单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
9961 2024-08-04
The progenitor basis of cortical projection neuron diversity
2023-08, Current opinion in neurobiology IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了不同类型的神经祖细胞如何产生皮层投射神经元的多样性。 创新点在于通过细胞类型解析的追踪方法来理解神经祖细胞在投射神经元多样性中的作用。 目前关于中间祖细胞在投射神经元多样性中的角色仍然研究不足。 研究神经祖细胞如何产生皮层投射神经元的多样性和层级组织。 主要研究对象为辐射胶质细胞和中间祖细胞。 神经科学 NA 细胞类型解析遗传命运追踪,轴突追踪,空间转录组学 NA NA NA
9962 2024-08-05
Protective Renalase Deficiency in β-Cells Shapes Immune Metabolism and Function in Autoimmune Diabetes
2023-08-01, Diabetes IF:6.2Q1
研究论文 本文探讨了肾素缺乏如何影响自身免疫糖尿病中β细胞的免疫代谢和功能 首次揭示了肾素缺乏在移植的β细胞中调节局部免疫细胞代谢和功能的能力 研究仅在小鼠模型中进行,缺乏对人类适用性的验证 本研究旨在了解肾素缺乏对自身免疫糖尿病中β细胞的影响 主要研究对象为小鼠模型中的β细胞和浸润的免疫细胞 数字病理学 1型糖尿病 流式细胞术和单细胞RNA测序 小鼠模型 细胞 NA
9963 2024-08-05
Ezh2 Knockout in B Cells Impairs Plasmablast Differentiation and Ameliorates Lupus-like Disease in MRL/lpr Mice
2023-08, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究评估了EZH2在B细胞中的表达对狼疮病理机制的影响 首次揭示EZH2缺失对浆细胞发育和狼疮样疾病的改善效果 研究主要集中在小鼠模型,临床相关性尚需进一步验证 评估EZH2在B细胞中的角色及其与狼疮发病机制的关系 MRL/lpr小鼠模型中的B细胞和人类狼疮患者的B细胞 数字病理 狼疮 单细胞RNA测序 鼠模型 细胞类型数据 小鼠模型和人类狼疮患者的多样本
9964 2024-08-05
Stimulation of Immune Checkpoint Molecule B and T-Lymphocyte Attenuator Alleviates Experimental Crescentic Glomerulonephritis
2023-08-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 这篇文章探讨了免疫检查点分子BTLA在实验性新月型肾小管肾炎中的作用 这项研究首次揭示BTLA在新月型肾小管肾炎中的保护作用和抗体治疗的潜力 研究主要集中在小鼠模型上,可能在临床应用中存在差异 研究BTLA在新月型肾小管肾炎中的作用及其作为治疗靶点的潜力 BTLA缺陷小鼠和野生型小鼠的实验 免疫学 肾炎 单细胞RNA测序 小鼠模型 生物样本(小鼠模型) 使用BTLA缺陷小鼠和野生型小鼠进行实验,但具体样本量未提及
9965 2024-08-05
Distinct Inflammatory Milieu in Patients With Right Heart Failure
2023-08, Circulation. Heart failure
研究论文 这项研究探讨了右心衰竭患者的循环炎症环境 识别了可预测患者预后的新生物标志物soluble CD163和CXCL12 样本数量较小,且需进一步研究这些分子如何影响心衰表现和疾病进展 了解右心衰竭与肝脏相互作用的机制 包括正常心脏功能的对照组和满足右心衰竭标准的心衰患者 数字病理学 心衰 多重蛋白检测和单细胞RNA测序 NA 血液样本和组织成像 三组患者的血液样本,具体数量未说明
9966 2024-08-05
Spatially patterned 3D model mimics key features of cancer metastasis to bone
2023-08, Biomaterials IF:12.8Q1
研究论文 本文报道了空间模式化的组织工程3D模型,模仿乳腺癌和前列腺癌骨转移的关键特征 提出了一种空间模式化的3D骨转移模型,可以模拟骨特异性侵袭和癌症对骨重塑的诱导性失调 缺乏对这些模型的广泛验证和应用研究 填补缺乏生理相关的体外模型的空白,探索骨转移的生物学 乳腺癌和前列腺癌的骨转移 数字病理学 乳腺癌和前列腺癌 单细胞RNA测序 3D模型 NA NA
9967 2024-08-05
Characterization of altered molecular mechanisms in Parkinson's disease through cell type-resolved multiomics analyses
2023-04-14, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 通过细胞类型解析的多组学分析,揭示帕金森病中改变的分子机制。 首次通过多组学数据整合提供了细胞类型特异性的cREs失调及其对帕金森病相关基因的转录影响。 未具体讨论其他神经退行性疾病的相关性及其影响。 研究帕金森病的细胞类型依赖性转录调控机制。 健康对照者和帕金森病患者的113,207个细胞核样本。 数字病理学 帕金森病 转录组学和表观基因组学 NA 单细胞转录组和表观基因组数据 113,207个细胞核
9968 2024-08-05
Perspectives on Bulk-Tissue RNA Sequencing and Single-Cell RNA Sequencing for Cardiac Transcriptomics
2022, Frontiers in molecular medicine
评论 本文探讨了心脏转录组学中对大规模组织RNA测序和单细胞RNA测序的看法 提出了单细胞测序在心脏功能和衰竭研究中的应用潜力 尚未完全理解心脏内细胞类型之间的复杂相互作用 旨在为使用NGS技术进行转录组研究的研究人员提供入门指南 关注心脏在功能和衰竭中的遗传和转录组贡献 数字病理学 心血管疾病 下一代测序 (NGS) NA NA NA
9969 2024-08-07
Drosophila Voltage-Gated Sodium Channels Are Only Expressed in Active Neurons and Are Localized to Distal Axonal Initial Segment-like Domains
2020-10-14, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
研究论文 本文研究了果蝇电压门控钠通道在神经元中的表达和亚细胞定位,发现这些通道主要在活跃神经元的远端轴突初始段样域中表达。 首次确定了果蝇神经元中动作电位起始的特定位置,即远端轴突段(DAS),并揭示了该位置与电压门控钠通道的富集相关。 研究主要集中在果蝇的神经元上,可能不完全适用于其他类型的神经元或生物体。 确定果蝇神经元中动作电位的起始位置,并探讨其与电压门控钠通道表达的关系。 果蝇的电压门控钠通道及其在神经元中的表达和定位。 神经科学 NA 单细胞转录组测序,全细胞膜片钳电生理记录 NA 转录组数据,电生理数据 胚胎和幼虫中枢神经系统中的神经元,成年中枢神经系统中的神经元
9970 2024-08-05
Second-Strand Synthesis-Based Massively Parallel scRNA-Seq Reveals Cellular States and Molecular Features of Human Inflammatory Skin Pathologies
2020-10-13, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 该文章介绍了一种新的高通量单细胞RNA测序方法,旨在揭示人类炎症性皮肤病的细胞状态和分子特征 文章提出了Seq-Well S方法,通过随机引物二链合成技术提高了转录本捕获和基因检测的效率 由于关注点主要集中在皮肤炎症,可能未能涵盖所有相关的生物学样本和病理特征 研究的目的是开发一种高保真和高通量的单细胞RNA测序平台 研究对象是五种人类炎症性皮肤疾病 数字病理学 炎症性皮肤病 RNA-seq NA NA 五种人类皮肤炎症疾病的样本
9971 2024-08-07
Prospects for Use of Single-Cell Sequencing to Assess DNA Methylation in Asthma
2020-Oct-03, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research IF:2.2Q3
研究论文 本文探讨了单细胞测序技术在评估哮喘中DNA甲基化作用的应用前景 单细胞测序技术能够揭示不同细胞群中基因的甲基化和表达情况,相较于传统的多组学测序,能更好地反映哮喘的发病机制 目前关于哮喘中DNA甲基化的研究较少,且主要使用单细胞测序技术的研究有限 研究单细胞测序技术在揭示哮喘中DNA甲基化功能和调控机制的作用 哮喘中的DNA甲基化 数字病理学 哮喘 单细胞测序 NA 基因组数据 未具体说明样本数量
9972 2024-08-07
Heterogeneous expression of the SARS-Coronavirus-2 receptor ACE2 in the human respiratory tract
2020-Oct, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和免疫组织化学技术,系统研究了人类呼吸道中SARS-CoV-2受体ACE2的表达情况及其与COVID-19严重程度风险因素的关系 首次详细描述了ACE2蛋白在人类呼吸道中的分布,并探讨了其与COVID-19易感性的关系 NA 研究SARS-CoV-2受体ACE2在人类呼吸道中的表达及其与COVID-19严重程度的关系 人类呼吸道中的ACE2蛋白表达 数字病理学 COVID-19 单细胞RNA测序,免疫组织化学 NA 蛋白质 NA
9973 2024-08-05
An optimized protocol for retina single-cell RNA sequencing
2020, Molecular vision IF:1.8Q3
PMID:33088174
研究论文 本研究提出了一种优化的视网膜单细胞RNA测序的协议 提出了一种温和的视网膜解离方法,最大限度减少细胞死亡并保存细胞形态,同时改进计算管道以提高单细胞RNA测序数据的质量 对新鲜与冷冻视网膜在制备细胞或细胞核悬浮液方面的优缺点进行了演示 优化视网膜样本的单细胞RNA测序流程,获得更高质量的转录组数据 小鼠视网膜样本 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA NA 小鼠视网膜样本的数量未明确说明
9974 2024-08-07
Interleukin-36γ-producing macrophages drive IL-17-mediated fibrosis
2019-10-11, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了生物材料植入后巨噬细胞亚群的功能和表型特征,特别是在尿膀胱基质(UBM)和聚己内酯(PCL)植入后的不同组织反应。 本研究首次识别并表征了在体内生物材料诱导的特定巨噬细胞亚群,这些亚群在不同的组织环境中表现出独特的功能和表型特征。 研究主要集中在小鼠模型上,未来研究需要进一步验证这些发现是否适用于人类。 旨在识别和表征生物材料植入后巨噬细胞的功能亚群,并探讨其在组织修复和病理过程中的作用。 研究对象包括生物材料植入后的巨噬细胞亚群及其在不同组织环境中的功能和表型特征。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 研究涉及从小鼠尿膀胱基质(UBM)和聚己内酯(PCL)中分离的巨噬细胞样本。
9975 2024-08-05
Unveiling major histocompatibility complex-mediated pan-cancer immune features by integrated single-cell and bulk RNA sequencing
2024-Aug-10, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和大规模RNA测序揭示了主要组织相容性复合体介导的全癌症免疫特征 开发了MHC转录特征(MHC.sig),并展示其作为普遍性的全癌症抗肿瘤免疫标记的潜力 未提及潜在的局限性 全面探索主要组织相容性复合体在癌症免疫疗法中的作用 分析了663,760个细胞的单细胞RNA测序数据以及30种实体肿瘤类型 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序,Bulk RNA-seq,空间转录组分析 NA RNA测序数据 663,760个细胞和30种实体肿瘤类型
9976 2024-08-07
Corrigendum to "scRNA-Seq and imaging mass cytometry analyses unveil iNKT cells-mediated anti-tumor immunity in pancreatic cancer liver metastasis" [Cancer Lett. (2023 May 1) 561 216149]
2024-Aug-10, Cancer letters IF:9.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
9977 2024-08-04
Blockade of Discoidin Domain Receptor Signaling with Sitravatinib Reveals DDR2 as a Mediator of Neuroblastoma Pathogenesis and Metastasis
2024-Aug-01, Molecular cancer therapeutics IF:5.3Q1
研究论文 本研究揭示了DDR2作为神经母细胞瘤发病机制和转移的介导者。 此文首次定义了DDR2在神经母细胞瘤中的新功能,以及sitravatinib作为其治疗剂的潜力。 研究仅在特定的肿瘤模型中进行,可能无法全面反映在临床中的效果。 研究sitravatinib对神经母细胞瘤的影响及其作用机制。 主要研究对象为神经母细胞瘤及其相关的受体酪氨酸激酶。 数字病理学 神经母细胞瘤 NA 肿瘤模型 单细胞测序数据 使用了不同的肿瘤相关模型,包括转基因小鼠和人类异种移植
9978 2024-08-04
Spatial enrichment and genomic analyses reveal the link of NOMO1 with amyotrophic lateral sclerosis
2024-Aug-01, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
研究论文 本研究揭示了NOMO1与运动神经元疾病(ALS)之间的关联 使用Entropy加权的差异基因表达矩阵工具SpatialE,首次在运动皮层中识别ALS相关基因的空间富集 本研究主要依赖于有限的样本量及特定脑区的分析,未能全面涵盖所有与ALS相关的区域 旨在研究运动皮层中ALS相关基因的空间分布和与ALS风险的关系 本研究分析了6814名ALS患者和3324名对照的基因组数据 数字病理学 运动神经元疾病 全基因组测序和空间转录组学 NA 基因组数据和转录组数据 6814名ALS患者和3324名对照
9979 2024-08-05
Synovial 5-Lipoxygenase-Derived Oxylipins Define a Lympho-Myeloid-Enriched Synovium
2024-Aug, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究探讨了合成的氧脂类在炎症关节中的作用及其与血浆中的氧脂类的关系 本研究首次揭示了滑膜5-脂氧合酶衍生的氧脂类在淋巴-骨髓丰富的滑膜中的高表达 研究样本数量较小,可能影响结果的广泛适用性 确定滑膜氧脂类在炎症关节与血浆氧脂类及滑膜组织学模式的相关性 确诊的类风湿关节炎或银屑病关节炎患者的滑膜组织和血浆样本 数字病理学 风湿性关节炎 液相色谱串联质谱 NA 血浆和滑膜组织样本 32个滑膜组织样本和26个配对血浆样本
9980 2024-08-05
Molecular Pathways and Cellular Subsets Associated with Adverse Clinical Outcomes in Overlapping Immune-Related Myocarditis and Myositis
2024-Aug-01, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 该研究探讨了与免疫相关心肌炎和肌炎不良临床结果相关的分子通路和细胞亚群 本研究通过单细胞RNA测序揭示了心肌炎和肌炎中的细胞亚群及其潜在的分子机制,提出了新的治疗靶点 样本量相对较小,仅包含10例重叠心肌炎和肌炎患者 探索免疫检查点疗法引起的心肌炎和肌炎背后的分子机制 心肌炎和肌炎患者的心脏和骨骼肌活检样本 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 细胞样本 总共20个样本(心肌炎与肌炎重叠患者10个,心肌炎单独患者1个,控制组9个)
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