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当前共找到 40374 篇文献,本页显示第 81 - 100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-06-13
Intra- and inter-organ communications in aging and cancer: Local and global spatial perspectives
2026-May, Seminars in cell & developmental biology IF:6.2Q1
综述 综述了衰老和癌症中细胞内及器官间通信的局部和全局空间视角,重点探讨了配体-受体相互作用和空间转录组学在该领域的应用 首次系统性地从空间视角整合了衰老与癌症转移中细胞内和器官间通信的配体-受体相互作用,并评估了相关的计算推断工具 未详细讨论验证特定配体-受体相互作用的实验方法,且对新兴空间组学技术(如多模态成像)的覆盖可能不全面 揭示衰老和癌症中细胞间通信失调如何重塑组织微环境,并探索靶向配体-受体相互作用的潜在治疗策略 衰老和癌症转移中的细胞间通信,包括局部肿瘤微环境和远端器官相互作用 数字病理学 癌症,老年病 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 文本,图像 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium空间转录组学
82 2026-06-13
DyGFormer:Transformer With Resistance-Distance Bias for Semi-Supervised Cell-Type Identification
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 提出了一种名为DyGFormer的半监督模型,通过结合阻力距离偏差的Transformer结构,用于单细胞空间转录组学中的细胞类型鉴定 首次将基于阻力距离的相对位置偏差引入Transformer,并结合邻居交互历史编码器和三元组度量的监督信号,实现输入依赖的细胞间连接权重学习 未明确说明局限性,但可能包括对空间先验的依赖以及跨平台泛化能力的进一步验证需求 开发一种半监督细胞类型鉴定方法,以应对单细胞空间转录组学中的测序噪声、跨平台异质性和有限标注预算等挑战 单细胞空间转录组学数据集(如NanoString/CosMx和MERFISH)中的细胞类型 机器学习 癌症 单细胞空间转录组学 Transformer 空间表达数据 多个跨组织和平台的数据集 NanoString 单细胞空间转录组学 CosMx Spatial Molecular Imager, MERFISH NA
83 2026-06-13
Single-Cell Analysis Identified a Recurrent Malignant-Associated Transcriptional State in Colorectal Cancer
2026-May, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 通过对四名日本结直肠癌患者的肿瘤和邻近正常组织进行单细胞RNA测序,鉴定出一个常见的恶性相关转录状态,其特征为长非编码RNA KCNQ1OT1高表达和RASSF6低表达 首次在单细胞水平上鉴定出日本结直肠癌患者中一个复发性恶性相关转录状态,并揭示该状态中KCNQ1OT1高表达和RASSF6低表达的特征,这在传统批量分析中难以发现 样本量较小(仅四名患者),可能无法完全代表日本人群的异质性;RASSF6的临床意义在东西方队列中存在差异,需进一步验证 利用单细胞转录组学技术解析结直肠癌的分子异质性,并鉴定与恶性相关的细胞状态 四名日本结直肠癌患者的肿瘤组织和邻近正常组织中的细胞群体 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 基因表达数据 4名患者的肿瘤组织和邻近正常组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
84 2026-06-13
TRAP5 Inhibition Targeting Scar-Associated Macrophages Ameliorates Acute Kidney Injury to Chronic Kidney Disease Transition
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
research paper 使用小鼠模型结合单细胞RNA测序,研究TRAP5阳性瘢痕相关巨噬细胞在急性肾损伤向慢性肾病转变中的作用,并验证TRAP5抑制的治疗潜力 首次发现并鉴定TRAP5阳性瘢痕相关巨噬细胞是急性肾损伤向慢性肾病转变的关键致病效应细胞,并证明靶向TRAP5可有效阻止该转变 主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;具体分子机制尚需进一步阐明 阐明急性肾损伤向慢性肾病转变的细胞机制并探索新的治疗靶点 小鼠肾脏巨噬细胞,人类慢性肾病活检组织 machine learning chronic kidney disease single-cell RNA sequencing, immunofluorescence NA single-cell transcriptome 3组小鼠(对照组、急性期、重塑期)共39,345个细胞,涵盖18个细胞簇;多种小鼠模型和人类活检样本 10x Genomics single-cell RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' sequencing
85 2026-06-13
DGAE: Dynamic Graph Convolutional Network for Multi-Slice Spatial Transcriptomics Alignment and Enhancement
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 提出基于动态图卷积网络(DGCNN)的多切片空间转录组学对齐与增强框架DGAE 首次将动态图卷积网络应用于多切片空间转录组数据对齐,能自适应更新节点嵌入以捕捉不同切片间的空间分布差异 未提及具体计算资源需求或大规模数据集的扩展性评估 多切片空间转录组数据的对齐与增强方法开发 空间转录组多切片数据 机器学习 未明确指定疾病范畴 空间转录组学 动态图卷积神经网络(DGCNN) 空间转录组数据 未明确样本量信息 NA 空间转录组学 NA NA
86 2026-06-13
ZBP1 Drives CD8+ T cell-mediated anti-tumor immunity in head and neck squamous cell carcinoma
2026-May, PLoS genetics IF:4.0Q1
研究论文 本研究鉴定ZBP1为头颈鳞状细胞癌中重编程免疫抑制微环境的关键免疫调节因子,能驱动CD8+ T细胞介导的抗肿瘤免疫 首次发现ZBP1通过重塑趋化因子信号网络和效应T细胞区室,将免疫“冷”肿瘤转化为免疫活性微环境,并作为双功能调节因子同步协调淋巴细胞募集和髓系抑制 研究主要基于体外模型和临床样本分析,缺乏体内多模型验证及基于人类HNSCC的泛癌验证,且ZBP1调控免疫微环境的具体分子机制尚需进一步阐明 探究ZBP1在头颈鳞状细胞癌免疫抑制微环境重编程中的作用及其分子机制 头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本、SCC-7/MOC2小鼠肿瘤模型 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 RNA-seq、多标免疫荧光、流式细胞术、单细胞转录组测序 多模型综合分析 转录组数据、空间蛋白数据、单细胞数据 92例头颈鳞状细胞癌标本 NA 单细胞转录组学 NA NA
87 2026-06-13
The intestinal microbiota impacts nutritional immunity and resistance to Acinetobacter baumannii pneumonia
2026-Apr-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 研究抗生素治疗导致肠道微生物群失调,增加肺部对鲍曼不动杆菌肺炎的易感性,并揭示其通过影响营养免疫机制的作用 首次通过单细胞RNA测序揭示抗生素引起的肠道微生物群失调通过削弱吞噬细胞营养免疫途径(如脂钙蛋白-2和钙卫蛋白)来加重肺部感染 未提及具体限制,但可能包括基于小鼠模型的推广性和人类患者队列的样本大小 探究抗生素治疗与肠道微生物群破坏对鲍曼不动杆菌肺炎易感性的机制关联 住院患者队列和鼠模型中的肠道微生物群、肺部和免疫细胞 机器学习 肺炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 住院患者队列和鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序系统
88 2026-06-13
Depletion of macrophages during early postnatal development leads to disrupted tooth root development and altered Gli1⁺ MSC trajectory
2026-Apr-26, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 研究揭示巨噬细胞在小鼠出生后牙根发育中通过TGF-β信号调控Gli1⁺间充质干细胞命运的关键作用 首次明确巨噬细胞作为牙根发育微环境关键组分,通过旁分泌TGF-β调控Gli1⁺ MSCs的骨/牙本质分化,揭示了免疫-间充质互作的新机制 未涉及人类样本验证,且巨噬细胞耗竭实验可能影响其他免疫细胞功能 探究巨噬细胞在牙根发育过程中的功能及其分子机制 出生后小鼠磨牙及牙根组织中的巨噬细胞与Gli1⁺间充质干细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序、氯膦酸盐脂质体介导的巨噬细胞耗竭、体外共培养 NA 单细胞测序数据、组织学图像 小鼠模型,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'测序平台
89 2026-06-13
PW1+ cells give rise to cardiac adipocytes during development and myofibroblasts following injury
2026-Apr-25, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 该研究利用遗传谱系追踪等方法,揭示PW1+细胞在心脏发育过程中分化为心脏脂肪细胞,在心肌梗死后分化为肌成纤维细胞 首次证明PW1+细胞具有祖细胞特性,能够在不同生理条件下分化为心脏脂肪细胞和肌成纤维细胞,为心脏脂肪生成和纤维化提供新见解 未提及具体局限性,但可能包括体外实验与体内环境的差异、仅使用小鼠模型等 探究PW1+细胞在心脏中是否具有干细胞特性,并评估其在发育和损伤后的分化潜能 PW1+细胞在小鼠心脏中的命运和功能 细胞生物学 心肌梗死 遗传谱系追踪、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用Pw1pCreER/m+;R26-tdT和Pw1p2A-CreER/m+;R26-tdT小鼠模型,具体样本量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
90 2026-06-13
Geometry-aware graph attention networks to explain single-cell chromatin states and gene expression with SEAGALL
2026-Apr-23, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 提出SEAGALL方法,利用几何感知图注意力网络解释单细胞染色质状态和基因表达 融合几何正则化自编码器与可解释图注意力网络,量化分子特征对细胞表型的影响,从多组学数据中提取特异且稳定的基因特征 未提及具体限制 开发深度学习方法解释单细胞测序数据中分子特征对细胞身份的影响 单细胞染色质状态和基因表达数据 机器学习 NA 单细胞测序 几何正则化自编码器、图注意力网络 单细胞数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
91 2026-06-13
TNF-α blockade mitigates immune checkpoint-related nephritis in a humanized mouse model
2026-Apr-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 该研究利用人源化嵌合PD-1/PD-L1小鼠模型,评估了免疫检查点抑制剂单独或联合促炎细胞因子对肾脏的影响,并测试了选择性TNF-α阻断能否预防ICI相关的急性间质性肾炎 首次在人源化小鼠模型中复制了ICI急性间质性肾炎的关键特征,并验证了TNF-α阻断剂对肾脏的保护作用 未提及具体局限性 探究TNF-α阻断剂在预防免疫检查点抑制剂相关肾炎中的潜在作用 人源化嵌合PD-1/PD-L1小鼠模型 机器学习 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠样本,按对照组、ICI组、ICI-细胞因子组和ICI-阻断组分为4组 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'测序
92 2026-06-13
AKAP12-LMOD1 signaling defines stromal CAF activation and epithelial junction loss in colorectal cancer
2026-Apr-20, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究定义了AKAP12-LMOD1信号在结直肠癌中作为区室依赖的基质程序,连接ACTA2阳性基质与间隙连接特征、纤维化和M2样巨噬细胞极化,而上皮区室则与紧密连接特征相关 首次发现AKAP12-LMOD1轴在结直肠癌肿瘤微环境中呈现区室依赖的表达模式,并阐明其在癌症相关成纤维细胞(CAF)激活和上皮连接丢失中的双重作用机制 研究主要基于体外共培养模型,缺乏体内动物模型验证;功能验证限于CAF-巨噬细胞非接触共培养系统,未涉及其他免疫细胞类型的相互作用 阐明AKAP12-LMOD1信号在结直肠癌上皮-基质相互作用中的区室依赖作用机制 结直肠癌肿瘤组织和匹配正常组织 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, 多重免疫荧光 NA 基因表达数据, 图像 结直肠癌肿瘤组织和匹配正常组织样本(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞RNA测序和10x Visium空间转录组学平台
93 2026-06-13
Spatial profiling of chronic liver disease: a pilot spatial case series
2026-Apr-20, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过空间转录组学对慢性肝病的空间组织进行初步病例系列研究 首次利用基于测序的空间转录组学,在保留组织学背景的情况下,系统比较酒精相关肝病、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎和慢性丙型肝炎三种主要病因的肝脏空间结构,并开发了能原位检测肝炎病毒RNA的工作流程 样本量较小,仅8个组织样本,4例通过质量控制,且HBV样本未纳入核心分析,结果可能缺乏普适性 探究不同病因慢性肝病的空间组织特征及其共享的假小叶功能结构 慢性肝病患者的肝脏组织样本,包括酒精相关肝病、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎和慢性丙型肝炎 数字病理学 慢性肝病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 8个肝脏组织样本,4例通过质量控制 NA 空间转录组学 NA 基于测序的空间转录组学方法,包含肝炎病毒RNA原位检测工作流程
94 2026-06-13
The ZNF737-CXCL10 axis drives immune exclusion and resistance to anti-PD-1 therapy in bladder cancer
2026-Apr-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本文系统性地鉴定了ZNF737转录因子在膀胱癌中驱动免疫排斥和抗PD-1治疗耐药的关键作用与机制 首次发现ZNF737通过直接转录抑制趋化因子CXCL10,导致CD8+ T细胞募集受损和抗原特异性细胞毒性降低,从而塑造免疫排斥肿瘤微环境 研究主要基于体外实验和人源化小鼠模型,尚未在更大规模临床队列中验证ZNF737作为治疗靶点的可行性 揭示膀胱癌中肿瘤内在分子驱动因子及免疫排斥微环境的表观遗传调控机制 膀胱癌患者肿瘤组织样本、BLCA细胞系、HLA匹配的人源化小鼠模型 数字病理学 膀胱癌 NGS, 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 双荧光素酶报告基因检测, MHC-I限制性细胞毒性检测 NA 图像, 文本 多个独立患者队列(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于scRNA-seq分析
95 2026-06-13
Norepinephrine promotes colorectal cancer liver metastasis via mechanisms dependent on Kupffer cells
2026-Apr-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过整合临床分析、单细胞转录组谱和体内外机制实验,揭示了去甲肾上腺素通过依赖库普弗细胞的β2-AR/PI3K/Akt信号通路促进结直肠癌肝转移的神经免疫机制 首次阐明去甲肾上腺素通过β2-AR信号通路重编程肝脏驻留库普弗细胞向促转移表型转化的机制,并发现CXCL12-CXCR4轴在其中起关键作用 仅基于小鼠模型和体外实验验证机制,缺乏大规模临床队列验证;未深入探讨其他儿茶酚胺类物质的潜在协同作用 探究去甲肾上腺素如何影响结直肠癌肝转移过程中肝脏驻留巨噬细胞的免疫微环境 结直肠癌肝转移患者样本、小鼠肝转移模型、原代库普弗细胞及结直肠癌细胞系 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、临床表型数据 临床样本包括有肝转移和无肝转移的结直肠癌患者 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
96 2026-06-13
Demethylation-primed tandem CD19/CD20 CAR T cells in relapsed/refractory B-cell lymphoma: a phase I/II trial
2026-Apr-15, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 评估地西他滨预处理的CD19/CD20双靶向CAR T细胞在复发/难治性B细胞淋巴瘤中的安全性和疗效 首次临床验证地西他滨预处理策略可增强CAR T细胞的持久性和疗效,并通过单细胞测序揭示其通过富集记忆样祖细胞并上调T细胞适应性相关基因的机制 单臂非随机设计,样本量有限(23例),且缺乏与未修饰CAR T细胞的直接随机比较 评估地西他滨预处理的CD19/CD20双靶向CAR T细胞在复发/难治性B细胞淋巴瘤中的安全性和疗效 23例复发或难治性非霍奇金淋巴瘤患者 数字病理学 B细胞淋巴瘤 CAR T细胞疗法, 单细胞测序 NA 临床数据, 单细胞测序数据 23例复发/难治性非霍奇金淋巴瘤患者 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序用于分析CAR T细胞
97 2026-06-13
PIM1 kinase-regulated cellular metabolism sustains differentiation and function of effector CD8+ T cells during chronic viral infection
2026-04-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和Compass算法分析慢性病毒感染中CD8+ T细胞的代谢异质性,发现PIM1激酶通过IL-21信号通路调控效应CD8+ T细胞的分化和功能 首次利用Compass算法揭示慢性感染中前体、效应和衰竭CD8+ T细胞亚群的代谢异质性,并阐明IL-21-PIM1轴对晚期效应CD8+ T细胞代谢重编程的调控作用 研究主要基于小鼠模型(淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒克隆13模型),可能不完全代表人类慢性感染中的情况 探究慢性病毒感染中CD8+ T细胞分化过程中的代谢调控机制 慢性病毒感染中的CD8+ T细胞(包括前体、效应和衰竭亚群)及IL-21产生的CD4+ T细胞 机器学习 慢性病毒感染 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA 利用Compass算法进行代谢状态预测,基于单细胞RNA测序数据
98 2026-06-13
Genomic characterization of sub-populations in human pluripotent stem cell-derived retinal progenitor cells driving retinal lamination
2026-Apr-14, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 研究人胚胎干细胞来源的视网膜祖细胞亚群驱动视网膜层状形成的基因组特征 首次揭示了经典WNT2B-FZD7和非经典WNT5A信号通路在视网膜早期形态发生中的序贯作用,并发现宿主视网膜环境对移植感光细胞排列和功能整合的强大驱动作用 体外非层状和有层状视网膜球体的结构差异在移植后未影响感光层形成,但研究未深入探讨其他信号通路或环境因子的具体机制 探究视网膜球体层状形成机制及移植后的功能整合 来自人胚胎干细胞来源视网膜类器官的Rax::GFP阳性视网膜祖细胞 分子生物学 视网膜退行性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 分化过程中的视网膜球体样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA-seq NA NA
99 2026-06-13
Intraovarian injection of securinine stimulates the growth of small ovarian follicles by reducing stromal suppression
2026-Apr-13, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文发现神经药物一叶萩碱可通过卵巢内注射促进小卵泡生长,改善老年小鼠生育能力,并在老年食蟹猴中验证其促进卵泡发育效果,为卵巢早衰及卵巢储备功能减退提供潜在治疗新策略 首次发现神经药物一叶萩碱可被重新用于促进小卵泡生长,并通过单细胞RNA测序揭示其通过缓解卵巢基质细胞外基质对颗粒细胞的负调控发挥作用的机制 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限(小鼠和食蟹猴),以及需要进一步临床验证 研究一叶萩碱促进小卵泡生长的潜力及其机制,评估其作为卵巢内注射治疗女性不孕/生育力低下的候选药物 老年小鼠和老年食蟹猴的卵巢组织 数字病理学 卵巢早衰、卵巢储备功能减退、高龄相关不孕 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 老年小鼠(数量未具体说明)和老年食蟹猴(数量未具体说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
100 2026-06-13
Design of the biosensor-dependent coupling system stabilizes the high-synthesis phenotype of cell factory
2026-Apr-13, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 开发了一种快速转录组挖掘工作流程,用于设计响应甘草次酸和美迪紫檀素的酵母生物传感器,并通过生长偶联电路稳定细胞工厂的高合成表型 报道一种通用的转录组挖掘方法快速获得天然产物响应生物传感器;通过精细调控PDR5启动子扩大动态范围并构建生长成瘾电路,结合单细胞转录组揭示群体分工机制 未明确说明该工作流程对其他天然产物的普适性验证,以及长期传代过程中电路稳定性 解决微生物细胞工厂中产量漂移和菌株退化问题,通过生物传感器依赖的偶联系统稳定高合成表型 酵母细胞工厂及其对甘草次酸和美迪紫檀素的生物合成 合成生物学 NA 生物传感器设计,转录组挖掘,单细胞转录组测序 生长偶联电路模型 单细胞转录组数据 酵母菌株群体(初始株与进化株) NA 单细胞RNA-seq NA NA
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