单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 27366 篇文献,本页显示第 9941 - 9960 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
9941 2024-08-07
FLT3+ DC inhibits immune rejection via interaction with Treg in liver transplantation
2024-Aug-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 研究探讨了FLT3+ DC在肝脏移植中通过与Treg相互作用抑制免疫排斥的作用 首次揭示了FLT3DCs与调节性T细胞(Tregs)在肝脏移植中的关系,并提出FLT3DCs可能成为减轻肝脏移植免疫排斥的新靶点 NA 研究FLT3DCs在肝脏移植中的免疫调节作用 FLT3+ DCs和调节性T细胞(Tregs) NA 肝脏移植 单细胞测序 NA 细胞 包括肝脏移植患者的外周血样本和肝脏组织,以及肝脏移植小鼠模型
9942 2024-08-07
Akt is a mediator of artery specification during zebrafish development
2024-Aug-05, Development (Cambridge, England)
研究论文 本文研究了蛋白激酶B(Akt)在斑马鱼发育过程中对背主动脉(DA)形成的作用 揭示了Akt激酶在动脉内皮细胞中作为Notch信号通路上游的作用,并参与正确胚胎动脉的形成 NA 探究Akt在斑马鱼胚胎心血管系统中对背主动脉形成的作用 斑马鱼胚胎的背主动脉形成过程 NA 先天性畸形 单细胞RNA测序 NA 图像 四重突变体(aktΔ/Δ)中的akt 1, 2, 3a, 和 3b基因表达和活性显著降低的斑马鱼胚胎
9943 2024-08-07
Huntington's disease cellular phenotypes are rescued non-cell autonomously by healthy cells in mosaic telencephalic organoids
2024-Aug-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过生成含有健康细胞或亨廷顿病(HD)细胞的端脑类器官,探讨了细胞间的非细胞自主机制对HD细胞表型的影响 首次揭示了健康细胞在混合类器官中对HD细胞身份、发育轨迹、突触密度及通信途径的恢复作用 NA 探讨亨廷顿病中细胞间的非细胞自主机制及其对疾病进展和治疗的影响 亨廷顿病细胞与健康细胞在端脑类器官中的相互作用 数字病理学 亨廷顿病 单细胞RNA测序 NA 细胞 NA
9944 2024-08-07
Exploring prognostic DNA methylation genes in bladder cancer: a comprehensive analysis
2024-Aug-02, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究旨在探讨膀胱癌中具有预后DNA甲基化位点的基因状态 利用多种机器学习算法筛选关键基因,并构建Nomogram模型进行预后评估和药物敏感性分析 NA 探索膀胱癌中预后DNA甲基化基因,为预后评估和药物选择提供参考 膀胱癌中的DNA甲基化基因 数字病理学 膀胱癌 甲基化测序 Nomogram 基因组数据 来自公共数据库的膀胱癌bulk转录组测序数据、甲基化数据和单细胞测序数据
9945 2024-08-07
Single-cell tumor heterogeneity landscape of hepatocellular carcinoma: unraveling the pro-metastatic subtype and its interaction loop with fibroblasts
2024-Aug-02, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示了肝细胞癌(HCC)恶性细胞的异质性景观,并识别了促进转移的亚型及其与成纤维细胞的相互作用 首次建立了HCC恶性细胞的异质性景观,并识别了三种不同的肿瘤细胞亚型,包括促进转移的亚型,以及该亚型与成纤维细胞之间的正反馈循环 NA 揭示肝细胞癌肿瘤细胞的异质性及其对肿瘤进展和转移的机制 肝细胞癌(HCC)的肿瘤细胞异质性 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA RNA测序数据 52个单细胞RNA测序数据和5个空间转录组学数据
9946 2024-08-07
Infiltrating lipid-rich macrophage subpopulations identified as a regulator of increasing prostate size in human benign prostatic hyperplasia
2024-Aug-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究通过单细胞RNA测序分析了良性前列腺增生(BPH)中CD45+过渡区的白细胞,发现脂质丰富的巨噬细胞亚群与前列腺体积增大相关 首次定义了BPH中的两种新型免疫亚群,即TREM2+和MARCO+巨噬细胞,并提出这些脂质丰富的巨噬细胞可能加剧大前列腺患者的下尿路症状 需要进一步研究评估针对这些细胞在BPH中的治疗益处 探讨巨噬细胞在良性前列腺增生中的激活状态及其对这种增生性疾病的影响 良性前列腺增生(BPH)中的巨噬细胞亚群及其与前列腺体积增大的关系 数字病理学 前列腺疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 20个人类前列腺样本,包括10个大前列腺(>90克)和10个小前列腺(<40克)
9947 2024-08-07
Refining the optimal CAF cluster marker for predicting TME-dependent survival expectancy and treatment benefits in NSCLC patients
2024-07-21, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据,系统筛选多个数据库,以确定在非小细胞肺癌中区分癌症相关成纤维细胞(CAFs)的最强标记,特别是用于早期诊断、分期和治疗反应评估 首次揭示了CAF标记簇在区分不同肿瘤微环境(TME)组中的独特作用,并确定COL1A1为最有效的CAF标记 研究主要集中在CAFs的异质性和不同成纤维细胞标记在各种样本分析中的使用,这可能导致临床应用中的混淆和障碍 旨在确定用于预测TME依赖性生存预期和治疗效益的最佳CAF集群标记 非小细胞肺癌患者的肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 未具体说明样本数量
9948 2024-08-07
Single-cell transcriptome sequencing reveals SPP1-CD44-mediated macrophage-tumor cell interactions drive chemoresistance in TNBC
2024-Jul, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序分析了三阴性乳腺癌(TNBC)中化疗耐药的机制 首次揭示了SPP1-CD44介导的巨噬细胞与肿瘤细胞相互作用在TNBC化疗耐药中的作用 研究样本量较小,仅包括五个化疗敏感和五个耐药的TNBC患者 探究三阴性乳腺癌化疗耐药的分子机制 三阴性乳腺癌患者的单细胞RNA测序数据 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 10个TNBC患者样本(5个化疗敏感和5个耐药)
9949 2024-08-07
Studying temporal dynamics of single cells: expression, lineage and regulatory networks
2024-Feb, Biophysical reviews IF:4.9Q1
综述 本文综述了利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,通过计算方法研究细胞分化和细胞命运决定的时空动态 总结了轨迹推断(TI)、谱系追踪(LT)和基因调控网络(GRN)推断等不同计算方法的优势和局限 讨论了不同方法的局限性 探讨多细胞器官从单细胞到不同细胞类型的发育过程 研究细胞分化和细胞命运决定 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA
9950 2024-08-07
Renin Cell Development: Insights From Chromatin Accessibility and Single-Cell Transcriptomics
2023-08-04, Circulation research IF:16.5Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
9951 2024-08-07
Systematic comparison of high-throughput single-cell RNA-seq methods for immune cell profiling
2021-Jan-20, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本文系统比较了七种高通量单细胞RNA测序方法在免疫细胞分析中的应用 展示了10x Genomics 5' v1和3' v3方法在mRNA检测灵敏度上的优势,减少了dropout事件,有助于识别差异表达基因和提高单细胞与免疫bulk RNA-seq特征的一致性 单细胞方法在恢复完整转录组方面存在固有限制,由于细胞和转录dropout事件的普遍性,以及样本可用性和异质性先验知识的限制,可能导致数据解释的混淆 评估不同高通量单细胞RNA测序方法在免疫细胞分析中的性能 七种高通量单细胞RNA测序方法在模拟免疫细胞类型和细胞大小异质性的混合样本中的表现 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 21个库,包含两个人类和小鼠淋巴细胞细胞系的混合样本
9952 2024-08-07
STAB: a spatio-temporal cell atlas of the human brain
2021-01-08, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了一个名为STAB的时空细胞图谱数据库,该数据库包含人类大脑多个区域和发育时期的单细胞转录组数据 STAB数据库提供了人类大脑在生命周期中动态细胞组成和分子特征的全面数据,填补了现有研究的空白 NA 旨在阐明大脑的细胞和转录组结构,以理解大脑功能和脑部疾病 人类大脑的细胞组成和转录组结构 数字病理学 神经精神疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 包含42种细胞亚型,跨越20个大脑区域和11个发育时期
9953 2024-08-07
MYC Promotes Bone Marrow Stem Cell Dysfunction in Fanconi Anemia
2021-01-07, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序分析了范可尼贫血患者的造血干细胞和祖细胞,发现MYC的高表达与骨髓衰竭相关,并探讨了MYC抑制剂对FA患者造血干细胞的影响 首次揭示了MYC在范可尼贫血骨髓衰竭中的作用,并通过实验验证了MYC抑制剂对FA患者造血干细胞的潜在治疗效果 研究主要集中在细胞和动物模型上,尚未进行临床试验验证MYC抑制剂的临床应用效果 探讨范可尼贫血患者骨髓衰竭的分子机制及潜在治疗策略 范可尼贫血患者的造血干细胞和祖细胞 NA 范可尼贫血 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 来自范可尼贫血患者的造血干细胞和祖细胞样本
9954 2024-08-07
Bi-FoRe: an efficient bidirectional knockin strategy to generate pairwise conditional alleles with fluorescent indicators
2021-01, Protein & cell IF:13.6Q1
研究论文 本文介绍了一种名为Bi-FoRe的高效双向敲入策略,用于生成带有荧光指示器的成对条件性等位基因 首次报道了通过单一供体生成具有条件性和基因标记双重功能的成对双功能敲入等位基因 NA 开发一种新的策略,用于基因表达标记和基因功能的条件性调控 zebrafish中的sox10和isl1基因座 基因工程 NA CRISPR/Cas系统 NA 基因组数据 NA
9955 2024-08-07
In vitro Targeting of Transcription Factors to Control the Cytokine Release Syndrome in COVID-19
2020-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究系统探索了COVID-19中细胞因子释放综合征(CRS)相关的炎症细胞因子的转录调节因子,以识别可用于治疗目标的候选转录因子(TFs)和已批准的药物 发现了581个显著相关的TF-细胞因子基因相互作用,并识别出19个可作为FDA批准药物靶点的TFs,以及10种药物和25种药物组合在体外抑制细胞因子产生的效果 NA 寻找治疗COVID-19患者细胞因子释放综合征(CRS)的潜在治疗方法 COVID-19患者的细胞因子释放综合征(CRS)及其相关的转录因子 生物医学 COVID-19 单细胞RNA测序 NA RNA 来自COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液细胞
9956 2024-08-07
Structural Variability, Expression Profile, and Pharmacogenetic Properties of TMPRSS2 Gene as a Potential Target for COVID-19 Therapy
2020-12-25, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本文研究了TMPRSS2基因的结构变异性、表达谱和药物遗传学特性,探讨其作为COVID-19治疗潜在靶点的可能性 首次分析了TMPRSS2基因在76个人群中的结构变异性,并发现了与前列腺癌相关的错义突变在不同人群中的分布模式 未提及具体限制 探讨TMPRSS2基因作为COVID-19治疗潜在靶点的可能性 TMPRSS2基因的结构变异性、表达谱和药物遗传学特性 NA COVID-19 单细胞RNA测序 NA 基因组数据 76个人群
9957 2024-08-07
Short-Chain Fatty Acid-Producing Gut Microbiota Is Decreased in Parkinson's Disease but Not in Rapid-Eye-Movement Sleep Behavior Disorder
2020-Dec-08, mSystems IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过16S rRNA测序分析了26名快速眼动睡眠行为障碍(iRBD)患者和137名对照组的肠道微生物群,并与223名帕金森病(PD)患者的肠道微生物群进行了比较,发现短链脂肪酸(SCFA)产生菌在PD患者中减少,而在iRBD患者中未见显著减少。 首次对iRBD患者的肠道微生物群进行了大规模分析,并与PD患者的肠道微生物群进行了比较,揭示了SCFA产生菌在两种疾病中的不同变化。 研究样本主要来自日本和德国,可能存在地域偏差;仅分析了肠道微生物群的组成,未探讨其功能。 探讨帕金森病和快速眼动睡眠行为障碍患者肠道微生物群的差异及其与疾病发展的关系。 帕金森病和快速眼动睡眠行为障碍患者的肠道微生物群。 NA 帕金森病 16S rRNA测序 NA 微生物群数据 26名iRBD患者,137名对照组,223名PD患者
9958 2024-08-07
Single-cell RNA-Seq reveals the transcriptional landscape and heterogeneity of skin macrophages in Vsir-/- murine psoriasis
2020, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术,揭示了Vsir-/-小鼠银屑病皮肤中巨噬细胞的转录组图谱和异质性 首次全面展示了Vsir psoriatic小鼠皮肤免疫细胞的单细胞景观,揭示了银屑病皮肤巨噬细胞的转录组图谱和表型异质性,并识别了其基因表达特征 NA 研究Vsir-/-小鼠银屑病皮肤炎症中涉及的免疫细胞亚群 Vsir psoriatic小鼠的皮肤免疫细胞 数字病理学 银屑病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 23,258个细胞
9959 2024-08-07
More than one antibody of individual B cells revealed by single-cell immune profiling
2019, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞免疫图谱技术,揭示了个体B细胞中存在多种抗体的可能性 发现了单个B细胞中存在多种Ig特异性的现象,挑战了传统的“一个细胞一个抗体”规则和CSR机制 NA 验证和定义单细胞转录组水平上的经典免疫学概念 B细胞及其产生的抗体 免疫学 NA Chromium单细胞免疫图谱技术和Sanger测序 NA 转录组 数百至数千个单个B细胞
9960 2024-08-07
Revealing the crucial roles of suppressive immune microenvironment in cardiac myxoma progression
2024-Aug-02, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序分析了心脏粘液瘤组织中的75,641个细胞,揭示了粘液瘤细胞的异质性及其与免疫细胞的相互作用 首次通过单细胞测序技术详细描述了心脏粘液瘤细胞的组成及其与免疫细胞的相互作用 NA 探究心脏粘液瘤的细胞组成及其与免疫微环境的相互作用 心脏粘液瘤组织中的细胞 数字病理学 心脏疾病 单细胞测序 NA 细胞 75,641个细胞
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