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当前共找到 40810 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-06-23 |
PanKbase Integrated Single-Cell Map: A Comprehensive Atlas of Human Pancreatic Islets
2026-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.02.729719
PMID:42327171
|
research paper | 构建了一个统一的人类胰腺胰岛单细胞图谱，整合来自多个来源的数据以研究1型糖尿病 | 整合了来自140名捐赠者、涵盖五种表型组的191个高质量测序数据，包括实验扰动样本（如SARS-CoV-2感染和促炎细胞因子暴露），并提供了公开访问的在线平台 | 未明确说明，但可能受限于公开数据的异质性和整合过程中对变量的控制 | 创建统一的单细胞RNA测序图谱以支持糖尿病病理生理学研究 | 人类分离胰腺胰岛组织及其单细胞数据 | machine learning | type 1 diabetes, type 2 diabetes | scRNA-seq | NA | 图像，文本 | 140名捐赠者中的191个高质量测序样本，包含448,935个细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2026-06-23 |
Perturbation of genes linked to common schizophrenia risk variants identifies cilia programs
2026-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.09.731172
PMID:42327190
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研究论文 | 利用CRISPR液滴测序在小鼠新皮层中扰动与精神分裂症风险变异相关的基因，揭示纤毛转录程序作为共同下游机制 | 首次在体内系统表型分析精神分裂症常见风险变异的靶基因，通过整合单细胞组学与多重扰动实验，发现纤毛功能障碍是精神分裂症遗传风险因素的汇聚机制 | 研究仅在产后小鼠新皮层进行，未包含人类神经细胞模型；扰动的12个基因可能未覆盖所有功能性风险变异 | 阐明精神分裂症常见风险变异如何通过调控基因表达影响疾病发生的生物学通路 | 出生后小鼠新皮层中的神经细胞及胶质细胞 | 机器学习 | 精神分裂症 | CRISPR液滴测序（CROP-seq）、单细胞RNA测序 | 基因调控网络推断、因子分析 | 单细胞转录组数据 | 扰动12个精神分裂症风险基因，通过单细胞测序获得3,031个差异表达基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2026-06-23 |
Wnt/β-catenin signaling regulates fibrotic atrophy of intra-articular adipose tissue in post-traumatic osteoarthritis
2026-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.08.730865
PMID:42327266
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研究论文 | 本文通过2D组织形态计量学、空间转录组学和3D微计算机断层扫描，揭示了创伤后骨关节炎中关节内脂肪组织的纤维化萎缩由Wnt/β-catenin信号通路调控 | 首次综合运用多模态成像和空间转录组学技术，系统描绘PTOA中关节脂肪组织的时空、结构和转录重编程，并证明Wnt/β-catenin信号和力学载荷是抗脂肪生成和促纤维化的关键因素 | 未提及具体局限性 | 阐明创伤后骨关节炎中关节内脂肪组织重塑的机制，特别是Wnt/β-catenin信号通路的作用 | 小鼠创伤后骨关节炎模型中的关节内脂肪组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 空间转录组学, 2D组织形态计量学, 3D微计算机断层扫描 | NA | 图像, 转录组数据 | 小鼠模型样本，具体数量文中未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 84 | 2026-06-23 |
Robust semi-supervised scRNA-seq integration from virtual adversarial learning
2026-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.07.730754
PMID:42327300
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2026-06-23 |
C1qa□ muscularis macrophages maintain enteric synaptic homeostasis to regulate gastrointestinal motility
2026-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.03.729640
PMID:42327058
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研究论文 | 发现C1qa+肌肉巨噬细胞通过补体依赖的突触重塑机制维持肠道神经突触稳态并调节胃肠动力 | 首次揭示C1qa+肌肉巨噬细胞在肠道神经突触稳态中的调节作用，并证明其通过补体依赖的吞噬功能维持突触密度 | 未在人类样本中验证该机制；未探索C1qa缺失对其他肠道功能的影响 | 探究肌肉巨噬细胞是否通过C1qa调节肠道神经突触组织和胃肠动力 | 小鼠肠道肌肉巨噬细胞和肠道神经系统 | 神经免疫学 | 胃肠动力障碍 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、巨噬细胞特异性基因敲除模型、电生理学、高分辨率成像 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据、电生理记录、成像数据 | 涉及小鼠模型（具体样本数量未在摘要中明确提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2026-06-23 |
Novel mouse models for perianal fistulizing Crohn's disease reveal therapeutic value of interferon-γ antagonists
2026-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.04.730162
PMID:42327245
|
研究论文 | 建立三种新型小鼠模型模拟人类肛周瘘管型克罗恩病，并验证干扰素-γ拮抗剂的治疗价值 | 首次建立三种临床相关的小鼠PFCD模型，揭示IFN-γ信号作为核心保守通路，并证明联合IFN-γ与TNF-α阻断的协同治疗效果优于抗TNF-α单药治疗 | 未提及具体局限性 | 建立临床相关的小鼠PFCD模型并评估IFN-γ作为新治疗靶点的潜力 | 三种小鼠模型（TNBS诱导的野生型小鼠、Il10-/-小鼠、TNFΔ69AU/+小鼠）及人源PFCD组织 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 转录组分析、流式细胞术、单细胞和空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 三种小鼠模型各至少5周观察期；人源PFCD组织（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 87 | 2026-06-23 |
Disease-dependent airway epithelial responses to acute electronic cigarette aerosol exposure: a pilot single-cell analysis
2026-Jun-05, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfag068
PMID:42244142
|
研究论文 | 使用单细胞RNA测序分析急性能电子烟暴露对健康和哮喘供体气道上皮细胞的疾病依赖性反应 | 首次在单细胞水平揭示哮喘背景下急性能电子烟暴露的细胞类型特异性转录反应，包括炎症、应激和衰老相关通路的疾病依赖性差异 | 样本量较小（初步研究），且仅评估了单次短期暴露（30分钟），未考虑长期暴露或不同电子烟成分的影响 | 探究急性能电子烟暴露对哮喘和非哮喘个体气道上皮细胞的细胞类型特异性反应差异 | 来自健康和哮喘供体的原代人气道上皮细胞（在气液界面分化） | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康和哮喘供体的气道上皮细胞样本（具体数量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2026-06-23 |
The immunodynamics of pulmonary fibrosis
2026-Jun, Cytokine & growth factor reviews
IF:9.3Q1
DOI:10.1016/j.cytogfr.2026.04.001
PMID:41999680
|
综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学揭示的肺纤维化免疫动力学，重新定义了免疫系统在肺纤维化中的核心驱动作用 | 提出免疫动力学框架，整合了特发性肺纤维化（IPF）和继发性纤维化间质性肺病（ILDs）的发病机制，并识别可干预的治疗窗口和患者分层策略 | 未提及具体局限性，需结合原文进一步分析 | 综合解析固有和适应性免疫细胞在肺纤维化疾病阶段的时空动态，评估免疫靶向治疗转化的成败 | 肺纤维化中的免疫细胞、上皮细胞和间质细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'基因表达, 10x Visium空间基因表达 |
| 89 | 2026-06-23 |
Single-cell transcriptomics reveals the ameliorative effect of gastrodin on cholestatic liver fibrosis
2026-Jun, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158165
PMID:41999704
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示天麻素对胆汁淤积性肝纤维化的缓解作用及多细胞机制 | 首次利用单核RNA测序（snRNA-seq）整合分析天麻素在胆汁淤积性肝纤维化模型中的多细胞调控机制，发现新的肝星状细胞亚群（Serpina表达）并鉴定关键靶点（Sult2a1、Sult1e1、Serpina1a） | 未明确提及，可能包括依赖鼠模型、缺乏临床验证、机制验证不足等（需参考全文） | 探究天麻素对胆汁淤积性肝纤维化的治疗潜力及其分子机制 | DDC饮食模型和胆管结扎模型小鼠的肝脏组织 | 机器学习 | 肝纤维化 | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | DDC模型小鼠和BDL模型小鼠（具体数量未在摘要中提供） | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2026-06-23 |
Resolving sensitivity, specificity and signal contamination in Xenium spatial transcriptomics
2026-Jun, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03089-8
PMID:42062553
|
研究论文 | 对Xenium空间转录组技术的敏感性、特异性和信号污染进行系统分析，并介绍一种信号净化方法SPLIT | 首次全面分析Xenium数据的技术噪声来源和性能特点，提出SPLIT方法解决信号污染问题并揭示T细胞耗竭特征与恶性细胞共定位的关联 | 文本未明确说明局限性，但可能包括数据集仅涵盖乳腺和肺肿瘤样本，以及方法仍需在更广泛组织类型中验证 | 评估Xenium空间转录组技术的性能特征并开发信号净化方法 | Xenium平台生成的40多个乳腺和肺肿瘤组织切片的空间转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌、肺癌 | 空间转录组学、单核RNA测序 | 不适用 | 空间基因表达数据 | 超过40个乳腺癌和肺癌组织切片 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组平台，使用多种基因组合 |
| 91 | 2026-06-23 |
Predicting gene-specific regulation with transcriptomic and epigenetic single-cell data
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag299
PMID:42143610
|
研究论文 | 提出MetaFR方法，利用单细胞ATAC-seq和RNA-seq数据预测基因特异性调控 | MetaFR通过高效回归树学习基因特异性模型，将染色质开放性与基因表达关联，并在元细胞级别实现优于单细胞级别的预测性能 | 具体局限性未在标题和摘要中提及 | 利用单细胞表观遗传和转录组数据预测基因表达调控 | 单细胞ATAC-seq和RNA-seq数据中的基因调控关系 | 机器学习 | 未指定疾病 | 单细胞ATAC-seq，单细胞RNA-seq | 回归树 | 单细胞数据 | 未具体说明样本数量 | NA | 单细胞ATAC-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2026-06-23 |
Genomics-informed approach identifies which cell types regulate the metabolome
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag330
PMID:42213079
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研究论文 | 利用基因组学方法整合大规模代谢物数量性状位点数据集和单细胞RNA测序资源，识别调控代谢组的细胞类型 | 整合了最大的代谢物数量性状位点数据集（TOPMed和UK Biobank）和最全面的单细胞RNA测序资源（Tabula Sapiens），采用多基因方法揭示新型代谢物-细胞类型关联，如苯丙酸与β细胞的关联 | NA | 确定调控代谢物水平的细胞类型 | 人体代谢物和细胞类型 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2026-06-05 |
Network methods for diagonal integration of unpaired single-cell multiomics data: a review
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag353
PMID:42234838
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综述 | 综述了用于非配对单细胞多组学数据对角集成的网络方法，涵盖从转录组学骨架构建到跨模态整合的完整计算流程 | 首次聚焦于非配对单细胞蛋白质组学数据的对角集成挑战，系统总结了生成式蛋白质组翻译、归纳先验嵌入和基于扰动的因果基准测试三大未来发展方向 | 未提供新的软件或算法实现，基准资源表仅作为补充材料提供 | 综述用于非配对单细胞多组学数据（特别是scMS与单细胞转录组）对角集成的网络方法 | 非配对的单细胞转录组与蛋白质组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞质谱法 | 图神经网络, 生成模型, 概率图模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 94 | 2026-06-23 |
Basal gland localization and focal distribution of OLFM4-expressing cells in increasing severity of gastric intestinal metaplasia
2026-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.14.725297
PMID:42239144
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研究论文 | 本研究通过多重免疫荧光和全切片图像分析，评估OLFM4表达细胞在胃肠化生加重过程中的基底腺定位和局灶分布 | 首次系统描绘OLFM4表达细胞在胃黏膜肠化生组织中的空间分布特征，揭示其从腺体基底到表面的表达梯度以及与化生严重程度的强相关性 | 样本量相对有限（100个组织活检），且未进行功能性验证实验来证实OLFM4阳性细胞的干细胞特性 | 探究胃黏膜肠化生高风险的分子标志物及其在组织中的空间分布特征 | 胃黏膜肠化生、不典型增生和腺癌患者组织活检样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 多重免疫荧光 | NA | 图像 | 100个组织活检样本（包括对照组胃组织、胃黏膜肠化生、不典型增生和腺癌） | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2026-06-23 |
Integrated Analysis of Macrophage-Associated Necroptosis in Alopecia Areata
2026-Jun, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70305
PMID:42325069
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研究论文 | 通过整合转录组学和组织学分析，研究斑秃中巨噬细胞相关的坏死性凋亡特征 | 首次结合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq揭示斑秃中巨噬细胞亚群（IL4I1 macrophages_1）与坏死性凋亡信号的特异性关联，并发现TGFβ、ITGB2和GAS6信号通路在巨噬细胞-成纤维细胞通讯中的作用 | 样本量有限且主要来自公共数据库，缺乏功能性验证实验 | 探究坏死性凋亡在斑秃发病机制中的作用 | 斑秃患者和健康对照的头皮样本 | 生物信息学 | 斑秃 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 图像 | 191个头皮样本（来自斑秃患者和健康对照） | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2026-06-23 |
scDIG: An R Shiny Application for Interactive Density-Based Gating of Single-Cell Proteomic and Transcriptomic Data
2026-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.20.726609
PMID:42239256
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研究论文 | scDIG是一个基于R Shiny的交互式密度门控应用程序，用于单细胞蛋白质组和转录组数据分析 | 结合双模态索引驱动特征选择、特征加权核密度估计和交互式等高线门控，可直接在scRNA-seq和CITE-seq数据的二维投影中定义细胞群 | 未提及 | 开发一种平衡专家指导与可重复性的单细胞嵌入空间细胞群划分方法 | 人类CITE-seq外周血单核细胞数据（来自CAVA队列） | 计算生物学 | 心血管疾病 | CITE-seq, scRNA-seq | 核密度估计 | 单细胞蛋白质组和转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, CITE-seq | NA | NA |
| 97 | 2026-06-23 |
Adrenal Gland Macrophage-derived TGF-β Governs Vascular Permeability to Drive Monocyte Recruitment during Stress
2026-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.18.726080
PMID:42239159
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研究论文 | 本研究揭示肾上腺巨噬细胞通过分泌TGF-β调控血管通透性，从而驱动压力状态下单核细胞募集 | 首次发现肾上腺巨噬细胞-TGFβ-内皮细胞轴在压力适应中的关键作用，揭示了巨噬细胞通过调控血管特性支持免疫细胞募集的先前未被识别的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类肾上腺中的相关机制有待进一步验证；仅关注了巨噬细胞来源的TGFβ，其他细胞来源的TGFβ可能也有贡献 | 探究肾上腺巨噬细胞在协调压力诱导的免疫重塑和血管功能中的作用 | 肾上腺巨噬细胞、内皮细胞和单核细胞之间的免疫-血管相互作用 | 机器学习和生物信息学 | 压力相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四种不同压力模型（急性冷暴露、慢性社交挫败、慢性炎症和全身感染）的小鼠肾上腺样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台，用于生成四种压力模型的单细胞转录组数据 |
| 98 | 2026-06-23 |
Once yearly cell-based therapy for sustained and dose tunable delivery of monoclonal antibodies
2026-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.19.726224
PMID:42239463
|
研究论文 | 开发了一种基于免疫调节封装的细胞“生物制剂工厂”，能够从单次给药中持续产生治疗性抗体长达一年 | 通过筛选化学修饰的海藻酸盐生物材料，开发出能维持稳定血清抗体滴度一年的免疫调节配方，并结合可回收的宏观装置实现剂量可调的按需治疗终止 | 未提及长期安全性和大规模临床试验数据 | 开发一种单次给药即可持续递送单克隆抗体的细胞疗法，替代传统频繁注射 | HIV中和抗体3BNC117、ipilimumab、pembrolizumab、adalimumab、PGT121等多种单克隆抗体 | 数字病理学 | 艾滋病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 免疫活性小鼠和非人灵长类动物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2026-06-23 |
From time-course expression to gene regulation: direct linear ODE inference without finite-difference approximation
2026-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.18.726023
PMID:42239317
|
研究论文 | 开发了一种无需有限差分近似的线性常微分方程直接推断方法，用于从时间序列表达数据中推断基因调控关系 | 首个不依赖有限差分近似而直接学习线性常微分方程模型进行基因调控推断的计算方法，利用闭合解优化问题并通过高效的高阶泰勒近似计算梯度 | 方法依赖于线性常微分方程模型假设，可能无法完全捕捉非线性调控关系；高计算需求在极大规模基因网络下可能受限 | 从时间序列基因表达数据中推断基因调控关系，准确理解细胞状态转变机制 | 时间序列基因表达数据，包括模拟数据和真实单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 线性常微分方程 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2026-05-21 |
Pan-cancer analysis of spatial transcriptomics reveals heterogeneous tumor spatial microenvironment
2026-May-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102751
PMID:41999752
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研究论文 | 对12种癌症类型373个样本进行泛癌空间转录组分析，揭示肿瘤空间微环境的异质性 | 首次大规模泛癌空间转录组分析，识别出56个局部细胞程序和13个重现性微环境，并发现肿瘤细胞和巨噬细胞的基因表达高度依赖于其空间位置 | 样本量和癌症类型覆盖仍有局限，部分微环境的临床关联需进一步验证 | 系统解析肿瘤空间微环境的异质性及其对临床结局的影响 | 12种癌症类型的373个肿瘤样本 | 数字病理学 | 多种癌症（泛癌） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 373个肿瘤样本（12种癌症类型） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |