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当前共找到 33643 篇文献,本页显示第 81 - 100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2025-12-05
Decoding CNS regeneration: Insights from single-cell RNA sequencing in SCI and TBI across multiple species
2025-Nov-26, Neuroscience IF:2.9Q2
综述 本文综述了利用单细胞RNA测序技术研究脊髓损伤和创伤性脑损伤后中枢神经系统再生机制的多物种研究成果 通过整合哺乳动物、青蛙和斑马鱼等多种物种的scRNA-seq数据,进行跨物种比较分析,揭示了中枢神经系统损伤后保守的细胞反应和再生机制 研究主要基于现有文献综述,缺乏原始实验数据验证;时间范围限定在2010-2025年,可能遗漏早期重要研究 深入理解中枢神经系统损伤与修复的分子和细胞机制,为未来治疗策略提供见解 脊髓损伤和创伤性脑损伤模型,涵盖哺乳动物、青蛙和斑马鱼等多种物种 数字病理学 神经系统损伤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
82 2025-12-05
CelLink: integrating single-cell multi-omics data with weak feature linkage and imbalanced cell populations
2025-Nov-26, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文提出了一种名为CelLink的新型单细胞多组学数据整合方法,旨在解决特征弱链接和细胞群体不平衡的挑战 CelLink通过特征归一化与平滑处理,结合多阶段最优传输算法迭代优化细胞对应关系,动态排除不可靠匹配的细胞,从而有效适应弱特征链接和不平衡细胞群体,并支持细胞亚型注释、错误标记细胞校正及空间转录组分析 NA 开发一种高效整合单细胞多组学数据的方法,以应对特征弱链接和细胞群体不平衡的问题 单细胞RNA测序数据、空间蛋白质组学数据以及配对的CITE-seq数据 机器学习 NA 单细胞多组学技术 最优传输算法 单细胞多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学, CITE-seq NA NA
83 2025-12-05
Targeted NAT10 Degradation by PROTAC NP1192 Suppresses Hypoxia-Adaptive Glycolysis and Reinvigorates CD8+ Effector T‑Cell Function for Synergistic Cancer Immunotherapy
2025-Nov-26, ACS central science IF:12.7Q1
研究论文 本文开发了一种靶向NAT10的PROTAC降解剂NP1192,通过抑制缺氧适应性糖酵解和增强CD8+效应T细胞功能,协同增强癌症免疫治疗效果 首次设计并验证了靶向NAT10的PROTAC降解剂NP1192,相比传统抑制剂Remodelin具有更强的降解效率和抗肿瘤效果,并揭示了其通过调控ac4C RNA修饰和HIF-1α通路来逆转肿瘤免疫抵抗的双重代谢-免疫机制 研究主要基于宫颈癌细胞系、肿瘤类器官和异种移植模型,尚未在更广泛的癌症类型或临床患者中进行验证 开发一种通过靶向降解NAT10来克服肿瘤免疫检查点阻断疗法抵抗的新策略 宫颈癌细胞、肿瘤类器官、小鼠异种移植模型以及CD8+ T细胞 癌症免疫治疗 宫颈癌 PROTAC技术、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、共培养实验 NA 基因表达数据、细胞功能数据 三种肿瘤类器官及小鼠异种移植模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
84 2025-12-05
Intraductal Papillary Mucinous Neoplasm Cellular Plasticity is Linked with Repeat Element Dysregulation
2025-Nov-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,结合定制重复元件探针,探讨了胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)的组织学亚型、重复元件失调与不同细胞群分子谱之间的关系 首次在IPMN中应用单细胞空间分子成像技术,揭示了从胃型向肠型和胰胆型分支的细胞状态可塑性连续体,并发现重复元件表达与高级别异型增生相关 样本量相对较小(18例患者),且仅针对手术切除的IPMN病变进行分析,可能无法完全代表所有临床情况 探究IPMN组织学亚型、重复元件失调与分子特征之间的关联,以理解其进展机制 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)的52个病变样本 数字病理学 胰腺癌 空间转录组学,单细胞空间分子成像,重复元件表达分析 NA 空间转录组数据,单细胞成像数据 52个病变样本来自18例患者 NA 空间转录组学,单细胞空间分子成像 GeoMx, CosMx GeoMx用于全转录组空间分析,CosMx用于单细胞空间分子成像,均使用LINE1、HSATII、HERVK和HERVH重复元件探针
85 2025-12-05
Orchestrating Spatial Transcriptomics Analysis with Bioconductor
2025-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一个基于Bioconductor在R中用于空间转录组学数据分析的开源在线书籍,包含可复现的代码示例和讨论 提供了一个免费、开源、持续更新和测试的在线资源,整合了多样化的计算方法和软件包,以简化空间转录组学数据分析工作流程 NA 旨在通过Bioconductor平台促进空间转录组学数据的分析和互操作性,包括与Python的集成 空间转录组学数据及其分析工作流程 生物信息学 NA 空间转录组学技术 NA 基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
86 2025-12-05
ARCADIA Reveals Spatially Dependent Transcriptional Programs through Integration of scRNA-seq and Spatial Proteomics
2025-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为ARCADIA的生成式框架,用于整合单细胞RNA测序和空间蛋白质组学数据,以揭示空间依赖的转录程序 提出了一种无需细胞条形码配对且不假设特征间直接对应关系的跨模态整合生成框架,通过识别模态特异性原型并最小化其细胞类型组成差异来实现对齐 方法在独立数据集上的应用效果依赖于数据质量,且未在更广泛的生物组织或疾病模型中验证 开发一种整合单细胞转录组和空间蛋白质组数据的方法,以解析空间微环境如何塑造细胞转录程序 人类扁桃体组织细胞 计算生物学 NA 单细胞RNA测序,空间蛋白质组学 变分自编码器 单细胞基因表达数据,空间蛋白质表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间蛋白质组学 NA NA
87 2025-12-05
Diffusion-based Representation Integration for Foundation Models Improves Spatial Transcriptomics Analysis
2025-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一个名为DRIFT的框架,通过扩散过程将空间信息整合到预训练的单细胞基础模型中,以改进空间转录组学数据分析 利用热核扩散在空间图上传播嵌入,将局部组织结构融入ST数据,同时保留先进单细胞基础模型学到的转录组表示,从而桥接单细胞基础模型与空间转录组学数据之间的鸿沟 未明确提及具体局限性,但可能涉及对预训练基础模型的依赖以及扩散过程参数设置的敏感性 开发一个通用框架,提升空间转录组学数据在细胞类型注释、聚类和跨样本对齐等下游任务中的分析性能 空间转录组学数据及其衍生的空间图 空间转录组学 NA 空间转录组学 扩散模型 基因表达谱与空间坐标数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
88 2025-12-05
Genetic dissection of microglia cannibalism reveals an IL10 signaling axis controls microglia lifespan
2025-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过大规模CRISPR筛选揭示了IL10信号轴如何通过调控溶酶体酸化来控制小胶质细胞的寿命和同类相食行为 首次在小胶质细胞中鉴定出IL10信号通路通过溶酶体酸化调控细胞寿命的机制,并提出了坏死性凋亡-同类相食过程作为小胶质细胞更新的质量控制机制 研究主要基于斑马鱼模型,虽然在小鼠中进行了验证,但人类小胶质细胞中的机制仍需进一步探索 探究小胶质细胞在清除细胞碎片后命运调控的遗传机制 斑马鱼和小鼠的小胶质细胞 神经免疫学 NA CRISPR筛选、单细胞RNA测序、机器人共聚焦显微镜 NA 基因表达数据、显微镜图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
89 2025-12-05
Single Cell and Spatial Transcriptomics Identify Novel Immune-Stromal Interactions in Cardiac Allograft Vasculopathy
2025-Nov-21, Research square
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,分析了心脏同种异体移植血管病变(CAV)中冠状动脉的转录特征,揭示了免疫-基质细胞相互作用在疾病进展中的关键作用,并发现干扰素阻断剂Ruxolitinib在小鼠模型中能显著降低CAV发生率 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,全面表征了CAV的独特细胞和转录景观,并识别出I型干扰素介导的炎症通路作为潜在治疗靶点 研究基于人类和小鼠模型,可能无法完全反映所有临床情况;样本量相对有限,需要更大规模验证 旨在阐明CAV的发病机制,识别关键细胞类型和分子信号,以开发新的治疗策略 人类冠状动脉样本(包括CAV、动脉粥样硬化冠状动脉疾病和非疾病对照)以及小鼠CAV模型 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 未明确指定具体样本数量,但涉及人类冠状动脉样本和小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
90 2025-12-05
Harnessing dental stem cell-derived synovial cells for IBD therapy: dual modulation of gut immunity and crypt repair
2025-Nov-20, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究提出利用人脱落乳牙干细胞分化为静止成纤维样滑膜细胞,通过双重调节肠道免疫和修复隐窝来治疗炎症性肠病 首次发现SHEDs能通过β-catenin非依赖的Wnt/JNK通路分化为TGM2+TFPI2+ QFLSs,并揭示其通过分泌IL-6促进潘氏细胞增殖和通过LIF驱动免疫抑制性Treg细胞扩增的双重治疗机制 研究主要基于小鼠结肠炎模型和人类组织验证,尚未进行临床试验 开发基于干细胞的新型IBD治疗方法 人脱落乳牙干细胞、小鼠结肠炎模型、人类IBD组织 干细胞治疗 炎症性肠病 单细胞RNA测序、类器官共培养 NA 基因表达数据、组织学数据 小鼠模型和人类IBD组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
91 2025-12-05
Lymphotoxin-driven cancer cell eradication by tumoricidal CD8 + TIL
2025-Nov-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过患者来源的TIL-黑色素瘤共培养系统,鉴定并表征了一种新型CD8+ TIL亚群,该亚群能够进行HLA I类非依赖性癌细胞裂解,并揭示了淋巴毒素β受体和干扰素感应通路在TIL介导的癌细胞杀伤中的关键作用 首次识别出一种新型CD8+ TIL亚群,该亚群具有HLA I类非依赖性癌细胞裂解能力,并通过全基因组CRISPR筛选确定了淋巴毒素β受体和干扰素感应通路为TIL介导癌细胞杀伤的关键决定因素 研究主要基于患者来源的TIL-黑色素瘤共培养系统,可能未完全反映体内肿瘤微环境的复杂性,且临床样本量有限 探究肿瘤浸润淋巴细胞疗法中关键TIL亚群及其介导癌细胞杀伤的分子机制 患者来源的肿瘤浸润淋巴细胞和黑色素瘤细胞 免疫肿瘤学 黑色素瘤 全基因组CRISPR筛选、单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 NA 单细胞测序数据、CRISPR筛选数据 患者来源的TIL和黑色素瘤细胞样本 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq NA NA
92 2025-12-05
Serum Procalcitonin: A Novel Tumor Biomarker for Diagnosis and Follow-Up in Fibrolamellar Hepatocellular Carcinoma
2025-Nov-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究探讨了血清降钙素原(PCT)作为纤维板层肝细胞癌(FLC)的新型肿瘤生物标志物在诊断和治疗监测中的潜在作用 首次将血清PCT确定为FLC的敏感且特异性生物标志物,并在血清和肿瘤水平上验证了其诊断和监测价值,填补了FLC缺乏可靠循环生物标志物的空白 样本量相对较小(18例FLC患者),且为回顾性研究,未来需要前瞻性验证和更大规模队列研究 评估血清降钙素原(PCT)作为纤维板层肝细胞癌(FLC)生物标志物的诊断和监测效用 纤维板层肝细胞癌(FLC)患者、肝细胞癌(HCC)患者、胆管癌(CCA)患者、肝硬化患者以及相关肿瘤组织样本 数字病理学 肝细胞癌 RNA测序、空间转录组学、免疫组织化学 NA 血清样本、肿瘤组织RNA测序数据、空间转录组学数据、免疫组织化学图像 34份血清样本来自18例转移性FLC患者,以及64例HCC、24例CCA、20例肝硬化患者;RNA测序分析包括27例FLC肿瘤、331例HCC肿瘤、39例CCA肿瘤、71例肝母细胞瘤、34例肝细胞腺瘤和55例非肿瘤肝样本;空间转录组学分析3例FLC;免疫组织化学分析13例FLC和34例其他原发性或继发性肝癌 NA RNA测序, 空间转录组学 NA NA
93 2025-12-05
Mature tertiary lymphoid structures support B cell-mediated antitumour immunity and are disrupted by neoadjuvant therapy in rectal cancer: a multicentre, retrospective study
2025-Nov-19, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究通过多中心回顾性分析,探讨了成熟三级淋巴结构(mTLS)在直肠癌中的免疫作用及其受新辅助治疗的影响 首次在直肠癌中系统评估mTLS与B细胞介导的抗肿瘤免疫的关联,并揭示新辅助治疗对TLS的破坏作用 回顾性研究设计可能引入选择偏倚,样本量相对有限,且缺乏前瞻性验证 阐明mTLS在直肠癌肿瘤免疫微环境中的作用及其治疗调控机制 直肠癌患者肿瘤组织样本 数字病理学 直肠癌 bulk RNA-seq, scRNA-seq, scBCR-seq, 免疫组织化学, 多重免疫荧光 NA 基因表达数据, 单细胞数据, 图像数据 队列1:bulk RNA-seq 123例,免疫组化/多重荧光 161例,scRNA-seq 10例(配对scBCR-seq 10例);队列2:bulk RNA-seq 19例,免疫组化 125例 NA 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序, 批量RNA测序 NA NA
94 2025-12-05
A Multimodal Atlas Reveals the Anatomical Distribution of Medium Spiny Neuron Subtypes and a Novel RGS6+ Population in the Primate Striatum
2025-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究结合单核多组学测序和高通量空间转录组学,构建了猕猴纹状体中型多棘神经元的全面图谱,揭示了新的神经元亚型和疾病风险关联 首次在灵长类纹状体中结合多组学和空间转录组学技术,识别出两个新的腹侧纹状体亚型(D1-VS-RGS6和D2-VS-RGS6),并揭示了细胞类型沿头尾轴的梯度分布 研究主要基于猕猴模型,结果向人类直接推广需谨慎;空间转录组学分辨率可能不足以捕捉所有细胞亚型细节 构建灵长类纹状体中型多棘神经元的综合图谱,以理解其细胞多样性、解剖分布及与疾病机制的关联 猕猴纹状体中的中型多棘神经元 数字病理学 帕金森病、物质使用障碍、精神分裂症、双相情感障碍 单核多组学测序、空间转录组学、ATAC-seq NA 单细胞多组学数据、空间转录组数据 约540万个空间解析细胞,覆盖纹状体全头尾和背腹范围 NA 单核多组学测序、空间转录组学 NA NA
95 2025-12-05
CBKMR: A Copula-based Bayesian Kernel Machine Regression Framework for Optimal Marker Detection in Omics Data
2025-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种基于Copula的贝叶斯核机器回归框架,用于优化组学数据中的生物标志物检测 提出了CBKMR模型,通过使用适合离散结果的边际分布和捕获观测间核诱导依赖性的高斯Copula,解决了传统BKMR在处理离散结果时的偏差和不稳定性问题,并进一步引入了基于最近邻高斯过程的NNCBKMR变体以提高计算效率 NA 开发一个能够捕获非线性基因-结果关系和高阶相互作用,同时具备自动相关性确定和不确定性量化的生物标志物检测框架 高通量组学数据中的生物标志物检测 机器学习 NA 单细胞RNA测序 贝叶斯核机器回归,高斯Copula,最近邻高斯过程 组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
96 2025-12-05
sc4D: spatio-temporal single-cell transcriptomics analysis through embedded optimal transport identifies joint glial response to Alzheimer's disease pathology
2025-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究提出了一个名为sc4D的生物可解释性时空分析框架,用于整合单细胞转录组数据,以研究阿尔茨海默病中的胶质细胞反应机制 开发了结合自编码器嵌入与最优传输的时空(4D)分析框架,能够联合建模疾病过程中的细胞状态、空间环境与时间动态,并预测干预措施 当前计算方法在联合建模复杂动态或从扰动实验中推断细胞轨迹方面能力有限 阐明疾病机制并预测能够改善细胞反应的候选干预措施 阿尔茨海默病小鼠模型的纵向空间转录组样本 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞转录组学,空间转录组学 自编码器,最优传输 单细胞转录组数据,空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
97 2025-12-05
CDH3 as a Novel Therapeutic Target in Basal-like Double-Negative Prostate Cancer
2025-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了CDH3在基底样前列腺癌中的作用,并评估了针对CDH3的抗体药物偶联物和CAR T细胞治疗策略 首次将CDH3识别为基底样前列腺癌的关键标志物和功能驱动因子,并开发了针对CDH3的ADC和CAR T细胞疗法,展示了在临床前模型中的显著疗效 研究主要基于小鼠模型和临床前实验,尚未在人类临床试验中验证,且样本量有限 阐明CDH3在基底样前列腺癌中的作用,并评估CDH3靶向治疗策略的潜力 基底样(双阴性)前列腺癌 癌症研究 前列腺癌 单细胞RNA测序、转录组分析、抗体药物偶联物和CAR T细胞技术 基因工程小鼠模型、异种移植模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据 小鼠前列腺癌模型和人类前列腺癌数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
98 2025-12-05
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Neutrophil Clusters Associated with Autoimmune Neuroinflammation
2025-Nov-19, Research square
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了与自身免疫性神经炎症相关的嗜中性粒细胞簇,并发现Saa3/SAA1作为潜在生物标志物和治疗靶点 首次在EAE模型中利用scRNA-Seq揭示嗜中性粒细胞在CNS炎症中的异质性,并识别出Saa3/SAA1作为MS的潜在生物标志物 研究基于小鼠EAE模型,结果在人类MS中的直接适用性需进一步验证 探究嗜中性粒细胞在自身免疫性神经炎症(如多发性硬化症)中的具体作用和异质性 小鼠EAE模型中的嗜中性粒细胞,以及多发性硬化症患者的血浆样本 单细胞组学 多发性硬化症 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 单细胞转录组数据 小鼠小脑和脊髓的嗜中性粒细胞,以及MS患者和健康对照的血浆样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
99 2025-12-05
CD301b lectin expression in the breast tumor microenvironment augments tumor growth
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文探讨了CD301b凝集素在乳腺癌微环境中的表达如何促进肿瘤生长 首次将肿瘤糖基化与CD301b⁺髓系细胞的凝集素信号传导联系起来,揭示其在调节免疫活性和促进肿瘤进展中的作用 研究主要基于小鼠模型,人类数据有限,且机制细节需进一步验证 研究肿瘤糖基化与凝集素相互作用对乳腺癌进展的影响 小鼠三阴性乳腺癌模型及人类乳腺癌样本 肿瘤免疫学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
100 2025-12-05
Comparative Single-Cell Transcriptomics Uncovers Shared and Distinct Molecular Signatures in Cystic Fibrosis and Primary Ciliary Dyskinesia
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过比较单细胞转录组学分析,揭示了囊性纤维化(CF)和原发性纤毛运动障碍(PCD)之间的共享和独特分子特征 利用预训练的transformer模型(scGPT)进行微调,并通过差异注意力分析识别两种疾病之间注意力分数改变的基因和通路,首次在单细胞水平上比较CF和PCD的分子机制 研究依赖于公开可用的测序数据,可能受数据质量和样本来源的限制,未涉及长期临床结果验证 比较CF和PCD的细胞异质性、分子通路和基因网络差异,以揭示其不同的分子机制 囊性纤维化(CF)和原发性纤毛运动障碍(PCD)患者的呼吸道细胞 自然语言处理 囊性纤维化 单细胞RNA-seq transformer(scGPT) 文本(基因表达数据) NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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