单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32005 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-31 |
Integration of single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveals neutrophil diversity and spatial heterogeneity in acute kidney injury
2025-Oct-22, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148478
PMID:41135905
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了急性肾损伤中中性粒细胞的多样性和空间异质性 | 首次在AKI中鉴定出9个中性粒细胞亚群，其中6个为AKI中首次发现，3个为文献中全新亚群；发现了以中性粒细胞为中心的新型微环境单元 | NA | 探索急性肾损伤中中性粒细胞的多样性和空间异质性 | 急性肾损伤中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 预后风险模型 | 基因表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-31 |
Identification and Validation of Iron Metabolism-Related Biomarkers in Endometriosis: A Mendelian Randomization and Single-Cell Transcriptomics Study
2025-Oct-09, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47100831
PMID:41150779
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞转录组学识别并验证子宫内膜异位症中铁代谢相关生物标志物 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞转录组学方法系统研究铁代谢相关基因在子宫内膜异位症中的作用机制 | 研究样本量有限，主要依赖公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索铁代谢相关基因在子宫内膜异位症中的生物标志物价值 | 子宫内膜异位症患者样本 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, RT-qPCR | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多个GSE数据集(GSE86534, GSE105764, GSE213216) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2025-10-31 |
Single-cell analysis of differential fat deposition in chicken pectoral muscle and abdominal fat tissues
2025-Oct-02, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105938
PMID:41108936
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析固始鸡胸肌和腹部脂肪组织的差异脂肪沉积特征 | 首次在固始鸡中应用单细胞RNA测序技术比较不同脂肪组织的细胞类型和分子特征，发现G0S2基因在腹部脂肪细胞中的特异性功能 | 仅分析了2周龄鸡的组织样本，缺乏其他发育阶段的单细胞数据 | 阐明家禽脂肪沉积的组织特异性机制 | 固始鸡的胸肌和腹部脂肪组织 | 单细胞组学 | 肥胖相关代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2至22周龄固始鸡的胸肌和腹部脂肪组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2025-10-31 |
Acellular Tissue Engineered Vessels as Coronary Artery Bypass Grafts
2025-Oct, JACC. Basic to translational science
DOI:10.1016/j.jacbts.2025.101379
PMID:40939573
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研究论文 | 评估小直径无细胞组织工程血管在灵长类动物模型中作为冠状动脉搭桥移植物的可行性和耐久性 | 首次在灵长类动物模型中验证小直径无细胞组织工程血管作为冠状动脉搭桥移植物的长期性能，并发现宿主细胞从旁路冠状动脉向内生长可调节移植物直径 | 研究样本量较小（n=5），仅观察了6个月的短期效果 | 开发冠状动脉搭桥手术的替代血管移植物 | 成年狒狒的右冠状动脉 | 组织工程 | 心血管疾病 | 空间转录组学，组织学分析 | NA | 医学影像数据，基因表达数据，组织学数据 | 5只成年狒狒 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 85 | 2025-10-31 |
Harnessing scRNA-seq and bulk RNA-seq to identify CD39+ T cell genes for rheumatoid arthritis diagnosis and therapy
2025-Oct-01, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf130
PMID:40974094
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，识别CD39+ T细胞相关基因作为类风湿关节炎诊断和治疗的生物标志物 | 首次结合scRNA-seq和bulk RNA-seq分析CD39+ T细胞基因特征，发现PELI1等关键基因的诊断价值并构建lncRNA-miRNA-PELI1调控网络 | 未明确说明样本来源和具体样本量，需要进一步实验验证PELI1的生物学功能 | 识别类风湿关节炎诊断和治疗生物标志物 | CD39+ T细胞及其相关基因 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2025-10-31 |
AURKA Enhances Antitumor Immunity by Activating CD4+ T Cell Proliferation in Colorectal Cancer
2025-Oct, Cancer investigation
IF:1.8Q3
DOI:10.1080/07357907.2025.2559403
PMID:40995659
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示AURKA在结直肠癌中通过激活CD4+ T细胞增殖增强抗肿瘤免疫的双重功能 | 首次整合空间转录组学发现AURKA在肿瘤周围T细胞富集区与免疫激活标志物共表达，并证实其可作为免疫治疗生物标志物 | 研究样本量有限，需要在更大队列中验证AURKA的预后和预测价值 | 阐明AURKA在结直肠癌肿瘤增殖和免疫微环境调控中的双重作用机制 | 结直肠癌患者样本和小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, CIBERSORT, ssGSEA, IHC, HE染色 | 小鼠模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床病理数据 | 未明确具体样本数量，包含临床队列和小鼠模型 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |
| 87 | 2025-10-31 |
Targeting Intratumoral Copper Inhibits Tumor Progression via p62-Mediated EZH2 Degradation and Potentiates Anti-PD-1 Immunotherapy in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417795
PMID:40719074
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研究论文 | 本研究揭示了铜在口腔鳞状细胞癌中的关键作用机制，发现通过靶向铜离子可促进EZH2降解并增强抗PD-1免疫治疗效果 | 首次发现铜通过SMURF2调控EZH2蛋白稳定性，并证实铜螯合剂与抗PD-1联合治疗的协同作用 | 研究主要聚焦于OSCC，其他癌症类型的适用性需进一步验证 | 探究铜在口腔鳞状细胞癌进展中的作用机制及治疗潜力 | 口腔鳞状细胞癌细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫组化染色，siRNA，蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据，组织染色图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-31 |
Mesencephalic Astrocyte-Derived Neurotrophic Factor Binds BAX to Preserve Mitochondrial Homeostasis and Energy Metabolism for Relieving Myocardial Hypertrophy
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502835
PMID:40739335
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研究论文 | 本研究探讨中脑星形胶质细胞源性神经营养因子(MANF)通过结合BAX蛋白维持线粒体稳态和能量代谢来缓解心肌肥厚的机制 | 首次发现MANF与促凋亡蛋白BAX相互作用，抑制其线粒体转位，从而减少线粒体损伤和心肌细胞死亡 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需要进一步验证 | 探究MANF在心肌肥厚中的作用机制 | 心肌细胞特异性MANF基因敲除小鼠模型 | 分子生物学 | 心肌肥厚 | 单细胞RNA测序,代谢组学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,代谢数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2025-10-31 |
Immune Cell Dynamics in Cardiac Diseases: Insights From Single-Cell Sequencing
2025-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70846
PMID:41139809
|
综述 | 本文通过单细胞测序技术系统总结免疫细胞在心脏疾病中的动态调控机制 | 首次基于单细胞测序技术全面揭示心脏疾病中免疫细胞的异质性、可塑性及细胞间相互作用 | NA | 阐明免疫细胞在心脏疾病发生发展中的动态调控机制，为精准治疗提供新靶点 | 心脏疾病中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因组和转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2025-10-31 |
In Vivo Reprogramming Dysfunctional Retinal Ganglion Cells and Visual-phototransduction via Wireless Charging Nanogold for Leber's Hereditary Optic Neuropathy
2025-Oct, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202504509
PMID:40852879
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研究论文 | 开发无线充电金纳米颗粒用于治疗Leber遗传性视神经病变，通过线粒体靶向基因递送和电刺激恢复视觉光转导功能 | 首次将无线充电金纳米颗粒同时作为基因递送平台和电刺激介导的光转导恢复工具，实现线粒体靶向治疗 | 研究主要基于小鼠模型和患者来源的视网膜类器官，临床转化效果需进一步验证 | 开发Leber遗传性视神经病变的新型基因治疗方法 | 视网膜神经节细胞、Müller胶质细胞、光感受器细胞 | 基因治疗 | Leber遗传性视神经病变 | 单细胞RNA测序、时空转录组分析、iPSC分化视网膜类器官 | NA | 基因表达数据、电生理数据、转录组数据 | LHON小鼠模型和患者来源的iPSC分化视网膜类器官 | NA | 单细胞RNA测序, 时空转录组分析 | NA | NA |
| 91 | 2025-10-31 |
The overexpression of HOXC6 in LUSC and pan-squamous cell carcinomas indicates the coexistence of nuclear division regulatory mechanisms
2025-Oct, Cancer biomarkers : section A of Disease markers
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/18758592251390255
PMID:41160411
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析HOXC6在肺鳞癌及其他鳞状细胞癌中的表达模式及功能 | 首次在泛鳞状细胞癌层面系统分析HOXC6的表达特征，并揭示其通过调控有丝分裂影响肿瘤发展的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证HOXC6调控有丝分裂的具体分子机制 | 探究HOXC6在肺鳞癌及泛鳞状细胞癌中的表达模式、功能及其与肿瘤微环境的关系 | 肺鳞癌、宫颈鳞癌、食管鳞癌、喉鳞癌和口腔鳞癌组织样本 | 生物信息学 | 肺鳞癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 免疫组织化学, CRISPR基因敲除 | NA | 基因表达数据, 组织切片图像 | 多种鳞状细胞癌组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 92 | 2025-10-31 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of the Immune Response to COVID-19 and Tuberculosis Coinfection
2025-Oct, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240022
PMID:41163794
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示COVID-19与结核病共感染患者的免疫反应特征 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘COVID-19与结核病共感染的免疫图谱，揭示严重共感染患者的免疫细胞群改变和免疫病理机制 | 样本数量未明确说明，研究结果主要基于观察性数据，需要进一步实验验证机制 | 阐明COVID-19与结核病共感染的免疫病理机制和保护性免疫反应 | COVID-19与结核病共感染患者 | 单细胞生物学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2025-10-31 |
PreDigs: A Database of Context-specific Cell Type Markers and Precise Cell Subtypes for Digestive Cell Annotation
2025-Sep-22, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf066
PMID:40795159
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研究论文 | 开发了一个用于消化系统细胞注释的数据库PreDigs，包含124个单细胞RNA测序数据集和142种细胞类型的本体树 | 构建了首个针对消化系统的细胞标记物数据库，统一了细胞亚型标识和命名，并提供了三种不同应用场景的细胞类型标记物 | NA | 解决大规模数据集整合和细胞类型识别标准化问题，促进胃肠道肿瘤细胞组成研究 | 消化系统细胞，特别是胃肠道肿瘤相关细胞 | 生物信息学 | 胃肠道肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 单细胞RNA测序数据 | 超过340万个细胞，来自124个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2025-10-31 |
Identification of shared pathogenetic mechanisms between endometriosis and RSA based on comprehensive bioinformatics analysis
2025-Sep, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03596-1
PMID:40705269
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研究论文 | 通过生物信息学分析识别子宫内膜异位症和复发性自然流产之间的共享分子机制和关键基因 | 首次发现FXYD1作为连接子宫内膜异位症和复发性自然流产的关键枢纽基因，并通过单细胞RNA测序验证其在基质细胞和蜕膜细胞中的表达 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证功能机制 | 探索子宫内膜异位症和复发性自然流产之间的共享分子机制 | 子宫内膜异位症和复发性自然流产患者样本 | 生物信息学 | 妇科疾病 | 生物信息学分析，单细胞RNA测序，WGCNA，功能富集分析 | 差异表达基因分析，共表达网络分析 | 基因表达数据 | GSE7305和GSE165004数据集 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2025-10-31 |
Identification of m5C-related genes and subclusters in recurrent pregnancy loss
2025-Sep, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03580-9
PMID:40751792
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研究论文 | 通过生物信息学方法鉴定复发性流产中m5C相关基因及其亚群 | 首次将复发性流产患者分为两个不同亚群，并分析其免疫微环境差异 | 样本量较小（48例子宫内膜组织样本） | 阐明m5C相关基因与复发性流产发病机制的关系 | 复发性流产患者的子宫内膜组织 | 生物信息学 | 复发性流产 | 机器学习，单细胞RNA测序，基因集富集分析 | 机器学习模型，列线图 | 基因表达数据 | 48例子宫内膜组织样本（24例RPL样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2025-10-31 |
Spatial transcriptomics: a bibliometric analysis with large language model on English literatures
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf553
PMID:41139313
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文献计量分析 | 使用大语言模型对空间转录组学英文文献进行文献计量分析 | 首次将大语言模型应用于空间转录组学领域的文献计量分析，使研究结果更加全面和具体 | 仅基于Web of Science数据库的1197篇英文文献（2015-2024年），可能存在文献覆盖不全的局限性 | 分析空间转录组学领域的研究趋势、期刊分布和关键词演变 | 1197篇空间转录组学相关英文文献 | 自然语言处理 | 癌症 | 文献计量分析，大语言模型 | 大语言模型 | 文本 | 1197篇文献 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 97 | 2025-10-31 |
scDETECT: a novel statistical model accounting for cell type correlation in single-cell RNA-seq differential expression analysis
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf556
PMID:41139925
|
研究论文 | 开发了一种考虑细胞类型相关性的单细胞RNA-seq差异表达分析新方法 | 首次在单细胞RNA-seq差异表达分析中通过贝叶斯层次模型考虑细胞类型相关性 | NA | 提高单细胞RNA-seq差异表达分析的准确性和统计功效 | 单细胞RNA-seq数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯层次模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2025-10-31 |
scVGAMF: a novel imputation method for scRNA-seq data by integrating linear and non-linear features
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf562
PMID:41139927
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研究论文 | 提出一种整合线性和非线性特征的单细胞RNA测序数据插补新方法scVGAMF | 首次将非负矩阵分解与变分图自编码器结合，同时捕捉scRNA-seq数据中的线性和非线性特征 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中dropout事件导致的缺失值问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解, 变分图自编码器, 全连接神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2025-10-31 |
ChromoPattern: characterizing chromosomal rearrangement patterns of copy number alteration in heterogeneous tumor cell populations at single-cell resolution
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf563
PMID:41148222
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研究论文 | 开发了ChromoPattern计算框架，用于在单细胞分辨率下量化肿瘤细胞群中与复杂拷贝数变异机制相关的染色体重排模式 | 首个能够在单细胞分辨率下系统量化四种不同染色体重排模式的计算框架，揭示了振荡模式在肿瘤异质性和进化中的关键作用 | 方法验证主要基于模拟数据和有限的实际样本，需要更广泛的临床应用验证 | 研究染色体不稳定性导致的拷贝数变异模式在肿瘤异质性和进化中的作用 | 肝癌细胞系和乳腺癌患者的单细胞DNA测序数据 | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序 | 计算框架 | 基因组测序数据, 转录组测序数据 | 肝癌细胞系和乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2025-10-31 |
spRefine Denoises and Imputes Spatial Transcriptomics with a Reference-Free Framework Powered by Genomic Language Model
2025-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.22.649977
PMID:40631230
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研究论文 | 提出了一种基于基因组语言模型的无参考框架spRefine，用于空间转录组数据的去噪和插补 | 首次将基因组语言模型应用于空间转录组数据的联合去噪和插补，无需参考数据集 | 未明确说明 | 解决空间转录组数据的高噪声和基因测量缺失问题 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | 衰老相关疾病 | 深度学习，基因组语言模型 | 深度学习框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |