单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9941 - 9960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9941 | 2025-10-07 |
The Loss of PPARγ Expression and Signaling Is a Key Feature of Cutaneous Actinic Disease and Squamous Cell Carcinoma: Association with Tumor Stromal Inflammation
2024-08-15, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13161356
PMID:39195246
|
研究论文 | 本研究通过分析PPARγ缺陷小鼠的转录组变化，揭示了PPARγ在皮肤光化性疾病和鳞状细胞癌中的关键抑制作用 | 首次通过单细胞测序证实PPARγ缺失导致肿瘤基质炎症变化，并发现PPAR信号通路是光化性角化病和皮肤鳞状细胞癌中最受抑制的经典通路 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究PPARγ在皮肤炎症和癌变过程中的作用机制 | PPARγ缺陷小鼠、人类和小鼠的光化性角化病及皮肤鳞状细胞癌样本 | 癌症生物学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞测序, 转录组分析, 基因集富集分析 | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据 | PPARγ缺陷小鼠模型及公共数据库中的人类和小鼠AKs、SCCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 9942 | 2025-10-07 |
Macrophages protect against sensory axon degeneration in diabetic neuropathy
2024-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.30.577801
PMID:38352324
|
研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞在糖尿病神经病变中对感觉轴突退化的保护作用 | 首次发现CCR2+巨噬细胞在糖尿病神经病变早期浸润神经并具有神经保护功能，延迟轴突退化 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探究炎症反应在糖尿病周围神经病变发病机制中的作用 | 高脂高果糖饮食诱导的糖尿病小鼠模型 | 神经科学 | 糖尿病神经病变 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9943 | 2025-10-07 |
Toll-Like Receptor 4 Agonist Injection With Concurrent Radiotherapy in Patients With Metastatic Soft Tissue Sarcoma: A Phase 1 Nonrandomized Controlled Trial
2023-12-01, JAMA oncology
IF:22.5Q1
DOI:10.1001/jamaoncol.2023.4015
PMID:37824131
|
研究论文 | 评估TLR4激动剂GLA-SE联合放疗治疗转移性软组织肉瘤的安全性、疗效和免疫调节作用 | 首次在转移性软组织肉瘤患者中研究瘤内注射TLR4激动剂GLA-SE联合放疗的免疫治疗策略 | 单中心非随机对照试验，样本量较小（12例患者） | 评估TLR4激动剂联合放疗在转移性软组织肉瘤中的安全性和免疫调节效果 | 转移性软组织肉瘤患者 | 临床医学 | 软组织肉瘤 | 免疫组织化学，T细胞受体测序，单细胞测序 | NA | 临床数据，测序数据 | 12例患者 | NA | TCR测序，单细胞测序 | NA | NA |
| 9944 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics of Mtb/HIV Co-Infection
2023-09-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12182295
PMID:37759517
|
综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学技术研究结核分枝杆菌/艾滋病共感染的免疫图谱进展 | 系统总结了单细胞RNA测序在揭示结核/艾滋病共感染中宿主-病原体相互作用和免疫异质性的创新应用 | 作为综述文章，不涉及原始实验数据，主要基于已有研究进行总结分析 | 探讨单细胞转录组学在结核/艾滋病共感染研究中的应用价值 | 结核分枝杆菌和艾滋病病毒的共感染机制及免疫反应 | 单细胞组学 | 结核病/艾滋病共感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9945 | 2025-10-07 |
Single‑cell RNA‑Seq reveals PBMC profile alterations in a patient following a radiation accident
2025-May, Experimental and therapeutic medicine
IF:2.4Q3
DOI:10.3892/etm.2025.12846
PMID:40165803
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示辐射事故患者外周血单核细胞谱的动态变化 | 首次在单细胞水平上系统描述辐射暴露后人类外周血免疫细胞的动态变化轨迹 | 样本量较小（仅1名患者和10名健康对照），缺乏多时间点跟踪 | 研究电离辐射对人体外周血免疫细胞的影响机制 | 辐射事故患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 辐射损伤 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析、基因调控网络推断 | 单细胞转录组数据 | 1名患者在辐射后第113天和631天，10名健康对照者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9946 | 2025-10-07 |
Comprehensive Multi-omics and Mendelian Randomization Reveal the Key Role of Monocytes in Aging and Osteoarthritis
2025-Apr-02, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01416-6
PMID:40172742
|
研究论文 | 通过多组学和孟德尔随机化方法揭示单核细胞在衰老和骨关节炎中的关键作用 | 首次整合单细胞RNA测序、批量RNA-seq数据和孟德尔随机化分析，发现单核细胞亚群在骨关节炎和衰老中的异质性，并鉴定出四个与骨关节炎有因果关系的关键标志基因 | 需要独立验证队列进一步确认研究结果，机制研究仍需深入 | 探索骨关节炎与衰老之间的潜在联系和分子机制 | 骨关节炎患者、衰老个体和对照组的单核细胞亚群 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析, 细胞功能分析 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据 | 包含骨关节炎、衰老和对照组的多组学数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9947 | 2025-10-07 |
Dynamic Alterations in DNA Methylation of CD4+ T Cells and Macrophages in a Murine Model of Tuberculous Pleural Infection Induced by BCG Vaccination
2025-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70166
PMID:40170749
|
研究论文 | 本研究通过分析BCG诱导的小鼠结核性胸膜炎模型中CD4+ T细胞和巨噬细胞的DNA甲基化动态变化 | 首次揭示了结核性胸膜炎进展过程中免疫细胞DNA甲基化的动态变化特征及其对T细胞分化的调控作用 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究结核性胸膜炎中免疫细胞的表观遗传调控机制 | BCG诱导的结核性胸膜炎小鼠模型中的CD4+ T细胞和巨噬细胞 | 表观遗传学 | 结核病 | DNA甲基化测序,转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 表观遗传数据,转录组数据 | BCG诱导的小鼠胸膜炎模型在0、1、7、14天时间点的胸膜灌洗液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9948 | 2025-10-07 |
Deciphering shared molecular dysregulation across Parkinson's disease variants using a multi-modal network-based data integration and analysis
2025-Mar-31, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-025-00914-3
PMID:40164620
|
研究论文 | 通过构建知识图谱整合多组学数据，探索不同帕金森病变异型之间的共同分子失调机制 | 首次将患者特异性中脑类器官的多模态数据与公共生物数据整合构建知识图谱，并在单细胞水平分析特发性帕金森病与单基因型帕金森病的共同转录组失调 | 研究样本量有限，仅包含特定基因突变类型，需要进一步验证 | 探索不同帕金森病变异型之间共享的分子失调机制 | 帕金森病患者特异性中脑类器官（含LRRK2-G2019S、SNCA三倍体、GBA-N370S、MIRO1-R272Q突变）及特发性帕金森病患者 | 系统生物医学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序，高通量成像，知识图谱构建 | 知识图谱，网络分析 | 图像数据，RNA测序数据，单细胞RNA测序数据 | 包含多种基因突变的帕金森病患者特异性中脑类器官及特发性帕金森病患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq，RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 9949 | 2025-10-07 |
Identification of druggable targets in acute kidney injury by proteome- and transcriptome-wide Mendelian randomization and bioinformatics analysis
2025-Mar-27, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00631-0
PMID:40148878
|
研究论文 | 通过蛋白质组和转录组范围的孟德尔随机化及生物信息学分析识别急性肾损伤的可成药靶点 | 首次整合多组学孟德尔随机化方法系统识别急性肾损伤的潜在治疗靶点，并验证其因果关系的稳健性 | 研究主要基于遗传数据推断，需要后续实验验证靶点的生物学功能 | 识别急性肾损伤的潜在治疗靶点和药物重定位机会 | 急性肾损伤患者和正常组织的遗传及转录组数据 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 全基因组关联研究(GWAS), 孟德尔随机化(MR), 单细胞转录组测序, 批量转录组测序 | 孟德尔随机化模型 | 遗传数据, 蛋白质组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 9950 | 2025-10-07 |
Transcriptomic and genetic analysis suggests a role for mitochondrial dysregulation in schizophrenia
2025-Mar-15, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.03.14.25323827
PMID:40162239
|
研究论文 | 本研究通过整合遗传分析和单核RNA测序技术，揭示了精神分裂症中线粒体功能紊乱的细胞类型特异性分子机制 | 首次在单细胞分辨率上系统揭示了精神分裂症中不同神经元亚型、星形胶质细胞和少突胶质细胞中线粒体功能紊乱等分子通路的共同扰动 | 样本量相对有限（85例），仅分析了背侧前额叶皮层特定区域 | 探索精神分裂症的细胞类型特异性病因机制 | 43例精神分裂症患者和42例正常对照的死后脑组织样本 | 生物信息学 | 精神分裂症 | 单核RNA-seq，遗传分析，表达数量性状位点分析，转录组关联分析 | 共调控网络分析 | 单细胞转录组数据，遗传数据 | 536,618个细胞核，来自85例人脑样本 | NA | 单核RNA-seq | NA | NA |
| 9951 | 2025-10-07 |
Myeloid-derived suppressor cell inhibits T-cell-based defense against Klebsiella pneumoniae infection via IDO1 production
2025-Mar, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012979
PMID:40096073
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了高毒力肺炎克雷伯菌感染中髓源性抑制细胞通过IDO1酶抑制T细胞免疫应答的机制 | 首次发现hvKp感染通过诱导色氨酸代谢增强MDSCs的免疫抑制活性，并证实IDO1在抑制T细胞抗细菌免疫中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；IDO1抑制剂在临床应用中的效果需进一步评估 | 探究高毒力肺炎克雷伯菌逃避宿主免疫防御的机制，为开发新的免疫治疗策略提供理论依据 | 高毒力肺炎克雷伯菌感染的小鼠模型及相关的免疫细胞 | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序，基因敲除，体外抑制实验 | NA | 基因表达数据 | 小鼠感染模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9952 | 2025-10-07 |
Inhibition of ERK1/2 mediated activation of Drp1 alleviates intervertebral disc degeneration via suppressing pyroptosis and apoptosis in nucleus pulposus cells
2025-Mar, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.01.013
PMID:40160807
|
研究论文 | 本研究探讨了Drp1在椎间盘退变中的作用机制，并验证了Drp1抑制剂Mdivi-1通过抑制细胞焦亡和凋亡缓解退变的治疗效果 | 首次揭示ERK1/2通过调控Drp1磷酸化介导的线粒体分裂在椎间盘退变中的作用机制，并证实Mdivi-1的治疗潜力 | 研究主要基于大鼠模型和体外细胞实验，尚未进行临床验证 | 阐明Drp1在椎间盘退变中的分子机制并评估其抑制剂Mdivi-1的治疗效果 | 大鼠椎间盘退变模型和髓核细胞 | 分子生物学 | 椎间盘退变 | 单细胞测序分析、Western blot、流式细胞术、免疫荧光染色、X射线、MRI | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、影像数据 | 8周龄大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9953 | 2025-10-07 |
A novel lactylation-related gene signature to predict prognosis and treatment response in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1549724
PMID:40161374
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于乳酸化相关基因的特征模型，用于预测肺腺癌患者的预后和治疗反应 | 首次在肺腺癌中系统研究乳酸化相关基因特征，构建了风险预后模型并验证其与免疫浸润和化疗敏感性的关联 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要更多前瞻性临床研究验证 | 探索乳酸化相关基因在肺腺癌预后预测和治疗反应评估中的价值 | 肺腺癌患者和肺腺癌细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | RNA测序，单细胞测序，LASSO回归分析 | 风险预后模型，列线图 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者样本 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9954 | 2025-10-07 |
Early Detection of Malignant Cells in Gastric Lavage via Hexokinase 2 and Single-Cell Sequencing for Gastric Cancer Diagnosis
2025, Risk management and healthcare policy
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/RMHP.S510123
PMID:40161902
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过胃灌洗液中HK2标记和单细胞测序检测脱落肿瘤细胞的新方法，用于胃癌早期诊断 | 首次将代谢标记物HK2与单细胞测序技术结合应用于胃灌洗液检测，实现胃癌早期诊断 | 样本量相对有限（60例），对重度不典型增生的敏感性仅为57% | 开发一种非侵入性的胃癌早期诊断方法 | 胃灌洗液中的脱落肿瘤细胞 | 数字病理 | 胃癌 | 单细胞测序，基因组拷贝数变异分析 | NA | 单细胞基因组数据 | 60例（10例胃癌，26例癌前病变，15例良性胃病，9例健康对照） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 9955 | 2025-10-07 |
Analysis and Validation of Mitophagy-Related Genes in Diabetic Foot Ulcers
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S504001
PMID:40162084
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，鉴定并验证了与糖尿病足溃疡相关的线粒体自噬关键基因 | 首次在糖尿病足溃疡中系统分析线粒体自噬相关基因，结合机器学习算法、免疫细胞浸润分析和单细胞RNA测序验证 | 样本量有限，需要更大队列研究；对炎症机制的机制性联系探索不够深入 | 鉴定糖尿病足溃疡发病机制中与线粒体自噬相关的关键基因 | 糖尿病足溃疡患者皮肤组织 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, RT-PCR, Western blot, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 使用GEO数据库中的多个数据集(GSE80178, GSE68183, GSE165816) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9956 | 2025-10-07 |
scCCTR: An iterative selection-based semi-supervised clustering model for single-cell RNA-seq data
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.03.018
PMID:40165824
|
研究论文 | 提出一种基于迭代选择的半监督聚类模型scCCTR，用于单细胞RNA测序数据分析 | 通过迭代选择高置信度细胞和标签来指导深度学习模型，结合Transformer神经网络的多头注意力机制提升聚类精度 | NA | 开发更准确有效的单细胞RNA测序数据聚类算法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer, 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9957 | 2025-10-07 |
Inflammation and cancer: molecular mechanisms and clinical consequences
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1564572
PMID:40165901
|
综述 | 本文综述了炎症与癌症之间的分子机制及临床关联，重点关注癌症相关炎症对肿瘤进展和治疗反应的影响 | 整合单细胞RNA测序和空间分子成像分析等先进技术，系统阐明慢性炎症与癌症的联系机制 | NA | 探讨炎症在癌症发生发展中的分子机制和临床后果 | 癌症相关炎症、肿瘤微环境、胃肠道癌症 | NA | 癌症、胃肠道癌症 | 单细胞RNA测序、空间分子成像分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9958 | 2025-10-07 |
Identification of immune characteristic biomarkers and therapeutic targets in cuproptosis for rheumatoid arthritis by integrated bioinformatics analysis and single-cell RNA sequencing analysis
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1520400
PMID:40166070
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析和单细胞RNA测序分析，鉴定铜死亡在类风湿关节炎中的免疫特征生物标志物和治疗靶点 | 首次系统研究铜死亡相关基因在类风湿关节炎中的表达特征和生物学功能，并探索其与免疫浸润和治疗药物的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 阐明铜死亡相关基因与类风湿关节炎的潜在关联，寻找新的生物标志物和治疗靶点 | 类风湿关节炎患者和对照组的铜死亡相关基因 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 蛋白质相互作用网络分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9959 | 2025-10-07 |
A dynamic peripheral immune landscape during human pregnancy
2025-Jan, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2022.06.011
PMID:40166108
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类妊娠期间外周免疫系统的动态转录变化 | 首次从免疫角度提出妊娠具有促衰老效应，并发现该效应在产后可能恢复 | 仅关注外周血单核细胞，未涉及局部组织免疫变化 | 阐明妊娠期间母体免疫系统的动态变化机制 | 妊娠期女性的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同妊娠阶段的孕妇外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9960 | 2025-10-07 |
A Noninvasive Menstrual Blood-Based Diagnostic Platform for Endometriosis Using Digital Droplet Enzyme-Linked Immunosorbent Assay and Single-Cell RNA Sequencing
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0652
PMID:40171018
|
研究论文 | 开发基于月经血的非侵入性子宫内膜异位症诊断平台，结合数字微滴酶联免疫吸附测定和单细胞RNA测序技术 | 首次将月经血作为诊断样本，开发了具有飞摩尔级灵敏度的ddELISA技术，并验证了月经血与子宫内膜异位症病变的关键生物学特性相似性 | 未提及样本规模和研究人群特征，需要进一步临床验证 | 开发子宫内膜异位症的非侵入性体外诊断方法 | 子宫内膜异位症患者，重点关注月经血中的遗传和炎症标志物 | 数字病理 | 子宫内膜异位症 | 数字微滴酶联免疫吸附测定，单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质检测数据，单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |