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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-06-17
Reactive oligodendrocytes promote glioblastoma progression through CCL5/CCR5-mediated glioma stem cell maintenance
2026-01-21, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 利用单细胞和空间转录组学技术,揭示反应性少突胶质细胞通过CCL5/CCR5信号轴维持胶质瘤干细胞,促进胶质母细胞瘤进展 首次发现胶质母细胞瘤细胞通过fractalkine信号将少突胶质细胞招募至肿瘤边缘,并诱导其进入类似脱髓鞘炎症和创伤损伤的IFN诱导反应状态,且CCL5/CCR5轴作为可药物靶点 未明确提及具体局限性,但可能包括依赖小鼠模型的局限性以及临床转化仍需进一步验证 研究少突胶质细胞在胶质母细胞瘤微环境中的功能作用及其对肿瘤进展的影响 原发性及复发性胶质母细胞瘤肿瘤组织、少突胶质细胞、胶质瘤干细胞 机器学习 胶质母细胞瘤 单细胞转录组测序、空间转录组测序、免疫组化、细胞因子分析、迁移实验 NA 基因表达数据、图像 原发性及复发性胶质母细胞瘤肿瘤样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞测序平台用于单细胞转录组,10x Visium用于空间转录组
82 2026-06-17
Genetically supported mediators linking peripheral metabolism to cerebral ischemia: a multi-omics characterization of HMGCR, TLR4, and MMP9 in angina pectoris and stroke
2026-Jan-09, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3
研究论文 利用多组学整合分析,鉴定出HMGCR、TLR4和MMP9作为连接心绞痛与缺血性卒中的遗传中介因子 首次通过多组学框架(孟德尔随机化、转录组学、单细胞RNA-seq)揭示外周代谢-炎症通路介导心绞痛向缺血性卒中转化的分子机制 未提及具体局限性 探究心绞痛与缺血性卒中之间的因果中介因子及外周-中枢信号传导机制 心绞痛和缺血性卒中患者的外周血及脑组织样本 多组学整合分析 心血管疾病,脑血管疾病 孟德尔随机化(BWMR)、转录组学分析、Boruta特征选择、分子对接、CIBERSORT、单细胞RNA-seq 多层感知器分类器(MLPC) 基因组数据、转录组数据(bulk RNA-seq和scRNA-seq) 大样本GWAS数据(n=628,000) NA 单细胞RNA-seq NA CIBERSORT用于免疫细胞浸润分析,scRNA-seq用于免疫细胞亚群分析
83 2026-06-17
BST2 expression at astrocyte borders promotes microglial recruitment via the C3/C3aR signaling
2026-01-07, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞测序和空间转录组学技术,发现星形胶质细胞边缘表达的BST2通过C3/C3aR信号促进小胶质细胞招募,在脑损伤后形成病变边界并调节神经功能 首次鉴定出星形胶质细胞边缘表达的BST2蛋白通过PKCβII磷酸化增强C3表达,进而调控星形胶质细胞-小胶质细胞相互作用,为脑卒中后早期脑损伤提供潜在治疗靶点 研究主要基于小鼠模型,BST2在人类脑损伤中的具体作用机制及临床转化潜力尚需进一步验证 阐明星形胶质细胞边界特征及其与小胶质细胞的相互作用机制,探索BST2作为脑卒中治疗靶点的可能性 脑损伤后边界星形胶质细胞、小胶质细胞以及它们之间的相互作用 机器学习 脑血管疾病 单细胞测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间基因表达数据 小鼠模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3‘测序和10x Visium空间转录组学
84 2026-06-17
Customized Design and Preparation of Bionic Drug Delivery System Leveraging Single-Cell RNA Sequencing for Precisely Targeted Therapy
2026-01, Advanced healthcare materials IF:10.0Q1
研究论文 本文报道了一种基于单细胞RNA测序定制的仿生药物递送系统,用于急性肾损伤的精准靶向治疗 首次利用单细胞RNA测序识别病理进展关键细胞亚型(PTIs)并筛选特异性细胞粘附分子(VCAM1和ICAM1)作为靶向递送介体,据此定制设计和制备了仿生药物递送系统BRNCs@AMMOs 未提及具体局限性,但可能包括体内分布和长期安全性需进一步评估 开发一种单细胞RNA测序引导的仿生药物递送系统,用于急性肾损伤的靶向治疗 急性肾损伤的关键细胞亚型(PTIs)及相应的靶向递送介体(VCAM1和ICAM1) 数字病理学 急性肾损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确提及样本数量,但涉及体外和体内实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
85 2026-06-17
Notch signaling is a driver of glandular stem cell activity and regenerative migration after damage
2026-01, The EMBO journal
研究论文 通过多组学整合方法揭示Notch信号在小鼠唾液腺类器官模型中调控干细胞活性及辐射损伤后再生迁移的作用 首次采用整合单细胞RNA测序、批量ATAC和RNA测序的多组学方法,结合体外类器官模型与体内组织验证,系统解析了Notch信号在腺体干细胞自我更新和辐射诱导迁移中的保守调控机制 研究主要基于小鼠模型,虽然扩展到人和鼠的多种腺体类器官,但人体内验证数据有限,且未深入探讨Notch信号下游的具体分子通路细节 探究腺体器官中稀有静止干细胞的调控机制,特别是Notch信号在辐射损伤后干细胞自我更新和迁移中的作用 小鼠唾液腺类器官、辐射损伤小鼠唾液腺组织、小鼠及患者来源的唾液腺、乳腺和甲状腺类器官 数字病理学 放射性损伤相关疾病 单细胞RNA测序, 批量ATAC测序, 批量RNA测序 NA 基因表达数据, 染色质可及性数据 小鼠唾液腺类器官多时间点样本及辐射损伤后样本,小鼠唾液腺组织样本,以及人和鼠的唾液腺、乳腺和甲状腺类器官样本 NA 单细胞RNA测序, 批量ATAC测序, 批量RNA测序 NA NA
86 2026-06-17
Cyst-independent oocyte phagocytosis builds the female reproductive reserve in mice
2026-01, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 开发高分辨率四维卵巢成像系统,发现小鼠卵母细胞通过独立于囊肿的吞噬作用构建生殖储备 发现卵母细胞以独立细胞形式而非囊肿结构进行选择,并通过吞噬牺牲卵母细胞碎片来富集细胞质和支持存活 实验仅在模型小鼠中进行,未在人类或其他哺乳动物中验证 揭示哺乳动物卵巢发育中卵母细胞命运决定的机制 小鼠卵母细胞 自然语言处理 NA NA NA 图像, 基因表达数据 小鼠卵巢样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
87 2026-06-17
A low-level Cdkn1c/p57kip2 expression in spinal progenitors drives the transition from proliferative to neurogenic modes of division
2026-01, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本研究利用鸡胚神经管的单细胞RNA测序数据,鉴定出细胞周期调节因子Cdkn1c作为从增殖性分裂转向神经源性分裂模式的关键驱动因子,其低表达水平在神经祖细胞中启动这一转变 首次揭示Cdkn1c/p57kip2的低表达水平而非高表达水平驱动神经祖细胞从增殖性向神经源性分裂模式转变,并提出其在不同表达阶段具有双重功能 主要基于鸡胚模型,未在哺乳动物或人类系统中验证,且低表达调控机制的分子细节尚不完整 探究脊椎动物神经发生过程中从对称增殖性分裂向不对称神经源性分裂转变的分子调控机制 鸡胚神经管中的神经祖细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 鸡胚神经管细胞(具体数量未在摘要中提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
88 2026-06-17
Transcript profiling and gene regulation of the human pre-implantation embryo: parental effects and impact of ARTs
2026-01-01, Human reproduction update IF:14.8Q1
综述 探讨人植入前胚胎转录组受亲本特征、辅助生殖技术(ART)条件和胚胎因素影响的综述 首次系统综述了影响人植入前胚胎转录组的多重因素,包括亲本特征、ART干预和胚胎内在因素,并利用单细胞RNA测序数据比对各细胞谱系特异性表达变化 关于多囊卵巢综合征、子宫内膜异位症、卵巢储备功能减退、精子异常、不明原因不孕及ART技术影响的证据仍然有限 探究亲本特征、ART条件和胚胎内因如何影响人植入前胚胎转录组,并识别不同因素中共有的失调分子通路 人植入前胚胎(尤其囊胚阶段)的转录组数据 自然语言处理 不孕症 单细胞RNA测序 NA 文本(综述信息)、基因表达数据 NA(综述,包含多篇研究数据) NA 单细胞RNA-seq NA NA
89 2026-06-17
Conserved Ductular Reaction Mechanisms in Biliary Atresia and Primary Sclerosing Cholangitis Derived From Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
综述 基于单细胞和空间转录组学研究胆道闭锁与原发性硬化性胆管炎中保守的导管反应机制 揭示了两种胆道疾病中导管反应共享的上皮、间充质和先天免疫机制,而适应性免疫机制存在差异 未来需要涵盖早期和晚期疾病样本,特别是非肝硬化PSC;单细胞空间转录组技术可提高配体-受体相互作用预测的置信度 阐明胆道闭锁和原发性硬化性胆管炎中导管反应的保守机制以识别通用治疗靶点 胆道闭锁和原发性硬化性胆管炎患者的肝脏组织样本 机器学习 胆道疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
90 2026-06-17
Integrative Single-Cell Transcriptomics and Network Pharmacology Analysis of Xiao Qing Long Tang in Pediatric Cough-Variant Asthma
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 通过整合单细胞转录组学和网络药理学分析,探究小青龙汤在小儿咳嗽变异性哮喘中的作用机制 首次利用单细胞RNA测序技术构建儿童哮喘气道上皮细胞的单细胞图谱,并结合网络药理学分析中药复方小青龙汤的多靶点作用机制 NA 揭示儿童咳嗽变异性哮喘的细胞异质性和分子机制,并探索小青龙汤的潜在治疗靶点 儿童哮喘患者的气道上皮组织 自然语言处理, 机器学习 哮喘 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) Monocle算法 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Genomics 单细胞RNA测序平台
91 2026-06-17
A Cross-Tissue Multiomics Analysis Reveals the Protective Role of TGFBR3 in Postmenopausal Osteoporosis
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 通过跨组织多组学分析揭示TGFBR3在绝经后骨质疏松中的保护作用 首次整合人类跨组织转录组谱发现TGFBR3作为绝经后骨质疏松的新型保护性调控因子,并结合遗传流行病学、单细胞转录组学及动物模型进行多层次机制验证 未提及具体局限性 发现绝经后骨质疏松的保守遗传调控因子并表征其生物学功能 绝经后骨质疏松患者的外周血单核细胞、骨髓及骨组织转录组数据,以及卵巢切除小鼠模型 机器学习 骨质疏松 RNA测序, 孟德尔随机化, 单细胞转录组学 机器学习算法组合(108种) 转录组数据 人类样本:外周血单核细胞、骨髓、骨组织;小鼠模型:卵巢切除骨质疏松模型 NA NA NA NA
92 2026-06-17
Rapid establishment of KRAS-driven bladder cancer initiation and immune escape models using genetically engineered mice and organoid approaches
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 结合基因工程小鼠模型和类器官技术快速建立KRAS驱动的膀胱癌起始和免疫逃逸模型 首次将新型基因表达小鼠模型与先进类器官技术结合,利用单细胞测序纵向追踪肿瘤演化和细胞动态,建立可扩展且生理相关的临床前药物筛选平台 未明确说明局限性 开发膀胱癌起始和免疫逃逸的快速模型以推动肿瘤生物学和药物开发研究 KRAS驱动的膀胱癌起始和免疫逃逸模型 机器学习 膀胱癌 单细胞测序 基因工程小鼠模型 单细胞数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
93 2026-06-17
ecPICK: A deep learning-enabled spatial diagnostic platform for direct ecDNA identification and clinical prognosis across pan-cancer histopathology
2026, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 开发一种名为ecPICK的深度学习框架,通过常规H&E染色全切片图像直接识别和定位染色体外DNA,并评估其在泛癌病理中的诊断和预后价值 首次将深度学习应用于常规病理切片的ecDNA空间诊断,无需昂贵测序即可实现ecDNA定性和定量分析,并揭示ecDNA富集区域的独特肿瘤微环境特征 需要进一步验证模型在不同染色条件和扫描仪下的一致性,以及更大规模临床队列的泛化能力 开发一种经济高效、可临床转化的ecDNA诊断平台,实现常规病理样本中的ecDNA定量和空间定位 来自20种不同癌症的4280张H&E染色全切片图像及其对应的ecDNA状态 数字病理学 泛癌(肺癌、前列腺癌等20种癌症) 深度学习、荧光原位杂交、空间转录组学 深度卷积神经网络 图像(H&E染色全切片图像) 4280张来自20种癌症的H&E染色图像 NA 空间转录组学 NA NA
94 2026-06-17
Multisite Assessment of Methods for Cell Preservation Upstream of Single-Cell RNA Sequencing
2026, Journal of biomolecular techniques : JBT
研究论文 评估三种单细胞RNA测序前细胞保存方法(10x Genomics FLEX、Parse Biosciences Evercode WT v2和Honeycomb Bio HIVE)的性能和可重复性 通过多中心、跨平台研究系统比较三种商业化细胞保存方案,揭示其在不同细胞类型保留、基因检测灵敏度和跨站点重复性方面的差异 仅使用单个健康个体的样本,未涵盖疾病状态或多样本人群;未评估保存后的长期稳定性 评估不同细胞保存方法在上游单细胞RNA测序中的性能和可重复性 来自单个健康个体的总白细胞和外周血单核细胞 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 1个健康个体的白细胞和PBMC样本 10x Genomics, Parse Biosciences, Honeycomb Bio 单细胞RNA测序 10x Chromium FLEX, Parse Biosciences Evercode WT v2, Honeycomb Bio HIVE, 10x 3' v3.1 10x Genomics FLEX固定方案、Parse Biosciences Evercode WT v2固定方案、Honeycomb Bio HIVE冻存方案、10x 3' v3.1新鲜处理方案
95 2026-06-17
CLIC6 and ANLN: novel exosome-related prognostic markers and therapeutic targets in lung adenocarcinoma
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究基于CLIC6和ANLN等外泌体相关基因构建肺腺癌预后模型,并评估其免疫特征和治疗价值 首次鉴定CLIC6和ANLN为外泌体相关新型预后标志物,并结合免疫浸润和单细胞分析揭示其在肺腺癌中的免疫调控机制 仅基于TCGA和GEO公共数据库,缺乏多中心外部验证队列;ANLN功能验证仅在有限细胞系中进行 探索肺腺癌中外泌体相关基因的预后价值及免疫治疗反应预测潜力 肺腺癌肿瘤样本(TCGA和GEO公共数据)、A549和NCI-H838肺腺癌细胞系 机器学习 肺癌 RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR LASSO回归, 共识聚类 基因表达数据, 单细胞转录组数据 未明确说明(利用TCGA和GEO公共数据库,样本量需参考原文) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
96 2026-06-17
Integrative profiling of lactylation reveals prognostic biomarkers and an immunosuppressive niche in acute myeloid leukemia
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合分析急性髓系白血病中乳酰化修饰谱,鉴定出预后生物标志物并揭示免疫抑制微环境 首次系统构建急性髓系白血病的乳酰化相关基因图谱,结合机器学习算法和多组学数据鉴定出GZMB和LSP1两个关键基因,并通过孟德尔随机化验证其因果关系 研究主要基于公开数据库的转录组数据,缺乏多中心独立验证队列,且乳酰化修饰的机制验证主要限于体外实验 阐明急性髓系白血病中乳酰化修饰的调控景观,发现预后生物标志物和潜在治疗靶点 急性髓系白血病患者样本及细胞系(Kasumi-1细胞) 机器学习 急性髓系白血病 RNA-seq, 单细胞测序, 免疫组化, 分子对接 LASSO-logistic, SVM-RFE, Boruta, GLM, CIBERSORT 转录组数据, 单细胞测序数据 来自GEO和TCGA数据库的公开数据集,具体样本量未明确说明 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
97 2026-06-17
Identification of CCND1 and IL7R as core JAK-STAT pathway genes promoting hepatitis B-related liver fibrosis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合生物信息学分析,识别出CCND1和IL7R作为JAK-STAT通路核心基因,并验证其在乙肝相关肝纤维化中的促进作用 首次结合WGCNA、机器学习诊断模型构建、孟德尔随机化因果推断和单细胞RNA测序验证,多维度鉴定CCND1和IL7R为JAK-STAT通路在乙肝相关肝纤维化中的核心基因 基于公开数据库分析,样本量和数据来源有限;实验验证仅在蛋白和mRNA水平进行,缺乏功能实验和体内动物模型验证 识别JAK-STAT通路中促进乙肝相关肝纤维化的核心基因并探索其生物学功能 乙肝病毒感染患者的肝纤维化组织样本 机器学习 肝纤维化 RNA-seq 机器学习诊断模型 基因表达数据 GSE84044数据集(具体样本数未明确给出) NA 单细胞RNA测序 NA NA
98 2026-06-17
S100A4 characterize antigen-presenting cancer-associated fibroblasts and predicts surgical outcomes in relapsed ovarian cancer
2026, Therapeutic advances in medical oncology IF:4.3Q2
研究论文 该研究通过多平台整合分析,鉴定了复发性卵巢癌中S100A4+抗原呈递癌症相关成纤维细胞亚群及其与手术结局的关联 首次在复发性卵巢癌中描绘S100A4+ CAFs的异质性,并发现抗原呈递S100A4+apCAFs亚群与完全手术切除及良好免疫微环境密切相关 样本量相对较小,需在更大队列中验证;功能性验证实验未直接在文中提及 阐明复发性卵巢癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其对手术预后和免疫调节的影响 复发性卵巢癌肿瘤组织样本 数字病理学 卵巢癌 多重免疫组化、空间数字表型分析、单细胞RNA测序、转录组荟萃分析 NA 空间图像、单细胞转录组数据、批量转录组数据 31个肿瘤切片(多重免疫组化),11个肿瘤(单细胞RNA测序),多个外部转录组数据集 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
99 2026-06-17
Activation of endogenous retroviruses in tumor cells and their immunomodulatory mechanisms: from molecular basis to clinical translation
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
综述 系统解析内源性逆转录病毒在肿瘤微环境中异常激活的分子机制及其免疫调节双重作用,并探讨其在肿瘤诊断与免疫治疗中的转化潜力 整合单细胞多组学和空间转录组学技术揭示ERV在肿瘤异质性中的动态表达模式,并首次提出利用时空精准基因编辑和AI驱动的ERV活性预测模型突破现有研究瓶颈 未提供具体实验验证数据,主要基于现有文献综述,缺乏对ERV激活与临床预后之间因果关系的直接证据 系统阐述ERV异常激活在肿瘤发生、进展和免疫逃逸中的分子机制,并评估其作为肿瘤诊断和免疫治疗靶点的临床转化可行性 内源性逆转录病毒在肿瘤细胞中的激活机制及其免疫调节作用 自然语言处理 恶性肿瘤 单细胞多组学、空间转录组学 NA 临床前和临床试验数据 NA NA 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
100 2026-06-17
Immunomodulatory Roles and Clinical Significance of GZMM and DDX24 in Sepsis: A Multiomics Integrative Analysis With Experimental Validation
2026, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 通过多组学整合分析和实验验证,揭示了GZMM和DDX24在脓毒症中的免疫调节作用及临床意义 首次利用多组学整合分析结合机器学习方法鉴定DDX24和GZMM作为脓毒症诊断和预后的关键基因,并通过单细胞RNA测序揭示其在T细胞和NK细胞中的表达模式 初步验证样本量有限,且未深入探讨基因调控的分子机制 探索脓毒症免疫功能障碍的分子机制并鉴定新的诊断和预后标志物 从GEO数据集获取的脓毒症转录组数据及临床样本 机器学习 脓毒症 RNA-seq 机器学习算法 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
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