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当前共找到 32188 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-11-06 |
Deconvolution and phylogeny inference of diverse variant types integrating bulk DNA-seq with single-cell RNA-seq
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf234
PMID:41169710
|
研究论文 | 提出TUSV-int框架，整合bulk DNA-seq和单细胞RNA-seq数据进行去卷积和系统发育推断 | 首次整合bulk DNA-seq和scRNA-seq数据，同时处理SNV、CNA和SV多种变异类型 | scDNA-seq数据成本高且技术挑战大，限制了在大规模队列中的常规应用 | 重建克隆谱系树以研究癌症进化 | 癌症基因组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 整数线性规划(ILP) | 系统发育推断模型 | DNA测序数据,RNA测序数据 | NA | NA | bulk DNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2025-11-06 |
Integrating single-cell transcriptomics and whole-genome CRISPR CAS9 screen identifies a cell cluster associated with tumor dependency in triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1705923
PMID:41179682
|
研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学和全基因组CRISPR筛选，识别出三阴性乳腺癌中与肿瘤依赖性相关的细胞亚群 | 首次结合单细胞转录组学与全基因组CRISPR筛选技术，系统识别三阴性乳腺癌肿瘤依赖性相关细胞亚群及其临床意义 | 研究主要基于公共数据库分析，实验验证仅限于体外细胞功能验证 | 识别三阴性乳腺癌的肿瘤依赖性基因和细胞亚群，探索新的治疗靶点 | 三阴性乳腺癌患者样本和细胞系 | 单细胞组学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA-seq, 全基因组CRISPR CAS9筛选, 基因组测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 基因组数据 | 多个公共数据库(TCGA-BRCA, METABRIC, DEPMAP)的样本数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因组测序 | NA | NA |
| 83 | 2025-11-06 |
Amelioration of intervertebral disc degeneration using engineered extracellular vesicle-delivered ZDHHC5 via inhibiting PANoptosis
2025 Jan-Dec, Journal of tissue engineering
IF:6.7Q1
DOI:10.1177/20417314251351011
PMID:41179831
|
研究论文 | 本研究通过工程化细胞外囊泡递送ZDHHC5抑制PANoptosis来改善椎间盘退变 | 首次发现PANoptosis是椎间盘退变的关键机制，并揭示PTH预处理的细胞外囊泡通过ZDHHC5/YBX1/ZBP1轴调控PANoptosis的新机制 | 细胞外囊泡产量有限且作用机制尚未完全明确 | 开发基于细胞外囊泡的椎间盘退变无细胞治疗策略 | 人脐带间充质干细胞来源的细胞外囊泡 | 细胞治疗 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2025-11-06 |
Enhanced ICOS Signaling Between Dendritic Cells and T Cells Characterizes the Immune Landscape of Human Cholangiocarcinoma
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/9981470
PMID:41180156
|
研究论文 | 通过整合分析两个独立的单细胞RNA测序数据集，全面绘制了人类胆管癌的细胞景观和细胞间通讯网络 | 首次发现树突状细胞与T细胞间增强的ICOS信号传导是胆管癌的显著特征，并验证了ICOS-ICOSL轴在CD8+T细胞活化中的功能重要性 | NA | 探索胆管癌肿瘤微环境中的细胞相互作用和免疫调控机制 | 人类胆管癌组织样本 | 单细胞分析 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序 | CellChat分析 | 单细胞转录组数据 | 两个独立数据集（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-11-06 |
Identification of keratinocyte-associated genes for immune characterization and drug response prediction in oral squamous cell carcinoma
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19953
PMID:41180476
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析识别口腔鳞状细胞癌中角质形成细胞相关基因，并构建诊断模型 | 首次系统分析角质形成细胞在OSCC中的作用机制，发现KRT16、CSTA和CSTB等新型生物标志物 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证样本量有限 | 识别角质形成细胞相关基因用于口腔鳞状细胞癌的免疫特征分析和药物反应预测 | 口腔鳞状细胞癌组织和细胞 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 加权基因共表达网络分析 | 诊断模型, 列线图 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的OSCC单细胞和批量RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2025-11-06 |
PTGDS: As a Specific Biomarker for Septic Cardiomyopathy
2025, Infection and drug resistance
IF:2.9Q2
DOI:10.2147/IDR.S554915
PMID:41180608
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研究论文 | 本研究通过RNA测序筛选脓毒症心肌病的特异性生物标志物，发现PTGDS作为新型诊断标志物 | 首次发现PTGDS作为脓毒症心肌病的特异性生物标志物，并通过单细胞RNA测序确定其在NK细胞和T细胞中的表达定位 | 基于初步概念验证队列，样本量有限 | 筛选脓毒症心肌病的特异性生物标志物，为早期识别和预后评估提供研究靶点 | 20例脓毒症患者和10例健康志愿者的外周血样本 | 生物信息学 | 脓毒症心肌病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, PPI分析, GO富集分析, KEGG通路分析, 生存分析, ROC曲线分析 | NA | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 | 30例样本（20例脓毒症患者，10例健康志愿者） | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2025-11-06 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals cell landscape and gene signatures associated with granulomatous lobular mastitis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1624640
PMID:41181111
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肉芽肿性小叶性乳腺炎的细胞景观和基因特征 | 首次对肉芽肿性小叶性乳腺炎进行单细胞RNA测序研究，鉴定了11种主要细胞群并发现M1巨噬细胞在疾病免疫病理中的核心作用 | 样本量较小（3例患者和3例对照），需要更大规模研究验证发现 | 系统比较GLM与健康乳腺组织的免疫微环境差异，揭示疾病相关细胞亚群和关键失调基因 | 肉芽肿性小叶性乳腺炎患者和健康对照的乳腺组织样本 | 单细胞组学 | 肉芽肿性小叶性乳腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例GLM患者和3例健康对照的乳腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-11-06 |
Correlation of immune cell subsets in the tumor microenvironment and peripheral blood with immunotherapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1633748
PMID:41181122
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析食管鳞癌肿瘤微环境和外周血中免疫细胞亚群与免疫治疗反应的相关性 | 首次系统揭示TIM3+ CD8+ T细胞在食管鳞癌免疫治疗中的预测价值，并建立了与临床疗效的定量关联 | 样本量有限，且为回顾性研究，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探索食管鳞癌免疫治疗反应的预测生物标志物 | 食管鳞癌患者肿瘤组织、癌旁组织及外周血样本 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | Seurat分析 | 基因表达数据, 流式细胞数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2025-11-06 |
Subtype-specific NK cell-TAM interactions drive a novel prognostic signature in HNSCC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1676878
PMID:41181127
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了头颈鳞状细胞癌中NK细胞与肿瘤相关巨噬细胞亚型特异性相互作用模式及其预后价值 | 首次系统解析HNSCC中NK细胞与TAM的亚型特异性相互作用网络，并构建了基于23个基因的预后特征模型CINT | 样本量相对有限（58例），需要在更大队列中进一步验证 | 探究头颈鳞状细胞癌免疫微环境中NK细胞与TAM的相互作用机制及预后意义 | 头颈鳞状细胞癌组织样本和公共数据库数据 | 肿瘤免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 免疫组织化学, 单细胞RNA测序, 多组学分析, 免疫荧光 | LASSO Cox回归 | 单细胞RNA测序数据, 公共数据库数据, 免疫组织化学图像, 免疫荧光图像 | 58例HNSCC组织样本，另使用TCGA-HNSC、GSE65858等公共数据库 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 90 | 2025-11-06 |
Gut microbiome as a potential mediator linking sexual behaviors to immune profiles in HIV-negative men who have sex with men: a multi-omics study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1659556
PMID:41181130
|
研究论文 | 通过多组学研究探讨男男性行为者中肠道微生物组如何介导性行为与免疫特征之间的联系 | 首次在HIV阴性MSM人群中整合肠道微生物组与免疫系统多组学数据，揭示性行为通过肠道微生物影响免疫特征的潜在机制 | 研究样本仅限于HIV阴性男男性行为者，结果可能不适用于其他人群 | 探究性行为如何通过肠道微生物组影响男男性行为者的免疫特征 | HIV阴性男男性行为者 | 多组学研究 | HIV易感性 | 16S rRNA基因测序, 批量转录组测序, 单细胞RNA测序, 贝叶斯分析 | PCA, Spearman相关分析, BayesPrism算法, 因果中介分析 | 粪便微生物组数据, 血液转录组数据 | HIV阴性男男性行为者队列 | NA | 16S rRNA测序, 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2025-11-06 |
TGF-β-driven T-cell exclusion in ovarian cancer: single-cell and spatial transcriptomic views of immune low-response states
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1698088
PMID:41181126
|
综述 | 总结TGF-β驱动的T细胞排斥在卵巢癌中的作用机制及单细胞与空间转录组学视角下的免疫低应答状态 | 整合单细胞RNA/ATAC测序与空间转录组学解析TGF-β信号相关的基质屏障机制，提出结合PD-1疗法与TGF-β轴靶向治疗的精准免疫新策略 | 存在病灶特异性异质性（附件/网膜/腹膜）、检测标准化不足及预测指标稀缺等临床转化挑战 | 探讨TGF-β信号通路在卵巢癌免疫微环境中的作用及精准免疫治疗策略 | 上皮性卵巢癌的肿瘤微环境（成纤维细胞/肿瘤细胞/免疫细胞） | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 92 | 2025-11-06 |
The effects of cryopreservation on PBMCs transcriptome profile
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1690316
PMID:41181136
|
研究论文 | 本研究评估了优化冷冻保存程序对外周血单个核细胞转录组特征的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统评估长期冷冻保存对PBMC转录组的影响 | 仅评估了6个月和12个月两个时间点，未涵盖更短或更长的保存时间 | 评估优化冷冻保存程序对PBMC细胞活性和转录组特征的影响 | 外周血单个核细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术，台盼蓝染色，碘化丙啶染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 冷冻保存6个月和12个月的PBMC样本，与新鲜细胞对比 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2025-11-06 |
B cell subpopulations and their role in the pathogenesis of primary Sjögren's syndrome: insights from single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1665086
PMID:41181153
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析原发性干燥综合征患者B细胞亚群及其在疾病发病机制中的作用 | 首次在pSS中通过单细胞RNA测序系统鉴定B细胞亚群，揭示I型干扰素信号通路、BCR克隆性改变和异常基因使用在发病机制中的关键作用 | 样本量较小（3例pSS患者和3例健康对照），需要在更大队列中验证发现 | 探讨B细胞在原发性干燥综合征发病机制中的潜在作用 | 原发性干燥综合征患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，GO和KEGG通路富集分析，转录因子分析，拟时序分析，细胞通讯分析，BCR repertoire分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 单细胞测序：3例pSS患者和3例健康对照；qRT-PCR验证：22例pSS患者和22例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 94 | 2025-11-06 |
Comprehensive analysis of single-cell and bulk transcriptomes reveals key B-cell genes and immune microenvironment regulation in bladder cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1600254
PMID:41181151
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研究论文 | 通过单细胞和批量转录组分析揭示膀胱癌中B细胞关键基因及免疫微环境调控机制 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序系统鉴定膀胱癌B细胞亚型的关键预后基因 | 样本量有限（8例患者肿瘤样本和4例正常样本） | 探索膀胱癌B细胞关键基因及其在肿瘤免疫微环境中的调控作用 | 膀胱癌患者的肿瘤组织和正常组织 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 体外实验验证 | 多组学分析 | 转录组数据 | 8例膀胱癌患者肿瘤样本和4例正常样本，共84,967个细胞（其中10,967个B细胞） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2025-11-06 |
Lactylation-Related Gene CALM1 Promotes Aortic Dissection via Immune Microenvironment Remodeling: Insights from Bioinformatics and Clinical Evidence
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S539938
PMID:41181366
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和临床证据揭示了乳酰化相关基因CALM1通过免疫微环境重塑促进主动脉夹层发生 | 首次系统研究乳酰化相关基因在主动脉夹层中的作用，发现CALM1可作为AD诊断的潜在生物标志物 | 仅验证了CALM1在临床样本中的表达差异，PARP1和PTBP1未显示显著差异 | 探讨乳酰化相关基因在主动脉夹层发病机制中的作用 | 主动脉夹层患者和健康个体的主动脉组织 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序，生物信息学分析 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 两个AD相关数据集(GSE 52093和GSE 98770)及临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2025-11-06 |
Gastric metastasis of renal cell carcinoma: features, mechanisms, and insights from existing literature
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1656858
PMID:41181710
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综述 | 本文综述肾细胞癌胃转移的临床特征、分子机制及治疗策略 | 整合多组学与单细胞测序技术解析器官特异性转移机制 | 基于回顾性病例系列数据，缺乏前瞻性研究验证 | 探讨肾细胞癌胃转移的病理机制与临床管理策略 | 肾细胞癌胃转移患者 | 肿瘤学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序、多组学分析 | NA | 临床病例数据 | 多中心病例系列（发病率0.2%-0.8%） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-11-06 |
Identification of Seven in absentia homolog 2 as a potential efferocytosis-related biomarker in diabetic foot ulcers
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0334163
PMID:41183121
|
研究论文 | 本研究识别了SIAH2作为糖尿病足溃疡中胞葬作用相关的潜在生物标志物 | 首次发现SIAH2在糖尿病足溃疡胞葬作用中的关键作用及其与预后的关联 | 样本量较小（20例患者），需要更大规模研究验证 | 探索糖尿病足溃疡伤口愈合中胞葬作用相关生物标志物 | II型糖尿病患者的血液和皮肤样本 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | RNA-seq, 单细胞测序, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床数据 | 20例II型糖尿病患者 | NA | 单细胞测序, RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2025-11-06 |
Unveiling and verification of mitochondria-related genes as potential diagnostic biomarkers in ulcerative colitis based on bioinformatics analysis and experimental validation
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0336224
PMID:41187148
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证，识别线粒体相关基因作为溃疡性结肠炎的潜在诊断生物标志物 | 首次构建基于20个线粒体相关基因的诊断模型，并验证ACADM和ACADSB基因在溃疡性结肠炎中的重要作用 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 构建溃疡性结肠炎的诊断模型并阐明线粒体相关基因在疾病发病机制中的作用 | 溃疡性结肠炎患者和健康对照 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | RNA测序，单细胞RNA测序，生物信息学分析 | 诊断模型 | 基因表达数据 | 465名溃疡性结肠炎患者和154名健康对照 | NA | RNA-seq，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2025-11-06 |
Construction and validation of an anoikis-related prognostic model for lung adenocarcinoma based on bulk and single-cell transcriptomic data
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0335788
PMID:41187171
|
研究论文 | 本研究基于批量和单细胞转录组数据构建并验证了一个肺腺癌失巢凋亡相关预后模型 | 首次结合批量转录组和单细胞RNA测序数据开发肺腺癌失巢凋亡相关基因预后模型，并揭示TIMP1通过促进Treg细胞活性导致免疫抑制微环境的机制 | 研究仅使用公共数据库的回顾性数据，需要前瞻性临床研究进一步验证 | 开发并验证肺腺癌失巢凋亡相关预后预测模型 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序，免疫组化，多重免疫荧光 | Cox回归，LASSO回归，随机森林，机器学习模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据，临床数据 | 两个GEO数据库肺腺癌队列 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2025-11-06 |
Finding differentially expressed genes between cell fates predicted by image-based deep learning
2025, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v22.0022
PMID:41189733
|
研究论文 | 开发了一种整合基于图像的深度学习细胞命运预测和单细胞转录组分析的方法，用于发现不同预测命运间的差异表达基因 | 将基于图像的细胞命运深度学习预测与单细胞全转录组分析相结合，在转录组谱未显示明显聚类时仍能检测差异表达基因 | 作为原理验证研究，仅应用于热应激诱导的细胞死亡模型，需要进一步验证在其他细胞命运决定过程中的适用性 | 发现细胞命运决定过程中的早期触发基因，理解细胞分化和疾病进展的分子机制 | 哺乳动物细胞系中经历热应激后命运不同的细胞（存活与死亡） | 计算机视觉, 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 延时成像, 深度学习 | 深度学习模型 | 图像, 转录组数据 | 经历热应激的哺乳动物细胞系细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 时间序列成像 | NA | NA |