌症免疫治疗靶点基因	研究结果需要进一步的实验验证，且仅针对四种特定癌症类型	识别与自身免疫性疾病和癌症风险相反的遗传变异，以发现潜在的癌症免疫治疗靶点	乳腺癌、前列腺癌、卵巢癌和子宫内膜癌患者以及七种自身免疫/自身炎症性疾病患者	基因组学	乳腺癌、前列腺癌、卵巢癌、子宫内膜癌、自身免疫性疾病	GWAS、RNA-Seq、单细胞RNA-Seq	NA	基因组数据、转录组数据	240,540例癌症患者/317,000例对照，112,631例自身免疫性疾病患者/895,386例对照
97	2025-06-04	Competing dynamic gene regulatory networks involved in fibroblast reprogramming to hematopoietic progenitor cells 2025-05-13, Stem cell reports IF:5.9Q2 DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102473 PMID:40185089	研究论文	本研究通过开发一个诱导系统，将成纤维细胞重编程为造血祖细胞，并研究了重编程过程中的基因调控网络	揭示了SCL和LMO2转录因子在重编程过程中的作用，以及FLI1、GATA1/2和KLF14作为其直接靶点的重要性，同时发现抑制神经元命运的竞争信号通路可以提高重编程效率	研究仅限于成纤维细胞向造血祖细胞的重编程，未涉及其他细胞类型	提高体细胞直接重编程为造血细胞的效率和功能性	成纤维细胞和造血祖细胞	基因调控网络	NA	转录组和表观基因组分析、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据、表观遗传数据	NA
98	2025-06-04	IFN-γ and donor leukocyte infusions for relapsed myeloblastic malignancies after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation 2025-May-08, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.190655 PMID:40131369	research paper	该研究探讨了IFN-γ与供体白细胞输注（DLI）联合治疗异基因造血干细胞移植后复发的髓系恶性肿瘤的安全性和初步疗效	首次在临床试验中评估IFN-γ联合DLI治疗异基因造血干细胞移植后复发的髓系恶性肿瘤的效果，并通过单细胞RNA测序验证了IFN-γ在体内的作用机制	样本量较小（n=7），需要更大规模的研究来验证疗效	评估IFN-γ联合DLI治疗异基因造血干细胞移植后复发的髓系恶性肿瘤的安全性和初步疗效	异基因造血干细胞移植后复发的急性髓系白血病或骨髓增生异常综合征患者	血液肿瘤学	急性髓系白血病, 骨髓增生异常综合征	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	临床数据, 单细胞RNA测序数据	7名患者
99	2025-06-04	Klf9 promotes the repair of myocardial infarction by regulating macrophage recruitment and polarization 2025-May-08, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.187072 PMID:40198141	研究论文	本研究探讨了转录因子Klf9通过调节巨噬细胞招募和极化对心肌梗死后修复的促进作用	揭示了Klf9通过调控IFN-γ/STAT1信号通路影响巨噬细胞表型和功能的新机制	研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类样本验证	阐明Klf9在心肌梗死后炎症反应和伤口愈合中的作用	心肌梗死小鼠模型中的巨噬细胞	心血管疾病	心肌梗死	单细胞RNA测序、流式细胞术	Klf9基因敲除小鼠模型	基因表达数据、细胞表型数据	野生型和Klf9敲除小鼠
100	2025-06-04	The brain-body circuit mediates acute stress-induced antiinflammatory reflex in bacterial cystitis by suppressing ILC2 activation 2025-May-08, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.189362 PMID:40100274	研究论文	本研究揭示了急性应激通过大脑-身体回路抑制细菌性膀胱炎中的炎症反应，特别是通过抑制ILC2细胞的激活	首次发现急性应激通过大脑-身体回路（特别是PVN脑区）抑制膀胱炎症，并揭示了糖皮质激素通过直接调控ILC2细胞内的信号通路来调节炎症反应的机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探究心理应激如何通过大脑-身体回路调节膀胱感染的免疫反应	小鼠模型中的膀胱感染和免疫反应	免疫学	尿路感染	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	小鼠感染模型	基因表达数据	未明确说明小鼠数量，但涉及多个实验组