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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-06-15
Peripheral CD4+ naïve T cell remodeling and MMP1-associated inflammatory signatures in acute gouty arthritis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 结合孟德尔随机化、质谱流式细胞术、单细胞转录组分析和血浆蛋白质组学,研究了急性痛风性关节炎中外周CD4+初始T细胞重塑和MMP1相关炎症特征 首次整合双向孟德尔随机化、CyTOF免疫图谱、单细胞转录组分析、血浆蛋白质组学和前瞻性临床随访数据,揭示急性痛风性关节炎中CD4+初始T细胞重塑和MMP1相关炎症特征在复发风险分层中的探索潜力 未提及具体限制,但暗示MMP1的机制角色仍需进一步功能验证 探索急性痛风性关节炎中适应性免疫重塑及其与复发相关的炎症特征 急性痛风性关节炎患者(GA-A组、GA-R组)及健康对照 机器学习和生物信息学 痛风性关节炎 CyTOF、单细胞RNA测序、Olink蛋白质组学、孟德尔随机化 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、免疫细胞表型数据 PBMC样本:GA-A组25例、GA-R组22例、健康对照组9例;血浆蛋白质组学训练队列40例和验证队列64例 Olink 血浆蛋白质组学、单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 Olink平台 Olink平台用于血浆炎症蛋白定量
82 2026-06-15
Integrative Multiomics and Network Pharmacology Exploration of Active Components and Mechanisms of Action of Qufu Shengxin Ointment in Treating Chronic Nonhealing Wounds
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 通过整合多组学与网络药理学,揭示祛腐生新软膏治疗慢性难愈合伤口的活性成分与作用机制 首次结合多组学分析、孟德尔随机化、分子对接和体内实验,系统阐明祛腐生新软膏通过PI3K/Akt/mTOR通路调控自噬和炎症促进伤口愈合的机制,并识别AKR1B1和VCAM1为潜在治疗靶点 该研究主要基于生物信息学分析和动物实验验证,缺乏临床样本的直接验证机制研究 探究祛腐生新软膏治疗慢性难愈合伤口的药理学机制 慢性难愈合伤口(CNHWs)组织样本 自然语言处理 慢性难愈合伤口 RNA-seq, 单细胞RNA测序 WGCNA 转录组学数据 来自GEO数据集的慢性难愈合伤口与正常伤口组织样本 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
83 2026-06-15
Decoding anoikis-related genes in lung adenocarcinoma brainmetastasis via single-cell RNA sequencing: CD44-mediated functions
2025-Dec-26, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序技术解码肺腺癌脑转移中失巢凋亡相关基因(特别是CD44)的功能 首次利用单细胞RNA测序数据系统分析失巢凋亡相关基因在肺腺癌脑转移中的作用机制,并构建基于CD44等基因的预后模型 未明确说明 探究失巢凋亡相关基因在肺腺癌脑转移进展中的作用及预后意义 肺腺癌患者原发肿瘤组织及脑转移组织样本 单细胞组学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据、批量RNA测序数据、生存数据 6例肺癌样本和6例脑转移样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
84 2026-06-15
Causality between Cholecystectomy, Blood Lipids, and Major Adverse Cardiac and Cerebrovascular Events: A Multimodal Approach Highlighting Lipid Regulation
2025-Nov, Bulletin of experimental biology and medicine IF:0.9Q4
研究论文 采用多模态方法探究胆囊切除术、血脂与主要不良心脑血管事件之间的因果关系,强调脂质调节的作用 结合孟德尔随机化、多变量孟德尔随机化、表达数量性状基因座孟德尔随机化及单细胞测序等多种方法,系统评估胆囊切除术对血脂和心脑血管事件的因果效应,并识别关键中介因子ApoB/ApoA1比率和LPL基因 NA 评估胆囊切除术对血脂水平和主要不良心脑血管事件风险的因果效应 胆囊切除术、血脂(包括ApoB/ApoA1比率)、主要不良心脑血管事件(心绞痛、冠心病、心力衰竭、心肌梗死、中风) 机器学习 心血管疾病 孟德尔随机化、单细胞测序 NA 遗传数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
85 2026-06-15
Microarray and Single-Cell RNA Sequencing Reveals G-Protein Gene Expression Signatures of Spermatogonia Stem Cell
2025-10, Stem cell reviews and reports IF:4.5Q2
研究论文 该论文通过微阵列和单细胞RNA测序技术,揭示了与精原干细胞发育相关的G蛋白基因表达特征 首次利用微阵列分析结合单细胞转录组学,系统鉴定了人类精原干细胞中G蛋白偶联受体基因的表达模式,并验证了多个新基因在精原干细胞发育中的调控作用 未详细说明样本量、验证实验及功能机制研究的局限性 探究人类精原干细胞发育的分子机制,为男性生育力基础研究和治疗应用提供依据 人类睾丸精原干细胞 单细胞转录组学 男性不育相关疾病 微阵列分析、单细胞RNA测序、免疫荧光标记 NA 基因表达数据、转录组数据 6个人类睾丸样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
86 2026-06-15
Mast Cells Drive Ferroptosis in Gastric Tumors as Key Players in the Tumor Immune Microenvironment
2025-09, Omics : a journal of integrative biology IF:2.2Q3
研究论文 通过整合转录组分析,探究肥大细胞在胃癌肿瘤微环境中驱动铁死亡的作用机制 首次揭示肥大细胞通过旁分泌信号(可能涉及膜联蛋白和亲环蛋白A)调控肿瘤微环境中铁死亡的新病理生理轴 基于公共数据库的转录组分析,缺乏实验验证;样本量有限(TCGA中412例,GSE66229中300例);机制细节尚未完全阐明 阐明铁死亡与特定免疫细胞类型(尤其是肥大细胞)在胃癌中的功能联系 胃癌患者的肿瘤样本及成纤维细胞-肥大细胞共培养体系 机器学习 胃癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq 单样本基因集富集分析 转录组数据 412例(TCGA数据)和300例(GSE66229数据)胃癌患者样本,以及成纤维细胞-肥大细胞共培养数据 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
87 2026-06-15
Unraveling the oxidative stress landscape in diabetic foot ulcers: insights from bulk RNA and single-cell RNA sequencing data
2025-07-04, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 利用批量RNA和单细胞RNA测序数据揭示糖尿病足溃疡中氧化应激的全局景观,并鉴定出BCL2和FOXP2作为诊断标志物 首次通过整合批量RNA和单细胞RNA测序数据,结合机器学习、伪时间轨迹分析和体外实验,系统揭示了糖尿病足溃疡中氧化应激的分子机制,特别是成纤维细胞的异质性和低分化潜力 研究依赖于公开数据库的原始数据,可能引入批次效应;体外实验仅验证了BCL2和FOXP2的表达变化,未深入探讨其功能机制 利用生物信息学和初步验证方法,揭示糖尿病足溃疡中氧化应激的全局景观,并识别潜在的诊断标志物 糖尿病足溃疡患者的样本(包括批量RNA和单细胞RNA测序数据),以及正常对照样本 生物信息学 糖尿病足溃疡 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 机器学习 支持向量机递归特征消除, 套索算法, 随机森林 基因表达数据 单细胞RNA测序数据包含31,787个细胞,来自10个不同聚类;批量RNA测序数据包括糖尿病足溃疡患者和对照样本 NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
88 2026-06-15
Identifying Immunomodulatory Subpopulations of Adipose Stromal Vascular Fraction and Stem/Stromal Cells Through Single-Cell Transcriptomics and Bulk Proteomics
2025-06, Stem cell reviews and reports IF:4.5Q2
研究论文 通过单细胞转录组学与批量蛋白质组学整合分析,鉴定脂肪基质血管组分中具有免疫调节活性的间充质干细胞亚群 首次通过多模态整合方法(Scissor算法结合单细胞RNA测序与批量蛋白质组学)在未培养的脂肪SVF中鉴定出与细胞因子处理的培养ASCs表型相似的免疫调节亚群,揭示其通过IL6和SEMA4信号通路发挥应激适应免疫调节功能 未提及明显局限性 阐明脂肪组织中基质血管组分来源的ASCs的异质性免疫调节潜力,为治疗策略提供依据 脂肪组织中的基质血管组分和脂肪来源的间充质干细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序, 批量蛋白质组学, Scissor算法 Scissor算法 单细胞转录组数据, 蛋白质组学数据 培养至第二代(P2)的ASCs和未培养(P0)的SVF样本 NA 单细胞RNA测序, 批量蛋白质组学 NA NA
89 2026-06-15
Long-lasting B cell convergence to distinct broadly reactive epitopes following vaccination with chimeric influenza virus hemagglutinins
2025-Apr-08, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和B细胞受体库测序,分析了嵌合血凝素(cHA)疫苗接种后诱导的B细胞反应,发现其针对血凝素茎部区域的广泛中和表位产生持久且特异的B细胞应答 首次通过单细胞RNA测序与B细胞受体库联合分析,揭示了cHA疫苗诱导的B细胞对茎部广泛保护性表位的长期克隆汇聚和记忆B细胞池重塑 未提及样本量大小及长期随访中可能存在的个体间应答差异 阐明cHA疫苗接种后B细胞的特异性、功能及亚群变化,以验证其诱导针对HA茎部广谱保护性表位的持久抗体反应 受试者(临床试验参与者)的B细胞,尤其是浆母细胞(PB)和记忆B细胞(MBC) 数字病理学 流感病毒感染 单细胞RNA测序, B细胞受体库测序 NA 单细胞转录组数据, BCR序列数据 一项I期临床试验的受试者样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
90 2026-06-15
Tumor-derived arachidonic acid reprograms neutrophils to promote immune suppression and therapy resistance in triple-negative breast cancer
2025-Apr-08, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 发现三阴性乳腺癌细胞中积累的中性脂质通过花生四烯酸重编程中性粒细胞,导致免疫抑制和治疗抵抗 首次揭示脂滴形成在抗PD-1和化疗抵抗中的关键作用,并阐明肿瘤来源的花生四烯酸通过细胞外囊泡重编程中性粒细胞的机制 NA 探究三阴性乳腺癌对免疫检查点阻断和化疗联合治疗获得性抵抗的机制 三阴性乳腺癌细胞、中性粒细胞 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
91 2026-06-15
Genome-Scale Metabolic Modeling of Human Pancreas with Focus on Type 2 Diabetes
2025-04, Omics : a journal of integrative biology IF:2.2Q3
研究论文 通过单细胞RNA测序数据与通用Human1模型整合,构建了非糖尿病和2型糖尿病状态下胰腺α、β、δ和PP细胞的特异性基因组规模代谢模型,并分析其代谢活动 首次在单细胞分辨率下构建了2型糖尿病胰岛细胞的基因组规模代谢模型,揭示了不同细胞类型中代谢活动的特异性变化 未提及 整合实验与计算生物学方法,深入理解2型糖尿病病理生理学并发现新的分子靶点 胰腺α、β、δ和PP细胞 机器学习 2型糖尿病 单细胞RNA测序 基因组规模代谢模型 单细胞转录组数据 未提及 未提及 单细胞RNA测序 未提及 未提及
92 2026-06-15
Peptide amphiphiles alleviate myocardial endoplasmic reticulum stress to enhance cardiomyocyte-macrophage communication and promote macrophage M2 polarization
2025-02-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1
研究论文 开发了一种级联响应药物递送系统CT-PA@Sal,靶向损伤心肌细胞并缓解内质网应激,促进心肌细胞-巨噬细胞通讯及M2型巨噬细胞极化,减轻心肌缺血再灌注损伤 首次利用肽两亲物构建级联响应药物递送系统,特异性靶向受损心肌细胞并控制释放内质网应激抑制剂Salubrinal,改善细胞间通讯并促进抗炎M2型巨噬细胞极化 缺乏有效靶向受损心肌细胞的内质网应激抑制剂是该研究面临的主要障碍,且体内外实验仍需进一步验证转化潜力 开发靶向心肌内质网应激的肽两亲物药物递送系统,为心肌缺血再灌注损伤提供新的治疗策略 心肌缺血再灌注损伤模型中的心肌细胞和巨噬细胞 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA NA NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
93 2026-06-15
Gut microbial production of lithocholic acid reprograms pro-resolutive macrophages to enhance vedolizumab responsiveness via the TGR5/FXR-NF-κB axis
2025-Jan-02, The ISME journal
research paper 该研究揭示了肠道微生物代谢物石胆酸通过TGR5/FXR-NF-κB轴重编程促溶解巨噬细胞来增强维多珠单抗在克罗恩病中的疗效 首次发现肠道微生物代谢物石胆酸通过同时激活TGR5/FXR通路及下游NF-κB信号,将巨噬细胞极化为M2促溶解表型,从而增强维多珠单抗治疗反应性,并揭示了微生物组-免疫互作机制 研究主要基于人源化小鼠模型,尚需在更大规模临床队列中验证;未明确其他次级胆汁酸的作用及细胞类型特异性信号互作 阐明肠道微生物代谢物调节维多珠单抗治疗反应的分子机制,为开发克罗恩病个性化治疗策略提供依据 克罗恩病患者来源微生物群移植的小鼠模型及肠道巨噬细胞 machine learning 克罗恩病 单细胞RNA测序, 宏基因组学, 代谢组学, 粪便微生物群移植 条件培养基共培养系统, 人源化小鼠模型 单细胞转录组数据, 宏基因组数据, 代谢物数据 2,4,6-三硝基苯磺酸诱导结肠炎的人源化小鼠及伪无菌小鼠 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 宏基因组测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'端测序, Illumina NovaSeq宏基因组测序
94 2026-06-15
Single-Cell Analysis of Subcutaneous Fat Reveals Profibrotic Cells That Correlate With Visceral Adiposity in HIV
2024-12-18, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
研究论文 通过单细胞RNA测序分析HIV感染者皮下脂肪中的促纤维化细胞,发现其与内脏脂肪组织体积相关 首次在HIV感染者中揭示了皮下脂肪组织特异性的细胞组成和转录程序与内脏脂肪组织体积的关联,特别是中间巨噬细胞、肌成纤维细胞和MYOC+成纤维细胞的比例升高 需要进一步的纵向研究来确定方向性和机制 表征HIV感染者皮下脂肪组织细胞类型特异性组成和转录程序,探索与内脏脂肪组织体积增大的关联 长期接受抗逆转录病毒治疗的HIV感染者 机器学习 心血管疾病, 代谢性疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 92名参与者进行批量RNA测序,43名进行单细胞RNA测序 Illumina 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 Illumina NovaSeq 单细胞RNA测序使用10x Chromium平台
95 2026-06-15
Dual decoding of cell types and gene expression in spatial transcriptomics with PANDA
2024-11-11, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 提出PANDA方法,同时从空间转录组学数据中解码细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达 PANDA方法整合原型分析捕获细胞类型内异质性,并在解卷积过程中动态学习每个点的细胞类型特征,同时推断细胞类型比例和特异性基因表达,克服了现有方法忽略细胞内异质性的局限 NA 开发一种新方法以同时从空间转录组学数据中解码细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达,揭示组织内异质性 空间转录组学数据,包括肿瘤、大脑和发育中心脏等多种组织 机器学习和数字病理学 肿瘤和其他疾病 空间转录组学,单细胞RNA测序 概率模型和原型分析 空间转录组学数据 多种组织样本,包括肿瘤、大脑和发育中心脏 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
96 2026-06-15
IRescue: uncertainty-aware quantification of transposable elements expression at single cell level
2024-10-28, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 介绍IRescue软件,一种在单细胞水平量化转座元件表达的软件,能够处理单细胞RNA测序数据中的多映射读段计数问题 提出独特的UMI去重算法纠正测序错误,并使用期望最大化程序有效重新分配多映射读段计数 未提及具体限制 解决单细胞RNA测序中因转座元件广泛分布和遗传相似性导致的表达量化挑战 人类结直肠癌、大脑、皮肤老化及SARS-CoV-2感染和恢复期间的外周血单核细胞的模拟和真实单细胞及细胞核RNA测序数据 计算生物学 结直肠癌, 神经系统疾病, 皮肤老化, 病毒感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 基于模拟数据和来自四类真实样本的数据:人类结直肠癌、大脑、皮肤老化及SARS-CoV-2感染和恢复期间的外周血单核细胞 NA 单细胞RNA测序, 单细胞核RNA测序 NA NA
97 2026-06-15
Glucose deprivation-induced disulfidptosis in human nucleus pulposus cells: a novel pathological mechanism of intervertebral disc degeneration
2024-09-12, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 发现葡萄糖剥夺诱导的人髓核细胞二硫下垂是椎间盘退变的新病理机制 首次证实髓核细胞中二硫下垂的存在并鉴定出新的二硫下垂相关细胞亚群,揭示了营养不良与椎间盘退变的新联系 仅使用一个正常样本和一个椎间盘退变样本进行单细胞RNA测序分析,样本量有限 探究营养剥夺诱导的细胞死亡(特别是二硫下垂)在椎间盘退变中的作用 人髓核细胞、软骨细胞亚群、椎间盘退变组织 自然语言处理 椎间盘退变 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 全基因组DNA甲基化测序, 机器学习 预测模型 基因表达数据, 单细胞转录组数据, DNA甲基化数据 一个正常样本和一个椎间盘退变样本(用于单细胞RNA测序) NA 单细胞RNA-seq NA NA
98 2026-06-15
Integrative genomics unveils basement membrane-related diagnostic markers and therapeutic targets in esophageal squamous cell carcinoma
2024-09-11, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 利用整合基因组学揭示食管鳞状细胞癌中基底膜相关的诊断标志物和治疗靶点 首次通过单细胞RNA测序数据结合多种机器学习算法,鉴定出七个基底膜相关基因(BGN、LAMB3、SPARC、MMP1、LUM、COL4A1和NELL2)作为ESCC诊断标志物,并发现BGN作为潜在药物靶点 当前对基底膜相关基因在ESCC诊断中的研究仍较稀疏 识别基底膜相关诊断标志物并构建ESCC诊断模型,探索潜在治疗靶点 食管鳞状细胞癌(ESCC) 机器学习 食管癌 单细胞RNA测序 LASSO、随机森林、SVM-RFE 基因表达数据 来自GEO和TCGA数据库的食管鳞状细胞癌样本 Illumina 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq 单细胞RNA测序数据来源GEO数据库
99 2026-06-15
Myelin-associated oligodendrocytic basic protein-dependent myelin repair confers the long-lasting antidepressant effect of ketamine
2024-06, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 使用空间转录组学揭示氯胺酮通过髓鞘相关少突胶质细胞碱性蛋白依赖的髓鞘修复实现长效抗抑郁作用 首次发现氯胺酮通过促进少突胶质前体细胞分化成熟、恢复受损髓鞘来产生长效抗抑郁效应,并阐明(R)-氯胺酮与(S)-氯胺酮在髓鞘修复效应上的差异 未明确提及,但可能包括动物模型与人类的差异及机制验证的局限性 阐明氯胺酮长效抗抑郁作用的髓鞘修复机制及其与立体异构体差异的关系 经受慢性社交挫败应激的小鼠 机器学习 抑郁症 空间转录组学 NA 空间转录组数据 小鼠脑组织样本(具体数量未说明) NA 空间转录组学 NA NA
100 2026-06-15
Single cell transcriptomics reveals distinct transcriptional responses to oxycodone and buprenorphine by iPSC-derived brain organoids from patients with opioid use disorder
2024-06, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 利用iPSC衍生的脑类器官进行单细胞转录组学分析,揭示阿片类药物使用障碍患者对羟考酮和丁丙诺啡的差异性转录反应 首次在单细胞分辨率下比较了OUD患者来源的iPSC衍生的前脑类器官对羟考酮和丁丙诺啡的转录反应差异,并发现了丁丙诺啡对胶质细胞转录调控的显著影响以及羟考酮诱导的I型干扰素信号通路激活 仅使用了三名男性OUD患者的样本,样本量较小;研究结果可能受性别和个体差异影响;类器官模型无法完全模拟体内复杂的脑环境 阐明阿片类药物在单细胞水平上如何调节脑细胞类型功能,特别是羟考酮和丁丙诺啡对OUD患者脑类器官的特异性转录反应机制 三名男性阿片类药物使用障碍(OUD)患者诱导多能干细胞(iPSC)衍生的前脑类器官 单细胞转录组学 阿片类药物使用障碍 单核RNA测序(snRNA-seq) NA 基因表达数据 25787个细胞,来自三名男性OUD患者的iPSC衍生前脑类器官 10x Genomics 单核RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单核RNA测序
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