单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 9921 - 9940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9921 | 2024-08-07 |
Single-cell and Spatial Transcriptomics Clustering with an Optimized Adaptive K-Nearest Neighbor Graph
2023-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.13.562261
PMID:37905097
|
研究论文 | 本文开发了一种名为aKNNO的方法，通过优化的自适应k近邻图同时识别丰富和稀有细胞类型 | aKNNO方法能够在不牺牲丰富细胞类型聚类性能的情况下，准确发现已知和新的稀有细胞类型 | NA | 开发一种新的方法来同时识别单细胞和空间转录组学数据中的丰富和稀有细胞类型 | 单细胞和空间转录组学数据中的细胞类型 | 单细胞测序 | NA | 单细胞和空间转录组学 | 自适应k近邻图 | 转录组数据 | 38个模拟数据集和20个单细胞及空间转录组学数据集 |
| 9922 | 2024-08-07 |
A lipid-associated macrophage lineage rewires the spatial landscape of adipose tissue in early obesity
2023-10-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171701
PMID:37651193
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和成像技术，探讨了小鼠饮食诱导肥胖过程中脂肪组织巨噬细胞（ATM）的动态变化及其与代谢疾病发展的关系 | 首次将单细胞RNA测序与空间转录组学结合，揭示了肥胖早期脂肪组织中脂质相关巨噬细胞（LAM）前体（pre-LAM）的空间分布及其与脂肪组织功能障碍标志物的共定位 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来研究需要验证这些发现是否适用于人类 | 深入理解肥胖过程中脂肪组织巨噬细胞的多样性及其在代谢疾病发展中的作用 | 脂肪组织巨噬细胞及其在肥胖过程中的动态变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据、图像数据 | 小鼠模型 |
| 9923 | 2024-08-07 |
Mild/asymptomatic COVID-19 in unvaccinated pregnant mothers impairs neonatal immune responses
2023-09-12, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172658
PMID:37698937
|
研究论文 | 研究分析了未接种疫苗的孕妇在孕期经历轻度或无症状COVID-19感染后，新生儿脐带血和绒毛膜绒毛的免疫细胞组成变化 | 首次详细探讨了轻度或无症状孕妇COVID-19感染对新生儿免疫反应的影响，包括免疫细胞的重编程和功能状态的改变 | 研究主要集中在脐带血和绒毛膜绒毛的免疫细胞分析，未涉及其他可能的影响因素 | 探讨孕妇轻度或无症状COVID-19感染对新生儿免疫系统的影响 | 未接种疫苗的孕妇及其新生儿 | NA | COVID-19 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，体外刺激试验 | NA | 细胞 | 多个新生儿的脐带血和绒毛膜绒毛样本 |
| 9924 | 2024-08-07 |
Targeting m6A reader YTHDF1 augments antitumour immunity and boosts anti-PD-1 efficacy in colorectal cancer
2023-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2022-328845
PMID:36717220
|
研究论文 | 本文研究了m6A阅读蛋白YTHDF1在结直肠癌免疫微环境中的作用及其机制 | 首次揭示了YTHDF1通过m6A-p65-CXCL1/CXCR2轴影响结直肠癌的免疫微环境，并增强抗PD-1疗法的效果 | NA | 阐明YTHDF1在结直肠癌免疫微环境中的功能和机制 | YTHDF1在结直肠癌中的表达及其对免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、甲基化RNA免疫沉淀测序（MeRIP-seq）、RNA测序（RNA-seq）和核糖体测序（Ribo-seq） | NA | 组织微阵列、TCGA数据集 | 组织微阵列（N=408）、TCGA数据集（N=526） |
| 9925 | 2024-08-07 |
Isoformic PD-1-mediated immunosuppression underlies resistance to PD-1 blockade in hepatocellular carcinoma patients
2023-Aug, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2022-327133
PMID:36450387
|
研究论文 | 本文探讨了程序性细胞死亡蛋白1（PD-1）的同种型Δ42PD-1在肝细胞癌（HCC）进展和对抗PD-1免疫检查点阻断（ICB）耐药性中的作用 | 发现了Δ42PD-1同种型在HCC患者中对抗PD-1 ICB耐药性的机制，并验证了针对Δ42PD-1的单克隆抗体在HCC免疫治疗中的效用 | NA | 阐明HCC患者对抗PD-1 ICB耐药性的机制，并探索新的免疫治疗策略 | 74名HCC患者，包括未治疗、接受nivolumab治疗和接受pembrolizumab治疗的患者 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液样本和肿瘤组织中的外周血单个核细胞及肿瘤浸润淋巴细胞 | 74名HCC患者 |
| 9926 | 2024-08-07 |
An integrated single-cell analysis of human adrenal cortex development
2023-07-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.168177
PMID:37440461
|
研究论文 | 本文通过结合单细胞和批量RNA测序、空间转录组学、免疫组化及微焦点计算机断层扫描技术，研究了人类肾上腺皮质在前20周妊娠期的发展关键方面 | 首次展示了肾上腺快速生长和血管化，以及外层确定区（DZ）中细胞分裂的增加，同时揭示了皮质醇和醛固酮合成能力随时间发展的机制 | NA | 探究人类肾上腺皮质在妊娠早期的发育过程 | 人类肾上腺皮质发育 | NA | 肾上腺疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, 微焦点计算机断层扫描 | NA | RNA序列 | 前20周妊娠期的人类肾上腺样本 |
| 9927 | 2024-08-07 |
Delayed boosting improves human antigen-specific Ig and B cell responses to the RH5.1/AS01B malaria vaccine
2023-01-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.163859
PMID:36692019
|
研究论文 | 研究通过延迟分次剂量（DFx）给药方案（0-1-6个月），使用AS01B佐剂的RH5.1疟疾抗原，深入分析了PfRH5特异性Ig和B细胞反应，发现DFx给药能增加循环中PfRH5特异性B细胞和血清IgG1的数量和持久性 | 首次揭示了DFx给药对体液反应的深远影响，并提出了可能增强抗体持久性的机制，包括血清Ig通过改善FcRn结合和潜在的细胞反应从循环短命浆细胞向非外周长命浆细胞的转变 | NA | 研究疫苗递送方式的改进如何增加血清抗体持久性，以最大化疫苗效力 | PfRH5特异性Ig和B细胞反应 | 免疫学 | 疟疾 | ELISA, 流式细胞术, 系统血清学, 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 血清, 细胞 | NA |
| 9928 | 2024-08-07 |
Dry eye disease in mice activates adaptive corneal epithelial regeneration distinct from constitutive renewal in homeostasis
2023-01-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2204134120
PMID:36595669
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠角膜上皮在稳态、老化、糖尿病和干眼病（DED）状态下的转录状态，揭示了DED中角膜上皮适应性再生的独特响应。 | 本研究首次提供了区分稳态更新与适应性再生的全局标记，并验证了SPARC作为适应性再生标记的表达，加速了角膜上皮细胞的伤口闭合。 | NA | 探索干眼病状态下角膜上皮的适应性再生机制，并为未来研究眼部表面干细胞在健康和疾病中的功能提供框架和图谱。 | 小鼠角膜上皮细胞在不同生理和病理状态下的转录状态。 | 数字病理学 | 干眼病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9929 | 2024-08-07 |
Transcriptional and Immune Landscape of Cardiac Sarcoidosis
2022-09-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.121.320449
PMID:36111531
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了心脏肉瘤病中的细胞和转录组景观，并识别了其与其它炎症性心脏疾病的差异 | 本研究首次通过空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了心脏肉瘤病中免疫细胞的多样性和独特的分子特征 | NA | 阐明心脏肉瘤病中的细胞和转录组景观，并区分其与其它炎症性心脏疾病的差异 | 心脏肉瘤病中的免疫细胞类型及其转录组景观 | 数字病理学 | 心脏肉瘤病 | 空间转录组学（GeoMx数字空间分析仪）和单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类心脏肉瘤病样本 |
| 9930 | 2024-08-07 |
Brain cancer stem cells: resilience through adaptive plasticity and hierarchical heterogeneity
2022-09, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-022-00486-x
PMID:35710946
|
综述 | 本文综述了脑癌干细胞如何通过适应性可塑性和层次异质性在脑肿瘤生态系统中维持其动态特性，并探讨了单细胞测序等技术进步如何帮助我们更好地理解这些机制以用于治疗目的 | 利用单细胞测序等技术深入探讨脑癌干细胞的生物机制，并探索这些机制如何被用于治疗 | NA | 探讨脑癌干细胞的生物机制及其在治疗中的应用潜力 | 脑癌干细胞及其在脑肿瘤中的作用 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 9931 | 2024-08-07 |
The human myocardium harbors a population of naive B-cells with a distinctive gene expression signature conserved across species
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.973211
PMID:36248879
|
研究论文 | 本文通过免疫组织化学染色和单细胞测序技术，研究了人类心肌中的B细胞数量、分布及其基因表达特征，并与小鼠数据进行了比较 | 首次详细描述了人类心肌中B细胞的分布和基因表达特征，并发现这些特征在不同物种间具有保守性 | 研究主要基于公开数据集和少量心脏辅助设备接受者的样本，可能需要更多临床样本以验证结果 | 探讨人类心肌中B细胞的生物学特性及其在心脏疾病治疗中的潜在应用 | 人类心肌中的B细胞及其基因表达特征 | 免疫学 | 心脏疾病 | 免疫组织化学染色，单细胞测序 | NA | 组织样本，基因表达数据 | 分析了健康人类心脏样本中的B细胞与T细胞比例，以及心脏辅助设备接受者的心脏和外周血样本 |
| 9932 | 2024-08-07 |
CD11c+CD88+CD317+ myeloid cells are critical mediators of persistent CNS autoimmunity
2021-04-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2014492118
PMID:33785592
|
研究论文 | 研究通过选择性删除CD11c细胞中的α4-整合素，探讨其在中枢神经系统（CNS）自身免疫中的作用 | 首次展示了CD11c+CD88+CD317+髓系细胞在持续性CNS自身免疫中的关键作用，并通过单细胞RNA测序进行了详细分析 | 研究主要在实验小鼠模型中进行，可能与人类疾病存在差异 | 探讨CD11c+CD88+CD317+髓系细胞在多发性硬化症（MS）中的作用及机制 | CD11c.Cre小鼠和野生型（WT）小鼠 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及CD11c.Cre小鼠和WT小鼠，以及人类脑脊液样本 |
| 9933 | 2024-08-07 |
Identification and Characterization of Zebrafish Tlr4 Coreceptor Md-2
2021-03-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.1901288
PMID:33472906
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和功能实验，鉴定并表征了斑马鱼中的Tlr4共受体Md-2，揭示了其在先天免疫系统中的作用 | 首次在斑马鱼中发现并验证了Md-2的存在，并证明其与Tlr4形成复合体响应LPS，挑战了之前认为斑马鱼缺乏Md-2的观点 | 文章中提到的功能丧失突变对LPS毒性的保护作用有限，表明可能存在其他未知的免疫机制 | 探究斑马鱼中Tlr4共受体Md-2的鉴定与功能，以及其在先天免疫系统中的作用 | 斑马鱼中的Tlr4共受体Md-2及其在先天免疫系统中的作用 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及11种有颌脊椎动物的基因组分析 |
| 9934 | 2024-08-07 |
Entropy subspace separation-based clustering for noise reduction (ENCORE) of scRNA-seq data
2021-02-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1157
PMID:33305325
|
研究论文 | 本文提出了一种基于熵子空间分离的聚类算法ENCORE，用于减少单细胞RNA测序数据中的噪声 | ENCORE算法通过集成熵子空间分离策略和共识聚类方法，能够有效区分信息特征与噪声，提高细胞聚类的准确性和可视化分辨率 | NA | 研究旨在提高单细胞RNA测序数据分析的准确性和分辨率，以更好地研究细胞异质性和发现群体标记 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类、标记识别和可视化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 共识聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 12个标准数据集 |
| 9935 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing and lipidomics reveal cell and lipid dynamics of fat infiltration in skeletal muscle
2021-02, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.12643
PMID:33244879
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和脂质组学分析，揭示了骨骼肌中脂肪浸润的细胞和脂质动态变化 | 首次通过单细胞RNA测序和脂质组学技术，详细解析了骨骼肌脂肪浸润过程中的细胞起源和脂质及转录组变化 | 研究主要集中在短期内的细胞和脂质变化，长期影响及机制尚需进一步研究 | 探究骨骼肌中脂肪浸润的细胞起源和脂质及转录组变化 | 骨骼肌中的脂肪浸润现象 | 数字病理学 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序, 脂质组学 | NA | RNA, 脂质 | GLY注射后的骨骼肌样本 |
| 9936 | 2024-08-07 |
Runx2-Twist1 interaction coordinates cranial neural crest guidance of soft palate myogenesis
2021-01-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.62387
PMID:33482080
|
研究论文 | 本研究使用小鼠软腭作为模型，通过单细胞RNA测序分析探讨了颅神经嵴衍生物在颅面肌肉发育中的异质性和谱系承诺 | 揭示了Runx2和Twist1在调控颅神经嵴衍生物命运中的新作用，以及它们通过细胞间相互作用指导颅面肌肉发育的机制 | NA | 研究颅神经嵴细胞在颅面肌肉发育中的作用及其调控机制 | 颅神经嵴细胞及其在颅面肌肉发育中的衍生物 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠软腭样本 |
| 9937 | 2024-08-07 |
A High-Dimensional Window into the Micro-Environment of Triple Negative Breast Cancer
2021-Jan-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13020316
PMID:33467084
|
综述 | 本文综述了三阴性乳腺癌（TNBC）微环境中淋巴细胞、髓系细胞和基质细胞的细胞表型和空间模式，并探讨了将这些特征映射到肿瘤细胞基因型的潜在价值 | 利用多种高维度技术（如单细胞RNA测序、空间转录组学、T细胞受体分析、高级流式细胞术、成像质谱细胞术及其整合）来定义细胞表型 | NA | 深入理解三阴性乳腺癌患者的肿瘤微环境组成，以提供有效的个性化免疫治疗 | 三阴性乳腺癌的肿瘤细胞和非肿瘤成分的异质性及其随时间的变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、T细胞受体分析、高级流式细胞术、成像质谱细胞术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 9938 | 2024-08-07 |
Single-Cell Profiling of Coding and Noncoding Genes in Human Dopamine Neuron Differentiation
2021-01-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10010137
PMID:33445654
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术对人类多巴胺神经元分化过程中的编码和非编码基因进行了高吞吐量转录组分析 | 开发了一种生物信息学管道，提供了基于时间和细胞类型特异性的长非编码RNA全景图，有助于揭示多巴胺神经元分化中编码和非编码基因的复杂调控网络 | NA | 评估干细胞培养作为人类多巴胺神经发生体外模型系统的实用性，并揭示人类多巴胺神经元的发育、成熟和功能的分子步骤 | 人类多能干细胞衍生的多巴胺神经元及其分化过程中的编码和非编码基因 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约20,000个腹侧中脑模式化的干细胞 |
| 9939 | 2024-08-07 |
FLOW-MAP: a graph-based, force-directed layout algorithm for trajectory mapping in single-cell time course datasets
2020-02, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-019-0246-3
PMID:31932774
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为FLOW-MAP的图形用户界面（GUI）软件工具，该工具利用基于图布局分析和时间顺序的方法，用于可视化高维单细胞数据集中的细胞轨迹 | FLOW-MAP算法通过图形布局分析和时间顺序的方法，为单细胞时间序列数据集的分析提供了一种新的可视化工具 | NA | 开发一种新的工具来分析和可视化单细胞时间序列数据集中的细胞轨迹 | 单细胞时间序列数据集，特别是来自流式细胞术、质谱细胞术或单细胞RNA测序（scRNAseq）实验的数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 图布局算法 | 高维单细胞数据 | 包括从小鼠胚胎干细胞分化的时间序列数据集和已发表的scRNAseq数据集 |
| 9940 | 2024-08-07 |
Integrated-omics profiling unveils the disparities of host defense to ECM scaffolds during wound healing in aged individuals
2024-Dec, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本文通过综合分析单细胞RNA测序和空间转录组学，探讨了ECM支架在老年个体伤口愈合中的差异性表现及其机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了老年小鼠中ECM支架周围六种功能和空间上独特的巨噬细胞和淋巴细胞群 | NA | 探索年龄相关差异背后的机制，并为未来针对老年个体的精准生物材料开发提供依据 | ECM支架在老年个体伤口愈合中的表现及其机制 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 老年小鼠 |