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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-11-03 |
Spatial Transcriptomic Approach to Understanding Coronary Atherosclerotic Plaque Stability
2024-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320330
PMID:39234691
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学方法分析冠状动脉粥样硬化斑块的稳定性 | 首次将GeoMx空间分析平台与全转录组图谱结合,在保留细胞间信号的同时实现斑块细胞形态和空间分辨的转录组分析 | 样本量较小(每组5例患者),仅使用尸检来源的冠状动脉 | 研究稳定和不稳定斑块中血管微环境的分子特征 | 尸检获取的冠状动脉粥样硬化斑块 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学,空间反卷积分析 | NA | 空间转录组数据,组织形态学数据 | 10例患者(稳定斑块组5例,不稳定斑块组5例) | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间分析平台与全转录组图谱 |
| 82 | 2025-11-03 |
Hepatocellular carcinoma-specific epigenetic checkpoints bidirectionally regulate the antitumor immunity of CD4 + T cells
2024-Nov, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-024-01215-0
PMID:39300319
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研究论文 | 本研究揭示了MATR3作为肝细胞癌特异性表观遗传检查点,双向调节CD4+T细胞的抗肿瘤免疫 | 首次发现MATR3在肝细胞癌中作为表观遗传检查点,通过招募SWI/SNF复合物调节TOX启动子区域染色质状态,双向调控Tconv细胞的抗肿瘤免疫功能 | NA | 探索肝细胞癌中CD4+T细胞的表观遗传调控机制及其在抗肿瘤免疫中的作用 | 肝细胞癌浸润的常规CD4+T细胞(Tconvs) | 表观遗传学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,体内外实验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 83 | 2025-11-03 |
Localized ablative immunotherapy enhances antitumor immunity by modulating the transcriptome of tumor-infiltrating Gamma delta T cells
2024-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217267
PMID:39307410
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析激光消融免疫疗法对肿瘤浸润γδT细胞转录组的调控作用 | 首次揭示LAIT疗法通过调节γδT细胞转录组增强抗肿瘤免疫的机制,发现LAIT独特地增加IL17-producing γδT细胞比例 | 研究仅在小鼠乳腺癌模型中进行,尚未在人体直接验证 | 探究激光消融免疫疗法对肿瘤浸润γδT细胞功能动态的影响 | 小鼠乳腺癌模型中的肿瘤浸润γδT细胞 | 免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照组、PTT组、GC组和LAIT组的小鼠肿瘤样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2025-11-03 |
Therapeutic single-cell landscape: methotrexate exacerbates interstitial lung disease by compromising the stemness of alveolar epithelial cells under systemic inflammation
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105339
PMID:39303666
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示甲氨蝶呤在系统性炎症下通过损害肺泡上皮细胞干性加重间质性肺病 | 首次在单细胞水平揭示甲氨蝶呤通过损害肺泡上皮细胞干性加重肺纤维化的机制 | 基于小鼠模型的研究结果需在人类患者中进一步验证 | 探究甲氨蝶呤和TNF抑制剂对类风湿关节炎相关间质性肺病的影响 | SKG小鼠模型和人类RA-ILD队列 | 单细胞转录组学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | SKG小鼠模型和人类RA-ILD队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-11-03 |
Improved characterization of single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.10.602909
PMID:39026715
|
研究论文 | 评估Element Biosciences的亲和性测序技术在单细胞RNA-seq中准确读取同聚物序列的能力及其对多聚腺苷酸化位点分析的影响 | 首次利用亲和性碱基化学测序技术准确读取单细胞RNA-seq文库中的同聚物引物区域,实现配对末端比对和多聚腺苷酸化位点的直接独立分配 | 与单端比对相比,配对末端比对并未持续提高读取映射率,且存在低水平人工产物 | 改进单细胞RNA-seq文库的表征方法,特别是多聚腺苷酸化位点的精确量化 | 单细胞RNA-seq文库 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 亲和性测序, 配对末端测序 | NA | DNA测序数据 | NA | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq | Element Aviti, Illumina测序平台 | Element Aviti亲和性测序系统,标准单细胞RNA-seq协议 |
| 86 | 2025-11-02 |
Bu Zhong Yi Qi Tang targets key monocyte-associated genes to enhance sepsis therapy
2026-Jan-30, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120610
PMID:40946819
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研究论文 | 本研究探讨补中益气汤通过靶向单核细胞关键基因增强脓毒症治疗的机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别脓毒症特异性单核细胞亚群,并发现补中益气汤可靶向METTL9、SAT1和SRGN等关键基因 | 研究样本量有限,需要更大规模的临床试验验证结果 | 研究补中益气汤在脓毒症辅助治疗中的作用机制 | 脓毒症患者外周血单个核细胞和CLP小鼠模型 | 生物医学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 伪时序分析, 细胞间通讯分析, hdWGCNA, 机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | 脓毒症患者和健康对照的外周血单个核细胞,CLP小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2025-11-02 |
Elucidating anti-triple-negative breast cancer mechanisms and mitigating toxicity of Fritillaria thunbergii Miq.: A multi-omics and network pharmacology approach
2026-Jan-30, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120600
PMID:40953776
|
研究论文 | 本研究通过多组学和网络药理学方法探讨浙贝母抗三阴性乳腺癌的机制并评估其毒性风险 | 整合网络药理学、机器学习和单细胞RNA测序技术,首次系统阐明浙贝母抗TNBC的分子机制,并通过结构优化降低毒性 | 本研究为计算模拟研究,缺乏实验验证,毒性评估基于计算预测 | 评估传统中药浙贝母治疗三阴性乳腺癌的潜在作用机制和安全性 | 浙贝母的活性成分及其与三阴性乳腺癌的相互作用 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 网络药理学、机器学习、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、网络毒理学 | 机器学习算法 | 组学数据、化合物结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-11-02 |
Decoding Gujin Luyan Xuming decoction: How ancient wisdom meets modern science in promoting angiogenesis to ameliorate cerebral infarction
2026-Jan-30, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120652
PMID:41016542
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研究论文 | 本研究解析古今录验续命汤通过RAB11A调控Wnt5a/β-catenin信号通路促进脑梗死血管新生的分子机制 | 首次结合网络药理学、RNA测序和单细胞测序技术系统阐明古今录验续命汤治疗脑梗死的分子靶点和作用机制 | 分子机制尚未完全阐明,需要进一步验证 | 阐明古今录验续命汤促进脑梗死后血管新生的分子机制 | 脑梗死动物模型和细胞模型 | 生物信息学 | 脑梗死 | HPLC-MS/MS, RNA-seq, 单细胞测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | 网络药理学分析, WGCNA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 使用公开数据集GSE137482和GSE225948 | NA | RNA测序, 单细胞测序 | NA | NA |
| 89 | 2025-11-02 |
Integrative multiomics elucidate crotonylation-associated GCDH in Parkinson's disease pathogenesis via metabolome remodeling
2025-Dec, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10151-x
PMID:40640550
|
研究论文 | 通过整合多组学方法阐明巴豆酰化相关基因GCDH通过代谢组重塑在帕金森病发病机制中的作用 | 首次将孟德尔随机化与中介分析相结合,系统揭示GCDH通过代谢物X-21,471和十四烷二酸介导帕金森病风险降低的机制,并发现GCDH在星形胶质细胞中特异性高表达 | 研究主要基于公共数据库和生物信息学分析,缺乏实验验证 | 阐明巴豆酰化及其代谢组调控网络在帕金森病发病机制中的作用 | 帕金森病患者脑组织和相关代谢物 | 生物信息学 | 帕金森病 | 孟德尔随机化分析,中介分析,单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据,转录组数据,代谢组数据 | eQTLGen数据集和GEO单细胞转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2025-11-02 |
Impaired immune metabolism in COPD driven by dysfunction of CXCL16 + alveolar macrophages: multivariate causal evidence
2025-Dec, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10163-7
PMID:41028288
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了CXCL16+肺泡巨噬细胞功能障碍在慢性阻塞性肺疾病中的因果机制 | 首次通过孟德尔随机化分析确定CXCL16在COPD中的因果作用,并发现其通过破坏免疫代谢稳态驱动疾病进展 | NA | 识别COPD中肺泡巨噬细胞衍生的因果分子驱动因素 | 人类肺组织样本 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 孟德尔随机化分析, 细胞间通讯分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2025-11-02 |
Multi-omics dissection of RAD21-PON1 axis reveals metabolic-immune crosstalk and prognostic significance in hepatocellular carcinoma
2025-Dec, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10166-4
PMID:41143965
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了RAD21-PON1轴在肝细胞癌中连接代谢与免疫的核心调控作用 | 首次发现RAD21通过结合PON1启动子调控代谢通路活性并塑造免疫微环境,建立了RAD21-PON1风险特征用于预后分层 | 研究主要基于组学数据分析,需要进一步的实验验证机制细节 | 探究RAD21是否调控PON1以及该轴如何在肝细胞癌中整合代谢和免疫信号 | 肝细胞癌 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组学, ChIP-seq, 单细胞RNA测序, GSVA, TIDE, LASSO建模 | LASSO | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ChIP-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 92 | 2025-11-02 |
Single-cell RNA sequencing reveals T and B cell-related immune features in foot and mouth disease virus-infected mice
2025-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2025.2580141
PMID:41144693
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示口蹄疫病毒感染小鼠脾脏中T细胞和B细胞的免疫特征 | 首次在单细胞水平系统解析口蹄疫病毒感染过程中T细胞和B细胞的组成变化、基因表达、细胞通讯和调控网络 | 研究仅针对小鼠模型,未在自然宿主中验证 | 探究口蹄疫病毒感染过程中适应性免疫反应的特征 | 口蹄疫病毒感染小鼠脾脏中的T细胞和B细胞 | 单细胞生物学 | 口蹄疫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | FMDV感染组和模拟感染对照组小鼠脾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2025-11-02 |
Lessons learned from spatial transcriptomic analyses in clear-cell renal cell carcinoma
2025-Nov, Nature reviews. Urology
DOI:10.1038/s41585-024-00980-x
PMID:39789293
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综述 | 总结了空间转录组学在透明细胞肾细胞癌研究中的应用与发现 | 首次系统总结空间转录组学在透明细胞肾癌中的研究发现,揭示了肿瘤微环境中空间依赖的细胞互作关系 | 目前仅针对透明细胞肾癌这一亚型进行研究,缺乏其他肾癌亚型的空间转录组数据 | 探讨空间转录组学在肾细胞癌研究中的应用价值 | 透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 肾细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 94 | 2025-11-02 |
Gain-of-function PPM1D mutations attenuate ischemic stroke
2025-Nov, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-025-01523-6
PMID:40399534
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研究论文 | 本研究通过全基因组测序发现功能获得性PPM1D突变可减轻缺血性脑卒中,并鉴定出小分子稳定剂T2755作为潜在治疗方法 | 首次发现功能获得性PPM1D突变对缺血性脑卒中的保护作用,并鉴定出首个PPM1D小分子稳定剂T2755 | 仅在小鼠模型中验证T2755的治疗效果,尚未进行临床试验 | 探索PPM1D基因在缺血性脑卒中中的作用机制并开发新型治疗方法 | 10,241名缺血性脑卒中患者和Ppm1d基因缺陷小鼠 | 基因组学 | 缺血性脑卒中 | 全基因组测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | 集成计算建模, 虚拟筛选 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | 10,241名患者和基因缺陷小鼠模型 | NA | 全基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 95 | 2025-11-02 |
Systemic activation of NRF2 contributes to the therapeutic efficacy of clinically-approved KRAS-G12C anti-cancer drugs
2025-Nov, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03162-7
PMID:40890297
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研究论文 | 研究发现临床批准的KRAS-G12C抗癌药物通过激活NRF2通路增强其治疗效果 | 首次揭示KRAS-G12C抑制剂通过靶向KEAP1半胱氨酸传感器激活NRF2通路,这是抗癌药物正向调控通常被认为是致癌基因的独特案例 | 未明确说明研究样本的具体数量和来源 | 探索异常激活的NRF2如何影响KRASG12C抑制剂的临床反应 | KRAS突变肺癌患者,特别是伴有KEAP1-NRF2通路共突变的患者 | 癌症治疗 | 肺癌 | 基因敲除,单细胞RNA测序,表面等离子共振 | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2025-11-02 |
Unraveling cellular dynamic changes in tumor evolution induced by long-term low dose-rate radiation
2025-Nov, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03128-9
PMID:40913060
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了长期低剂量率辐射诱导肿瘤细胞恶性演化的动态过程 | 首次发现长期低剂量率辐射通过ANGPTL4-SDC4配体-受体对促进肿瘤血管生成并增强细胞恶性表型 | 研究仅使用BEAS-2B细胞系,未涉及其他细胞类型或体内直接验证 | 探究长期低剂量率辐射对肿瘤细胞恶性演化的影响机制 | BEAS-2B细胞系及其辐射诱导的肿瘤细胞 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | scRNA-seq, FACS, 分子对接, 多重免疫组化, qRT-PCR, 免疫共沉淀 | 细胞轨迹分析, 细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 蛋白互作数据 | BEAS-2B细胞系及其辐射处理后的衍生细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-11-02 |
Novel Genetic Loci for Nontuberculous Mycobacterial Pulmonary Disease and Potential Protective Effect of Body Mass Index
2025-Nov, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202406-1253OC
PMID:40938630
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研究论文 | 通过全基因组关联研究识别与非结核分枝杆菌肺病相关的遗传位点,并探讨体重指数的潜在保护作用 | 发现两个新的NTM-PD遗传位点并验证一个已知位点,首次通过孟德尔随机化揭示体重指数与NTM-PD的潜在因果关系 | 研究样本主要来自东亚人群,欧洲队列样本量相对较小 | 识别NTM-PD的遗传结构并评估风险因素关联 | 非结核分枝杆菌肺病患者和健康对照人群 | 基因组学 | 肺部疾病 | 全基因组关联研究, 单细胞转录组分析, 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 韩国队列1949例患者和2955例对照,日本队列1137例患者和1546例对照,欧洲队列243例患者和570例对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2025-11-02 |
Tool Comparison for Detecting Tumour Cells in Endometrial Cancer via Single-Cell Copy Number Variations Analysis
2025-Nov, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70932
PMID:41160707
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研究论文 | 比较四种单细胞拷贝数变异分析工具在检测子宫内膜癌细胞方面的性能 | 首次系统比较SCEVAN、CopyKAT、InferCNV和sciCNV四种工具在子宫内膜癌单细胞数据分析中的表现 | InferCNV和sciCNV无法直接预测肿瘤细胞,CNV评分分布曲线未能清晰区分恶性和非恶性细胞群体 | 评估单细胞CNV分析工具在检测子宫内膜癌细胞中的可靠性 | 子宫内膜癌细胞 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | SCEVAN, CopyKAT, InferCNV, sciCNV | 单细胞转录组数据 | 公开可用的scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2025-11-02 |
VEGF-D Protects the Lung in Neonatal Hyperoxia-induced Lung Injury
2025-Nov, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0544OC
PMID:40343859
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研究论文 | 本研究探讨VEGF-D在新生儿高氧诱导肺损伤中的保护作用及其机制 | 首次揭示肺泡成纤维细胞通过表达VEGF-D调控淋巴管生成和淋巴管结构在BPD中的关键作用 | 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证 | 阐明VEGF-D在支气管肺发育不良发病机制中的保护作用 | 新生小鼠肺组织 | 病理生理学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, 定量PCR, 基因敲除 | 动物疾病模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量的小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2025-11-02 |
Reply to 'Enhancing spatial transcriptomics in clear-cell renal cell carcinoma'
2025-Nov, Nature reviews. Urology
DOI:10.1038/s41585-025-01086-8
PMID:40866723
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |