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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
9941 2025-10-06
Immunoregulatory Endothelial Cells Interact With T Cells After Myocardial Infarction
2025-Aug-29, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 本研究揭示了心肌梗死后心脏内皮细胞通过形成免疫调节表型调控T细胞活化的新机制 首次发现心肌梗死后出现的CD45+CD11b+Cdh5+免疫调节内皮细胞表型及其通过MHC-II和细胞因子调控T细胞活化的功能 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 探究心肌梗死后内皮细胞的免疫调节功能及其机制 小鼠心肌梗死模型中的内皮细胞和T细胞 单细胞生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 骨髓移植, 谱系追踪 基因敲除小鼠模型 单细胞基因表达数据, 空间定位数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
9942 2025-10-06
Bacterial Infections Shape Cardiac Macrophages' Response to Ischemia
2025-Aug-29, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 本研究探讨细菌感染如何通过改变心脏巨噬细胞的特性来增强后续心肌缺血损伤的炎症反应 首次发现细菌感染诱导心脏巨噬细胞形成两个具有不同功能特征的新亚群,并证明这些变化会加剧后续缺血损伤的炎症反应 研究主要基于动物模型,在人类中的适用性需要进一步验证 探究细菌感染对心脏先天免疫细胞的长期影响及其在后续心肌缺血中的作用机制 心脏髓系细胞、外周白细胞、造血干细胞和祖细胞 免疫学 心血管疾病 流式细胞术、单细胞RNA测序、纳米颗粒介导的RNA干扰 遗传命运图谱模型 单细胞转录组数据、流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
9943 2025-10-06
StemDriver: a knowledgebase of gene functions for hematopoietic stem cell fate determination
2024-Jan-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 介绍了一个专门用于造血干细胞命运决定基因功能注释的综合知识库StemDriver 整合了42项研究的单细胞RNA测序数据,构建了从胚胎期到成年期的全面造血谱系图谱 NA 建立造血干细胞命运决定相关基因功能的知识库 人类和小鼠的造血干细胞及其分化谱系 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 整合42项研究数据,涵盖14种组织类型,评估人类23,839个基因和小鼠29,533个基因 NA 单细胞RNA-seq NA NA
9944 2025-10-06
Amyloid-beta and tau pathologies act synergistically to induce novel disease stage-specific microglia subtypes
2022-12-17, Molecular neurodegeneration IF:14.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了淀粉样蛋白-β和tau病理在阿尔茨海默病进展中协同诱导新型疾病阶段特异性小胶质细胞亚型 首次发现Aβ和tau病理协同作用在疾病不同阶段诱导特异性小胶质细胞亚型EADAM和LADAM,并鉴定Siglec基因作为AD进展的生物标志物 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需扩展 探究阿尔茨海默病中Aβ和tau病理如何协同调控小胶质细胞亚型 AD模型小鼠的小胶质细胞及人类颞上回和内嗅皮层组织 单细胞基因组学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序, snRNA-Seq NA 单细胞转录组数据 AD模型小鼠及不同Braak分期的人类脑组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9945 2025-10-06
Spatial isoform sequencing at sub-micrometer single-cell resolution reveals novel patterns of spatial isoform variability in brain cell types
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了亚微米单细胞分辨率空间异构体测序技术Spl-ISO-Seq2,揭示了小鼠大脑细胞类型中新的空间异构体变异模式 开发了220nm点大小和500nm分辨率的Spl-ISO-Seq2技术及配套分析软件,首次在单细胞分辨率实现空间异构体测序 技术仍处于发展阶段,仅在小鼠脑组织中进行验证,尚未在其他组织或物种中广泛应用 研究大脑细胞类型中空间异构体的变异模式 成年小鼠大脑组织 空间转录组学 NA 空间长读长测序,异构体测序 NA 空间转录组数据,异构体表达数据 成年小鼠大脑组织样本 NA 空间异构体测序 Spl-ISO-Seq2 220nm点大小,500nm分辨率空间异构体测序平台
9946 2025-10-06
Monocyte Single-Cell Multimodal Profiling in Cardiovascular Disease Risk States
2024-Aug-30, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 通过单细胞多组学技术对心血管疾病风险状态下单核细胞进行综合表征 首次采用CITE-seq和单细胞RNA测序相结合的多模态方法,系统揭示单核细胞的高度异质性及其在心血管疾病风险状态下的变化 研究主要关注特定心血管疾病风险因素,未涵盖所有可能的病理条件 探索单核细胞在心血管疾病风险状态下的异质性变化和功能特征 437,126个人类单核细胞 单细胞生物学 心血管疾病 CITE-seq, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, 蛋白质表位数据 437,126个单核细胞 NA 单细胞多组学, 单细胞RNA测序 NA NA
9947 2025-10-06
Cytomulate: accurate and efficient simulation of CyTOF data
2023-11-16, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 开发了一种准确高效的CyTOF数据模拟算法Cytomulate 能够捕捉CyTOF数据的多种特征,在整体数据分布学习上优于scDesign2、Splatter等单细胞RNA-seq导向方法和LAMBDA等生成模型 NA 为流式飞行时间质谱数据分析方法的开发和评估提供基础 CyTOF数据 机器学习 NA 流式飞行时间质谱 生成模型 质谱数据 NA NA 质谱流式细胞术 NA NA
9948 2025-10-06
Integrated multidimensional bioinformatics analysis of the molecular mechanisms of ulcerative colitis-associated colorectal cancer and MMP1 as a potential therapeutic target
2025-Sep, Cancer gene therapy IF:4.8Q1
研究论文 通过整合多组学分析研究溃疡性结肠炎相关结直肠癌的分子机制并确定MMP1作为潜在治疗靶点 首次通过孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序相结合,揭示MMP1在UC相关CRC中的保护作用及免疫调节机制 研究依赖于公共数据库数据,需要实验验证 研究溃疡性结肠炎相关结直肠癌的分子机制并识别潜在治疗靶点 溃疡性结肠炎和结直肠癌的分子机制 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序,全基因组关联研究,分子对接 孟德尔随机化分析,蛋白质-蛋白质相互作用网络 基因表达数据,基因组数据 来自GEO、TCGA和GWAS数据库的数据 NA 单细胞RNA测序,多组学分析 NA NA
9949 2025-10-06
Immune signaling mediates stromal changes to support epithelial reprogramming in celiac duodenum
2025-Aug-26, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了乳糜泻十二指肠中免疫信号介导的基质变化如何支持上皮重编程 构建了迄今为止最全面的乳糜泻单细胞RNA测序数据集,揭示了T细胞-髓系细胞-基质细胞-上皮细胞通讯网络在疾病中的作用机制 样本量相对有限(21例活动性乳糜泻和11例对照),且为观察性研究 探究乳糜泻发病机制中细胞间通讯和上皮重编程的分子基础 乳糜泻患者和健康对照的十二指肠组织样本 单细胞转录组学 乳糜泻 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 203,555个细胞,来自21例活动性乳糜泻和11例对照十二指肠样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9950 2025-10-06
Gut commensal microbiota drive tailored macrophage responses
2025-Aug-26, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析人类巨噬细胞对不同肠道共生菌的响应模式 首次在单细胞水平系统评估人类巨噬细胞对15种主要共生菌的异质性响应,发现特定菌种驱动不同免疫反应 研究基于体外单核细胞来源的巨噬细胞模型,可能与体内组织驻留巨噬细胞存在差异 探究肠道共生菌如何调控巨噬细胞的免疫反应特性 人类单核细胞来源的巨噬细胞和15种主要肠道共生菌 免疫学 肠道疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 74,476个巨噬细胞 NA 单细胞RNA测序 NA 多重单细胞RNA测序
9951 2025-10-06
A human-specific enhancer fine-tunes radial glia potency and corticogenesis
2025-Jul, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究揭示了人类特异性增强子HARE5通过调控神经祖细胞增殖和神经发生能力来精细调节大脑皮层发育和连接 首次证明人类特异性增强子HARE5通过放大经典WNT信号通路调控神经祖细胞行为,促进大脑皮层扩张 研究主要依赖基因编辑动物模型和类器官,与真实人类大脑发育存在差异 探索人类加速区域HARs在物种特异性大脑皮层发育中的功能作用 基因编辑小鼠模型、灵长类模型、人类和黑猩猩神经祖细胞、皮层类器官 发育生物学 NA 单细胞RNA测序、基因组编辑、活体成像、谱系分析 NA 基因表达数据、成像数据、电生理数据 多种基因编辑动物模型和细胞模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9952 2025-10-06
METI: deep profiling of tumor ecosystems by integrating cell morphology and spatial transcriptomics
2024-Aug-25, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 开发了一种整合细胞形态和空间转录组学的肿瘤生态系统深度分析框架METI 首次将空间转录组学、细胞形态学和基因特征整合到端到端分析框架中,无需匹配单细胞RNA测序数据 未明确说明样本量的具体数量和研究设计的局限性 开发能够增强肿瘤微环境中细胞相互作用理解的分析工具 胃癌、肺癌、膀胱癌肿瘤组织及癌前组织 数字病理学 多癌种肿瘤 空间转录组学 深度学习模型 空间转录组数据、细胞形态数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
9953 2025-10-06
Single-cell Mayo Map (scMayoMap): an easy-to-use tool for cell type annotation in single-cell RNA-sequencing data analysis
2023-10-20, BMC biology IF:4.4Q1
研究论文 开发了一个名为scMayoMap的易于使用的单细胞RNA测序数据细胞类型注释工具及其配套数据库 构建了全面的细胞标记物数据库scMayoMapDatabase,并开发了无需标记训练数据集或预定义细胞亚群标记物的用户友好注释工具 未在摘要中明确说明研究的局限性 开发准确且用户友好的单细胞RNA测序数据细胞类型注释工具 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 48个独立的单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9954 2025-10-06
Single-cell transcriptomics and cell-specific proteomics reveals molecular signatures of sleep
2022-08-19, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 通过单细胞转录组学和细胞特异性蛋白质组学揭示睡眠的分子特征 首次结合单细胞RNA测序和细胞类型特异性蛋白质组学技术系统研究睡眠分子机制 仅研究了三个脑区,未覆盖全脑所有区域;样本量未明确说明 探索睡眠调控的分子机制 脑干、皮层和下丘脑中的不同细胞类型(星形胶质细胞和神经元) 生物信息学 NA 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 磷酸化蛋白质组学 NA 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 磷酸化数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 NA NA
9955 2025-10-06
Single-cell immunomics reveals the immunological hallmarks about the onset and different outcomes for ankylosing spondylitis patients
2025-Sep, Clinical rheumatology IF:2.9Q2
研究论文 通过单细胞免疫组学揭示强直性脊柱炎发病和不同预后的免疫学特征 首次通过单细胞RNA测序结合TCR/BCR分析系统揭示AS不同病程阶段的免疫细胞克隆扩增模式和V(D)J基因使用特征 样本量有限,未包含其他免疫细胞类型的深入分析 探索强直性脊柱炎发生发展和不同预后的免疫学机制 健康供者和不同病程阶段AS患者的外周血单个核细胞 单细胞组学 强直性脊柱炎 单细胞RNA测序,T细胞受体分析,B细胞受体分析 NA 单细胞转录组数据,免疫受体序列数据 健康供者和不同病程阶段AS患者的外周血单个核细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9956 2025-10-06
Semaglutide ameliorates retinal vascular permeability destruction in diabetic retinopathy by AnxA2-mediated MMP-9 activation and basement membrane remodeling
2025-Sep, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
研究论文 本研究揭示索马鲁肽通过上调AnxA2激活MMP-9改善糖尿病视网膜病变中基底膜增厚和血管通透性破坏的分子机制 首次发现索马鲁肽通过AnxA2-MMP-9信号轴改善糖尿病视网膜病变,揭示了其不依赖血糖控制的血管保护作用 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 探究索马鲁肽在糖尿病视网膜病变中的治疗机制 2型糖尿病小鼠模型的视网膜组织 数字病理学 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序,蛋白质组学,免疫荧光,免疫组化,Western blot,透射电镜 NA 图像,文本 糖尿病小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9957 2025-10-06
Multi-omics identification of circulating protein biomarkers for intervertebral disc degeneration using Mendelian randomization and scRNA-seq
2025-Sep, Clinical rheumatology IF:2.9Q2
研究论文 本研究通过整合多组学方法识别与椎间盘退变相关的循环蛋白生物标志物 首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序识别椎间盘退变的因果循环蛋白标志物 需要进一步的体内验证研究来确认临床相关性和治疗适用性 识别与椎间盘退变因果相关的循环蛋白生物标志物 椎间盘退变患者和健康个体的循环蛋白及椎间盘组织 生物信息学 椎间盘退变 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 机器学习 机器学习分类模型 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据 4907个循环蛋白的蛋白质组数据, FinnGen队列数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9958 2025-10-06
NFATC3 enhances osteosarcoma progression by increasing PD-L1 and CXCL2 levels
2025-Jul-29, Medical oncology (Northwood, London, England)
研究论文 本研究探讨了NFATC3基因通过增加PD-L1和CXCL2表达促进骨肉瘤进展的机制 首次揭示NFATC3通过调控PD-L1配体和炎症因子表达促进骨肉瘤进展,并发现其在肿瘤微环境T细胞和巨噬细胞中的高表达 研究主要基于细胞系实验,缺乏体内动物模型验证 探究NFATC3基因在骨肉瘤中的表达及其对肿瘤进展的影响机制 骨肉瘤细胞系(143B、SJSA、HOS、MG63、MNNG)和肿瘤微环境中的免疫细胞 肿瘤免疫学 骨肉瘤 qRT-PCR、单细胞测序、肿瘤细胞与巨噬细胞共培养系统 细胞系模型 基因表达数据、单细胞测序数据 5种骨肉瘤细胞系和多个骨肉瘤测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9959 2025-10-06
Dissecting the immune landscape in pediatric high-grade glioma reveals cell state changes under therapeutic pressure
2025-May-20, Cell reports. Medicine
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析儿童高级别胶质瘤免疫景观 首次全面揭示儿童高级别胶质瘤免疫微环境在治疗压力下的细胞状态变化,并与成人胶质瘤进行对比 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 解析儿童高级别胶质瘤免疫微环境特征及其在治疗过程中的变化 儿童弥漫性高级别胶质瘤和高级别室管膜瘤患者的恶性细胞、髓系细胞和T细胞 数字病理学 脑肿瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间转录组数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
9960 2025-10-06
Central control of dynamic gene circuits governs T cell rest and activation
2025-Jan, Nature IF:50.5Q1
研究论文 通过CRISPR筛选和单细胞转录组学揭示MED12调控T细胞静息与激活状态转换的动态基因回路 发现约90%的IL-2Rα调控因子在不同细胞类型和刺激状态下具有可变效应,其中MED12作为动态协调者通过COMPASS复合物控制组蛋白甲基化 研究主要聚焦于CD4 T细胞,未涵盖其他免疫细胞类型 阐明T细胞在不同状态下维持身份和响应环境信号的动态基因调控机制 原代人CD4 T细胞 基因调控网络 免疫相关疾病 CRISPR筛选, 单细胞转录组学, 免疫沉淀-质谱分析 NA 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 多种原代人CD4 T细胞环境 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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