单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
81	2025-07-29	Exploration of potential therapeutic target genes for preeclampsia through genetic analysis 2025-Jul-25, Journal of human hypertension IF:2.7Q2 DOI:10.1038/s41371-025-01054-0 PMID:40715499	研究论文	通过遗传分析探索先兆子痫的潜在治疗靶基因	利用cis-eQTL和孟德尔随机化分析识别与先兆子痫显著相关的17个可药物基因，并通过功能富集分析、SMR和共定位分析验证了其中5个基因的因果关系	研究主要基于血液样本的eQTL数据，可能未完全反映胎盘或其他相关组织中的基因表达情况	从基因组角度识别可能降低先兆子痫风险的潜在遗传靶点	先兆子痫患者及健康对照	遗传学	先兆子痫	cis-eQTL分析、孟德尔随机化(MR)、功能富集分析、SMR、共定位分析、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	eQTLGen联盟提供的血液样本数据
82	2025-07-29	Spatial transcriptomics reveals macrophage domestication by epithelial cells promotes immunotherapy resistance in small cell lung cancer 2025-Jul-24, NPJ precision oncology IF:6.8Q1 DOI:10.1038/s41698-025-01005-5 PMID:40702109	研究论文	通过空间单细胞转录组学揭示上皮细胞驯化巨噬细胞促进小细胞肺癌免疫治疗耐药性的机制	发现Epi-I和Epi-II两种上皮细胞亚型及其在免疫化疗耐药性中的作用，揭示了MIF-SPP1-PI3K-AKT信号轴在细胞转化中的关键作用	样本量较小（18例患者），需要在更大规模队列中验证发现	阐明小细胞肺癌肿瘤微环境中免疫化疗耐药性的机制	广泛期小细胞肺癌患者肿瘤组织	数字病理学	肺癌	空间单细胞转录组学	NA	转录组数据	18例广泛期小细胞肺癌患者样本
83	2025-07-29	Interpretable machine learning-guided single-cell mapping deciphers multi-lineage pancreatic dysregulation in type 2 diabetes 2025-Jul-24, Cardiovascular diabetology IF:8.5Q1 DOI:10.1186/s12933-025-02865-8 PMID:40707916	研究论文	该研究通过整合单细胞RNA测序和机器学习框架，解码了胰腺细胞异质性，并揭示了2型糖尿病中的多谱系胰腺失调	开发了PanSubPred和PSC-Stat两种新型工具，用于多谱系注释和星状细胞激活分析，并识别了64种细胞类型特异性标记物（其中38种为新型标记物）	研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能未涵盖所有胰腺细胞类型的复杂性	解码胰腺细胞异质性并揭示2型糖尿病中的病理变化	胰腺细胞	数字病理学	2型糖尿病	单细胞RNA测序	XGBoost	RNA测序数据	NA
84	2025-07-29	CXCR4+ Monocytes Promote Neovascularization in Wet Age-Related Macular Degeneration 2025-Jul-24, Experimental eye research IF:3.0Q1 DOI:10.1016/j.exer.2025.110550 PMID:40713972	研究论文	本研究通过整合RNA测序、单细胞转录组学、多重免疫组化和体内模型，揭示了CXCR4+单核细胞在湿性年龄相关性黄斑变性（wAMD）中促进新生血管形成的关键作用	首次发现MMP2+内皮细胞（ECs）具有双重血管生成和干细胞样特性，并确定CXCR4+单核细胞通过CXCL12-CXCR4信号轴与MMP2+ ECs相互作用，调控病理性血管生成	研究主要基于实验模型，临床样本验证不足	阐明wAMD中血管生成的分子机制并寻找潜在治疗靶点	湿性年龄相关性黄斑变性（wAMD）相关的血管生成过程	分子病理学	年龄相关性黄斑变性	bulk RNA测序, 单细胞转录组学, 多重免疫组化（mIHC）	NA	转录组数据, 免疫组化数据	NA
85	2025-07-29	Neoadjuvant immune checkpoint inhibition improves protection against hepatic melanoma metastasis 2025-Jul-24, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217950 PMID:40714065	research paper	本研究探讨了新辅助免疫检查点抑制（ICI）在预防肝黑色素瘤转移中的作用	发现新辅助ICI比辅助治疗更能有效预防肝转移，并与T细胞扩增和TH1免疫反应增强相关	研究仅基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	评估新辅助ICI在预防肝黑色素瘤转移中的效果	小鼠模型中的肝黑色素瘤转移	肿瘤免疫学	黑色素瘤	scRNA-Seq, 流式细胞术, 免疫荧光, 原位杂交, 多重细胞因子检测	小鼠模型	基因表达数据, 细胞组成数据, 细胞因子数据	使用WT31或B16F10 luc2黑色素瘤细胞的小鼠模型
86	2025-07-29	Radiotherapy in combination with PD-1 and TIGIT blockade mediate antitumor abscopal effects and immune memory via CD8+ T cells 2025-Jul-24, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217935 PMID:40714064	研究论文	本研究探讨了放疗联合抗PD-1和抗TIGIT抗体（aPD-1/aTIGIT）的协同抗肿瘤效果，重点关注原发性和远隔肿瘤控制、免疫机制及长期免疫记忆	揭示了CD8 T细胞作为远隔效应和长期免疫的核心介质，强调了M1巨噬细胞极化在增强治疗协同作用中的关键作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行临床试验验证	探索放疗联合免疫治疗增强抗肿瘤效果的机制	小鼠模型中的LLC、CMT-167、B16-F10、MC38肿瘤	肿瘤免疫治疗	癌症	流式细胞术、多色免疫荧光、单细胞转录组学、Luminex细胞因子分析	小鼠肿瘤模型	细胞和分子数据	多种小鼠肿瘤模型（LLC、CMT-167、B16-F10、MC38）
87	2025-07-29	A STAT1-GBP3-STING positive feedback loop governs inflammation, oxidative stress, and DNA damage to trigger acute aortic dissection 2025-Jul-24, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112015 PMID:40714274	研究论文	本研究揭示了STAT1-GBP3-STING正反馈环在急性主动脉夹层（AAD）中调控炎症、氧化应激和DNA损伤的机制	首次发现STAT1-GBP3-STING正反馈环在AAD发病机制中的核心作用，并验证STAT1抑制剂Fludarabine的治疗潜力	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	阐明急性主动脉夹层的分子机制并探索潜在治疗靶点	小鼠AAD模型、人升主动脉样本、血管平滑肌细胞（VSMCs）	分子病理学	心血管疾病	ATAC-seq, RNA-seq, 单细胞RNA测序, ChIP-PCR, CoIP分析	小鼠AAD模型	基因组数据、转录组数据	未明确说明具体样本数量（包含小鼠模型和人类组织样本）
88	2025-07-29	Natural small molecule bergapten ameliorates rheumatoid arthritis by targeting STAT3 2025-Jul-24, Pharmacological research IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.phrs.2025.107878 PMID:40714303	研究论文	本文报道了一种天然小分子佛手柑素（BG）作为治疗类风湿性关节炎（RA）的潜在药物	发现BG通过靶向STAT3抑制炎症，为RA治疗提供了新的候选药物	研究仅基于胶原诱导的关节炎（CIA）大鼠模型，尚未进行人体试验	探索BG作为RA治疗药物的潜力及其作用机制	胶原诱导的关节炎（CIA）大鼠及其滑膜组织	NA	类风湿性关节炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	胶原诱导的关节炎（CIA）大鼠
89	2025-07-29	Melanocytes and photosensory organs share a common ancestry that illuminates the origins of the neural crest 2025-Jul-23, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-025-08502-0 PMID:40696183	research paper	该研究探讨了脊椎动物中两种主要色素细胞类型（视网膜色素上皮细胞和神经嵴来源的黑色素细胞）的进化关系，支持它们源自共同的祖先色素感光结构	通过单细胞转录组学、染色质可及性和空间转录组学数据，揭示了黑色素细胞和视网膜色素上皮细胞在色素生产、光感受、代谢和生物合成等方面的共同调控基因表达模块	研究主要基于转录组数据，缺乏直接的实验验证	探索脊椎动物中色素细胞的进化起源和关系	黑色素细胞、视网膜色素上皮细胞、被囊动物Ciona的感光囊色素细胞	evolutionary biology	NA	单细胞转录组学、染色质可及性分析、空间转录组学、系统转录组学	NA	转录组数据	未明确说明样本数量
90	2025-07-29	RBM17 promotes hepatocellular carcinoma progression by regulating lipid metabolism and immune microenvironment: implications for therapeutic targeting 2025-Jul-23, Cell death discovery IF:6.1Q1 DOI:10.1038/s41420-025-02642-2 PMID:40702000	研究论文	本研究探讨了可变剪接因子RBM17在肝细胞癌（HCC）进展中的作用，特别是其对脂质代谢和免疫微环境的调控机制	首次揭示了RBM17通过调控CSAD和HACD3前体mRNA的外显子剪接，促进M2巨噬细胞浸润和脂肪酸代谢，进而影响HCC进展的新机制	研究主要基于实验室数据，尚未进行临床验证	阐明RBM17在HCC进展中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力	肝细胞癌（HCC）组织和细胞	肿瘤生物学	肝细胞癌	无标记蛋白质组学、单细胞测序（scRNA-seq）、高通量测序、流式细胞术（FCM）、液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）、多参数免疫荧光（mIF）和染色质免疫沉淀（ChIP）	NA	蛋白质组数据、转录组数据、单细胞数据	NA
91	2025-07-29	Single-cell perspective on the Monocyte-to-HDL cholesterol ratio as a metastasis biomarker in papillary thyroid cancer 2025-Jul-23, BMC cancer IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12885-025-14373-9 PMID:40702447	research paper	该研究通过单细胞视角探讨了单核细胞与高密度脂蛋白胆固醇比值（MHR）作为甲状腺乳头状癌（PTC）转移生物标志物的潜在作用	首次从单细胞角度揭示了MHR在PTC中的潜在作用，并证实了单核/巨噬细胞和胆固醇稳态对PTC淋巴结转移的显著促进作用	研究结果需要进一步的大样本临床验证，以确认MHR作为术前淋巴结转移预测标志物的可靠性	探讨MHR作为炎症标志物在PTC淋巴结转移中的作用及其机制	甲状腺乳头状癌（PTC）患者及其淋巴结转移（LNM）情况	digital pathology	thyroid cancer	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化、共培养实验、Transwell实验	NA	临床数据、单细胞RNA测序数据	整合了GSE191288和GSE193581数据集的单细胞RNA测序数据
92	2025-07-29	Single-Cell Transcriptional Analysis of Murine Mesenteric Lymph Nodes Following Oral Lyso-phosphatidylserine Nanoparticle Administration Reveals Cellular Heterogeneity in Tolerance Features 2025-Jul-23, Journal of pharmaceutical sciences IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.xphs.2025.103919 PMID:40712826	研究论文	该研究通过单细胞转录组分析揭示了口服含LysoPS纳米颗粒后小鼠肠系膜淋巴结中免疫细胞的异质性及耐受特征	利用含LysoPS的耐受性纳米颗粒平台预防和减轻不良免疫反应，并通过单细胞RNA测序揭示了其耐受机制	LysoPS介导的口服耐受涉及的生物过程和细胞通讯仍不完全清楚	研究含LysoPS纳米颗粒在预防不良免疫反应中的作用及其机制	小鼠肠系膜淋巴结中的免疫细胞（B细胞、T细胞和NK细胞）	免疫学	自身免疫性疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	小鼠模型
93	2025-07-29	Technological innovations promote cancer stem cell-based translational research 2025-Jul-23, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217949 PMID:40712971	综述	本文全面概述了癌症干细胞（CSCs）在肿瘤治疗抵抗和复发中的作用，并探讨了技术进步如何促进基于CSCs的治疗策略的发展	整合了单细胞测序、功能基因组学、器官芯片平台和人工智能（AI）等最新技术，深入理解CSCs的分子调控机制，并推动靶向干预的发展	未提及具体实验数据或临床研究结果，主要依赖文献综述和技术展望	探讨癌症干细胞（CSCs）在肿瘤治疗抵抗和复发中的作用，并分析技术进步如何促进基于CSCs的治疗策略	癌症干细胞（CSCs）及其微环境	肿瘤生物学	癌症	单细胞测序、功能基因组学、器官芯片平台、AI	NA	NA	NA
94	2025-07-29	TNF drives aberrant BMP signaling to induce endothelial and mesenchymal dysregulation in pulmonary hypertension 2025-Jul-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.174456 PMID:40569693	研究论文	研究探讨了肿瘤坏死因子α（TNF）如何通过异常BMP信号传导导致肺动脉高压（PH）中内皮细胞和间充质细胞的失调	揭示了TNF通过内皮NF-κB激活和随后的内皮SMAD2/3信号传导导致BMP信号传导异常的新机制	研究主要基于TNF-Tg小鼠模型，可能无法完全反映人类PH的复杂性	阐明肺动脉高压发病机制中内皮细胞和间充质细胞间的分子互作	野生型和TNF-Tg小鼠的肺内皮细胞和间充质细胞	病理生物学	肺动脉高压	单细胞RNA测序、免疫荧光染色、配体-受体相互作用分析、转录因子结合分析、RNA速度评估	TNF-Tg小鼠模型	单细胞RNA测序数据	野生型和TNF-Tg小鼠的肺内皮细胞和间充质细胞
95	2025-07-29	Prkcq in ILC2 cells-enhanced the amounts of tissue-resident macrophages promotes pancreatic fibrosis in chronic pancreatitis 2025-Jul-22, Archives of biochemistry and biophysics IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.abb.2025.110559 PMID:40706949	研究论文	本研究通过单细胞测序技术揭示了Prkcq在ILC2细胞中的作用及其通过调节组织驻留巨噬细胞（TRMs）促进慢性胰腺炎（CP）纤维化的机制	首次发现Prkcq在ILC2细胞中通过调节IL-4的表达影响TRMs的数量，进而调控慢性胰腺炎的纤维化过程	研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证	探索慢性胰腺炎纤维化的分子机制及潜在治疗靶点	小鼠模型中的ILC2细胞和组织驻留巨噬细胞（TRMs）	分子生物学	慢性胰腺炎	单细胞测序、H&E染色、Masson染色、Sirius Red染色	小鼠模型	基因表达数据、病理学图像	未明确提及具体样本数量
96	2025-07-29	Single-cell transcriptomics identifies chondrocyte differentiation dynamics in vivo and in vitro 2025-Jul-22, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.031 PMID:40712580	研究论文	该研究通过单细胞转录组学技术，比较了体内和体外软骨细胞分化的动态过程，并提出了改进体外软骨形成的方法	结合胚胎长骨的单细胞RNA测序数据和公共数据，构建了软骨内骨化的图谱，并利用这一图谱评估了已发表的体外软骨形成方案	研究中未提及样本的具体数量，且缺乏与人类胚胎组织的详细比较	改进体外软骨形成的方法，以促进肌肉骨骼疾病建模和再生医学的发展	胚胎长骨和人类胚胎干细胞	生物医学工程	肌肉骨骼疾病	scRNA-seq, snRNA-seq	NA	单细胞RNA测序数据	NA
97	2025-07-29	Marsupial single-cell transcriptomics identifies temporal diversity in mammalian developmental programs 2025-Jul-22, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.037 PMID:40712578	research paper	通过单细胞转录组学分析有袋类动物（袋鼠）的发育程序，揭示哺乳动物发育时序的多样性	首次构建了有袋类动物（袋鼠）原肠胚形成和早期器官发生的单细胞转录组图谱，揭示了前部结构转录程序的加速发育	研究仅聚焦于一种有袋类动物（Monodelphis domestica），可能无法完全代表所有有袋类动物的发育特征	探究哺乳动物发育程序的时序多样性，特别是有袋类动物的异时发育现象	有袋类动物（袋鼠 Monodelphis domestica）的原肠胚形成和早期器官发生过程	发育生物学	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
98	2025-07-29	N-glycosylation stabilized TNFAIP6 promotes ovarian cancer metastasis by activating the PI3K-AKT signaling pathway 2025-Jul-21, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112013 PMID:40701312	研究论文	本研究揭示了N-糖基化稳定的TNFAIP6通过激活PI3K-AKT信号通路促进卵巢癌转移的机制	首次发现TNFAIP6通过N-糖基化稳定化促进卵巢癌转移，并阐明其通过PI3K/AKT通路调控EMT的分子机制	研究主要基于细胞和动物模型，临床转化应用仍需进一步验证	阐明卵巢癌转移的分子机制并寻找潜在治疗靶点	卵巢癌细胞系和动物模型	癌症生物学	卵巢癌	RNA-seq, scRNA-seq, Western blot, 免疫荧光, 免疫共沉淀	shRNA敲低/过表达模型	基因组数据、蛋白质数据	TCGA和GEO数据库中的批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据
99	2025-07-29	An amphiregulin reporter mouse enables transcriptional and clonal expansion analysis of reparative lung Tregs 2025-Jul-08, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.187245 PMID:40626358	研究论文	本研究通过创建一种能够检测活细胞中Areg表达的报告小鼠（AregThy1.1），研究了Areg产生的调节性T细胞（Tregs）在组织修复中的作用	首次创建了能够检测活细胞中Areg表达的报告小鼠，并利用单细胞RNA测序和TCR测序技术揭示了Areg产生Tregs的转录组特征和克隆扩增偏好	研究主要基于小鼠模型，结果是否适用于人类尚需进一步验证	探究Areg产生的Tregs在组织修复中的作用机制	AregThy1.1报告小鼠中的调节性T细胞（Tregs）	免疫学	肺损伤	单细胞RNA测序（scRNA-Seq），单细胞TCR测序	AregThy1.1报告小鼠	RNA测序数据	使用流感A和博来霉素诱导的肺损伤小鼠模型
100	2025-07-29	Allergen induces pulmonary neuroendocrine cell hyperplasia in a model of asthma 2025-Jul-08, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.187018 PMID:40626365	research paper	该研究探讨了过敏原如何通过调控肺神经内分泌细胞（PNECs）来加剧哮喘反应	揭示了过敏原（如屋尘螨）通过Notch信号通路调控PNECs增生，进而加剧哮喘反应的机制	研究仅基于小鼠模型，尚未在人类哮喘患者中验证	探究PNECs在过敏原诱导的哮喘反应中的调控机制	小鼠肺神经内分泌细胞（PNECs）	呼吸系统疾病研究	哮喘	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	小鼠哮喘模型	基因表达数据	未明确说明样本数量，但涉及野生型和基因敲除小鼠