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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-11-14 |
In-silico discovery of druggable molecular signatures that drive dengue fever to severe dengue fever highlighting common pathogenesis through single-cell RNA-Seq analysis
2025-Nov-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23000-3
PMID:41219276
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现登革热向重症登革热转变的关键分子特征和候选药物 | 整合多个单细胞RNA-Seq数据集,识别出与登革热进展相关的关键细胞类型和宿主基因,并通过计算药物筛选推荐潜在治疗药物 | 研究基于计算分析,需要实验验证;样本来源和数量有限 | 探索登革热向重症登革热发展的分子机制并发现潜在治疗靶点 | 登革热患者单细胞RNA-Seq数据 | 生物信息学 | 登革热 | 单细胞RNA测序, 细胞间通讯分析, 差异表达分析, 蛋白质相互作用网络分析, 分子对接, ADME/T分析, DFT分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个数据集(GSE220969和GSE154386),具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2025-11-14 |
Exploring drug resistance via intercellular crosstalk using spatial transcriptomics in high-grade serous ovarian carcinoma
2025-Nov-11, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01122-1
PMID:41219363
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学探索高级别浆液性卵巢癌中细胞间通讯与PARP抑制剂耐药性的关系 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,发现midkine信号通路在PARP抑制剂耐药中的作用,并鉴定出SDC4受体表达与患者预后不良相关 | 样本量较小(仅8个肿瘤样本),需要在更大队列中验证发现 | 探索高级别浆液性卵巢癌中PARP抑制剂耐药的分子机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者的肿瘤样本 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 8个高级别浆液性卵巢癌肿瘤样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium | Visium空间转录组技术 |
| 83 | 2025-11-14 |
Molecular mechanisms and genetic predisposition to osteoarthritis and osteosarcoma through Mendelian inheritance patterns
2025-Nov-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03917-x
PMID:41219646
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研究论文 | 通过孟德尔遗传方法系统分析骨关节炎和骨肉瘤的遗传易感性与分子机制 | 首次结合GWAS和单细胞RNA测序技术系统揭示骨关节炎遗传易感位点及骨肉瘤细胞异质性特征 | NA | 阐明骨关节炎和骨肉瘤的遗传易感性机制及分子网络 | 骨关节炎和骨肉瘤的遗传变异特征及细胞分子网络 | 生物信息学 | 骨关节炎,骨肉瘤 | 全基因组关联研究(GWAS),单细胞RNA测序,t-SNE降维分析 | NA | 基因组数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2025-11-14 |
Integrated bulk and single-cell transcriptomics identifies shared and specific immune signatures in Takayasu Arteritis
2025-Nov-11, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03673-x
PMID:41219777
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研究论文 | 通过整合外周血T细胞亚群的bulk RNA测序和主动脉组织的单细胞RNA测序,揭示高安动脉炎中CD4⁺和CD8⁺ T细胞的共享和特异性免疫特征 | 首次整合外周血T细胞亚群的bulk RNA测序与主动脉组织的单细胞RNA测序,系统揭示高安动脉炎的免疫特征并识别关键转录调控因子EGR1 | 样本量较小(8名治疗初治TAK患者和3名健康对照用于bulk测序,3名TAK患者和3名动脉粥样硬化对照用于单细胞测序) | 寻找高安动脉炎的机制性生物标志物和治疗靶点 | 高安动脉炎患者的外周血CD4⁺和CD8⁺ T细胞及主动脉组织 | 生物信息学 | 高安动脉炎 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 基因本体富集分析, KEGG通路分析, Reactome分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, 细胞间通讯分析 | NA | 基因表达数据 | 8名治疗初治TAK患者和3名健康对照(bulk测序),3名TAK患者和3名动脉粥样硬化对照(单细胞测序) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-11-14 |
Delineating transcriptomic signatures of in vitro human skeletal muscle models in comparison to in vivo references
2025-Nov-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102684
PMID:41135530
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研究论文 | 通过大规模转录组数据分析比较体外人类骨骼肌模型与体内参考组织的差异 | 首次对39项研究中的400多个样本进行大规模转录组比较分析,系统评估体外骨骼肌模型的保真度 | 研究主要基于转录组数据,可能未涵盖蛋白质水平和功能层面的差异 | 评估体外人类骨骼肌模型在转录组水平上对体内组织的再现程度 | 人类骨骼肌体外模型和体内参考组织 | 转录组学 | NA | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 400多个样本,来自39项研究 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2025-11-14 |
A phenotype-driven data and drug repurposing strategy used to identify potential treatments targeting chondrocyte hypertrophy in osteoarthritis
2025-Nov-11, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118773
PMID:41223767
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研究论文 | 本研究通过表型驱动的数据和药物重定位策略,结合单细胞转录组学数据识别能够逆转骨关节炎中软骨细胞肥大表型的潜在治疗方法 | 首次将单细胞转录组学数据与药物重定位策略相结合,应用特征逆转原理来识别针对软骨细胞肥大表型的潜在治疗药物 | 研究主要基于体外实验和离体组织验证,尚未进行体内动物模型或临床试验验证 | 开发针对骨关节炎中软骨细胞肥大表型的有效药物治疗策略 | 骨关节炎患者的软骨细胞和软骨组织外植体 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,基因表达分析,体外细胞培养,离体组织培养 | 特征逆转分析,基因表达速度分析 | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2025-11-14 |
"Oxygen tone" drives stage-specific OPC phenotypes for cell-based stroke therapy
2025-Nov-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102709
PMID:41223837
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研究论文 | 本研究探索缺氧如何影响缺血性中风后少突胶质前体细胞(OPCs)的表型特征 | 揭示了氧浓度依赖的OPC表型可同时促进血管生成和髓鞘再生 | NA | 探索缺氧环境对OPC功能特性的影响及其在中风细胞治疗中的潜力 | 少突胶质前体细胞(OPCs) | 单细胞转录组学 | 缺血性中风 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-11-14 |
Matrix metalloproteinases are hallmark early biomarkers and therapeutic targets in FSHD
2025-Nov-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195104
PMID:40966415
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研究论文 | 本研究揭示了基质金属蛋白酶(MMPs)在面肩肱型肌营养不良症(FSHD)中作为早期生物标志物和治疗靶点的重要作用 | 首次通过单细胞RNA测序确定FAPs和巨噬细胞是MMPs的主要来源,并证明泛MMP抑制剂batimastat可改善FSHD病理特征 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究MMPs在FSHD疾病进展中的作用机制及治疗潜力 | 面肩肱型肌营养不良症(FSHD)患者活检样本和iDUX4pA FSHD小鼠模型 | 生物医学研究 | 肌肉营养不良症 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2025-11-14 |
Platelets impair the resolution of inflammation in atherosclerotic plaques in insulin-resistant mice after lipid lowering
2025-Nov-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.193593
PMID:41066197
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研究论文 | 本研究揭示血小板通过阻碍巨噬细胞向促消退表型转化,削弱胰岛素抵抗小鼠动脉粥样硬化斑块在降脂治疗中的炎症消退过程 | 首次证明血小板会阻碍降脂治疗期间动脉粥样硬化斑块的炎症消退,并发现Fcgr4+巨噬细胞亚群在炎症消退中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床数据仅涉及循环单核细胞分析 | 探究血小板在胰岛素抵抗背景下如何影响降脂治疗诱导的动脉粥样硬化斑块炎症消退 | 肥胖且胰岛素抵抗的小鼠模型及临床患者数据 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 小鼠模型及临床患者队列(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2025-11-14 |
Single Cell Transcriptomics of Traditional Chinese Medicine Bioactives: Mapping Immune, Neural and Hepatic Responses
2025-Nov-10, Zhongguo ying yong sheng li xue za zhi = Zhongguo yingyong shenglixue zazhi = Chinese journal of applied physiology
DOI:10.62958/j.cjap.2025.028
PMID:41207694
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研究论文 | 本研究应用单细胞RNA测序技术解析中药活性成分对免疫、神经和肝脏系统的细胞特异性反应 | 首次在单细胞分辨率揭示中药活性成分的细胞特异性药效学机制,发现传统批量转录组学研究无法检测的细胞类型特异性反应 | 研究仅使用小鼠模型,样本数量相对有限,需要进一步人体验证 | 阐明中药活性成分在免疫、神经和肝脏系统中的细胞特异性药理作用机制 | 小鼠脾脏、海马体和肝脏组织分离的单细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,RT-qPCR,免疫荧光 | Seurat,CellChat | 单细胞转录组数据 | 超过42,000个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 91 | 2025-11-14 |
Descendants of hypertrophic chondrocytes promote angiogenesis by secreting THBS4 during bone growth and injury repair
2025-Nov-10, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00469-2
PMID:41207902
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研究论文 | 本研究揭示了肥大软骨细胞后代通过分泌THBS4促进血管生成在骨骼生长和损伤修复中的关键作用 | 首次发现肥大软骨细胞后代中特定细胞亚群(PADs)通过分泌THBS4调控血管生成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究肥大软骨细胞转化在骨骼发育和修复中的病理生理意义 | 小鼠肥大软骨细胞及其后代细胞 | 发育生物学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序,免疫染色,组织透明化,体外细胞培养 | Col10a1-Cre; R26基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,图像数据 | 小鼠股骨和跖骨样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 92 | 2025-11-14 |
Unveiling prognostic biomarkers and immunotherapeutic insights in prostate cancer through multi-omics and machine learning
2025-Nov-10, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03363-z
PMID:41207909
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研究论文 | 通过多组学和机器学习方法识别前列腺癌预后生物标志物和免疫治疗靶点 | 整合单细胞和bulk转录组数据,开发包含14种算法和162种算法组合的机器学习框架构建共识免疫预后特征 | NA | 评估前列腺癌相关基因的临床相关性和预后潜力 | 前列腺癌肿瘤微环境中的细胞群体 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 多组学分析 | 机器学习集成算法 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2025-11-14 |
STAT3 regulates NK and NKT cell differentiation through C-X3-C motif chemokine receptor 1 (CX3CR1) in hyper-IgE syndrome
2025-Nov-10, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00323-1
PMID:41212476
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和流式细胞术揭示了STAT3基因突变通过CX3CR1调控NK和NKT细胞分化在高IgE综合征中的作用机制 | 首次发现STAT3突变导致CX3CR1CD57 NK和NKT细胞群体增加,并通过CUT&Tag分析揭示突变STAT3增强与IL-4转录起始位点的结合 | STAT3突变的分子机制仍然复杂且未完全阐明,研究样本量有限 | 探究STAT3突变在高IgE综合征中导致免疫失调的分子机制 | STAT3突变患者、STAT3条件性敲除小鼠的免疫细胞(NK细胞、NKT细胞、CD4 T细胞) | 免疫学 | 高IgE综合征 | 单细胞测序, 流式细胞术, CUT&Tag分析 | NA | 单细胞测序数据, 流式细胞数据, 表观基因组数据 | STAT3突变患者和STAT3条件性敲除小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 94 | 2025-11-14 |
MZT2B promotes malignant phenotypes in NSCLC cells by enhancing mitochondrial function and COX5B expression
2025-Nov-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08182-y
PMID:41213905
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研究论文 | 本研究揭示MZT2B通过增强线粒体功能和促进COX5B表达驱动非小细胞肺癌恶性进展的分子机制 | 首次发现MZT2B在NSCLC中的致癌作用及其通过调控线粒体功能和COX5B表达促进肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索NSCLC新型治疗靶点及MZT2B的致癌机制 | 非小细胞肺癌细胞系、临床组织标本和皮下异种移植模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑, shRNA基因沉默, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 临床病理数据, 功能实验数据 | TCGA数据库NSCLC组织样本、多种NSCLC细胞系和异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2025-11-14 |
Distinct autoreactive CD19- plasma cell subsets accumulate in lupus-prone mice
2025-Nov-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65906-6
PMID:41213970
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术鉴定了狼疮易感小鼠中自身反应性CD19⁻浆细胞亚群的积累特征 | 首次发现自身反应性CD19⁻浆细胞亚群在狼疮发病中的关键作用,并揭示其独特的基因表达谱和来源途径 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 鉴定系统性红斑狼疮中致病性浆细胞亚群,为靶向治疗提供依据 | 狼疮易感小鼠和系统性红斑狼疮患者外周血 | 单细胞生物学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, B细胞受体谱分析, 遗传模型 | NA | 单细胞转录组数据, B细胞受体序列数据 | 狼疮易感小鼠模型和SLE患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2025-11-14 |
Neutrophil-derived Il1r2 modulates inflammation and alleviates acute lung injury by promoting M2 macrophage polarization
2025-Nov-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-14278-4
PMID:41213982
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研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞来源的Il1r2通过促进M2巨噬细胞极化调节炎症反应并缓解急性肺损伤的分子机制 | 首次发现中性粒细胞表达的Il1r2在急性肺损伤中通过促进M2巨噬细胞极化发挥抗炎作用 | 研究主要基于LPS诱导的小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索急性肺损伤的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 生物信息学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, western blotting, 免疫组织化学, 免疫荧光 | 机器学习, 基因共表达网络分析 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-11-14 |
Investigating prognostic features in high-grade serous ovarian cancer through gene regulatory network inference with single-cell transcriptomic profiles
2025-Nov-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-22937-9
PMID:41214061
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据推断基因调控网络,识别高级别浆液性卵巢癌的预后特征 | 开发了整合单细胞RNA测序分析和基因调控网络推断的工作流程,证明基于调控子的预后特征比差异表达特征更有效 | 需要同时具备单细胞数据和具有临床结果的大样本RNA测序数据才能推广到其他癌症类型 | 识别高级别浆液性卵巢癌的预后特征 | 高级别浆液性卵巢癌患者细胞 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,基因调控网络推断 | 二元分类模型 | 单细胞转录组数据,批量转录组数据 | 118,173个细胞(来自HGSOC患者),1,211个元细胞,342名TCGA HGSOC患者 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2025-11-14 |
Identification of T cell stress response state (TSTR) and key genes related to T cells in discoid lupus erythematosus
2025-Nov-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23088-7
PMID:41214060
|
研究论文 | 通过转录组和单细胞测序数据联合分析,鉴定盘状红斑狼疮中T细胞应激反应状态及相关关键基因 | 首次在DLE真皮中发现大量浸润的T细胞应激反应状态(TSTR),并通过多组学数据交叉验证筛选出CXCL13等9个关键疾病基因 | 需要进一步实验验证这些关键基因在DLE发病机制中的具体功能 | 深入探索盘状红斑狼疮的发病机制和生物标志物 | 盘状红斑狼疮患者的T细胞 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 转录组测序,单细胞RNA测序,WGCNA分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2025-11-14 |
Development and validation of a novel nerve-related prognostic model for gastric cancer based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2025-Nov-10, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15202-9
PMID:41214583
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研究论文 | 基于大量和单细胞RNA测序数据开发并验证了一种新型的胃癌神经相关预后模型 | 首次结合大量和单细胞RNA测序数据构建神经相关风险评分模型,系统分析神经相关基因在胃癌中的预后价值和肿瘤微环境特征 | 样本量相对有限,单细胞测序仅包含8例患者,需要更大规模验证 | 开发胃癌神经相关预后模型并评估其临床价值 | 胃癌患者组织样本和公开数据库中的基因表达数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,大量RNA测序,LASSO回归分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据,临床数据 | 8例胃癌患者的匹配癌组织和癌旁组织(单细胞测序),TCGA和GEO数据库中的大量数据 | NA | 单细胞RNA-seq,大量RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2025-11-14 |
Integrated clinical and single-cell profiling of BCMA CAR-T therapy in relapsed/refractory multiple myeloma
2025-Nov-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07106-w
PMID:41214679
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研究论文 | 本研究评估了自体BCMA CAR-T细胞疗法在复发/难治性多发性骨髓瘤患者中的安全性和有效性,并通过单细胞分析揭示了CAR-T细胞异质性与临床结局的关系 | 首次结合临床数据和单细胞测序分析本地生产的BCMA CAR-T疗法,揭示了CD8⁺ T细胞亚群功能特化、克隆适应性演变与免疫调节在治疗反应中的关键作用 | 样本量较小(仅6例患者),单臂试验设计缺乏对照组 | 评估本地生产的BCMA CAR-T细胞疗法在复发/难治性多发性骨髓瘤患者中的安全性和有效性 | 6例复发/难治性多发性骨髓瘤患者 | 单细胞分析 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据,临床数据 | 6例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |