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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-07-10
Identification and verification of immunogenic cell death-related signatures derived from bone metastasis of prostate cancer based on multi-omics and machine learning algorithms
2026-Jul-07, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 基于多组学和机器学习算法,识别并验证前列腺癌骨转移相关的免疫原性细胞死亡特征,并构建预后模型 首次整合单细胞转录组和批量转录组数据,结合多种机器学习算法(98种组合)构建免疫原性细胞死亡相关特征模型,用于前列腺癌骨转移的预后评估和免疫治疗反应预测 研究仅基于公开数据集和体外实验验证,缺乏体内实验和临床队列的进一步确认 阐明免疫原性细胞死亡在前列腺癌骨转移中的预后意义,并开发相关特征模型以改善风险分层和治疗决策 前列腺癌骨转移相关的免疫原性细胞死亡基因特征 机器学习 前列腺癌 单细胞转录组测序,批量转录组测序,机器学习 Enet [α = 0.3] 基因表达数据,单细胞转录组数据 训练队列和两个独立验证集(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
82 2026-07-10
Mapping clinical CAR-T cells: insights from scRNA-seq
2026-Jul, Trends in molecular medicine IF:12.8Q1
综述 本文综述了使用单细胞RNA测序分析临床CAR-T细胞的研究,重点关注T细胞耗竭、细胞毒性、记忆、扩增、克隆多样性和细胞因子等方面 系统总结了scRNA-seq在CAR-T细胞治疗中的应用,涵盖多个关键生物学过程及其与临床响应的关联 scRNA-seq技术在CAR-T细胞研究中的局限性,包括技术挑战和未来方向 为临床医生和研究人员提供scRNA-seq在CAR-T细胞研究中的关键见解 临床CAR-T细胞 机器学科技、数字病理学 癌症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
83 2026-07-10
Lineage and organ signals sequentially build organ intrinsic nervous systems
2026-Jul, Nature IF:50.5Q1
研究论文 跨器官系统分析揭示器官固有神经系统从神经嵴细胞发育的双重调控逻辑:谱系程序预置空间框架,器官特异性信号决定最终分子特征和结构精度 首次在系统层面整合谱系追踪、三维成像、单细胞转录组学和遗传扰动,阐明器官固有神经系统发育的时空双重调控机制 该研究未探讨其他器官(如膀胱、子宫)的固有神经系统发育是否遵循相同逻辑,也未定量评估不同器官特异性信号对神经元分化的相对贡献 阐明器官固有神经系统如何从共同神经嵴细胞前体发育出不同器官特有的神经架构 心脏、胰腺、肠道和肺的器官固有神经系统及其发育过程 发育神经生物学, 单细胞组学 NA 谱系追踪, 三维成像, 单细胞转录组学, 遗传扰动, 体外共培养 NA 单细胞转录组数据, 三维荧光图像, 谱系数据 涉及小鼠心脏、胰腺、肠道和肺四个器官 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA-seq,Illumina NovaSeq 用于测序
84 2026-07-10
Single-cell transcriptomic analyses provide insights into TME related with tumor-promoting in AIDS-CNS-DLBCL
2026-Jul, Genomics IF:3.4Q2
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示与艾滋病相关中枢神经系统弥漫大B细胞淋巴瘤中肿瘤促进相关的肿瘤微环境 首次在艾滋病相关中枢神经系统弥漫大B细胞淋巴瘤中发现具有神经特征的肿瘤细胞亚群(神经信号细胞),并阐明其通过ERK通路激活和谷氨酸受体上调促进肿瘤恶性进展的机制 样本量较小(仅7例艾滋病患者和2例免疫功能正常患者),可能限制结果的普遍性 阐明艾滋病相关中枢神经系统弥漫大B细胞淋巴瘤的发病机制和肿瘤微环境特征 艾滋病和免疫功能正常患者的中枢神经系统弥漫大B细胞淋巴瘤样本 单细胞转录组学 艾滋病相关中枢神经系统弥漫大B细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 7例艾滋病患者和2例免疫功能正常患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
