单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 39637 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-05-21 |
Application and Challenges of Chimeric Antigen Receptor T Cell Therapy in Systemic Rheumatic Diseases and Autoimmune Disorders
2026-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70658
PMID:41930334
|
综述 | 综述嵌合抗原受体T细胞疗法在系统性风湿病和自身免疫性疾病中的应用与挑战 | 系统总结了CAR-T在自身免疫性疾病中的作用机制，分析了核心临床挑战，并突出了新兴策略（如通用型/体内生成CAR-T细胞、多靶点/逻辑门设计、器官归巢工程以及与耐受增强剂的合理组合），强调多组学整合用于患者分层和复发预测 | 面临制造复杂、组织穿透有限、抗原逃逸、免疫后遗症以及缺乏预测性生物标志物等未满足需求 | 系统阐述CAR-T在自身免疫性疾病中的机制、挑战和精准导向创新策略，推动功能免疫重置 | 系统性风湿病和自身免疫性疾病患者 | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病 | CAR-T细胞疗法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2026-05-21 |
Metabolic Alterations in Macrophage Subtypes Propel Immune and Stromal Remodeling in Neurofibroma's Malignant Progression
2026-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70709
PMID:41930352
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示巨噬细胞亚型代谢变化驱动神经纤维瘤恶变过程中的免疫和基质重塑 | 首次鉴定出SPP1KYNU巨噬细胞亚群在MPNST恶变中协调基质重塑和免疫抑制的核心作用，并发现色氨酸代谢作为潜在治疗靶点 | 未提及样本量较小等具体局限性 | 阐明神经纤维瘤恶性转化为MPNST的潜在机制，寻找新的治疗靶点和诊断标志物 | 人类良性丛状神经纤维瘤和恶性外周神经鞘瘤样本中的肿瘤微环境细胞 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病1型、恶性外周神经鞘瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本（基因表达数据） | 9个丛状神经纤维瘤和5个恶性外周神经鞘瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 83 | 2026-05-21 |
High-Purity Functional Corneal Endothelial Cells From Human Induced Pluripotent Stem Cells via a Novel Wash-Out Method
2026-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70650
PMID:41930340
|
研究论文 | 通过新颖的冲洗方法从人诱导多能干细胞中生成高纯度功能性角膜内皮细胞 | 首次开发了一种高效、非细胞毒性的冲洗方法，用于去除未分化的诱导多能干细胞并获得高纯度的角膜内皮样细胞 | 内容未提及该方法在长期移植后的稳定性以及其他动物模型或临床试验的验证 | 建立从诱导多能干细胞高效生成高纯度功能性角膜内皮样细胞的稳健方法，以克服角膜内皮移植治疗中供体短缺的问题 | 角膜内皮细胞和诱导多能干细胞 | 机器学习 | 角膜内皮功能不全 | 诱导多能干细胞分化、冲洗方法、单细胞测序、体内移植 | NA | 单细胞测序数据 | 诱导多能干细胞衍生的角膜内皮样细胞和人类原代角膜内皮细胞，以及角膜内皮功能障碍家兔模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2026-05-21 |
Infection of 5xFAD mice with a mouse-adapted SARS-CoV-2 does not alter Alzheimer's disease neuropathology yet induces widespread changes in gene expression across diverse cell types
2026-04, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71394
PMID:42029189
|
研究论文 | 研究小鼠适应性SARS-CoV-2感染对5xFAD小鼠阿尔茨海默病神经病理学及基因表达的影响 | 首次使用小鼠适应性SARS-CoV-2感染老年5xFAD小鼠模型，结合空间转录组学分析未直接感染脑部病毒情况下对多种细胞类型基因表达的广泛影响 | 未在脑内检测到病毒RNA，感染可能未直接作用于中枢神经系统，且研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类SARS-CoV-2感染对阿尔茨海默病的影响 | 探究SARS-CoV-2感染是否加重阿尔茨海默病神经病理学及疾病进展 | 老年5xFAD和野生型小鼠 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 老年5xFAD和野生型小鼠 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 85 | 2026-05-19 |
Dysregulated landscape of RNA-binding proteins in unexplained recurrent spontaneous abortion revealed by bulk and single-cell transcriptome
2026-Apr-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-45052-9
PMID:41922522
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2026-05-21 |
Delta family protocadherins contribute to protoglomerular targeting of olfactory sensory neuron axons in the olfactory bulb
2026-Apr, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1012090
PMID:41920906
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别斑马鱼嗅觉感觉神经元中差异表达的轴突导向基因，发现δ-原钙黏蛋白家族成员在嗅球原肾小球靶向中发挥关键作用 | 首次揭示δ1-和δ2-原钙黏蛋白家族成员分别特异性调控不同亚群嗅觉感觉神经元轴突靶向特定原肾小球区域 | 未明确阐述研究限制 | 阐明嗅觉感觉神经元轴突定向连接嗅球原肾小球的分子机制 | 斑马鱼嗅觉感觉神经元及其轴突在原肾小球中的靶向行为 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼嗅觉感觉神经元（具体样本数未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2026-05-21 |
Generative cerebral vasculature visualization using spatial transcriptomic data
2026-Mar-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-46455-4
PMID:41917199
|
研究论文 | 利用空间转录组数据生成大脑血管可视化 | 提出生成式AI模型Tera-MIND，利用单细胞空间转录组数据预测脑脉管系统空间组织，无需额外组织处理 | NA | 从空间转录组数据中推断血管组织的空间结构 | 小鼠大脑脉管系统 | 数字病理学 | 神经疾病 | 空间转录组学 | 扩散模型（Tera-MIND） | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 88 | 2026-05-21 |
Spike-in probe-enhanced single-cell RNA-seq reveals post-infusion transcriptomic remodeling of "prime-and-kill" synNotch-CAR-T cells
2026-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.26.713760
PMID:41929125
|
研究论文 | 开发了一种带有外源探针的增强型单细胞RNA测序工作流程，用于追踪和分析“prime-and-kill” synNotch-CAR-T细胞输注后的转录组重塑 | 首次采用定制外源探针增强单细胞RNA测序技术检测synNotch-CAR转录本，结合机器学习辅助分类器实现工程化细胞的高特异性和高灵敏度检测 | 外源探针检测敏感性在不同细胞类型间存在差异（E-SYNC细胞78.2% vs B-SYNC细胞60.0%），可能影响低丰度细胞的全面捕获 | 开发能够同时检测工程化细胞并进行转录组分析的单细胞RNA测序工作流程，以解析synNotch-CAR-T细胞输注后的动态行为 | 针对胶质母细胞瘤的synNotch-CAR-T细胞（E-SYNC和B-SYNC系统） | 机器学习、数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、外源探针设计、机器学习辅助分类器 | NA | 单细胞转录组数据 | 胶质母细胞瘤异种移植模型中的脾脏、肺和脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2026-05-21 |
Risk assessment of secondary primary malignancies: results from two large prospective European cohorts
2026-Mar-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01380-7
PMID:41888349
|
研究论文 | 利用孟德尔随机化分析和单细胞测序，探究原发性肿瘤与继发性恶性肿瘤的因果关系，发现胃癌与继发性食管癌和直肠癌的风险增加显著相关 | 首次通过孟德尔随机化分析系统验证了原发性肿瘤与继发性恶性肿瘤之间的因果联系，并利用单细胞测序发现PLK1癌症干细胞是这种因果关系的潜在驱动因素 | 依赖于欧洲人群的队列数据，可能限制结果的普适性；未详细说明孟德尔随机化分析中的工具变量选择及其潜在偏倚 | 评估原发性肿瘤患者发生继发性恶性肿瘤的风险，并验证其因果关联 | 来自UK Biobank（31种癌症类型）和FinnGen（28种癌症类型）两大欧洲前瞻性队列的癌症患者 | 机器学习 | 癌症 | 孟德尔随机化分析, 单细胞测序 | NA | 基因数据 | UK Biobank包含31种癌症类型，FinnGen包含28种癌症类型；具体样本量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2026-05-21 |
HarveST uses a heterogeneous graph learning framework to reveal spatial transcriptomics patterns
2026-Mar-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09841-2
PMID:41896336
|
研究论文 | HarveST利用异构图学习框架揭示空间转录组模式 | 提出基于异构图的空间转录组学统一计算模型，结合自监督学习与部分监督精炼的双重学习策略，并采用随机游走重启算法鉴定空间域标志基因 | 未提及局限性 | 开发能够精确识别空间域和标志基因的计算方法 | 人类皮层组织、小鼠嗅球、肿瘤微环境 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 异构图神经网络 | 空间转录组数据 | 多种组织样本（人类皮层、小鼠嗅球、肿瘤微环境） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 91 | 2026-05-21 |
AI-driven body composition atlas reveals its association with NSCLC immunotherapy outcome and molecular background: a multicenter study
2026-Mar-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01382-5
PMID:41896593
|
研究论文 | 通过AI驱动的身体成分图谱分析，揭示其与非小细胞肺癌免疫治疗结果及分子背景的关联 | 首次整合多维度身体成分参数，利用深度学习从CT图像中自动提取92个参数，并揭示其与免疫治疗预后的性别差异及分子机制 | 未提及 | 探究多维身体成分与非小细胞肺癌免疫治疗结果及分子背景的关联 | 非小细胞肺癌患者 | 计算机视觉, 机器学习 | 肺癌 | 深度学习, RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 深度学习算法 | CT图像, 转录组数据 | 2132例非小细胞肺癌患者，包括1919例免疫检查点抑制剂预后队列、190例批量RNA-seq队列和23例前瞻性单细胞RNA-seq队列 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2026-05-21 |
NetTracer3D Enables User-Friendly Analysis of Diverse Microscopic and Medical 3D Datasets
2026-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.25.714104
PMID:41929015
|
研究论文 | NetTracer3D 是一个用于分析多样化显微与医学3D数据集的用户友好型工具 | NetTracer3D 提供了三种广泛适用的网络分析模式（连接网络、分支邻接与分支点网络、邻近网络），并支持标准化数据格式和交互式探索，简化了3D图像分析流程 | 文章未明确提及局限性 | 开发一个集成工具，简化三维图像分析，促进不同数据集之间的整合、共享和分析 | 人类和小鼠肾脏、小鼠支气管、人类脑血管造影、淋巴结以及3D光片癌症图像 | 计算机视觉 | 癌症 | CODEX, 无标记拉曼光谱, 光片显微镜 | 网络分析模型（连接网络、分支邻接与分支点网络、邻近网络） | 图像 | 多种样本，包括人类和小鼠肾脏、小鼠支气管、人类脑血管造影、淋巴结及3D光片癌症图像 | NA | 空间转录组学, CODEX | NA | NA |
| 93 | 2026-05-21 |
Cross-Species Multi-Omics Profiling Identifies Conserved Activated Valvular Interstitial Cell Population Driving Myxomatous Mitral Valve Degeneration
2026-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.23.713796
PMID:41929066
|
研究论文 | 跨物种多组学分析揭示了在粘液样二尖瓣退行性变中保守的活化瓣膜间质细胞群 | 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学，跨物种（小鼠和人类）鉴定出一个保守的活化瓣膜间质细胞群，该细胞群富集促纤维化细胞外基质重塑程序，并优先定位于机械脆弱区域 | 研究生效细胞群的因果关系验证尚不充分，且人类样本数量有限 | 解析粘液样二尖瓣退行性变中瓣膜间质细胞的分子异质性及其在疾病发病机制中的状态特异性贡献 | 纤维蛋白-1缺陷小鼠模型和人类二尖瓣组织标本（包括正常、散发性二尖瓣脱垂和马凡综合征相关二尖瓣脱垂） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间表达数据 | 包含小鼠和人类样本，具体样本数未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 94 | 2026-05-21 |
Multi-omics integration reveals ANXA6-high γδ T cell-endothelial communication as a potential link between periodontitis and MASLD
2026-Mar-25, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00690-7
PMID:41876560
|
研究论文 | 通过整合多组学策略，揭示ANXA6高表达γδ T细胞与内皮细胞的通讯是牙周炎和MASLD共病的潜在免疫学联系 | 首次通过整合多组学分析，发现ANXA6高表达γδ T细胞与内皮细胞的免疫-血管交互作用，为牙周炎和MASLD共病提供新的分子机制 | 尚未提及具体实验验证或临床样本验证的局限性 | 探究牙周炎和MASLD共病的分子基础，寻找共享免疫特征和治疗机会 | 牙周炎和MASLD共病的免疫激活与代谢重塑相关基因和细胞通讯 | 机器学习 | 牙周炎, MASLD | 批量RNA测序, 空间转录组学, 单细胞测序, 机器学习 | 加权基因共表达网络分析, 机器学习模型 | 转录组数据, 空间转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 批量RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2026-05-21 |
Vascular invasion-associated gene expression is detectable in pre-surgical biopsies of stage I lung adenocarcinoma
2026-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70600-2
PMID:41876493
|
研究论文 | 检测I期肺腺癌术前活检标本中与血管侵犯相关的基因表达，以预测复发和手术获益 | 发现血管侵犯相关的基因特征在肿瘤侵袭灶之外也可检测到，并在术前活检中具有区分VI的潜力，支持术前风险分层 | 文中未明确提及具体局限性 | 识别能预测I期肺腺癌血管侵犯的生物标志物，以改善术前风险分层 | I期肺腺癌肿瘤样本，包括切除肿瘤和术前活检标本 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 162个切除肿瘤样本，及其子集用于空间转录组学；独立验证队列和多区域采样数据；术前活检队列 | Illumina | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | Illumina NovaSeq, 空间转录组平台未详述 | bulk RNA测序使用Illumina平台，空间转录组学用于部分子集 |
| 96 | 2026-05-21 |
ZMAP: A single-cell meta-atlas of zebrafish embryonic development reveals a consensus hierarchy of cell identities
2026-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.23.713599
PMID:41928926
|
研究论文 | 整合8个斑马鱼胚胎单细胞RNA测序数据集，构建统一参考图谱ZMAP，揭示细胞身份的分层共识 | 通过整合多个独立数据集，建立斑马鱼胚胎发育的共识层次注释本体和标记基因发现流水线，并提供交互式网络工具 | 未提及具体局限性，但跨研究整合可能受限于数据批次效应和原始注释差异 | 构建斑马鱼胚胎发育的单细胞整合参考图谱，实现跨研究一致性注释和细胞身份共识推断 | 斑马鱼胚胎发育中的单个细胞 | 计算生物学， 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 798,790个细胞，覆盖15个发育时间窗口 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 整合8个已发表的斑马鱼全胚胎scRNA-seq数据集 |
| 97 | 2026-05-21 |
Endometrial Hyperplasia Risk Is Increased by High-Fat Diet Via Estrogen-Driven Stromal Fibroblast Reprogramming Toward a Pro-Fibrotic State
2026-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.20.713224
PMID:41929061
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析高脂饮食如何通过雌激素驱动的基质成纤维细胞重编程增加子宫内膜增生风险 | 首次揭示高脂饮食通过雌激素信号驱动成纤维细胞向促纤维化状态重编程，从而连接雌激素优势、基质纤维化、免疫清除缺陷和子宫内膜增生易感性之间的机制 | 研究基于小鼠模型，可能不完全代表人类子宫内膜增生的病理机制 | 阐明肥胖如何改变子宫内膜细胞状态并增加子宫内膜增生风险 | 对照饮食或高脂饮食喂养的对照小鼠和易发子宫内膜增生小鼠的子宫内膜组织 | 数字病理学 | 子宫内膜增生 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照饮食和高脂饮食喂养的小鼠子宫内膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2026-05-21 |
CD8+ T cells sustain vaccination-induced immunity against dissemination of contained tuberculosis in immunosuppressed hosts
2026-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70911-4
PMID:41876499
|
研究论文 | 本研究利用小鼠模型，探究了在免疫抑制条件下，CD8+ T细胞如何通过疫苗接种维持对结核分枝杆菌潜伏感染的免疫力，防止感染扩散 | 首次揭示了在CD4 T细胞缺失的情况下，CD8 T细胞能够介导疫苗诱导的结核分枝杆菌扩散预防，为免疫低下个体的潜伏感染管理提供了新见解 | 研究基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 阐明在免疫抑制宿主中，维持结核分枝杆菌潜伏感染（LTBI）的免疫相关机制 | 小鼠模型中受控的淋巴结核分枝杆菌感染 | 数字病理学 | 结核病 | 多重参数成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 小鼠样本，具体数量未在摘要中提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 99 | 2026-05-21 |
IgA autoantibodies promote inflammation, Th17 polarization and fibrotic responses in hidradenitis suppurativa
2026-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70883-5
PMID:41876535
|
研究论文 | 本研究揭示IgA自身抗体在化脓性汗腺炎中促进炎症、Th17极化和纤维化反应的作用机制 | 首次系统阐明IgA自身抗体在HS中的致病角色，发现其通过NET-IgA免疫复合物引发促炎和促纤维化级联反应，揭示多细胞类型间的免疫串扰 | NA | 探究IgA自身抗体在化脓性汗腺炎慢性炎症和纤维化中的致病机制 | 化脓性汗腺炎患者的病变皮肤组织及免疫细胞（浆细胞、B细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、树突状细胞、T细胞、成纤维细胞） | 免疫学 | 皮肤疾病（化脓性汗腺炎） | 单细胞RNA测序、qPCR、免疫荧光、Western blot、自身抗原谱分析 | NA | 基因表达数据、免疫荧光图像、蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2026-05-21 |
Cellular landscape and diagnostic value of TROP2 in cerebrospinal fluid of lung adenocarcinoma leptomeningeal metastases
2026-Mar-24, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01379-0
PMID:41876785
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序描绘肺腺癌软脑膜转移患者脑脊液的细胞图谱，并发现TROP2作为诊断生物标志物的潜力 | 首次系统描绘肺腺癌软脑膜转移患者脑脊液的单细胞转录组图谱，揭示免疫抑制状态及TROP2作为新型诊断标志物 | 样本量较小（仅6例患者），且缺乏独立验证队列 | 探究肺腺癌软脑膜转移患者的脑脊液细胞组成及诊断标志物 | 肺腺癌软脑膜转移患者的脑脊液细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6例肺腺癌软脑膜转移患者的脑脊液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |