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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-06-11
Early-activated extracellular matrix proteins shape the metabolic and spatial dynamics of the kidney fibrotic microenvironment
2026-Mar, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 揭示早期激活的细胞外基质蛋白ECM1通过整合素α2β1-RhoC-YAP信号轴调控肾脏纤维化微环境的代谢和空间动态 首次发现ECM1作为早期肾脏重塑调控因子,通过机械-代谢通路(ECM-线粒体串扰)选择性调控成纤维细胞活化而不影响其氧化磷酸化,为抗纤维化治疗提供新靶点 未在人类样本验证ECM1的早期调控作用;AAV9介导的敲低策略在临床转化中可能面临递送效率问题;机制研究主要在动物模型中进行 阐明早期激活的细胞外基质蛋白在肾脏纤维化微环境中的代谢和空间动态调控作用 ECM1基因敲除小鼠、慢性肾病模型、肾脏纤维化组织 数字病理学 肾脏纤维化 空间转录组学、蛋白质组学 NA 基因表达数据、蛋白质组数据 全球ECM1敲除小鼠(数量未明确)及慢性肾病小鼠模型(数量未明确) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台用于肾脏组织空间基因表达分析
82 2026-06-11
Machine Learning Reveals the Association Between Gene Expression and Immune Infiltration in Colorectal Cancer: A Comprehensive Study From Single-Cell to Survival Analysis
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 利用机器学习分析单细胞RNA测序数据,揭示结直肠癌中基因表达与免疫浸润的关联,并识别新型分子亚型和生物标志物 首次将机器学习应用于单细胞RNA测序分析,以解析结直肠癌中基因表达谱与免疫细胞浸润之间的复杂相互作用,并识别出两个具有不同预后效果的新型分子亚型以及CD19、MAP2、CALB2和TGFB2作为关键免疫调节生物标志物 未提及 探索结直肠癌肿瘤微环境中基因表达与免疫细胞浸润的分子机制,并开发预测性模型以指导临床治疗决策 结直肠癌患者的单细胞RNA测序数据 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序、CIBERSORT、ESTIMATE、UMAP、t-SNE 机器学习模型(含无监督聚类、生存分析、基因集富集分析) 单细胞RNA测序数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
83 2026-06-11
Immune Microenvironment Dynamics and Therapeutic Targets in GIST Revealed by Multi-Omics and Functional Validation
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 通过多组学分析和功能验证,揭示胃肠道间质瘤免疫微环境动态变化及潜在治疗靶点 首次结合孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序和功能实验,系统鉴定出MYBL1和AIF1L作为调节CD8 T细胞功能和PD-1应答的关键介质 未提及具体局限性信息 阐明胃肠道间质瘤免疫微环境的因果机制及识别治疗靶点 胃肠道间质瘤患者肿瘤组织、细胞系(GIST-882)及CD8 T细胞 机器学习 胃肠道间质瘤 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、批量RNA测序、细胞共培养模型、功能实验(增殖、迁移、侵袭和蛋白摄取追踪) NA 基因表达数据、免疫细胞表型数据、血浆代谢物数据 731种免疫细胞表型(孟德尔随机化分析)及多个肿瘤样本(scRNA-seq和bulk RNA-seq) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
84 2026-06-11
Exploring the phthalates-induced neurotoxicity mechanisms of neurodegenerative diseases via network toxicology, single-cell transcriptomics and molecular dynamic simulation
2026-Mar-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 通过网络毒理学、单细胞转录组学和分子动力学模拟,探索邻苯二甲酸酯诱发神经退行性疾病的神经毒性机制 首次结合网络毒理学、单细胞转录组学和分子动力学模拟,揭示邻苯二甲酸酯通过BCL2调控星形胶质细胞亚型转化(从神经保护性A2向促炎性A1转化)进而诱发神经退行性疾病的机制 研究主要基于公共数据库和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证和更广泛的临床样本支持 阐明邻苯二甲酸酯暴露与神经退行性疾病(帕金森病、路易体病、阿尔茨海默病)之间的潜在关联机制 邻苯二甲酸酯(特别是DEHP和DiBP)、血脑屏障、神经退行性疾病相关基因和通路、星形胶质细胞 机器学习, 数字病理学 帕金森病, 路易体病, 阿尔茨海默病 单细胞转录组测序, 分子动力学模拟 诊断模型(逻辑回归等) 转录组数据, 单细胞转录组数据 帕金森病患者组织样本(具体数量未在摘要中明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
85 2026-06-11
Ventricular assist device unloading reverses microvascular senescence in single ventricle disease
2026-Mar, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1
研究论文 通过单核RNA测序和空间转录组学,研究了左心发育不全综合征患者右心室微环境中的微血管衰老及其在心室辅助装置卸载后的逆转 首次揭示HLHS心肌细胞内在衰老特性,并发现微血管衰老生态位与成人心肌梗死相似但不同于儿童扩张型心肌病,VAD卸载可改善该衰老生态位 NA 阐明HLHS右心室微环境的细胞衰老机制及VAD卸载的逆转作用 HLHS患者右心室组织及诱导多能干细胞来源的心肌细胞 数字病理学 左心发育不全综合征 单核RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 出生时(心力衰竭前)、术后伴心力衰竭及VAD卸载后的HLHS患者样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
86 2026-06-11
Dendritic Cell-Associated MARCKSL1 Regulates Fibroblast Differentiation During Wound Healing
2026 Mar-Apr, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society IF:3.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析小鼠疤痕组织,发现树突状细胞中的MARCKSL1调节成纤维细胞分化,影响伤口愈合中的疤痕形成 首次揭示树突状细胞中的MARCKSL1基因在伤口愈合过程中调控成纤维细胞分化及其在疤痕形成中的关键作用 主要基于小鼠模型,人类伤口愈合中的机制有待验证;MARCKSL1抑制剂的安全性和长期效果尚未明确 阐明树突状细胞相关MARCKSL1在伤口愈合中调控成纤维细胞分化的机制,探索疤痕预防的新治疗途径 成年小鼠疤痕组织 和 小鼠胎儿伤口愈合模型中的树突状细胞和成纤维细胞 机器学习和数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),shRNA转导 NA 单细胞基因表达数据 小鼠疤痕组织(具体数目未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
87 2026-06-11
The Immune Cell Atlas of "Longevity Molecular Tag": Identification of Principal Immune Cell Subsets and Their Underlying Molecular Regulatory Mechanisms
2026-Mar, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序数据,识别与长寿表型相关的免疫细胞亚群,并揭示其分子调控机制 整合全生命周期单细胞数据与超长寿人群转录组数据,利用Scissor算法构建“长寿分子标签”免疫细胞图谱,发现NK细胞、CD8 T细胞和γδ T细胞等细胞毒性免疫细胞与长寿正相关,而CD4 T细胞、B细胞和树突状细胞与炎症信号通路相关 NA 揭示长寿人群中免疫细胞亚群及其分子调控机制,探索免疫衰老调节策略 东亚人群全生命周期的单细胞RNA测序数据和广西百岁老人队列的批量转录组数据 机器学习 老年疾病 单细胞RNA测序 Scissor算法 基因表达数据 东亚人群全生命周期样本及广西百岁老人队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
88 2026-06-11
Developing a Metabolic-Associated Prognostic Index for Risk Stratification and Therapeutic Guidance in Stage I Lung Adenocarcinoma via Multiomics Analysis
2026-Mar, JCO precision oncology IF:5.3Q1
研究论文 通过多组学分析开发了一种代谢相关预后指数,用于I期肺腺癌的风险分层和治疗指导 首次系统性地探讨代谢重编程在I期肺腺癌中的预后意义,并基于机器学习和多组学数据构建了一个生物学可解释、临床适用的代谢相关预后指数(MAPI),同时通过单细胞RNA测序和体外实验验证了关键基因的功能 研究依赖于公共数据库,缺乏前瞻性临床验证;MAPI的临床应用需进一步在更大规模、多中心队列中验证 开发一种生物驱动的预后工具,用于I期肺腺癌患者的风险分层和个体化治疗决策 I期肺腺癌患者的肿瘤样本及临床数据 机器学习 肺癌(肺腺癌) 多组学分析、单细胞RNA测序、体外细胞实验 加权基因共表达网络分析、机器学习组合模型 转录组数据、单细胞转录组数据、临床数据 来自TCGA、GEO和EGA数据库的多个I期LUAD队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
89 2026-06-11
scSCCNIA: similarity matrix based contrastive clustering with neighbor information aggregation for single-cell RNA sequencing data
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出一种基于相似性矩阵对比聚类与邻居信息聚合的框架scSCCNIA,用于单细胞RNA测序数据的细胞聚类分析 采用拉普拉斯滤波器进行邻居信息聚合,通过特殊非共享参数孪生编码器构建不同图视图进行数据增强,并利用基于相似性矩阵的对比学习学习潜在低维嵌入表示 未明确提及局限性 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性,并促进下游分析 来自不同平台和不同细胞数量的多个单细胞RNA测序数据集 机器学习 NA scRNA-seq 孪生网络 基因表达数据 多个数据集,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
90 2026-06-11
Mitochondrial and Ribosomal Stress Underlying Pronuclear Envelope Breakdown Failure: Insights From Single-Cell Transcriptomics in Human Zygotes
2026-Mar, Molecular reproduction and development IF:2.7Q2
研究论文 通过单细胞转录组学揭示人类受精卵中前核膜破裂失败的分子机制,重点关注线粒体和核糖体应激 首次发现MT-ND1-RPL10A/RPL38轴作为评估ICSI胚胎质量的新型分子标志物,并揭示线粒体代谢功能障碍和核糖体组装异常共同导致前核膜破裂失败 未提及具体局限性 阐明前核膜破裂失败的核心调控网络及其对胚胎发育的影响 人类受精卵(PNEB型2PN受精卵和3PN对照受精卵) 机器学习和数字病理学 不孕不育及胚胎发育异常 单细胞测序 加权基因共表达网络分析和LASSO回归 单细胞转录组数据、荧光染色数据 PNEB型2PN受精卵和3PN对照受精卵(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
91 2026-06-11
Assessment of dispersion metrics for estimating single-cell transcriptional variability
2026-Mar, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 系统性比较统计指标在估计单细胞转录变异中的效果,并应用方差均值比(Fano因子)测量单细胞数据集中的转录变异性 通过模拟单细胞数据系统比较多种常用统计指标对噪声的响应性,并发现Fano因子是测量转录变异性的合适指标,能揭示平均表达以外的生物学信息 研究主要基于模拟数据和特定平台的数据集,结论的普适性有待进一步验证 评估不同统计指标在估计单细胞转录变异性中的有效性,并应用最合适的指标分析生物学相关信息 单细胞RNA测序数据中的转录变异性 单细胞生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 使用多个单细胞数据集,代表不同复杂系统和跨平台测量,具体样本数未明确 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 使用10x Chromium进行单细胞捕获,Illumina NovaSeq进行测序,具体细节未提供
92 2026-06-11
Sinusoidal cell-derived biomarker scores predict diagnosis and prognosis in chronic liver disease
2026-Feb-28, BMC medicine IF:7.0Q1
research paper 本研究通过单细胞RNA测序数据分析,开发了正弦细胞特异性生物标志物评分,用于慢性肝病的诊断和预后预测 首次从单细胞层面识别肝窦内皮细胞毛细血管化、肝星状细胞活化和巨噬细胞极化的细胞类型特异性特征,并将其整合为三个正弦评分(内皮、间充质和巨噬细胞),用于慢性肝病进展和逆转的生物学通路监测 回顾性研究设计,需进行前瞻性验证后才能推广至临床试验实施 开发正弦细胞特异性生物标志物评分,用于慢性肝病的诊断和预后预测 慢性肝病患者 machine learning chronic liver disease 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因表达定量分析 逻辑回归(AUROC评分) 基因表达数据(来自肝活检样本) 内部队列108例,验证队列1008例(含两年随访数据) NA single-cell RNA-seq NA NA
93 2026-06-11
GeneExt: a gene model extension tool for enhanced single-cell RNA-seq analysis
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 GeneExt是一款利用单细胞RNA测序数据完善基因注释的工具,能够提升非模式物种基因表达量化准确性 首次专门针对非模式物种设计,通过扩展和均一化基因注释来解决因基因模型不完整导致的表达量化问题 未提及具体限制,但推测可能依赖高质量scRNA-seq数据,且在不同物种间的适用性可能需要进一步验证 提升单细胞RNA测序数据中基因表达量化的准确性,改善非模式物种的生物注释和跨物种比较 八个非模式生物的单细胞图谱 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 八个非模式生物的单细胞图谱 NA 单细胞RNA测序 NA NA
94 2026-06-11
scDock: streamlining drug discovery targeting cell-cell communication via scRNA-seq analysis and molecular docking
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出scDock管线,整合单细胞RNA测序分析与分子对接,实现靶向细胞间通讯的药物发现 首次将单细胞RNA测序数据处理、细胞间通讯推断和基于分子对接的药物发现整合为无需编程技能的一站式管线 NA 开发一个用户友好的端到端管线,用于从单细胞数据中发现靶向细胞间通讯的治疗化合物 疾病相关的配体-受体相互作用及潜在治疗化合物 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(RNA-seq)、分子对接 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
95 2026-06-11
The dorsal root ganglion T-junction: a critical node in somatosensory processing and pain pathogenesis
2026-Feb-25, Sheng li xue bao : [Acta physiologica Sinica]
PMID:41777127
综述 综述背根神经节T形连接在躯体感觉处理和疼痛发病机制中的关键作用 首次系统总结空间转录组学、单细胞测序、超分辨率显微镜、类器官模型等新技术对T形连接分子组成、离子通道分布和电生理特性的解析 T形连接体内动态调控机制尚不完全清楚,精准靶向治疗临床转化仍有挑战 阐明背根神经节T形连接在感觉信号处理和疼痛病理中的功能机制 背根神经节中的假单极神经元及其T形连接 数字病理学 神经病理性疼痛 空间转录组学、单细胞测序、超分辨率显微镜、电生理记录 NA 空间转录组数据、单细胞测序数据、图像数据 NA 10x Genomics, Illumina 空间转录组学, 单细胞RNA测序 10x Visium, Illumina NovaSeq NA
96 2026-06-11
Canonical human blood dendritic cells are distinguished by robust E-selectin binding
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 该研究表明,所有人血液树突状细胞亚群均能通过表达E-选择素配体实现与内皮细胞的粘附,从而在血流与组织间迁移中发挥作用 首次揭示人血液树突状细胞及其前体细胞普遍具备稳健的E-选择素结合能力,重新定义了这类连接先天性和适应性免疫系统的免疫细胞的分子迁移机制 单细胞RNA测序无法提供树突状细胞表达sLeX的关键化学酶效应物的见解,仅依靠RNA测序方法具有局限性 探究人血液树突状细胞与E-选择素结合的能力及其在免疫细胞组织募集中的作用 人血液树突状细胞及其前体细胞 数字病理学 炎症性疾病 流式细胞术、生化分析、转录本测序、批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA 文本、测序数据 人血液样本,具体数量未提及 NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
97 2026-06-11
A comprehensive single-cell analysis reveals the impact of laser interstitial thermal therapy on the tumor microenvironment in glioblastoma
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 利用单细胞RNA测序和免疫荧光技术,研究激光间质热疗对胶质母细胞瘤肿瘤微环境的影响 首次通过单细胞RNA测序全面揭示激光间质热疗诱导的亚致死高温对胶质母细胞瘤肿瘤微环境的多重复杂影响,包括促进细胞毒性T细胞浸润、驱动树突状细胞成熟、增强生发中心B细胞募集、减少M2型巨噬细胞浸润,并发现其通过减弱胶原相关基因与Cd44的相互作用抑制肿瘤,同时通过增强Ptn与Ncl的相互作用促进肿瘤血管生成和增殖的双重效应 研究基于大鼠颅内胶质母细胞瘤模型,结论可能需要进一步在人类患者中验证 研究激光间质热疗诱导的亚致死高温对胶质母细胞瘤肿瘤细胞及其微环境的影响 胶质母细胞瘤(GBM)大鼠颅内模型 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、免疫荧光分析 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 大鼠颅内胶质母细胞瘤模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium,10x Visium 10x Chromium单细胞RNA测序,10x Visium空间转录组学
98 2026-06-11
T cells co-expressing high levels of CD29 and CD99 show increased cytotoxic potential and are upregulated in Sjögren's disease
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究旨在探讨CD29和CD99在人类T淋巴细胞中的作用及其在干燥综合征中的意义 首次发现CD29和CD99在T细胞中高度共表达,并鉴定出CD29hiCD99hi T细胞亚群具有增强的细胞毒性潜能和活化表型,且在干燥综合征患者中上调 仅分析了外周血中的T细胞,缺乏对组织浸润T细胞的直接验证,且ROC分析显示仅CD29hiCD99hi CD4+ T细胞中的TIGIT表达达到高AUC值,临床价值有限 探索CD29和CD99在人类T细胞中的协同作用及其在干燥综合征发病机制中的意义 人类T淋巴细胞,特别是外周血单个核细胞中的CD4+和CD8+ T细胞亚群 数字病理学 干燥综合征 单细胞RNA测序,流式细胞术,批量RNA测序 NA 基因表达数据 干燥综合征患者和健康对照者的外周血样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'测序
99 2026-06-11
IFNγ/JAK/STAT1/CD38 pathway in SH2D1Bhigh NK cells: Implications for inflammation in type 1 diabetes
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究探讨了SH2D1B高表达的自然杀伤细胞中IFNγ/JAK/STAT1/CD38通路在1型糖尿病炎症中的作用 首次揭示SH2D1B高表达的NK细胞通过IFNγ/JAK1/STAT/CD38通路产生腺苷,可能限制1型糖尿病的自身免疫和疾病发展 NA 探究1型糖尿病中SH2D1B高表达NK细胞的分子机制及其对炎症的影响 1型糖尿病患者外周血中的NK细胞 机器学习 1型糖尿病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, Western blotting LASSO 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
100 2026-06-11
TWEAK is increased in ulcerative colitis and contributes to fibroblast-mediated monocyte activation via heterologous non-canonical NF-kB/STAT3 signaling
2026-Feb-05, Journal of Crohn's & colitis
研究论文 揭示TWEAK在溃疡性结肠炎中上调并通过异源非经典NF-kB/STAT3信号促进成纤维细胞介导的单核细胞活化 首次阐明TWEAK处理后的炎症成纤维细胞通过非经典NF-kB/STAT3信号通路诱导单核细胞STAT3磷酸化,并发现该轴与抗TNF治疗耐药和IBD易感性基因相关 未明确说明,但从摘要中推断机制研究主要在体外和公共数据中,体内验证有限 阐明成纤维细胞与单核细胞间通讯在溃疡性结肠炎中的失调机制,特别是TWEAK/NF-κB/STAT3轴的作用 溃疡性结肠炎患者及健康供体的结肠活检组织,以及共培养模型中的成纤维细胞和单核细胞 machine learning 溃疡性结肠炎 单细胞转录组学, 共培养模型, 免疫组化, 磷酸化分析 NA 转录组数据, 组织图像 溃疡性结肠炎患者及健康供体结肠活检(具体数量未说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 公共单细胞转录组数据(具体配置未明确)
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