单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 9921 - 9940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9921 | 2024-08-07 |
CD63+ Cancer-Associated Fibroblasts Confer Tamoxifen Resistance to Breast Cancer Cells through Exosomal miR-22
2020-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202002518
PMID:33173749
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序描绘了肿瘤微环境的整体景观，并发现了一种新的癌症相关成纤维细胞（CD63 CAFs），这种细胞通过分泌富含miR-22的胞外囊泡促进乳腺癌细胞对他莫昔芬的耐药性 | 首次揭示了CD63 CAFs通过分泌富含miR-22的胞外囊泡诱导乳腺癌细胞对他莫昔芬产生耐药性，并提出了CD63 CAFs作为增强他莫昔芬敏感性的新型治疗靶点 | NA | 旨在从肿瘤微环境的角度更好地理解他莫昔芬耐药性 | 乳腺癌细胞对他莫昔芬的耐药性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 9922 | 2024-08-07 |
Identification of diverse cell populations in skeletal muscles and biomarkers for intramuscular fat of chicken by single-cell RNA sequencing
2020-Oct-31, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07136-2
PMID:33129271
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，首次描述了鸡骨骼肌在两个发育阶段的异质性，并鉴定了APOA1和COL1A1作为鸡肌内脂肪细胞的生物标志物。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了鸡骨骼肌在不同发育阶段的细胞亚群，并鉴定了新的肌内脂肪细胞生物标志物。 | NA | 研究鸡骨骼肌发育过程中的细胞异质性及其与肌内脂肪细胞的关系。 | 鸡骨骼肌在不同发育阶段的细胞亚群及其基因表达。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在孵化后第5天和第100天分别鉴定了10个和7个细胞集群。 |
| 9923 | 2024-08-07 |
Heterogeneity of Neuroinflammatory Responses in Amyotrophic Lateral Sclerosis: A Challenge or an Opportunity?
2020-Oct-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21217923
PMID:33113845
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综述 | 本文综述了肌萎缩侧索硬化症（ALS）中神经炎症反应的异质性，并探讨了其作为治疗挑战或机遇的可能性 | 介绍了单细胞和空间转录组学技术在发现新的治疗靶点和非侵入性诊断/预后标志物方面的潜力 | 异质性/多方面的微胶质细胞反应在不同中枢神经系统区域的发生为单一药物疗法的临床转化带来了障碍 | 总结过去十年中关于ALS中微胶质细胞反应复杂性的研究结果，并讨论新技术带来的新治疗途径 | 肌萎缩侧索硬化症（ALS）中的神经炎症反应及其微胶质细胞的作用 | NA | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞和空间转录组学技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9924 | 2024-08-07 |
Genomic Analysis of Hematopoietic Stem Cell at the Single-Cell Level: Optimization of Cell Fixation and Whole Genome Amplification (WGA) Protocol
2020-Oct-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21197366
PMID:33036143
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研究论文 | 本文评估了不同的细胞免疫染色、固定和全基因组扩增方法对单细胞测序效率和产量的影响 | 优化了单细胞水平上造血干细胞的细胞固定和全基因组扩增协议 | NA | 深入理解肿瘤发病机制及肿瘤群体对治疗的反应 | 造血干细胞的单细胞基因组分析 | NA | 血液系统肿瘤 | 全基因组扩增 | NA | 基因组数据 | NA |
| 9925 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals mRNA Splice Isoform Switching during Kidney Development
2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019080770
PMID:32651222
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研究论文 | 本研究利用全长单细胞RNA测序技术，分析了小鼠胚胎肾脏中544个单细胞的转录组，揭示了肾脏发育过程中mRNA剪接异构体转换的现象 | 本研究首次通过全长单细胞RNA测序技术，全面分析了肾脏发育过程中细胞状态转换时的剪接异构体转换，并识别了几个潜在的剪接调控因子 | NA | 揭示胎儿肾脏间质向管状上皮分化过程中基因的替代剪接机制，以增进对肾脏发育分子机制的理解 | 小鼠胚胎肾脏中的单细胞 | 数字病理学 | NA | 全长单细胞RNA测序 | NA | RNA | 544个小鼠胚胎肾脏单细胞 |
| 9926 | 2024-08-07 |
An Experiment on Ab Initio Discovery of Biological Knowledge from scRNA-Seq Data Using Machine Learning
2020-Aug-14, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2020.100071
PMID:33205121
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法在单细胞RNA测序数据上进行实验，探索了在没有现有知识指导的情况下发现生物学知识的能力和局限性 | 本研究采用无监督和监督机器学习相结合的策略，揭示了主要细胞谱系，且最小程度依赖先验知识或人工干预，实现了人类早期胚胎细胞分化的新发现 | 研究展示了机器学习在复杂生物问题知识发现的可行性和重要性，但也指出了其局限性 | 探索机器学习在无现有知识指导的高通量生物数据中发现新模式的潜力和局限 | 早期胚胎发育的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-Seq | NA | 数据 | NA |
| 9927 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of the developing mouse brain and spinal cord with split-pool barcoding
2018-04-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aam8999
PMID:29545511
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研究论文 | 本文开发了一种名为SPLiT-seq的单细胞RNA测序方法，用于对发育中的小鼠大脑和脊髓进行单细胞转录组分析 | SPLiT-seq方法通过组合条形码标记细胞来源，适用于固定细胞或细胞核，无需定制设备，并允许高效样本复用 | NA | 研究小鼠大脑和脊髓在早期发育阶段的单细胞转录组特征 | 小鼠大脑和脊髓的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 156,049个单核转录组 |
| 9928 | 2024-08-05 |
The prognostic marker KRT81 is involved in suppressing CD8 + T cells and predicts immunotherapy response for triple-negative breast cancer
2024-Dec-31, Cancer biology & therapy
IF:4.4Q2
DOI:10.1080/15384047.2024.2355705
PMID:38778753
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研究论文 | 本研究探讨了角蛋白81（KRT81）在三阴性乳腺癌中的预后标志作用及其对免疫治疗反应的预测。 | KRT81被发现是三阴性乳腺癌的独立预测因子，并与免疫微环境相关，表明其在个性化治疗中的重要性。 | 目前研究主要集中在KRT81的表达相关性，尚未充分探讨其他潜在的影响因素。 | 研究KRT81在三阴性乳腺癌中的作用及其作为免疫治疗预后标志的潜力。 | 三阴性乳腺癌及其相关的免疫细胞浸润情况。 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种三阴性及非三阴性乳腺癌样本的差异表达分析 |
| 9929 | 2024-08-05 |
scGAAC: A graph attention autoencoder for clustering single-cell RNA-sequencing data
2024-Sep, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2024.06.010
PMID:38950719
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研究论文 | 提出了一种基于图注意力自编码器的聚类方法scGAAC，以处理单细胞RNA测序数据 | 引入了一种新的聚类方法，通过图注意力自编码器利用细胞间的结构信息，发现潜在关系 | 尽管scGAAC有效，但可能仍然受到数据噪声和高维度的影响 | 研究并改进单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 图注意力自编码器 | 基因表达数据 | 四个真实的单细胞RNA测序数据集 |
| 9930 | 2024-08-05 |
A novel mechanism of ferroptosis inhibition-enhanced atherosclerotic plaque stability: YAP1 suppresses vascular smooth muscle cell ferroptosis through GLS1
2024-Aug-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202401251R
PMID:39091212
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研究论文 | 本研究揭示了通过YAP1抑制血管平滑肌细胞的铁死亡以增强动脉粥样硬化斑块的稳定性的新机制 | 本研究首次阐明了YAP1/GLS1轴在动脉粥样硬化斑块稳定性中的关键作用 | 本研究的局限性在于主要基于动物模型，尚需进一步在人类中验证 | 研究铁死亡在动脉粥样硬化斑块稳定性中的作用及其机制 | 动脉粥样硬化斑块中的血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA | 在Apoe小鼠模型中进行了实验 |
| 9931 | 2024-08-04 |
Evolving concepts in meningioma management in the era of genomics
2024-Aug-01, Cancer
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/cncr.35279
PMID:38753473
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综述 | 本文探讨了基因组时代脑膜瘤管理的新概念 | 通过分子分析方法，识别具有不良预后的脑膜瘤患者 | 研究主要为综述性，缺乏原始数据支持 | 帮助读者理解脑膜瘤的分子特征，以制定管理和监测策略 | 相关的脑膜瘤患者及其分子特征 | 数字病理 | NA | 分子测序、DNA甲基化、蛋白质组学、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 9932 | 2024-08-04 |
Integrated multi-omics profiling landscape of organising pneumonia
2024-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1782
PMID:39083563
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研究论文 | 本研究探讨了脂质代谢重编程在组织性肺炎中的作用，重点关注炎症和纤维化 | 揭示了组织性肺炎与脂质代谢重编程之间的显著关联，并首次确定了CD36在这一过程中的重要角色 | 本研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的病理机制 | 研究脂质代谢重编程在组织性肺炎中的病理生理意义 | 组织性肺炎小鼠模型及其巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、Visium CytAssist空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学和质谱 | NA | 组织样本 | 组织性肺炎小鼠模型的组织样本 |
| 9933 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals CD8+ T cell structure and developmental trajectories in idiopathic pulmonary fibrosis
2024-Aug, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.06.008
PMID:38936318
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研究论文 | 这篇文章研究了在特发性肺纤维化中CD8+ T细胞的结构和发育轨迹 | 使用单细胞转录组技术揭示了特发性肺纤维化患者中CD8+ T细胞的代谢特征和相关信号通路 | 样本量较小，仅包含5名IPF患者和3名无纤维化肺的受试者 | 探讨不同免疫细胞亚群在特发性肺纤维化发病机制中的作用 | 特发性肺纤维化患者中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 8个样本（5名IPF患者和3名无纤维化肺的受试者） |
| 9934 | 2024-08-05 |
Endothelial cell diversity: the many facets of the crystal
2024-Aug, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.16660
PMID:36266750
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研究论文 | 内皮细胞的分子异质性在不同器官和病理条件下受到关注 | 文章探讨了内皮细胞在各种器官和相同血管中的独特分子特征和机制 | 并未详细说明研究的具体限制 | 揭示内皮细胞的多样性及其在生理和病理状态下的作用 | 内皮细胞及其在不同器官和病理条件下的异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA | NA |
| 9935 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics at the brain-electrode interface in rat motor cortex and the relationship to recording quality
2024-Jul-31, Journal of neural engineering
IF:3.7Q2
DOI:10.1088/1741-2552/ad5936
PMID:38885679
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研究论文 | 研究了大脑电极植入后的外来物反应及其与记录质量的关系 | 采用空间转录组学的方法识别电极植入引发的基因表达变化，并将其与传统的神经胶质反应和电生理记录质量进行比较 | 研究主要集中在大鼠的运动皮层，结果可能无法直接推广到其他脑区或物种 | 探讨电极植入对脑组织的影响，并寻找与记录信号质量相关的生物标志物 | 使用功能性微电极阵列的慢性植入大鼠 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 在电极周围的300μm范围内对不同时间点的脑组织进行分析，共涉及553个显著不同表达的基因 |
| 9936 | 2024-08-05 |
Oncostatin M-driven macrophage-fibroblast circuits as a drug target in autoimmune arthritis
2024-Jul-31, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-024-00347-0
PMID:39080781
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研究论文 | 本研究揭示了在自身免疫性关节炎中由OSM驱动的巨噬细胞-成纤维细胞相互作用作为潜在药物靶点 | 确定了OSM信号通路作为JAK抑制剂在体内的主要靶向通路，并证明了巨噬细胞-成纤维细胞电路在自身免疫性关节炎中的关键作用 | 本研究主要基于小鼠模型，可能无法完全应用于人类自身免疫性关节炎 | 确定JAK抑制剂在自身免疫性关节炎中的治疗靶点 | 以胶原诱导性关节炎小鼠为研究对象，探讨巨噬细胞和成纤维细胞之间的相互作用 | 数字病理学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 胶原诱导性关节炎小鼠的实验样本 |
| 9937 | 2024-08-04 |
Whole brain alignment of spatial transcriptomics between humans and mice with BrainAlign
2024-Jul-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50608-2
PMID:39080277
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研究论文 | 本研究开发了一种名为BrainAlign的自监督学习方法，用于人类与小鼠之间空间转录组学的全脑对齐 | BrainAlign同時在两个分离的共享嵌入空间中编码斑点和基因，使用异构图神经网络进行全脑对齐 | NA | 研究人类与小鼠之间空间转录组学的对齐 | 人类和小鼠的大脑区域 | 计算机视觉 | NA | 自监督学习 | 异构图神经网络 | 空间转录组学数据 | NA |
| 9938 | 2024-08-05 |
Metabolic reprogramming and heterogeneity during the decidualization process of endometrial stromal cells
2024-Jul-30, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01763-y
PMID:39080628
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研究论文 | 本文研究了人类子宫内膜细胞在妊娠过程中的代谢特征 | 首次综合分析了单细胞RNA测序数据，揭示了子宫内膜基质细胞转变为决孕细胞过程中的代谢重塑和异质性 | 研究主要集中于单细胞层面，尚未探讨大范围的组织或动物模型的代谢特征 | 旨在深入了解人类子宫内膜决孕化过程中细胞的代谢动态 | 研究对象为人类子宫内膜基质细胞及其向决孕细胞的分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 9939 | 2024-08-04 |
Mapping the molecular landscape of Lotus japonicus nodule organogenesis through spatiotemporal transcriptomics
2024-Jul-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50737-8
PMID:39080318
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研究论文 | 这篇文章通过空间转录组学研究了鹤虞豆的根瘤发生发展 | 本研究首次揭示了根瘤中感染区和外围组织的发育轨迹，并确定了相关的基因集 | 研究可能未能涵盖所有影响根瘤发生的基因和分子机制 | 旨在深入了解根瘤发生的分子事件，为开发共生固氮作物提供数据支持 | 研究对象为模式豆类植物鹤虞豆的根瘤发育 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 9940 | 2024-08-04 |
Enhancer-driven gene regulatory networks inference from single-cell RNA-seq and ATAC-seq data
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae369
PMID:39082647
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为STREAM的新方法，用于推断来自单细胞转录组和染色质可及性数据的增强子驱动基因调控网络 | STREAM结合了Steiner森林问题模型、混合二聚簇管道和次模优化，提供了一种创新的推断方法 | NA | 研究基因调控程序在复杂生物系统中的作用 | 单细胞转录组和染色质可及性数据，以推断增强子驱动的基因调控网络 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病，弥漫性小淋巴细胞淋巴瘤 | RNA-seq，ATAC-seq | 混合二聚簇，次模优化 | 文本 | 涉及阿尔茨海默病和弥漫性小淋巴细胞淋巴瘤的数据集 |