单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 38047 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-04-02 |
CXCR6+ T cells promote apoptosis and necroptosis in proximal tubules during AKI-to-CKD transition
2026-Mar-24, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08644-x
PMID:41876471
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序等技术，揭示了在AKI向CKD转变过程中，CXCR6+ T细胞通过CXCL16-CXCR6轴促进近端小管细胞凋亡和坏死性凋亡的关键机制 | 首次确定了CXCR6+ T细胞是适应性不良修复过程中免疫驱动肾小管细胞死亡的关键介质，并提出了靶向CXCL16-CXCR6轴的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型，其结论在人类中的适用性仍需进一步验证 | 探究在急性肾损伤向慢性肾病转变过程中，免疫细胞如何促进肾小管损伤和细胞死亡 | 小鼠肾脏近端小管细胞、CXCR6+ T细胞、巨噬细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 蛋白质分析 | NA | RNA测序数据, 图像数据, 蛋白质数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2026-04-02 |
Multiomic characterisation of the clinical efficacy of guselkumab induction therapy in ulcerative colitis
2026-Mar-23, BMJ open gastroenterology
IF:3.3Q2
DOI:10.1136/bmjgast-2025-002153
PMID:41871904
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法详细评估了古塞奇尤单抗诱导治疗在中重度活动性溃疡性结肠炎患者中的临床疗效及相关的细胞和分子变化 | 首次详细描述了通过拮抗IL-23p19亚基选择性抑制IL-23在炎症性肠病中产生临床疗效的分子变化，并整合了bulk RNA测序、单细胞RNA测序和流式细胞术等多种技术进行多组学分析 | 研究样本量相对有限（单细胞RNA测序n=52，流式细胞术n=30），且为短期诱导研究（12周），缺乏长期疗效数据 | 评估古塞奇尤单抗治疗溃疡性结肠炎的临床疗效及其分子机制 | 中重度活动性溃疡性结肠炎患者 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 血清蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 临床数据 | 313名患者（随机分组），其中bulk RNA测序257例，单细胞RNA测序52例，流式细胞术30例，血清蛋白质组学302例 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 83 | 2026-04-02 |
Dynamic changes of the immune microenvironment in ovarian cancer following neoadjuvant chemotherapy
2026-Mar-23, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03070-6
PMID:41872134
|
研究论文 | 本研究通过分析已发表的单细胞RNA测序数据并结合体外和体内实验，揭示了卵巢癌新辅助化疗后前列腺素介导的免疫抑制微环境形成是化疗耐药的关键机制 | 首次系统揭示了前列腺素在卵巢癌新辅助化疗后免疫抑制微环境形成中的关键作用，并证明联合使用顺铂和前列腺素特异性抑制剂可恢复CD8T细胞功能 | 研究主要基于已发表的单细胞测序数据，样本量可能有限；体内外实验模型可能无法完全模拟人体肿瘤微环境的复杂性 | 探索卵巢癌新辅助化疗后肿瘤免疫微环境的动态变化及化疗耐药机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本及相应的体外和体内实验模型 | 单细胞组学与肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 基于已发表数据，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2026-04-02 |
TRIM21-Mediated ubiquitination of FBL suppresses PI3K/AKT signaling and tumor progression in clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar-21, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06113-4
PMID:41863623
|
研究论文 | 本研究揭示了TRIM21通过介导FBL的泛素化降解，抑制PI3K/AKT信号通路，从而调控透明细胞肾细胞癌的进展 | 首次发现TRIM21作为FBL的新型E3泛素连接酶，催化其K48连接的多聚泛素化，促进其蛋白酶体降解，并阐明该轴通过PI3K/AKT信号调控ccRCC进展 | NA | 探究FBL在透明细胞肾细胞癌中的致癌机制及其与TRIM21的相互作用 | 透明细胞肾细胞癌细胞和组织 | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序、转录组学、蛋白质组学、免疫沉淀-质谱、分子对接 | NA | RNA测序数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2026-04-02 |
Enhanced endocrine-metabolic support and axonemal assembly in high-sperm-motility geese: insights from testicular cellular heterogeneity by scRNA-seq
2026-Mar-21, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106840
PMID:41916058
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了高精子活力鹅睾丸细胞异质性，并探讨了内分泌代谢支持和轴丝组装在精子活力差异中的作用 | 首次在鹅中应用单细胞RNA测序技术，系统分析了高、低精子活力个体睾丸细胞的转录组差异，并关联了内分泌、抗氧化和代谢指标 | 样本量较小（每组仅3只鹅用于单细胞测序），且研究仅针对早期成熟公鹅，未涵盖其他年龄或品种 | 探究鹅精子活力差异的细胞和分子基础 | 高、低精子活力公鹅的睾丸组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 60只公鹅（高、低活力组各6只，其中每组3只用于单细胞测序） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2026-04-02 |
Histone lactylation-driven feedback loop modulates pyrimidine metabolism to promote oral carcinogenesis
2026-Mar-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08580-w
PMID:41857010
|
研究论文 | 本研究揭示了组蛋白乳酸化，特别是H3K18la，通过激活胸苷激酶1（TK1）转录和嘧啶代谢，在口腔鳞状细胞癌（OSCC）发生中起关键作用，并发现了一个糖酵解/H3K18la/TK1/β-catenin正反馈环路 | 首次阐明了组蛋白乳酸化（H3K18la）在口腔癌变中的具体分子机制，发现了一个连接表观遗传修饰、代谢重编程和经典信号通路（Wnt/β-catenin）的新型正反馈环路 | 研究主要基于体外细胞实验和4NQO诱导的小鼠舌癌模型，其发现需要在更广泛的临床样本和体内模型中进一步验证 | 探究组蛋白乳酸化在口腔癌变（从口腔白斑到口腔鳞癌）过程中的作用及分子机制 | 口腔白斑（OLK）和口腔鳞状细胞癌（OSCC）组织、OSCC细胞系、4NQO诱导的小鼠舌癌模型 | 表观遗传学、肿瘤代谢 | 口腔鳞状细胞癌 | 免疫组织化学、CUT&Tag、scRNA-seq、ChIP-qPCR、糖酵解抑制、基因沉默 | NA | 组织切片图像、单细胞RNA测序数据、ChIP-qPCR数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量，涉及人体OLK和OSCC组织、细胞系及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2026-04-02 |
Frequency-domain kernels enable atlas-scale detection of spatially variable genes
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711372
PMID:41890107
|
研究论文 | 本文提出了一种名为FLASHS的新方法，用于在空间转录组学中检测空间可变基因，该方法通过频域核实现高精度、良好校准和大规模计算 | FLASHS方法将空间测试移至频域，利用随机傅里叶特征和稀疏草图技术，无需构建距离矩阵即可在零膨胀数据上进行多尺度核测试，并通过峰度校正零假设保持校准 | NA | 开发一种准确、校准良好且可扩展的方法，用于识别空间转录组学中的空间可变基因 | 空间转录组学数据，包括艾伦大脑MERFISH图谱中的394万个细胞和人类心脏组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 频域核方法 | 空间转录组数据 | 50个数据集，覆盖9个平台，包括艾伦大脑MERFISH图谱中的394万个细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 88 | 2026-04-02 |
COUP-TFII promotes macrophage-myofibroblast transition by attenuating HIF-1α-mediated glycolysis
2026-Mar-18, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153640
PMID:41916009
|
研究论文 | 本研究探讨了COUP-TFII在糖尿病肾病纤维化中通过抑制HIF-1α介导的糖酵解促进巨噬细胞-肌成纤维细胞转化的机制 | 揭示了COUP-TFII在糖尿病肾病纤维化中的新作用机制，即通过调控HIF-1α依赖的糖酵解途径促进巨噬细胞向肌成纤维细胞转化 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型，未涉及人类临床样本验证，且具体信号通路细节需进一步探索 | 探究COUP-TFII在糖尿病肾病纤维化进程中的调控机制 | 巨噬细胞、DB/DB糖尿病肾病小鼠模型 | NA | 糖尿病肾病 | Western blotting、单细胞测序、免疫荧光 | NA | 蛋白质表达数据、单细胞测序数据、GEO数据库数据 | 未明确样本数量，使用DB/DB糖尿病肾病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-04-02 |
Epigenetic context defines the transcriptional activity of canonical and noncanonical NF-κB signaling in pancreatic cancer
2026-Mar-17, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03019-9
PMID:41844578
|
研究论文 | 本研究通过转录组、基因组和表观基因组分析，探讨了胰腺导管腺癌中RELA和RELB的差异激活与功能，揭示了TNFα和TWEAK在调控NF-κB信号通路中的独特作用 | 揭示了TNFα通过RELA激活经典NF-κB信号，而TWEAK通过RELB选择性激活非经典信号，并发现RELB与AP1基序的强关联及其在可及染色质区域的专一结合 | 未明确说明样本数量或实验设计的潜在限制，如细胞系或动物模型的代表性 | 阐明胰腺导管腺癌中经典和非经典NF-κB信号通路的激活机制及其转录调控作用 | 胰腺导管腺癌细胞和组织 | 表观遗传学 | 胰腺癌 | 转录组基因表达谱分析、全基因组占据图谱、表观基因组分析、单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据、单细胞转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2026-04-02 |
Lysine attenuates acute lung injury by restoring α-tubulin acetylation and ciliary activity
2026-Mar-16, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03025-x
PMID:41839843
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析和靶向血浆代谢组学，揭示了赖氨酸在急性肺损伤中通过恢复α-微管蛋白乙酰化和纤毛活性来促进肺上皮修复的作用机制 | 首次将赖氨酸代谢与α-微管蛋白乙酰化、纤毛信号传导及钙稳态联系起来，阐明了赖氨酸作为代谢-结构协调器在肺再生中的新功能 | 研究主要基于动物模型和非人灵长类模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究氨基酸代谢在急性肺损伤修复中的作用，特别是赖氨酸对肺上皮再生的调控机制 | 人类急性肺损伤样本、小鼠和非人灵长类急性肺损伤模型、肺上皮细胞（特别是SFTPC+肺泡上皮II型细胞） | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、靶向血浆代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据、代谢组学数据 | 人类ALI样本、小鼠和非人灵长类模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2026-04-02 |
High-Fidelity Long-term Whole-embryo Lineage and Fate Reconstruction by Iterative Tracking with Error Correction
2026-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711203
PMID:41889864
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ITEC的无监督方法，用于高保真地自动重建胚胎中每个细胞的完整谱系和命运图 | 提出ITEC方法，通过迭代追踪与错误校正实现无监督的细胞谱系重建，在斑马鱼胚胎数据中达到超过99.7%的准确率 | NA | 重建活体胚胎的完整细胞谱系和命运图，以探索发育生物学中的关键形态发生过程 | 斑马鱼、小鼠等胚胎的细胞 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | 四个跨物种数据集，包括斑马鱼和小鼠胚胎，总计1850万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2026-04-02 |
UniST: A Unified Computational Framework for 3D Spatial Transcriptomics Reconstruction
2026-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711362
PMID:41889901
|
研究论文 | 本文提出了一个名为UniST的统一生成式人工智能框架，用于从稀疏的连续切片中计算重建密集且连续的三维空间转录组学景观 | 提出了一个统一的生成式AI框架，整合了核点卷积与交叉注意力层、基于光流的插值以及图自编码器与隐式神经表示三个互补模块，以解决稀疏、异质的三维ST数据重建问题，而无需改变底层实验技术 | 未明确提及该计算框架在处理极低质量或高度降解组织样本时的性能，也未讨论其计算资源需求或在不同物种间的普适性限制 | 开发一个通用的计算解决方案，以经济高效且可扩展的方式重建三维空间转录组学景观，从而更真实地研究组织结构和疾病生物学 | 小鼠胚胎数据集和三维人类癌症组织 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | 生成式AI框架（整合核点卷积、交叉注意力层、光流插值、图自编码器、隐式神经表示） | 三维空间转录组学数据（点云、连续切片） | 未明确指定具体样本数量，涉及小鼠胚胎数据集和两种三维人类癌症组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 93 | 2026-04-02 |
Predicting targeted- and immunotherapeutic response outcomes in melanoma with single-cell Raman spectroscopy and AI
2026-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.654612
PMID:41889902
|
研究论文 | 本文提出了一种结合单细胞拉曼光谱和机器学习的方法，用于快速分析黑色素瘤细胞并预测其对靶向和免疫疗法的反应 | 开发了一种非破坏性、单细胞水平的拉曼光谱结合机器学习方法，用于预测黑色素瘤的靶向和免疫治疗反应，该方法成本较低且能反映影响肿瘤行为的生化改变 | 研究样本量有限（9例患者来源样本），且方法在更广泛临床环境中的验证仍需进一步研究 | 预测黑色素瘤对靶向和免疫治疗的反应，以改善精准医疗中的治疗选择评估 | 小鼠和人类黑色素瘤细胞系，以及9例已知对靶向和免疫治疗抑制剂（如bemcentinib、cabozantinib、dabrafenib、nivolumab等）具有耐药性特征的黑色素瘤患者来源样本 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞拉曼光谱 | 随机森林 | 光谱数据 | 小鼠和人类黑色素瘤细胞系，以及9例患者来源样本 | NA | 单细胞拉曼光谱 | NA | NA |
| 94 | 2026-04-02 |
MAPK14/SLC7A11/GPX4 axis dysregulation drives podocyte ferroptosis via mediating glycerophospholipid metabolism
2026-Mar-11, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-02990-7
PMID:41813669
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学方法，揭示了糖尿病肾病中足细胞铁死亡的关键驱动机制，并验证了黄芪甲苷IV的保护作用 | 首次通过单细胞RNA测序识别足细胞为糖尿病肾病的核心细胞枢纽，发现MAPK14/SLC7A11/GPX4轴失调通过介导甘油磷脂代谢驱动足细胞铁死亡，并确定了尿液代谢物作为非侵入性生物标志物 | 未明确说明样本量大小及具体实验模型细节，临床转化潜力需进一步验证 | 阐明糖尿病肾病的细胞类型特异性发病机制，发现新的治疗靶点和诊断生物标志物 | 人类糖尿病肾脏组织、足细胞 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学, 转录组学, 代谢组学 | NA | RNA测序数据, 代谢组数据, 空间代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间代谢组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 95 | 2026-04-02 |
In Vivo CRISPR Screening Identifies the Glutamate Receptor GRIA2 as Promoting Peritoneal Metastasis of Gastric Cancer via Calcium-Dependent β-Catenin Activation
2026-Mar-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521746
PMID:41806318
|
研究论文 | 本研究通过体内CRISPR筛选发现谷氨酸受体GRIA2通过钙依赖性β-连环蛋白激活促进胃癌腹膜转移 | 首次通过体内全基因组CRISPR/Cas9筛选鉴定出GRIA2作为胃癌腹膜转移的关键驱动因子，并揭示了癌症相关成纤维细胞通过谷氨酸旁分泌轴促进转移的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本分析，尚未在人体中进行直接干预验证 | 探索胃癌腹膜转移的新治疗靶点 | 胃癌细胞、腹膜转移灶、癌症相关成纤维细胞 | 癌症生物学 | 胃癌 | CRISPR/Cas9筛选、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床病理数据 | 细胞系来源和患者来源的类器官异种移植小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2026-04-02 |
Spatially defined danger zone shapes gastric cancer progression through CCDC80+ fibroblast-induced CD8+ T cell dysfunction
2026-Mar-07, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02287-1
PMID:41793512
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学识别了胃癌中的“危险区”，揭示了其通过CCDC80+成纤维细胞诱导CD8+ T细胞功能障碍来驱动癌症进展的机制 | 首次定义了胃癌中的空间“危险区”，并发现CCDC80+成纤维细胞通过CXCL12-CXCR4信号招募并诱导CD8+ T细胞功能障碍，为预后预测和免疫治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本的观察，机制验证虽包括共培养实验，但临床转化和体内功能验证仍需进一步探索 | 探究胃癌肿瘤微环境的空间异质性及其对癌症进展和免疫抑制的影响 | 小鼠侵袭性肿瘤和人类胃癌样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学，单细胞分析，非负矩阵分解，XGBoost分类器，LightGBM模型 | XGBoost, LightGBM | 空间转录组数据，单细胞数据，H&E切片图像 | 未明确指定样本数量，但涉及小鼠肿瘤和人类胃癌队列 | NA | 空间转录组学，单细胞分析 | NA | NA |
| 97 | 2026-04-02 |
CRISPR-based functional genomics for dissecting therapeutic dependency in primary acute myeloid leukemia samples
2026-Mar-05, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2026.02.003
PMID:41759529
|
研究论文 | 本研究开发了一种优化的基于CRISPR的功能基因组学平台，用于直接研究原发性急性髓系白血病样本中的癌症依赖性和细胞异质性 | 将CRISPR功能基因组学平台直接应用于异质性原发性肿瘤（特别是患者来源的异种移植和原发性AML样本），而非仅限于小鼠模型或已建立的癌细胞系，并结合Perturb-seq在单细胞水平解析扰动效应 | 研究主要聚焦于急性髓系白血病，平台在其他癌症类型中的普适性有待进一步验证 | 开发并应用CRISPR功能基因组学平台，以直接剖析原发性癌症样本中的治疗依赖性和耐药机制 | 患者来源的异种移植模型和原发性急性髓系白血病样本 | 功能基因组学 | 急性髓系白血病 | CRISPR-Cas9基因敲除、CRISPR干扰、单细胞RNA测序 | NA | 基因组测序数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2026-04-02 |
COL8A1-positive cancer-associated fibroblasts are drivers of 5-fluorouracil resistance in colorectal cancer
2026-Mar-05, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02306-1
PMID:41784732
|
研究论文 | 本研究揭示了COL8A1阳性癌症相关成纤维细胞通过COL8A1/ITGB1介导的上皮-间质转化轴驱动结直肠癌对5-氟尿嘧啶耐药的新机制 | 首次鉴定出COL8A1阳性成纤维细胞亚群作为5-FU耐药的关键驱动因素，并阐明了其通过COL8A1/ITGB1信号轴诱导EMT的具体分子机制 | 研究样本量相对有限（24个队列），体内验证主要在异种移植模型中进行，缺乏更接近人体微环境的模型验证 | 探究结直肠癌中5-氟尿嘧啶获得性耐药的基质细胞驱动机制 | 结直肠癌组织、癌症相关成纤维细胞、肿瘤细胞系、小鼠异种移植模型 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、多组学分析、CRISPR/Cas9基因编辑、siRNA干扰、免疫化学分析 | 细胞通讯模型 | 单细胞转录组数据、多组学数据、体外实验数据、体内实验数据 | 24个结直肠癌队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2026-04-02 |
Transcriptional factor ZMYM3 promotes hepatocellular carcinoma metastasis by upregulating CTTN and inducing invadopodia formation
2026-Mar-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08506-6
PMID:41775697
|
研究论文 | 本研究探讨了转录因子ZMYM3通过上调CTTN表达并诱导侵袭伪足形成来促进肝细胞癌转移的分子机制 | 首次揭示了ZMYM3在肝细胞癌转移中的关键作用，并阐明其通过直接调控CTTN基因表达促进侵袭伪足形成的具体机制 | 研究主要基于体外实验和数据库分析，缺乏体内动物模型的深入验证 | 探究肝细胞癌侵袭和转移的分子机制，寻找潜在治疗靶点 | 肝细胞癌细胞系、TCGA和GEO数据库中的肝细胞癌组织样本 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | RNA测序、染色质免疫沉淀测序、免疫组织化学、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、组织图像数据、单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的肝细胞癌组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 100 | 2026-04-02 |
Atlas-guided discovery of transcription factors for T cell programming
2026-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09989-7
PMID:41639465
|
研究论文 | 本研究通过构建一个整合转录组和表观遗传数据的综合图谱，系统性地定义了驱动CD8 T细胞不同状态的转录因子，并利用CRISPR筛选和单细胞RNA测序技术，揭示了调控T细胞分化的关键因子，为细胞免疫疗法提供了新靶点 | 构建了首个整合九种CD8 T细胞状态的转录和表观遗传数据的综合图谱，并利用in vivo Perturb-seq技术（CRISPR筛选与单细胞RNA测序结合）系统性地鉴定了调控T细胞分化的转录因子，包括新发现的ZSCAN20和JDP2等TEX选择性因子 | 研究主要基于小鼠模型，人类T细胞验证数据有限；平台虽全面，但可能未覆盖所有T细胞状态或环境因素 | 系统性发现和验证调控CD8 T细胞不同分化状态的转录因子，以优化细胞免疫疗法设计 | CD8 T细胞，特别是终末耗竭T细胞（TEX）和组织驻留记忆T细胞（TRM） | 免疫学与计算生物学 | 癌症与慢性病毒感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、表观遗传分析、CRISPR筛选、in vivo Perturb-seq | NA | 转录组数据、表观遗传数据、单细胞RNA测序数据 | 涉及九种CD8 T细胞状态，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |