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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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9961 | 2025-10-07 |
ITGB2 and ICAM3 predict increased survival of sepsis with decreased intercellular communication in cytotoxic CD8+ T cells
2025-Apr-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93685-z
PMID:40221459
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别与脓毒症免疫相关的关键基因,发现ITGB2和ICAM3可预测脓毒症生存率增加 | 首次揭示细胞毒性CD8+T细胞中ITGB2、SELL和ICAM3低表达通过减少细胞间通讯不利于脓毒症生存 | 研究样本量有限,仅使用两个GEO数据集和小鼠模型验证 | 识别与脓毒症免疫相关的关键基因 | 脓毒症患者的CD8+T细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, KEGG分析 | NA | 基因表达数据 | GSE167363和GSE54514数据集,加小鼠CLP模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9962 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing characterization of Holstein cattle blood and milk immune cells during a chronic Staphylococcus aureus mastitis infection
2025-Apr-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-96657-5
PMID:40221598
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析荷斯坦奶牛在慢性金黄色葡萄球菌乳腺炎感染期间血液和乳汁免疫细胞的特征 | 首次使用单细胞RNA测序技术同时分析乳腺炎感染期间血液和乳汁中的免疫细胞,揭示了乳腺局部特异性粒细胞簇及其基因特征 | 研究仅涉及三头中期泌乳荷斯坦奶牛,样本量较小 | 研究慢性金黄色葡萄球菌乳腺炎感染期间免疫反应的细胞和分子特征 | 荷斯坦奶牛的血液和乳汁免疫细胞 | 单细胞组学 | 乳腺炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 3头中期泌乳荷斯坦奶牛 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9963 | 2025-10-07 |
Single Molecule Fluorescence In Situ Hybridization Using RNAscope to Study Hematopoietic and Vascular Interactions in the Zebrafish Embryo and Larva
2025-Apr-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5269
PMID:40224667
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研究论文 | 本文介绍了一种使用RNAscope技术优化单分子荧光原位杂交方案,用于研究斑马鱼胚胎和幼体阶段造血干细胞前体与血管的相互作用 | 优化了RNAscope技术在斑马鱼模型中的应用,提高了mRNA检测的灵敏度和空间分辨率,能够可视化深埋在内部器官中的造血生态位 | 主要局限在于技术方法专注于斑马鱼模型,可能在其他物种中的适用性需要进一步验证 | 研究造血干细胞前体如何从血管中出现并在发育生态位中定植的过程 | 斑马鱼胚胎和幼体阶段的造血干细胞前体及其血管生态位 | 空间转录组学 | NA | 单分子荧光原位杂交,RNAscope技术,荧光共聚焦显微镜 | NA | mRNA表达数据,荧光图像 | 斑马鱼胚胎和幼体 | Advanced Cell Diagnostics | 单分子荧光原位杂交,空间转录组学 | RNAscope | RNAscope技术结合高灵敏度mRNA检测和高分辨率荧光共聚焦成像 |
9964 | 2025-10-07 |
TET3 is expressed in prostate cancer tumor-associated macrophages and is associated with anti-androgen resistance
2025-Apr, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03708-w
PMID:39240303
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研究论文 | 本研究探讨TET3在前列腺癌肿瘤相关巨噬细胞中的表达及其对抗雄激素治疗疗效的影响 | 首次发现TET3在前列腺癌肿瘤相关巨噬细胞中特异性表达,并揭示其与抗雄激素治疗敏感性的关联 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证机制 | 研究TET3在前列腺癌中的表达特征及其对抗雄激素治疗疗效的影响 | 前列腺癌组织和肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, CIBERSORT算法, 伪时间分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 1965例前列腺癌病例, 493例正常前列腺组织, 21292个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9965 | 2025-10-07 |
ApoE ε4-dependent Alteration of CXCR3 + CD127+ CD4+ T cells associates with elevated plasma neurofilament light chain in Alzheimer's disease
2025-Apr, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877251320123
PMID:40112322
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研究论文 | 本研究通过单细胞质谱流式技术揭示了阿尔茨海默病患者外周血中CXCR3+CD127+ Th1细胞与神经丝轻链蛋白的负相关性 | 首次发现CXCR3+CD127+ Th1细胞与神经丝轻链的关联具有ApoE ε4依赖性,并揭示了该细胞群在脑脊液与外周血中的差异分布 | 样本量有限,机制研究不够深入,需要进一步验证 | 表征阿尔茨海默病患者外周血适应性免疫细胞组成 | 阿尔茨海默病患者和健康对照的外周血单个核细胞及血浆样本 | 免疫学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞质谱流式技术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质浓度数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞质谱流式, 单细胞RNA测序 | CyTOF | 质谱流式细胞技术分析外周血单个核细胞 |
9966 | 2025-10-07 |
Large Peritoneal Macrophages Play No Role in the Pathogenesis of Postoperative Ileus Induced by Intestinal Manipulation
2025-Apr, Neurogastroenterology and motility
IF:3.5Q2
DOI:10.1111/nmo.14997
PMID:39777769
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞迁移实验证明大腹膜巨噬细胞在术后肠梗阻发病机制中不起作用 | 首次通过单细胞测序和细胞特异性清除技术明确排除了大腹膜巨噬细胞在术后肠梗阻中的作用 | 研究仅关注早期POI阶段,未探讨长期效应或其他潜在机制 | 探究大腹膜巨噬细胞在术后肠梗阻发病机制中的作用 | 小鼠肠道操作模型中的免疫细胞 | 免疫学 | 术后肠梗阻 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, qPCR, 免疫荧光, 细胞过继转移 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9967 | 2025-10-07 |
Asthma-derived genetic signature predicts lung cancer prognosis: a multi-scale omics investigation
2025-Mar-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-24-1697
PMID:40223964
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研究论文 | 通过多组学方法研究哮喘与肺癌的关联,并开发基于哮喘相关基因的肺癌预后模型 | 首次将哮喘相关基因特征应用于肺癌预后预测,结合流行病学、孟德尔随机化和单细胞测序进行多尺度验证 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索哮喘与肺癌的关联并开发预后预测模型 | 哮喘和肺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 全基因组关联研究, 孟德尔随机化, RNA测序, 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 基因组数据, 转录组数据, 流行病学数据 | 1990-2019年全球疾病负担数据及公共数据库样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9968 | 2025-10-07 |
An Efficient Method for Extracting Human Fallopian Tube Epithelia for Single-cell Analyses
2025-Mar-28, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67753
PMID:40228013
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研究论文 | 本文介绍了一种从新鲜输卵管中高效分离上皮细胞用于单细胞分析的方法 | 开发了一种能够在4-6小时内从新鲜输卵管中分离上皮细胞的方法,具有最小的基质细胞污染 | NA | 建立输卵管上皮细胞的有效分离方法 | 人类输卵管上皮细胞 | 单细胞分析 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞悬浮液 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9969 | 2025-02-18 |
Single-cell transcriptome sequencing in synovial joint: insights of new progenitors and targets in joint development and disease
2025-Mar-10, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf008
PMID:39957282
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组测序在滑膜关节中的应用,揭示了关节发育和疾病中的新祖细胞和靶点 | 利用单细胞转录组测序技术,揭示了滑膜关节中不同细胞类型的异质性和相互作用,为关节发育和疾病研究提供了新的视角和策略 | 未提及具体的技术限制或样本量限制 | 研究滑膜关节的发育过程和疾病机制 | 滑膜关节,包括膝关节、颞下颌关节和脊柱关节 | 生物信息学 | 关节炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
9970 | 2025-10-07 |
Disulfiram ameliorates bone loss in ovariectomized mice by suppressing osteoclastogenesis
2025-Mar, Journal of bone and mineral metabolism
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s00774-024-01555-x
PMID:39373772
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研究论文 | 本研究探讨了双硫仑在卵巢切除小鼠模型中改善骨质疏松的作用机制 | 首次在体内证实双硫仑通过抑制破骨细胞生成早期阶段的Tnfrsf11a表达来改善骨丢失 | 研究仅使用小鼠模型,未涉及人类临床试验 | 研究双硫仑在骨质疏松小鼠模型中对破骨细胞生成的影响 | 卵巢切除小鼠模型和原代破骨细胞培养 | 骨代谢研究 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,微计算机断层扫描,骨形态计量分析 | NA | 基因表达数据,影像数据,细胞计数数据 | 卵巢切除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9971 | 2025-10-07 |
Single-Cell Profiling of Tubular Epithelial Cells in Adaptive State in the Urine Sediment of Patients With Early and Advanced Diabetic Kidney Disease
2025-Mar, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2024.11.002
PMID:40225386
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析糖尿病肾病患者尿沉渣中的适应性状态肾小管上皮细胞 | 首次在糖尿病肾病患者尿液中鉴定出适应性状态肾小管上皮细胞,并发现其不同状态比例具有诊断价值 | 样本量有限,仅针对糖尿病肾病患者进行研究 | 探究糖尿病肾病患者尿液中适应性状态肾小管上皮细胞的存在及其临床意义 | 糖尿病肾病患者的尿液样本 | 单细胞组学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 轨迹推断分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
9972 | 2025-10-07 |
Unraveling tumoral heterogeneity and angiogenesis-associated mechanisms of PD-1 and LAG-3 dual inhibition in lung cancers by single-cell RNA sequencing
2025-Mar, Chinese medical journal pulmonary and critical care medicine
DOI:10.1016/j.pccm.2025.02.004
PMID:40226601
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示PD-1和LAG-3双重抑制在肺癌中的抗肿瘤机制 | 首次在肺鳞癌PDX模型中证实PD-1和LAG-3双重抑制的协同抗肿瘤效果,并发现其与肿瘤异质性评分低、MHC I类通路上调和肿瘤血管正常化相关 | 研究仅使用PDX模型,未涉及人体临床试验;对腺癌和小细胞肺癌模型无效 | 阐明PD-1和LAG-3双重抑制在肺癌中的协同抗肿瘤机制 | 肺癌患者来源异种移植模型 | 单细胞测序分析 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析、差异表达基因分析 | 单细胞转录组数据 | 8127个细胞(2699个基底细胞、4109个恶性细胞、1319个上皮细胞) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9973 | 2025-10-07 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing data: unveiling RNA methylation and autophagy-related signatures in chronic obstructive pulmonary disease patients
2025-02-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-87437-2
PMID:39893187
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序数据,揭示了慢性阻塞性肺疾病中RNA甲基化和自噬相关特征 | 首次系统整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据研究COPD中RNA甲基化与自噬的关联,发现FTO和IGF2BP2作为关键RNA甲基化调控因子在巨噬细胞中表达下调 | 研究主要基于公共数据库数据,部分发现需要通过动物模型验证,样本来源和数量有限 | 研究RNA甲基化调控因子及其与自噬在COPD发病机制中的作用 | COPD患者和非COPD患者的肺组织样本,COPD小鼠模型 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 流式细胞术 | 逻辑回归, WGCNA, 基因集富集分析 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的COPD和非COPD患者样本,具体数量未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9974 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis reveals the tumor suppressor role of macrophage signature gene FCER1G in hepatocellular carcinoma
2025-02-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88071-8
PMID:39893200
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和基因组分析揭示巨噬细胞特征基因FCER1G在肝细胞癌中的肿瘤抑制作用 | 首次系统性地识别巨噬细胞相关特征基因并构建基于LASSO回归的预后预测模型,发现FCER1G在HCC中的肿瘤 suppressor 功能 | 样本量较小(仅7个HCC样本),未发现MSI和TMB评分的显著差异 | 探索肝细胞癌中巨噬细胞特征基因及其对患者预后的影响 | 肝细胞癌患者样本和巨噬细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,基因组分析,主成分分析,t-SNE降维,LASSO回归 | LASSO回归模型 | 单细胞测序数据,基因组数据 | 7个HCC样本(来自GEO数据库),TCGA-LIHC队列验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9975 | 2025-10-07 |
MSC-EVs and UCB-EVs promote skin wound healing and spatial transcriptome analysis
2025-02-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-87592-6
PMID:39893214
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研究论文 | 本研究探讨间充质干细胞来源细胞外囊泡和脐带血来源细胞外囊泡通过调节关键信号通路促进皮肤伤口愈合和减少瘢痕形成的机制 | 首次结合空间转录组学技术系统分析两种来源细胞外囊泡对皮肤伤口愈合过程中细胞异质性和信号通路的调控作用 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体临床试验验证 | 探究细胞外囊泡促进皮肤伤口愈合和减少瘢痕形成的分子机制 | 人真皮成纤维细胞和小鼠皮肤伤口模型 | 空间转录组学 | 皮肤创伤 | 超速离心法、透射电镜、纳米颗粒追踪分析、Western blot、细胞划痕实验、细胞迁移实验、细胞增殖实验、空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、组织学图像、细胞实验数据 | 小鼠皮肤组织样本(分组对照) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
9976 | 2025-10-07 |
Vascular smooth muscle cell-derived SO2 sulphenylated interferon regulatory factor 1 to inhibit VSMC senescence
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1516885
PMID:40223932
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研究论文 | 本研究揭示了内源性二氧化硫通过亚磺酰化干扰素调节因子1抑制血管平滑肌细胞衰老的分子机制 | 首次发现SO2通过IRF1蛋白C83位点的亚磺酰化修饰抑制VSMC衰老的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,人类临床相关性需要进一步验证 | 探索内源性SO2在血管平滑肌细胞衰老中的作用及其分子通路 | 老年小鼠、VSMC特异性AAT1敲除小鼠、D-半乳糖处理的主动脉环和大鼠VSMC系A7r5 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | Western blot、单细胞RNA测序、实时定量PCR、SA-β-gal染色、生物素转换实验、定点突变 | NA | 蛋白质表达数据、基因表达数据、细胞染色数据 | 老年小鼠(24月龄)、基因修饰小鼠模型、细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9977 | 2025-10-07 |
Bioinformatic Analysis of Apoptosis-Related Genes in Preeclampsia Using Public Transcriptomic and Single-Cell RNA Sequencing Datasets
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S507660
PMID:40224388
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研究论文 | 通过公共转录组和单细胞RNA测序数据分析先兆子痫中凋亡相关基因及其细胞机制 | 首次结合转录组学和单细胞RNA测序技术系统分析先兆子痫中凋亡相关基因,并构建诊断列线图 | 所有数据均来自公共数据库,需进一步实验验证 | 探索先兆子痫中凋亡相关基因作为生物标志物的潜力及其细胞机制 | 先兆子痫患者胎盘组织 | 生物信息学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, RT-qPCR | CytoHubba算法, 诊断列线图 | 基因表达数据 | 公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
9978 | 2025-10-07 |
Causal Associations of Inflammatory Cytokines With Osteosarcopenia: Insights From Mendelian Randomization and Single Cell Analysis
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/6005225
PMID:40224485
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析炎症细胞因子与骨少肌症的因果关系 | 首次整合孟德尔随机化和单细胞RNA测序方法研究细胞因子在骨少肌症中的因果作用 | 研究结果为初步发现,需要进一步研究验证 | 阐明循环细胞因子在骨少肌症发病机制中的因果作用 | 骨少肌症(骨质疏松和肌肉减少症共存)患者 | 生物医学研究 | 老年疾病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 | 两样本孟德尔随机化 | 基因组关联研究数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个队列的公开GWAS数据,分析91种循环细胞因子 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9979 | 2025-10-07 |
Mendelian Randomization Combined with Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals the Role of the Key Gene PCLAF in the Pathogenesis of Atopic Dermatitis
2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S506139
PMID:40225314
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研究论文 | 结合孟德尔随机化和单细胞转录组分析揭示PCLAF基因在特应性皮炎发病机制中的关键作用 | 首次将孟德尔随机化与单细胞转录组分析相结合,系统性地识别特应性皮炎的关键致病基因和代谢通路 | 研究结果需要进一步实验验证,样本来源和数量可能存在限制 | 探索特应性皮炎的遗传和代谢分子机制 | 特应性皮炎相关的基因和细胞类型 | 生物信息学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 孟德尔随机化, 基因集富集分析 | edgeR, Seurat | 基因表达数据, eQTL数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
9980 | 2025-10-07 |
Targeting formyl peptide receptor 2 to suppress neuroinflammation in neuromyelitis optica spectrum disorder
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.107303
PMID:40225578
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研究论文 | 本研究探讨了甲酰肽受体2(FPR2)在视神经脊髓炎谱系障碍(NMOSD)神经炎症中的作用及其治疗潜力 | 首次揭示FPR2/mFpr2通过调控小胶质细胞活性参与NMOSD神经炎症的新机制 | 研究主要基于动物模型,人类样本验证有限 | 研究FPR2在NMOSD神经炎症中的作用及FPR2拮抗剂的治疗潜力 | NMOSD患者外周血样本和NMOSD小鼠模型 | 神经免疫学 | 视神经脊髓炎谱系障碍 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,MRI,免疫染色 | NA | 基因表达数据,影像数据,细胞计数数据 | NMOSD患者和健康对照的外周血样本,NMOSD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |