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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-11-16 |
D-dimer drives immune dysregulation in COVID-19 via chemokine modulation and inflammatory signaling
2025-Nov, Virus research
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.virusres.2025.199641
PMID:41083108
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研究论文 | 本研究探讨了D-二聚体通过调节趋化因子和炎症信号通路在COVID-19中驱动免疫失调的机制 | 首次揭示D-二聚体不仅是血栓形成的生物标志物,还能通过调节趋化因子介导的细胞募集和炎症信号通路直接参与免疫调节 | 体外实验未能在THP-1细胞中诱导IL-6表达,机制研究仍需深入 | 探究D-二聚体在COVID-19免疫调节中的作用机制 | COVID-19患者和SARS-CoV-2阴性对照人群 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 体外细胞刺激实验 | NA | 临床数据, 转录组数据, 单细胞测序数据 | 356名来自上海的参与者,包括轻度和重度COVID-19患者及阴性对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2025-11-16 |
Brain abundant membrane attached signal protein 1 regulates macrophage polarization through EGFR/PI3K/AKT signaling in renal cell carcinoma
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148268
PMID:41093214
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研究论文 | 本研究揭示了BASP1通过激活EGFR/PI3K/AKT信号通路促进巨噬细胞向M2表型极化,从而推动肾细胞癌进展的机制 | 首次发现BASP1在肾癌巨噬细胞中的特异性表达及其通过EGFR/PI3K/AKT通路调控巨噬细胞极化的新机制 | 研究主要基于数据库分析和动物模型,缺乏临床样本验证 | 探究BASP1在肾细胞癌免疫微环境中调控巨噬细胞极化的分子机制 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)及其肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 单细胞转录组测序,WB,qRT-PCR,流式细胞术,AAV基因沉默 | NA | 转录组数据,蛋白质表达数据,细胞表型数据 | TCGA数据库样本,小鼠颅内同种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 83 | 2025-11-16 |
Mixed Molecular Subtypes Coexist in Estrogen Receptor Heterogeneous Primary Breast Cancers
2025-Nov, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO-25-00529
PMID:41237360
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析雌激素受体异质性乳腺癌,揭示不同分子亚型在肿瘤内共存的现象 | 首次在ER中等阳性乳腺癌中发现Luminal A和Luminal B分子亚型混合共存,并揭示ER阴性区域具有内分泌耐药但化疗敏感的表型特征 | 样本量较小(20例),仅针对ER中等阳性乳腺癌,未包含其他分子亚型 | 理解乳腺癌中雌激素受体表达的肿瘤内异质性,探索不同分子亚型在同一肿瘤中共存的可能性 | 20例原发性乳腺癌(10例ER异质性,10例ER高表达) | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 数字空间分析,空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 20例原发性乳腺癌样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx平台 | NanoString GeoMx平台配合人类全转录组图谱探针组 |
| 84 | 2025-11-16 |
CluVar: clustering of variants using autoencoder for inferring cancer subclones from single cell RNA sequencing data
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf603
PMID:41240059
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研究论文 | 提出基于自编码器的CluVar框架,用于从单细胞RNA测序数据推断癌症亚克隆的系统发育关系 | 开发了专门针对scRNA-seq数据高丢失率特点的自定义损失函数和优化隐藏层结构 | 依赖scRNA-seq数据,仍受技术噪音和高丢失率影响 | 从单细胞RNA测序数据重建癌症亚克隆的进化轨迹 | 癌症肿瘤组织中的恶性亚克隆 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-11-16 |
Six1-Eya1 Axis Governs Myofiber Remodeling and Fibrosis in Extraocular Myopathy: Insights from Single-Cell RNA Sequencing and Mesenchymal Stem Cell Therapy in Thyroid Eye Disease
2025-Oct-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14211708
PMID:41227354
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和间充质干细胞治疗,揭示了Six1-Eya1轴在甲状腺眼病眼外肌肌纤维重塑和纤维化中的调控作用 | 首次发现Six1和Eya1作为眼外肌肌纤维分化和纤维化抑制的核心调控因子,为甲状腺眼病相关肌病提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,需要更大规模的临床验证 | 探究甲状腺眼病中眼外肌肌病的分子机制和治疗策略 | TED小鼠模型、正常人和TED患者的成肌细胞 | 单细胞测序分析 | 甲状腺眼病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | TED小鼠模型和患者来源的成肌细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2025-11-16 |
Comparative Oncology: Cross-Sectional Single-Cell Transcriptomic Profiling of the Tumor Microenvironment Across Seven Human Cancers
2025-Oct-31, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17213527
PMID:41228323
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序对七种人类癌症的肿瘤微环境进行跨癌种比较分析 | 首次在七种不同癌症类型中系统比较单细胞转录组特征和细胞间通讯模式 | 使用公开数据集,部分癌症亚型需要进一步特异性分析 | 阐明不同癌症类型中肿瘤微环境的转录特征和细胞间信号差异 | 七种人类癌症:胰腺导管腺癌、肝细胞癌、食管鳞状细胞癌、乳腺癌、甲状腺癌、胃癌和结直肠癌 | 单细胞转录组学 | 多癌种比较 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的七种癌症类型的公开scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2025-11-16 |
Integrated bulk sequencing and single-cell transcriptomic profiling implicates neutrophil-driven hypoxia in atrial fibrillation development
2025-Oct-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2025-1066
PMID:41229788
|
研究论文 | 本研究通过整合批量测序和单细胞转录组分析揭示了中性粒细胞驱动的缺氧在房颤发病机制中的作用 | 首次结合批量测序和单细胞转录组数据系统分析房颤中的炎症细胞浸润特征,并建立了基于中性粒细胞相关基因的机器学习诊断模型 | 研究结果需要通过体内、体外实验和外部验证研究进一步确认 | 阐明炎症细胞在房颤发病机制中的具体作用,并建立基于机器学习的诊断模型 | 房颤患者和窦性心律患者的心脏组织样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 批量RNA测序,单细胞RNA测序,机器学习 | 支持向量机(SVM) | 基因表达数据 | 46个房颤样本和18个窦性心律样本 | NA | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-11-16 |
Integrating transcriptomics, single-cell omics, and deep learning-based histopathological features to identify OLFML3 in bladder cancer
2025-Oct-31, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-365
PMID:41230137
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学、单细胞组学和深度学习技术,识别OLFML3作为膀胱癌1年内复发的关键基因,并构建预测模型 | 首次结合多组学数据与深度学习病理特征识别OLFML3在膀胱癌复发中的作用,并开发基于ResNet50的OLFML3表达预测模型 | 需要进一步研究阐明OLFML3在膀胱癌1年内复发的具体作用机制 | 提高膀胱癌复发预测准确性并改善临床管理 | 膀胱癌患者 | 数字病理 | 膀胱癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,深度学习 | ResNet50,随机森林,Cox回归 | 基因表达数据,临床信息,病理图像 | TCGA和GEO数据库中的膀胱癌患者数据,以及广东省第二人民医院的单细胞RNA测序数据 | NA | RNA-seq,scRNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2025-11-16 |
Single-cell multi-omics and spatial transcriptomics reveal the transcriptional regulatory landscape of clear cell renal cell carcinoma
2025-Oct-31, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-328
PMID:41230160
|
研究论文 | 通过单细胞多组学和空间转录组学技术揭示透明细胞肾细胞癌的转录调控景观 | 首次整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学全面解析ccRCC的细胞异质性、表观遗传调控和转录因子网络 | 研究样本量有限,功能验证仅针对YBX3基因 | 全面表征ccRCC的细胞异质性、表观遗传调控和转录因子网络,识别具有预后和治疗意义的关键基因 | 透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中的细胞群体 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, 伪时间分析, 基因集富集分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 90 | 2025-11-16 |
A Glycerophospholipid Metabolism-Based Prognostic Model Guides Osteosarcoma Therapy
2025-Oct-30, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102572
PMID:41172875
|
研究论文 | 本研究基于甘油磷脂代谢构建了一个预后模型,用于指导骨肉瘤的治疗策略 | 首次将甘油磷脂代谢活性与骨肉瘤预后关联,开发了优于42个已发表特征的预后模型,并揭示了代谢与肿瘤免疫的相互作用 | 样本量相对有限,需要更多独立队列验证模型的普适性 | 探索甘油磷脂代谢在骨肉瘤进展、免疫和治疗中的作用,构建预后模型指导个性化治疗 | 骨肉瘤患者和骨肉瘤细胞 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 转录组分析,单细胞RNA测序,Cox回归分析,Lasso-Cox建模 | Lasso-Cox预后模型 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | TARGET队列85例,GEO队列124例,单细胞RNA-seq数据6个骨肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2025-11-16 |
Cell-cell fusion and immunostimulatory cytokines significantly impact oncolytic vaccinia virus immunotherapeutic potential
2025-Oct-30, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.10.055
PMID:41174883
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研究论文 | 本研究开发了一种携带IL-12和CCL21细胞因子的融合性溶瘤痘苗病毒,显著增强了系统性抗肿瘤免疫反应 | 首次将细胞融合特性与双免疫刺激细胞因子(IL-12和CCL21)结合于溶瘤病毒,通过单细胞转录组分析揭示了其对效应记忆CD8 T细胞的增强作用 | 研究基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 提高溶瘤病毒对远端转移瘤的治疗效果 | 溶瘤痘苗病毒和鼠肿瘤模型 | 免疫治疗 | 转移性肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2025-11-16 |
Novel Taxol-Derivative, STO-1, Induces Selective Anti-Tumor Immunity and Sustained Remission of Glioblastoma Without Triggering Autoimmune Reactions
2025-Oct-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14211703
PMID:41227348
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研究论文 | 本研究开发了一种新型前药STO-1,通过选择性重编程肿瘤相关巨噬细胞实现胶质母细胞瘤的持续缓解且不引发自身免疫反应 | 首次通过紫杉醇与姜黄素的可裂解共价连接创建前药,实现肿瘤特异性巨噬细胞重编程而不引发系统性自身免疫反应 | 研究样本量较小(仅6只原位胶质母细胞瘤小鼠),缺乏人类临床试验数据 | 开发选择性抗肿瘤免疫疗法,避免自身免疫反应 | 胶质母细胞瘤小鼠模型和肿瘤相关巨噬细胞 | 免疫治疗 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,高分辨率离体T2加权MRI | NA | 基因表达数据,医学影像数据 | 6只原位胶质母细胞瘤荷瘤小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2025-11-16 |
Integrated Multi-Omics Analysis Identifies SRI as a Critical Target Promoting Gastric Cancer Progression and Associated with Poor Prognosis
2025-Oct-29, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17213483
PMID:41228276
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研究论文 | 通过整合多组学分析和实验验证,识别促进胃癌进展并与不良预后相关的关键分子驱动因子 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学和功能验证,识别出胃癌恶性上皮亚群C5和五基因预后标志物,并证实SRI在肿瘤进展中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 识别胃癌进展的关键分子驱动因子和预后标志物 | 胃癌患者样本和肿瘤细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 功能验证实验 | Cox回归模型, LASSO回归 | 基因表达数据, 空间定位数据 | 多个队列的胃癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 94 | 2025-11-16 |
Accumulation of Lymphoid Progenitors with Defective B Cell Differentiation and of Putative Natural Killer Progenitors in Aging Human Bone Marrow
2025-Oct-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262110467
PMID:41226506
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类骨髓造血干细胞和祖细胞,揭示衰老过程中淋巴系发育轨迹的异常变化 | 首次发现衰老人类骨髓中积累具有B细胞分化缺陷的淋巴祖细胞和记忆样自然杀伤细胞祖细胞群 | 样本量较小(15例),年龄跨度范围有限 | 探究人类骨髓造血系统衰老过程中淋巴系发育轨迹的变化特征 | 人类骨髓造血干细胞和祖细胞(CD34+) | 单细胞基因组学 | 衰老相关血液系统变化 | 单细胞RNA测序,功能转录组分析,发育轨迹研究 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 15名健康人类受试者骨髓样本(年龄19-74岁) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2025-11-16 |
CD5 Expression in CTCL and Its Implications for Anti-CD5 CAR T-Cell Therapy
2025-Oct-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262110411
PMID:41226451
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析蕈样肉芽肿中CD5的表达模式及其对CAR T细胞治疗的启示 | 首次在单细胞水平揭示CD5在蕈样肉芽肿不同病变阶段的动态表达特征 | 样本量有限,需要更多研究阐明临床意义 | 评估CD5作为CAR T细胞治疗靶点在皮肤T细胞淋巴瘤中的潜力 | 蕈样肉芽肿患者皮肤活检组织中的CD4 T细胞 | 单细胞基因组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例斑片/斑块期MF活检、8例肿瘤期MF活检、8例健康对照活检 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2025-11-16 |
Emerging Roles of Megakaryocytes in Immune Regulation and Potential Therapeutic Prospects
2025-Oct-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14211677
PMID:41227322
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综述 | 本文系统阐述了巨核细胞在免疫调节中的新兴功能及其治疗潜力 | 突破传统认知,揭示巨核细胞在免疫调节、造血干细胞微环境调控和组织特异性功能等方面的多重作用 | NA | 探讨巨核细胞在免疫调节和系统稳态中的新兴功能及治疗应用前景 | 巨核细胞及其在骨髓、肺等不同组织中的亚群 | NA | 自身免疫疾病、血液系统疾病 | 单细胞转录组学、成像技术、异种移植策略 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-11-16 |
The Anti-Cancer Potential of Genistein: Single-Cell RNA Sequencing Analysis and Spatial Transcriptome Reveal That Genistein Targets HSD17B1 to Inhibit the Progression of Gastric Adenocarcinoma
2025-Oct-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262110369
PMID:41226409
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示了染料木黄酮通过靶向HSD17B1抑制胃腺癌进展的分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统研究染料木黄酮在胃腺癌中的'药物-基因-细胞'相互作用网络 | NA | 探索染料木黄酮在胃腺癌治疗中的分子靶点及其作用机制 | 胃腺癌相关基因和细胞 | 单细胞组学 | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接,分子动力学 | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 98 | 2025-11-16 |
Single-Cell Heterogeneity of Epigenetic Factor Regulation Deciphers Alteration of RNA Metabolism During Proliferative SHH-Medulloblastoma
2025-Oct-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17213424
PMID:41228218
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析髓母细胞瘤中表观遗传调控因子的表达异质性及其与RNA代谢改变的关系 | 开发了与RNA代谢相关的表观遗传评分(epi-score),并发现其在SHH亚型增殖性肿瘤细胞中的预后价值 | 研究基于现有数据库和有限样本量,需要进一步实验验证 | 探究表观遗传调控在髓母细胞瘤分子异质性和肿瘤进展中的作用机制 | 髓母细胞瘤患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个独立RNA测序队列(PBTA和Williamson) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2025-11-15 |
Intratumoral SPP1+BCL2A1+ Tumor-Associated Macrophages Predict Poor Response to PD1 Blockade
2025-Oct-23, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics15212680
PMID:41225975
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现SPP1+BCL2A1+肿瘤相关巨噬细胞是预测肝细胞癌患者PD1阻断治疗反应不良的新型生物标志物 | 首次鉴定出SPP1和BCL2A1双阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群,并证实其与免疫检查点抑制剂治疗反应不良相关 | 样本量相对较小,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探索肝细胞癌免疫治疗反应的预测生物标志物 | 肝细胞癌患者肿瘤组织中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 发现队列10例,ICB队列4例,验证队列18例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2025-11-16 |
Visceral Peritoneum Hyperpigmentation in Chickens Is Associated with DCT Expression
2025-Oct-23, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15213076
PMID:41227407
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研究论文 | 本研究探讨了鸡内脏腹膜色素沉着过度(HVP)的遗传基础及其调控机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定HVP相关黑色素细胞群体,发现DCT基因在HVP中过度表达并确定其多态性可作为遗传选择标记 | 研究样本量有限,功能验证实验主要在细胞水平进行,需要进一步体内验证 | 阐明鸡内脏腹膜色素沉着异常的遗传原因和分子机制 | 鸡内脏腹膜组织和黑色素细胞 | 生物信息学 | 色素沉着异常 | HPLC, bulk RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR, Western blotting, siRNA干扰 | NA | 基因表达数据, 组织切片图像 | 超过9700个高质量单细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |