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当前共找到 40164 篇文献,本页显示第 81 - 100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-06-06
Highly Constrained Kinetic Models for Single-Cell Gene Expression Analysis
2026-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种整合多数据类型的动力学模型,用于单细胞基因表达分析,将稳定状态和时间分辨数据集结合以模拟基因转录 首次将scRNA-seq与单分子追踪(SMT)数据整合到统一动力学模型中,发现3态模型相比2态模型有本质改进,并具有动力学校对特性 未明确说明,可能涉及模型对大规模scRNA-seq数据的计算效率或对特定基因类型的适用性 开发一种高度约束的动力学模型,用于分析单细胞基因表达动态和变异 单细胞RNA测序数据、单分子追踪数据、转录因子调控机制 机器学习 NA 单细胞RNA测序、单分子追踪 3态动力学模型、2态模型 图像、文本序列数据 未明确提供样本数量 NA 单细胞RNA测序, 单分子追踪 NA NA
82 2026-06-06
FAP-CD40 and PD1-IL2v combination therapy reprograms immunologically cold tumors through de novo intratumoral T cell-dendritic cell clusters
2026-May-28, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 FAP-CD40与PD1-IL2v联合疗法通过新生瘤内T细胞-树突状细胞簇重新编程免疫冷肿瘤 首次提出FAP-CD40联合PD1-IL2v策略,通过激活树突状细胞并促进T细胞扩增与分化,在免疫冷胰腺癌模型中诱导新生瘤内T细胞-树突状细胞簇,实现协同抗肿瘤免疫 未明确说明临床转化中的潜在毒副作用及人体免疫微环境差异的影响 评估FAP-CD40与PD1-IL2v联合疗法对免疫冷肿瘤的治疗效果及机制 胰腺导管腺癌小鼠模型(KPC肿瘤) 数字病理学 胰腺癌 多重共聚焦成像(3D免疫表型分析)、单细胞RNA测序、外重新刺激实验 不适用 图像、基因表达数据 小鼠胰腺肿瘤组织样本(具体数量未提供) 不明确 单细胞RNA测序、多重免疫荧光成像 不明确 不明确
83 2026-06-06
Single-cell spatial transcriptional profiling of pancreatic ductal adenocarcinoma uncovers key immune-modulating and pro-metastatic mechanisms
2026-May-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 利用单细胞空间转录组学技术解析胰腺导管腺癌从原发肿瘤到肝转移的细胞动态、空间结构及分子机制,揭示免疫调节和促转移的关键机制 首次在匹配的原发肿瘤和肝转移样本上应用高分辨率单细胞空间转录组学,构建包含超过90万个细胞的单细胞空间图谱,识别出TREM2和MMP12巨噬细胞亚群分别驱动血管重塑和细胞外基质重组,并发现CXCL9/10细胞可增强免疫检查点阻断疗效 未明确说明局限性,但基于摘要推测可能包括样本量有限、动物模型与人类生物学差异、以及空间转录组学技术的分辨率限制 揭示胰腺导管腺癌从原发肿瘤到肝转移过程中肿瘤微环境的细胞动态、空间结构及分子机制,寻找新的免疫调节和促转移机制及治疗靶点 胰腺导管腺癌患者的匹配原发肿瘤和肝转移样本 数字病理学,机器学习 胰腺导管腺癌 单细胞空间转录组学 (Xenium In Situ), 单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 超过90万个细胞 10x Genomics 空间转录组学,单细胞RNA-seq Xenium In Situ (5K) Xenium In Situ (5K) 用于FFPE样本的单细胞空间转录组分析
84 2026-06-06
Distinct senescent β-cell senotypes differentially drive islet aging and dysfunction
2026-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞分辨率的空间蛋白质组学和转录组学,鉴定人类胰腺中两种不同的衰老β细胞亚型,并揭示其在胰岛衰老和功能障碍中的差异化作用 首次在单细胞水平上鉴定出两种功能不同的衰老β细胞亚型(CDKN1A+和CDKN2A+),并区分适应性衰老和适应不良性衰老程序 研究样本量有限,且未在更大人群或病程中验证这些衰老亚型的动态变化 阐明人类内分泌胰腺中细胞衰老的异质性及其在正常衰老和2型糖尿病中的作用 人类胰腺组织样本(26名供体,年龄20-80岁)和分散胰岛细胞(14名供体,年龄34-69岁) 单细胞生物学 2型糖尿病 空间蛋白质组学、空间转录组学、单细胞RNA测序、功能检测 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、空间位置数据 26名供体的完整胰腺组织,14名供体的分散胰岛细胞 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
85 2026-06-06
Supporting-like cells constitute an alternative steroidogenic lineage conserved in amniotes
2026-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 揭示支持样细胞是羊膜动物中一种保留甾体生成功能的替代性细胞谱系 首次发现支持样细胞在哺乳动物胚胎发育中可作为主要甾体生成谱系,挑战了传统上认为雄激素产生仅依赖间质细胞谱系的观点 未明确支持样细胞在人类性腺发育中的具体作用,研究主要基于兔模型,需进一步验证跨物种保守性 探究支持样细胞在羊膜动物性腺中作为替代性甾体生成细胞谱系的功能和进化保守性 兔胚胎性腺中的支持样细胞、间质细胞和甾体生成细胞 单细胞转录组学 生殖发育相关疾病 单细胞转录组学、甾体组学、器官成像 单细胞转录组分析 单细胞RNA测序数据、甾体组数据、成像数据 兔胚胎性腺样本 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium 单细胞3'试剂盒结合Illumina NovaSeq测序
86 2026-06-06
CCL19⁺ fibroblasts define a proliferative niche in chronic lymphocytic leukemia
2026-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用单细胞RNA测序技术深入表征慢性淋巴细胞白血病(CLL)淋巴结中的增殖中心,揭示CCL19+成纤维细胞及其微环境在CLL细胞增殖中的作用 首次通过单细胞RNA测序技术解析CLL增殖中心的细胞组成,发现CCL19+成纤维细胞构成CLL细胞的招募和增殖微环境,并鉴定出多种配体-受体相互作用,包括CD74/MIF通路 研究主要基于体外培养和空间分析,部分发现尚未在体内模型或更大样本中验证,且测序样本量可能有限 探究慢性淋巴细胞白血病淋巴结中增殖中心的细胞和分子微环境,识别潜在的肿瘤脆弱性和治疗靶点 慢性淋巴细胞白血病患者的淋巴结组织及反应性淋巴结组织 数字病理学 慢性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及CLL和反应性淋巴结样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
87 2026-06-06
Spatially-Resolved Multiomic Atlas of Leiomyosarcoma Identifies Two Clinically Relevant Epigenetically-Driven Cell States
2026-May-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过多组学分析揭示平滑肌肉瘤中两种表观遗传驱动的临床相关细胞状态 首次在平滑肌肉瘤中发现两种表观遗传不同的细胞状态(去分化的间充质样MES和分化的平滑肌富集SMC),并揭示NFI和AP-1转录因子在这些状态中的作用,以及MES区域与免疫抑制性巨噬细胞的独特相互作用 主要基于未经治疗的平滑肌肉瘤样本,可能未涵盖所有治疗相关变异;空间转录组样本虽多但来自单个机构,可能存在选择偏倚 阐明平滑肌肉瘤在转录组和表观基因组层面的细胞异质性及其分子基础 未经治疗的原发性平滑肌肉瘤组织样本 机器学习 平滑肌肉瘤 单核多组学测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 128例平滑肌肉瘤的328个组织核心 10x Genomics 单核多组学测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单核多组学测序, 10x Visium空间转录组学
88 2026-06-06
Intermittent parathyroid hormone employs autonomous and non-autonomous mechanisms to drive osteogenesis from Ebf3-expressing skeletal progenitor cells
2026-May-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 揭示间歇性甲状旁腺激素通过内在和外源机制驱动Ebf3表达骨骼祖细胞成骨分化 首次阐明间歇性甲状旁腺激素同时通过细胞内在转录抑制和外部微环境重塑协同驱动CAR祖细胞成骨分化的双重机制,并在人类样本中得到验证 文中未明确提及研究局限性 探究间歇性甲状旁腺激素如何协调干细胞命运决定及骨骼组织重塑的机制 小鼠骨髓中表达Ebf3的Cxcl12丰富网状细胞及绝经后女性患者样本 医学研究 骨质疏松症 诱导谱系追踪、单细胞转录组学、条件遗传学 NA 单细胞转录组数据 小鼠和绝经后女性患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
89 2026-06-06
Multimodal atlas of human atherosclerosis links granular vascular cell states to coronary artery disease risk
2026-May-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 构建人类动脉粥样硬化多模态图谱,将颗粒状血管细胞状态与冠状动脉疾病风险联系起来 首次整合单细胞转录组、表观基因组和高分辨率空间表达数据,构建多模态动脉粥样硬化图谱;揭示平滑肌细胞和内皮细胞表型转变的顺式调控架构;建立细胞特异性增强子-基因连接图谱和多模态基因调控网络 未明确说明 通过多模态分子图谱解析冠状动脉疾病遗传风险位点的细胞特异性调控机制 人类动脉粥样硬化动脉床组织样本 基因组学、表观基因组学、空间转录组学 冠状动脉疾病、动脉粥样硬化 单细胞转录组测序、单细胞表观基因组测序、空间表达分析 NA 单细胞转录组数据、单细胞表观基因组数据、空间表达数据 超过一百万个细胞 NA 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 NA NA
90 2026-06-06
Targeting Oncomucin-driven Immunosuppression Improves the Efficacy of K-rasG12D Inhibition in Pancreatic Cancer
2026-May-25, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 研究癌性黏蛋白驱动的免疫抑制如何影响胰腺癌中K-rasG12D抑制剂的疗效,并探索靶向癌性黏蛋白的联合治疗策略 首次揭示跨膜癌性黏蛋白通过表皮生长因子受体/Unc-5 Netrin受体B信号通路促进胰腺癌免疫逃逸,并证明靶向癌性黏蛋白可增强K-rasG12D抑制剂的治疗效果,提出癌性黏蛋白作为新型免疫调节因子和治疗靶点 NA 评估癌性黏蛋白对胰腺癌肿瘤微环境的患者中心影响,为诊断和治疗策略提供信息 胰腺导管腺癌患者和小鼠模型 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序, 多重/连续免疫染色, NanoString分析, 基因沉默 NA 基因表达数据, 图像数据 34例单细胞RNA测序样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
91 2026-06-06
Targeting LRRC15 in Cancer-Associated Fibroblasts Modifies the Extracellular Matrix and Enhances Tumor Immune Responses to Suppress Lung Cancer Progression
2026-May-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究识别了LRRC15+癌症相关成纤维细胞是肺癌中肿瘤特异性的CAF亚群,并提出LRRC15作为潜在治疗靶点,通过调节细胞外基质和增强免疫应答抑制肺癌进展 首次提出LRRC15作为肺癌治疗靶点,并开发了靶向LRRC15和TGFβ的双特异性抗体,为靶向CAF的癌症治疗提供新策略 研究主要在动物模型中进行,未在人类患者中验证其疗效和安全性 探索LRRC15在癌症相关成纤维细胞中的作用及其作为肺癌治疗靶点的潜力 肺癌相关成纤维细胞(CAF)、小鼠肺癌模型 机器学习和数字病理学 肺癌 单细胞转录组学 NA NA 小鼠肺癌模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3端测序平台用于单细胞转录组分析
92 2026-06-06
Immune dysfunction contributes to comorbid depression in patients with multiple sclerosis
2026-May-15, Journal of affective disorders IF:4.9Q1
研究论文 通过整合基因组和单细胞数据,研究免疫功能障碍在多发性硬化症合并抑郁中的作用 首次整合GWAS和单细胞RNA测序数据,发现CD8+ T细胞介导的HLA-B限制性靶向5-HT1F受体神经元可能是MS合并抑郁的机制 单细胞数据样本量较小(仅4例MS患者),且未验证因果关系 探讨免疫功能障碍是否促进多发性硬化症合并抑郁的发病机制 多发性硬化症患者及抑郁患者 机器学习 多发性硬化症, 抑郁症 GWAS, 单细胞RNA测序, TCR测序 NA 基因组数据, 单细胞转录组数据 4例多发性硬化症患者(2例合并抑郁,2例无抑郁)的外周血单核细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
93 2026-06-06
Single-cell and spatial analyses identify a glycolysis-high state driven by STOML2 in epithelial ovarian cancer
2026-May-15, Experimental cell research IF:3.3Q2
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序与空间转录组学,揭示STOML2驱动上皮性卵巢癌中糖酵解高活性恶性表型及其调控机制 首次通过单细胞和空间多组学联合分析,发现STOML2作为糖酵解枢纽基因通过AKT/mTOR信号通路驱动卵巢癌代谢重编程,并构建基于STOML2的预后风险模型 未明确STOML2直接结合靶点,体内动物模型验证尚缺,临床样本验证队列规模有限 阐明上皮性卵巢癌中糖酵解相关恶性上皮状态的调控机制,鉴定可干预的代谢调控枢纽 上皮性卵巢癌细胞(A2780和SKOV3细胞系)及临床肿瘤组织样本 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, Seahorse细胞外通量分析, 蛋白质免疫印迹 高维加权基因共表达网络分析, 机器学习预后模型 基因表达数据, 空间转录组数据 TCGA-OV队列及多个独立GEO队列,具体样本数未明确 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
94 2026-06-06
PI3Kδ inhibition alters CD8 T cell differentiation and reprograms the tumor microenvironment following adoptive immunotherapy
2026-May-14, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本文研究了PI3Kδ抑制剂CAL-101在过继性免疫治疗中如何改变CD8 T细胞分化并重编程肿瘤微环境 首次揭示PI3Kδ抑制剂通过增强T细胞干性和代谢适应性来抵抗终末耗竭,并利用单细胞RNA测序和空间转录组学分析其机制 主要基于B16黑色素瘤小鼠模型,临床适用性需进一步验证 探索提高过继性细胞治疗在实体瘤中效果的新策略 CD8 T细胞和B16黑色素瘤肿瘤微环境 机器学习 黑色素瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 转录组数据 B16黑色素瘤小鼠肿瘤样本 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium
95 2026-06-06
CXCL16 as a potential therapeutic target to limit the activity of asthmatic CD4 memory T cells
2026-May-14, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 探讨CXCL16-CXCR6通路在哮喘CD4记忆T细胞活性中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 首次通过单细胞转录组学揭示CXCR6在哮喘肺CD4记忆T细胞中高表达,并证实阻断CXCL16可显著减少肺CD4记忆效应T细胞积累,减少组织炎症,并具有持续保护效应 研究主要在动物模型中进行,人类数据仅基于单细胞RNA测序分析,需进一步验证临床转化效果 研究CXCL16-CXCR6相互作用在哮喘相关CD4组织驻留记忆T细胞活性和积累中的作用 人和小鼠哮喘肺CD4 T细胞 机器学习和数字病理学 哮喘 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 人和小鼠哮喘肺细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
96 2026-06-06
Multi-Omics Analysis and In Vitro Experimental Validation Identify Candidate Mechanisms of Baicalein Against Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2026-May-11, Molecules (Basel, Switzerland)
研究论文 该研究通过多组学分析和体外实验验证,探讨黄芩素对抗慢性阻塞性肺疾病的潜在机制 创新地将多数据集转录组分析、单细胞转录组学、机器学习特征选择、孟德尔随机化、分子模拟和虚拟敲除分析等多种方法整合,用于黄芩素治疗COPD的靶点优先排序和机制探索 预测的以巨噬细胞为中心的机制尚需在免疫细胞和体内模型中进行专门的验证 阐明黄芩素治疗慢性阻塞性肺疾病的潜在机制 慢性阻塞性肺疾病(COPD)和黄芩素 机器学习 慢性阻塞性肺疾病 转录组学分析、单细胞转录组学、机器学习的特征选择、孟德尔随机化、分子模拟、虚拟敲除分析、体外实验 LASSO回归、随机森林、支持向量机 转录组数据、单细胞转录组数据、蛋白质组数据、遗传关联数据 260个对照样本和250个COPD样本(来自四个整合的GEO数据集) NA NA NA NA
97 2026-06-06
AnnQ: reference-based quantification of cellular abnormality at single-cell resolution
2026-May-04, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出AnnQ框架,利用单细胞RNA测序中的注释不确定性作为细胞异常性的定量指标,以检测异常细胞状态 将传统上被视为技术伪影的注释不确定性重新定义为衡量细胞异常性的定量指标,并引入多变量不确定性空间中的出参考评分来量化每个细胞的偏差 NA 开发一种基于参考的量化方法,在单细胞分辨率下检测细胞异常状态 单细胞RNA测序数据中的细胞 机器学习 NA RNA-seq NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
98 2026-06-06
scMVAF: a multi-view adaptive fusion clustering approach for single-cell RNA-sequencing data
2026-May-04, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
research paper 提出了一种名为scMVAF的多视图自适应融合聚类方法,用于分析单细胞RNA测序数据,通过生成多视图表征并融合特征来提升聚类性能 首次引入多视图框架并利用基于去噪零膨胀负二项模型的自动编码器来学习单细胞RNA-seq数据的嵌入表示,并通过多视图融合模块整合不同视图的信息以获取更判别的细胞嵌入 可能依赖于降采样特征生成视图的策略,对高维稀疏数据中的零计数处理仍有改进空间,且尚未在更大规模或更复杂的数据集上验证 开发一种能够更好地处理单细胞RNA-seq数据高维稀疏性和异质性的聚类方法 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 machine learning NA 单细胞RNA测序 自动编码器(基于去噪零膨胀负二项模型), 多视图融合模块 基因表达数据 16个真实数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
99 2026-06-06
USADAE: a deep learning approach to disentangle hidden covariates in RNA-seq data
2026-May-04, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 开发了一种基于对抗学习的自编码器框架USADAE,用于从RNA-seq数据中分离隐藏的协变量 首次提出无监督对抗解缠自编码器框架,专门用于分离RNA-seq数据中隐藏的混杂因素与生物学信号,突破了传统方法仅针对已知批次标签的局限 未提及具体局限性 开发一种深度学习方法,有效解缠RNA-seq数据中的隐藏混杂因素,提升差异表达和eQTL分析的下游校正能力 RNA-seq数据中的生物学信号和隐藏协变量(如未测量的技术变异和生物-技术变量间的非线性交互作用) 自然语言处理 癌症基因组学 RNA-seq 自编码器、对抗学习 基因表达数据 综合模拟和真实数据应用 NA bulk RNA-seq NA NA
100 2026-06-06
Lense: optimizing data preprocessing in single-cell omics using large language models
2026-May-04, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 介绍Lense,一种利用大语言模型自动优化单细胞组学数据预处理的方法 首次将大语言模型应用于单细胞组学数据预处理流程的自动优化,无需手动调参 未提及具体局限性 开发并验证一种基于语言模型的方法,自动选择最优预处理流程,提高单细胞组学分析的鲁棒性和效率 单细胞组学数据集,特别是新兴平台(如空间转录组学)的数据 机器学习 NA 单细胞组学,空间转录组学 大语言模型 (LLM) 单细胞组学数据(低维表示可视化图) NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
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