单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 35396 篇文献,本页显示第 81 - 100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-01-20
Androgen Signaling in ILC2s Drives Sex Differences in Helicobacter-induced Gastric Inflammation and Atrophy
2025-Nov-29, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示了雄激素通过调节ILC2活性,在幽门螺杆菌诱导的胃部炎症中发挥保护作用,并解释了胃癌发病率的性别差异 首次发现雄激素信号通过调控ILC2s活性来影响幽门螺杆菌诱导的胃部炎症和萎缩,揭示了ILC2s作为幽门螺杆菌驱动胃部炎症的主要调节因子及其在性别差异中的作用 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证;雄激素信号的具体分子机制尚未完全阐明 探究雄激素如何影响幽门螺杆菌感染后的胃部炎症反应,并解释胃癌前病变进展中的性别差异 雄性及雌性小鼠(幽门螺杆菌感染模型)、ILC2s(2型先天淋巴样细胞) 单细胞组学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 雄性及雌性小鼠(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
82 2026-01-20
Single-cell transcriptomic analysis reveals the heterogeneity and functional characteristics of macrophage subpopulations in colon cancer
2025-Nov-23, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了结肠癌中巨噬细胞亚群的异质性及其功能特征,特别是Macrophages_SPP1亚型在肿瘤进展中的作用 首次在结肠癌中系统鉴定出五个巨噬细胞亚型,并深入解析了Macrophages_SPP1亚型通过代谢重编程和基质相互作用促进肿瘤进展的机制 样本量较小(仅3例患者),且为观察性研究,需要更大规模队列和功能实验验证 探究结肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞亚群的异质性及其功能特征,特别是SPP1在巨噬细胞-肿瘤相互作用中的作用 结肠癌患者的肿瘤组织和癌旁正常组织 数字病理学 结肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 伪时间轨迹分析、转录因子网络分析、细胞-细胞通讯分析、计算机模拟SPP1敲除模型 单细胞转录组数据 3例结肠癌患者的肿瘤和癌旁组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
83 2026-01-20
CHD7 regulates cardiac neural crest cell differentiation through SOX5-mediated self-activation
2025-Nov-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了CHD7通过SOX5介导的自激活机制调控心脏神经嵴细胞分化,为CHARGE综合征相关心脏缺陷提供了新见解 首次发现CHD7通过SOX5介导的自激活机制调控其自身表达,并证明SOX5过表达可恢复CHD7单倍体不足细胞中的基因表达和心肌细胞分化能力 研究主要基于体外细胞培养模型,体内验证和临床转化潜力仍需进一步探索 探究CHD7在心脏神经嵴细胞分化中的作用机制及其与CHARGE综合征心脏缺陷的关联 心脏神经嵴细胞 发育生物学 先天性心脏病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
84 2026-01-20
HNRNPA2B1 confers immune escape of non-small cell lung cancer through targeting lactate/ferroptosis
2025-Nov-21, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究探讨了m6A阅读蛋白HNRNPA2B1通过调控LDHA mRNA稳定性和乳酸积累,促进非小细胞肺癌免疫逃逸和铁死亡抵抗的机制 首次揭示了HNRNPA2B1作为m6A阅读器,通过靶向LDHA mRNA的m6A修饰位点增强其稳定性,进而通过乳酸积累和干扰素-γ分泌抑制,介导非小细胞肺癌的免疫逃逸和铁死亡抵抗 研究主要在体外共培养体系中进行,体内模型验证相对有限;机制研究聚焦于LDHA通路,可能存在其他下游靶点 探究HNRNPA2B1在非小细胞肺癌免疫逃逸和铁死亡抵抗中的作用及分子机制 非小细胞肺癌细胞、活化的CD8 T细胞 肿瘤生物学 肺癌 单细胞转录组测序、体外共培养实验 NA 基因表达数据、单细胞测序数据 非小细胞肺癌临床样本及单细胞测序数据(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
85 2026-01-20
LMNA-PRKDC axis enhances DNA repair and promotes chemoresistance in glioblastoma
2025-Nov-21, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了胶质母细胞瘤中LMNA-PRKDC轴通过增强DNA修复能力驱动替莫唑胺耐药的新机制 首次发现LMNA-PRKDC相互作用促进非同源末端连接修复,并证明PRKDC抑制剂可逆转耐药 研究主要基于患者来源异种移植模型和单细胞测序数据,临床转化仍需进一步验证 探究胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的分子机制 胶质母细胞瘤患者样本、患者来源异种移植模型 分子肿瘤学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、免疫共沉淀 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 原发性与复发性胶质母细胞瘤标本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
86 2026-01-20
The Spatial Atlas of Human Anatomy (SAHA): A Multimodal Subcellular-Resolution Reference Across Human Organs
2025-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了空间人体解剖学图谱(SAHA),这是一个跨多器官系统的健康成人组织的多模态亚细胞分辨率参考图谱 首次创建了跨多器官系统的多模态亚细胞分辨率健康成人组织参考图谱,整合了空间转录组学、蛋白质组学和组织学特征 NA 构建一个全面的健康人体组织图谱,以支持空间诊断和下一代精准医学的发展 健康成人组织,包括胃肠道和免疫组织,以及结直肠癌和炎症性肠病的比较分析 数字病理学 结直肠癌, 炎症性肠病 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单核RNA-seq NA 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 组织学图像 超过100名捐赠者的超过1500万个细胞 10x Genomics, NanoString 空间转录组学, 单细胞RNA-seq CosMx SMI, 10x Xenium, RNAscope, GeoMx DSP CosMx SMI, 10x Xenium, RNAscope, GeoMx DSP, 单核RNA-seq
87 2026-01-20
A New Model of Gastric Pre-neoplasia Induced by Aberrant ADAR1-mediated Double-stranded RNA Signaling
2025-Nov-04, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过在小鼠胃壁细胞中特异性删除ADAR1基因,建立了一种新的胃前瘤变模型,揭示了内源性双链RNA信号在胃上皮损伤和癌前病变中的作用 首次建立了由ADAR1介导的双链RNA信号失调驱动的胃前瘤变遗传模型,并发现线粒体双链RNA在胃上皮中的富集是病变的关键因素 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证;模型依赖于特定的基因删除,可能无法完全反映自然发生的胃前瘤变过程 明确双链RNA反应失调在胃上皮中对胃前瘤变的影响 ADAR1基因特异性删除的小鼠胃壁细胞及其引发的胃前瘤变 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序、流式细胞术、双链RNA免疫沉淀、免疫电子显微镜 遗传小鼠模型(Adar1ΔPC) 组织学、转录组、免疫学数据 Adar1ΔPC小鼠及年龄匹配的对照组小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
88 2026-01-20
Integrated single-cell transcriptomics and spatial metabolomics unveil cellular differentiation and ginsenosides biosynthesis in Panax root tips
2025-Nov, Horticulture research IF:7.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序和空间代谢组学分析,揭示了人参属植物根尖的细胞分化轨迹和人参皂苷生物合成的细胞异质性 首次在人参属植物根尖中整合单细胞转录组和空间代谢组学,识别了新的转录因子并验证了其在内皮层木栓化和人参皂苷生物合成中的调控作用 研究仅聚焦于三种人参属物种,可能无法完全代表该属的多样性,且功能验证实验范围有限 探究人参属植物根尖早期发育过程中的细胞命运转变及人参皂苷生物合成的细胞异质性 三种人参属植物(Panax ginseng、Panax quinquefolius和Panax notoginseng)的根尖组织 植物生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间代谢组学、LC-MS/MS、RNA原位杂交、双荧光素酶报告基因检测(dual-LUC)、电泳迁移率变动分析(EMSA) NA 转录组数据、代谢组数据、图像数据 三种人参属物种的根尖样本 NA 单细胞RNA-seq、空间代谢组学 NA NA
89 2026-01-20
RetiGene, a comprehensive gene atlas for inherited retinal diseases
2025-Oct-02, American journal of human genetics IF:8.1Q1
研究论文 本文介绍了RetiGene,一个专为遗传性视网膜疾病设计的专家策划基因图谱,整合了变异数据、批量与单细胞RNA测序以及功能注释 开发了首个综合性的专家策划基因图谱,整合多源数据以支持遗传性视网膜疾病的基因发现、功能研究和治疗开发 未提及样本量或具体技术限制,可能依赖于现有数据源的完整性和准确性 解决遗传性视网膜疾病中基因目录不完整和变异解释困难的问题,促进分子诊断和遗传研究 遗传性视网膜疾病相关基因 数字病理学 遗传性视网膜疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 基因变异数据、RNA测序数据、功能注释 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
90 2026-01-20
Recent Advances in Deciphering Normal and Diseased Aortic Valve Biology Using Transcriptomic Technologies
2025-Sep, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
综述 本文综述了转录组学技术(尤其是RNA-seq和单细胞测序)在揭示正常和病变主动脉瓣生物学机制方面的最新进展,并强调了其在识别治疗靶点方面的潜力 整合了最新的转录组学发现,特别关注瓣膜细胞可塑性、异质性和细胞间相互作用(尤其是瓣膜内皮细胞与单核细胞在生理和病理条件下的互作),并强调了表征健康主动脉瓣基线分子过程对解读疾病相关改变的重要性 NA 总结主动脉瓣结构和功能的最新认识,识别关键分子靶点,并为其在湿实验中的验证提供优先顺序,最终为开发有效的钙化性主动脉瓣疾病(CAVD)疗法提供信息 主动脉瓣(AV),包括正常和病变状态,特别关注瓣膜内皮细胞(VECs)和单核细胞 数字病理学 心血管疾病 RNA测序(RNAseq),单细胞测序(scRNAseq) NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
91 2026-01-20
Regional Transcriptomic Architecture of Glioblastoma Reveals NUCB2 as a Key Orchestrator of Tumour Aggression and Immune Dysfunction
2025-Sep, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序分析,揭示了胶质母细胞瘤中NUCB2作为肿瘤侵袭和免疫功能障碍的关键调控因子 首次将NUCB2鉴定为胶质母细胞瘤中协调肿瘤细胞增殖和免疫调节功能的多功能调控因子,并揭示了其在肿瘤中心区域神经祖细胞样肿瘤细胞中的特异性上调 研究基于公共数据集,缺乏实验验证NUCB2在体内模型中的具体作用机制 阐明胶质母细胞瘤空间分子程序驱动肿瘤进展的机制 胶质母细胞瘤中心和外周区域的细胞群体 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 两个公共数据集中的胶质母细胞瘤样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
92 2026-01-20
Numbat-multiome: inferring copy number variations by combining RNA and chromatin accessibility information from single-cell data
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为Numbat-multiome的新算法,该算法通过结合单细胞RNA测序和染色质可及性数据来推断拷贝数变异 Numbat-multiome扩展了原始Numbat算法的功能,使其能够从scRNA-seq和scATAC-seq数据中单独或整合地进行CNV推断,通过基于共同基因组坐标系统的分箱策略统一不同模态的数据 NA 开发一种能够从单细胞多组学数据中准确推断拷贝数变异的算法,以更好地理解癌症中的遗传和表观遗传变化 癌症样本,包括早期多发性骨髓瘤和由慢性淋巴细胞白血病引发的Richter综合征 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA 单细胞RNA-seq数据, 单细胞ATAC-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
93 2026-01-20
Interpretable and integrative analysis of single-cell multiomics with scMKL
2025-Aug-06, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 介绍一种基于多核学习(scMKL)的创新方法,用于单细胞多组学数据的可解释和整合分析 结合复杂模型的预测能力和线性方法的可解释性,在单细胞多组学数据整合中实现高精度且可解释的结果,识别关键转录组和表观遗传特征及多模态通路 NA 提供一种可解释且整合的单细胞多组学分析方法,以增强对癌症生物学和肿瘤进展的理解 健康与癌性细胞群体,包括乳腺癌、淋巴癌、前列腺癌和肺癌 机器学习 乳腺癌, 淋巴癌, 前列腺癌, 肺癌 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 多组学分析 多核学习(MKL) 单细胞多组学数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 10x Multiome NA
94 2026-01-20
Ex vivo model of functioning human lymph node reveals role for innate lymphocytes and stroma in response to vaccine adjuvant
2025-Jul-22, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文介绍了一种使用人淋巴结切片作为功能性模型系统,研究疫苗佐剂早期炎症反应的方法 开发了精确切割的人淋巴结切片作为保持组织结构完整的全器官模型系统,结合单细胞转录组学和多重成像技术,揭示了先天淋巴细胞和基质细胞在疫苗佐剂反应中的新作用 模型系统可能无法完全模拟体内复杂免疫环境,且研究聚焦于早期炎症反应,长期效应未涉及 研究人类免疫系统对疫苗佐剂的早期炎症反应机制 人淋巴结切片中的免疫细胞和基质细胞 免疫学 NA 单细胞转录组学,多重成像 NA 转录组数据,图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
95 2026-01-20
Lyz1-Expressing Alveolar Type II Cells Contribute to Lung Regeneration
2025, Journal of respiratory biology and translational medicine
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析,识别出一种表达Lyz1的肺泡II型细胞亚群,并揭示其在肺损伤后对肺泡再生的贡献 首次识别出表达Lyz1的肺泡II型细胞作为先前未被认识的祖细胞群,扩展了肺泡再生的范式 NA 探究异质性肺泡II型细胞在肺修复中的作用 小鼠肺组织中的肺泡II型细胞 数字病理学 肺疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
96 2026-01-20
Single-cell RNA sequencing unraveled immune-related expression heterogeneity and lymphoid cell development dysregulation in childhood asthma
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析儿童哮喘患者的外周血单个核细胞,揭示了免疫相关表达异质性和淋巴细胞发育失调在疾病中的作用 首次在儿童哮喘中应用单细胞RNA测序技术,系统揭示了免疫细胞发育轨迹异常和细胞间通讯网络的变化,识别了潜在的分子靶点 样本量较小(3例患者和4例对照),可能限制统计功效和普遍性结论 阐明免疫失调在儿童哮喘发病机制中的作用 儿童哮喘患者的外周血单个核细胞 数字病理学 哮喘 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 3例儿童哮喘患者和4例年龄匹配的健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
97 2026-01-20
Role of SUV39H2 in shaping the malignant phenotype of triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本文研究了SUV39H2在三阴性乳腺癌中的表达模式、临床相关性及其在肿瘤恶性表型中的功能作用 首次系统分析了SUV39H2在多种癌症中的表达模式,并验证了其在三阴性乳腺癌中的过表达及其与恶性特征的关联 SUV39H2的临床效用需要进一步验证 阐明SUV39H2在三阴性乳腺癌中的表达模式、临床相关性及其功能作用 三阴性乳腺癌细胞系(MDA-MB-231和Hs-578T)及患者样本 癌症生物学 乳腺癌 TCGA-GTEX数据库分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学、Western blotting、Transwell迁移、克隆形成、球体形成及皮下异种移植肿瘤形成实验 NA 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、免疫组织化学图像、蛋白质印迹数据 五对三阴性乳腺癌患者样本及两个细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
98 2026-01-20
Research progress of stem cells in the treatment of atherosclerosis
2025, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 本文系统综述了近年来干细胞在治疗动脉粥样硬化方面的研究进展,重点关注了间充质干细胞、诱导多能干细胞和内皮祖细胞等主要细胞类型的作用机制,并总结了动物实验和临床试验的关键证据 提出了利用单细胞测序、类器官模型和精准递送系统等前沿技术来促进干细胞临床转化的具体实施路径,如筛选高活性干细胞亚群、模拟病变微环境评估疗效以及增强靶向递送 干细胞存在归巢效率低、存活时间短以及免疫排斥风险等核心挑战 探讨干细胞在动脉粥样硬化靶向治疗中的应用,旨在为疾病修饰治疗提供理论依据和研究方向 动脉粥样硬化(AS) 数字病理学 心血管疾病 单细胞测序 NA NA NA NA NA NA NA
99 2026-01-20
Bu-Yi-Xin-Shen formula targets monocytes through PI3K-Akt/NF-κB signaling in post-percutaneous coronary intervention angina
2025, American journal of translational research IF:1.7Q4
研究论文 本研究结合生物信息学与实验验证,探讨补益心肾方治疗经皮冠状动脉介入术后心绞痛的机制,发现其通过靶向单核细胞调控PI3K-Akt/NF-κB信号通路发挥作用 首次结合单细胞RNA测序与分子对接技术,识别补益心肾方在经皮冠状动脉介入术后心绞痛中的核心靶点基因与活性成分,并明确单核细胞为关键作用细胞类型 研究主要基于动物实验和生物信息学分析,缺乏临床样本的直接验证,且活性成分的体内药效与毒性需进一步评估 探究补益心肾方治疗经皮冠状动脉介入术后心绞痛的作用机制 经皮冠状动脉介入术后心绞痛患者相关靶点基因、单核细胞及动物模型 生物信息学 心血管疾病 单细胞RNA测序、分子对接、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、功能富集分析 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
100 2026-01-20
Visualizing stability: a sensitivity analysis framework for t-SNE embeddings
2025, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2
研究论文 本文提出一个计算框架,用于扩展标准t-SNE图,通过可视化线索展示t-SNE嵌入的稳定性 结合隐函数定理与自动微分进行敏感性分析,计算嵌入对输入数据的敏感性,并通过雅可比矩阵可视化特征影响和结构不稳定区域 未在摘要中明确说明 评估t-SNE可视化的稳健性和可解释性,以支持生物信息学中更严谨的科学结论 高维生物数据,包括批量RNA-seq、蛋白质组学和单细胞转录组学数据集 机器学习 NA t-SNE, 敏感性分析, 自动微分 t-SNE 高维数据 三个不同的生物数据集 NA bulk RNA-seq, proteomics, single-cell transcriptomics NA NA
回到顶部