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当前共找到 32658 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-11-17 |
Single-cell atlas of human penile corpus cavernosum reveals cellular and functional heterogeneity of aging-related erectile dysfunction
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1671482
PMID:41234230
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类阴茎海绵体细胞图谱，揭示与衰老相关的勃起功能障碍的细胞和功能异质性 | 首次在单细胞分辨率下揭示衰老阴茎海绵体的细胞异质性和免疫微环境特征，识别了关键细胞亚群和分子特征 | 样本量较小（6例ARED患者），且对照组使用公开数据 | 阐明衰老相关勃起功能障碍的细胞和转录组异质性及免疫微环境 | 人类阴茎组织样本 | 单细胞组学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例老年ARED患者（4例轻度ED，2例重度ED）和3例年轻健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2025-11-17 |
A spatially resolved single-cell landscape of colorectal cancer liver metastasis reveals a stromal-tumor glycolytic signaling interaction
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1687485
PMID:41234356
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，揭示了结直肠癌肝转移中基质-肿瘤细胞通过HGF-MET-MYC信号轴形成糖酵解代谢生态位的空间机制 | 首次在空间分辨率水平发现高恶性度CRC亚群与基质成纤维细胞的空间共定位，并揭示HGF-MET-MYC信号轴驱动的糖酵解代谢生态位 | 样本数量有限（35个单细胞RNA-seq数据集），主要依赖计算分析需进一步实验验证 | 解析结直肠癌肝转移的分子和空间动态机制 | 结直肠癌原发肿瘤、肝转移灶及匹配正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, inferCNV, CytoTRACE, CellChat, NicheNet, 体外共培养, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 35个单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 83 | 2025-11-17 |
SegDecon bridges histology and transcriptomics through AI-based nuclei segmentation and image-informed spatial deconvolution
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.10.041
PMID:41234485
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研究论文 | 提出SegDecon计算框架，通过AI驱动的细胞核分割和图像信息空间解卷积连接组织学与转录组学 | 将图像衍生的细胞计数估计整合到贝叶斯解卷积中，使用HSV色彩空间转换、形态学过滤和深度学习实例分割增强细胞核分割 | 仅在鼠脑空间转录组数据上进行了评估，未在其他组织或物种中验证 | 提高空间转录组学中细胞组成空间定位的精确度 | 鼠脑组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习实例分割，改进的cell2location模型 | 组织图像，空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 84 | 2025-11-17 |
Single-cell sequencing reveals cellular heterogeneity and molecular mechanisms in tendon and enthesis injury repair
2025, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2025.1685955
PMID:41234689
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综述 | 本文通过单细胞测序技术揭示肌腱和骨附着点损伤修复过程中的细胞异质性及分子机制 | 利用多模态整合方法精确识别肌腱和骨附着点细胞亚群，阐明细胞间通讯及愈合过程中的分化路径 | NA | 探索肌腱和骨附着点损伤修复的细胞分子机制 | 肌腱和骨附着点细胞 | 单细胞生物学 | 肌腱损伤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-11-17 |
Unraveling porcine dendritic-cell diversity: welcome tDC and DC3
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1639553
PMID:41235223
|
研究论文 | 本研究通过流式细胞术和RNA测序技术揭示了猪树突状细胞的新型亚群tDC和DC3 | 首次在猪血液中鉴定出与人类和小鼠对应的过渡型树突状细胞(tDC)和DC3亚群 | tDC和DC3的核心功能尚未完全阐明，需要进一步功能验证 | 解析猪树突状细胞的异质性和亚群分类 | 猪树突状细胞 | 免疫学 | NA | 流式细胞术,RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2025-11-17 |
Single-cell/spatial integration reveals an MES2-like glioblastoma program orchestrated by immune communication and regulatory networks
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1699134
PMID:41235227
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组数据揭示了胶质母细胞瘤中由免疫通讯和调控网络协调的MES2样程序 | 首次整合单细胞RNA-seq、空间转录组和bulk数据系统解析胶质母细胞瘤间质程序，发现MES2样状态的空间分布特征和调控网络 | 样本量相对有限，功能验证主要在U251细胞系中进行，需要更多体内实验验证 | 解析胶质母细胞瘤间质程序的空间分布、临床意义和分子机制 | 胶质母细胞瘤患者样本和U251细胞系 | 数字病理 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组, bulk RNA-seq, 细胞功能实验 | 图神经网络(GNN), WGCNA, hdWGCNA, 贝叶斯反卷积 | 单细胞转录组, 空间转录组, bulk转录组 | TCGA队列157例, CGGA队列共225例, GBM组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | 10x Visium | Visium空间转录组技术 |
| 87 | 2025-11-17 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomics analysis reveals FLAD1 as a regulator of the immune microenvironment in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680101
PMID:41235234
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示FLAD1作为肝细胞癌免疫微环境调节因子的作用 | 首次整合单细胞和空间转录组学技术系统分析线粒体相关基因在肝细胞癌中的作用，发现FLAD1与肿瘤免疫微环境的结构性排斥相关 | NA | 探索线粒体相关基因在肝细胞癌进展中的作用及其与免疫微环境的关联 | 肝细胞癌组织样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,DNA甲基化分析,Western blotting | 九种机器学习算法的92种组合建模 | 基因表达数据,空间转录组数据,DNA甲基化数据,蛋白质印迹数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-11-17 |
The role of the MYL12A liquid-liquid phase separation in neutrophil improves the prognosis of acute respiratory distress syndrome: a multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1662680
PMID:41235230
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了MYL12A液-液相分离在急性呼吸窘迫综合征中性粒细胞中的保护作用机制 | 首次发现MYL12A通过磷酸化依赖性相分离动态调控中性粒细胞迁移，并证明LLPS评分可作为ARDS预后生物标志物 | 研究样本量有限，需要更大规模临床队列验证 | 探究液-液相分离在急性呼吸窘迫综合征发病机制中的作用及临床意义 | 急性呼吸窘迫综合征患者的中性粒细胞及fMLP刺激的中性粒细胞 | 多组学分析 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞转录组测序,蛋白质组学,免疫荧光,Western blotting,功能实验 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,临床队列数据 | 来自GEO数据库的单细胞转录组数据集(GSE157789)和蛋白质组数据集(GSE32707/GSE76293)，以及临床队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 89 | 2025-11-17 |
Integration of bulk and single-cell transcriptomic data reveals a novel signature related to liver metastasis and basement membrane in pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1671956
PMID:41235257
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk转录组数据，构建了一个与胰腺癌肝转移和基底膜相关的预后模型 | 首次整合单细胞和bulk转录组数据识别胰腺癌肝转移和基底膜相关基因，并构建包含COL7A1等六个标志基因的创新预后模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证；样本来源有限，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 构建胰腺癌肝转移和基底膜相关基因的预后模型，并验证其与免疫微环境和治疗疗效的关联 | 胰腺癌患者样本数据，包括TCGA、ICGC和GEO数据库的转录组、突变和临床数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，WGCNA分析，机器学习算法，多变量Cox回归分析 | 预后模型，机器学习算法，Cox回归模型 | 转录组数据，突变数据，临床数据 | TCGA-PAAD队列（训练集）和PACA-AU队列（验证集） | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2025-11-17 |
The single-cell revolution in transplantation: high-resolution mapping of graft rejection, tolerance, and injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1670683
PMID:41235239
|
综述 | 系统总结单细胞测序技术在移植生物学中的应用及其对移植排斥、免疫耐受和损伤机制的高分辨率解析 | 首次系统阐述单细胞技术如何将移植医学从形态学诊断推向分子内表型分析的新时代，揭示传统方法无法发现的细胞亚群和致病通路 | 临床转化仍面临挑战 | 阐明决定移植物命运的机制 | 实体器官和胰岛移植 | 数字病理学 | 移植相关疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 91 | 2025-11-17 |
Integrating scRNA-seq and machine learning identifies MNAT1 as a therapeutic target in OSCC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1663487
PMID:41235252
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和机器学习技术，构建了口腔鳞状细胞癌的预后模型并鉴定MNAT1为治疗靶点 | 首次构建基于T细胞相关泛素化基因的预后风险模型，并发现MNAT1在OSCC恶性进展中的关键作用 | 研究主要基于计算分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 开发口腔鳞状细胞癌的预后预测模型和寻找治疗靶点 | 口腔鳞状细胞癌患者和Cal27细胞系 | 机器学习 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序, WGCNA, LASSO算法, Spearman相关分析, 集落形成实验, Transwell实验 | 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2025-11-17 |
Multiomic Landscape Uncovers TRMT112 as a Central Driver of HPV-Positive Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/5308441
PMID:41235342
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示TRMT112作为HPV阳性头颈鳞状细胞癌的核心驱动因子 | 首次整合单细胞RNA测序、bulk RNA测序和空间转录组数据，发现TRMT112是HPV+HNSCC的关键风险基因并与免疫排斥微环境形成相关 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证机制 | 解析HPV阳性头颈鳞状细胞癌的分子机制和免疫景观 | 头颈鳞状细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组, 机器学习算法 | 高维加权基因共表达网络分析, 基因非负矩阵分解, 101种机器学习算法 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | TCGA-HNSC和GSE65858队列患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 93 | 2025-11-17 |
Glucokinase Regulatory Protein (GCKR) Links Metabolic Reprogramming With Immune Exclusion: Insights From a Pan-Cancer Analysis and Gastric Cancer Validation
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/4240223
PMID:41235343
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研究论文 | 通过泛癌分析和胃癌验证揭示了GCKR在代谢重编程与免疫排斥中的关键作用 | 首次系统描绘GCKR在泛癌中的表达和突变图谱，并发现其通过代谢重编程影响肿瘤免疫微环境的新机制 | 研究主要聚焦于胃癌验证，其他癌症类型的功能验证相对有限 | 探究GCKR在癌症中的遗传和功能作用及其与免疫微环境的关联 | 泛癌数据集和胃癌样本 | 生物信息学 | 胃癌 | 多组学分析、空间转录组学、单细胞分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据 | 泛癌数据集和胃癌验证样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞分析 | NA | NA |
| 94 | 2025-11-17 |
Comprehensive Analysis of the PANoptosis-Related Genes in Stroke Based on Single-Cell RNA-Seq and Spatial Transcriptomics
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/5828665
PMID:41235394
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序和空间转录组学综合分析脑卒中中的PANoptosis相关基因 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据，系统研究缺血性脑卒中中的PANoptosis分子特征 | 研究样本量有限，需要进一步实验验证TNFRSF1A的功能机制 | 探索PANoptosis在脑缺血再灌注损伤中的作用机制 | 缺血性脑卒中患者的脑组织样本 | 生物信息学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,Western blot | 多模态交叉分析,高维加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,批量转录组数据 | 多个数据集（包括GSE35338和GSE137482） | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2025-11-17 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.628020
PMID:39763850
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析，揭示了白细胞介素-1β在致心律失常性心肌病发病机制中的关键作用 | 首次在ACM中发现炎症-纤维化空间生态位，并证实靶向IL-1β治疗可改善疾病表型 | 研究样本量有限，动物模型结果需在人类中进一步验证 | 探究ACM疾病进展的分子机制并评估靶向治疗策略 | ACM患者心肌样本和Desmoglein-2突变小鼠模型 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | ACM患者和对照供者心肌样本 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 96 | 2025-11-17 |
Lung Tissue Multilayer Network Analysis Uncovers the Molecular Heterogeneity of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-Nov-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0500OC
PMID:38626356
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研究论文 | 通过多层网络分析整合肺组织多组学数据，揭示慢性阻塞性肺疾病的分子异质性 | 首次采用多层网络方法整合mRNA、microRNA和甲基化组数据，识别出具有不同分子特征但临床表现相似的COPD患者亚群 | 研究样本仅包含135名前吸烟COPD患者，需要更大规模验证 | 揭示COPD的分子异质性及其与临床特征的关系 | 135名前吸烟COPD患者的肺组织样本 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | mRNA测序,microRNA测序,甲基化测序,空间转录组学 | 机器学习模型,多层网络分析 | 分子组学数据,临床数据 | 135名前吸烟COPD患者 | NA | 空间转录组学,单组学分析 | NA | NA |
| 97 | 2025-11-17 |
Single-cell RNA sequencing unveils Lrg1's role in cerebral ischemia‒reperfusion injury by modulating various cells
2023-Nov-30, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02941-4
PMID:38037097
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Lrg1在脑缺血再灌注损伤中通过调节多种细胞功能状态的作用机制 | 首次在单细胞水平上系统阐明Lrg1通过调控多种细胞类型功能状态参与脑缺血再灌注损伤的机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究Lrg1在脑缺血再灌注损伤中的具体作用机制 | 野生型和Lrg1敲除小鼠的脑组织 | 单细胞组学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 微血管白蛋白渗漏检测 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 组织染色图像 | 野生型和Lrg1敲除小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2025-07-30 |
Leveraging single-cell spatial transcriptomics and connectomics to resolve brain circuit function in psychiatry
2026-Jan, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology
IF:6.6Q1
DOI:10.1038/s41386-025-02178-0
PMID:40721521
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2025-11-16 |
Periostin-positive stellate cells associated with perineural invasion in pancreatic adenocarcinoma
2026-Jan-01, Molecular and cellular endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1016/j.mce.2025.112678
PMID:41106801
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了胰腺星状细胞在胰腺癌神经侵袭中的关键作用 | 首次发现高表达Periostin的胰腺星状细胞在神经侵袭阳性样本中富集，并揭示了ANXA1-SPP1/PLAU信号轴在促进神经侵袭中的协调作用 | 样本量相对有限（24个活检标本），需要进一步功能验证实验确认机制 | 阐明胰腺导管腺癌中神经侵袭的细胞和分子机制 | 胰腺导管腺癌患者活检组织中的细胞群体 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 24个PDAC活检标本，约60,000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 100 | 2025-11-16 |
Cell-type deconvolution methods for spatial transcriptomics
2025-Dec, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00845-y
PMID:40369312
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综述 | 本文系统评述了空间转录组学中细胞类型反卷积方法的类型、功能对比，并创建了在线交互式表格以促进方法选择 | 开发了基于网络的交互式表格工具，帮助研究人员更高效地选择适合的空间转录组细胞类型反卷积方法 | NA | 评述空间转录组学中细胞类型反卷积方法的现状与发展 | 空间转录组学数据中的细胞类型组成 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |