单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
9941	2024-08-14	Single-cell transcriptomic analysis uncovers heterogeneity in the labial gland microenvironment of primary Sjögren's syndrome 2024-Dec, Journal of translational autoimmunity IF:4.7Q2 DOI:10.1016/j.jtauto.2024.100248 PMID:39131726	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了原发性干燥综合征患者唇腺微环境的细胞和分子机制	揭示了唇腺微环境中上皮细胞分化减少和干扰素信号通路增强等新的细胞功能变化	样本量较小，仅包括三名患者和三名健康对照	探究原发性干燥综合征唇腺微环境的细胞和分子机制	原发性干燥综合征患者的唇腺细胞	数字病理学	自身免疫疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	32,337个细胞，来自三名原发性干燥综合征患者和三名健康个体
9942	2024-08-14	Tailored endothelialization enabled by engineered endothelial cell vesicles accelerates remodeling of small-diameter vascular grafts 2024-Nov, Bioactive materials IF:18.0Q1 DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.07.006 PMID:39131628	研究论文	本文通过应用工程化内皮细胞囊泡来伪装血管移植物，以增强血管重塑，从而创建具有定制化内皮化的微小直径血管移植物（SDVG）。	本文创新性地通过代谢糖工程将叠氮基团修饰的工程化内皮细胞囊泡（ECVs-N）精确连接到PCL-DBCO制成的血管移植物上，形成ECVG，有助于抑制血小板粘附和激活，促进内皮细胞粘附并增强抗炎作用。	NA	研究目的是通过工程化内皮细胞囊泡实现微小直径血管移植物的定制化内皮化，以克服传统血管移植物的局限性。	研究对象是微小直径血管移植物（SDVG）及其内皮化过程。	生物工程	心血管疾病	代谢糖工程，点击化学	NA	单细胞转录组数据	具体样本数量未在摘要中提及
9943	2024-08-14	Novel prognostic alternative splicing events in colorectal Cancer: Impact on immune infiltration and therapy response 2024-Sep-30, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112603 PMID:39043103	研究论文	本研究旨在全面分析结直肠癌（CRC）中的选择性剪接（AS）特征，并阐明其与CRC免疫微环境的关系	本研究首次构建了一个包含15个AS事件的预测模型，并揭示了BCAS1作为ANO7\|58341\|AT剪接事件潜在调控因子的作用	NA	全面分析结直肠癌中的选择性剪接特征及其与免疫微环境的关系	结直肠癌患者的转录组数据、临床信息和AS事件的PSI值	数字病理学	结直肠癌	单细胞测序	Cox比例风险模型	转录组数据	CRC患者的数据来自TCGA和TCGA SpliceSeq数据库
9944	2024-08-14	TIM-3/CD68 double-high expression in Glioma: Prognostic characteristics and potential therapeutic approaches 2024-Sep-30, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112665 PMID:39002523	研究论文	本研究探讨了TIM-3和CD68在胶质瘤中的表达及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力	发现TIM-3在胶质瘤中的表达主要集中在巨噬细胞上，与CD68的双高表达可能成为胶质瘤的新升级标志物	NA	寻找胶质瘤中的有价值的免疫治疗靶点，并探索潜在的免疫治疗策略	TIM-3和CD68在胶质瘤中的表达及其与患者生存率的关系	数字病理学	胶质瘤	免疫组织化学(IHC)、多重荧光免疫组织化学(mIHC)、生物信息学分析	NA	单细胞测序数据	187名胶质瘤患者
9945	2024-08-14	Comprehensive transcriptomic analysis of immune-related genes in diabetic foot ulcers: New insights into mechanisms and therapeutic targets 2024-Sep-30, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112638 PMID:39079197	研究论文	本研究通过RNA测序分析糖尿病足溃疡（DFU）中的免疫相关基因表达，探索DFU中免疫相关基因与病理机制的关联	首次系统性地研究了DFU中免疫相关基因的表达差异，并识别了关键的免疫相关基因	样本量较小，且仅限于DFU患者和健康对照组	探索糖尿病足溃疡中免疫相关基因的表达变化及其与病理机制的关系	糖尿病足溃疡患者的伤口活检样本	数字病理学	糖尿病	RNA测序	NA	基因表达数据	10名糖尿病足溃疡患者和11名健康对照
9946	2024-08-14	Single-cell RNA-sequencing analysis reveals α-syn induced astrocyte-neuron crosstalk-mediated neurotoxicity 2024-Sep-30, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112676 PMID:39053230	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了α-突触核蛋白诱导的星形胶质细胞与神经元之间的交叉对话介导的神经毒性机制	首次详细探讨了α-突触核蛋白如何通过增强星形胶质细胞与神经元之间的通信，特别是通过TNF和炎症相关信号通路，导致神经毒性	研究主要基于体外实验和小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现	探讨α-突触核蛋白在星形胶质细胞与神经元交叉对话中的作用及其对神经毒性的影响	α-突触核蛋白、星形胶质细胞、神经元、TNF和炎症相关信号通路	数字病理学	神经退行性疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	使用来自Hua-Syn (A53T)和野生型小鼠的脑前额叶皮层和中脑样本
9947	2024-08-14	Mitoclone2: an R package for elucidating clonal structure in single-cell RNA-sequencing data using mitochondrial variants 2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1 DOI:10.1093/nargab/lqae095 PMID:39131821	research paper	本文介绍了一个名为mitoClone2的R包，用于通过整合单细胞测序实验中发现的线粒体异质性变异来识别克隆群体结构	mitoClone2包提供了与常用克隆结构划分工具的内置兼容性，能够直接使用多重BAM文件作为输入，并包含人类和小鼠线粒体基因组的注释，以及用于调用、过滤、聚类和可视化变异的辅助函数	NA	阐明单细胞RNA测序数据中的克隆结构	单细胞RNA测序数据中的线粒体变异	生物信息学	NA	RNA-seq	NA	基因组数据	NA
9948	2024-08-14	CilioGenics: an integrated method and database for predicting novel ciliary genes 2024-Aug-12, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkae554 PMID:38989623	研究论文	本文开发了一种名为CilioGenics的综合方法和数据库，用于预测人类新的纤毛基因	CilioGenics方法结合了单细胞RNA测序、蛋白质-蛋白质相互作用、比较基因组学、转录因子网络分析和文本挖掘等多种方法，提高了预测纤毛基因的能力	NA	揭示人类纤毛基因的完整列表，以诊断与纤毛相关的人类疾病，即纤毛病	人类纤毛基因	比较基因组学	纤毛病	单细胞RNA测序、蛋白质-蛋白质相互作用、转录因子网络分析、文本挖掘	NA	基因数据	NA
9949	2024-08-14	Cellular dynamics in pig-to-human kidney xenotransplantation 2024-Aug-09, Med (New York, N.Y.) DOI:10.1016/j.medj.2024.05.003 PMID:38776915	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和纵向RNA测序分析，研究了猪到人肾脏异种移植中的细胞动力学和异种移植与受者之间的相互作用。	首次详细描述了异种移植后肾脏和受者外周血单个核细胞的细胞动力学，为优化异种移植结果提供了新的见解。	本文主要集中在细胞和分子层面的分析，未涉及临床结果的长期追踪。	揭示异种移植过程中的细胞动力学和受者免疫反应，以优化异种移植策略。	猪到人肾脏异种移植中的细胞动力学和受者免疫反应。	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和纵向RNA测序	NA	RNA	两例猪到人肾脏异种移植
9950	2024-08-14	Enhanced microglial dynamics and a paucity of tau seeding in the amyloid plaque microenvironment contribute to cognitive resilience in Alzheimer's disease 2024-Aug-05, Acta neuropathologica IF:9.3Q1 DOI:10.1007/s00401-024-02775-1 PMID:39102080	研究论文	本研究探讨了无症状阿尔茨海默病（AsymAD）患者大脑中与认知抵抗相关的机制，发现AsymAD病例中核心斑块增多、纤维状斑块积累减少以及斑块周围微胶质细胞增多，且病理tau聚集较少。	首次揭示了AsymAD病例中斑块微环境中微胶质细胞的高效肌动蛋白细胞运动机制和减少的tau播种活性，这些机制可能保护大脑免受Aβ引发的毒性级联反应。	NA	探究无症状阿尔茨海默病患者大脑中抵抗病理变化和认知衰退的机制。	无症状阿尔茨海默病（AsymAD）患者的大脑组织。	神经科学	阿尔茨海默病	空间转录组学	NA	组织样本	一批无症状阿尔茨海默病（AsymAD）患者的尸检大脑样本
9951	2024-08-14	STdGCN: spatial transcriptomic cell-type deconvolution using graph convolutional networks 2024-Aug-05, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-024-03353-0 PMID:39103939	研究论文	本文介绍了一种利用图卷积网络（STdGCN）进行空间转录组细胞类型反卷积的方法，该方法结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组（ST）数据进行细胞类型鉴定	STdGCN模型在多个数据集上表现优于17种最先进模型，能够准确地描绘肿瘤微环境和组织发育中的细胞交互	NA	开发一种新的方法来提高空间转录组数据的细胞类型分辨率	空间转录组数据中的细胞类型鉴定	数字病理学	乳腺癌，心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组（ST）	图卷积网络（GCN）	转录组数据	多个数据集，包括人类乳腺癌Visium数据集和人类心脏ST数据
9952	2024-08-14	The society for craniofacial genetics and developmental biology 46th annual meeting 2024-08, American journal of medical genetics. Part A DOI:10.1002/ajmg.a.63615 PMID:38563316	会议报告	第46届颅面遗传学和发育生物学学会年会在辛辛那提儿童医院医疗中心举行，重点讨论了颅面发育、人类遗传学、转化和再生方法以及临床管理的新发现	NA	NA	NA	NA	发育生物学	NA	空间转录组学	NA	NA	122名参会者
9953	2024-08-14	Cohesin composition and dosage independently affect early development in zebrafish 2024-Aug-01, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.202593 PMID:38975838	研究论文	研究探讨了斑马鱼中 cohesin 复合体的组成和剂量对早期发育的独立影响	首次展示了斑马鱼中 rad21 或 stag2b 突变体独立影响胚胎尾芽发育，并揭示了 cohesin 的组成和剂量变化对发育的独立影响	研究主要集中在斑马鱼模型上，可能需要进一步的人类细胞或临床数据来验证这些发现	探究 cohesin 复合体的组成和剂量变化对斑马鱼早期发育的独立影响	斑马鱼中的 cohesin 复合体及其突变体	NA	NA	单细胞 RNA 测序	NA	RNA	涉及斑马鱼 rad21 和 stag2b 突变体的胚胎
9954	2024-08-14	Single-Cell RNA Sequencing Identifies WARS1+ Mesenchymal Stem Cells with Enhanced Immunomodulatory Capacity and Improved Therapeutic Efficacy 2024-Aug-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.4049/jimmunol.2300752 PMID:38856632	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，发现WARS1高表达的间充质干细胞具有增强的免疫调节能力和改善的治疗效果	首次揭示WARS1作为间充质干细胞的主要调节因子，通过维持RhoA-Akt轴来调控其免疫调节特性	NA	提高间充质干细胞对银屑病的治疗效果	间充质干细胞及其在银屑病治疗中的应用	数字病理学	银屑病	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
9955	2024-08-14	Novel insights into paclitaxel's role on tumor-associated macrophages in enhancing PD-1 blockade in breast cancer treatment 2024-Jul-15, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-008864 PMID:39009452	研究论文	本研究探讨了紫杉醇（PTX）在三阴性乳腺癌（TNBC）治疗中通过激活肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的TLR4信号通路，增强PD-1阻断剂效果的机制	发现紫杉醇通过激活TAMs中的TLR4信号通路，增强其抗原呈递能力，从而提升CD8+ T细胞的抗肿瘤反应	NA	探究紫杉醇与PD-1阻断剂联合治疗三阴性乳腺癌的机制	三阴性乳腺癌患者及其肿瘤相关巨噬细胞	数字病理学	乳腺癌	空间转录组学、单细胞RNA测序	NA	转录组数据	来自三阴性乳腺癌患者的样本
9956	2024-08-14	Investigation into the role of H2-Ab1 in vascular remodeling in pulmonary arterial hypertension via Bioinformatics 2024-Jul-15, BMC pulmonary medicine IF:2.6Q2 DOI:10.1186/s12890-024-03156-w PMID:39010027	研究论文	本研究通过生物信息学方法探讨H2-Ab1在肺动脉高压血管重塑中的作用	通过WGCNA和差异分析筛选出与肺动脉高压相关的关键基因H2-Ab1，并验证其在肺动脉高压发展中的作用	NA	探索肺动脉高压的生物标志物，以增进对该疾病的理解	H2-Ab1基因在肺动脉高压中的作用	生物信息学	肺动脉高压	WGCNA, 差异分析, qRT-PCR, Western Blot	NA	基因表达数据, 单细胞测序数据	使用GSE49114, GSE180169, GSE154959数据集，涉及906个关键模块基因和576个差异表达基因
9957	2024-08-14	Sex-specific circulating unconventional neutrophils determine immunological outcome of auto-inflammatory Behçet's uveitis 2024-May-04, Cell discovery IF:13.0Q1 DOI:10.1038/s41421-024-00671-2 PMID:38704363	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析、中性粒细胞特异性基因敲除和转移实验，揭示了两种非常规（干扰素-α响应和T细胞调节）中性粒细胞亚群的失调导致男性在自身炎症性Behçet眼炎中的发病率、严重程度和预后较差	首次在单细胞分辨率下识别出正常和自身炎症条件下中性粒细胞组成的广泛性别特异性异质性，并发现非常规中性粒细胞亚群在性别特异性治疗目标中的重要性	NA	研究中性粒细胞在性别特异性炎症疾病中的机制	中性粒细胞及其在自身炎症性Behçet眼炎中的作用	免疫学	自身炎症性疾病	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	NA
9958	2024-08-14	Diabetes Accelerates Steatohepatitis in Mice: Liver Pathology and Single-Cell Gene Expression Signatures 2024-05, The American journal of pathology DOI:10.1016/j.ajpath.2024.01.007 PMID:38309428	研究论文	本研究探讨了糖尿病对非酒精性脂肪性肝炎的影响，并建立了一种新的糖尿病性非酒精性脂肪性肝炎小鼠模型	本研究建立了新的糖尿病性非酒精性脂肪性肝炎模型，并利用单细胞RNA测序分析了糖尿病对肝脏非实质细胞的影响	NA	研究糖尿病如何加速小鼠的非酒精性脂肪性肝炎	C57BL/6J雄性小鼠	NA	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	基因表达	NA
9959	2024-08-14	Age-related dysregulation of the retinal transcriptome in African turquoise killifish 2024-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.02.21.581372 PMID:38559206	研究论文	研究使用非洲蓝绿杀鱼作为模型，通过批量和单细胞RNA测序分析不同年龄组的视网膜转录组变化，揭示与年龄相关的视网膜退行性病变和视觉下降的分子机制	首次在非洲蓝绿杀鱼模型中结合批量和单细胞RNA测序技术，揭示了视网膜细胞类型特异性基因表达的变化，以及与年龄相关的分子通路变化	研究主要集中在分子层面，未来研究需要进一步验证这些分子变化如何影响视网膜的生理功能	探究年龄对视网膜稳态的生理和分子影响，以及这些变化如何导致视觉下降和相关疾病	非洲蓝绿杀鱼的视网膜	数字病理学	视网膜疾病	RNA测序	NA	转录组数据	三个年龄组（6周、12周和18周）的非洲蓝绿杀鱼视网膜样本
9960	2024-08-14	The GATA transcriptional program dictates cell fate equilibrium to establish the maternal-fetal exchange interface and fetal development 2024-Feb-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2310502121 PMID:38346193	研究论文	本文研究了GATA转录因子在胎盘发育中的作用，特别是其在母胎交换界面建立中的关键角色	揭示了GATA2和GATA3在胎盘发育中的协同作用，以及它们在促进滋养层祖细胞向合体滋养层细胞分化中的重要性	NA	探讨GATA转录因子在胎盘发育和母胎交换界面建立中的作用	小鼠和人类的胎盘发育	NA	妊娠失败	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠胚胎和人类滋养层干细胞