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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-05-31
Preservation and clonal behavior of extrachromosomal DNA in patient-derived xenograft models of childhood cancers
2026-May-28, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 该研究调查了患者来源异种移植模型在儿童癌症中保持染色体外DNA的保真度及其克隆行为 首次系统评估PDX模型在再现原发肿瘤ecDNA景观方面的保真度,并发现原发肿瘤中罕见的ecDNA阳性细胞优先驱动PDX肿瘤发展 未提及具体局限性,但可能包括PDX模型与人类肿瘤之间ecDNA获取率的差异以及样本量限制 评估患者来源异种移植模型在儿童实体癌中保持染色体外DNA序列组成和拷贝数变化的保真度 338个PDX模型和127个对应原发肿瘤的儿童实体癌样本 数字病理学 儿童癌症 全基因组测序, 多组学RNA和ATAC单细胞测序 NA 基因组测序数据, 单细胞测序数据 338个PDX模型和127个对应原发肿瘤 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA NA
82 2026-05-31
Loss of foxp3a drives sex-specific immune-metabolic remodeling across the gut-liver-gonad axis in zebrafish
2026-May-28, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 本研究利用foxp3a缺陷斑马鱼模型,揭示了foxp3a在肠道-肝脏-性腺轴中性别特异性免疫-代谢重塑中的作用 首次在斑马鱼中鉴定foxp3a为哺乳动物FOXP3的功能同源物,并通过多组学分析揭示了性别依赖性免疫-代谢协调机制 斑马鱼与哺乳动物免疫系统的差异可能限制结果直接外推至人类,且未深入探讨微生物群变化的因果关系 探究foxp3a在性别差异黏膜免疫调节中的作用及其对肠道-肝脏-性腺轴免疫-代谢协调的影响 foxp3a缺陷斑马鱼模型及其肠道、肝脏、性腺组织 机器学习和数字病理学中的多组学分析 NA 单细胞RNA测序、转录组分析、多组学整合分析 NA 基因表达数据、微生物组数据 不同性别和年龄的foxp3a缺陷斑马鱼及其野生型对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
83 2026-05-31
Spatial transcriptomics and multi-omics approach to decipher age-related tissue microenvironments and therapeutics in neurodegeneration and aging
2026-May-28, Ageing research reviews IF:12.5Q1
综述 系统综述空间转录组学及其与多组学整合在解析神经退行性与衰老相关组织微环境、发现生物标志物及指导精准治疗中的应用 首次系统阐述空间转录组学如何弥补传统转录组学和单细胞技术的空间信息缺失,并强调其在揭示年龄相关病理微环境中的关键桥梁作用 未具体讨论空间转录组学在临床应用中的技术成本、分辨率限制或样本处理标准化等实际挑战 整合空间转录组学与多组学方法,解析衰老及神经退行性疾病的组织微环境异质性,推动精准医学发展 衰老相关的神经退行性疾病(如阿尔茨海默病、帕金森病等)的脑组织微环境 数字病理学 神经退行性疾病、老年病 空间转录组学、多组学 NA 空间转录组数据、多组学数据(如基因组、蛋白组等)、临床影像数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
84 2026-05-31
Circadian rhythm disruption aggravates periodontitis via orchestrating TREM2+ macrophage-mediated bone resorption
2026-May-28, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序揭示了生物钟紊乱通过TREM2+巨噬细胞加剧牙周炎的机制 首次发现生物钟调控因子BMAL1通过节律性结合TREM2启动子调控其表达,生物钟紊乱导致TREM2持续过表达并驱动牙周骨吸收 基于小鼠模型,结论需在人源样本中验证;具体信号通路下游机制尚不明确 探究生物钟紊乱加重牙周炎中巨噬细胞介导的骨吸收机制 小鼠牙周组织及巨噬细胞亚群 机器学习 牙周炎 单细胞RNA测序,CUT&Tag测序 NA 基因表达数据 CRD加重牙周炎小鼠模型的牙龈组织样本 NA 单细胞RNA测序,CUT&Tag测序 NA NA
85 2026-05-31
Acute wood smoke exposure is associated with cell-specific hippocampal transcriptomic responses in an accelerated ovarian failure mouse model
2026-May-28, Neurotoxicology IF:3.4Q2
研究论文 利用急性木烟暴露结合加速卵巢衰竭小鼠模型,通过空间转录组学分析海马区的细胞特异性转录响应 首次结合围绝经期激素状态与急性木烟暴露,揭示海马体不同细胞类型的转录组差异反应 仅使用小鼠模型,结果需在人类中验证;急性暴露设计未考虑长期慢性效应 探讨围绝经期激素水平变化如何影响大脑对空气污染暴露的敏感性 雌性C57BL/6小鼠(加速卵巢衰竭模型)的海马体组织 数字病理学 老年疾病 空间转录组学 NA 基因表达数据 每组4个海马切片 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组分析
86 2026-05-31
Hypoxia Drives ANGPTL4 Expression in Tumor-Associated Macrophages and Promotes Intrahepatic Cholangiocarcinoma Intrahepatic Metastasis
2026-May-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和多组学分析,揭示了缺氧驱动的肿瘤相关巨噬细胞中ANGPTL4表达促进肝内胆管癌肝内转移的机制 首次发现缺氧通过CEBPB转录因子激活肿瘤相关巨噬细胞中ANGPTL4表达,并通过Integrin α5β1/FAK/Src/GSK3β/β-catenin信号通路促进肝内胆管癌细胞上皮-间充质转化和转移 研究样本量有限(15例iCCA样本),且未详细说明ANGPTL4阻断剂的具体类型和安全性评估 阐明肝内胆管癌肝内转移的肿瘤微环境驱动机制 肝内胆管癌肿瘤相关巨噬细胞和恶性上皮细胞 数字病理学 肝内胆管癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 15例肝内胆管癌样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
87 2026-05-31
Single-cell spatial transcriptional profiling of pancreatic ductal adenocarcinoma uncovers key immune-modulating and pro-metastatic mechanisms
2026-May-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 利用单细胞空间转录组学分析胰腺导管腺癌原发肿瘤与肝转移灶的细胞组成、空间组织和细胞间通讯差异,揭示新的免疫调节和促转移机制 首次对匹配的PDAC原发肿瘤和肝转移样本进行高分辨率单细胞空间转录组学分析,构建包含超过90万个细胞的单细胞空间图谱,并鉴定出TREM2和MMP12巨噬细胞亚群在空间上协调促转移程序 未提及 阐明胰腺导管腺癌从原发肿瘤到肝转移过程中细胞动态、空间结构和分子网络的变化,并发现新的免疫调节和促转移机制 胰腺导管腺癌患者匹配的原发肿瘤和肝转移组织样本 数字病理学 胰腺癌 单细胞空间转录组学(Xenium In Situ)、单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 超过90万个细胞 10x Genomics 空间转录组学 Xenium In Situ (5K) Xenium In Situ (5K)平台,用于福尔马林固定石蜡包埋样本的高分辨率单细胞空间转录组分析
88 2026-05-31
Immune cell imaging in the glioma microenvironment
2026-May-27, Brain research IF:2.7Q3
综述 综述了胶质瘤微环境中免疫细胞的成像技术进展及其在诊断和免疫治疗中的应用潜力 整合了多模态成像、放射性示踪剂及空间转录组学等方法,系统描绘了胶质瘤微环境中免疫细胞的分布与功能状态,并为个性化治疗策略提供了新途径 血脑屏障通透性、示踪剂特异性以及监管障碍仍是主要挑战 探讨免疫细胞成像在胶质瘤微环境中的现状及未来发展方向,以增强诊断、指导免疫治疗并改善患者预后 胶质瘤微环境中的免疫细胞(肿瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞、T细胞等)及其成像靶点 数字病理学 胶质瘤 磁共振成像、正电子发射断层扫描、光学成像、放射性示踪剂 NA 图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
89 2026-05-31
Spatial multi-omics reveals region-specific redox dysregulation in chronic aristolochic acid I-induced nephrotoxicity
2026-May-27, Free radical biology & medicine
研究论文 整合空间代谢组学、空间转录组学和区域定量分析,揭示慢性马兜铃酸I暴露引起的肾脏区域特异性氧化还原失调 首次建立慢性AAN大鼠模型,结合空间代谢组学、空间转录组学与区域LC-MS/MS定量分析,阐明毒物累积与代谢功能障碍的空间关联 未提及 阐明慢性马兜铃酸I暴露引起的区域特异性代谢功能障碍及其与毒物累积的空间关系 慢性马兜铃酸肾病大鼠模型 数字病理学 肾病 空间代谢组学、空间转录组学、AFADESI-MSI、LC-MS/MS NA 代谢组学数据、转录组学数据 慢性AAN大鼠模型,12周口服AAI(1和10 mg/kg/天) NA 空间代谢组学、空间转录组学 AFADESI-MSI AFADESI-MSI用于空间代谢组学分析
90 2026-05-31
Time-Dependent Gene Expression Patterns in Epidermal Wound Healing: Mechanistic Insights into Cayratia japonica Hydrogel Intervention After Anal Fistula Surgery
2026-May-27, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过开发优化的Cayratia japonica水凝胶并整合多组学分析,揭示了其在肛瘘术后皮肤伤口愈合中的时间依赖性基因表达模式及分子机制 首次结合时间序列多组学分析、临床随机对照试验和体外实验,系统阐明了C. japonica水凝胶通过Luteolin 7-glucuronide靶向BMP4蛋白促进成纤维细胞增殖的阶段特异性修复机制 未明确提及限制 开发优化的C. japonica水凝胶并通过多组学整合分析阐明其在皮肤伤口愈合中的分子机制 C. japonica水凝胶、肛瘘术后患者、体外成纤维细胞、公共转录组数据集 数字病理学 肛瘘 RNA-seq, 单细胞RNA测序, UPLC-ESI-Q-TOF-MS/MS, GNPS, 分子对接 加权基因共表达网络分析, 时间序列聚类 基因表达数据, 质谱数据, 临床数据 81例患者(临床随机对照试验),公共数据集(GSE28914, GSE241132) Illumina RNA-seq, 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq NA
91 2026-05-31
Single-cell transcriptomic analyses provide insights into TME related with tumor-promoting in AIDS-CNS-DLBCL
2026-May-27, Genomics IF:3.4Q2
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示艾滋病相关中枢神经系统弥漫大B细胞淋巴瘤肿瘤微环境与肿瘤促进的关系 首次在艾滋病相关CNS-DLBCL中发现具有神经特征的肿瘤细胞亚群,并揭示其通过ERK通路激活和免疫微环境重塑促进肿瘤进展的机制 样本量较小(7例艾滋病患者和2例免疫功能正常患者),且未提及功能验证实验 探究艾滋病相关中枢神经系统弥漫大B细胞淋巴瘤的肿瘤微环境和致病机制 艾滋病相关CNS-DLBCL患者和免疫功能正常CNS-DLBCL患者的肿瘤样本 单细胞转录组学 艾滋病相关中枢神经系统弥漫大B细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 7例艾滋病患者和2例免疫功能正常患者的肿瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
92 2026-05-31
Single cell sequencing in acute myeloid leukemia: Linking genotype to functional phenotype for precision risk stratification and treatment decisions
2026-May-27, Human pathology IF:2.7Q2
综述 本文综述了单细胞测序技术在急性髓系白血病中的应用,探讨其如何将基因型与功能表型联系起来,以实现精准风险分层和治疗决策 系统总结了单细胞多组学技术在解析AML克隆复杂性、区分残留白血病与克隆性造血方面的最新进展,并展望了空间单细胞技术对骨髓微环境研究的影响 未明确提及该领域当前的技术成本、数据整合复杂性及临床转化中的实际障碍 探讨单细胞测序技术如何改善AML的风险分层和治疗决策 急性髓系白血病(AML)的细胞、血液及骨髓样本 数字病理学 白血病 单细胞测序 NA 基因组、转录组、蛋白质组、表观基因组、代谢组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
93 2026-05-31
SLC39A1 promotes pancreatic cancer metastasis by elevating intracellular zinc and activating the Src/FAK signaling pathway
2026-May-27, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 该研究揭示了SLC39A1通过升高细胞内锌离子水平并激活Src/FAK信号通路促进胰腺癌转移的机制 首次通过单细胞RNA测序分析发现SLC39A1在胰腺癌转移中显著富集,并阐明其通过锌离子调控Src/FAK通路促进转移的新机制 未明确SLC39A1调控锌离子的具体分子机制,且体内实验仅采用小鼠模型,缺乏临床样本验证 探究锌离子稳态及其调控蛋白在胰腺癌转移中的作用和机制 胰腺癌原发灶与转移灶的单细胞转录组数据、胰腺癌细胞系及小鼠模型 机器学习 胰腺癌 单细胞RNA测序、免疫荧光、免疫组化、Western blot、细胞划痕实验、Transwell侵袭实验、3D细胞球形成实验 NA 单细胞转录组数据 从GEO数据库下载胰腺癌原发及转移样本的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA GEO数据库单细胞RNA测序数据
94 2026-05-31
Asiaticoside alleviates mesothelial cell senescence and peritoneal fibrosis by targeting macrophage-mesothelial communication in single-cell peritoneal landscape
2026-May-23, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析,揭示积雪草苷通过调控巨噬细胞-间皮细胞通讯缓解间皮细胞衰老和腹膜纤维化的机制 首次在单细胞水平解析腹膜纤维化微环境中的细胞组成和细胞间通讯网络,并阐明积雪草苷通过IGF1信号通路抑制间皮细胞衰老的抗纤维化新机制 未提及在人类样本中的验证,也未探讨长期治疗的安全性 研究腹膜纤维化进展中腹膜细胞成分及其相互作用的变化,探索积雪草苷对抗腹膜纤维化的药理作用和潜在机制 小鼠腹膜纤维化模型及高糖腹膜透析液诱导的腹膜样本 数字病理学 腹膜纤维化、慢性肾病 单细胞RNA测序 无特定模型 基因表达数据 57,032个单细胞,分为7种细胞类型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒用于单细胞RNA测序
95 2026-05-31
Integrative single-cell analysis reveals Bu-Shen-Huo-Xue Formula rescues iron-overloaded ovarian function via rewiring IFN-γ/JAK/STAT/CXCL10-driven immune-stromal interactions and BNIP3-mediated mitophagy in endometriosis
2026-May-23, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 通过整合单细胞分析揭示补肾活血方通过重编程IFN-γ/JAK/STAT/CXCL10驱动的免疫-基质相互作用和BNIP3介导的线粒体自噬,挽救子宫内膜异位症中铁超载的卵巢功能 首次利用整合单细胞RNA测序和Stereo-seq技术,从单细胞分辨率阐明补肾活血方通过双重机制——抑制铁超载诱导的免疫-纤维化微环境及恢复BNIP3-PINK1/Parkin依赖性线粒体自噬——改善卵巢子宫内膜异位症相关卵巢损伤和不孕症 未在人类样本中验证BNIP3靶向作用及毛蕊异黄酮苷的治疗潜力,缺乏长期生殖结局的随访数据,且未探讨其他潜在活性成分的协同效应 确定补肾活血方如何减轻卵巢子宫内膜异位症相关卵巢损伤和不孕,并识别关键生物活性成分及分子靶点 卵巢子宫内膜异位症小鼠模型 数字病理学 子宫内膜异位症 单细胞RNA测序, Stereo-seq, 血清药化学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 卵巢子宫内膜异位症小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
96 2026-05-31
Single-cell RNA sequencing reveals cadmium-induced cell-type-specific mechanisms of developmental neurotoxicity in human cortical organoids
2026-May-22, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示镉在人类皮层类器官中诱导细胞类型特异性发育神经毒性的机制 首次在人类皮层类器官模型中利用单细胞RNA测序技术揭示镉暴露引起细胞周期阻滞、锌铜离子稳态失调及抑制性神经元丢失的细胞类型特异性机制 未提供明确局限性信息 评估镉诱导的细胞类型特异性发育神经毒性并阐明分子机制 人类皮层类器官及其中神经细胞(如增殖神经细胞、星形胶质细胞) 单细胞转录组学 发育神经毒性 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 人类皮层类器官样本(未具体说明数量) NA 单细胞RNA测序 NA NA
97 2026-05-31
Functional Heterogeneity of Hepatitis B Virus-Specific CD8+ T Cells Mediates the Clinical Outcomes of Infection
2026-May-21, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 本研究探讨乙型肝炎病毒特异性CD8+ T细胞的功能异质性如何介导病毒感染的不同临床结局 首次通过单细胞测序和功能分析将HBV特异性CD8+ T细胞细分为IFNγ+、mTGFβ+和双阴性三个功能亚群,并发现其比例与临床结局密切相关 未提及具体限制,但样本量可能有限且仅针对HBV核心18-27表位 阐明HBV特异性CD8+ T细胞是功能耗竭还是源于初始T细胞库的不完全应答,并探索与临床结局的关系 乙型肝炎病毒特异性CD8+ T细胞及其功能亚群 免疫学 乙型病毒性肝炎 单细胞测序 NA 单细胞转录组和TCR序列数据 包含急性HBV感染已恢复者、非活动性HBV携带者和病毒免疫耐受患者 NA 单细胞测序 NA NA
98 2026-05-31
Macrophage-derived SPP1 promotes subretinal fibrosis by YAP1 phase separation in retinal pigment epithelium
2026-May-19, Metabolism: clinical and experimental
研究论文 研究巨噬细胞来源的SPP1通过YAP1相分离促进视网膜色素上皮下纤维化的机制 首次发现YAP1-2α的液-液相分离驱动RPE细胞纤维化,揭示了SPP1/CD44/RhoA通路在脉络膜新生血管向纤维化转化中的新机制 未提及明确的研究局限性 探究新生血管性年龄相关性黄斑变性中视网膜下纤维化的病理机制 小鼠巨噬细胞、视网膜色素上皮细胞、激光诱导的CNV和SRF模型 机器学习 老年病 RNA-seq, single-cell RNA-seq, ATAC-seq, Co-IP, Western blotting, 荧光恢复光漂白 NA RNA-seq数据、单细胞转录组数据、ATAC-seq数据、图像数据 小鼠巨噬细胞(酸性缺氧条件下琥珀酸盐或乳酸处理)、CNV和SRF模型小鼠 Illumina bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, ATAC-seq Illumina NovaSeq NA
99 2026-05-31
PI3Kδ inhibition alters CD8 T cell differentiation and reprograms the tumor microenvironment following adoptive immunotherapy
2026-May-14, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本文研究了PI3Kδ抑制剂CAL-101对CD8 T细胞分化的影响及其在过继免疫治疗后重塑肿瘤微环境的作用 首次揭示PI3Kδ抑制通过增强T细胞干性和代谢适应性来抵抗终末耗竭,并利用单细胞RNA测序和空间转录组学分析肿瘤微环境的变化 主要基于小鼠B16黑色素瘤模型,人类T细胞实验有限,且未在临床样本中验证 探索PI3Kδ抑制剂改善过继细胞治疗在实体瘤中疗效的机制 CD8 T细胞和B16黑色素瘤肿瘤微环境 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据 B16黑色素瘤肿瘤样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
100 2026-05-31
Eosinophils drive intestinal remodelling and innate defence in reproduction
2026-May-13, Nature IF:50.5Q1
研究论文 揭示嗜酸性粒细胞在生殖过程中驱动肠道重塑和先天防御的新机制 首次发现嗜酸性粒细胞在妊娠和哺乳期积累于小肠,以干细胞内在方式促进杯状细胞分化和粘液产生,增强肠道先天防御,且这种重塑在哺乳停止后持续存在 未提及具体局限性 研究怀孕至产后哺乳期间母体肠道免疫适应机制 小鼠肠道组织及嗜酸性粒细胞 NA NA 单细胞转录组学、空间转录组学、类器官培养、遗传和药物调控 NA 基因表达数据、图像 NA NA 单细胞转录组学、空间转录组学 NA NA
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