85 2026-07-10
Refined single-cell profiling captures a CCR5high CD4+ cytotoxic T-cell precursor in multiple sclerosis
2026-Jul, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 通过精细单细胞分析在多发性硬化中发现一种CCR5高表达CD4+细胞毒性T细胞前体 首次揭示多发性硬化中低频Th17.1细胞存在一个独特的CCR5高表达亚群,具有增强的细胞毒性和中枢神经系统浸润潜能,并鉴定其为CD4+细胞毒性T细胞前体 未明确提及 探索多发性硬化中Th17.1细胞的功能异质性和独特作用机制 多发性硬化患者血液和脑脊液中的CD4+ T细胞亚群 计算机视觉 多发性硬化 光谱流式细胞术、单细胞转录组学 NA 流式细胞术数据、单细胞转录组数据 多发性硬化患者配对血液和脑脊液样本,以及那他珠单抗治疗前后血液样本 NA 单细胞转录组学 NA NA
86 2026-07-10
The complement C3-microglial axis in depression of Parkinson's disease: from mechanism to therapeutic intervention
2026-Jul, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究探讨了补体C3-小胶质细胞轴在帕金森病抑郁中的作用机制及治疗干预,揭示了性别特异性血浆蛋白质组特征和补体介导的突触修剪在病理生理中的作用 首次揭示补体C3-小胶质细胞轴在帕金森病抑郁中的性别特异性机制,并发现肉毒杆菌神经毒素A通过抑制C3-C3aR信号通路发挥抗抑郁作用 临床分析受限于验证队列规模,机制研究仅限于雄性小鼠,可能限制研究结果对女性群体的普适性 阐明帕金森病抑郁患者的性别特异性血浆蛋白质组特征,并研究补体介导的突触修剪在其病理生理中的作用 帕金森病伴抑郁患者(DPD)及MPTP诱导的帕金森病小鼠模型 神经科学 帕金森病 质谱蛋白质组学、单细胞RNA测序、免疫组织化学 动物模型(MPTP/丙磺舒诱导的慢性帕金森病小鼠模型)、基因敲除小鼠模型(C3-/-和C3aR-/-) 蛋白质组学数据、单细胞转录组数据、行为学数据 来自帕金森病进展标志物倡议(PPMI)数据库的临床样本及独立验证队列(具体样本量未提及),小鼠模型(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
87 2026-07-10
A succinylation-based classifier predicts chemotherapy response in prostate cancer and reveals KAT2A as a therapeutic target
2026-Jul, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 基于琥珀酰化修饰的分类器预测前列腺癌化疗反应并揭示KAT2A为治疗靶点 首次提出基于琥珀酰化修饰的转录组评分(SS),整合代谢与免疫特征预测前列腺癌化疗反应,并发现KAT2A通过琥珀酰化PIK3R2促进化疗耐药的机制 研究主要基于TCGA-PRAD队列和体外实验,未在多中心大样本中验证SS的临床实用性 评估琥珀酰化修饰在前列腺癌中的预后意义,开发基于琥珀酰化的生物标志物,并阐明化疗耐药的驱动机制 前列腺癌患者肿瘤样本、患者来源类器官、前列腺癌细胞系、异种移植模型 机器学习, 数字病理学 前列腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 基因编辑 ssGSEA, CIBERSORT, TIDE, oncoPredict 转录组数据, 单细胞转录组数据 TCGA-PRAD队列(约500例)及患者来源类器官和细胞系 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
88 2026-07-10
Olfml3 Regulates Microglial Inflammation and Neuronal Injury in Obstructive Sleep Apnea via Cybb-Mediated TLR4/NF-κB Pathway
2026-Jul, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 该研究探讨Olfml3通过Cybb介导TLR4/NF-κB通路调节阻塞性睡眠呼吸暂停小胶质细胞炎症和神经元损伤 首次揭示Olfml3在间歇性缺氧诱导的小胶质细胞炎症中的调控作用,并阐明其通过Cybb/TLR4/NF-κB轴发挥神经保护作用 未提及具体局限性 研究Olfml3在阻塞性睡眠呼吸暂停间歇性缺氧诱导神经炎症中的作用机制 阻塞性睡眠呼吸暂停小鼠模型和经间歇性缺氧处理的小胶质细胞 NA 阻塞性睡眠呼吸暂停 单细胞RNA测序,qRT-PCR,Western blot,流式细胞术,酶联免疫吸附测定,荧光探针,CCK-8检测,组织染色 NA 基因表达数据,蛋白质表达数据,细胞表型数据 小鼠模型和体外培养细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
89 2026-07-10
Lecanemab treatment improves B cell subpopulation immune homeostasis in patients with Alzheimer's disease
2026-Jul, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 评估Lecanemab治疗对阿尔茨海默病患者外周免疫的影响,特别是B细胞亚群免疫稳态的恢复作用 首次揭示Lecanemab通过调节外周B细胞亚群比例和功能稳态发挥免疫调节作用的新机制 未提及具体局限性 评估Lecanemab对阿尔茨海默病患者外周免疫系统的免疫学影响 健康对照者和阿尔茨海默病患者的外周血单个核细胞及血清 NA 阿尔茨海默病 抗体阵列分析、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、血清蛋白数据 健康对照者和阿尔茨海默病患者,基线、治疗后3个月和6个月 10x Genomics(推测) 单细胞RNA测序 10x Chromium(推测) 单细胞RNA测序平台(具体型号未说明)
90 2026-07-10
Multi-omics analysis identifies altered EOMES-associated differentiation programs of precursor effector-memory CD8⁺ T cells in transplant-associated cutaneous squamous cell carcinoma
2026-Jul-01, Cancer genetics IF:1.4Q4
研究论文 通过多组学分析揭示移植相关皮肤鳞状细胞癌中EOMES相关的CD8⁺ T细胞前体效应记忆分化程序的改变 首次发现前体效应记忆CD8⁺ T细胞在移植相关皮肤鳞状细胞癌中显著积聚,并识别出EOMES作为其效应分化的关键转录调控因子 未提供具体的样本数量和验证实验细节 探究慢性免疫抑制如何重塑移植相关皮肤鳞状细胞癌中CD8⁺ T细胞的分化程序 移植相关皮肤鳞状细胞癌和免疫功能正常的皮肤鳞状细胞癌组织 数字病理学 皮肤鳞状细胞癌 单细胞转录组测序、T细胞受体库分析、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 一个独立的鳞状细胞癌队列,包含配对的肿瘤和邻近组织 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
91 2026-07-10
Epstein-Barr Virus-Induced Upregulation of GPR183: A Potential Upstream Mechanism in IgG4-Related Ophthalmic Disease
2026-Jul-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 研究EB病毒诱导GPR183上调在IgG4相关性眼病发病机制中的作用 首次发现GPR183是IgG4-RD中唯一一致上调的基因,并揭示EB病毒通过上调GPR183促进异位生发中心形成 样本量较小,需在更大队列中验证EBV-GPR183轴的因果作用 探索IgG4相关性眼病的上游触发机制和潜在治疗靶点 14名IgG4-ROD患者和13名对照者的泪腺标本 机器学学习 IgG4相关性眼病 RNA-seq, 多重免疫荧光, 流式细胞术, qPCR, 单细胞RNA-seq NA RNA测序数据, 蛋白表达数据 14名患者和13名对照者 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
92 2026-07-10
IL-17-driven tumor cell-intrinsic inflammatory programming creates an immunotherapy-permissive microenvironment
2026-Jun-30, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究揭示了IL-17驱动的肿瘤细胞内在炎症编程可创造免疫治疗允许的微环境,尤其在卵巢透明细胞癌中 首次阐明IL-17通过激活NF-κB依赖性炎症程序增强肿瘤免疫微环境对免疫检查点抑制剂的敏感性 主要基于小鼠模型和有限的人类样本,IL-17响应性肿瘤细胞炎症编程的临床转化潜力需进一步验证 探索IL-17驱动的肿瘤细胞内在炎症编程在卵巢透明细胞癌免疫治疗响应中的作用机制 卵巢透明细胞癌患者样本及同源小鼠模型 机器学习 卵巢癌 单细胞RNA测序、免疫组化、转录组分析 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据 180例人类样本及小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'测序平台
93 2026-07-10
Advancements in diagnosis and treatments of acute leukemia
2026-Jun-30, Chinese journal of cancer research = Chung-kuo yen cheng yen chiu
评论 总结急性白血病在微小残留病灶指导的精准分层、靶向治疗、细胞免疫治疗和异基因造血干细胞移植方面的里程碑式进展,并讨论未解决的临床瓶颈和未来方向 将MRD从预后指标升级为风险分层的核心决策因素,并系统总结LSC导向的MRD检测、单细胞测序等技术创新在提高监测灵敏度方面的作用 仍面临抗原逃逸、CAR-T细胞持久性、移植物抗宿主病和治疗可及性等挑战 总结急性白血病诊断和治疗的最新进展,提出未来改善治愈率和长期生存的方向 急性白血病患者,包括复发/难治性和老年患者 自然语言处理 急性白血病 单细胞测序, 数字PCR NA 文本 NA NA NA NA NA
94 2026-07-10
Diosgenin alleviates radiation nephropathy by suppressing renal mTORC1 signalling with concomitant effects on the gut and liver
2026-Jun-29, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 该研究通过整合单细胞转录组学、网络药理学和体内验证,揭示薯蓣皂苷通过抑制mTORC1信号通路减轻放射性肾病的机制,并伴随对肠道和肝脏的调节作用 首次利用单细胞转录组学解析放射性肾病中肾小管细胞和免疫细胞的mTORC1激活模式,并结合网络药理学和分子动力学模拟阐明薯蓣皂苷与mTOR的高亲和力结合,建立多组学框架揭示药物对肠道-肝脏轴的协同效应 未提及具体局限性,但可能包括小鼠模型与人类差异、辐射暴露方式的临床可比性以及长期疗效和安全性数据缺失 阐明薯蓣皂苷减轻放射性肾病的分子机制及其对肠道和肝脏的系统性影响 全身照射小鼠模型 数字病理学 放射性疾病(放射性肾病) 单细胞转录组学(scRNA-seq)、网络药理学、分子对接、分子动力学模拟、体内验证 mTORC1信号通路靶点分析 基因表达数据、蛋白质结构数据、组织病理学数据 小鼠模型,具体样本量未在摘要中明确给出 NA 单细胞RNA测序 NA NA
95 2026-07-10
Transcriptional heterogeneity predicts and enables clonal selection in ageing haematopoiesis
2026-Jun-25, Research square
研究论文 通过整合克隆谱系追踪和单细胞RNA测序,研究造血干细胞在衰老过程中的转录异质性如何预测并驱动克隆选择 开发了scCloneVar计算框架来量化克隆分辨率的转录异质性,发现转录变异性(而非平均状态)能预测衰老相关克隆选择,且DVG相关程序在人和小鼠中保守 未提及具体局限性 探究克隆内姐妹细胞间的转录变异性(而非转录状态)是否为预测衰老相关克隆选择的关键属性 小鼠造血干细胞(HSC)及其克隆 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) scCloneVar(计算框架) 单细胞转录组数据 涉及异时和同时间移植模型中的HSC克隆 NA 单细胞RNA测序 NA NA
96 2026-07-10
Comparative Transcriptional Profiling of Key Macrophage and Fibroblast Subpopulations in Rheumatoid Arthritis-Associated Lung Disease
2026-Jun-22, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 利用Flex单细胞RNA测序比较类风湿关节炎相关肺病中关键巨噬细胞和成纤维细胞亚群的转录谱 首次使用探针基础的Flex单细胞RNA测序对固定肺组织标本进行转录组分析,比较RA-ILD与RA肺结节中巨噬细胞和成纤维细胞的基因表达差异,并揭示与IPF的转录重叠 标题和摘要未明确提及研究局限性,样本量较小(对照组4例,RA-ILD组9例,RA结节组3例) 通过转录组分析评估不同类风湿肺病中细胞特异性基因表达和通路激活,比较RA-ILD与RA肺结节及IPF的差异 固定肺组织标本中的巨噬细胞和成纤维细胞亚群 数字病理学 类风湿关节炎、间质性肺病、肺结节、特发性肺纤维化 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 4名无疾病对照、9名RA-ILD患者、3名RA结节患者的肺标本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium Flex 探针基础的Flex单细胞RNA测序(scRNA-seq)处理固定肺组织标本
97 2026-07-10
Pathway-centric visualization of cell-cell communication in single-cell transcriptomics data
2026-06-20, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 开发了scVizComm,一个用于交互式可视化单细胞转录组数据中细胞间通信的Web门户 提供了一个非编程的交互式可视化平台,并能够整合分子通路信息以优先分析细胞间通信中的下游受体信号 依赖于预计算的结果,可能无法实时分析新数据集 实现单细胞转录组数据中细胞间通信的途径中心化可视化 人类肾脏和心脏单核转录组数据,以及小鼠前脑数据 数字病理学 纤维化相关疾病 单核RNA测序 NA 基因表达数据 人类肾脏和心脏组织样本,以及小鼠前脑样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单核RNA测序数据
98 2026-07-10
Adiposity-Associated Monocyte Costimulatory Programming in Rheumatoid Arthritis Identified by Single-Cell Transcriptomics
2026-Jun-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 通过单细胞转录组学识别类风湿关节炎中与肥胖相关的单核细胞共刺激编程 首次在单细胞水平揭示肥胖通过增强单核细胞共刺激信号通路促进类风湿关节炎适应性免疫激活的机制 未提及具体局限性 探究肥胖如何增强类风湿关节炎中单核细胞的共刺激编程,从而促进适应性免疫激活 来自31名捐赠者(16名类风湿关节炎患者和15名非RA对照)的纯化循环单核细胞 单细胞转录组学 类风湿关节炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 31名捐赠者(16名RA患者和15名对照),约135,599个单核细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Flex平台 10x Genomics Flex平台用于纯化循环单核细胞的单细胞RNA测序
99 2026-07-10
JMJD3-driven epigenetic reprogramming of p16INK4a-positive cells promotes tendon regeneration
2026-06-11, Bone research IF:14.3Q1
研究论文 研究表明损伤诱导的p16阳性细胞通过JMJD3驱动的表观遗传重编程促进肌腱再生 首次揭示p16阳性细胞在肌腱再生中的有益作用及其依赖JMJD3的表观遗传机制,挑战了p16仅为衰老标志的传统认知 主要基于小鼠模型,缺乏人体组织验证;具体信号通路上下游调控细节未完全阐明 阐明p16阳性细胞在肌腱再生中的细胞身份和功能贡献 小鼠跟腱损伤模型中的p16阳性细胞 数字病理学 肌腱损伤 单细胞RNA测序, 原位免疫染色, 组蛋白去甲基化酶活性分析 NA 基因表达数据, 组织图像 小鼠跟腱损伤模型(具体样本量未明确提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
100 2026-07-10
circVDJ-seq for T cell clonotype detection in single-cell and spatial multi-omics
2026-06-10, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 介绍circVDJ-seq技术,用于从3'导向的单细胞和空间多组学工作流程中简化且高效地检测T细胞克隆型 circVDJ-seq提供了一种简化且经济高效的T细胞受体分析方法,可从单细胞RNA测序、ATAC+RNA多组学和空间转录组学等3'导向工作流中获取VDJ信息,无需特殊测序设备 NA 开发并验证一种可兼容多种3'导向单细胞和空间组学技术的T细胞克隆型检测方法 新鲜切除的神经母细胞瘤组织和受肺炎或COVID-19影响的死后淋巴结组织中的T细胞 machine learning 肿瘤学, 传染病学 circVDJ-seq NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、多组学数据 新鲜切除的神经母细胞瘤组织样本和死后淋巴结样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, 多组学 10x Chromium NA
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