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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-29 |
Research overview and hotspots in the field of recurrent miscarriage: A literature-mining study
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1605088
PMID:41140654
|
文献计量分析 | 通过文献计量学方法分析复发性流产领域的研究概况和热点 | 首次系统梳理2015-2024年复发性流产领域的文献计量特征和研究热点演变 | 仅基于Web of Science数据库,可能遗漏其他重要文献来源 | 探索复发性流产领域的研究现状和发展趋势 | 3114篇相关学术文献 | 文献计量学 | 复发性流产 | 文献挖掘、共现分析、共被引分析 | NA | 文献元数据 | 3114篇文献 | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2025-10-29 |
The role of the nervous system in the occurrence, development, and immune response of renal cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1681503
PMID:41142779
|
综述 | 系统探讨神经系统在肾细胞癌发生、发展及免疫应答中的作用机制 | 首次系统阐述神经免疫系统在肾癌中的作用机制,提出靶向神经免疫轴的新型治疗策略 | 主要基于临床前研究数据,缺乏大规模临床验证 | 阐明神经系统在肾细胞癌发生发展和治疗抵抗中的作用机制 | 肾细胞癌及其肿瘤微环境中的神经免疫相互作用 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 空间转录组学,临床前模型 | NA | 文献综述数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 83 | 2025-10-29 |
Prognostic genes related to mitochondrial dynamics and mitophagy in diffuse large B-cell lymphoma are identified and validated using an integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1686948
PMID:41142795
|
研究论文 | 通过整合分析批量和单细胞RNA测序数据,鉴定并验证了与弥漫大B细胞淋巴瘤中线粒体动力学和线粒体自噬相关的预后基因 | 首次发现TCF7、CEBPA、BBC3、GALR3、BMP8B和BAALC六个溶酶体富集基因作为DLBCL的独立预后指标,并构建了整合风险评分和临床参数的复合预测模型 | 研究主要基于公共数据库和回顾性分析,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探讨线粒体动力学相关基因在弥漫大B细胞淋巴瘤患者预后中的作用 | 弥漫大B细胞淋巴瘤患者和临床样本 | 生物信息学 | 淋巴瘤 | RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, WGCNA, LASSO-Cox回归 | 风险评分模型, 诺模图 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 公共RNA-seq数据和临床验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2025-10-29 |
Elevated SerpinB2 regulates MUC5AC expression via STAT6 signaling in nasal epithelial cells in allergic rhinitis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1669777
PMID:41142810
|
研究论文 | 本研究探讨了在过敏性鼻炎中SerpinB2通过STAT6信号通路调控MUC5AC表达的机制 | 首次揭示了SerpinB2在过敏性鼻炎中通过STAT6信号通路调控MUC5AC表达的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步的体内实验验证 | 评估SerpinB2在过敏性鼻炎中的表达并确定其是否通过STAT6信号通路调控MUC5AC | 过敏性鼻炎患者和健康对照者的鼻上皮细胞 | 分子生物学 | 过敏性鼻炎 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,Western blot,免疫荧光,ELISA | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,细胞图像 | 间歇性和持续性过敏性鼻炎患者及健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-10-29 |
Effects of hormone-primed oviduct epithelial cell co-culture system on swine SCNT embryo development
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1692877
PMID:41142920
|
研究论文 | 本研究通过建立激素预处理的猪输卵管上皮细胞共培养系统,提高了猪体细胞核移植胚胎的发育效率 | 首次使用雌二醇和孕酮预处理的输卵管上皮细胞建立共培养系统,更好地模拟输卵管生理环境 | 囊胚总细胞数未增加,分子机制研究仍需深入 | 提高猪体细胞核移植胚胎的发育效率 | 猪体细胞核移植胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序(SMART-seq2) | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2025-10-29 |
Identification and Validation of the Key Genes of Diabetic Vasculopathy: Evidence Based on Bioinformatics Analysis and Animal Study
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/7850852
PMID:41143005
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和动物实验鉴定并验证糖尿病血管病变的关键基因 | 整合多种算法识别关键基因,结合调控网络分析和单细胞RNA测序技术,并通过动物实验进行验证 | 样本量有限,需要更多临床样本验证 | 探索糖尿病血管病变的分子机制并识别关键基因 | 2型糖尿病动脉样本和糖尿病小鼠模型 | 生物信息学 | 糖尿病血管病变 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序,动物实验 | PPI网络分析,调控网络分析 | 基因表达数据 | GSE13760数据集中的T2DM和对照动脉样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2025-10-29 |
Proteome-wide and network pharmacology integration identifies sunitinib as a potential therapeutic for type 2 diabetes targets
2025, Therapeutic advances in endocrinology and metabolism
IF:3.9Q2
DOI:10.1177/20420188251376325
PMID:41146943
|
研究论文 | 通过蛋白质组范围孟德尔随机化分析和网络药理学整合,识别出舒尼替尼作为2型糖尿病的潜在治疗药物 | 首次将蛋白质组范围MR分析与网络药理学整合,识别出TPST2和CHRDL1作为新型T2D治疗靶点,并发现已上市药物舒尼替尼的多靶点作用 | 需要未来临床试验验证舒尼替尼对T2D的治疗效果 | 识别2型糖尿病的潜在生物标志物和治疗靶点 | 人类蛋白质组和2型糖尿病相关蛋白 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 孟德尔随机化分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络, 通路富集分析, 单细胞RNA测序 | 逆方差加权MR, 贝叶斯加权MR | 蛋白质组数据, 基因组数据 | deCODE Genetics: 35,559个体, 4,907种蛋白质; FinnGen研究: 65,085例T2D病例, 335,112例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-29 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.628020
PMID:39763850
|
研究论文 | 本研究通过单细胞核RNA测序和空间转录组学分析,发现白细胞介素-1β在致心律失常性心肌病疾病进展中的关键驱动作用 | 首次在ACM中识别出炎症-纤维化空间生态位,并证明抗IL-1β治疗可改善疾病表型 | 研究样本量有限,主要基于动物模型验证 | 探索致心律失常性心肌病的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | ACM患者心肌样本和Desmoglein-2突变小鼠模型 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | ACM患者和对照供体的心肌样本,Desmoglein-2突变小鼠 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 89 | 2025-10-29 |
Tissue and cellular spatiotemporal dynamics in colon aging
2024-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.22.590125
PMID:38712088
|
研究论文 | 本研究通过构建结肠的细胞和空间图谱,揭示了结肠组织在衰老过程中的时空动态变化 | 开发了新的计算框架cSplotch,利用组织学特征在组织样本和数据模态间共享信息,建立了与年龄、组织区域和性别相关的空间解析细胞表达层次贝叶斯模型 | 研究仅限于小鼠模型,人类结肠衰老的直接适用性需要进一步验证 | 探究结肠组织结构和分子回路在衰老过程中的时空动态变化 | 小鼠结肠组织 | 空间转录组学 | 衰老相关疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 层次贝叶斯模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 约1,500个小鼠肠道组织进行空间转录组分析,约400,000个单核RNA测序图谱 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2025-10-28 |
CD73 inhibitor AB680 suppresses glioblastoma in mice by inhibiting purine metabolism and promoting P2RY12+ microglia transformation
2025-Nov, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-025-01585-9
PMID:40500344
|
研究论文 | 本研究探讨CD73抑制剂AB680通过抑制嘌呤代谢和促进P2RY12+小胶质细胞转化来抑制小鼠胶质母细胞瘤的机制 | 首次揭示AB680通过改变嘌呤代谢微环境促进P2RY12+小胶质细胞向M1样抗肿瘤表型转化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床效果需进一步验证 | 研究AB680在胶质母细胞瘤中的抗肿瘤效应及其作用机制 | 胶质母细胞瘤小鼠模型和人类GBM样本 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 代谢组学分析、单细胞RNA测序、核RNA测序 | 动物模型 | 代谢组数据、单细胞测序数据 | G422-GBM荷瘤小鼠模型和人类GBM样本 | NA | 单细胞RNA测序、核RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2025-10-28 |
EpiFoundation: A Foundation Model for Single-Cell ATAC-seq via Peak-to-Gene Alignment
2025-Sep-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.05.636688
PMID:39975086
|
研究论文 | 本文提出了首个专门针对单细胞ATAC-seq数据的预训练基础模型EpiFoundation,通过峰值到基因对齐解决数据稀疏性问题 | 开发了创新的跨模态预训练方法,专门处理非零峰值集以提高信息密度,并利用基因表达信息监督预训练过程 | NA | 开发专门针对单细胞ATAC-seq数据的基础模型,解决高维稀疏数据的表示学习问题 | 单细胞ATAC-seq数据中的细胞表示学习 | 机器学习 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | 基础模型 | 表观基因组数据, 基因表达数据 | 超过100,000个单细胞,包含配对的scRNA-seq和scATAC-seq数据 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 92 | 2025-10-28 |
Spatial transcriptomic analysis of HIV and tuberculosis coinfection in a humanized mouse model reveals unique transcription patterns, immune responses and early morphological alterations
2025-Sep-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.29.635571
PMID:39975088
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研究论文 | 通过人源化小鼠模型研究HIV和结核分枝杆菌共感染的早期空间转录组特征 | 首次在HIV和结核分枝杆菌共感染模型中应用空间转录组技术揭示早期免疫细胞浸润模式和转录特征 | 研究仅观察感染后三周的早期变化,未涵盖疾病全程发展 | 理解HIV和结核分枝杆菌共感染早期免疫细胞浸润的表型和功能变化 | 人源化小鼠模型的肺组织 | 空间转录组学 | HIV和结核分枝杆菌共感染 | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | 人源化小鼠感染模型(单感染和共感染组) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 93 | 2025-10-28 |
STAMP: Single-cell transcriptomics analysis and multimodal profiling through imaging
2025-Sep-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.05.027
PMID:40532697
|
研究论文 | 开发了一种名为STAMP的新型单细胞分析方法,通过成像平台实现转录组和蛋白质组的多模态分析 | 通过成像而非测序进行单细胞分析,消除了测序成本,支持RNA、蛋白质和H&E的多模态分析,同时保留细胞结构和形态 | NA | 克服单细胞RNA测序在可扩展性、高成本和细胞破坏方面的限制 | 外周血单核细胞、细胞系和干细胞 | 数字病理学 | NA | 转录组成像、蛋白质组成像、多模态分析 | NA | 图像、转录组数据、蛋白质组数据 | 10,962,092个高质量细胞/细胞核和6,030,429,954个转录本 | NA | 单细胞RNA-seq、蛋白质组学、空间转录组学 | NA | 成像平台,支持多模态(RNA、蛋白质和H&E)分析 |
| 94 | 2025-10-28 |
Powerful and accurate case-control analysis of spatial molecular data
2025-Aug-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.07.637149
PMID:39975274
|
研究论文 | 提出一种结合深度学习和统计原理的空间分子数据分析方法VIMA,用于识别与疾病相关的空间特征 | 将变分自编码器与多重检验控制相结合,通过定义数据依赖的'微生态位'来发现传统方法难以识别的疾病相关空间结构 | NA | 开发更灵活精确的空间分子数据分析方法,识别与疾病相关的关键空间结构 | 空间分子数据中的组织斑块和微生态位 | 空间转录组学 | 类风湿关节炎,溃疡性结肠炎,痴呆 | 免疫荧光显微镜,CODEX,空间转录组学 | 变分自编码器 | 空间分子数据 | NA | NA | 空间转录组学,免疫荧光,CODEX | NA | NA |
| 95 | 2025-10-28 |
CROPseq-multi: a universal solution for multiplexed perturbation in high-content pooled CRISPR screens
2025-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.17.585235
PMID:38558968
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研究论文 | 开发了一种名为CROPseq-multi的多重CRISPR筛选系统,用于在高质量集合筛选中实现通用多重扰动 | 开发了具有多功能读出兼容性的CROPseq-inspired慢病毒系统,支持单个和组合扰动,在条形码识别和扰动性能方面表现优异 | NA | 开发兼容多种筛选方法的多重CRISPR扰动系统 | CRISPR筛选系统和遗传扰动技术 | 基因编辑技术 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑,单细胞RNA测序,光学集合筛选 | NA | 基因表达数据,条形码序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,光学集合筛选 | NA | NA |
| 96 | 2025-10-28 |
Specific cell states underlie complex tissue regeneration in spiny mice
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637521
PMID:39990382
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研究论文 | 本研究通过细胞增殖动力学分析揭示多刺小鼠复杂组织再生的特定细胞状态机制 | 首次发现基质细胞在损伤后快速重新进入细胞周期并维持严格的时空控制,识别出CRABP1+和αSMA+等与再生特异性相关的关键细胞类型 | 未明确说明样本规模,且对年轻小鼠中类似成纤维细胞无法促进再生的机制解释有限 | 探索哺乳动物复杂组织再生过程中的细胞增殖动力学和特定细胞状态 | 多刺小鼠(Acomys spp.)和实验室小鼠的耳组织再生过程 | 发育生物学 | 组织损伤修复 | 时间脉冲追踪实验、免疫染色、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据、免疫染色图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-10-28 |
Improved characterization of single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.10.602909
PMID:39026715
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研究论文 | 评估Element Aviti平台通过亲和碱基化学测序技术准确读取单细胞RNA-seq文库中同聚物区域的能力 | 首次利用亲和碱基化学测序技术直接准确读取单细胞RNA-seq文库中的同聚物引物区域 | 与单端比对相比,双端比对并未持续提高读段映射率 | 改进单细胞RNA-seq文库的特征分析,特别是多聚腺苷酸化位点的精确量化 | 单细胞RNA-seq文库 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq | Element Aviti | 亲和碱基化学测序技术 |
| 98 | 2025-07-17 |
Unveiling new therapeutic targets for esophageal cancer treatment through single-cell transcriptomics: pH-responsive nanobubbles enhance the efficacy of 125I radiotherapy
2025-Jul-15, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03552-2
PMID:40665303
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2025-10-27 |
Distinct adipose progenitor cells emerging with age drive active adipogenesis
2025-Apr-25, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adj0430
PMID:40273250
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现中年小鼠内脏脂肪中出现独特的脂肪祖细胞亚群CP-A,揭示其通过白血病抑制因子受体信号驱动年龄依赖性脂肪重塑的机制 | 首次鉴定出年龄特异性富集的脂肪祖细胞亚群CP-A,并阐明其通过LIFR信号通路驱动中年期脂肪生成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚不充分 | 探究年龄依赖性脂肪组织重塑的细胞机制 | 小鼠脂肪祖细胞 | 单细胞生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序,谱系追踪,细胞移植,药理学和遗传学操作 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2025-10-27 |
Visualizing Immune Checkpoint Inhibitors Derived Inflammation in Atherosclerosis
2024-Oct-25, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.324260
PMID:39328090
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研究论文 | 本研究使用CCR2靶向放射性示踪剂和PET成像技术,可视化免疫检查点抑制剂引起的动脉粥样硬化炎症反应 | 首次开发非侵入性方法检测ICI治疗引起的动脉粥样硬化炎症,揭示IFNγ信号在其中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体验证 | 探索免疫检查点抑制剂引起动脉粥样硬化的机制并开发可视化检测方法 | Apoe-/-和Ldlr-/-基因敲除小鼠 | 分子影像学 | 心血管疾病 | PET成像、单细胞RNA测序、免疫组化、流式细胞术 | NA | 影像数据、分子数据、单细胞测序数据 | Apoe-/-和Ldlr-/-小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,PET成像 | NA | 64Cu-DOTA-ECL1i PET示踪剂 |